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LUCÍA CLAVIJO PIZZANO BIOLOGÍA BLOQUE 1

La base molecular y fisicoquímica de la vida.

La materia viva es una forma de organización de la materia, caracterizada por su


complejidad, que presenta límites físicos, una compleja mezcla coloidal donde ocurren
una gran cantidad de reacciones bioquímicas, intercambio de materia y energía con
el medio y capaz de realizar las funciones vitales.

Niveles: Subatómico < atómico < molecular < celular < pluricelular < de población < de
ecosistema.

Bioelementos son los elementos químicos presentes y funcionales en los seres vivos.

 Clasificación:
 Primarios:
 C, O, H, N (aminoácidos), P (ácidos nucleicos), y S (proteínas).
 Presentes en todos los seres vivos y componentes mayoritarios de las
biomoléculas >96%.
 Forman parte de las biomoléculas en todos los organismos.

Carbono,
Componentes principales de los esqueletos y grupos funcionales de
oxígeno e
las biomoléculas.
hidrógeno
Forma parte de muchas moléculas biológicas, como los fosfolípidos
(sustancias fundamentales de las membranas celulares), los ácidos
Fósforo nucleicos y el ATP (donde forma enlaces que transfieren energía) en
forma de fosfatos, aparece en esqueletos y dientes, y tienen acción
tamponadora.
Forma parte de muchas proteínas y además es responsable de la
Azufre
actividad catalítica de numerosos enzimas, como el coenzima A.

 Secundarios:
 Na, K, Cl, Mg y Ca.
 Presentes en todos los seres vivos. Función estructural y fisiológica <4%.

Forma parte de la molécula de clorofila, y en forma iónica actúa


Magnesio como catalizador, junto con las enzimas, en muchas reacciones
químicas del organismo.
Forma parte de los carbonatos de calcio de estructuras
Calcio esqueléticas. En forma iónica interviene en la contracción muscular,
coagulación sanguínea y trasmisión del impulso nervioso.
Son los responsables de la creación de los gradientes de membrana,
Sodio, potasio
imprescindibles para la transmisión del impulso nervioso y mantienen
y cloro
el equilibrio osmótico.

 Oligoelementos.
 Fe, Cu, Co, Zn, Mn, Br, I, Si, F, Cr…
 En conjunto no están presentes en todos los organismos. Participan en
funciones esenciales. <0.5%.

Fundamental para la síntesis de clorofila, catalizador en reacciones


químicas y formando parte de citocromos que intervienen en la
Hierro
respiración celular, y en la hemoglobina que interviene en el transporte de
oxígeno.
Necesario para la síntesis de la tiroxina, hormona que regula el
Yodo metabolismo energético, cuya carencia provoca enfermedades como el
bocio, cretinismo…
Forma parte del esmalte dentario, de los huesos y también aparece en la
Flúor estructura de la piel, las glándulas… Su carencia está relacionada con la
aparición de caries.
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Forma parte de la vitamina B12 (cianocobalamida), necesaria para la


Cobalto síntesis de hemoglobina y la formación de eritrocitos. SU carencia origina
anemia.
Actúa sobre neurotransmisores y la permeabilidad celular. Es un
Litio estabilizador del estado de ánimo (se utiliza en el tratamiento de algunas
psicosis maniacodepresivas).

 Carbono.
 Importancia biológica: Forma el esqueleto de la mayoría de las biomoléculas.
 Propiedades fisicoquímicas confieren su importancia biológica.
 Bajo peso molecular y valencia IV. Le permite construir 4 enlaces covalentes
simples, dobles o triples formando cadenas lineales o ramificadas y anillos
cíclicos, idóneos para formar una gran variedad de biomoléculas.
 Por la configuración tetraédrica de sus orbitales, se pueden conseguir
moléculas con estructuras tridimensionales diferentes, de gran importancia
en las funciones biológicas que desempeñan.
 Se combina con otros elementos para formar gran cantidad de grupos
funcionales y sus enlaces son suficientemente fuertes para dar estabilidad a
las moléculas y suficientemente débiles para permitir las reacciones
bioquímicas.
 Forma compuestos sólidos (carbonato cálcico de los esqueletos), solubles en
agua (multitud de metabolitos) y gaseosos (CO2 en la fotosíntesis) de gran
importancia biológica.
 En la Coca-Cola hay carbono disuelto que hace que la bebida tenga gas.
 Enlaces covalentes del carbono:
 Sencillos (109º)

 Dobles (120º)

 Triples (180º)

 Enlaces químicos.

El enlace fundamental de la materia viva es el covalente, es un enlace fuerte que


proporciona estabilidad molecular y permite las reacciones químicas en condiciones
fisiológicas (cadenas carbonadas, rotación de enlaces, moléculas hidrofílicas,
hidrofóbicas, anfipáticas, polares, apolares, solubles…). Los átomos implicados
comparten sus electrones más externos para formar el enlace siendo difícil su
separación.

 Interacciones intra e intermoleculares débiles de gran importancia como:


 Enlaces o puentes de hidrógeno: aparece cuando un átomo de hidrógeno,
unido covalentemente a un átomo electronegativo (p. ej. O, N,
S), es compartido con otro átomo, también de carácter
electronegativo. Es una interacción electrostática de tipo
dipolo-dipolo. Es la unión de dos moléculas dipolares. Las
moléculas dipolares son moléculas neutras, pero que tienen
una carga parcial (- y +) debido a que uno de los elementos es
más electronegativo. Cuanto mayor sea la electronegatividad,
más fuerza en el enlace. Los enlaces de hidrógeno pueden ocurrir entre
moléculas (intermoleculares) o entre diferentes partes de una misma
molécula (intramoleculares).
 Interacciones electrostáticas: Unión de iones con cargas (- y +).
Responsable de la atracción o repulsión entre objetos con carga
eléctrica.
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 Interacciones hidrofóbicas: describe las fuerzas existentes entre el agua y los


compuestos llamados hidrófobos (moléculas con muy baja
solubilidad en agua). Las moléculas cambian su organización
en función del agua. Hidrofóbicos (repelen el agua) e
hidrofílicos (atraen el agua). Ambos se pliegan al estar en
contacto con el agua  Aminoácidos apolares. Los
compuestos hidrófobos son moléculas no polares que usualmente contienen
largas cadenas carbonadas que no interaccionan con las moléculas de
agua. La mezcla entre grasas y agua es un buen ejemplo. Impulsan el
plegamiento de las proteínas, o la inserción de las proteínas de membrana
en el entorno no polar de los lípidos.
 Fuerzas de Van der Waals: Unión de dipolos no estables/dipolo inducido.
Cuando un dipolo se acerca a una molécula neutra, el dipolo
induce a la molécula neutra a ser un dipolo y se crea un dipolo
instantáneo (en la molécula neutra). Este es un enlace menos
estable que el puente de hidrogeno porque no son dipolos
estables/permanentes si no que son cargas cambiantes. Son
fuerzas residuales, de atracción o repulsión entre moléculas o
grupos atómicos. Las fuerzas de van der Waals suelen ser dipolos
no permanentes, es decir, transitorios. Las fuerzas de van der
Waals determinan muchas de las propiedades de los
compuestos orgánicos, incluyendo su solubilidad en medios polares y no
polares. Son muy débiles en comparación con los enlaces covalentes.

El agua, las sales minerales y las disoluciones acuosas son biomoléculas (moléculas
presentes y funcionales en los seres vivos) inorgánicas, pequeñas, sencillas, poco
energéticas y no exclusivas de los seres vivos.

 Estructura del agua: molécula formada por dos átomos de hidrógeno


(+) y un átomo de oxígeno (-) unidos por un enlace covalente. Su
composición y estructura favorecen la formación de enlaces de
hidrógeno y otras interacciones, lo que le confiere unas propiedades
fisicoquímicas fundamentales para la vida. Es una molécula de carga
neutra. Es un dipolo eléctrico ya que el oxígeno es mucho más
electronegativo que el hidrógeno y por esto se forman puentes de
hidrógeno intermoleculares. La molécula del agua es polar (104,5º
entre átomos de hidrógeno).

 Propiedades fisicoquímicas del agua: condicionadas por la estructura y por la


composición del agua y fundamentales para sus funciones biológicas.
 Propiedades elevadas

Propiedades Definiciones
Las moléculas de agua se atraen mucho entre ellas gracias a la
Cohesión molecular
formación de los puentes de hidrógeno.
Resistencia que ejerce el líquido en la superficie de contacto con el
Tensión superficial medio gaseoso. Se forma una película en la superficie del agua que
requiere cierta fuerza para romperla.
Las moléculas de agua tienden a adherirse a las paredes de
Fuerza de adhesión conductos de pequeño diámetro o a la propia superficie que las
contiene.
Cantidad de calor necesario para que el agua pueda cambiar de un
Calor latente
estado a otro. Durante el cambio de estado la temperatura no varía
Cantidad de calor necesario para variar la temperatura del agua. Ej.:
Calor específico 1 caloría es el calor necesario para subir 1ºC la temperatura de 1g de
H2O.
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Tendencia del agua a oponerse a las fuerzas de atracción


Constante dieléctrica
electrostática entre iones positivos y negativos.
Densidad La densidad es mayor en estado líquido que en estado sólido.
El agua pura se encuentra mayoritariamente en forma de H2O y
Bajo grado de ionización
mínimamente ionizada, H3O+ y OH-.

 Funciones biológicas del agua: Determinadas por las propiedades fisicoquímicas.

Funciones biológicas Propiedades Ejemplos


Medio de reacción. Coloides
Disolvente Polaridad + constante dieléctrica celulares. (reacciones metabólicas
disueltas en agua)
Metabólica Disolvente + Grado de ionización Medio de reacción. Fotolisis
Estructural Densidad + Incompresibilidad Forma celular. Aparato ambulacral.
Amortiguadora física Densidad + Incompresibilidad Líquido pleural y sinovial.
Transporte Disolvente + Densidad + Capilaridad Sangre y saliva
Termorregulación Calor latente + Calor específico Sudor
Protección térmica
acuática (Mantenimiento
Densidad + Calor específico Capa hielo flotante.
de ecosistemas
acuáticos)

 Las sales minerales

Disueltas Sales minerales Precipitadas Silicatos

Carbonatos
Asociadas a
moléculas orgánicas Fosfatos

SiO2
Aniones (-): Cloruro ( ), fosfato ( ), fosfato
Esqueletos, CaCO3
monoácido ( ), carbonato ( ), bicarbonato
caparazones,
( ) y nitrato ( ). CaF2
dientes… (partes
Cationes (+): sodio ( ), calcio ( ), magnesio
duras de organismos)
( ), hierro ( ) y potasio ( ) Ca3(PO4)2

- Funciones generales.
Mantienen el grado de salinidad específico
Regulan la actividad enzimática
Regulan la presión osmótica y el volumen celular
Estabilizan las disoluciones coloidales
Generan potenciales eléctricos
Regulan el pH.
- Funciones específicas
El cloro es el principal anión del líquido intersticial, indispensable para el equilibrio hídrico.
El cobalto es el componente de la vitamina B12.
El yodo es imprescindible en la actividad de las hormonas tiroideas.
El hierro está asociado a moléculas de hemoglobina o mioglobina, es responsable del transporte de
oxígeno.

 Disoluciones acuosas: todas las reacciones químicas que ocurren en los seres vivos
lo hacen en medio acuoso.

Disoluciones verdaderas

Disolvente/dispersante Estables
Agua Solutos ≤ 1 nanómetro
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En las disoluciones verdaderas los solutos se reparten


homogéneamente en el seno del disolvente (difusión). Disoluciones
en suspensión  plaquetas y glóbulos. Disolución = dispersión.
Disolución verdadera = estable = homogénea.

Disoluciones coloidales

Disolvente/dispersante Estables
Agua Solutos >_ 1 nanómetro

Hidrofílicas  Solutos en dispersión Hidrofóbicas 


acuosa Solutos en emulsión

 Estas disoluciones se pueden presentar en estado de:


 SOL: Aspecto líquido, más disolvente que soluto.
 GEL: Aspecto gelatinoso, más soluto que disolvente.

Pueden sedimentar por centrifugación, coagular por deshidratación y dializar mediante


membra semipermeable.

Si los solutos tienen más de 100 nm, tenemos dispersiones groseras o suspensiones;
sedimentan por gravedad y los solutos no atraviesan membranas permeables (ejemplo,
componentes celulares en la sangre).

 Ósmosis

Es el paso del disolvente a través de una membrana


semipermeable (difusión pasiva) que separa disoluciones de
distinta concentración, desde la más diluida a la más concentrada.
Se denomina presión osmótica a la necesaria para impedir el flujo
del disolvente a través de la membrana (será más fuerte cuanto
mayor sea la diferencia de concentración).

Disoluciones isotónicas // hipotónica // hipertónica

= concentración // < concentración // > concentración

Turgencia (células turgentes)

(entra y sale con normalidad)

Plasmosis (células plasmolizadas)

 Regulación del pH

El pH de los medios biológicos es una constante fundamental para el mantenimiento de


los procesos vitales. La acción enzimática y las transformaciones químicas de las células
se realizan dentro de unos estrictos márgenes de pH. En humanos los valores extremos
compatibles con la vida y con el mantenimiento de funciones vitales oscilan entre 6,8 y
7,8; siendo el estrecho margen de 7,35 a 7,45 el de normalidad.
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Los procesos metabólicos y fisiológicos pueden variar los valores de pH del medio intra
y extracelular; los organismos cuentan con sistemas Tampón o Buffer que compensan
estos cambios. Pueden ser

 Orgánicos: Proteínas como la hemoglobina.


 Inorgánicos: Mezclas, en equilibrio de un ácido o una base débiles y sus sales
o ácidos conjugados correspondientes.
• Tampón Bicarbonato
• Tampón Fosfato

Glúcidos

Son biomoléculas formadas por C, H y O (hay


derivados N, P o S), con fórmula general
CnH2nO (por eso se conocen como hidratos de
carbono). Químicamente son:

- Polihidroxialdehidos: grupos funcionales


- Polihidroxicetonas: grupos funcionales

 Clasificación:
 Osas (monosacáridos):
 Ósidos (polímeros)
• Holósidos (polímero de osas)
♦ Oligosacáridos
♦ Polisacáridos
 Homopolisacáridos (un solo tipo de monómero)
 Heteropolisacáridos (varios tipos de monómeros)
• Heterósidos (parte glucídica + parte no glucídica).
 Derivados de monosacáridos

 Monosacáridos.

Son sólidos, cristalizables, blancos, solubles en agua, con poder reductor y dulces
(azúcares). Se caracterizan por presentar

- Isomería: Compuestos con la misma fórmula molecular pero distinta disposición


espacial de sus átomos, lo que les confiere distintas propiedades y funciones
biológicas. Hay distintos tipos de isómeros, funcionales (cambia el grupo
funcional), estereoisómeros (debido a la presencia de carbonos asimétricos o
quirales que tienen todos sus sustituyentes distintos) y ópticos (desvían la luz
polarizada a derecha o izquierda).
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 Formas lineales, Proyección de Fisher: Representación lineal sobre el plano


(dos dimensiones).

Cada una de estas formas tendrá un par de isómeros ópticos, (+) si desvía la luz
polarizada a la derecha y (-) si lo hace a la izquierda.

 Formas cíclicas hemiacetálicas o de Haworth

Los monosacáridos de 5 o más átomos de carbono en disolución acuosa presentan una


estructura cíclica mediante un enlace intramolecular.

• Aldehído: Carbonilo—Hidroxilo  Hemiacetal.


• Cetona: Carbonilo—Hidroxilo  Hemicetal.
♦ Formas:
 Furanosa (pentosas)

 Piranosa (hexosas)

 Forma de silla
 Forma de bote

En el paso de la forma lineal a la forma cíclica se generan dos nuevos isómeros, los
anómeros α y β.

Los grupos funcionales que se representan a la derecha en la proyección lineal se


representan hacia abajo en la representación cíclica.
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(Ciclación de la D-Ribosa, D-Glucosa y D-Fructosa) (formas α y β)  pdf monosacáridos

 Importancia biológica de los monosacáridos.


• Fuente de energía
• Metabolitos e intermediarios bioquímicos
• Monómeros de moléculas estructurales y de reserva
• Componentes de nucleótidos
 Ejemplos
• Triosas (Gliceraldehído): Ciclo de Calvin  metabolitos.
• Tetrosas (Eritrosa): Biosíntesis de aminoácidos.
• Pentosas (Ribosa): Componentes de nucleótidos
• Hexosas (Glucosa): Energía

 Derivados de monosacáridos

Compuestos obtenidos por oxidación, reducción, adición o sustitución de grupos


funcionales de monosacáridos (ejemplos).

• Desoxirribosa

• Glicerina (glicerol) jabón

• Ácido ascórbico (vitamina C)


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• N-Acetil-Glucosamina (caparazones)

 Enlace O-glucosídico

Es el enlace que permite a los monosacáridos unirse entre sí y que implica a dos grupos
hidroxilo. El enlace se denomina α y β dependiendo de la posición del OH anomérico
del primer monosacárido. Estos enlaces pueden ser:

 Monocarbonílico: Participa un OH anomérico y otro no anomérico (se


mantiene el poder reductor).
 Dicarbonílico: Participan dos OH anoméricos (se pierde el poder reductor).

NOTA: El poder reductor se refiere a la capacidad de ciertas biomoléculas(como por


ejemplo los monosacáridos) de ceder electrones o recibir protones en reacciones
metabólicas de reducción-oxidación. Al ceder electrones la molécula se oxida.
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 Disacáridos y oligosacáridos

Son polímeros formados por entre dos y diez monosacáridos.

Los disacáridos Son solubles en agua, dulces y cristalizables. Primero se nombra el primer
monosacárido agregándole el sufijo –osil. Entre paréntesis, se escriben los números de
los carbonos que intervienen en el enlace, separados por una flecha. Luego se escribe
el nombre del segundo monosacárido. Si el enlace es Dicarbonílico, la terminación será
–ósido, si es Monocarbonílico, la terminación será –osa.

 Lactosa (galactosa (1-4) glucosa)

 Sacarosa (glucosa (1-2) fructosa)

Los oligosacáridos se encuentran frecuentemente formando parte de glicoproteínas y


glicolípidos de membrana y son frecuentes en la leche materna, participando en el
desarrollo del sistema inmunitario de los lactantes.

 Polisacáridos

Polímeros de monosacáridos (numerosos monómeros) unidos por enlace O-glucosídico.


Son insolubles en agua o formadores de coloides, no dulces y sin poder reductor. Forman
cadenas lineales o ramificadas.

Los enlaces de tipo α son fácilmente hidrolizables y son típicos de polímeros de reserva
energética (glucógeno), los de tipo β son más
resistentes y se encuentran en polímeros estructurales
(celulosa).

 Homopolisacáridos (mismos monosacáridos)


• Estructurales (sus funciones básicas son el
soporte y la protección)
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♦ Celulosa: Polímero presente en las paredes de células vegetales y


algas, formado por cadenas lineales de β-D-Glucopiranosa con
enlaces β (1-4) en disposición helicoidal (unos 4 restos por vuelta). Las
cadenas se unen mediante puentes de hidrógeno y se organizan en
fibras complejas que forman láminas que se asocian entre sí. Esta
estructura confiere resistencia mecánica, insolubilidad y resistencia
química (enlaces poco accesibles).
♦ Quitina: Polímero presente en exoesqueletos animales y paredes
celulares de hongos, formado
por cadenas lineales de N-Acetil-
β-D-Glucosamina con enlaces β
(1-4). Se estructura de forma
similar a la celulosa y comparte
sus propiedades fisicoquímicas.
• De reserva energética (almacén de
glucosa sin afectar al potencial osmótico de la célula.
♦ Almidón: Polímero presente en plantas y algas, formado por α-D-
Glucopiranosa estructurado como mezcla de dos polímeros distintos
 Amilosa: Cadenas lineales con enlaces α (1-4)

 Amilopectina: Cadenas ramificadas con enlaces α (1-4) y α (1-6)

Forma granos insolubles en el citoplasma o en los amiloplastos.

♦ Glucógeno: Polímero de α-D-Glucopiranosa presente en células


animales y fúngicas, formado por cadenas ramificadas con enlaces
α (1-4) y α (1-6).

 Heteropolisacáridos (+ de un tipo de monosacárido)


• Agar-agar (D-Galactosa + L-Galactosa): Espesante y medio de cultivo.
• Mureína (N-Acetil- Glucosamina + N-Acetil- Murámico): Pared
bacteriana.
• Heparina: Anticoagulante
• Ácido hialurónico (N-acetilglucosamina y ácido glucurónico): El ácido
hialurónico es una sustancia que se encuentra de forma natural en
numerosos tejidos y órganos del cuerpo humano: epidermis, tejido
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conectivo, cartílagos, líquido sinovial, ojos, etc. Una de sus propiedades


más importantes es la capacidad para atraer y retener el agua, lo que
hace que esos tejidos se mantengan en buenas condiciones.

 Heterósidos

Son moléculas muy variadas que se caracterizan por tener una parte glucídica y una
parte no glucídica denominada aglucón

 Glicolípidos (glúcido + lípido)


• Cerebrósidos: Componentes del glicocálix  capa externa de la célula.
 Glicoproteínas (Glúcido + péptido)  proteínas
• Inmunoglobulinas: Función inmunológica.
 Otros (Glúcido + moléculas diversas)
• Digitalina: Cardiotónico  veneno que regula el ritmo cardíaco

 Funciones generales de los glúcidos


 Energética: Glucosa
 Estructural: Celulosa
 Reconocimiento celular: Glicoproteínas
 Antibiótica: Estreptomicina
 Biocatalizadora: Vitamina C
 Anticoagulante: Heparina
 Hormonal: Hormona luteinizante  preparan útero para embarazo.
 Inmunológica: Complejo mayor de histocompatibilidad

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