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Resumen

Por Hiromi Tzab C.


1.1 Genoma humano
Se dispone de la secuencia de 3,000 millones de bases nitrogenadas distribuidas en los 23 pares
de cromosomas proporcionalmente al tamaño de éstos. El cromosoma 21 tiene un ADN con 41
millones de bases y el 22 tiene 45 millones de bases.
1.1.1 Estructura de los cromosomas
El ADN se organiza en paquetes conocidos como cromosomas. El ADN se compone por
unidades llamadas monómeros que son miles y se repiten, se llaman nucleótidos. Polinucleótido.
Dos polinucleótidos en hélice para hacer desnaturalización y renaturalización. Nucleótido
formado por azúcar, un fosfato y bases nitrogenadas. Adenina y Guanina son púricas o purinas;
Citosina y Tímida son pequeñas y pirimídicas o pirimidinas.
Hipercromicidad es el aumento de absorción de rayos UV del ADN.
Desoxirribosa en el ADN, ribosa en el ARN. La ribosa tiene un oxhidrilo en el segundo
carbono. Ambas son pentosas cíclicas por el oxígeno en el aldehído del primer carbono.
Carbonos 5’ y 3’ se unen gracias a sus oxhidrilos a 2 fosfatos, determinan la polaridad, muchas
enzimas leen de 5’ a 3’.
El ion fosfato con 3 valencias puede combinarse, al carbono 5 o 3. Carga negativa o poli
anión que repele otras cargas negativas, pero atrae cationes, del ADN debido a que queda una
valencia libre por cada fosfato, 2 valencias de fosfato en 2 desoxirribosas distintas.
Las hélices giran en sentido de las agujas del reloj, los nucleótidos así se alinean.
(FORMA B). Las hélices izquierdas se llaman FORMA Z. El ADN es regularidad, se alarga
indefinidamente, las hélices son complementarias entre sí, + la que se leen del telómero del brazo
corto hasta el centrómero y – la que se lee en sentido opuesto. En un lado se codifica, la
complementaria no codifica. Uniones hidrógeno. Las hélices son antiparalelas. Columna vertebral
unida por iones fosfato entre desoxirribosas continuas. Bases nitrogenadas en el centro, fosfatos
hacia afuera. No hay restricción para la secuencia de bases, puede ser infinita. Hay una ranura
para que el ADN se comunique con proteínas. AT tiene dos uniones hidrógeno, CG tiene tres.
Las moléculas parecen pilas de fichas, las sustancias intercalantes son moléculas planas que sí
entran en ese espacio. La FORMA B tiene una medida media de 36°, 360° por vuelta de hélice de
10 pares de bases.
El ADN de las mitocondrias y los plásmidos son circulares. El ADN bacteriano y viral
también. Los lazos de ADN son órdenes fundamentales del empaquetamiento del ADN en el
cromosoma. Numerosas proteínas con afinidad por el ADN lo tuercen o distorsionan de forma
más o menos regular.
El ADN de hélice triple se da cuando hay una secuencia puramente purínica. Uniones de
Hoogsteen y puede pasar con un ADN al replegarse.
La desnaturalización sucede cuando hay una temperatura elevada, temperatura de
separación de cadenas. Equivale a separar cadenas, sucede por la intervención de enzimas es
necesaria para la replicación y transcripción d el ADN. Sucede en agua destilada por ausencia de
cationes. La renaturalización es cuando se reasocian dos cadenas simples de ADN
complementarias, hibridación cuando se unen como sondas (AADN o ARN). Paso de nucleación
y cierre o abrochamiento.
La complejidad del genoma es la cantidad total de pares de bases que no se encuentran en
secuencias repetidas en ese genoma, las curvas Cot permiten determinar esa complejidad.
En el centrómero de los cromosomas se encuentra el ADN satelitas a o alfoide, picos
secundarios.
El ADN se encuentra en paquetes organizados llamados cromátidas, dos idénticas
constituyen un cromosoma. Cada núcleo tiene dos juegos de cromosomas. Cada par se distingue
por su tamaño, características de forma y patrón de bandas en el color de bandeado. Dentro de
cualquier cromosorna, el ADN esta compactado en varios 6rdenes sucesivos de
ernpaquetamiento, de los cuales los mejores conocidos son los primeros: el nucleos6mico y el de
la fibra de cromatina de 30 nm de espesor.
Están muy compactados, nucleosómico, fibra de cromatina (solenoide), agrupamiento de
lazos y espiralización de cromátida. En los primeros 2 se empaca en espiral sobre cada
nucleosoma, dos vueltas de hélice izquierda. Los segundos 2 es helicoidal e izquierdo y forma la
cromatina de microscopios electrónicos. Los lazos son porque en sus brazos se haya el armazón
nuclear y por último espirilización.
Los elementos del cromosoma son los centrómeros, telómeros y orígenes de replicación.
ADN centromérico, el ADN alfoide son 172 pb, 17 nucleótidos llamados caja de CENP-B
que se unen a la proteína centromérica CENP-B. Región estrechada de la cromatina, asociadas las
cromátidas hermanas y los cinetocoros (elementos que se observan en la mitosis y se insertan
microtúbulos. El cinecotoro es proteico, ADN en su placa interna y trilaminar.
Porteína ATPásica (movimiento), kinesina (microtúbulos) y CENP-E. La estructura de los
centr6meros humanos es compleja, pero al menos tres componentes son esenciales para un
centr6mero funcional: una cantidad umbral de ADN alfoide, la proteína CENP-B que se asocia al
anterior, y la CENP-C que es propia del cinetocoro funcional. Además, es obvio que los
centr6meros humanos son poliméricos, formados por un número de unidades
repetidas, posiblemente en relaci6n con el número de rnicrotúbulos insertados por
cromosoma (una docena) y la necesidad absoluta de su funcionalidad para conservar el genoma.
El ADN telomérico está constituido por repeticiones TAGGG. 12 nucleótidos, rica en guanina,
no doble hélice y termina en 3’. Imposible replicarse, ya que el 3’ no tiene una secuencia
adicional para ser apoyo al primero de ARN. Telomerasa es transcripta inversa, usa lo rico de la
G para asociarla a su ARN.
Cada cromosoma es un orgánulo complejo. La cromatina tiene individualidad y especificidad
para reaccionar con moléculas o segregados específicos. Existen modificaciones químicas de las
histonas nucleosomales. Códifgo de histonas. Modificaciones epigenéticas. Porteínas actúan en
lugares específicos. Determinan la actividad de genes, modificación de histonas (Acetilación,
metilación, fosforilación, ubicuitinación y otras).
Partícula nucleosómica formada por tetrámeros de histonas H3, H4, H2A, H2B es el núcleo
donde el ADN se enrolla 2 veces.
Factores de remodelación de la cromatina, proteínas HMG (SRY).

1.1.2 Función
EI genoma hurnano, constituido por 3.000 megabases (3 x 109 bases), posee una
estructura compleja que, adernas de las secuencias de bases que codifican genes estructurales de
ARN (de ARNr,ARNt) y las que codifican proteinas, posee numerosos segmentos con otras
significaciones, que constituyen alrededor del 90% del ADN total. Se clasifican por
funcionalidad o por su grado de repetición.
ADN en centrómeros, telómeros de cromosomas. Y repetidas o en Tándem. El ADN
telomérico es el simple, repeticiones TTAGGG, de 2 mil a 10 mil veces seguidas.
Codificar proteínas o acomodarlas. EL ADN alfoide consta de de unidades de 171 pares
de bases. Varía según el cromosoma. Importante por su proteína específica del centrómero, la
CENO-B.
Es decir que el cromosoma nosólo posee informaci6n para la síntesis bioquímica de las
proteínas, sino también información esencial para su propia estabilidad y replicación,
ordenamiento mitótico e interfásico y acceso a su propia información.
Los orígenes de replicación son muy abundandtes (20 mil) y se hallan en las bandas R.
Las acetilaciones de lisina y arginina liberan o fluidifican la estructura de la cromatina
haciendo posible la transcripción, la desacetilización deja libres las cargas positivas e inhibe la
transcripción.
1.1.3 Genoma codificante y genoma no codificante
Hay secuencias de elementos propios del organismo (ARN y proteínas propias) y
elementos accesorios o ajenos al organismo (retrposones y transposones). Requieren 3 bases
(codones) para iniciar la transcripción y traducción en los ribosomas.
Pueden ser estructurales (ADN satelital, centromérico y telomérico), regulatorias
(promotores, estimuladores, etc.) o de función desconocida (ADN intergénico).
ADN desperdicio o basura.
El ADN satélite o a alfoide, participa en las estructuras centroméricas. Otras funcionan en
secuencias teloméricas.
Los retrosposones comprenden varios tipos de secuencias: LINEs, SINEs y Pseudogenes
procesados.
El SINEs es característico de los primates, bandeado G de los cromosomas. La familia de
secuencias Alu, llamada así Porque presentan en sus extremos sinos de restricci6n para la enzima
AluI (extraida de Arthrobacter luteus, sitio 5' AGCT-3') Alu es muy abundante; hay unas 500.000
copias de esta secuencia de 300 pb, pero están localizadas casi exclusivamente en las bandas R (0
reversas), esto es, las bandas que aparecen claras en el bandeado G de los cromosomas humanos.
El ADN LIHs son restos fósiles de retrovirus insertados en el genoma humano.
Los "pseudogenes" son genes incompletos no funcionales, originados por una duplicación
de un gen, cuya copia se torna no funcional por deleciones o inserciones que cambian el marco de
lectura u otras mutaciones que mutilan la estructura del gen, tal como la inserción de codones
terminales. Típicas en la globina a y b de las globinas humanas. Los procesados provienen de
ARN mensajeros que presentan una región terminal (lado 3’) como la B-tubulina y la de
inmunoglobilinas. Presentan cortes. Implican la duplicación de genes.
1.1.4 Genoma mitocondrial
Es circular. Causan enfermedades lineales maternas, su tasa de mutabilidad es 10 veces más
alta que en la nuclear debido a su falta de sistema de reparación de errores sofisticado.
1.1.5 Regulación de la expresión génica
Activación del gen del interferón B, IFN-beta. GCN5/PCAF Lleva la acetilación de las Lis8 de
las H4 y lisinas 9 y 14 de la H3.
HDAC (desatilasas de histonas) represionan la expresión génica. 19 proteínas HAT acetilan
residuos de lisina.
Metilación de las histonas:
Las metilasas de histonas hacen cambios permanentes pero reversible por la LSD1, por
ejemplo. Participan desde señalización de áreas de la cromatina silenciadas, es decir,
participan tienen un cambio epigenético de largo alcance mantenimiento de expresiones
génicas. Lisina H3 (4K) activa, la posición 9 (K9) metilada de efecto represor.
La K9 está en centrómeros, subteloméricas. La heterocromatina constitutiva requiere una
proteína auxiliar, la HP1 en el cromosoma activo X.
Barreras de la extensión de heterocromatización, límite geográfico. La metilación de la lisina
79 interviene.
Metiltransferasa humana SUV39H tiene un crodominio (módulo espacial de 50 aa conservado
evolutivamente).
Metilación de citosinas. Intervienen en la metilación de las CpG en la región del gen FMR1,
síndrome de X-frágil. Mutaciones de la proteína MECP2 originan síndorme de Rett (regiones
metiladas CpG del ADN) y desacetilasa (HDAC). La metilación puede no ser normal, pero es
un mecanismo de silenciamiento en la modificación de histonas.
Interferencia de ARN (ARNi). Detectado por la célula para degradar el ARN de doble cadena.
Inactivar la expresión de cualquier gen, aspecto técnico, herramienta tecnológica.
El ARNdc que da origen al noqueado génico puede ser un sector de ARNm transcripto o por
transposones, o puede ser un virus de ARN exógenos al organismo. Más de 30 nucleótidos
desencadenan la respuesta inmune a virus. Por ello se usan ARNi pequeños de 21 o 22 de
largo. Comprende 3 etapas.
1. El ARN inductor encuentra una ARNsa de tipo III, y corta ese ARN en trozos menores de
21 o 25 de largo.
2. El complejo RISC recoge los fragmentos del paso 1 busca un ARNm con secuencia
complementaria y lo degrada usando al ARNsi como molde y una ARNsa para cortarlo.
En plantas impide virus. En invertebrados la proliferación de transposones. En los humanos no se
inicia con ARNdc mayor a 30 nucleótidos, no se potencia con polimerasas y las proteínas son
diferentes. Utilidad médica como en la hepatitis C, silenciamiento experimental de genes
anormales.
Las moléculas pueden ingresar al núcleo y ejercer efectos sobre la expresión de genes, pues ahí
hay receptores nucleares (proteínas) que se ligan a estas y actúan como factores de transcripción.
A veces son complejos de proteínas (se miden con correguladores: correpresores y
coactivadores). Los efectos de los receptores dependen de los modificantes de histonas y
remodelación de la cromatina, por ello no puede ejercer directamente sobre una cromatina
reprimida. Pueden ser receptores hormonales, o huérfanos. Se conocen 50 en el humano. Su
estructura es dos dominios y algunos accesorios. Receptores de proteína RRE (elementos de
respuesta al receptor) y de hormona es elementos de respuesta a la hormona (HRE).
Receptor de andrógenos RA es una proteína cuya mutación puede producir SÍNDROME DE
INSENSIBILIDAD COMPLETA A LOS ANDRÓGENOS (SICA), síndrome de testículo
feminizante, gen en el cromosoma X. 404 productos de transcripción de genes de 32 968 tienen
diferencias mayores de 200 en el nivel de expresión génica. Algunos son genes reguladores
importantes en el desarrollo embrionario. Quedan estabilizados por modificaciones de la
cromatina en los clones de fibroblastos.
Otras formas de regular la expresión génica, es el que mide la vida media del ARN transcripto y
los mecanismos postranscripcionales de regulación.
Los cambios epigenéticos son cambios en las funciones génicas que son transmitibles por
mitosis, pero no cambia la secuencia del ADN. Síndrome de Prader-Willi, Angelman.

1.2 Herencia
1.2.1 Mendeliana
1.2.2 No mendeliana
1.2.3 Mitocondrial

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