UNIVERSIDAD AUTONOMA DE CHIHUAHUA

FACULTAD DE MEDICNA Y CIENCIAS BIOMEDICAS

Ingeniería Biomédica

Practica 1:
Traducción de secuencias

Nombre del alumno: Josue Alfredo Escobar Polanco

Matrícula: 342958

Materia: Informática medica

Docente: Alvarado González Carmen Carolina

Fecha: 15 de febrero del 2023

INDICE

I. INTRODUCCIÓN ...................................................................................................... 1

II. OBJETIVO ................................................................................................................ 1

III. METODOLOGÍA .................................................................................................... 2

IV. RESULTADOS ...................................................................................................... 5

V. CONCLUSIÓN Y DISCUSION .............................................................................. 6

VI. REFERENCIAS ..................................................................................................... 7

I. INTRODUCCIÓN
La manzanilla (Chamaemelum nobile) es una hierba perenne con florecillas de pétalos
blancos similares a las margaritas que se utiliza en la medicina natural. Su aroma a
manzana es característico. Se puede usar en tés, gotas, compresas, y aplicaciones
externas para tratar dolores de cabeza, inflamaciones, infecciones, enfermedades
respiratorias, entre otros. También se utiliza en la industria para la elaboración de
productos capilares, cosméticos y papel higiénico. Es una hierba que crece en lugares
secos y elevados en México, Europa y América del Norte. La cosecha se realiza
cortando las flores, secándolas y conservándolas durante un año. Esta hierba se vende
en estado natural o en productos envasados. (GOBIERNO DE MEXICO, 2001).

La secuencia seleccionada proveniente la Chamaemelum nobile corresponde a los

genes para ITS1, 5.8S rRNA e ITS2, 26S rRNA (Katsuoka, y otros, 2022). Los
ribosomas citoplasmáticos de los eucariotas contienen un componente de ARN integral
adicional, el ARNr 5.8S, que forma un complejo ARN-ARN con el ARNr 25-28S de la
subunidad ribosomal grande. Estudios sobre la inhibición de la síntesis de proteínas
mediante oligonucleótidos anti-5.8S rRNA específicos han sugerido que este ARN
desempeña un papel importante en la función del ribosoma eucariótico. Las
mutaciones en el 5.8S rRNA pueden inhibir el crecimiento celular y comprometer la
síntesis de proteínas in vitro. En conjunto, los resultados demuestran una función
definida y crítica para el 5.8S rRNA, sugiriendo que este ARN desempeña un papel en
la translocación del ribosoma. (Abou & Nazar, 1997).

II. OBJETIVO
El objetivo de esta practica es realizar la traducción de una secuencia dada, de forma
que se aprenda a interpretar una secuencia y utilizar la tabla de código genético,
identificando componentes importantes de la secuencia como lo son los codones de
inicio y parada, su función y las herramientas informáticas que se pueden utilizar para
la investigación de genomas.

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III. METODOLOGÍA
Paso 1. Obtener la secuencia molde del ADN

Ya que nuestra secuencia de ADN seleccionado se encuentra en una dirección

5’➞3’, es necesario determinar la secuencia complementaria, que nos servirá como
para encontrar la secuencia de ARN (figura 1).

Figura 1. Determinar la secuencia complementaria.

Paso 2. Convertir la secuencia de ADN a ARN (transcripción)

Este proceso consiste en tomar nuestra secuencia molde de ADN y crear la cadena
complementaria de ARNm, donde en lugar de usar los nucleótidos de timina(T),
serán de uracilo(U). En la figura 2 se muestran cómo queda la secuencia genómica
luego de este proceso.

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 Figura 2. Transcripción de la secuencia genómica.

Paso 3. Invertir la secuencia de ARNm

Es necesario que invirtamos nuestra secuencia de ARNm para que en lugar de

empezar por 3’ empiece por 5’, de forma que podamos realizar la traducción. En la
figura 3 se observa cómo queda esta inversión.

Figura 3. inversión de la secuencia de ARNm.

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Paso 4. Convertir la secuencia de ARN a la proteína (traducción)

Para este paso es necesario que primero se identifique el codón de inicio AUG para
poder empezar a separar la secuencia por codones, es decir grupos de tres
nucleótidos, de forma que se facilite utilizar la tabla de código genético. Luego de
realizar esta división podremos empezar con la traducción (figura 4). En la figura 5
se observa la tabla de código genético que se utilizó.

Figura 4. Traducción de la secuencia de ARN.

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 w

Figura 5. Tabla de código genético.

IV. RESULTADOS
En la siguiente figura 6 se presenta como que quedo la secuencia traducida y se
compara con un aplicación web (ExPASy, s.f.) que tiene la capacidad de traducir
secuencias de ADN y mostrar varios marcos de lectura (figura 7).

Figura 6. Resultado de la traducción manual de la secuencia.

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 Figura 7. Resultado de la traducción mediante aplicación web de la secuencia.

V. CONCLUSIÓN Y DISCUSION
La secuencia es bastante larga y compleja, por lo que puede ser difícil determinar la
función exacta de la proteína solo por la secuencia de aminoácidos. Aunado esto
cuando nos damos cuenta de que pueden existir múltiples marcos de lectura, se torna
más complejo poder interpretar esta secuencia sin un conocimiento más a fondo del
tema. Sin embargo, es posible extraer cierta información de la secuencia.

Contiene una serie de aminoácidos cargados y polares, como "Gln Arg Ala Thr Gln Asn
Lys Glu Arg", que pueden ser importantes para la estructura y función de la proteína.
Además, la presencia de varios aminoácidos hidrofóbicos, como "Leu Val Cys Ala Pro
Ile", sugiere que la proteína puede estar involucrada en la interacción con otras
moléculas y en la regulación de la actividad celular. (Reddy, s.f.)

En esta secuencia se observa que existen varias inicios y paradas, lo que nos puede
indicar que hay varias subunidades en la proteína, y la secuencia completa representa
solo una de estas subunidades. En general, la secuencia de aminoácidos
proporcionada representa una proteína compleja que pueden estar involucradas en la
regulación de la actividad celular y en la interacción con otras moléculas.

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VI. REFERENCIAS
Abou, S., & Nazar, R. (1997). Role of the 5.8S rRNA in ribosome translocation.
OXFORD ACADEMIC, 25(9), 1788–1794.
doi:https://doi.org/10.1093/nar/25.9.1788

ExPASy. (s.f.). ExPASy-translate tool. Recuperado el 15 de 02 de 2023, de

https://web.expasy.org/translate/

GOBIERNO DE MEXICO. (2001). Gobierno de méxico. Recuperado el 14 de 02 de

2023, de Gobierno de méxico:
https://www.gob.mx/cms/uploads/attachment/file/96281/Manzanilla_monografias.
pdf

Katsuoka, H., Hamabe, N., Kato, C., Hisamatsu, S., Baba, F., Taneishi, M., . . . Inaba,
Z. (25 de Junio de 2022). National Library Of Medicine. J-STAGE, 39(2), 93-100.
doi:https://doi.org/10.5511/plantbiotechnology.21.1130a

Reddy, M. k. (s.f.). Britannica. Obtenido de Britannica:

https://www.britannica.com/science/amino-acid/Standard-amino-acids

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