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Traducción: traduce
el triplete de
codones en aa
Activacion de aa:
Interacción codón-anticodon:
ACTIVACION DE AA:
AminoaciltRNAligasas (20 tipos diferentes)
Cada enzima reconoce un AA apropiado y un tRNA específico
el aa no puede unirse al ARNt por
asi nomas, sino que debe activarse
previamente y eso lo hace en
presencia de ATP. Forma aminoacil
AMP, este es transferido al ARNt
liberándose el AMP y formándose
el aminoacil ARNt. A este proceso
lo llevan a cabo las
aminoaciltRNAligasas (hay una
para cada aa). Cada aminoaciltRNA
reconoce a un aa y tRNA especifico
Estas enzimas aminoacil tRNA ligasa/sintetasa tiene sitios del tRNA y sitios de union del aa. Por
ejemplo para el triptófano se ve en la imagen. Se observa la enzima especifica para el
triptófano. Entonces es capaz de unir solo al triptófano y solo el tRNA que tiene el anticodon
para llevar al triptófano. Luego el tRNA se va a aparear con el triplete del mensajero.
RIBOSOMAS:
Etapas:
1. Iniciacion
Ensamblaje de componentes
Selección del codón de iniciación (AUG)
Regulación
Diferentes complejos de iniciación para bacterias y para eucariotas
En bacterias y en eucariotas el primer aa es la metionina, con la diferencia que en las
primeras esa metionina esta formilada
Eucariotas:
AUG iniciador e internos (metionina inicial y metioninas que van en el medio de la
cadena). El sistema se da cuenta de si tiene que meter una metionina inicial o interna
por los factores que hay iniciadores o de elongación (específicos para cada una de las
etapas). ARNt para la metionina inicial y para la interna. En el citosol hay tRNA para la
metionina inicial y para la metionina interna.
Lo que ocurre en procariotas es lo que esta en el recuadro: la metionina se une al tRNA
porque el triplete que codifica para metionina formilada y luego de unido se le une el
formilo. El formilo es llevado por el THF.
El que inicia el proceso de incorporación de aa en mitocondrias y en cloroplasto, al
igual que en procariotas, es una metionina formilada.
En la subunidad menor del ribosoma hay un sitio A (sitio aminoacil) y otro sitio P (sitio
peptidil), se une el mensajero y se unen dos factores de iniciación. El IF-1 impide que
hasta ese momento se un ARTt cargado y el IF-3 que impide el ensamblamiento con la
subunidad mayor. El primer aa (f-met) es llevado hasta el complejo de iniciación por el
IF-2 que depende de GTP. Esto hace que se ubique en el sitio peptidil, se produce una
hidrolisis del GTP, se separan IF-2 y el IF-1 y se ensambla la subunidad mayor; es decir
que esta ultima solo se ensambla cuando ya esta en el sitio P el primer aa
Factores de elongación:
El ARNm tiene sitios de union al ribosoma previo a la secuencia de inicio. Cada grupo
de triplete entre dos AUG dan origen a distintas proteínas.
Proceso postraducional:
Tenemos una proteína naciente (desplegada), se foldea (plegarse) hasta que avanza al
carboxilo terminal ayudado por ejemplo por chaperonas, puede sufrir modificaciones
covalente por union de H de C, fosforilacion, por incorporación de grupos acetilos. Se
puede unir a otras subunidades. Se termina de plegar una vez liberado del ribosoma.
De esta manera la proteína madura y se transforma en funcional. Todo esto ocurre
cuando la proteína es correctamente plegada.
Desde el amino terminal comienza a plegarse. Se termina de plegar una vez que se
libera del ribosomas.
Plegamiento de proteínas:
Cuando no son correctamente plegadas es ayudado por chaperonas
Estas proteínas se
unen a residuos
hidrofóbicos de la
cadena
polipeptidica en
crecimiento o
pueden una vez
que la cadena
esta
desnaturalizada
(desplegada)
unirse a ella. Es
decir que se
pueden unir a la cadena en crecimiento o a la cadena ya liberada
Estas chaperonas tienen actividad ATPasas y en esa actividad permiten la interaccion
con grupos hidrofóbicos del propio polipéptido y se liberan las chaperonas de la
proteína, quedando este ultima plegada.
Como es la secuencia:
Degradación proteosomal:
Para que el proteosoma la reconozca y la degrada tiene que tener un sello (ubiquitina).
Primero se activa la ubiquitina (en presencia de ATP) y se une a una enzima llamada
E1, esta enzima transfiere la ubiquitina a una enzima E2 y esta ultima tiene afinidad
pro una tercera enzima que a su vez tiene afinidad por el sustrato. En este complejo de
E3, E2 ubiquitinada y sustrato; esa ubiquitina se transfiere al sustrato (proteína)
desensamblándose el complejo y liberándose la proteína ubiquitinada, E2 y E3
E1: activa a la
ubiquitina en
presencia de ATP y
se forma Ub-AMP
Esta Ub activa se
transfiere a la E2 que
conjuga ubiquitina. Y
esta pasa a otra
enzima que es la E3.
E3: sitio de
reconocimiento para
la E2+Ub y otro sitio
para la proteína en cuestión. La ubiquitina se transfiere a la proteína que tiene que ser
degradada y se libera la enzima 2 y 3.
Ahora esa proteína ubiquitinada va hacia el proteosoma
Llega al proteosoma
(marcada con ubiquitina)
por un proceso
dependiente de ATP y
dentro de este se libera la
ubiquitina y se hidrolizan
los péptidos.
Digestion proteosomica: