FACULTAD DE CIENCIAS

DEPARTAMENTO DE QUÍMICA

TALLER 8
AMINOÁCIDOS, PÉPTIDOS Y PROTEÍNAS

PARTE I
1. ¿Las semillas y verduras con frecuencia son deficientes en uno o má s aminoá cidos esenciales?
La siguiente tabla muestra cuá les aminoá cidos esenciales está n presentes en cada alimento.
(19.1)

Use la tabla para decidir si cada combinació n de alimentos, especificada en cada inciso,
proporciona los aminoá cidos esenciales de lisina, triptó fano y metionina.
a. Arroz y garbanzo
b. Frijol reina y harina de maíz
c. Una ensalada de garbanzo y frijol reina

2. Use la tabla del problema 19.43 para decidir si cada combinació n de alimentos, especificada en
cada inciso, proporciona los aminoá cidos esenciales de lisina, triptó fano y metionina. (19.1).
a. arroz y frijol reina
b. arroz y avena
c. avena y frijol reina

Use las siguientes fó rmulas estructurales condensadas de cisteína (1-4) para responderlos
problemas 3 y 4:

3. Si la cisteína, un aminoá cido prevalente en el pelo, tiene un pI de 5.1, ¿cuá l fó rmula estructural tendría en
disoluciones con cada uno de los siguientes valores pH?

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a. pH =10.5
b. pH =5.1
c. pH =1.8
Las proteínas del pelo pueden
contener grupos R de cisteína 
que forman enlaces por puente 
disulfuro.

4. Si la cisteína, un aminoá cido prevalente en el pelo, tiene un pI de 5.1, ¿cuá l fó rmula condensada tendría en
disoluciones con cada uno de los siguientes valores pH?

a. pH = 2.0
b. pH = 3.5
c. pH = 9.1

5. Cada uno de tres péptidos contiene una molécula de valina y dos moléculas de serina. Use sus abreviaturas de
tres letras y de una letra para escribir los tres péptidos posibles.

6. Cada uno de tres péptidos contiene una molécula de glicina, una molécula de alanina y dos moléculas de
isoleucina. En este péptido, el extremo N-terminal es glicina. Use sus abreviaturas de tres letras y de una letra
para escribir los tres péptidos posibles.

7. Identifique los aminoá cidos y el tipo de interacció n que se da entre los aminoá cidos y grupos R siguientes en
una estructura proteínica terciaria:

8. ¿Qué tipo de interacció n esperaría entre los grupos R de los aminoá cidos siguientes en una estructura
terciaria?

a. treonina y glutamina.
b. valina y alanina.
c. arginina y á cido glutá mico.

9. En la preparació n del merengue para una tarta se agregan algunas gotas de jugo de limó n y las claras de
huevo se baten.
¿Qué hace que se forme el merengue?

10. a. Dibuje la fó rmula estructural condensada de Ser-Lys-Asp

b. ¿Esperaría encontrar este segmento en el centro o en la superficie de una proteína globular? ¿Por qué?

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11. Si los aminoá cidos lisina, prolina y á cido glutá mico se encontraran en una proteína, ¿cuá l de estos
aminoá cidos…

a. se encontraría en regiones hidrofó bicas?

b. se encontraría en regiones hidrofílicas?
c. formaría puentes salinos?

12. El aspartame, que se usa en edulcorantes artificiales, contiene el siguiente dipéptido:

El aspartame es un edulcorante artificial.

a. ¿Cuá les son los aminoá cidos en el aspartame?

b. ¿Có mo nombraría el dipéptido en el aspartame?
c. Proporcione las abreviaturas de tres letras y de una letra del
dipéptido en aspartame.

13. GHK-Cu es un tripéptido que tiene una fuerte atracció n por los iones Cu2+ y está presente en la sangre y la
saliva de los seres humanos. Tiene la siguiente estructura:

a. ¿Cuá les son los aminoá cidos en GHK-Cu?

b. ¿Có mo nombraría este tripéptido, GHK-Cu?
c. Proporcione las abreviaturas de tres letras y de una
letra del tripéptido en GHK-Cu.

14. En la preparació n del merengue para una tarta se agregan algunas gotas de jugo de limó n y las claras de
huevo se baten.
¿Qué hace que se forme el merengue?

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PARTE II
ANÁLISIS ESTRUCTU RAL DE PROTEINAS MEDIANTE HERRAMIENTAS BIOINFORMÁTICAS

1. Observa muy atentamente los videos:

Bioinformática Estructural parte 1 de 2: https://www.youtube.com/watch?v=UlEKXtSHYcw
Bioinformática Estructural parte 2 de 2: https://www.youtube.com/watch?v=0IgtBnZCKtI

2. Escoge y analiza tres proteínas de interés para el grupo de trabajo, para lo cual tener en
cuenta:

2.1. Ingresa a PDB (Protein Data Bank): https://www.rcsb.org/

2.2. Nombre de la proteína de interés:

2.3. Seleccionar la entrada con la información estructural de la proteína

2.4. Selecciona la vista 3D (ejemplo a continuación).

- Toma los pantallazos de la estructura 3D desde diferentes ángulos del modelo. Indique el tipo de estructuras o
niveles estructurales de las proteínas elegidas.

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- Estructura primaria de la proteína (Formato FASTA)

-Descargar el formato PDB de la proteína. ¡Qué información proporciona el archivo PDB de una proteína?

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- Aná lisis de estructuras secundarias y sitios de unió n: Al ingresar a SEQUENCE, se observa el
modelamiento por regiones de la secuencia (Toma pantallazos).Luego hacer click en View
Feature in 3D.

- Dar click a BINDING SITE YA1. Señ ale una regió n e identifique el nombre y el tipo aminoá cidos
presentes.

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