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Bioquímica Parcial 3

Este parcial incluye regulación de COLESTEROL

Lipoproteínas y dislipidemias
 Quilomicrones son 90% de lípido  entre más lípidos y menos proteínas son de menos densidad
 LDLsd  LDL pequeñas y densas  son más aterogénicas que cualquier otra LDL
 Función de quilomicrones  Transporte de TG exógenos
 Función de VLDL  transporte de TG endógenos
 La VLDL  Apopoliproteína C-II
 Metabolismo
o Los quilomicrones se producen en intestino  linfa  circulación sistémica  en tej periféricos hay LPL
(lipoproteína lipasa) que capta al quilomicrón  la lipasa lo hidroliza y reduce el tamaño del quilomicrón hasta que
ya no pueden ser detectados por la LPL  los remanentes se van a tejido hepático donde se convierten en
o Los quilomicrones se forman después de comer & normalmente se depuran después de 4 horas
o En el intestino delgado se fabrican también las iHDL  este es una HDL naciente o discoidal que  con el paso
del tiempo la LCAT (una enzima) el colesterol se esterifica y se va al centro  la HDL esférica que conocemos es
la MADURA
 Se producen en Hígado y puede que cuando quilomicrones y VLDL pierden un pedacito se convieertan en
iHDL
o Las VLDL see forman en hígado y protan TG que agarraron en hígado, son captadas por LPL y las hidrolizan
hasta que se hacen IDL y se van a tejido hepático para ser excretadas
 Se puede ir a tejido hepático y se convierte en LDL por una HL que lleva colesterol a tejido extrahepático
 ENTRA A HIGADO A DEPOSITAR COLESTEROL POR MEDIO DE TRANSPORTADOR LDLR
o Las HDL se forman a partir de Apolipoproteínas y iHDL que llevan colesterol a tejido hepático para ser excretados.
 Toman colesterol en tejidos periféricos  lo esterifica  se hace redonda
 Se requiere de APOC2 porque activa a LPL para que empiece a hidrolizar y sacar los TG para meterlos a células.
o Se encuentra en Quilomicrones y VLDL
 Estos necesitan -OH para poder estar en membrana
 Los esteres de colesterol salen hasta que se convierte en LDL
 Metabolismo malo
o NO hay receptores para IDL o LDL hipercolesterolemia familiar  Gente no expresa los receptores y LDL / IDL
no son captadas por hígado por lo que las LDL se quedan circulantes
o Las LDL se van normalmente a su receptor LDLR  pero como tiene mutación tampoco se expresan los
receptores en tejidos extrahepáticos  niveles altos de colesterol ciruclante  es genético la familiar
o Personas con hipercolesterolemia familiar es difícil de controlar
 Metabolismo por dieta alta en colesterol
o Llega colesterol exogeno a tejido hepático por quilomicrones y llega a LPL  se hace quilomicrón remanente
captado por LDLR y llega a hígado con TG alto  Si TG llega a hepático  baja la expresión por alta cantidad de
colesterol que se detecta en RE de hepatocitos  no se produce más enzimas reguladoras ni más receptor  se
capta menos  más circulante
 Clasificación de las dislipidemias por perfil lipídico
o Hipercolesterolemia aisladas  colesterol total >200 mg/dL con TG <150 mg/dL  SOLO colesterol alto
o Hipertrigliceridemia aisalada  colesterol total <200 mg/dL con TG >150 mg/dL  SOLO TG alto
o Mixta  Colesterol total >200 mg/dL con TG >150 mg/dL  TODO ALTO
o Colesterol HDL bajo aisalado  Colesterol HDL <40 mg/dL
 Clasificación según etiología
o Primarias  hay un defecto genético. Aparecen en más de un familiar , se asocian con niveles de lípidos y
lipoproteínas considerablemente alterados con respecto a los valores de referencia. OCASIONALMENTE
presentan manifestaciones clínicas características, se asocian a enfermedades cardiovasculares prematuras.
 Hipercolesterolemia familiar  receptor LDL mutado
 Defecto familiar de Apo B100  apo b100 esta mutado
 Deficiencia familiar de LPL  gen mutado de LPL  en muestra de sangre se observa turbio
o Adquiridas  son producidas por situaciones que derivan de hábitos incorporados como tabaquismo
 Tablita de pres
 LA incatividad física puede llegar a disminuir las c-HDL
o Secundarias  aparecen como resultado de otra enfermedad
Agregar tablita de valores de colesterol
 Fórmula de friedewald
o ColT= HDL-col + LDL-col + VLDL-col
 VLDL-col es dificil y caro de cuantificar  NO  se calcula como TG
Col .Total – HDL−col−TG
o LDL-col =  creo que es TG/5 y no lo otro pq TG/5 es VLDL pero preguntar isis!!
5
 Calculado  si la persona trae más de 400 mg/dL calculo ya no sirve!!!!!
o Se debe de medir en ayunas de 12-14 hrs
 Colesterol no-HDL  suma de colesterol LDL + VLDL
Aminoácidos
Catabolismo de aminoácidos
« Su primer paso es la desaminación (-NH4) y queda un esqueleto carbonado, el cual se metaboliza a un -cetoácido
que se puede ir a cetogenesis o a CK para oxidarse, gener coenzimas reducidas o llegar a oxalacetato  glucosa.
« ¿Qué pasa con el grupo amino?
o A pH fisiológico, se convierte en amonio (NH4+)
 Tóxico para el SNC  causante encefalopatía hepática
 Se convierte en urea en hígado, para su eliminación
 Urea es muy soluble en agua
 El amonio se ha de transportar al hígado en una forma que NO es NH4  se tiene que disfrazar
o En forma de glutamina o de alanina
o Amoniaco  NH3+
« Enzimas claves en la desaminación
o Transaminasas o aminotransferasas: Pueden transferir grupos aminos entre aminoácidos
 La mayoría de las transaminaciones van para -cetoglutarato  y dee donde se lo quita (el grupo amino)
se crea un -cetoácido.
 Se requiere piridoxina/Vitamina B6 para realizar esta función enzimática.
 GPT/ALT  alanina aminotransferasa  desamina a la alanina que se hace piruvato y le da el grupo
amino al -CG para hacer glutamato.
 GOT/AST  Aspartato aminotransferasa  De asp + -CG = oxalacetato + glutamato
 LISINA & TREONINA  no tienen una transaminasa.
o Glutaminasas: genera NH4+ y glutamato a partir de Gln
 Si esta reacción ocurre en hígado, todo bn  si ocurre en tejidos periféricos se necesita transportarlo
disfrazado de GLN o ALA a través de circulación para que llegue a hígado.
 (me falta algo aquí, disocie)
 Es la única que quita el NH4 de cadena lateral, las demás del carbono alfa
o Glutamato deshidrogenasa: produce NH4+ y -cetoglutarato - le quita el grupo amino al glutamato y deja al
amonio libre
 Es una desaminación oxidativa  quita el grupo amonio y lo deja libre, requiere de NAD+  NADH y tmb
sale -CG
 Se encuentra en mitocondria y es una reacción reversible.
 Regulación
 ADP  estimula
 GTP  inhibe
o Glutamato sintetasa: Le pone el grupo amino a glutamato
 Se necesita un ion amonio libre (NH4), glutamato y ATP  glutamina + ADP + Pi
 El nitrógenos de la glutamina puede convertirse en urea en el hígado
« TODAS LAS REACCIONES DE CARBOXILACIÓN NECESITAN DE BIOTINA
« La mayor parte de la desaminación ocurre en tejidos extrahepáticos
o Músculo utiliza aminoácidos como fuente de combustible en ejercicio prolongado y el ayuno
« El nitrógeno DEBE de viajar en forma de alanina y/o glutamina
o Para viajar debe de meterse al ciclo de alanina para que llegue a hígado.  se utiliza la alanina transaminasa
para que se convierta en alanina y en hígado la glutamato deshidrogenasa hace su acción.
o Ciclo de la glucosa alanina: Glucosa llega a musculo  piruvato  alanina 
sangre para ir a hígado  transaminación para hacerse piruvato 
gluconeogénesis  glucosa  se va a músculo  glucolisis  ciclo.
« Integración de las enzimas de las desaminaciones
o (foto de pres con un chorro de flechas “Transporte de N al hígado”)
o Los aas se desaminan x transaminasas  se hace un glutamato
 En tej periféricos se hace un ion amonio libre y se lo incorporamos a
glutamato  se hace glutamina (en tej periféricos se produce glutamina)
 Esta glutamina sale a circulación y llega a hígado, la glutaminasa actúa sobre ella  le quita su grupo
amino y se convierte en glutamato  El ion amonio que YA le quitaron (falta 1) se va a ciclo de urea  el
glutamato x medio de la glutamato DH se hace en cetoglutarato y se libera un ion amonio que se va a ciclo
de la urea.
o En músculo la degradación de proteínas libera aas que son deesaminados para hacer glutamato o puede
reaccionar con una transaminasa  alanina  se va ahígado y ciclo glucosa alanina.

« Posibles causas de la toxicidad del amonio


o Bajan niveles de cetoglutarato al empujar la reacción de la Glutamato DH hacia la formación de GLut y la de la Gln
sintetasa hacia la formación de Gln  Baja actividad de CK  baja producción dde ATP en neurona porque
ambas enzimas son abundantes en tejido nervioso.
 Porque bajan  porque tienes niveles altos de NH4
 También el glutamato se puede convertir en glutamina por la Gln sintetasa
o Baja la relación NADH/NAD+  baja la producción de ATP
 Porque no se producen los NADH  no fosforilación oxidativa  baja ATP
o Bajan los niveles del glutamato al acelerar la síntesis de Gln por la Gln Sintetasa  Baja la concentración de
neurotransmisores glutamato y GABA (glutamato es precursor)  si glutamto baja su concentración  baja
respuesta neuronal
o El exceso de Gln es tóxica para astrocitos

Regulación
 Glutamina sintetasa
o Controlada por modificación covalente reversible
 Si se adenila por medio de ADENILTRASNFERASA + proteína reguladora en estado A se hace menos
activa
 Si se desadenila por medio de ADENILTRASNFERASA + proteína reguladora en estado D  se hace MAS
activa.  es una fosforolisis
 Lo que hace que una proteína (A o D) se una al adeniltransferasa es  ATP y cetoglutarato (para
que pase a Proteína D) la glutamina inhibe este proceso  inhibe la síntesis de glutamina
o La glutamina estimula que se cambia de A  D, mientras que el cetoglutarato inhibe este
cambio.
 ¿Cómo cambia la proteína A  D?
o Uridil transferasa  Cambia la proteína reguladora  la puede pasar de A a D
 Activada por  ATP y cetoglutarato
 Inhibe  glutamina

Ciclo de la urea
« Hay organismos (us) que eliminan el grupo amonio en forma de urea  ureotélicos
« Aspartato y ion amonio  el que le da el grupo amonio a la urea
« Su primera reacción no esta en el ciclo
« Una parte ocurre en mitocondria (primera reacción) y otra en citosol
« Su enzima reguladora es  carbamoil fosfato sintetasa 1
o Sintetiza carbamoil fosfato y necesita 1 ion amonio, bicarbonato y 2 ATP
« La ornitina reacciona con carbamoil (en mitocondria)  citrulina (sale y ya de aquí todo en citosol)  reacciona con el
aspartato para hacer argininosuccinato  se rompe la molécula y se hace fumarato  se va a ciclo de Krebs 
queda la arginina y se hidrolisa y se hace urea
o Y queda ornitina  tiene un transportador que la lleva a mitocondria para volver a iniciar el ciclo
« Busca eliminar el ion amonio
« La tablita de las enzimas solo hacerle caso a las amarallias
« Se une con CK  por el fumarato y por el aspartato (porque sin grupo amino es oxalacetato)
« Regulación
o A corto plazo
 Se regula la carbommoil fosfato sintetasa I  el n-acetil glutamato la estimula
 Acetil-CoA + glutamato = N-acetilglutamato
 N-acetylglutamato sintasa es la enzima que lo hace
 Activada por  Arginina
o A largo plazo = nos lleva más tiempo
 Biosintesis de las enzimas del ciclo  hay ciertos estimulos que hacen que se expresen más estas 5
enzimas del ciclo  + enzimas= + ciclo  estimulada por un aumento de proteínas en dieta y un
aumento en la degradación de proteínas endógenas (inanición)

Destinos de la cadena carbonada de los AA ( preguntará en examen)


- Los 20 aas convergen a solo 7 metabolitos distintos
o Piruvato
o Oxalacetato
o Fumarato
o Succinato
o A-cetoglutarato
o Acetil-CoA
o Acetoacetil-CoA
Transaminasas
 Limite de 40 en laboratorio
o Pero preocupate cuando trae el doble o más
 En el hígado se producen múltiples reacciones de transaminación pero las de importancia méduca son
o Aspartato-aminotransferasa (AST)  vida media de 18 hrs
 Se encuentra en citosol y mitocondria  se encuentran en hígado, corazón, músculo esq, riñones,
erebro, páncreas, pulmón, ertitrocitos y leucocitos.
o Alanina aminotransferasa (ALT)  vida media de 63 hrs
 Más especifica de daño hepático porque se localiza mayormente en citosol de hepatocitos
 Son asociadas a enfermedades hepáticas
o Son la causa más importante del aumento de la actividad de la ALT y frecuente del aumento de la actividad de la
AST
 Ambas enzimas estan normalmente bajas en suero con valores inferiores a 40 U/L
o Son factores que pueden
modificar los resultados de una
prueba de laboratorio (anotar
cuales son los factores y
masomenos los porcentajes.
o Agregar las patologías
 Abuso de alcohol
 Una vez comprobada la
hipertransaminasemia real, será la
anamnesis y una exploración física
detallada
 El cociente AST/ALT nos oriente sobre
una patología determinada según el
siguientes esquema (solamente sirve
cuando los AST y ALT por si solos
estan fuera del rango normal)
o <= 1  hepaittis vírica
o >2  cirrosis de cualquier etiología
o >4  fallo hepático agudo
 Ante una ALT elevada y confirmada se empieza a buscar marcadores para hepatitis en especial la viral (VHA, VHB y
VHC)
o Si los marcadores virológicos son NEGATIVOS la siguiente etiología a descartar será la lesión hepática por
tóxicos o medicamentos.
 Principales fármacos hepatotóxicos
o Paracetamol
o Acido aminosalicilico
o Isoniazidas (cuidarle las transaminsas)
o Sulfamidas
o Metildopa
o Ketoconazol
o Verapamilo
o AINES

NUCLEOTIDOS
Sintesis de pirimidinas
 Tienen un solo anillo en su estructura
 De los 6 átomos del anillo  4 provienen del aspartato y los otros 2 del carbamoil fosfato (viene de HCO3 y NH4)
o Una vez que se hace el anillo se une a PRPP y se hace  UTP  a partir de UTP se sintetiza CTP y TMP 
a partir de CTP se hace desoxiCTP
 Para hacer carbomoil fosfato se gastan 2 ATP
o Lo hace la carmoil fosfato sintetasa 2
 Es citoplasmática
 Utiliza glutamina como fuente de NH3
 INHIBIDA por UTP
 ACTIVADA por PRPP y ATP
 Carbomoil fosfato  entra el aspartato y con aspartato transcarbamilasa se une el N  se deshidrata con
dihidroorotasa y se hace dihydroorotato  que por la dihidroorotato deshidrogenasa se hace ácido orotico / orotato
o El orotato se une a PRPP sobre el carbono 1 del PRPP y sale  orotidilato (nucelosido)
 El PRPP viene de la ribosa-5-P + ATP
o Al ácido orotico para hacerlo en UMP se necesita descarboxilarse por orotidilato descarboxilasa (inhibida por
UMP)
 Fuentes de UMP
o HCO3, glutamina, aspartato y ATP
 Regulación
o Carbomoil fosfato sintetasa 2
o Orotidilato descaboxilasa

 De UTP a CTP
o Por la CTP sintetasa  inhibida por CTP
o See necesita glutamina y agua  se utiliza un grupo NH3 y sale glutamato  se utiliza ATP
 De UTP a TTP

Sintesis de Purinas
- Se necesita
o Glutamina
o Aspartato
o CO2
o Glicina
o Formyl tetrahydrofolato (THF) (derivado del ácido folico)
- Se sintetizan los 2 anillos sobre el PRPP (ribosa 5 fosfato + atp)
- PASOS SIN ENZIMAS!!!
o Fosforibosil-amina  que viene del PRPP + GLN + H2O  entra Gly y ATP  para hacer glycinamide
ribonucleótido  entra THF con CHO y ( poner diagramita de pres y checar cambios en estructura de cada
uno)

o El resultado de estas reacciones es inosina monofosfato (IMP) con base de HIPOXANTINA


- Puede preguntar quien es el donador de nitrógeno o de carbono
- Adenosina, inosina  nucleósido
- Adenilato, uridilato inosinato  nucleótido
- Del IMP a AMP
o Se necesita Asp para donarle un NH y sale fumarato
- De IMP a GMP
o Se reduce un NAD+  NADH  se hace xanrhylate  se necesita un grupo amino que viene del glutamina
- Vitamina B9 / ácido fólico
o Es ácido porque tiene muchos grupos funcionales
o Su Nitrogeno 5 y 10 son importante porque son en donde se cambian y varia el tipo de ácido folico
 SLide con titulo derivados del ácido folico
 Solo varian en que se les agrega carbonos y son donadores de fragmentos monocarbonados como el
metilo, metileno, formilo, metenilo, formimino
o Importancia en embarazadas
- Regulación
o GMP; GTP; GDP / AMP; ADP; ATP inhiben a la ribosa-5-fosfato pyrofosfoquinasa (sintetiza PRPP)
 Tmb inhiben a glutamina prpp amidotransferasa
 El PRPP la estimula
o GMP  inhibe a la IMP deshidrogenasa
o AMP  inhibe a la Adenilosuccinato sintetasa

Vía de recuperación
 Para hacer nucleótidos a base de algo
 Guanina + PRPP  guanilato + PPi  hipoxantina-guanina fosforribosiltransferasa
o Una deficiencia de esta enzima  Lesch-Nyan
 Hipoxantina + PRPP  inosinato + PPi  AMP o GMP
 Adenina + PRPP  Adenilato + PPi  adeninan fosforribosiltransferasa

Síntesis de desoxirribonucleótidos
 No se sintetizan de novo a partir de desoxirribosa, sino que se sintetizan por reducción de los ribonucleótidos difosfato
o Deben de perder el OH del C2 sustituyendolo por un hidrogeno
o La ribonucleótido reductasa cataliza la acción
o Se utiliza NADPH  dador último de los dos electrones
 Los electrones se transfieren por vía tiorredoxina o glutarredoxina
o La síntesis culmina con la fosforilación de los dNPDs a dNTP
 Los ribonucleótidos pierden su OH o se reducen y se hacen desoxirribonucleótidos por medio de la ribonucleótido
reductasa
o Esta enzima se oxida (se hace un enlace disulfuro)
o La reducida es la que necesito para este proceso
o ¿Cómo vuelve a la forma reducida? HAY DOS CAMINOS
 Tiorredoxina
 La tiorredoxina reducida ayuda a reducir a ribonucleótido reductasa, pero la tiorredoxina se oxida 
¿quién la reduce?  FADH, pero este se oxida y se tiene que reducir  NADPH lo reduce, y este se
oxida y luego se va a pentosas fosfato para que se vuelva a reducir
 Glutaredoxina
 Le dona electrones a la ribonucleótido reductasa y se oxida  el glutatión reducido la reduce pero se
oxida  NADPH lo vuelve a reducir por medio de la glutatión reductasa

 La ribonucleótido reductasa puede reducir al ADP, CDP, UDP y GDP,


pero NO AL TTP
o Tiene un sitio de especificidad de substrato
 Donde solo entra el ATP, dATP, dGTP y dTTP
 Dependiendo de cual entre aquí es el que entre en el
sitio activo
o dTTP  GDP
o dGTP  ADP
o ATP & dATP  UDP y CDP
o Inhibidor  dATP
o Actividor  ATP
 Si hay mucho ATP todo el el sistema se activa
 El dTMP (nucleótido de timina con 1 fosfato que carece un OH)se sintetiza por
metilación de dUMP con la tinidilato sintasa
o El dUMP se genera a partir de dUTP, con lo cual se mantiene baja la
concentración celular de dUTP para que la DNA polimerasa no se confunda
o Sin dUMP no se puede sintetiza dTMP  no se sintetiza de novo
 Timidilato sintasa
o En ella se introduce un metilo en la dUMP que lo aporta el ácido folico THF
 Este se regenera con la dihidrofolato reductasa que utiliza NADPH y dihidrofolato (son sus sustratos) y con
la serina hidroximetil transferasa que utiliza serina

 Una célula tumorosa


o Requiere muchos dNTP
o Entonces se debe inhibir una de las tres enzimas anteriores y ya así no puede replicar DNA
o El fluorodesoxiridilato es un INHIBIDOR suicida de la timidilato sintasa
 La enzima lo reconoce como si fuera el sustrato y se unen por enlace covalente
 Entonces la célula ya no puede crecer entonces afecta a TODO
o El metotrexato o aminoprterin inhiben a la dihrofolato reductasa  son inhibidores competitivos
 Se limita la producción de THF y ps ya no se puede hacer más dTMP
 Se llaman antifolatos
 Los antifolatos son patentes agentes anti cancer
 El metotrexato tiene una estructura similar al dihidrofolato y la inhibe a la enzima …. Tengosueño

Degradación de nucleótidos de purina


 La 5`nucleotidasa convierte nucleótidos en nucleósidos
o Abunda en tejido hepático
o Entre sus ventajas esta  solo se eleva en enfermedades hepáticas
 Se utiliza para evitar confundir
o No se produce en la placenta  no se eleva en embarazo  se utiliza para descartar problemas hepáticos que
tengan que ver con el embarazo
 La guanosina le quitamo su azúcar y queda la pura base nitrogenada  se oxida y se hace xantina xantina oxidasa
 se hace ácido urico
 En adenosina se le quita el NH4 y se hace Inosina  se le quita azucar y queda la base hipoxantina  xantina 
ácido urico
 Alopurinol es similar a la hipoxantina y es inhibidor de la producción de ácido urico de la enzima xantina oxidasa
 Purinas se catabolizan a ácido urico
Ácidos nucleicos
 ATP  adenosina 5 prima trifosfato
o Es primo porque en la bases también se numeran los carbonos
 Nitrogeno 9 en purinas y nitrógeno 1 en pirimidinas es donde se une el nitrógeno del azúcar
 Modelo Watson y Crick en 1953
o Proponen el modelo de moléula del ADN con una muy buena explicación
o El modelo demostraba que la molécula de ADN podría llevar info acerca de síntesis de proteínas.
o Permite explicar la replicación del ADN  es semiconservativa
 Que siempre va a tener una cadena vieja y una nueva (messelson y Stahl lo descubrieron en 1958)
 Erwin Chargaff  descubrió que hay la misma cantidad de Adeninas que de tiaminas y de Citosinas que de guanina.
o G – C son 3 enlaces
 Rosalind Franklin
o Utilizó difracción por rayos X para dilucidar la estructura de las moléculas
 La técnica sirve para determina la distancia entre los átomos de las moléculas de un cristal mediante
un análisis matemático de la silueta creada en una película
 Para saber como es una molécula
o Ella encontró la forma de hélice del ADN
 La doble hélice
o Hay 10 pares de bases por cada vuelta
o Tiene ancho constante y preciso
o Las secuencias de bases en una hilera de la cadena son COMPLEMENTARIAS
o Este modelo sugiere
 Que las secuencia de bases en el ADN hace posible el almacenamiento de información genética y que
esta secuencia se relaciona a las secuencias de aminoácidos en proteínas
 El número de combinaciones y posibles secuencias es ilimitado.
 Dogma central de la biología celular  transcriptasa reversa es lo que se le agrego al dogma de Crick

o
o Replicación de una proteína  un ejemplo son los priones  como  prion anormal se acerca con el normal
e induce cambios que lo hace malo y se acerca otro.  prion anormal funciona como molde.
o Replicación de ARN  las ribozimas catalizan ciertos procesos  no es una replicación como la del ADN

Replicación del ADN


- Lo del exones e intrones (no tome notes pq me Sali, pero es lo que vimos con el manuelmillan)
- Un adn circular se puede superenrollar  por las topoisomerasas
- El adn de una persona de 70 kg va a medir para ir a la luna, darle varias y vueltas y regresar
- La hebra de DNA le da dos vueltas a la histona  cada bolita es un nucleosoma
o Se tienen 5 tipos de histonas  H2B, H2A, H3 y H4  forman el nucleosoma 8 de estas histonas
 La H1 sella para que DNA y la histona no se separen y esta por afuera
o Ya que se tiene la cadena de histonas  se acorta el tamaño del ADN  cada nucleosoma se va
acomodando para hacer un tipo tunelito  Hiposolenoide (es la forma más compacta)  el solenoide se
compacta más y se hace el supercoil  se compacta más hasta llegar a la forma típica del cromosoma “X”
- El brazo P es el corto y el Q es el largo
- Tiene un erros por cada 10 mil millones de nucleótidos
- El proceso avanza de 1000 a 3000 pb/mmin
- La dirección de replicación es 5’ a 3’
- Se lee de 3’ a 5’
- Una se forma de manera continua y la otra en fragmentos (fragmentos de Okazaki)
- Las DNA polimerasas no sintetiza de novo, necesita un cebador o primer.
- Caracteristicas:
o Semiconservativa
o Bidireccional
o Discontinua o asimétrica
- En el genoma humano hay 10^3 a 10^4 sitios para iniciar replicación
- Tarda 8 horas en replicarse y la celula tarda 24 h en dividirse

Enzimas
1. ADN polimerasas
a. Necesitan un molde
b. No comienzan de novo
c. Añaden a partir del extremo 3’
d. Requiere MAGNESIO
e. La alfa  síntesis del cebador y de la hebra retardada
i. Tiene una subunidad que actúa como primasa
f. Gamma  Síntesis de DNA mitocondrial
g. Epsilon  tiene propiedades correctoras y reparación de ADN y síntesis de la hebra retardada
h. Beta  Reparación de ADN y une fragmentos de Okazaki
i. Delta  sintetiza cadena líder
2. Helicasa  abren cadena, requieren de ATP, se transloca
3. Topoisomerasas  Alivian la tensión por torsión que provoca el desenrollamiento
a. Como lo hacen  Si hay mucha tensión, rompe una hebra para relajar y ya que este relajada vuelve a unir a la
hebra que rompió
b. SON Muy importantes en procesos de transcripción y replicación
c. Son blanos terapéuticos
d. Topoisomerasa 1  características por cortar solo 1 hebra de ADN y este misma enzima vuelve a pegar
e. Topoisomerasa 2  Cortan las 2 hebras
4. DNA primasa  inicia la síntesis de los cebadores de RNA
5. SSB /RPA en eucariontes evitan la reasociación prematura de las cadenas de ADN, son las que evitan que se
vuelva a enrrollar
6. ADN ligasa - une fragmentos de Okazaki, puede utilizar ATP
7. ADN primasa  coloca el primer para comenzar a trabajar la ADN polimerasa (son de 8 a 12 nucleotidos los que
pone)
8. FEN-1  Remueve el primer
Fases
- Fase de iniciación
o A partir de la iniciación se hacen las burbujas de replicación,
o Puntos de iniciación  Son ricas en GATC (secuencia)
o La ORC reconoce con la secuencia de bases que son el origen  se le unen las proteínas cdc6 y cdt1  la
unión de estas tres uniones manda la señal para que la helicasa (mcm) se una para que comience la
replicación  deben de llegar dos helicasas
o Las cinasas dependientes de ciclinas llegan y fosforilan a las cdc6 y se degrada para que se separen 
también fosforilan a ORC
- Fase de elongación
o Funcionan varias polimerasas  alfa, beta, gamma y epsilon
o Fase en la que tiene lugar la síntesis de nuevas hebras de ADN complementarias a cada una de las hebras de
ADN originales.

INTEGRACIÓN DE REPLICACIÓN
1. Las RPA estabilizan a las cadenas de ADN  La Pol-Alfa  coloca al cebador con su subunidad primasa  la
polalfa le agrega un cachito de ADN (20 nucleotidos) y se va
a. Procesividad de una polimerasa  Capacidad de replicación que tiene antes de soltarse
i. Beta y polimerasa alfa son de baja  sintetizan poquito y se van
ii. Delta, épsilon y gamma  son de alta porque se unen a proteínas como RFC o PCNA que la
mantienen unida para que siga trabajando
2. Llega la pol-delta sintetiza hasta encontrarse con otro cebador
3. FEN-1 quita cebador y la DNA ligasa junta los fragmentos.
Las dos polimerasas se mueven en la misma dirección (épsilon y delta)
1. Una de las hebras se queda derecha y la otra da una vuelta

Del lado donde es la hebra continua


1. Es lo mismo pero sin dna ligasa

Terminación de la replicación
1. Se remueve el primer cuadno ya estamos en los extremos cuando ya me acabe la hebra  entre 150 y 300
nucleotidos se pierden  donde estaba el cebador que se elimina y no se “paga” otra vez no se pone otra vez SE
PIERDE
2. Telomeros  Ayudan a organizar cada uno de los 46 cromosomas  previenen la fusión de los cromosomas por su
parte final
i. Proteger los extremos de las nucleasas y otros efectos desestabilizantes de los cromosomas formando una
tapita
ii. Permitir que el cromosoma se replique correctamente durante la división celular
b. Su secuencia es TTAGGG de 5’ a 3’ 15 mil pares que forman 1 telomero
c. Cada que se pierde el cachito del cebador ps se va perdiendo telomero  envejecimiento
d. Cancerosas no pierden telomeros
e. La telomerasa  enzima que permite que crezcan los telomeros y se encuentran en células madre, germinales,
linfocitos activado, endometriales del ciclo menstrual.
i. Pero las células somaticas normales tienen NULA actividad telomerasa  por eso envejecemos
ii. Desarrollo de fármacos anti-tumorales destruyen células con telomerasa ya que inactivan a la enzima
iii. Cómo trabaja  alarga a la cadena que termina en 3’
1. Ya que elongo  llega la primasa a poner el cebador y la polimerasa a trabajar y blah blah same
mechanism hasta quitar el cebador y well aja.
iv. Tiene ácido nucleico que es RNA  es una núcleo-proteína  tiene aminoácidos y ácidos nucleicos  otro
ejemplo  ribosomas, nucleosomas
f. Al final los telómeros son vueltas que forman  lazo t
i. La vuelta es estabilizada por proteínas: TRF2, TRF1, Tin2, Pot1, TPP1, Rap1,

g. Cuando se hace DNA a partir de RNA se llama transcripción inversa

Transcripción – conocer la diferencia entre enzimas de proca y euc


« Recordar JAK-STAT, PKA y MAP cinasas que estimulan factores de transcripción  estos reconocen ciertas
zonas de DNA las promotoras que le van a decir “ponte aquí” para que comience a trancribir.
« Corriente arriba  antes del primer nucleótido del gen a transcribir
« Los factores de transcripción forman un complejo proteíco que le dice a la ARN polimerasa donde empezar a
replicar.
« Principales promotores  a -25 nucleotidos TATAAAA 
« (Anotar los conceptos de la slide bn cargada que inicia con la definición de factores de transcripción)
« La transcripción y traducción son no procesos simultáneos en células eucariotas
« El proceso de transcripción es más complejo y solo se puede trancribir el ADN que constituye la eucromatina
(cromatina descondensada)
« La mayor parte de ADN genómico no se transcribe (solo se transcribe el 35%)
« El ARN trancrito primero sufre en el núcleo el proceso de maduración
« Los ARNm deben ser transportados al citoplasma para participar en la traducción.
« Intervienen 3 ARNpolimerasas diferentes (1, 2, 3) que sintetizan los distintos tipos de RNA  en bacterias solo
hay 1.
« La que lleva a cabo la transcripción son las RNA polimerasas
« RNA polimerasas
o No necesitan cebado
o Dirección de síntesis  5 3
o NO poseen actividad nucleasica correctora
o Buscan sitios de inciciación (secuencias promotoras)
o Desenrolla una pequeña parte del DNA  actividad helicasa  abren 17 pares de bases
o Selecciona el NTP y forman el enlace fosfodiéster
o Detecta señales de terminación
o Interactúa con factores de transcripción
« En bacterias no hay factores de transcripción  los factores son proteínas que reconocen al DNA, se unen para
que la ARN polimerasa se una y sepa donde empezar a codificar.
o Se tiene la subunidad sigma  permite a la RNA polimerasa el reconocimiento de las secuencias
promotoras
 Se libera cuando la cadena naciente de RNA tiene una longitud de 9-10 nucleotidos
 Puede colaborar a la iniciación con otro núcleo enzimatico (actúa como un catalizador de la
iniciación)
o Las zonas promotoras son diferentes oara todo y la sigma especifica para una secuencia tmb varia
« En procariotas  transcripción
o Primero se debe de buscar el promotor correcto para que se ubique la ARN polimerasa  la subunidad
que la busca es la sigma
 Sigma 70  estándar
 Sigma ……
 La subunidad beta es la que va formando la cadena de ARN
o Detecta la secuencia y se forma el complejo
o La sigma ya reconoce y desenrrolla hasta 17 pares de bases
o Ya se desenrrollo se forma el complejo promotor abierto  se va la subunidad sigma cuando ya se
formaron entre 6-10 nucleotidos se separa

o La cadena híbrida (porque es ARN-ADN) solamente es de 8pares de bases


o La velocidad de elongación es de 50 nucleótidos por seg
o Como termina  Deja de formarse enlace fosfodiéster, el hibrido se disocia, la región de DNA fundido se
enrolla, la RNA polimerasa se desprende del DNA.
o Mecanismos de terminación  Por proteína RO y por una señal de terminación en el RNA naciente.
 Señal de terminación en el ARN naciente
 Termina la transcripción cuando se forma la estructura combinada horquilla-oligo
 En la cadena de ADN se tienen secuencias que son repetidos invertidos  cuando salen
de la ARN polimerasa se hace el rulo-tallo  se unen y esto hace que “pierda afinidad por
la polimerasa” y ya se sueltan
 No todos los genes tienen esta señal
 Proteína RO
 Detecta secuencias de terminación que no son reconocidas por la RNA polimerasa por si
sola
 Tiene actividad de helicasa, es dependiente de ATP y se une al RNA en un tramo de 72
nucleotidos.
 Se une en regiones de la hebra de ARN ricas en citosina y pobres en tiamina  necesita
ATP para avanzar hasta alcanzar a la POLIMERASA o donde esta la hebra hibrida y
como tiene actividad helicasa ps las separa.
o Transcritos primario  es toda una cadena de ARN donde trae el tARN y el rARN se cortan por hidrolisis
o Otras modificaciones post-transcripcionales  Se pueden añadir nucleotidos al extremo terminal de
algunas bases o las puede modificar
 Esto es que le pone “bases raras” que son las no 4 comunes
« EN EUCARIOTAS
o Se tienen polimerasas de 3 tipos
 1  sintetiza RNA ribosomal
 2  en nucleoplasma y sintetiza ARNm y RNA nuclear pequeño (snRNA)
 3  en nucleoplasma y sintetiza ARNt
 La alfa-amanitina no le hace nada a la 1, la 2 es fuertemente inhibida por esta y la 3 solo
se inhibe a altas concentraciones
o Es un péptido toxico y es producido por amanita phalloides y bloquea la fase de
elongación de la síntesis de ARN
o Como incia la transcripción 
 El factor de transcripción reconoce a los promotores y la ARN polimerasa reconoce al factor  ya
inicia la transcripción
 Por lo regular el ARN que salió debe de ser madurado  se le corta un chunk leader y un intrón
 en el intrón es donde queda el anticodón so be careful porque es muy importante.
 Se le agrega la poli-A  puesta por la poli-a polimerasa
 Se le agrega la CAP  es una guanina con 3 fosfatos unidos  puede ser 0, 1 o 2 y depende si
estan o no metiladas los otros nitrógenos (cuantas esten metiladas es el numero)
 Intrones  son eliminados porque un OH de una base del intrón reacciona con un fosfato del otro
extremo del intrón  se da la vuelta el extron azul que quedo volando y su OH reacciona con el
fosfato del extron verde que queda volando
 Como sabe la adenina que tiene que reaccionar con el fosfato ese  los snRNA
o El 1 se aparea con parte del intrón en la parte en la que inicia  se ancla por
complementariedad de bases y el U2 se aparea con parte del intrón donde esta la
adenina Branch  el U6 se aparea con el U2  este apareamiento permite que
se acerquen la U1 y U2 y las demás los apoyan y ya lo separan.
Síntesis de proteínas – aquí si saberme los dos
 AUG  metionina  codon de inicio
 UAA – UAG – UGA  codones de stop
« La metionina y la Trp son los únicos que tienen 1 solo codón
« Se tienen varios codones para un aminoácido en caso de mutación
« El anticodón es el que esta en el tRNA
o Son de 73 a 93 ribonucleotidos
o Contienen muchas bases poco frecuentes
o Aproximadamente el 50% estan apareados
o 5 grupos de bases no se aparean
o (slide con las bases raras)
 Las bases que son modificadas químicamente terminan siendo estas bases raras 
modificaciones post-transcripcional
o Tiene forma de L invertida  las cuatro hélices de la estructura secundaria del tRNA se pliegan para
formar la L
« Estructura de un ribosoma
o Es un conjunto de proteínas y RNA
o La subunidad mayor tiene aprox 49 proteínas y la menor tiene 33 proteínas  en eucariotas
 Sub60S y Sub 40S  ribosoma 80S  velocidad de sedimentación se ve afectada por la forma
« Aminoacil-tRNA sintetasas
o Encargadas de pegar el aas al tRNA correcto
o La unión es crucial porque:
 EN la unión dee un aminoácido dado a un tRNA particular se aplica el código genético
 La formación dele enlace peptídico entre aminoácidos libres NO es termidinamicamente favorable
o Los aas están unidos a los tRNA por enlaces ester con el grupo OH 2 o 3 de la adenosina en extremo 3’
o Estas enzimas forman el enlace ester
o ¿Cómo lo hacen?
 El aminoácido se activa por la aminoacil-tRNA sintetasa  se activa con ATP (glutamina sintetasa
se regula por adenilación)  se le une un AMP y sale un PPi
 Tiene dos caminos  depende de la clase de la enzima  varia en el OH donde une al
aminoácido
 De clase 1  unen al aas en el C2’
o Arg, cys, Gln, Glu, Ile, Met, Trp, Tyr, Val (no es necesario aprenderse la tabla
solo características de cada clase)
 De clase 2  Unen al aas en el C3’
 Independiente de la enzima que se utiliza por medio de trasmutaciones termina en el C3
o La enzima tiene un sitio para la enzima, uno para ATP  ya que lo activo  la tRNA llega  COMO
SABE CUAL DEEJAR ENTRAR  solamente deja entrar al tRNA que tiene un anticodón que corresponda
con el aminoácido activado
o Tiene un sitio de corrección/edición
o Que pasa cuando se equivoca  si el aas es el incorrecto se va al sitio de edición  si el aas puede
entrar al sitio de edición lo corta y lo deja irse
o Hay muchas aminoacil  cada aas tiene su propia pero se dividen en clase 1 y clase 2

« Uno de los ribosomas más importantes en eucariotes es el 18s


« ¿Cómo inicia la síntesis en procariotas?
o Inicia con la secuencia con AUG  una metionina que se va a formular por N10-formiltetrahidrofolato 
formil-metionina
o Inicia con el ribosoma desintegrado  llega la sub menor reconoce unas secuencias Shine-Dalgarno
previas al codon de incio para poder colocarse SOBRe el codon de incio  se estabiliza por factores de
iniciación (1 y 3)
 Entra el ARN de trans con el anticodón correcto acompañado del IF-2 con GTP  se hidroliza el
GTP y salen los factores  llega sub mayor
 Llega la subunidad mayor y comienza la elongación
o Llega el sig tRNA  con ayuda del factor de elongación llamado TU- GTP  lo deposita en el sitio A
 El Tu se va con el GDP ya hidrolizado  llega TS y se une a TU  GTP llega y reemplaza a TS y
ya esta listo para llevar a otro tRNA al sitio A del ribosoma.
o Unión de aminoácidos
 El primer aminoácido que pusimos se une al segundo aminoácido arriba y asi va a ir creciendo la
proteína
o Se mueve el aas  se transloca el  lo que estaba en el sitio a se mueve al sitio p  deja libre al sitio A
o Después de varios ciclos se llega al codón de terminación  ya no deja entrar a tRNA  es reconocido
por un factor de liberación y esta corta a la proteína y se desensabla todo el complejo.

Traducción en eucariotas
« ¿Cómo inicia en eucariontes?  como reconoce  ribosoma reconoce al casquete
o Participan al menos 10 factores de iniciación y 3 factores de elongación
o Quien forma el enlace peptídico  ARNr28s
o El primer aas es la METIONINA no modificada, sin embargo el tRNA iniciador es diferente  el tRNA
iniciador es diferente a los otros tRNA que ponen Metionina en otras posiciones que no sean la primera 
tRNAi
o NO ExISTEN sEcUENCIAS SHINE-DaLGARNO  se usa el AUG más cercano al cap 5’  el cap es
fundamental para que ribosoma ubique bn donde ponerse 
« Formación del complejo de preiniciación
o El factor 3 y el 1ª llegan con la subunidad 40s del ribosoma y con ayuda del factor 1 se une el ARNt con la
metionina acompañado del factor 2 y esto da  complejo de pre-iniciación 43s
 Factor 3 y 1ª  favorece que se separe el ribosoma.
o Al mismo tiempo que pasa eso  en el RNAm adopta su estructura secundaria
 El complejo 4f interactua cerca del CAP  4E recluta a 4G y 4ª  la 4ª tiene propiedades de
helicasa  desdobla el apareamiento del mRNA  el 4B y el 4H van a potencias la actividad de
la 4A y requieren de ATP  ya cuando regresa a la estructura primaria el complejo de iniciación
interactua con el el 4F y se tiene un complejo nuevo  por último llega el factor 5 (utiiza ATP) 
usa ATP porque se mueve al codon de inicio  a este último complejo se le conoce como
complejo de preiniciación 48s (cuando ya esta anclado a AUG)
 Sin CAP nada de esto ocurre.
 El factor 2 cuando llego tiene un GTP  si este GTP no se hidroliza y se queda en GDP si
procede la traducción  se desastabiliza el complejo y se separa.
 Se le une la subunidad mayor y …..
 Estructura mRNA
 Primaria  las puras secuencias
 Secundaria  Estructura que tiene el RNA de transferencia  cuando se unen por
puentes de hidrogeno.
 Terciaria  La forma en L invertida del RNA de transferencia
 Reciclaje de factor 2-GTP  participa el factor 2B
« Elongación
o Se tiene el complejo 80S y el sitio A vacío  entra el siguiente ARNt y viene acompañado de un factor de
elongación 1ª y GTP  GTP se hidroliza y se suelta el factor y sale GDP  ya colocado en el sitio A el
ribosoma 28s forma el enlace peptídico  se mueve  así hasta llegar al codon de terminación  el
factor de liberación detecta el codon de terminación y viene con GTP  al hidrolizarse y hacerse GDP 
se suelta y se desensambla el complejo 80s .
« LA hipótesis de la subunidad 40s y el complejo 43s es propuesta por Kozak  esta es la ultima slide de esta pres.

PREES DEE INTEEGRACION


 Sistemas energéticos que se utilizan durante ejercicio
o Sistema ATP-PC  anareobica aláctica
 Es para ejercicio de corta duración  6-10 seg
 Emplea ATP y fosfocreatina (PC)
 Utilizan el ATP que YA estaba creado
 PC  molécula de alta energía que esta en músculo y se utiliza para sintetizar
ATP
o MÁS energética que el ATP
o Viene de la creatina y se neceita desfosforilarse para rehacer al ATP
 Liberación de energía con gran rapidez pero muy limitada  3-4 kCal
o Sistema anaerobico glucolítico o del acido lactico  glucolítica anaeróbica
 Para ejercicios de 60-90 segundos
 Entrenamientos con pesas
 Sprint de 400-800 m
 En sus primero 6 seg ya se termina el ATP ya formado  ya utilice a la FC  Sintesis de lactato a partir de
piruvato  Ciclo de cori
 Este ciclo es lo que mantiene que tenga ATP
o Sistema aerobico, glucolítico y lipolítico  aerobico oxidativo
 Demanda de energía más lenta y menor que en las actividades anaeróbicas
 Glucogeno se utiliza para sintetizarlo en glucosa  38 ATP
 Tambien se utiliza la grasa para sintetizarlo en AG  80-200 ATP
 No produce mucha energía pero la produce para largo y es más constante
 Alimentación-Ayuno-Inanición
o En el ciclo de alimentación-ayuno hay estados
 Estado de alimentación  dura 3h después de la comida
 Se utiliza glucosa y hay un control hormonal.
 Favorece la liberación de insulina
 Estado postabsortivo o ayuno temprano desde las 3h después de comer a las 12 a 18 horas siguientes
 El cerebro utiliza la glucosa, músculo e hígado utiliza acidos grasos
 Se libera glucagón y noradrenalina  se estimulan el catabolismo
 La mayoría de la glucosa la proporciona la degradación de glucogeno hepático

Estado de ayuno  desde las 18h hasta las 48h sin ingesta
 Inanición precoz  12h a 16 días
o Inicia la producción de cetonas  hígado metaboliza AG
 Inanición tardía  >16 días
o Menos glucosa para cerebro para conservar proteínas y más cuerpos cetónicos.  músculo
solo AG
 Estado de inanición o ayuno a largo plazo  varias semanas
o Las horas de estas fases son aproximadas porque hay facyores que influyen como la actividad física

 Inanición
o Es una grave reducción en nutrientes
o Es la forma de más extrema malnutrición como consecuencia de la prolongada insuficiencia dee alimento s
o Se caracteriza por pérdida extrema de peso, disminución de tasa metabólica y debilidad extrema  puede llevar
a muerte.
 El mejor marcador nutricional es prealbúmina

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