Miriam González Ruiz 2º Grado de Bioquímica

THIS WEEK IN NATURE

· SEMANA 15/10/2021 ·

Nature Volume 598, Issue 7879: “Mastering the Surface strain of platinum catalysts for efficient
electrocatalysis”

He, T., Wang, W., Shi, F., & et al. (2021). Mastering the surface strain of platinum catalysts for
efficient electrocatalysis. Nature, 598(7879), 76-81. doi:https://doi.org/10.1038/s41586-021-03870-z

El platino (Pt) es un electrocatalizador cuya actividad está controlada por su estructura electrónica
dependiente del enrejado de la red de electrones. Esta dependencia es la clave para el diseño de
catalizadores de platino para reacciones de conversión de energía renovable.
El objetivo principal de los investigadores es identificar la modificación específica óptima de estos
catalizadores para cada una de las reacciones que catalizan lo cual les permitirá optimizar su
rendimiento.
El ensayo se ha basado en la medición de los espaciamientos de la red de platino, colocada sobre
nanocubos de paladio como consecuencia de la fosforilación progresiva del paladio (FIGURA 1.a). Así
se observó que, al aumentar el grado de fosforilación, se aumentaba la expansión del nanocubo y,
por tanto, la deformación de la red de platino originando una tensión de tracción. El proceso inverso
tenía lugar al desfosforilar los nanocubos de paladio (FIGURA 1.b) e inducirse la contracción del volumen
de los núcleos internos.

Figura 1. La imagen a muestra el proceso de expansión por fosforliación de los nanocubos de Pd. Por el contrario, en la
imagen b se muestra el proceso inverso de contracción debido a la desfosforilación de los nanocubos de Pd-P

Las técnicas analíticas empleadas han sido microscopia de transmisión de barrido, espectrómetría
de masas o difracción de rayos X.
Como conclusión los investigadores obtuvieron que, los principales catalizadores de platino
identificados para la conversión de energía renovable son PtT2.8 para la catálisis de la reacción de
evolución del H (HER), con una actividad óptima dependiente de elevada tensión de tracción
(EXPANSIÓN); y PtT4.7, para la catálisis de la reacción de oxidación de metanol (MOR), con una
actividad óptima dependiente de baja tensión de tracción (COMPRESIÓN).

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Nature Volume 597, Issue 7879: “Single–cell epigenomics reveals mechanisms of human cortical
development”

Ziffra, R., Kim, C., Ross, J., & et al. (2021). Single-cell epigenomics reveals mechanisms of human
cortical development. Nature, 598(7879), 205-213. doi:https://doi.org/10.1038/s41586-021-03209-8

Las diferencias del estado de la cromatina a lo largo del desarrollo de mamíferos se corresponden
con las etapas de diferenciación celular y reflejan las alteraciones en la regulación génica. En este
artículo, se muestran ensayos para la accesibilidad a la trasposasa por secuenciación; incluyendo Comentado [MGR1]: La TRASPOSASA es una enzima que
se une al final de un trasposón (segmento de ADN que puede
análisis para la identificación de loci genómicos con alteraciones y para predecir los elementos
desplazarse de un cromosoma a otro) y cataliza su
reguladores específicos. movimiento a otra parte del genoma mediante splicing.

Tras los estudios realizados en células individuales del cerebro, se ha visto la existencia de distintos
motivos de unión al factor de transcripción en la corteza prefrontal dorsolateral (PFC) y en la corteza
visual primaria (V1). Además, se ha descubierto que la vía de señalización del ácido retinoico (AR)
está implicada en la diferenciación de las neuronas de PFC y en trastornos psiquiátricos.

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THIS WEEK IN NATURE BIOTECHNOLOGY

· 2021, OCTOBER ·

Nature Volume 39, Issue 10: “Profiling the genetic determinants of chromatin accessibility with scalable
single–cell CRISPR screens”

Liscovitch-Brauer, N., Montalbano, A., Deng, J., & et al. (2021). Profiling the genetic determinants
of chromatin accessibility with scalable single-cell CRISPR screens. Nature biotechnology, 39(10),
1270-1277. doi:https://doi.org/10.1038/s41587-021-00902-x

La indexación combinatoria unicelular por CRISPR para la accesibilidad de la cromatina por

trasposasas (CRISPR–sciATAC) es un método de elevado rendimiento para determinar el efecto de
alteraciones génicas en la cromatina en estado normal y/o patológico. Esto es debido a que utiliza
una metodología en dos pasos para etiquetar moléculas de ADN y, posteriormente, la actividad de
la transcriptasa inversa para obtener ARN genómicos (ARNg) marcados.

Figura 2. Flujo de trabajo de la técnica CRISPR-sciATAC

El estudio se basa en la aplicación de la técnica CRISPR–sciATAC a 105 genes de células de

leucemia mielógena humana. Como resultado se ha podido identificar la enzima EZH2, que cataliza Comentado [MGR2]: La enzima EZH2 también tiene un
papel relevante en el desarrollo embrionario ya que está
la compactación del nucleosoma a través de la metilación de H3K27 y, por tanto, aumenta la
implicada en procesos de diferenciación celular.
accesibilidad de cromatina en regiones con H3K27me3. Este modificador de la cromatina presenta
una elevada carga mutacional por lo que está altamente mutado cuando se encuentra en
situación patológica (CÁNCER). Cuando esto sucede, la enzima EZH2 pierde su función catalítica y,
como consecuencia, H3K27 deja de tener actividad metiltransferasa incrementando la expresión
génica en los factores de transcripción (TF) HOXA y HOXD.
Por tanto, se ha demostrado que la técnica CRIPSR permite identificar genes responsables de la
resistencia terapéutica, proliferación celular y trastornos mendelianos ya que puede aplicarse al
estudio de diversos genotipos para comprender la interacción entre cambios genéticos y
accesibilidad a la cromatina en todo el genoma.

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Nature Volume 39, Issue 10: “Quantitative profiling of pseudouridynlation dynamics in native RNAs with
nanopore sequencing”

Begik, O., Lucas, M., Pryszcz, L., & et al. (2021). Quantitative profiling of pseudouridylation dynamics
in native RNAs with nanopore sequencing. Nature biotechnology, 39(10), 1278-1291.
doi:https://doi.org/10.1038/s41587-021-00915-6

Este artículo hace referencia a un ensayo in sílico para el estudio de las modificaciones de ARN
mediante la identificación de ARNm dependiente de la enzima Pus4. Antes, se pensaba que esta
enzima sólo estaba implicada en la alteración de ARNm y ARNt mitocondrial de levaduras; sin
embargo, se ha demostrado que es la responsable de la modificación de pseudouridina 854 (Ψ854)
en ARNr mitocondrial. Los investigadores que llevaron a cabo el estudio confirmaron la hipótesis con
un ensayo in vitro aplicando secuenciación por nanoporos en Saccharomyces Cerevisiae.

Nature Volume 39, Issue 10: “Genome-wide specificity of prime editors in plants”

Jin, S., Lin, Q., Luo, Y., & et al. (2021). Genome-wide specificity of prime editors in plants. Nature
Biotechnology, 39(10), 1292-1299. doi:https://doi.org/10.1038/s41587-021-00891-x

El artículo estudia la tolerancia a los desajustes de los editores de cebadores (PEs) en células
vegetales, que afectan a los sitios de unión al cebador y al espaciador de ARN guía de edición
primaria (pegRNA). Para ello, se va a realizar un estudio in vitro en el que se fusiona la transcriptasa
inversa del virus de la leucemia murina de Moloney (MMLV–RT) con nCas9 (H840A) y un pegRNA
(con secuencia espaciadora, secuencia de unión al cebador y secuencia plantilla). Como resultado, se

obtuvo que los PEs no inducen ediciones independientes de pegRNA fuera del objetivo pero sí,
ediciones dependientes de pegRNA.