I.

bloque
TRANSMISION Y EXPRESION DE LA
INFORMACION GENETICA

1. TEMA. INTRODUCCION
2. TEMA. ESTRUCTURA SECUNDARIA Y TERCIARIA DEL DNA
3. TEMA. METABOLISMO DE AMINOÁCIDOS Y NUCLEÓTIDOS
4. TEMA. REPLICACIÓN DEL DNA
5. TEMA. ESTRUCTURA Y METABOLISMO DEL DNA
6.TEMA. SINTESIS DE PROTEINAS
7. TEMA. REGULACIÓN DE LA EXPRESIÓN GÉNICA
 Tema 2

ESTRUCTURA SECUNDARIA Y TERCIARIA

DEL DNA

● Estructura secundaria del DNA: doble hélice

● Estructura terciaria del DNA: superenrrollamiento
● Cromatina y cromosomas
● Desnaturalización del DNA
● Genomas
Claves para el descubrimiento de la estructura secundaria del DNA

(1) Leyes de Chargaff

1. La composición del DNA varía de una especial a otra
2. En una misma especie, la composición del DNA extraída de diferentes
tejidos es la misma
3. La composición del DNA no varía con la edad, con las condiciones
ambientales etc.
4. En todos los ADNs, la cantidad de adenina y timina es la misma (A=T),
mientras que la cantidad de guanina es igual que la de citosina (G=C).
Erwin Chargaff
1905-2002

Ley de Chargaff (1940):

A=T
C=G
A+G=T+C
Purinas = Pirimidinas
(2) Imágenes de difración de rayos X

Mediante la técnica de difracción por rayos X analizaros cristales de

ADN y obtuvieron patrones de difracción de dicha molécula (foto 51)

Foto 51
Maurice Wilkins Rosalind Franklin (1952)
1916-2004 1920-1958

▪ Conclusiones extraídas respecto a la estructura del ADN:

• Polímero largo, ordenado y helicoidal – diámetro 20 Å
• Dos periodicidades: una primaria de 3.4 Å y otra secundaria de 34 Å
 Watson & Crick, 1953
Cavendish Laboratory, Cambridge
Doble hélice del DNA

Premio Nobel de Medicina 1962

Watson, Crick eta Wilkins
 WATSON y CRICK: LA DOBLE HÉLICA (DNA B)

http://www.umass.edu/molvis/tutorials/dna/
http://www.biorom.uma.es/contenido/biomodel/model1j/dna/inicio.htm
 Emparejamiento de las bases

Timina
(Ceto) A=T
Adenina
(Amino)

Puentes de hidrógeno

Citosina
(Amino)
Guanina
(Ceto)
C G

20 Å
(diámetro)
 – Tautomerización de las bases –

Tautomerización amino/imino Tautomerización ceto/enol

Base común Base no común Base común Base no común

(amino) (imino) (ceto) (enol)
Citosina

Timina
Guanina
Adenina
 Emparejamiento no común de las bases tautoméricas
T* enol
(forma tautomérica)

Guanina

C* imino
(forma tautomérica)
Adenina

Timina

Citosina

G* enol A* imino
(forma tautomérica) (forma tautomérica)

http://highered.mheducation.com/sites/9834092339/student_view0/chapter15/mutation_by_base_substitution.html
It has not escaped our notice that
the specific pairing we have
postulated immediately suggest a
possible copying mechanism for
the genetic material
 ESTRUCTURA SECUNDARIA DEL DNA - variantes

 Humedad relativa 65-75 %

B DNA  En duplexos de RNA/RNA y
(definido por Watson y Crick) RNA/DNA
 Características:
- Dextrógiro
A DNA - Más corto y más ancho que
el DNA B

 Existe In vivo: relacionado con

la regulación génica y la
Z DNA recombinación
 Características:
Estructura común en células - Levógiro
(humedad relativa 92 %) - Más largo y más estrecho
que el DNA B
- Esqueleto tiene forma de
zig-zag

Todas las imágenes están en la misma escala

ESTRUCTURA SECUNDARIA DEL DNA – Estructuras peculiares

(a) H-DNA (triple hélice)

- Triple hélice dextrógira

- En secuencias ricas en CT
ESTRUCTURA SECUNDARIA DEL DNA – Estructuras peculiares

(b) Palíndromo

5’5’ 3’

3’3’ 5’

• Las enzimas de restricción normalmente reconocen y cortan

secuencias palíndromas

(c) Espejo repetido

5’ 3’

3’ 5’
ESTRUCTURA SECUNDARIA DEL DNA – Estructuras peculiares

(d) Horquilla (hairpin) (e) Cruz

 ESTRUCTURA TERCIARIA DEL DNA
SUPERENROLLAMIENTO

Las moléculas de DNA son mucho mayores que sus

huéspedes (célula, virus o bacteria)
Bacteria E. coli :
E.coli
2 µm

E.coli DNA
1,7 mm

Humanos:

▪ Cada célula 1 m DNA (2n, diploide) = 2 m

▪ Longitud de DNA total (10¹⁴ célula)  2 x10¹¹ Km
▪ Circunferencia Tierra  4 x 10⁴ Km

▪ Distancia Tierra – Sol  1.5 x 10⁸ Km

 ¿Dónde y cómo se organiza el ADN?

EUCARIOTOS PROCARIOTOS
(animales, plantas, levaduras, hongos) (bacterias)

DNA nuclear Nucleo

(cromatina/ Zona Plásmidos
cromosomas) Nucleoide
Citosol

Cloroplasto

Cromosomas
Zona
DNA no nuclear en citosólica
Mitocondria orgánulos
 ¿cómo es posible que el ADN, siendo tan largo quepa
en un espacio tan pequeño?

La clave está en el
SUPERENROLLAMIENTO
del ADN

Relajado Enrollado Superenrollado

Micrografía electrónica de
un plásmido relajado y
enrollado en distintos
grados.
Aún en ausencia de proteínas,
el ADN bacteriano esta
superenrrollado.
 B ADN dextrógiro – conformación estable sin
superenrrollamiento

Ej.
10 pb/vuelta, luego cada nt 36º inclinación
Nº de vueltas = n

Si gira a la izquierda Si gira a la derecha

Hélice enrollada menos de la cuenta Hélice enrollada más de la cuenta

- Conformación inestable – conformación inestable

Nº vueltas < n Número de vueltas > n

Ej. 11 pb/vuelta, luego cada nt 32º inclinación Ej. 9 pb/vuelta, luego cada nt 40º inclinación

Para liberar la tensión, la hélice se enrolla Para liberar la tensión, la hélice se enrolla
sobre sí misma hacia la DERECHA sobre sí misma hacia la IZQUIERA
Superrenrollamiento negativo Superrenrollamiento positivo
Topoisomerasa: Enzimas que aumentan o disminuyen el grado de
enrollamiento del ADN
Topoisomerasa I: Para liberar tensión, corta una hebra del ADN. Una vez
liberada la tensión, entrelaza los extremos de la hebra cortada.

n bira n-1 bira n bira n+1 bira

Topoisomerasa: Enzimas que aumentan o disminuyen el grado de
enrollamiento del ADN
Topoisomerasa II (o girasa): Para liberar tensión, corta las dos hebra del
ADN. A continuación la doble hélice intacta pasa por el punto de corte, y finalmente
los extremos cortados se unen.

Mecanismo qie se propone:

El DNA rodea la enzima La enzima corta las dos hebras El ADN intacto pasa por el
girasa del ADN en un punto en concreto hueco del corte

Los extremos cortados por la

girasa son unidos
¿en qué proceso celular se da el superrenrollamiento del ADN?

(i) Empaquetamiento del ADN

Superrenrollamiento Superrenrollamiento
negativo positivo

(ii) Replicación

Superrenrollamiento Superrenrollamiento
negativo positivo

(iii) Transcripción
El empaquetamiento del ADN se da gracias al
superrenrollamiento de tipo solenoide

superrenrollamiento de tipo superrenrollamiento de

plantoténico tipo solenoide

Forma

Las dos imágenes están hechas a escala

-Disoluzioan
Proteínas No - Proteinarik gabe
Sí
Grado de Bajo - Alto
compactación
 Cromatina y cromosomas (células eucariotas)

Condensación

Cromatina Cromosona
Amorfo, extendido en el núcleo Ordenado, forma de bastón

Forma

¿en qué fase del ciclo

Interfase Mitosis/Meiosis
celular?

Grado de compactación Bajo Alto (> x10.000)

Componentes DNA, RNA, proteínas

decondensación
En distintas fases del ciclo celular, el grado de
compactación del ADN varía

Anafase

Interfase
Metafase

Prometafase

Meristemo de la raíz
 NUCLEOSOMA: Unidad básica de la cromatina, complejos DNA-histona

Elementos 2 H2A,
que 2 H2B,
conforman el 2 H3
DNA de doble hebra 2 H4 H1
nucleosoma
(~200 bp)

DNA Histona H1
Nukleosoma ● 145 pb DNA
NÚCLEO ● (H2A, H2B, H3, H4)2

Nukleosoma

● 200 pb DNA
Nukleosoma
● (H2A, H2B, H3, H4)2
ENTERO
● H1
Histona octámero
HISTONA: Proteínas básicas muy pequeñas
que aparecen en el cromatina de todas las
células eucariotas.

5 tipo: H1, H2A, H2B, H3 eta H4 DNA

Histona
octámero
Octámero de histona

Dímero
Dímero H2A-H2B
H3-H4

Tetrámero Octámero de histona

H3-H4
Núcleo del nucleosoma

DNA de > 200 pb tiene una longitud de 680 Å. Tras rodear el octámero 1.8 veces,
la longitud de ese DNA desciende a 100 Å (7 veces más compacto)
 Núcleo del nucleosoma

Colas de las histonas

Colas de las histonas

Visto de lado
Visto de
frente

Colas de las histonas

Estructura de rosario

DNA conector
(54 bp DNA)

Histona H1

Octamero de histona
rodeado por 146 pb de
DNA
Los nucleosomas se empaquetan en estructuras cada vez más compactas

2º nivel de organización de orden superior: fibra de 30 nm

100 veces más compacto

Condensación y
decondensación
del DNA
CUIDADO!!!

DECONDENSACION DEL DNA

=
DESNATURALIZACIÓN DEL DNA
 DESNATURALIZACIÓN DEL ADN

ADN de doble hélice

Desnaturalización Hibridación

RENATURALIZACIÓN
DESNATURALIZACIÓN

ADN desnaturalizado
parcialmente

Separación de las Unión de las hebras de

hebras de ADN ADN mediante el
emparejamiento de bases

ADN totalmente desnaturalizado

(hebras de ADN totalmente separadas)
Efecto hipercrómico:
De estas dos

Grado de desnaturalización (%)

(lo veremos en practicas GL) moléculas quién
tendrá más GC?
Xurgapena (UM)

Cantidad GC (%)
Genomas
 GEN:

▪ 1940 Gorge Beadle y Edward Tatum

1 Gen = 1 Enzima

▪ Más tarde,
1 Gen = Proteína

▪ Hoy en día,
Gen: Un segmento de una
molécula de DNA que contiene la
información necesaria para la
síntesis de un producto biológico
Esquema simplificado
funcional (proteína o RNA) de un gen eucariota
 DNA EN LA CELULA:
DISTRIBUCION DEL GENOMA HUMANO
Codificante Exones
(~0.8%) Secuencias reguladoras
DNA de copia
única(30%) Intrones
No codificante DNA entre genes
(~29.2%) (DNA separador)

En grupos Genes repetidos en tandem

Codificante (clusters) Familias multigénicas en grupos (clusters)
(~1%)
Disperso Familias multigénicas dispersas

DNA repetido Agrupados y Secuencias Cortas Repetidas/

(70%) muy repetitivos Repeticiones Cortas en Tandem
No codificante (SSR/ STR) (%3)
(~69%) Secuencias SINE (cortas)
Intercalados
Secuencias LINE (largas)
Organización del genoma humano

LINE = long interspersed nuclear elements

SINE = short interspersed nculear elements
SSR = simple sequence repeat
SD = segmental duplication
 Cuanto más complejo un organismo,
más ADN no codificante

Procariotoak Eukarioto Onddoak/ Ornogabeak Kordatuak Ornodunak Gizakiak

zelulabakarrak landareak