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Bioquímica General
Proteínas. Las proteínas biológicamente activas son polímeros que
constan de aminoácidos enlazados por uniones peptídicas covalentes.
Por su tamaño.
Chica si contiene de 50 a 200 aminoácidos
Mediana si contiene de 200 a 500 aminoácidos
Grande si contiene más de 1000 aminoácidos
Sus masas moleculares serán cada vez mayores al aumentar el número
de aminoácidos.
Por su composición.
1. Estructura Primaria
2. Estructura Secundaria
3. Estructura Terciaria
4. Estructura Cuaternaria
La estructura primaria. Es el orden en que los aminoácidos
individualmente están unidos covalentemente, también llamada
“Secuencia de Aminoácidos” ejemplo:
Leu-Gly-Thr-Val-Arg-Asp-Hist
Estructura Primaria
Estructura secundaria. Es el arreglo en el espacio de
los átomos en el esqueleto peptídico, sin tomar en cuenta
las cadenas laterales.
Β-láminas plegadas
Estructura terciaria. Es la relación espacial total tridimensional
de la proteína, en donde se toman en cuenta el esqueleto
peptídico, las cadena laterales y todos los átomos de la proteína.
Anemia Falciforme
La estructura primaria de una proteína determina los
demás niveles de su estructura.
ϕ (phi) C-N
Ángulos
Ramachandran
Ψ (psi) C-C
La conformación de una columna proteínica se describe
especificando los valores de ϕ y Ψ para cada residuo (-180°
a 180°).
En las proteínas a menudo dos tipos de estructuras secundarias
aparecen de forma repetitiva formando puentes de hidrógeno como son
la helice-α y la hoja β-plegada (o lámina β).
Las hélice-α es de tipo varilla e implica solo una cadena polipeptídica.
La estructura de la hoja β-plegada puede tomar un arreglo
bidimensional y puede implicar una o más cadenas polipeptídicas.
La hélice-α esta estabilizada por puentes de hidrógeno paralelos al eje
de la hélice dentro del esqueleto de la cadena polipeptídica individual.
Contando a partir del extremo N terminal, el grupo C-O de cada residuo
de aminoácido está unido por un puente de hidrógeno al grupo N-H del
aminoácido.
La conformación helicoidal permite un arreglo lineal a los átomos
implicados en el establecimiento de los puentes de hidrógeno, lo cual le
da a los puentes máxima resistencia, por lo que esta conformación es
muy estable.
Hay 3.6 residuos por cada vuelta de la hélice, y el paso de la hélice y (la
distancia lineal entre los puntos correspondientes de vueltas sucesivas)
5.4 Å angstrom.
En el Sistema Internacional (SI) de medidas
Angstrom 1Å= 10-8 m
Nanómetro 1nm= 10-9 m, Picómetro 1pm=10-12 m.
Las proteínas tienen cantidades variables de estructuras α-helicoidales.
Estructura de la hélice-α
Estructura de la hélice-α
Factores que pueden perturbar la hélice-α
El aminoácido prolina crea un doblez en la cadena debido a:
1) La rotación alrededor del enlace entre el N y el C-alfa es muy restringido.
2) El grupo α-Amino de la prolina no puede participar en la formación de puentes de
hidrógeno intracadena.
Factores que pueden perturbar la hélice-α
Cadenas Paralelas
Cadenas Antiparalelas
Cadenas Antiparalelas
Cadenas Paralelas
PROTEÍNAS FIBROSAS Y GLOBULARES
FIBROSAS.
Fibras de colágeno. Componente del hueso y tejidos conectivos, proteína
más abundante en los vertebrados. Formada por 3 cadenas polipeptídicas
enrolladas una de otra en un trenzado de triple hélice.
Acidos/Bases
Rompe puentes de hidrógeno entre grupos polares y los enlaces iónicos.
Agitación
Agita las cadenas hasta que se rompen.
Las proteínas pueden ser desnaturalizadas por medio de
calor, pH extremos y sustancias químicas específicas.