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capítulo
22
BIOSÍNTESIS DE AMINOÁCIDOS,
NUCLEÓTIDOS Y RELACIONADOS
MOLÉCULAS
22.1 Resumen del metabolismo del nitrógeno 834 mucha química común, en particular una preponderancia
de reacciones que involucran la transferencia de nitrógeno o grupos de
22.2 Biosíntesis de aminoácidos 841
un carbono.
22.3 Moléculas derivadas de aminoácidos 854
Los caminos descritos aquí pueden ser intimidantes para
22.4 Biosíntesis y degradación de nucleótidos 862 el estudiante de bioquímica principiante. su complejidad
surge no tanto de la química misma, que en
muchos casos se entiende bien, pero por la gran cantidad de pasos y
El tiempo pasa rápidamente cuando te diviertes. la emoción de la variedad de intermediarios. Estos caminos se abordan mejor
ver a personas recuperarse que de otro modo podrían haber muerto de manteniendo un enfoque en
enfermedad . . . no se puede describir con palabras. El premio Nobel principios metabólicos que ya hemos discutido, en clave
intermedios y precursores, y en clases comunes
fue sólo la guinda del pastel.
de reacciones Incluso una mirada superficial a la química puede
—Gertrude Elion, citada en un artículo en Science, 2002 ser gratificante, por algunos de los químicos más inusuales
Las transformaciones en los sistemas biológicos ocurren en estos
caminos; por ejemplo, encontramos ejemplos destacados de
sólo se ubica detrás del carbono, hidrógeno y el raro uso biológico de los metales molibdeno, selenio y vanadio. El
Nitrógeno
oxígeno en su contribución a la masa de los sistemas vivos. La esfuerzo también ofrece una práctica
mayor parte de este nitrógeno está ligado a los aminoácidos. dividendo, especialmente para estudiantes de humanos o veterinarios
y nucleótidos. En este capítulo abordamos todos los aspectos medicamento. Muchas enfermedades genéticas de humanos y animales.
del metabolismo de estos compuestos que contienen nitrógeno, excepto se han atribuido a la ausencia de una o más enzimas
el catabolismo de aminoácidos, que se cubre del metabolismo de aminoácidos y nucleótidos, y muchos
en el Capítulo 18. productos farmacéuticos de uso común para combatir infecciones
Discutiendo las rutas biosintéticas para amino Las enfermedades son inhibidores de enzimas en estas vías:
ácidos y nucleótidos juntos es un enfoque sólido, no como lo son algunos de los agentes más importantes en el cáncer
solo porque ambas clases de moléculas contienen nitrógeno quimioterapia.
(que surge de fuentes biológicas comunes) pero porque los dos La regulación es crucial en la biosíntesis de los compuestos que
conjuntos de vías están ampliamente entrelazados, con varios contienen nitrógeno. Porque cada amino
intermediarios clave en común. Ciertos aminoácidos o partes de ácido y cada nucleótido se requiere en cantidades relativamente pequeñas
aminoácidos se incorporan cantidades, el flujo metabólico a través de la mayoría de estas vías no
en la estructura de purinas y pirimidinas, y en una es tan grande como el flujo biosintético que conduce a los carbohidratos
caso parte de un anillo de purina se incorpora a un amino o las grasas en los tejidos animales. Porque el
ácido (histidina). Los dos conjuntos de vías también comparten Se deben producir diferentes aminoácidos y nucleótidos en
833
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nitrificación
22.1 Descripción general del metabolismo del nitrógeno por bacterias del
suelo (p. ej., Nitrosomonas) Amoníaco
Las rutas biosintéticas que conducen a los aminoácidos y NH4
El Ciclo del Nitrógeno Mantiene una Reserva de Biológicamente FIGURA 22-1 El ciclo del nitrógeno. La cantidad total de nitrógeno fijado
Nitrógeno disponible anualmente en la biosfera supera los 1011 kg.
El triple enlace NmN, sin embargo, es muy estable, con una Fig. 19-5), flavodoxina reducida y tal vez otras
energía de enlace de 930 kJ/mol. Por lo tanto, la fijación de nitrógeno fuentes que juegan un papel. En al menos una especie, la fuente última
tiene una energía de activación extremadamente alta y el nitrógeno de electrones para reducir la ferredoxina es el piruvato (figura 22-2).
atmosférico es casi químicamente inerte en condiciones normales.
condiciones. El amoníaco es producido industrialmente por la El papel del ATP en este proceso es algo inusual. Como recordará,
Proceso de Haber (llamado así por su inventor, Fritz Haber), ATP puede contribuir no solo
que requiere temperaturas de 400 a 500 C y nitrógeno e hidrógeno a energía química, a través de la hidrólisis de uno o más
presiones de decenas de miles de sus enlaces fosfoanhídrido, sino también energía de enlace (págs.
de kilopascales (varios cientos de atmósferas) para proporcionar 196, 301), a través de interacciones no covalentes
la energía de activación necesaria. La fijación biológica de nitrógeno, que reducen la energía de activación. En la reacción llevada a cabo por
sin embargo, debe ocurrir a temperaturas biológicas la dinitrogenasa reductasa, tanto la unión de ATP
ya 0,8 atm de nitrógeno, y la alta barrera de activación se supera por
otros medios. Esto se logra,
4 CoA + 4CO2 +
al menos en parte, por la unión e hidrólisis de ATP.
4 piruvato 4 acetil-CoA
La reacción total se puede escribir
8e
N2 10H 8e 16ATP 88n 2NH4 16ADP 16Pi H2
La fijación biológica del nitrógeno se lleva a cabo mediante un sistema altamente
complejo conservado de proteínas llamado nitrogenasa
complejo (Fig. 22-2), cuyos componentes cruciales 8 Ferredoxina o 8 Ferredoxina o
8 flavodoxina 8 flavodoxina
son la dinitrogenasa reductasa y la dinitrogenasa
(oxidado) (reducido)
(Figura 22-3). La dinitrogenasa reductasa (Mr 60,000) es una
dímero de dos subunidades idénticas. Contiene un solo centro redox 8e
4Fe 4S (ver Fig. 19-5), unido entre el
subunidades, y puede ser oxidado y reducido por un electrón. También
tiene dos sitios de unión para ATP/ADP (un sitio
en cada subunidad). Dinitrogenasa (Mr 240,000), un 8 Dinitrogenasa 8 Dinitrogenasa
reductasa reductasa
tetrámero con dos copias de dos subunidades diferentes, contiene (reducido) (oxidado)
hierro y molibdeno; sus centros redox tienen
16 ATP 16ADP
un total de 2 Mo, 32 Fe y 30 S por tetrámero. Casi la mitad
+ 16Pi
del hierro y el azufre está presente como dos pares puenteados de
centros 4Fe-4S llamados grupos P; el resto está presente como parte 8 Dinitrogenasa 8 Dinitrogenasa
de un nuevo cofactor de hierro y molibdeno. Una forma reductasa (reducida) reductasa (oxidada)
+ 16ATP + 16ATP
de nitrogenasa que contiene vanadio en lugar de
se ha descubierto molibdeno y algunas bacterias
8e
las especies pueden producir ambos tipos de sistemas de nitrogenasa.
La enzima que contiene vanadio puede ser la principal
sistema de fijación de nitrógeno bajo algunas condiciones ambientales,
pero aún no está tan bien caracterizado como el
dinitrogenasa dinitrogenasa
enzima dependiente de molibdeno. (oxidado) (reducido)
La fijación de nitrógeno se lleva a cabo por una muy reducida
forma de dinitrogenasa y requiere ocho electrones: seis 8e
para la reducción de N2 y dos para producir una molécula de H2 como
parte obligada del mecanismo de reacción. La dinitrogenasa se reduce
por la transferencia de electrones de la dinitrogenasa reductasa (figura + H2 2H+
2NH4 N2
22-2). los
el tetrámero de dinitrogenasa tiene dos sitios de unión para la reductasa.
FIGURA 22-2 Fijación de nitrógeno por el complejo nitrogenasa. Los
Los ocho electrones necesarios se transfieren
electrones se transfieren del piruvato a la dinitrogenasa a través de la ferredoxina (o
de reductasa a dinitrogenasa uno a la vez: un reducido flavodoxina) y dinitrogenasa reductasa. La dinitrogenasa reductasa reduce la
La molécula de reductasa se une a la dinitrogenasa y dinitrogenasa un electrón a la vez, con al menos seis electrones.
transfiere un solo electrón, entonces la reductasa oxidada necesario para fijar una molécula de N2. Dos electrones adicionales son
se disocia de la dinitrogenasa, en un ciclo repetitivo. para reducir 2 H a H2 en un proceso que acompaña obligatoriamente
Cada vuelta del ciclo requiere la hidrólisis de dos fijación de nitrógeno en anaerobios, haciendo un total de ocho electrones requeridos
moléculas de ATP por la reductasa dimérica. La fuente inmediata de por molécula de N2 . Las estructuras de subunidades y los cofactores metálicos de
electrones para reducir la dinitrogenasa reductasa varía, con se describen las proteínas dinitrogenasa reductasa y dinitrogenasa
ferredoxina reducida (pág. 733; véase también en el texto y en la figura 22-3.
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(a)
(b) (C)
FIGURA 22-3 Enzimas y cofactores del complejo nitrogenasa. negro, homocitrato gris claro). Los grupos P (pares puenteados de 4Fe-4S
(PDB ID 1N2C) (a) En este diagrama de cinta, las subunidades de dinitrogenasa complejos) también se muestran. (b) Los cofactores del complejo de dinitrogenasa
se muestran en gris y rosa, las subunidades de dinitrogenasa reductasa en sin la proteína (colores como en (a)). (c) El cofactor hierro-molibdeno contiene 1
azul y verde. El ADP enlazado es rojo. Nótese el complejo 4Fe-4S (Fe Mo (negro), 7 Fe (naranja), 9 S (amarillo) y una molécula de homocitrato (gris).
átomos de naranja, átomos de S amarillo) y el cofactor de hierro-molibdeno (Mo
y la hidrólisis de ATP provocan proteínas conformacionales Los nódulos (fig. 22-4) se ocupa tanto de los requisitos de energía como
cambios que ayudan a superar la alta energía de activación de la labilidad al oxígeno de la nitrogenasa.
de fijación de nitrógeno. La unión de dos moléculas de ATP. complejo. La energía necesaria para la fijación de nitrógeno.
a la reductasa desplaza el potencial de reducción (E ) de fue probablemente la fuerza impulsora evolutiva de este
esta proteína de 300 a 420 mV, una mejora asociación planta-bacteria. Las bacterias en los nódulos de la raíz tienen
de su poder reductor que se requiere para transferir electrones a la acceso a una gran reserva de energía en el
dinitrogenasa. Luego, las moléculas de ATP se hidrolizan justo antes de forma de abundante carbohidrato y ciclo del ácido cítrico
la transferencia real de un electrón. intermedios puestos a disposición por la planta. Esto puede
a la dinitrogenasa. permitir que las bacterias fijen cientos de veces más nitrógeno que el
Otra característica importante de la nitrogenasa que sus primos de vida libre pueden fijar en las condiciones que
complejo es una labilidad extrema en presencia de oxígeno. La reductasa generalmente se encuentran en los suelos. para resolver el
se inactiva en el aire, con una vida media problema de toxicidad del oxígeno, las bacterias en los nódulos de la raíz
de 30 segundos; la dinitrogenasa tiene una vida media de 10 minutos están bañados en una solución del grupo hemo que se une al oxígeno
en el aire. Bacterias de vida libre que fijan la capa de nitrógeno proteína leghemoglobina, producida por la planta (aunque el hemo
con este problema en una variedad de maneras. Algunos viven solo puede ser aportado por las bacterias).
anaeróbicamente o reprimir la síntesis de nitrogenasa cuando La leghemoglobina une todo el oxígeno disponible para que
el oxígeno está presente. Algunas especies aeróbicas, como Azo no puede interferir con la fijación de nitrógeno, y eficientemente
tobacter vinelandii, desacoplan parcialmente la transferencia de entrega el oxígeno a la bacteria de transferencia de electrones
electrones de la síntesis de ATP, de modo que el oxígeno se quema como sistema. El beneficio para la planta, por supuesto, es una lista
rápidamente a medida que ingresa a la célula (véase el cuadro 19-1). Al suministro de nitrógeno reducido. La eficiencia de la simbiosis entre
fijar nitrógeno, los cultivos de estas bacterias en realidad aumentan plantas y bacterias es evidente en la
de temperatura como resultado de sus esfuerzos por librarse del oxígeno. enriquecimiento del nitrógeno del suelo provocado por las leguminosas.
Este enriquecimiento es la base de los métodos de rotación de cultivos,
La relación simbiótica entre las leguminosas en los que las plantaciones de no leguminosas
plantas y las bacterias fijadoras de nitrógeno en sus raíces plantas (como el maíz) que extraen nitrógeno fijo de
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FIGURA 22-4 Nódulos fijadores de nitrógeno. (a) Nódulos de la raíz de la pata de pájaro fuera de los bacteroides, la planta es incapaz de utilizar N2. La raíz infectada
trébol, una legumbre. La flor de esta planta común se muestra en el conjunto. (b) Micrografía Las células proporcionan algunos factores esenciales para la fijación de nitrógeno, incluyendo
electrónica coloreada artificialmente de una sección delgada leghemoglobina; esta proteína hemo tiene una afinidad de unión muy alta por
a través de un nódulo de raíz de guisante. Las bacterias fijadoras de nitrógeno simbióticas, o oxígeno, que inhibe fuertemente la nitrogenasa. (El núcleo de la célula se muestra
bac teroides (rojo), viven dentro de las células del nódulo, rodeadas por la membrana peribac en amarillo/verde. No visibles en esta micrografía son otros orgánulos de
teroid (azul). Los bacterioides producen el complejo nitrogenasa. la célula de la raíz infectada que normalmente se encuentra en las células vegetales).
el suelo se alternan cada pocos años con las plantaciones proporcionar el punto de entrada crítico. Recuerde que estos dos mismos
de legumbres como la alfalfa, los guisantes o el trébol. los aminoácidos desempeñan funciones centrales en el catabolismo del
La fijación de nitrógeno es objeto de un intenso estudio debido a su amoníaco y los grupos amino en la oxidación de aminoácidos (capítulo
inmensa importancia práctica. Industrial 18). El glutamato es la fuente de grupos amino para la mayoría
La producción de amoníaco para su uso en fertilizantes requiere una otros aminoácidos, a través de reacciones de transaminación
entrada grande y costosa de energía, y esto ha (lo contrario de la reacción que se muestra en la figura 18-4). los
estimuló un impulso para desarrollar recombinantes o transgénicos El nitrógeno amídico de la glutamina es una fuente de grupos amino.
organismos que pueden fijar nitrógeno. ADN recombinante en una amplia gama de procesos biosintéticos. En la mayoría de los tipos
técnicas (Capítulo 9) se están utilizando para transferir la de las células y en los fluidos extracelulares de los organismos superiores,
ADN que codifica las enzimas de fijación de nitrógeno en uno o ambos de estos aminoácidos están presentes en mayor
bacterias y plantas no fijadoras de nitrógeno. El éxito en concentraciones—a veces un orden de magnitud o
estos esfuerzos dependerán de la superación del problema de más alto—que otros aminoácidos. Una Escherichia
toxicidad del oxígeno en cualquier célula que produzca nitrogenasa. coli requiere tanto glutamato que este aminoácido
es uno de los solutos primarios en el citosol. Su concentración se regula
no solo en respuesta a los requerimientos de nitrógeno de la célula, sino
El amoníaco se incorpora a las biomoléculas
también para mantener un equilibrio osmótico entre el citosol y el medio
a través del glutamato y la glutamina
externo.
El nitrógeno reducido en forma de NH4 se asimila en Las rutas biosintéticas del glutamato y la glutamina son simples, y
aminoácidos y luego en otras biomoléculas que contienen nitrógeno. Dos todos o algunos de los pasos ocurren en
aminoácidos, glutamato y glutamina, la mayoría de los organismos. La vía más importante para el
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la asimilación de NH4 en glutamato requiere dos reacciones. La glutamina sintetasa es un punto regulador primario
Primero, la glutamina sintetasa cataliza la reacción de glutamato en el metabolismo del nitrógeno
y NH4 para producir glutamina. Esta reacción tiene lugar en dos
pasos, con fosfato de glutamil ÿ unido a enzima como intermediario La actividad de la glutamina sintetasa está regulada en
(véase la figura 18-8): prácticamente todos los organismos, lo que no sorprende, dado su
papel metabólico central como punto de entrada para el nitrógeno reducido.
(1) Glutamato ATP 88n -glutamil fosfato ADP En bacterias entéricas como E. coli, la regulación no suele ser
compleja. La enzima tiene 12 subunidades idénticas de Mr 50 000
(2) -Glutamil fosfato NH4 88n glutamina Pi H
(figura 22-5) y se regula tanto alostéricamente como por
Suma: Glutamato NH4 ATP 88n modificación covalente. La alanina, la glicina y al menos seis
glutamina ADP Pi H (22–1) productos finales del metabolismo de la glutamina son inhibidores
La glutamina sintetasa se encuentra en todos los organismos. alostéricos de la enzima (figura 22-6). Cada inhibidor solo produce
Además de su importancia para la asimilación del NH4 en las una inhibición parcial, pero los efectos de múltiples inhibidores son
bacterias, tiene un papel central en el metabolismo de los más que aditivos, y los ocho juntos prácticamente apagan la
aminoácidos en los mamíferos, convirtiendo el NH4 libre de tóxicos enzima. Este mecanismo de control proporciona un ajuste
en glutamina para su transporte en la sangre (Capítulo 18). constante de los niveles de glutamina para satisfacer los requisitos
En bacterias y plantas, el glutamato se produce a partir de la metabólicos inmediatos.
glutamina en una reacción catalizada por la glutamato sintasa.
-El cetoglutarato, un intermedio del ciclo del ácido cítrico, sufre
aminación reductora con glutamina como donante de nitrógeno:
Glutamato
(a) O
(b)
-cetoglutarato Glutamato
A
información personal
información personal
atp
A PPi atp
Pi
UTP UMP
adenilación NH3
Glutamina Glutamina
uridilación UT atp
sintetasa sintetasa
(inactiva) (activa)
gln AMPERIO
deadenililación ADP
+ Pi
PPi H2O
A
Pi ADP
A
información personal
UMP
PII UMP
glutamina
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con PII desuridilado estimula la adenilación de la glutamina sintetasa. intermedio covalente se hidroliza a la enzima libre
Tanto la uridilación como la deuridilación de PII son provocadas por y glutamato. Si se debe activar el segundo sustrato, el método habitual
una sola enzima, la uridililtransferasa. La uridilación se inhibe por la es el uso de ATP para generar
unión de un intermedio de fosfato de acilo (ROOX en la figura 22-8,
glutamina y Pi a uridililtransferasa y se estimula con X como grupo fosforilo). La enzima glutaminasa
mediante la unión de -cetoglutarato y ATP a PII . actúa de manera similar, pero utiliza H2O como segundo sustrato, lo
La regulación no se queda ahí. el uridilado que produce NH4 y glutamato (figura 18-8).
PII también media la activación de la transcripción de la
gen que codifica la glutamina sintetasa, aumentando así Dominio de NH3-
la concentración celular de la enzima; el PII deuridinamente lilado unión a glutamina dominio aceptor
+
de PII con proteínas adicionales involucradas en la regulación génica, CH
H3N
de un tipo descrito en el Capítulo 28. El resultado neto
de este elaborado sistema de controles es una disminución en la CH2
NH3
actividad de la glutamina sintetasa cuando los niveles de glutamina son bajos. CH2 canal
alto, y un aumento en la actividad cuando los niveles de glutamina
son bajos y -cetoglutarato y ATP (sustratos para la
Cis SH
: O
C
H+
NH2
reacción de sintetasa) están disponibles. Las múltiples capas glutamina
de regulación permiten una respuesta sensible en la que la síntesis
de glutamina se adapta a las necesidades celulares. glutamina R1
amidotransferasa ROH o CO
Varias clases de reacciones juegan papeles especiales en 1 R2
la biosíntesis de aminoácidos y nucleótidos Aceptador
Activado
Las vías descritas en este capítulo incluyen una variedad de sustrato
RESUMEN 22.1 Descripción general del metabolismo del nitrógeno Los organismos varían mucho en su capacidad para sintetizar
los 20 aminoácidos comunes. Mientras que la mayoría de las
ÿ El nitrógeno molecular que constituye el 80% de la bacterias y plantas pueden sintetizar los 20, los mamíferos pueden
atmósfera terrestre no está disponible para la mayoría de sintetizar solo alrededor de la mitad de ellos, generalmente aquellos
los organismos vivos hasta que se reduce. Esta fijación de con vías simples. Estos son los aminoácidos no esenciales, que
N2 atmosférico tiene lugar en ciertas bacterias de vida libre no se necesitan en la dieta (véase el cuadro 18-1). El der restante,
y en bacterias simbióticas en los nódulos de las raíces de los aminoácidos esenciales, deben obtenerse de los alimentos. A
las leguminosas. menos que se indique lo contrario, las vías para los 20 aminoácidos
comunes que se presentan a continuación son las que operan en
ÿ El ciclo del nitrógeno implica la formación de
las bacterias.
amoníaco por la fijación bacteriana de N2, la
nitrificación de amoníaco en nitrato por los Glucosa
organismos del suelo, la conversión de nitrato en amoníaco
por las plantas superiores, la síntesis de aminoácidos a
partir del amoníaco por todos los organismos y la conversión
de nitrato en N2 por desnitrificación bacterias del suelo. Glucosa 6-fosfato
ÿ La fijación de N2 como NH3 la realiza el complejo
nitrogenasa, en una reacción que requiere ATP. El 4 pasos
complejo nitrogenasa es altamente lábil en presencia
de O2. ÿ En los sistemas vivos, el nitrógeno reducido Ribosa 5-
4 pasos fosfato
es
incorporado primero en aminoácidos y luego en una
variedad de otras biomoléculas, incluidos los nucleótidos. Histidina
El punto de entrada clave es el aminoácido glutamato. El
glutamato y la glutamina son los donantes de nitrógeno
en una amplia variedad de reacciones biosintéticas. La Eritrosa 4-
3-fosfoglicerato serina
glutamina sintetasa, que cataliza la formación de fosfato
glutamina a partir de glutamato, es una enzima reguladora
principal del metabolismo del nitrógeno.
oxaloacetato -cetoglutarato
843
O
B O
CH3
O
C O
S-CoA CoA-SH B
O NH3 O HNOCOCH3
A A
METRO METRO
C O
CH2O CH2
O
CH O
ARRULLO C O
CH2
OO
CH2 COO CH O
D acetilglutamato sintasa D
O O
Glutamato N-acetilglutamato
atp atp
N-acetilglutamato
glutamato quinasa
quinasa
ADP ADP
O
O NH3 B
HN COCH3
O
METRO
A
O
C CH2
O
COO CH OO
CH2
O
-Glutamil
D
A
METRO
C CH2
O
O OCH
CH2
O
ARRULLO
PAGS
O
O fosfato D N-acetil--glutamil
PAGS
O
O
fosfato
NAD(P)HH NAD(P)H H
glutamato N-acetilglutamato
deshidrogenasa deshidrogenasa
NAD(P) NAD(P)
Pi Pi
O
O NH3 B
HN COCH3
O
A
METRO
CCH2
O
O OCH
CH2
O
ARRULLO
O
D METRO
A
H C CH2
O
O OCH
CH2
O
ARRULLO
Glutamato -semialdehído D N-acetilglutamato
H
no enzimático
-semialdehído
Glutamato
aminotransferasa
H2C CH2
-cetoglutarato
HCO CH director de operaciones
O
norte
1
H -Pirrolina-5-carboxilato B
(P5C) HNO C O
CH3
A
CH3COO
H H2C CH2
H ciclo de la urea
C CH O
ARRULLO NH3
F norte A
prolina
ornitina Fosfato de carbamoilo
FIGURA 22-10 Biosíntesis de prolina y arginina a partir de glutamato carbamoil
transferasa
en bacterias. Los cinco átomos de carbono de la prolina surgen del glutamato. En Pi
muchos organismos, la glutamato deshidrogenasa es inusual porque utiliza
L-citrulina
ya sea NADH o NADPH como cofactor. Lo mismo puede ser cierto de otros
enzimas en estas vías. El -semialdehído en la ruta de la prolina sufre una
ATP aspartato
1
ciclación rápida y reversible a -pirrolina-5- argininosuccinato
carboxilato (P5C), con el equilibrio favoreciendo la formación de P5C. sintetasa
amperio PPi
La ciclación se evita en la ruta de la ornitina/arginina por acetilación
del grupo -amino del glutamato en el primer paso y eliminación del Argininosuccinato
grupo acetilo después de la transaminación. Aunque algunas bacterias carecen
argininosuccinasa
arginasa y, por lo tanto, el ciclo completo de la urea, pueden sintetizar arginasa
Fumarato
a partir de ornitina en pasos que son paralelos al ciclo de la urea de los mamíferos,
con citrulina y argininosuccinato como productos intermedios (figura 18-10). NH3
H2N
Aquí, y en las figuras subsiguientes de este capítulo, las flechas de GRAMO A
CO
O
norte
CH2O CH2O CH2 OCH
O
ARRULLO
reacción indican el camino lineal hacia los productos finales, sin considerar la j H
H2N
reversibilidad de los pasos individuales. Por ejemplo, el segundo paso
Arginina
de la vía que conduce a la arginina, catalizada por N-acetilglutamato
deshidrogenasa, es químicamente similar a la reacción del gliceraldehído 3-
fosfato deshidrogenasa en la glucólisis (figura 14-7) y es fácilmente reversible.
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deshidrogenasa (usando NAD) para producir 3- la teína, que reacciona con la serina, catalizada por la
fosfohidroxipiruvato. La transaminación del glutamato cistationina-sintasa, para producir cistationina (figura
produce 3-fosfoserina, que es hidrolizada a serina libre por 22-14). Finalmente, la cistationina-liasa, una enzima que
la fosfoserina fosfatasa. requiere PLP, cataliza la eliminación de amoníaco y la
La serina (tres carbonos) es el precursor de la glicina escisión de la cistationina para producir cisteína libre.
(dos carbonos) mediante la eliminación de un átomo de
carbono por la serina hidroximetiltransferasa (figura 22-12).
El tetrahidrofolato acepta el carbono (C-3) de la serina,
que forma un puente de metileno entre N-5 y N-10 para
producir N5 ,N10-metilenetetrahidrofolato (ver Fig. ARRULLO
OH
requiere fosfato de piridoxal. En el hígado de los A
3-fosfoglicerato
HO O
C O O
oh_oh
CH3N 3-fosfoserina
somete a una reducción de ocho electrones a sulfuro.
A
O OP
de serina en una vía de dos pasos. Los mamíferos
H2O
sintetizan cisteína a partir de dos aminoácidos: la metionina fosfoserina
fosfatasa
proporciona el átomo de azufre y la serina proporciona el Pi
esqueleto de carbono. La metionina primero se convierte ARRULLO
serina folato H4
plp
hidroximetil
transferasa N5 , N10-metileno H4 folato
H2O
FIGURA 22-12 Biosíntesis de serina a partir de 3-fosfoglicerato y de ARRULLO
H3N O
C O
H Glicina
produce a partir de CO2 y NH4 por la acción de la glicina sintasa, con A
2
ARRULLO
ATP SO4
O
H3N CH NADPH
cisteína
CH2 PAPS reductasa NADP
SH 3 -fosfoadenosina 5 -fosfato (PAP)
2
SO3 sulfito
3NADPH
FIGURA 22-13 Biosíntesis de cisteína a partir de serina en sulfuro reductasa
3NADP
bacterias y plantas. Se muestra el origen del azufre reducido.
S2 Sulfuro
en el camino de la derecha.
Homocisteína serina
plp
aspartato
cistationina -sintasa
H2O
NH3
Asparragina Metionina treonina lisina
OOC CH CH2 CH2 S CH2 CH ARRULLO
NH3
alanina Valina leucina isoleucina
cistationina
H2O
cistationina -liasa plp
NH4 piruvato
FIGURA 22-14 Biosíntesis de cisteína a partir de homocisteína y Metionina, treonina, lisina, isoleucina, valina y
serina en mamíferos. La homocisteína se forma a partir de la metionina, la leucina son aminoácidos esenciales. Su biosintético
como se describe en el texto. las vías son complejas y están interconectadas (figura 22-15).
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O NH3 OH 17
H2O
NADPH H
2
NH3
NADP
PAGS
CH2 CH2 Director de operaciones de CH
Fosfohomoserina
Pi
ADP
O NH3
NADPH H 4
C CH2 Director de operaciones de CH
atp
piruvato
H NADP
10 Aspartato -semialdehído 3
NH3
OH NH3 CH2 CH2 CH ARRULLO homoserina
succinato
Succinil-CoA H2O
12
CoA NH3
H2C S CH2 CH2 CH COO Cistationina
-cetoglutarato Glutamato
H
plp H C NH3
OOC NH2 ARRULLO OOC O ARRULLO
NUEVA HAMPSHIRE
ARRULLO
NUEVA HAMPSHIRE 13
plp
succinato
succinato 8
Piruvato NH3
N-succinil-2-amino 6-
N-succinil-L,L-
ceto-L-pimelato
, -diamino NH3
pimelato
HS CH2 CH2 CH COO Homocisteína
H2O
14
succinato
N5 -Metil H4 folato
9
ARRULLO ARRULLO ARRULLO
folato H4
C H C H H CO2 C H
H3N H3N H3N NH3
plp
(CH2)3 (CH2)3 (CH2)3 CH3 S CH2 CH2 CH ARRULLO
15 dieciséis
1 aspartoquinasa
2 aspartato -semialdehído deshidrogenasa
3 homoserina deshidrogenasa homoserina quinasa
4
CH3 C ARRULLO
CH3
CH2 CH3
CH3 C C ARRULLO CH3 C C ARRULLO
HO O OH O
NAD(P)HH
19 NAD(P)HH Director de operaciones de CH3
19
CH3 CH C CH2 ARRULLO -Isopropilmalato
NAD(P)
NAD(P) OH
CH3
23
CH2 H , -Dihidroxi- CH3 H ,
-metilvalerato -dihidroxiisovalerato
CH3 C C ARRULLO CH3 C director de operaciones
CH3 ARRULLO
OH OH OH OH 22 CH3 CH CH CH ARRULLO
-Isopropilmalato
CoA OH
20
H2O
20
H2O NAD
CH3 Acetil-CoA
-Isovalerato de ceto
H O H O CO2
CH3
Glutamato
Glutamato
21 plp
CH3 CH CH2 C ARRULLO -Cetoisocaproato
21 plp
O
-cetoglutarato
-cetoglutarato
CH3
Glutamato
CH2 NH3 CH3 NH3 25 plp
-cetoglutarato
isoleucina Valina
CH3 NH3
CH3 CH CH2 CH ARRULLO
leucina
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En algunos casos, las vías en bacterias, hongos y plantas a valina e isoleucina en vías que comienzan con la condensación
difieren significativamente. Las vías bacterianas se describen en de dos carbonos de piruvato (en forma de pirofosfato de
la figura 22-15. hidroxietiltiamina; véase la figura 14-13) con otra molécula de
El aspartato da lugar a metionina, treonina y lisina. Los piruvato (vía de la valina) o con -cetobutirato (vía de la isoleucina).
puntos de ramificación ocurren en el aspartato-semialdehído, un El -cetobutirato se deriva de la treonina en una reacción que
intermediario en las tres vías, y en la homoserina, un precursor requiere fosfato de piridoxal (figura 22-15, paso 17). Un
de la treonina y la metionina. intermediario en la vía de la valina, el -cetoisovalerato, es el
La treonina, a su vez, es uno de los precursores de la isoleucina. punto de partida de una vía ramificada de cuatro pasos que
Las vías de la valina y la isoleucina comparten cuatro enzimas conduce a la leucina (pasos 22 a 25).
(fig. 22-15, pasos 18 a 21). El piruvato da lugar
PAGS
3-deshidroshikimato
O ARRULLO
NADPH H
4
C NADP
Fosfoenolpiruvato
(ENERGÍA)
CH2
ARRULLO
O H
HO 1 2-ceto-3-desoxi-D-arabinoheptulosonato 7-fosfato sintasa
C OH deshidroquinato sintasa 3-deshidroquinato deshidratasa
H H Shikimate
CHOH Eritrosa 4-fosfato 2 shikimato deshidrogenasa shikimato quinasa
HO H
CHOH 3
4
CH2 O PAGS
atp
5 5
ADP 6 5-enolpiruvilshikimato 3-fosfato sintasa corismato
H2O
1 7 sintasa
Pi ARRULLO
O ARRULLO PAGS O
OH Shikimato 3-
C
H H fosfato
C H2 HO H
HO C H ENERGÍA
2-ceto-3-desoxi-D 6
H C OH arabinoheptulosonato 7- Pi
fosfato
HC OH
ARRULLO
CH2 O PAGS
CH2
PAGS O
NAD
2 Director de operaciones del CO
H H
Pi HO H 5-enolpiruvilshikimato 3-
fosfato
HO ARRULLO FIGURA 22-16 Biosíntesis de corismato, un intermediario
7
C Pi en la síntesis de aminoácidos aromáticos en bacterias y plantas.
Todos los carbonos se derivan del 4-fosfato de eritrosa (púrpura
OH claro) o del fosfoenolpiruvato (rosa). Tenga en cuenta que el
O H 3-deshidroquinato
ARRULLO
NAD requerido como cofactor en el paso 2 se libera sin
HO H
CH2 cambios; puede reducirse transitoriamente a NADH durante la
3 O C ARRULLO
reacción, con formación de un intermedio de reacción oxidado.
H2O H El paso 6 es inhibido competitivamente por el
HO H 2
activo en ( COOOCH2ONHOCH2OPO3,glifosato,
el herbicida
el ingrediente
ampliamente
ARRULLO Corismato utilizado Roundup. El herbicida es relativamente no tóxico para los
mamíferos, que carecen de esta vía biosintética.
Los nombres químicos quinato, shikimato y corismato se derivan
OH
O H de los nombres de las plantas en las que se ha encontrado que se
HO H 3-deshidroshikimato acumulan estos intermediarios.
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C O
ARRULLO
Fosfoenolpiruvato
' H
HO H
Eritrosa 4-fosfato
glutamina
1
Glutamato
Fenilalanina tirosina triptófano piruvato
ARRULLO
NH2
tirosina antranilato
O O
CH2 O norte
del cierre del anillo de un precursor alifático seguido de la
ARRULLO
adición paso a paso de dobles enlaces. Los primeros cuatro
H H
pasos producen shikimato, una molécula de siete carbonos H H N-(5 -fosforribosil)-
derivada de eritrosa 4-fosfato y fosfoenolpiruvato (figura 22-16). antranilato
OH OH
El shikimato se convierte en corismato en tres pasos que
incluyen la adición de tres carbonos más de otra molécula de
3
fosfoenolpiruvato. El corismato es el primer punto de ramificación
de la vía, con una rama que conduce al triptófano y la otra a la ARRULLO HO OH
fenilalanina y la tirosina. A A
HO O
C OCOC O
CH2OOO P
B A A
H
convierte en antranilato en una reacción en la que la glutamina norte
H
dona el nitrógeno que formará parte del anillo de indol. El Fosfato de enol-1-o-carboxifenilamino-1-
antranilato luego se condensa con PRPP. desoxirribosa
4
El anillo de indol del triptófano se deriva de los carbonos del H2O CO2
CH O
CH O
CH2
O
O OP
catalizada por la triptófano sintasa. Esta enzima tiene una
estructura de 2 2 subunidades
subunidades
y puede ydisociarse
una 2 subunidades
en dos
que catalizan diferentes partes de la reacción general: Fosfato de indol-3-glicerol
norte
NH3
A
CH2
O
CH O
ARRULLO
norte
H
1 antranilato sintasa
2 antranilato fosforribosiltransferasa mi triptófano
3 N-(5'-fosforribosil)-antranilato isomerasa indol-3- merase
4 glicerol fosfato sintasa triptófano sintasa FIGURA 22-17 Biosíntesis de triptófano a partir de corismato en
5 bacterias y plantas. En E. coli, las enzimas que catalizan los pasos 1 y
2 son subunidades de un solo complejo.
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O enzima cataliza una reacción de varios pasos con varios tipos de arreglos
CH CH CH2 PAGS
indol
norte
NH3
sintasa OH serina
subunidades
plp
2
H2O
B B media pensión
H
H H
H2C ARRULLO CH2 ARRULLO
CH2 CH ARRULLO
norte
C C
H norte
indol H norte
NUEVA HAMPSHIRE
H
NUEVA HAMPSHIRE NUEVA HAMPSHIRE
HC
HC HC
3 4 PAGS O CH2 OH
PAGS
CH2 OH PAGS O CH2 OH
norte CH3
norte CH3 norte CH3 H
H H
5 H2O
NH3
CH 2 CH ARRULLO Enzima plp
norte
triptófano
La segunda parte de la reacción requiere fosfato de piridoxal (figura ria, pero son proteínas separadas en otros. además, el
22-18). El indol formado en la primera parte no es la actividad de algunas de estas enzimas requiere una asociación
liberada por la enzima, sino que se mueve a través de un no covalente con otras enzimas de la vía.
canal desde el sitio activo de la subunidad a la subunidad Estas observaciones sugieren que todas las enzimas de la vía son
sitio activo, donde se condensa con una base intermedia de Schiff componentes de un gran complejo multienzimático.
derivada de serina y PLP. Intermedio tanto en procariotas como en eucariotas. Tales complejos son
canalización de este tipo puede ser una característica de todo el generalmente no se conservan intactos cuando las enzimas se
vía del corismato al triptófano. Enzima activa aislado utilizando métodos bioquímicos tradicionales, pero la
sitios que catalizan diferentes pasos (a veces no pasos secuenciales) evidencia de la existencia de complejos multienzimáticos es
de la vía al triptófano se encuentran acumulando para este y un número de otros metabólicos
polipéptidos individuales en algunas especies de hongos y bacterias caminos (pág. 605).
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O ribosa 5-fosfato
prefenato
NAD HO H Histidina
hn norte hn norte
PPi
norte C norte C
PAGS
CH2 O H
PAGS
CH2 O H
CH H C 2 CH H C
H C HC H C HC
OH OH OH OH
N1 -5 -Fosforribosil-ATP N1 -5 -Fosforribosil-AMP
O H
Ribonucleótido de 5-
PAGS
CH2 O
HCH 4
aminoimidazol 4- CH H C
carboxamida (AICAR) C O
H C HC
5 HC OH
OH OH
HC OH
glutamina
N1 -5 -Fosforribosilformimino 5-
H aminoimidazol-4- carboxamida
norte
CH2 O PAGS
HC Glutamato ribonucleótido
CH N1 -5 -fosforibulosil
formimino-5-amino
C
norte imidazol-4-carboxamida
HC OH ribonucleótido
HC OH
1 ATP fosforribosil transferasa 5 glutamina amidotransferasa
CH2PO_ 2 pirofosfohidrolasa fosforribosil-AMP 6 imidazol glicerol 3-fosfato deshidratasa
Imidazol glicerol 3- 3 ciclohidrolasa fosforribosilformimino-5- 7 L-histidinol fosfato aminotransferasa histidinol
fosfato 4 aminoimidazol 4-carboxamida ribonucleótido 8 fosfato fosfatasa histidinol deshidrogenasa
isomerasa 9
6 H2O
H H H H
norte norte norte norte
HC HC HC HC
CH CH CH CH
C Glutamato -Ketoglutarato C C 2NAD 2NADH 2H C
norte norte
Pi norte norte
CH2 O PAGS
CH2 O PAGS
CH2 O H ARRULLO
aspartato
NH3
A
A1 A2 A3
CH3 O
OH
treonina deshidratasa
Aspartil-b-fosfato
O
B
CH3 OO CH2 C O
ARRULLO -Cetobutirato
Aspartato b-semialdehído
5 pasos
B1 B2
NH3
A
CH3 OO
CH2 CH O CH O
ARRULLO isoleucina
6 pasos
A
CH3
metionina
Debido a que los 20 aminoácidos comunes deben hacerse
treonina
en las proporciones correctas para la síntesis de proteínas, las células
C1 C2
han desarrollado formas no sólo de controlar la tasa de
síntesis de aminoácidos individuales sino también de coordinar su
formación. Esta coordinación es especialmente
bien desarrollado en células bacterianas de crecimiento rápido. Figura
a-cetobutirato
22–22 muestra cómo las células de E. coli coordinan la síntesis
de lisina, metionina, treonina e isoleucina, todos
5 pasos
hecho de aspartato. Son evidentes varios tipos importantes de
patrones de inhibición. El paso de aspartato a aspartil-fosfato es
catalizado por tres isoenzimas, isoleucina
cada uno controlado independientemente por diferentes moduladores.
Esta multiplicidad de enzimas impide que una biosintética FIGURA 22-22 Mecanismos reguladores entrelazados en la biosíntesis
producto final del cierre de pasos clave en un camino de varios aminoácidos derivados del aspartato en E. coli. Tres
cuando se requieren otros productos de la misma vía. Las enzimas (A, B, C) tienen dos o tres formas de isoenzimas, indicadas
Los pasos de aspartato-semialdehído a homoserina y de treonina por subíndices numéricos. En cada caso, una isoenzima (A2, B1 y C2)
a -cetobutirato (detallados en no tiene regulación alostérica; estas isoenzimas están reguladas por cambios
Fig. 22-15) también son catalizadas por doble, independientemente en la cantidad sintetizada (Capítulo 28). Síntesis de las isoenzimas A2 y
isoenzimas controladas. Una isoenzima para la conversión de B1 se reprime cuando los niveles de metionina son altos y la síntesis de
el aspartato a aspartil-fosfato es inhibido alostéricamente por dos la isoenzima C2 se reprime cuando los niveles de isoleucina son altos. Enzima A
es aspartoquinasa; B, homoserina deshidrogenasa; C, treonina dehidratasa.
moduladores diferentes, lisina e isoleucina,
cuya acción es más que aditiva—otro ejemplo
de inhibición concertada. La secuencia de aspartato a isoleucina
sufre múltiples cambios negativos superpuestos.
inhibición por retroalimentación; por ejemplo, la isoleucina inhibe
la conversión de treonina a -cetobutirato (como se describe arriba), vía temprana al corismato intermedio común
y la treonina inhibe su propia formación en tres puntos: de es catalizada por la enzima 2-ceto-3-desoxi-D-arabino heptulosonato
homoserina, de aspartato 7-fosfato (DAHP) sintasa (paso 1
-semialdehído, y de aspartato (pasos 4 y , 3 , en la figura 22-16). La mayoría de los microorganismos y las plantas tienen
1 en la figura 22-15). Este mecanismo regulador general tres isoenzimas DAHP sintasa. Uno está inhibido alostéricamente
se denomina inhibición por retroalimentación secuencial. (inhibición por retroalimentación) por la fenilalanina, otro
Se evidencian patrones similares en las vías que conducen por tirosina, y el tercero por triptófano. este esquema
a los aminoácidos aromáticos. El primer paso de la ayuda a la vía general a responder a las
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requisitos para uno o más de los aminoácidos aromáticos. La La glicina es un precursor de las porfirinas
regulación adicional tiene lugar después de que el camino se
La biosíntesis de porfirinas, para las cuales la glicina es un
bifurca en chorismate. Por ejemplo, las enzimas que catalizan los
precursor principal, es nuestro primer ejemplo, debido a la
dos primeros pasos de la rama del triptófano están sujetas a la
importancia central del núcleo de porfirina en proteínas hemo como
inhibición alostérica por el triptófano.
la hemoglobina y los citocromos. Las porfirinas se construyen a
partir de cuatro moléculas del porfobilinógeno derivado de
RESUMEN 22.2 Biosíntesis de aminoácidos monopirrol, que a su vez se deriva de dos moléculas de
-aminolevulinato. Hay dos vías principales para el -aminolevulinato.
ÿ Las plantas y las bacterias sintetizan los 20 aminoácidos En los eucariotas superiores (figura 22-23a), la glicina reacciona
comunes. Los mamíferos pueden sintetizar alrededor con la succinil CoA en el primer paso para producir -amino-
de la mitad; los demás son necesarios en la dieta -cetoadipato, que luego se descarboxila a -aminolevulinato. En
(aminoácidos esenciales). plantas, algas y la mayoría de las bacterias, el aminolevulinato se
ÿ Entre los aminoácidos no esenciales, el glutamato se forma forma a partir del glutamato (figura 22-23b). El glutamato se
por aminación reductora de -cetoglutarato y sirve como esterifica primero a glutamil-tRNAGlu (véase el capítulo 27 sobre
precursor de el tema de los RNA de transferencia); la reducción por NADPH
glutamina, prolina y arginina. La alanina y el aspartato convierte el glutamato en glutamato 1-semialdehído, que se
(y, por tanto, la asparagina) se forman a partir de escinde del ARNt. Una aminotransferasa convierte el glutamato 1-
piruvato y oxaloacetato, respectivamente, por semialdehído en -aminolevulinato.
transaminación. La cadena de carbono de la serina se
deriva del 3-fosfoglicerato. La serina es un precursor de En todos los organismos, dos moléculas de -aminolevulinato
la glicina; el átomo de carbono de la serina se transfiere se condensan para formar porfobilinógeno y, a través de una serie
a tetrahidrofolato. En los microorganismos, la cisteína se de reacciones enzimáticas complejas, cuatro moléculas de
produce a partir de la serina y del sulfuro producido por porfobilinógeno se unen para formar protoporfirina (figura 22-24).
la reducción del sulfato ambiental. Los mamíferos El átomo de hierro se incorpora después de ensamblar la
producen cisteína a partir de metionina y serina mediante protoporfirina, en un paso catalizado por la ferroquelatasa. La
una serie de reacciones que requieren S-adenosilmetionina biosíntesis de porfirina está regulada en los eucariotas superiores
y cistationina. por la concentración del producto hemo, que sirve como inhibidor
de la retroalimentación de los primeros pasos en la vía sintética.
Los defectos genéticos en la biosíntesis de porfirinas pueden
ÿ Entre los aminoácidos esenciales, los aminoácidos
conducir a la acumulación de intermediarios de la vía, lo que causa
aromáticos (fenilalanina, tirosina y triptófano) se forman
una variedad de enfermedades humanas conocidas colectivamente
por una vía en la que el corismato ocupa un punto de
como porfirias (cuadro 22-1).
ramificación clave.
El pirofosfato de fosforribosil es un precursor del triptófano
El hemo es la fuente de los pigmentos biliares
y la histidina. La vía de la histidina está interconectada
con la vía sintética de las purinas. La tirosina también se El grupo de hierro-porfirina (hemo) de la hemoglobina,
puede formar por hidroxilación de fenilalanina (y por lo liberado de los eritrocitos moribundos en el bazo, se
tanto se considera condicionalmente esencial). Las vías degrada para producir Fe3 libre y, finalmente, bilirrubina. Esta vía
para los otros aminoácidos esenciales son complejas. es sorprendente por su capacidad de inyectar color en la bioquímica
humana.
El primer paso en la vía de dos pasos, catalizado por la
ÿ Las rutas biosintéticas de aminoácidos son hemooxigenasa (HO), convierte el hemo en biliverdina, un derivado
sujeto a la inhibición alostérica del producto final; la de tetrapirrol lineal (abierto) (figura 22-25). Los otros productos de
enzima reguladora suele ser la primera en la secuencia. la reacción son Fe2 y CO libres.
La regulación de las diversas rutas sintéticas está El Fe2 se une rápidamente a la ferritina. El monóxido de carbono
coordinada. es un veneno que se une a la hemoglobina (cuadro 5-1), y la
producción de CO por la hemooxigenasa asegura que, incluso en
ausencia de exposición ambiental, cerca de 1% del hemo de un
individuo forme complejos con CO.
22.3 Moléculas derivadas de aminoácidos
La biliverdina se convierte en bilirrubina en el segundo paso,
Además de su función como componentes básicos de las proteínas, catalizada por la biliverdina reductasa. Puede monitorear esta
los aminoácidos son precursores de muchas biomoléculas reacción colorimétricamente en un experimento familiar in situ.
especializadas, incluidas hormonas, coenzimas, nucleótidos, Cuando tiene hematomas, el color negro y/o púrpura es el resultado
alcaloides, polímeros de la pared celular, porfirinas, antibióticos, de la liberación de hemoglobina de los eritrocitos dañados. Con el
pigmentos y neurotransmisores. Describimos aquí las vías para tiempo, el color cambia al verde de la biliverdina y luego al amarillo
varios de estos derivados de aminoácidos. de la bilirrubina. Bilirú
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ARRULLO
(a) ARRULLO
glutamato-1-semialdehído
aminomutasa
(b)
ARRULLO ARRULLO ARRULLO
CH2 ARNtGlu ATP AMPERIO PPi CH2 NADPH NADP tRNAGlu CH2
ARRULLO C O C O
H
Glutamato ARNtGlu
Glutamil-ARNtGlu Glutamato 1-semialdehído
FIGURA 22-23 Biosíntesis de -aminolevulinato. (a) En mamíferos y en rojo. (b) En bacterias y plantas, el precursor de -aminolevulinato es
otros eucariotas superiores, el -aminolevulinato se sintetiza a partir de glutamato.
glicina y succinil-CoA. Los átomos proporcionados por la glicina se muestran
PR C.A PR C.A
ARRULLO
C.A PR C.A PR
ARRULLO OOC NUEVA HAMPSHIRE hn NUEVA HAMPSHIRE hn
H
H3N C.A PR PR PR
NH3
-Aminolevulinato porfobilinógeno preuroporfirinógeno Uroporfirinógeno III
4
4 CO2
grupo de vinilo
CH3 CH3 CH3 PR CH3
PR PR PR PR PR PR PR PR
hemo protoporfirina protoporfirinógeno Coproporfirinógeno III
1 porfobilinógeno sintasa
2 uroporfirinógeno sintasa
3 uroporfirinógeno III cosintasa
4 uroporfirinógeno descarboxilasa
5 coproporfirinógeno oxidasa
6 protoporfirinógeno oxidasa
FIGURA 22-24 Biosíntesis de hemo a partir de -aminolevulinato. Ac 7 ferroquelatasa
representa acetilo (OCH2COO ); Pr, propionilo (OCH2CH2COO ).
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MV M Pr PR M MV
NADPH, H
biliverdina
reductasa
NADP
MV M Pr PR M MV
urobilinógeno urobilinógeno
transporte al riñón
YO M Pr PR M YO YO M Pr PR M YO
S.S H H
H H
O norte norte norte norte O O norte norte norte norte O
H H H H H H
urobilina estercobilina
bin es en gran parte insoluble y viaja en el torrente sanguíneo como un dición llamada ictericia. En casos de ictericia, la determinación de la
complejo con la albúmina sérica. En el hígado, la bilirrubina se transforma concentración de bilirrubina en sangre puede ser útil en el diagnóstico
en el pigmento biliar bilirrubina diglucurónido. Este producto es de una enfermedad hepática subyacente.
suficientemente soluble en agua para secretarse con otros componentes Los bebés recién nacidos a veces desarrollan ictericia porque aún no
de la bilis en el intestino delgado, donde las enzimas microbianas lo han producido suficiente glucuronil bilirrubina transferasa para procesar
convierten en varios productos, predominantemente urobilinógeno. Parte su bilirrubina. Un tratamiento tradicional para reducir el exceso de
del gen de urobilino se reabsorbe en la sangre y se transporta al riñón, bilirrubina, la exposición a una lámpara fluorescente, provoca una
donde se convierte en urobilina, el compuesto que da a la orina su color conversión fotoquímica de la bilirrubina en compuestos que son más
amarillo (fig. 22-25, rama izquierda). solubles y fáciles de excretar.
El urobilinógeno que queda en el intestino se convierte (en otra reacción Estas vías de descomposición del hemo desempeñan un papel
dependiente de microbios) en estercobilina (fig. 22-25, rama derecha), importante en la protección de las células contra el daño oxidativo y en
que imparte el color marrón rojizo a las heces. la regulación de ciertas funciones celulares. El CO producido por la
hemooxigenasa es tóxico en concentraciones altas, pero en las
El deterioro de la función hepática o el bloqueo de la secreción de concentraciones muy bajas generadas durante la degradación del hemo
bilis hacen que la bilirrubina se filtre del hígado a la sangre, lo que parece tener algunas funciones reguladoras y/o de señalización. Actúa
provoca una coloración amarillenta de la piel y los globos oculares, una estafa. como vasodilatador, mucho más
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Las porfirias (enumeradas a la derecha) son un grupo de Esta condición genética puede haber dado lugar a los mitos de
enfermedades genéticas en las que, debido a defectos en las enzimas del vampiros de la leyenda popular.
vía biosintética de la glicina a las porfirinas, los precursores de Los síntomas de la mayoría de las porfirias ahora se controlan
porfirinas específicos se acumulan en los eritrocitos, fácilmente con cambios en la dieta o la administración de hemo o
derivados del hemo.
líquidos corporales y el hígado. La forma más común es
porfiria intermitente aguda. La mayoría de los individuos afectados -Aminolevulinato
son heterocigotos y suelen ser asintomáticos, dos porfiria
porque la única copia del gen normal proporciona
porfobilinógeno
un nivel suficiente de función enzimática. Sin embargo, ciertos
factores nutricionales o ambientales (todavía poco Porfiria intermitente aguda
entendido) puede causar una acumulación de -aminolevulinato
preuroporfirinógeno
y porfobilinógeno, lo que lleva a ataques de
Porfiria eritropoyética congénita
dolor abdominal y disfunción neurológica. Rey
Jorge III, monarca británico durante la Revolución Americana, sufrió Uroforfirinógeno III
varios episodios de aparente
Porfiria cutánea tardía
locura que empañaba el historial de este hombre consumado. Los
síntomas de su condición. coproporfirinógeno
sugieren que Jorge III sufría de porfiria de tienda intermitente aguda. coproporfiria hereditaria
protoporfirinógeno
Una de las porfirias más raras resulta en una acumulación de
uroporfirinógeno I, un isómero anormal porfiria variegata
de un precursor de protoporfirina. Este compuesto tiñe protoporfirina
la orina roja, hace que los dientes emitan una fuerte fluorescencia
Protoporfiria eritropoyética
a la luz ultravioleta y hace que la piel sea anormalmente sensible a
la luz solar. Muchas personas con esta porfiria hemo
igual que (pero menos potente que) el óxido nítrico (discutido Los aminoácidos son precursores de la
abajo). Los niveles bajos de CO también tienen algunos efectos
creatina y el glutatión
reguladores sobre la neurotransmisión. La bilirrubina es el antioxidante
más abundante en los tejidos de los mamíferos y es responsable de la La fosfocreatina, derivada de la creatina, es un amortiguador
mayor parte de la actividad antioxidante en el suero. Su energético importante en el músculo esquelético (v. fig. 13-5).
Los efectos protectores parecen ser especialmente importantes en La creatina se sintetiza a partir de la glicina y la arginina (fig.
el cerebro en desarrollo de los recién nacidos. La toxicidad celular 22–26); metionina, en forma de S-adenosilmetionina,
asociada con la ictericia puede deberse a la bilirrubina actúa como donante de grupos metilo.
niveles superiores a la albúmina sérica necesaria para solubilizarla. Glutatión (GSH), presente en plantas, animales,
y algunas bacterias, a menudo en niveles altos, se puede pensar
Dadas estas funciones variadas de los productos de degradación como tampón redox. Se deriva de la glicina, el glutamato y la cisteína
del grupo hemo, la ruta de degradación está sujeta a regulación, (figura 22-27). El grupo -carboxilo
principalmente en el primer paso. Los humanos tenemos al menos tres de glutamato es activado por ATP para formar un intermediario de
isoenzimas de la hemo oxigenasa. HO-1 está altamente regulado; fosfato de acilo, que luego es atacado por el -
la expresión de su gen es inducida por una amplia gama de grupo amino de la cisteína. Sigue una segunda reacción de
condiciones de estrés (esfuerzo cortante, angiogénesis (desarrollo condensación, con el grupo -carboxilo de la cisteína
incontrolado de vasos sanguíneos), hipoxia, hiperoxia, choque térmico, activado a un fosfato de acilo para permitir la reacción con
exposición a la luz ultravioleta, hidrógeno glicina. La forma oxidada de glutatión (GSSG), producida en el curso
peróxido y muchas otras agresiones metabólicas). HO-2 es de sus actividades redox, contiene dos
se encuentra principalmente en el cerebro y los testículos, donde se moléculas de glutatión unidas por un enlace disulfuro.
expresa continuamente. La tercera isoenzima, HO-3, aún no está bien El glutatión probablemente ayuda a mantener el sulfhidrilo
caracterizada. ÿ grupos de proteínas en estado reducido y el hierro de
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hemo en estado ferroso (Fe2 ) y actúa como agente reductor de se une al átomo de selenio (Se) en forma de selenocisteína (v.
la glutaredoxina en la síntesis de desoxirribonucleótidos (figura fig. 3-8a), que es esencial para su actividad.
22-39). Su función redox también se utiliza para eliminar los
peróxidos tóxicos formados en el curso normal del crecimiento y Los D-aminoácidos se encuentran principalmente en las bacterias
C PAGS
NH2
Glicina
A
CH2
A
NUEVA HAMPSHIRE
A
Arginina
ARRULLO
(CH2)3
(a)
A
CH O
NH3 Glutamato
A
amidinotransferasa ARRULLO
ornitina cisteína
atp
NH2
A
-glutamil
C PAGS
NH2 cisteína sintetasa
A
NUEVA HAMPSHIRE
guanidinoacetato
A
Pi ADP
CH2
A
ARRULLO
-Glu–Cys
adoMet metionina
metiltransferasa
adolescencia Glicina
atp
NH2
A
glutatión
C PAGS
NH2 sintetasa
A
norte
O
CH3 creatina
A
Pi ADP
CH2
A
ARRULLO
-Glú Cis gly
atp NH3 O O
creatina
quinasa
ADP OOC CH CH2 CH2 CAROLINA DEL NORTE CH C norte CH2 ARRULLO
O H CH2 H
SH
A
OPcorreos O
A
Glutatión (GSH)
NUEVA HAMPSHIRE
(reducido)
A
C PAGS
NH2
A
norte
O
CH2 S
A
ARRULLO S
Fosfocreatina
-Glu–Cys–Gly
Glutatión (GSSG)
FIGURA 22-26 Biosíntesis de creatina y fosfocreatina. La creatina (oxidado)
está hecha de tres aminoácidos: glicina, arginina y metionina. Esta vía
muestra la versatilidad de los aminoácidos como precursores de otras FIGURA 22-27 Metabolismo del glutatión. (a) Biosíntesis de glutatión.
biomoléculas nitrogenadas. (b) Forma reducida de glutatión.
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la alanina racemasa son objetivos principales para la industria farmacéutica. Los análogos de GABA se utilizan en el tratamiento de la epilepsia y
agentes Uno de estos agentes, la L-fluoroalanina, está siendo hipertensión. Los niveles de GABA también se pueden aumentar mediante
probado como un fármaco antibacteriano. Otro, cicloserina, administrar inhibidores de la enzima degradadora de GABA
se utiliza para tratar la tuberculosis. Debido a que estos inhibidores GABA aminotransferasa. Otro importante neurotransmisor, la
también afectan algunas enzimas humanas que requieren PLP, sin serotonina, se deriva del triptófano en un
embargo, tienen efectos secundarios potencialmente indeseables. ÿ vía de dos pasos.
ARRULLO
La histidina se descarboxila a histamina,
O un potente vasodilatador en los tejidos animales. La histamina se libera
H3NCH H2C NUEVA HAMPSHIRE
en grandes cantidades como parte de la respuesta alérgica,
CH2 HC C y también estimula la secreción de ácido en el estómago. A
amino
Las aminas biológicas son productos transferasa
de la descarboxilación de aminoácidos
O
Muchos neurotransmisores importantes son primarios CH2 C ARRULLO
H CH2 CH ARRULLO
ornitina ácida, un componente del ciclo de la urea. Un denominador
común de muchas de estas vías es amino NH3
descarboxilación ácida, otra reacción que requiere PLP Fenilalanina
(ver figura 18-6).
descarboxilasa CO2
La síntesis de algunos neurotransmisores se ilustra en la figura
22-29. La tirosina da lugar a una familia de fenilalanina
amoníaco
catecolaminas que incluye dopamina, norepinefrina y epinefrina. CH2 ARRULLO liasa NH3
Los niveles de catecolaminas son
correlacionado con, entre otras cosas, cambios en la sangre
presión. El trastorno neurológico de la enfermedad de Parkinson norte CH CH ARRULLO
H
se asocia con una producción insuficiente de dopamina, y
Indol-3-acetato
tradicionalmente se ha tratado mediante la administración de L-dopa. cinamato
(auxina)
La sobreproducción de dopamina en el cerebro puede estar relacionada
a trastornos psicológicos como la esquizofrenia.
(a) (b)
La descarboxilación del glutamato da lugar a -amino butirato
(GABA), un neurotransmisor inhibidor. Su FIGURA 22-28 Biosíntesis de dos sustancias vegetales a partir de aminoácidos.
la subproducción se asocia con ataques epilépticos. (a) indol-3-acetato (auxina) y (b) cinamato (sabor a canela).
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tirosina Glutamato
tetrahidrobiopterina
plp norte
glutamato Triptófano H
O2 descarboxilasa
tirosina CO2
hidroxilasa
H2O tetrahidrobiopterina
dihidrobiopterina NH3 O2
triptófano
HO OOC hidroxilasa
CH2 CH2 CH2 H2O
NH3
-Aminobutirato
dihidrobiopterina
HO CH2 COO CH (GABA)
Dopa
NH3
aminoácido plp
aromático CH2 CH ARRULLO
CO2 NH3 HO
descarboxilasa
CH2 CH ARRULLO
HO
NH3 norte
5-
N NH H
hidroxitriptófano
HO CH2 CH2 Histidina aminoácido plp
dopamina aromático
ascorbato plp descarboxilasa CO2
histidina
descarboxilasa CO2
O2
dopamina NH3
-hidroxilasa H2O
NH3 CH2 CH2
Dehidroascorbato HO
CH2 CH2
HO
NH3
N NH norte
HO CH CH 2 H
Histamina serotonina
OH
norepinefrina
adoMet
feniletanolamina FIGURA 22-29 Biosíntesis de algunos neurotransmisores a partir de
N-metiltransferasa
adolescencia aminoácidos. El paso clave es el mismo en cada caso: una descarboxilación
861
ARRULLO
atp P Pi Pi H3N CH
S-adenosilmetionina
CH2
metionina
CH2
S adenosina NH3
adoMet ornitina
plp plp
descarboxilasa descarboxilasa
CO2 CO2
CH3
H3N (CH2) 3NH (CH2)4 NH3 espermidina
adoMet
descarboxilado
propilaminotransferasa II
CH3 S adenosina
FIGURA 22-30 Biosíntesis de espermidina y espermina. Los pasos de
descarboxilación dependientes de PLP están sombreados en rosa. En
H3N (CH2)3 NUEVA HAMPSHIRE
(CH2)4 NUEVA HAMPSHIRE
(CH2)3 NH3
estas reacciones, la S-adenosilmetionina (en su forma descarboxilada) actúa
como fuente de grupos propilamino (sombreado en azul). espermina
FIGURA 22-31 Biosíntesis de óxido nítrico. Ambos pasos son catalizados por la óxido nítrico sintasa.
El nitrógeno del NO se deriva del grupo guanidino de la arginina.
ÿ La glicina y la arginina dan lugar a la creatina y ÿ La arginina es el precursor del óxido nítrico, un mensajero
fosfocreatina, un amortiguador de energía. El glutatión, biológico.
formado a partir de tres aminoácidos, es un importante
agente reductor celular.
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Curar la enfermedad del sueño africana con un La cubierta celular de los tripanosomas está cubierta por
caballo de Troya bioquímico La enfermedad del una sola proteína, que es el antígeno al que responde el sistema
inmunitario. Sin embargo, de vez en cuando, mediante un proceso
sueño africana, o tripanosomiasis africana, es causada por
de recombinación genética (cuadro 28-1), algunas células de la
protistas (eucariotas unicelulares) llamados tripanosomas (Fig.
población de tripanosomas infectantes cambian a una nueva
1). Esta enfermedad (y las enfermedades relacionadas
cubierta proteica, no reconocida por el sistema inmunitario. Este
causadas por tripanosomas) es importante desde el punto de
proceso de “cambiar de abrigo” puede ocurrir cientos de veces.
vista médico y económico en muchos países en desarrollo.
El resultado es una infección cíclica crónica: el huésped humano
Hasta hace poco, la enfermedad era virtualmente incurable. Las
desarrolla fiebre, que disminuye a medida que el sistema
vacunas son ineficaces porque el parásito tiene un mecanismo
inmunitario combate la primera infección; los tripanosomas con
novedoso para evadir el sistema inmunitario del huésped.
cubiertas cambiadas se convierten en la semilla de una segunda
infección y la fiebre reaparece. Este ciclo puede repetirse durante
semanas y la persona debilitada eventualmente muere.
H2 norte
(CH2)3 CH C O
H
O
NH2 H2O H2 norte
(CH2)3 CH C CO2 H3 norte
(CH2)3 CH
O NUEVA HAMPSHIRE
O NUEVA HAMPSHIRE
CH CH H CH
correos CH2 OH correos CH2 OH correos CH2 OH
H2O
putrescina
FIGURA 2 Mecanismo de reacción de la ornitina descarboxilasa.
22.4 Biosíntesis y degradación así como de intermediarios biosintéticos activados tales como UDP-
de nucleótidos glucosa y CDP-diacilglicerol. Algunos, como cAMP y cGMP, también
son segundos mensajeros celulares.
Como se discutió en el Capítulo 8, los nucleótidos desempeñan una Dos tipos de vías conducen a los nucleótidos: las vías de
variedad de funciones importantes en todas las células. Son los novo y las vías de salvamento. La síntesis de novo de nucleótidos
precursores del ADN y el ARN. Son transportadores esenciales de comienza con sus precursores metabólicos: aminoácidos, ribosa 5-
energía química, una función principalmente del ATP y, en cierta fosfato, CO2 y NH3.
medida, del GTP. Son componentes de los cofactores NAD, FAD, Las vías de salvamento reciclan las bases libres y los nucleósidos
S-adenosilmetionina y coenzima A, como liberados por la degradación de los ácidos nucleicos. Ambos tipos de
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22–30). En las células de los mamíferos, la ornitina descarboxilasa Figura 2. Una vez que se libera CO2, el movimiento de los
experimenta una rápida renovación, es decir, una ronda electrones se invierte y se produce putrescina (ver Fig.
constante de degradación y síntesis de enzimas. En algunos 22–30). En base a este mecanismo se han diseñado varios
panosomas, sin embargo, la enzima, por razones que no se activadores suicidas, uno de los cuales es la difluorometilornitina
comprenden bien, es estable y no se reemplaza fácilmente por (DFMO). DFMO es relativamente inerte en solución. Sin
una enzima recién sintetizada. Un inhibidor de la ornitina embargo, cuando se une a la ornitina descarboxilasa, la enzima
descarboxilasa que se une permanentemente a la enzima tendría se inactiva rápidamente (Fig. 3).
poco efecto sobre las células humanas, que podrían reemplazar El inhibidor actúa proporcionando un sumidero de electrones
rápidamente a la enzima inactivada, pero afectaría negativamente alternativo en forma de dos átomos de flúor colocados
al parásito. estratégicamente, que son excelentes grupos salientes. En lugar
Los primeros pasos de la reacción normal catalizada por de que los electrones se muevan hacia la estructura del anillo de
la ornitina descarboxilasa se muestran en la Fig. PLP, la reacción da como resultado el desplazamiento de un átomo de flúor.
La S de un residuo de Cys en el sitio activo de la enzima forma
DFMO un complejo covalente con el aducto inhibidor de PLP altamente
F F reactivo en una reacción esencialmente irreversible. De esta
CH O F F forma, el inhibidor hace uso de los propios mecanismos de
H2 norte (CH2)3 C C CH
reacción de la enzima para matarla.
O
O
DFMO ha demostrado ser muy eficaz contra la enfermedad
NH2 H2 norte (CH2)3 C C
del sueño africana en ensayos clínicos y ahora se usa para tratar
H2O O
O NUEVA HAMPSHIRE
la enfermedad del sueño africana causada por T. brucei
CH CH gambiense. Enfoques como este muestran una gran promesa
PAGS O CH2 OH correos CH2 OH para el tratamiento de una amplia gama de enfermedades. El
diseño de fármacos basados en el mecanismo y la estructura
enzimáticos puede complementar los métodos más tradicionales
norte CH3 norte CH3
H H de prueba y error para desarrollar productos farmacéuticos.
CO2F _
reordenamientos adicionales
¡Atascado!
CH CH
correos CH2 OH correos CH2 OH
Las vías son importantes en el metabolismo celular y ambas se un tiempo, unido a la ribosa durante todo el proceso. El anillo de
presentan en esta sección. pirimidina se sintetiza como orotato, se une a la ribosa fosfato y
Las vías de novo para la biosíntesis de purinas y pirimidinas luego se convierte en los nucleótidos de pirimidina comunes
parecen ser casi idénticas en todos los organismos vivos. En necesarios en la síntesis de ácidos nucleicos. Aunque las bases
particular, las bases libres guanina, adenina, timina, citidina y libres no son intermedias en las vías de novo, sí lo son en algunas
uracilo no son intermediarios en estas vías; es decir, las bases no de las vías de recuperación.
se sintetizan y luego se unen a la ribosa, como cabría esperar. La
estructura del anillo de purina está formada por uno o unos pocos Las vías de novo para la síntesis de pirimidinas y purinas
átomos en comparten varios precursores importantes.
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Glicina
aspartato
AIRE 865
HCO3 _
6
atp
6a
Pi ADP
correos CH2 O
H norte
CO2 HC
H H
O CH N5-carboxiaminoimidazol
H PAGS PAGS
C ribonucleótido
5-fosforribosil 1- ONC norte
OH OH (N5-CAIR)
pirofosfato (PRPP) H
O R
glutamina
1 7
Glutamato
PPi
(CAIR)
OH OH R
Glicina
aspartato
2
atp 8
atp
Pi ADP
Pi ADP
ARRULLO
NH3
H2C
Ribonucleótido CH2 O
O C de glicinamida (GAR) H norte
NUEVA HAMPSHIRE
H C norte C C
CH -Succinil-5-aminoimidazol-4-
norte
N10-formil H4 folato
3 R
folato H4
9 Fumarato
H
norte
O
H2C C H
Ribonucleótido de
formilglicinamida (FGAR) C
O CO norte
norte H
H2N C
CH Ribonucleótido de 5-aminoimidazol-4-
C carboxamida (AICAR)
R norte
H2N
glutamina R
H norte CO H H
norte H R 1 glutamina-PRPP
R 11 H2O amidotransferasa
2 GAR sintetasa
atp O 3 GAR transformilasa
5 C 4 FGAR amidotransferasa
Pi ADP norte
H CN 5 FGAM ciclasa
H2O CH
HC C (AIR sintetasa)
norte
O norte
HC
Ribonucleótido de 5-
norte
6 N5-CAIR sintetasa
CH
aminoimidazol (AIR) OP O CH2 O 6a AIRE carboxilasa
C
H2N norte
7 N5-CAIR mutasa
O H H
R 8 SAICAR sintetasa
H H
9 SAICAR liasa
OH O 10 AICAR transformilasa
Inosinato (IMP)
11 IMP sintasa
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El primer intermedio con un anillo de purina completo es La biosíntesis de nucleótidos de purina está regulada por
inosinato (IMP).
la inhibición de la retroalimentación
Como en el biosintético de triptófano e histidina
vías, las enzimas de la síntesis de IMP parecen ser Tres mecanismos principales de retroalimentación cooperan en la
organizados como grandes complejos multienzimáticos en la célula. regulación de la tasa general de síntesis de nucleótidos de purina
Una vez más, la evidencia proviene de la existencia de polipéptidos de novo y las tasas relativas de formación de los dos extremos.
únicos con varias funciones, algunas de las cuales catalizan pasos productos, adenilato y guanilato (figura 22-35). los
no secuenciales en la ruta. en eucariota primer mecanismo se ejerce sobre la primera reacción que es
células que van desde levaduras hasta moscas de la fruta y pollos, pasos exclusivo de la síntesis de purinas: transferencia de un grupo amino
1 y, 53en
, la figura 22-33 son catalizadas por una proteína a PRPP para formar 5-fosforribosilamina. esta reacción
multifuncional. Una proteína multifuncional adicional cataliza los es catalizada por la enzima alostérica glutamina-PRPP
pasos 10 y 11. En humanos, una enzima multifuncional combina amidotransferasa, que es inhibida por los productos finales IMP,
las actividades de la AIR carboxilasa y la SAICAR sintetasa (pasos AMP y GMP. AMP y GMP actúan sinérgicamente en esta inhibición
6a y 8). concertada. Así, cada vez que cualquiera
En las bacterias, estas actividades se encuentran en proteínas AMP o GMP se acumula en exceso, el primer paso en su
separadas, pero en ellas puede existir un gran complejo no covalente. la biosíntesis de PRPP se inhibe parcialmente.
estas células. La canalización de los intermedios de reacción. En el segundo mecanismo de control, ejercido en un momento posterior
de una enzima a la siguiente permitida por estos complejos es etapa, un exceso de GMP en la célula inhibe la formación de
probablemente especialmente importante para intermediarios xantilato del inosinato por IMP deshidrogenasa, sin afectar la
inestables como la 5-fosforribosilamina. formación de AMP (fig. 22-35). Por el contrario, una acumulación
La conversión de inosinato a adenilato requiere la de adenilato inhibe la formación
inserción de un grupo amino derivado del aspartato (Fig. de adenilosuccinato por la adenilosuccinato sintetasa,
22–34); esto tiene lugar en dos reacciones similares a las sin afectar la biosíntesis de GMP. en el tercero
se utiliza para introducir N-1 del anillo de purina (Fig. 22-33, mecanismo, se requiere GTP en la conversión de IMP
pasos 8 y 9). Una diferencia crucial es que GTP en lugar a AMP (figura 22-34, paso 1), mientras que se requiere ATP
que el ATP es la fuente del fosfato de alta energía en para la conversión de IMP a GMP (paso 4), un recíproco
sintetizar adenilosuccinato. El guanilato está formado por disposición que tiende a equilibrar la síntesis de la
la oxidación del inosinato en C-2 que requiere NAD, seguida de la dos ribonucleótidos.
adición de un grupo amino derivado de la glutamina. El ATP se El último mecanismo de control es la inhibición de
escinde en AMP y PPi en el paso final . Síntesis de PRPP por la regulación alostérica de la ribosa.
(Figura 22-34). fosfato pirofosfoquinasa. Esta enzima se inhibe
H
OOC CH2 C ARRULLO
Fumarato
NUEVA HAMPSHIRE
NH2
norte norte
GTP PIB Pi norte norte
adenilosuccinato
aspartato norte
norte
liasa norte
norte
norte
sintetasa
hn adenilosuccinato adenilato
(AMPERIO)
norte
norte
Costilla PAGS
inosinato H2O
NAD
(DIABLILLO)
NADHH
O gln Glu ATP AMP PPi O
DIABLILLO
deshidrogenasa hn
norte
hn
norte
XMP-glutamina
O norte
norte
H2O amidotransferasa H2N norte
norte
H
Costilla PAGS Costilla PAGS
PRPP Fosfato de
aspartato
carbamoilo
AMPERIO
glutamina-PRPP trans
amidotransferasa BPF carbamoilasa
Pi O O
DIABLILLO C
H2N CH2
N-Carbamoilaspartato
C CH ARRULLO
5-fosforribosilamina O norte
dihidroorotasa H
O
9 pasos H2O
C
hn CH2
L-dihidroorotato
C CH ARRULLO
O norte
DIABLILLO
H
adenilosuccinato IMP NAD
sintetasa deshidrogenasa dihidroorotato
deshidrogenasa
AMPERIO BPF O
NADHH
C
hn CH
XMP Orotato
XMP-glutamina C C
amidotransferasa O norte ARRULLO
H
Adenilosuccinato PRPP
BPF orotato O
adenilosuccinato liasa
fosforribosil
C
transferasa
hn CH
AMPERIO
PPi C C
O norte ARRULLO
orotidilato PAGS
OOCH2
FIGURA 22-35 Mecanismos reguladores en la biosíntesis de O
quinasas OH OH
Los ribonucleótidos de pirimidina comunes son citidina 5 -
monofosfato (CMP; citidilato) y uridina 5 - monofosfato
2ADP
(UMP; uridilato), que contienen las pirimidinas citosina y
uracilo. La biosíntesis de nucleótidos de pirimidina de Uridina 5 -trifosfato (UTP)
novo (fig. 22-36) procede de una manera algo diferente gln
de la síntesis de nucleótidos de purina; primero se forma
el anillo de pirimidina de seis miembros y luego se une a
la ribosa 5-fosfato. En este proceso se requiere carbamoil citidilato Glú
sintetasa
fosfato, también un intermediario en el ciclo de la urea
atp
(figura 18-10). Sin embargo, como apuntábamos NH2
C
norte CH
Pi ADP
FIGURA 22-36 Síntesis de novo de nucleótidos de pirimidina: C CH
O norte
yzNDP
ATP NMP ADP
SA
S
Los sistemas celulares eficientes para refosforilar ribonucleótido ribonucleótido
reductasa S reductasa
ADP a ATP tiende a empujar esta reacción en la dirección SA
de productos.
Los nucleósidos difosfatos se convierten en trifosfatos por la
acción de una enzima ubicua, la nucleósido difosfato quinasa, SH SH
S S
que cataliza la reacción . glutaredoxina glutaredoxina tiorredoxina tiorredoxina
S S
SH SH
(a) (b)
Los ribonucleótidos son los
precursores de los desoxirribonucleótidos FIGURA 22-39 Reducción de ribonucleótidos a desoxirribonucleótidos por
la ribonucleótido reductasa. Los electrones se transmiten (azul
Los desoxirribonucleótidos, los componentes básicos del ADN, son flechas) a la enzima de NADPH por (a) glutaredoxina o (b) tioredoxina. Los
derivado de los ribonucleótidos correspondientes por reducción grupos sulfuro en la glutaredoxina reductasa son aportados por
directa en el átomo de carbono 2 de la D-ribosa a dos moléculas de glutatión unido (GSH; GSSG indica oxidado
formar el derivado 2-desoxi. Por ejemplo, la adenosina glutatión). Tenga en cuenta que la tiorredoxina reductasa es una flavoenzima, con
difosfato (ADP) se reduce a 2 -desoxiadenosina FAD como grupo protésico.
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subunidad R1
Base Base
OPP CH2 O SA OPP CH2 O SA
H H SA H SA
H H H H
3 2
1
OH OH OH OH
PND H
Ribonucleótido X X
reductasa subunidad R2
Tiorredoxina SS
PND (glutaredoxina)
6 2
Base Base
OPP CH2 O S OPP CH2 O SA
H H S H S
H H H H
OH H OH O H
dNDP H
H
X X
O
5 3
S.S
S
Base Base
OPP CH2 O S OPP Canal 2 O H
H S H S
4
H H H H
OH H OH
X H XH _
atp (d)ATP
dCTP CDP CDP CDP dCTP
FIGURA 22-42 Regulación de la ribonucleótido reductasa por los en el segundo tipo de sitio regulatorio (derecha). El diagrama indica la inhibición
desoxinucleótidos trifosfatos. La actividad general de la enzima se ve afectada. o estimulación de la actividad enzimática con los cuatro sustratos diferentes.
uniéndose al sitio regulador primario (izquierda). La especificidad del sustrato La ruta de dUDP a dTTP se describe más adelante (véanse las Figs.
de la enzima se ve afectada por la naturaleza de la molécula efectora unida 22–43, 22–44).
La regulación de la ribonucleótido reductasa de E. coli es dTTP, que cambia la especificidad para favorecer la reducción de
inusual en que no solo su actividad sino su sustrato PIB. Los altos niveles de dGTP, a su vez, cambian la especificidad
la especificidad está regulada por la unión de moléculas efectoras. a la reducción de ADP, y los altos niveles de dATP apagan la enzima.
Cada subunidad R1 tiene dos tipos de sitios reguladores Se cree que estos efectores inducen varias conformaciones enzimáticas
(Figura 22-40). Un tipo afecta la actividad enzimática general distintas con especificidades alteradas.
y se une al ATP, que activa la enzima, o
dATP, que lo inactiva. El segundo tipo altera la especificidad del
sustrato en respuesta a la molécula efectora:
El timidilato se deriva de dCDP y dUMP
ATP, dATP, dTTP o dGTP, que está unido allí (Fig.
22–42). Cuando ATP o dATP están unidos, la reducción de UDP El ADN contiene timina en lugar de uracilo, y el de
y CDP es favorecido. Cuando dTTP o dGTP están vinculados, La vía novo a la timina implica solo desoxirribonucleótidos. El precursor
se estimula la reducción del PIB o ADP, respectivamente. inmediato del timidilato.
El esquema está diseñado para proporcionar un conjunto equilibrado de (dTMP) es volcado. En bacterias, el camino hacia dUMP comienza
precursores de la síntesis de ADN. ATP es también un general con la formación de dUTP, ya sea por desaminación de
activador de la biosíntesis y reducción de ribonucleótidos. dCTP o por fosforilación de dUDP (figura 22-43). los
La presencia de dATP en pequeñas cantidades aumenta la dUTP se convierte en dUMP mediante una dUTPase. Este último
reducción de nucleótidos de pirimidina. Una sobreoferta de La reacción debe ser eficiente para mantener las reservas de dUTP bajas y
los dNTP de pirimidina se señalan por altos niveles de prevenir la incorporación de uridilato en el ADN.
dUTPasa
vertedero
timidilato
FIGURA 22-43 Biosíntesis de timidilato (dTMP). los caminos
sintasa
se muestran comenzando con la reacción catalizada por el ribonucleótido
dTMP
reductasa. La figura 22-44 proporciona detalles de la reacción de la timidilato
sintasa.
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H
O O
C H
vertedero hn dTMP hn
H
O norte O norte
PAGS
O CH2 PAGS
O CH2
O O
H H H H
H H H H
OH H OH H
timidilato
sintasa
H H
H2N norte norte H2N norte norte
H
hn hn
n CH2 norte CH2
O H C O
norte R HN R
H
N5 , N10-metileno 7,8-Dihidrofolato
tetrahidrofolato
Glicina NADPH H
serina
plp dihidrofolato
hidroximetil reductasa
transferasa
serina NADP
H
H2N norte norte
H
hn
n CH2
O H
hn R
tetrahidrofolato
FIGURA 22-44 Conversión de dUMP a dTMP por timidilato sintasa y dihidrofolato drofolato. En la síntesis de dTMP, los tres hidrógenos del grupo metilo agregado se derivan de
reductasa. Se requiere serina hidroximetiltransferasa para la regeneración de la forma N5 ,N10- N5 ,N10-metilentetrahidrofolato (rosa y gris).
metileno de tetrahy
Excretado por:
AMPERIO
O
H2O
5 -nucleotidasa
C norte
hn C
Pi C
COH Ácido úrico
Primates, aves,
C C reptiles, insectos
BPF adenosina norte
HO norte
H2O H
H2O
adenosina
5 -nucleotidasa
desaminasa 1
Pi 2 O2H2O _
NH3 urato oxidasa
guanosina inosina CO2
H2O H2O O
nucleosidasa nucleosidasa
H
norte
ribosa ribosa NH2 C
C O alantoína La mayoría de los mamíferos
O O O C C
norte
H norte
norte norte H H
hn hn Hipoxantina (forma
ceto) H2O
H2N norte
norte
H
norte
norte
H alantoinasa
guanina
H2O H2O O2
xantina
oxidasa NH2 ARRULLO NH2
NH3 H2O2
C C C alantoato peces óseos
O O norte H NO
guanina H H
desaminasa norte
hn Xantina
H2O
(forma ceto)
alantoicasa
HO NN
H ARRULLO
H2O O2 CHO
xantina
oxidasa glioxilato
H2O2
O Anfibios, peces
O
Urea cartilaginosos
norte 2H2N _ C NH2
hn
OH
2H2O
HO NN ureasa
H
2CO2
Ácido úrico
4NH4
invertebrados marinos
FIGURA 22-45 Catabolismo de nucleótidos de purina. Tenga en cuenta que los como ácido úrico a partir de la degradación de purinas. De manera similar, los peces excretan
primates excretan mucho más nitrógeno como urea a través del ciclo de la urea (Capítulo 18) que mucho más nitrógeno como NH4 que como urea producida por la vía que se muestra aquí.
El catabolismo de GMP también produce ácido úrico como Las vías de degradación de las pirimidinas conducen
producto final. GMP se hidroliza primero a guanosina, que luego generalmente a la producción de NH4 y, por tanto, a la síntesis
se escinde a guanina libre. La guanina se somete a eliminación de urea. La timina, por ejemplo, se degrada a
hidrolítica de su grupo amino para producir xantina, que se metilmalonilsemialdehído (fig. 22-46), un intermedio del
convierte en ácido úrico mediante la xantina oxidasa (figura 22-45). catabolismo de la valina. Se degrada aún más a través de
El ácido úrico es el producto final excretado del propionil-CoA y metilmalonil-CoA a succinil CoA (figura 18-27).
metabolismo de las purinas en primates, aves y algunos otros
animales. Un ser humano adulto sano excreta ácido úrico a una Se han encontrado aberraciones genéticas en el
velocidad de alrededor de 0,6 g/24 h; el producto excretado metabolismo de las purinas humanas, algunas con
surge en parte de las purinas ingeridas y en parte del recambio consecuencias graves. Por ejemplo, la deficiencia de
de los nucleótidos de purina de los ácidos nucleicos. En la adenosina desaminasa (ADA) conduce a una enfermedad de
mayoría de los mamíferos y muchos otros vertebrados, el ácido inmunodeficiencia grave en la que los linfocitos T y los linfocitos
úrico se degrada aún más a alantoína por la acción de la urato B no se desarrollan adecuadamente. La falta de ADA conduce
oxidasa. En otros organismos, la vía se extiende aún más, a un aumento de 100 veces en la concentración celular de
como se muestra en la figura 22-45. dATP, un inhibidor potente de la ribonucleótido reductasa (figura 22-42). Niveles a
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OH OH
H
C C C norte
norte C norte C
norte CH
HC C HC C
norte norte
norte
H norte
H
alopurinol Hipoxantina
(forma enol)
xantina
oxidasa
FIGURA 22-47 Alopurinol, un inhibidor de la xantina
OH oxidasa. La hipoxantina es el sustrato normal de la
La gota se trata eficazmente mediante una combinación de terapias serina y acivicina (fig. 22-48). La azaserina, caracterizada por John Buchanan
nutricionales y farmacológicas. Los alimentos especialmente ricos en nucleótidos en la década de 1950, fue uno de los primeros ejemplos de un inactivador
y ácidos nucleicos, como el hígado o los productos glandulares, no se incluyen enzimático basado en un mecanismo (inactivador suicida; pág. 211 y cuadro
en la dieta. El fármaco alopurinol proporciona un alivio importante de los 22-2). Acivicin se muestra prometedor como agente quimioterapéutico contra el
síntomas (fig. 22-47), que inhibe la xantina oxidasa, la enzima que cataliza la cáncer.
conversión de purinas en ácido úrico. Allop urinol es un sustrato de la xantina Otros objetivos útiles para los agentes farmacéuticos son la timidilato
oxidasa, que convierte el alopurinol en oxipurinol (aloxantina). El oxipurinol activa sintasa y la dihidrofolato reductasa, enzimas que proporcionan la única vía
la forma reducida de la enzima al permanecer estrechamente unido a su sitio celular para la síntesis de timina (fig. 22-49). Un inhibidor que actúa sobre la
activo. Cuando se inhibe la xantina oxidasa, los productos excretados del timidilato sintasa, el fluorouracilo, es un agente quimioterapéutico importante.
metabolismo de las purinas son xantina e hipoxantina, que son más solubles en El fluorouracilo en sí no es el inhibidor enzimático. En la célula, las vías de
agua que el ácido úrico y es menos probable que formen depósitos cristalinos. recuperación lo convierten en el desoxinucleósido monofosfato FdUMP, que se
El alopurinol fue desarrollado por Gertrude Elion y George Hitchings, quienes une a la enzima y la inactiva. La inhibición por FdUMP (figura 22-50) es un
también desarrollaron el aciclovir, que se usa en el tratamiento de personas con ejemplo clásico de inactivación enzimática basada en mecanismos. Otro agente
SIDA, y otros análogos de purina que se usan en la quimioterapia contra el quimioterapéutico destacado, el metotrexato, es un inhibidor de la dihidrofolato
cáncer. ÿ reductasa. Este análogo de folato actúa como un inhibidor competitivo; la enzima
se une al metotrexato con una afinidad unas 100 veces mayor que el dihidrofolato.
FdUMP
vertedero dTMP
O CH3
O
F H3CO norte
NH2
timidilato hn
sintasa
O norte
H3CO norte
H NH2
N5, N10-metileno 7,8-Dihidrofolato fluorouracilo trimetoprima
folato H4
NADPH H
serina
H
Glicina hidroximetiltransferasa H2 norte norte norte
dihidrofolato metotrexato 5
reductasa norte
trimetoprima NH2
10
norte C CH Director deCH2
operaciones de CH2
folato H4
NUEVA HAMPSHIRE
CH3
NADP
serina metotrexato
(a) (b)
FIGURA 22-49 Síntesis de timidilato y metabolismo de folato inhibe la timidilato sintasa. El metotrexato, un análogo estructural del
como objetivos de la quimioterapia. (a) Durante la síntesis de tetrahidrofolato, inhibe la dihidrofolato reductasa; los grupos amino y metilo
timidilato, el N5 ,N10-metilenetetrahidrofolato se convierte en 7,8- sombreados reemplazan un oxígeno carbonílico y un protón, respectivamente,
dihidrofolato; el N5 ,N10-metilentetrahidrofolato se regenera en dos pasos en el folato (véase la figura 22-44). Otro importante análogo del folato, la
(figura 22-44). Este ciclo es un objetivo principal de varios agentes aminopterina, es idéntico al metotrexato excepto que carece del grupo metilo
quimioterapéuticos. (b) El fluorouracilo y el metotrexato son agentes sombreado. La trimetoprima, un inhibidor de unión estrecha de la dihidrofolato
reductasa
quimioterapéuticos importantes. En las células, el fluorouracilo se convierte en FdUMP, que bacteriana, se desarrolló como antibiótico.
N5 , N10-metileno
folato H4
hidruro
SH S S S
R R R R R
dTMP
H 1 H 2 H
R R R
HN FC hn FC HN FC
CH _ B CH _ B CH _ B Complejo
O norte O norte O norte
covalente
SH S S
R R R
sin salida
MECANISMO FIGURA 22-50 Conversión de dUMP a dTMP y su Cambio de hidruro 1,3 (paso 3), que mueve un ion hidruro (sombreado en
inhibición por FdUMP. La fila superior es el mecanismo de reacción normal rosa) desde C-6 de folato H4 al grupo metilo de timidina, lo que resulta en
de la timidilato sintasa. El grupo sulfhidrilo nucleofílico aportado por la la oxidación de tetrahidrofolato a dihidrofolato. Es este cambio de hidruro el
enzima en el paso 1 y los átomos del anillo de dUMP que participan en la que aparentemente no ocurre cuando FdUMP es el sustrato (abajo).
reacción se muestran en rojo; :B denota una cadena lateral de aminoácido Los pasos 1 y 2 proceden normalmente, pero dan como resultado un
que actúa como base para extraer un protón en el paso 3. Los hidrógenos complejo estable, con FdUMP unido covalentemente a la enzima y al
derivados del grupo metileno de N5 ,N10-metilenetetrahidrofolato están tetrahidrofolato, que inactiva la enzima.
Mecanismo de timidilato sintasa
sombreados en gris. Una característica novedosa de este mecanismo de reacción es una
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El potencial médico de los inhibidores de la biosíntesis de proporcionan todos los átomos de nitrógeno de las purinas.
nucleótidos no se limita al tratamiento del cáncer. Todas las células de Dos pasos de cierre de anillo forman el núcleo de purina.
crecimiento rápido (incluidas las bacterias y los protistas) son objetivos
ÿ Las pirimidinas se sintetizan a partir de carbamoil fosfato y
potenciales. La trimetoprima, un antibiótico desarrollado por Hitchings
aspartato, y luego se une a la ribosa 5-fosfato para
y Elion, se une a la dihidrofolato reductasa bacteriana casi 100 000
producir los ribonucleótidos de pirimidina.
veces mejor que a la enzima de los mamíferos. Se usa para tratar
ciertas infecciones bacterianas urinarias y del oído medio. Los protistas
ÿ Los monofosfatos de nucleósidos se convierten en sus
parásitos, como los tripanosomas que causan la enfermedad del sueño
trifosfatos mediante reacciones de fosforilación enzimática.
africana (tripanosomiasis africana), carecen de vías para la biosíntesis
Los ribonucleótidos se convierten en desoxirribonucleótidos
de nucleótidos de novo y son particularmente sensibles a los agentes
mediante la ribonucleótido reductasa, una enzima con nuevas
que interfieren con su eliminación de nucleótidos del entorno circundante
características mecánicas y reguladoras. Los nucleótidos de
utilizando vías de recuperación. El alopurinol (fig. 22-47) y varios
timina se derivan de dCDP y dUMP.
análogos de purina relacionados se han mostrado prometedores para
el tratamiento de la tripanosomiasis africana y afecciones relacionadas.
ÿ El ácido úrico y la urea son los productos finales de la
degradación de purinas y pirimidinas.
Consulte el Cuadro 22-2 para conocer otro enfoque para combatir la
ÿ Las purinas libres pueden recuperarse y reconstruirse en
tripanosomiasis africana, posible gracias a los avances en nuestra nucleótidos. Las deficiencias genéticas en ciertas enzimas
comprensión del metabolismo y el mecanismo enzimático. ÿ
de rescate provocan trastornos graves como el síndrome
de Lesch-Nyhan y la deficiencia de ADA.
RESUMEN 22.4 Biosíntesis y degradación ÿ La acumulación de cristales de ácido úrico en las articulaciones,
de nucleótidos posiblemente causada por otra deficiencia genética, produce
gota.
ÿ El sistema de anillo de purina se construye paso a paso ÿ Las enzimas de las rutas biosintéticas de nucleótidos son dianas
comenzando con 5-fosforribosilamina. Los aminoácidos para una variedad de agentes quimioterapéuticos que se usan
glutamina, glicina y aspartato para tratar el cáncer y otras enfermedades.
Términos clave
Otras lecturas
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Stadtman, TC (1996) Selenocisteína. año Rev. Bioquímica. 65, 83–100.
Este conjunto de cuatro volúmenes tiene buenos capítulos sobre trastornos del
metabolismo de aminoácidos, porfirina y hemo. Véanse también los capítulos
sobre errores congénitos del metabolismo de las purinas y las pirimidinas.
Problemas
1. Consumo de ATP por los nódulos de la raíz en las proteína de tamaño de metanol y amoníaco. Las técnicas de ADN
leguminosas Las bacterias que residen en los nódulos de la raíz recombinante han mejorado el rendimiento de proteína al introducir
de la planta de guisantes consumen más del 20% del ATP producido en M. methylotrophus el gen de la glutamato deshidrogenasa de E.
por la planta. Sugiera por qué estas bacterias consumen tanto ATP. coli. ¿Por qué esta manipulación genética aumenta el rendimiento
proteico?
2. Glutamato deshidrogenasa y síntesis de proteínas La
bacteria Methylophilus methylotrophus puede sintetizar
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