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1 INTRODUCCIÓN AL ESTUDIO DE LA BIOQUÍMICA Y BIOLOGÍA MOLECULAR

CONCEPTO Y ÁREAS DE LA BIOQUÍMICA

La Bioquímica es la ciencia que estudia la química de los seres vivos. Se divide en 3 grandes áreas: bioquímica estructural (relación
entre la estructura y la función de las moléculas), metabolismo o bioquímica metabólica (reacciones en organismos y seres vivos para
sintetizar moléculas y conseguir energía para la síntesis, el transporte, el impulso nervioso, el movimiento y el calor) y biología
molecular (estudia la estructura de las moléculas en formación).

IMPORTANCIA DE LA BIOQUÍMICA EN EL GRADO DE FARMACIA

Se estudia su relación con el medicamento.
Algunas biomoléculas son componentes activos de medicamentos (no se deshacen, la propia molécula es el componente activo):
vitaminas hormonas (insulina), azúcares, aminoácidos, etc.
Para conocer el mecanismo de acción de muchos fármacos, que se explica por su interacción con estructuras y procesos bioquímicos.
Están los inhibidores de enzimas o inhibidores enzimáticos (bloquean una determinada enzima y su proceso): antibióticos (penicilina).
antipiréticos (ibuprofeno) y agentes quimioterapéuticos (metotrexato).
Permite conocer la metabolización de los fármacos, que repercute en su vida media, su funcionalidad y la interacción entre ellos
(algunos fármacos se toman juntos o no y se produce la potenciación o anulación de efectos).
Las técnicas de biología molecular se aplican a la obtención de fármacos como insulina, interferón, hormona del crecimiento,
anticuerpos, etc.
La terapia génica permite tratar el origen de las enfermedades genéticas (por mutación de un gen) sustituyendo el DNA alterado por
uno normal.
Por lo tanto, una buena formación bioquímica es imprescindible para que el farmacéutico se convierta en especialista en el medicamento.

COMPOSICIÓN QUÍMICA DE LOS SERES VIVOS

BIOELEMENTOS: toda materia viva está compuesta por 30 elementos
naturales que son esenciales para los seres vivos. La mayoría tienen un
número atómico bajo.
-Bioelementos primarios o principales (>95%): C, H, O, N. Son los
elementos más ligeros y son capaces de formar enlaces covalentes, cuanto
más ligeros son los elementos más enlaces covalentes fuertes pueden
formar.
-Bioelementos secundarios (>4,5%): S (en proteínas), P, Mg, Ca, Na, K,
Cl. S y P forman enlaces covalentes, mientras que los demás forman iones.
-Oligoelementos (0,1%): Fe, Mn, I, F, Si, Cr, Zn, Li, Mo, etc. No se encuentran en todos los seres vivos, se necesitan para procesos de
transporte o como componentes de enzimas catalizadoras.
BIOMOLÉCULAS: los bioelementos se unen entre sí para formar los compuestos biológicos, que pueden ser de dos tipos:
-Inorgánicos: son aquellos que aunque forman parte de los seres vivos también son muy abundantes en el mundo inanimado. Está en
el agua (es el más abundante), los gases (O2 y CO2) y las sales (pueden encontrarse disueltas en líquidos biológicos como iones y realizar
funciones como transmitir el impulso nervioso o precipitadas)
-Orgánicos: son aquellas moléculas que tienen como base el carbono y que son las que caracterizan a la materia viva. Hay cuatro
grupos: aminoácidos, monosacáridos, lípidos y nucleótidos; son moléculas pequeñas de un peso molecular menor de 500 (en el
citoplasma de la célula hay aproximadamente 1.000 tipos de moléculas pequeñas que pertenecen a estos cuatro grupos).
Las biomoléculas orgánicas se pueden considerar derivadas de los hidrocarburos, en los que se han reemplazado átomos de H por
diversos grupos funcionales.
Muchas biomoléculas son polifuncionales y tienen dos o más tipos de grupos funcionales, como la Acetil-Coenzima A.

MACROMOLÉCULAS: la complejidad de la vida requiere que muchas moléculas sean enormes (pueden tener un peso mayor de 5.000).
Estas macromoléculas son polímeros, formados a partir de monómeros elementales por
condensación y pueden disgregarse en sus monómeros constituyentes por hidrólisis.
Están el ácido nucleico (DNA y RNA, formado por nucleótidos), la proteína (formada por
20-22 aminoácidos diferentes) y el polisacárido (formado por muchos monómeros
diferentes, pueden ser polímeros lineales y ramificados).
Los lípidos no forman polímeros, sino que son moléculas individuales que se agrupan entre
sí por su insolubilidad en agua. La estructura básica de muchos es el ácido graso.

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INTERACCIONES DÉBILES
Los constituyentes de las moléculas y macromoléculas biológicas se mantienen unidos por enlaces
covalentes (energías de enlace entre 350-400 kJ/mol), pero para explicar la complejidad de la vida se
necesitan también las interacciones débiles (tienen mucha menos energía de enlace, lo que les permite
romperse y formarse fácil y continuamente, en la interacción molecular dinámica que es la vida).
Son los enlaces de hidrógeno, las interacciones electrostáticas entre grupos cargados, las interacciones
de van der Waals y las interacciones hidrofóbicas. Aunque su energía de enlace es pequeña, la suma de
muchas interacciones en toda la extensión de las grandes macromoléculas puede llegar a ser muy
importante, contribuyendo en gran medida a su estructura y función.
ENLACES DE HIDRÓGENO: en bioquímica, el enlace de hidrógeno se produce entre un átomo de H
unido a un átomo de O o N, interaccionando con otro O o N. La parcial positiva de H (δ+) es atraída por O o N (δ-).
INTERACCIONES IÓNICAS: son atracciones entre grupos de una macromolécula de cargas opuestas. Tienen menos energía de enlace
que el enlace covalente y el enlace de hidrógeno.
INTERACCIONES DE VAN DER WAALS: interacción de electrones en todas las sustancias, pero sobre todo en sustancias no polares.
INTERACCIONES HIDROFÓBICAS: interacción entre moléculas apolares en presencia de agua. El sistema de agua y moléculas
apolares puede estar en dos estados diferentes:
-Las dos moléculas apolares están separadas y cada una tiene su propia jaula de moléculas de agua ordenadas alrededor. Desde un punto
de vista termodinámico no pueden interaccionar con la otra molécula ni con las moléculas de agua (inestabilidad), por lo que se disponen
de la forma más estable posible y se rodean de la jaula.
-El agua empuja las moléculas apolares hasta juntarlas, se necesitarán menos moléculas de agua para formar la jaula de moléculas de
agua ordenadas ya que la comparten. El número total de moléculas en la jaula es menor, por lo que algunas moléculas que antes estaban
fijas recuperan su capacidad de movimiento.
-Las moléculas apolares se agrupan espontáneamente (estado 2),
ya que el agua las expulsa de su seno, aumentando la entropía y
haciendo que el sistema sea termodinámicamente más estable (es
espontáneo el proceso). Después las moléculas apolares pueden
atraerse mediante interacciones de van der Waals.

ORGANIZACIÓN JERÁRQUICA DE LOS SERES VIVOS

Los seres vivos son sistemas organizados jerárquicamente; cada nivel descansa sobre el inmediato inferior. Así, los bioelementos
forman biomoléculas y éstas se unen para formar polímeros (macromoléculas). Combinaciones de biomoléculas y macromoléculas
forman los orgánulos y éstos forman la célula. En los organismos multicelulares hay niveles de organización superior: tejidos, órganos,
sistemas y aparatos. En cada nivel de organización, el conjunto es mayor que la suma de sus partes (propiedades emergentes).

EL AGUA COMO DISOLVENTE

El agua es la molécula más abundante en los seres vivos. Proporciona un entorno fluido que permite la movilidad de las biomoléculas
y su interacción en los procesos metabólicos. El O del agua posee una hibridación sp3 dando una unión H-O-H de 104.5°. El agua tiene
dos propiedades esenciales para la vida: es polar y en el agua líquida sus moléculas pueden interaccionar mediante enlaces de
hidrógeno (duran muy poco tiempo, son lábiles, constantemente se rompen y se forman).
El agua es el disolvente universal de los medios intra y extracelulares, debido a su naturaleza polar y a su tendencia a formar enlaces
de hidrógeno. El agua disuelve fácilmente a los compuestos iónicos y polares (son llamados compuestos hidrófilos), con grupos cargados
o capaces de formar enlaces de H con el agua (-COO-, -NH3+, -OH, -SH, -COOH, -CO-NH2). Un ejemplo es el NaCl, los iones Na+ y
Cl- son rodeadas por las moléculas de agua formando esferas de solvatación.
NO SE DISUELVEN EN AGUA:
Las moléculas apolares son insolubles en agua (hidrófobas). Se producen las interacciones hidrofóbicas y las jaulas de agua. Están los
hidrocarburos alifáticos y aromáticos o sus derivados, que no pueden interaccionar con el agua; y los gases apolares (O2 y CO2), que se
disuelven mal en agua.
Las moléculas anfipáticas (con regiones polares y apolares) forman agregados para tener la forma más estable, en los que la parte polar
queda en contacto con el agua y la apolar alejada de ella. Se forman micelas (una única capa de moléculas), vesículas (una capa de
moléculas hacia el exterior y otra capa hacia el interior) o monocapas. También hay estructuras en jaula. Están los ácidos grasos y
fosfolípidos.

PH Y TAMPONES BIOLÓGICOS
El agua es un electrolito débil que tiene una ligera tendencia a ionizarse en protones H 3O+ o H+ y aniones OH-.

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Todos los procesos biológicos son dependientes del pH, que determina el estado iónico de las moléculas y, por tanto, su estructura y
actividad. Por ello, los seres vivos tienen que mantener constante el pH en los distintos compartimentos:
pH(sangre) = 7,35 - 7,45
pH(intracelular) = 6,8
pH(estómago) = 1,5 - 3
pH(duodeno) = 8 - 8,5
En los seres vivos se llevan a cabo reacciones en las que se liberan H+ o OH- que pueden modificar el pH del medio. Para mantener
constante el pH se utilizan tampones biológicos, que son soluciones acuosas que tienden a resistir cambios de pH cuando se les añade
pequeñas cantidades de ácido o de base (en relación a la concentración del tampón).
CURVA DE VALORACIÓN DE UN ÁCIDO DÉBIL CON BASE FUERTE:
Ejemplo:
Se prepara disolución 0,1 M de ácido acético (AH) que está parcialmente disociado → pH ácido.
Se añade la base fuerte 0,1 M de NaOH → se estudia cómo varía el pH.
Durante toda la valoración se mantienen en equilibrio:

Durante la valoración disminuye la concentración del ácido acético [AH] y aumenta la concentración del acetato [A-], el pH va subiendo.
-Hay 2 informaciones:
1. pKa del grupo que se valora

En el punto medio de la curva [AH] = [A-], Ka = [H+], -logKa = -log[H+], pKa = pH.
El pKa es el valor de pH al que el ácido está disociado al 50 %.
2. Cantidades equivalentes de un ácido débil y su base conjugada (mitad de la curva de valoración), se resiste a los cambios de
pH por lo que pueden actuar como tampón.
Un tampón está formado por cantidades similares de un ácido débil y su base conjugada (o una base débil y su ácido conjugado). Se
preparan a partir de un ácido débil y una de sus sales o una base débil y una de sus sales.
Ejemplo:
Se añaden ácido acético y acetato sódico al agua. Kw del H2O es despreciable

Si añadimos una base fuerte, los iones OH- se Si añadimos un ácido fuerte, los H+
combinan con los H+ del sistema para formar reaccionan con A- y el equilibrio se desplaza
agua. El equilibrio de disociación de AH se hacia la izquierda, formándose AH.
desplaza hacia la derecha, formándose A-.

Aumenta [AH] y disminuye [A-]

Aumenta [A-] y disminuye [AH]

CÓMO VARÍA EL PH EN FUNCIÓN DE [AH] Y [A-] DEL TAMPÓN:
Se modifican las concentraciones de A- y AH del tampón, modificando un poco el pH.
Un tampón no controla el pH en todo el intervalo, solo en uno pequeño. Cada par ácido-
base conjugado tiene una región de pH en que es eficaz como tampón,
aproximadamente se extiende una unidad de pH alrededor del valor de su pKa.

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TAMPÓN FOSFATO: es un tampón intracelular, controla el pH en el interior de las células ya que allí el fosfato es abundante.

TAMPÓN BICARBONATO: es un tampón extracelular, controla el pH en la sangre (7,4) y en los líquidos intersticiales.

Es un tampón especial al ser un sistema abierto (se puede aumentar o disminuir la excreción de HCO 3- por vía renal, y aumentar o
disminuir la de CO2 por vía respiratoria, de forma que la [HCO3-]/[H2CO3] se mantenga próxima a 20), las concentraciones de
bicarbonato y de ácido carbónico no son constantes.

-Si se añaden hidroxilos a la sangre, aumenta la excreción de bicarbonato por vía renal, por lo que disminuye [HCO3-] para que vuelva
a 20.
Se modificaría el pH (sube).

-Si se añaden protones a la sangre, aumenta la excreción de CO2 por vía respiratoria, por lo que disminuye [H2CO3] para que vuelva a
20.
Se modificaría el pH (baja).

PROTEÍNAS: son el principal tampón biológico, mantienen el pH tanto en el medio intracelular como extracelular.

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