OBJETIVO GENERAL: Destacar la importancia de los Biocatalizadores en las reacciones metabólicas. TAREA: Conceptos que deben dominar:
1. Define qué son las enzimas. Diferencia entre enzimas y catalizadores.
Las enzimas son proteínas complejas que producen un cambio químico específico en todas las partes del cuerpo. Por ejemplo, pueden ayudar a descomponer los alimentos que consumimos para que el cuerpo los pueda usar. La coagulación de la sangre es otro ejemplo del trabajo de las enzimas. Las enzimas son necesarias para todas las funciones corporales. Se encuentran en cada órgano y célula del cuerpo, como en: La sangre, Los líquidos intestinales,La boca (saliva),El estómago (jugo gástrico). Diferencia de enzima y catalizadores Los catalizadores aceleran una reacción al disminuir la energía de activación o al cambiar el mecanismo de reacción mientras que las enzimas son proteínas que actúan como catalizadores en las reacciones bioquímicas.
2. Menciona 4 características de las
enzimas. Naturaleza proteica Las proteínas están formadas por numerosos aminoácidos, que se agrupan a través de uniones peptídicas, formando largas cadenas. Esas cadenas suelen formar espirales, enrollamientos y plegamientos. Especificidad Las enzimas en general tienen una alta especificidad de sustrato, lo que significa que pueden “reconocer” al compuesto químico que deben procesar y anclarlo en lo que se conoce como “sitio activo”. El sustrato “encaja” en dicho sitio activo, tal como una llave encaja en el diseño de una cerradura. A veces, compuestos muy parecidos entre sí pueden insertarse en el mismo sitio activo, a esto se le llama “inhibición competitiva” de una reacción. Diferente localización: Si consideramos la estructura de la célula, algunas enzimas se localizan en el citosol, otras en las membranas plasmáticas, otras en ciertas organelas (ejemplo: mitocondrias, peroxisomas, cloroplastos), aunque también hay enzimas que se pueden localizar en diferentes estructuras. Diferentes condiciones óptimas Las enzimas suelen ser activas en determinado rango de condiciones de temperatura y pH, con un óptimo donde su velocidad de reacción es máxima. La mayoría de las enzimas del cuerpo humano funcionan bien a 36-37 °C, que es la temperatura corporal. 3. Describe el mecanismo de acción de las enzimas. MODELO LLAVE-CERRADURA En este caso, la estructura de la enzima y el sustrato al que se une son complementarios, es decir, encajan perfectamente de la forma en que lo hacen una llave y una cerradura. El centro activo (la zona donde se produce la unión) tiene una conformación geométrica y rígida que no se modifica, de esta forma, solo aquellos sustratos con geometría complementaria podrán unirse de forma específica. MODELO AJUSTE INDUCIDO Estudios posteriores a este modelo sugirieron que este centro activo era mucho más flexible y propusieron otro mecanismo. En este modelo de ajuste inducido, el centro activo de la enzima adapta su forma en presencia del sustrato. Es decir, la unión del sustrato al centro activo de la enzima desencadena un cambio conformacional en la misma que da lugar a la formación del producto. 4. Menciona los tipos de unión enzima sustrato y en qué consiste cada uno. Enlace llave-cerradura: El sustrato encaja perfectamente en el centro activo gracias a unas complementariedades moleculares y electrostáticas con la enzima de manera tal que este no cambia su forma. (El sustrato sería la llave y la enzima o centro activo la cerradura en este símil).
Enlace inducido: El sustrato NO encaja perfectamente en el centro activo de la enzima
pero el centro activo cambia su conformación espacial provocando un ambiente favorable a la unión y reacción con el sustrato de manera que se une a este para proceder con la catálisis. En este caso no encontramos la misma especificidad como en el enlace de tipo llave-cerradura, por lo que la enzima puede reaccionar con varios sustratos de conformaciones parecidas. 5. Señala la clasificación de las enzimas, y ponga 2 ejemplos de cada una. OXIDORREDUCTASAS Catalizan reacciones de oxidorreducción, es decir, transferencia de hidrógeno (H) o electrones (e-) de un sustrato a otro, según la reacción general. AH2 + B A + BH2 Ared + Box Aox + Bred Ejemplos son la succinato deshidrogenasa o la citocromo c oxidasa TRANSFERASAS Catalizan la transferencia de un grupo químico (distinto del hidrógeno) de un sustrato a otro, según la reacción, A-B + C A + C-B Un ejemplo es la glucoquinasa, que cataliza la reacción representada: glucosa + ATP ADP + glucosa-6-fosfato HIDROLASAS Catalizan las reacciones de hidrólisis: A-B + H2O AH + B-OH Un ejemplo es la lactasa, que cataliza la reacción: lactosa + agua glucosa + galactosa
6. ¿Cuáles son los factores cinéticos enzimáticos?
Haga la gráfica que represente a cada uno. Los valores de KM de las enzimas varían ampliamente. Para la mayoría de las enzimas varía entre 10-1 y 10-7 M. El valor de KM para una enzima depende de cada sustrato particular y de las condiciones ambientales, tales como pH, temperatura y fuerza iónica. Los valores de KM de las enzimas varían ampliamente. Para la mayoría de las enzimas varía entre 10-1 y 10-7 M. El valor de KM para una enzima depende de cada sustrato particular y de las condiciones ambientales, tales como pH, temperatura y fuerza iónica. La constante de Michaelis, KM, tiene dos significados. Primero KM es la concentración del sustrato a la cual la mitad de los centro s activos están ocupados. Así KM, proporciona una medida de la concentración de sustrato necesaria para que tenga lugar una catálisis significativa. Segundo, KM se relaciona con la constante de velocidad de las etapas individuales en el esquema catalítico. KM= (k-1+k-2)/k1 . Esto significa que la disociación del complejo ES hacia E y S es mucho más rápida que la formación de producto. En otras palabras, KM es igual a la constante de disociación del complejo ES, si K2 es mucho menor que K-1 Velocidad máxima (Vmáx) Velocidad máxima (Vmáx) revela el número de recambio de una enzima, que es el número de moléculas de sustrato convertidas en producto por unidad de tiempo por una molécula de enzima cuando éste está totalmente saturado de sustrato. Es igual a la constante cinética K2, también llamada Kcat. 8. ¿Cuáles son los mecanismos de regulación enzimática? Explique en qué se basa cada uno. En la regulación de la actividad enzimática participan sustancias que actúan como inhibidores, los cuales reducen la velocidad de las reacciones catalizadas. Hay inhibidores naturales que regulan el metabolismo y otros artificiales que permiten tratar enfermedades o eliminar bacterias patógenas 9. ¿Qué son inhibidores? Especifique cómo se clasifica la inhibición enzimática e ilustre con un ejemplo. son moléculas que se unen a enzimas y disminuyen su actividad. Puesto que el bloqueo de una enzima puede matar a un agente patógeno o corregir un desequilibrio metabólico, muchos medicamentos actúan como inhibidores enzimáticos. También son usados como herbicidas y pesticidas. Existen tres tipos de inhibidores reversibles. Se clasifican en base al efecto producido por la variación de la concentración del sustrato de la enzima en el inhibidor. Inhibición competitiva.Dos (o más) sustratos no se pueden unir al mismo tiempo al centro activo de la misma enzima de la que ambos (o todos ellos) son sustratos. Por lo tanto se “molestaran” entre ellos y “competirán” para unirse en el centro activo. La unión se deberá hacer de forma alternativa y el que esté en más alta concentración tendrá más probabilidades que el que esté en menor concentración. Esto también puede ocurrir con otras sustancias que tengan afinidad por el sitio activo de una enzima en el que también se une el sustrato;el sustrato y el inhibidor “compiten” para el acceso al sitio activo de la enzima. Este tipo de inhibición, “in vitro” se puede superar con concentraciones suficientemente altas del sustrato, es decir, dejando fuera de competición al inhibidor, ahora bien “in vivo” y concretamente en terapéutica, no suele ser posible pues equivaldría a aumentar mucho la dosis del fármaco, lo que podría provocar efectos indeseables por sobredosis. Los inhibidores competitivos son a menudo similares en estructura al sustrato verdadero. Esto puede clarificar conceptualmente el hecho de quealgunos fármacos son a la vez sustratos e inhibidores de un mismo CYP o enzimas de la fase II. Cuando se revisan las tablas de “sustratos- Inhibidores-Inductores” de diferentes CYP, se observa –y a veces no se entiendeque un mismo fármaco actúe a la vez como sustrato y como inhibidor. La explicación es que si en la medicación se encuentra solo él como sustrato de dicho CYP actuará como sustrato, pero si en la comedicación hay otros fármacos que también se metabolizan por este mismo CYP, podrá actuar como inhibidor competitivo de los otros y viceversa. Inhibición mixta. En este caso el inhibidor se puede unir a la enzima al mismo tiempo que el sustrato. Sin embargo, la unión del inhibidor afecta la unión del sustrato, y viceversa. Este tipo de inhibición se puede reducir, pero no superar al aumentar las concentraciones del sustrato. Aunque es posible que los inhibidores de tipo mixto se unan en el sitio activo, este tipo de inhibición resulta generalmente de un efecto alostérico por el que el inhibidor se une a otro sitio que no es el sitio activo de la enzima. La unión del inhibidor con el sitio alostérico de la conformación, es decir la estructura terciaria de la enzima. 10. ¿Cómo se nombran las enzimas? Ponga 2 ejemplos a) Se denominan convencionalmente, por el sustrato en que actúan mas el sufijo "asa". b) si el sustrato es un lípido, la enzima se llama, lipasa. c) También, se denominan por el tipo de producto que se forma en la RQ, agregando "asa" d) si provocan pérdida de H en el sustrato, la EZ, se denomina deshidrogenasa. e) Las denominaremos, de la primera forma. Ejemplos de enzimas: •Proteasas •Piruvato carboxilasa. •Desoxirribonucleasa •Ribonucleasa •Acetilcolinesterasa 11. Detalle la importancia biológica de las enzimas en el diagnóstico y seguimiento de enfermedades. Ponga 5 ejemplos. Las enzimas son el grupo más variado y especializado de las proteínas. Su función es actuar como catalizadores y permitir que las reacciones que tienen lugar en los seres vivos se desarrollen a un ritmo adecuado. Todas las reacciones químicas están catalizadas por enzimas. Podemos defi nir un catalizador como un compuesto que con su sola presencia aumenta la velocidad de la reacción sin experimentar ninguna alteración. Las enzimas pueden acelerar reacciones químicas específi cas en un medio acuoso y en condiciones en las que los catalizadores no biológicos serían incapaces de realizar iguales funciones. La enzimología clínica es la aplicación del conocimiento de las enzimas en el diagnóstico, tratamiento y pronóstico de la enfermedad. La enzimología es una parte fundamental de la química clínica ya que la determinación de enzimas en el laboratorio suele ser una de las pruebas más requeridas en la práctica diaria. La determinación de una enzima o un grupo de enzimas en el plasma sanguíneo o en otro líquido biológico, puede proporcionarnos una información muy valiosa a cerca del tejido o células de las que provienen las enzimas detectadas en el laboratorio. Las enzimas son importantes en el diagnóstico y seguimiento de enfermedades como: •Pancreatitis aguda: la autólisis del parénquima del páncreas exocrino libera lipasa y alfaamilasa al tejido intersticial, que pasan de los vasos linfáticos a la circulación sanguínea. Como tienen un peso molecular relativamente bajo atraviesan el glomérulo renal. Los túbulos reabsorben la lipasa pero no la amilasa, que aparecerá en elevadas concentraciones en orina. Por estas razones, en el diagnóstico de la pancreatitis se determinan lipasa en sangre y amilasa en sangre y orina. •Hepatitis víricas agudas: se puede constatar la elevación de la ALT en mayor proporción que la AST. La elevación de los niveles séricos de estas enzimas no es directamente proporcional a la gravedad del daño hístico. En las hepatitis agudas también se produce una elevación de la GGT. Las enzimas séricas se normalizan en un plazo de 3 a 5 semanas. En las situaciones clínicas de hepatitis fulminante, los niveles séricos de transaminasas van a descender de forma brusca debido a que la necrosis generalizada de las células hepáticas (hepatocitos), va afectando a todo el parénquima hepático perdiendo éste su funcionalidad y por tanto es incapaz de producir más enzimas y liberarlas al medio. Si la hepatitis se hace crónica, las enzimas no llegan a normalizarse. •Cirrosis hepática: en la cirrosis hay un incremento moderado de las transaminasas, siendo el incremento de AST mayor que el de ALT, al contrario de lo que ocurría en la hepatitis vírica aguda. Si la cirrosis es de origen etílico, también se encontrará aumentada la GGT, y si es de origen biliar, lo estarán de forma clara las fosfatasas alcalinas. Como hemos visto en el estudio de las enfermedades hepáticas, las determinaciones enzimáticas nos sirven tanto para el diagnóstico y diagnóstico diferencial como para el pronóstico, pues la normalización de las enzimas séricas es un signo de eficacia en el tratamiento.