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Introducción
La célula es un sistema de transducción de energía, que realiza múltiples reacciones químicas que
siguen unos pocos modelos de procesamiento, lo cual le permite desempeñarse con una gran
eficiencia. El ensamble de tales reacciones se realiza mediante la constitución de las llamadas
VIAS METABOLICAS.
El carbono es un elemento que por su constitución electrónica está capacitado para compartir los
electrones de su último nivel de energía en formas muy diversas dando origen a compuestos que
pueden presentar diferentes estados de oxidación. Usualmente los compuestos de importancia
biológica se encuentran en alguno de los estados que muestra la figura siguiente:
H H H OH H O H
C C C C C C C C
H H H H H H
Como puede observarse va desde el completamente reducido similar a un alcano hasta el de
carbonilo, ya sea en forma de aldehído, cetona o ácido.
Catabolismo Anabolismo
El catabolismo es la fase del metabolismo que permite la degradación de moléculas a otras más
simples y esta usualmente acompañado de la liberación de energía la cual se utiliza para
sintetizara ATP a partir de ADP y fosfato. El anabolismo es la fase del metabolismo que permite la
síntesis de moléculas complejas a partir de otras más simples y esta acompañado de la utilización
de energía usualmente mediante la hidrólisis de ATP a AMP + P
1. Activación y Adaptación
1.1. Monosacáridos
1.2. Ácidos grasos
1.3. Aminoácidos
2. Oxidación
2.1. Compuestos reducidos.
2.2. Compuestos parcialmente oxidados
2.2.1.Cadenas hidrocarbonadas no saturadas
2
2.2.2.Alcoholes
2.2.3.Carbonilos
3. Transferencia de grupos fosforilo
3.1. Desde sustratos de alta energía
3.2. Mediante reacciones oxidativas acopladas
3.3. Mediante reacciones no oxidativas acopladas
3.4. Por reordenamiento intramolecular
4. Isomerización
4.1. Isomerización funcional
4.2. Epimerización
4.3. Racemización
4.4. Reordenamiento intramolecular
5. Ruptura y formación de enlaces C-C
5.1. Aldolización
5.2. Transaldolización
5.3. Transcetolización
5.4. Tiólisis
6. Formación y remoción no oxidativa de dobles enlaces
7. Transferencia de unidades de carbono
7.1. Con alto estado de oxidación
7.2. Con bajo estado de oxidación
8. Fijación y transferencia de nitrógeno
8.1. Formación de amidas
8.2. Formación de carbamoil-fosfato
1. Activación y adaptación
Para que un compuesto pueda ser metabolizado debe estar activado o adaptado. Las formas
activas de los principales sustratos metabolizables son las siguientes:
Los conceptos son aplicables a elementos que poseen características comunes a todos los
miembros (atributos críticos). Algunos de los elementos del conjunto cobijado por un concepto
pueden poseer ciertas características particulares que no los excluyen (atributos no críticos).
Enzima
+ +
Enzima
Dador de energía
Sub-producto
Adaptación de aminoácidos
La adaptación de los aminoácidos para utilización de sus esqueletos hidrocarbonados se ilustra
mediante los siguientes ejemplos:
Enziima
+ +
NAD NADH + H
H
H2N C COOH O C COOH
H C OH H C OH
H C COOH H C COOH
H NH3 H
H2N C H H2N C HN C O C
H C OH H C H C H H C H
H H2O H H NH 3 H
Los electrones fluyen de los compuestos con potencial redox más negativo (o menos positivo)
hacia los de potencial más positivo (o menos negativo), de tal manera que los mejores reductores
se localizan hacia la izquierda de la escala y los mejores oxidantes hacia la derecha.
H / H+
Reductores Oxidantes
- 0V +
Potenciales redox de algunos pares de importancia biológica
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Si los compuestos que se incluyen a continuación poseen los potenciales redox indicados
De los anteriores el NAD y NADP, son derivados de la niacina y el FAD y FMN de la riboflavina
Las cadenas redox permiten la realización de trabajo químico gracias a las diferencias de potencial
redox entre pares consecutivos. La diferencia de potencial entre dos pares redox puede
transformarse en diferencia en energía libre mediante la llamada ecuación de Faraday:
H O
2
H H H H H H
D esh id r o g en asa D esh i d r o g en asa
R C C R´ R C C R´ R C C R´ R C C R´
H H H H id r at asa OH H
+ O H
+
FAD FADH NAD NADH + H
2
La utilización del NAD o el FAD como oxidante depende del potencial redox del sustrato oxidable.
Cuando un carbono primario llega a su máximo de oxidación (carboxilo) en el siguiente paso de
oxidación ocurre el rompimiento del enlace entre el carboxilo y hay desprendimiento de CO 2.
CO2
H O H
R C C OH R C H
H + H
NAD
+
NADH + H
Organice los siguientes pares redox para que formen una cadena de oxidación, determine
las diferencias de potencial entre cada par. Calcule la cantidad de energía liberada en cada
paso
A ox /red - 0,05 V
B ox /red 0,02 V
C ox /red- 0,15 V
D ox /red - 0,30 V
E ox /red 0,05 V
D red
Dox A ox B red E ox C red
Ared
D ox
Dred A red B ox E red C ox
¿En qué sitios de la cadena anterior sería posible acoplar fosforilación de ADP a ATP?
La utilización del NAD o el FAD como oxidante depende del potencial redox del sustrato oxidable.
Sin tener en cuenta la especificidad de las enzimas, ¿Podrían ser oxidados el ceto
glutarato por el FAD, y el hidroxibutírico por el NAD, respectivamente?
O
O C C OH
H C H
H C C OH
H O
Calcule los parámetros solicitados y diga en que pasos sería posible formar ATP
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E volts
G Kcal
ATP í
O
R O P OH
OH
Fos for ilo
Fos fa to
El grupo que normalmente se transfiere en los procesos bioquímicos es el fosforilo.
En el ATP el enlace que une el fosfato a la ribosa en un éster fosfórico, los otros dos son
anhídridos. Los grupos fosforilo solo pueden transferirse de un compuesto de igual o superior nivel
energético a otros de igual o inferior poder energético, o acoplar reacciones en forma tal que el G
de las reacciones acopladas sea negativo (o cero como máximo).
X - P + Y X + Y - P
Fosfotransferasa
En donde:
X~P sustrato dador del grupo fosforilo
Y sustrato aceptor del grupo fosforilo
X - P + Y X + Y - P
Fosfotransferasa
En donde:
X~P sustrato dador del grupo fosforilo
Y sustrato aceptor del grupo fosforilo
O
C OH
OH H C OH
O O HO P O C H
(I)
C O P OH O H
OH H C OH OH
HO P O C O O
O H ( II ) C O P OH
H C OH OH
HO C H
H
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formar ATP. En el esquema adjunto se indican dos formas posibles de hacerlo. ¿Es posible
la reacción (I) o la (II), ambas, o ninguna?.
X + P
X - P
Y Y~P
R~X R+ X
XDP+ P XTP
O O
-
C C S~CoA C C O
- -
C C O C C O
O H20 CoASH O
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La hidrólisis del tioéster de coenzima A libera suficiente energía para la formación del enlace
anhídrido del ATP.
Represente la transferencia del grupo fosforilo para la formación de GTP en el ciclo de krebs
O
-
C O
fosfomutasa
H C OH O
-
H C O P O
-
H O
4. Isomerización
En el metabolismo los monosacáridos pueden ser aldosas o cetosas: Las aldosas se reconocen
porque su nombre termina en osa, mientras que el de las cetosas lo hace en ulosa.
Excepciones a la anterior regla son: las hexosas, el gliceraldehído y la dihidroxiacetona.
En la nomenclatura enzimática corriente los diferentes tipos de isomerización y las enzimas que
catalizan los diferentes procesos son:
Tipo de
isomerización Enzima Ejemplo
Funcional Isomerasa Glucosa-6-P Fructosa-6-P
Epimerización Epimerasa UDP-glucosa UDP-galactosa
Racemización Racemasa D-Lisina L-Lisina
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Cis - trans Cis-trans isomerasa 3 cis enoil Coa 3 trans enoil Coa
H O O O
H C OH C H C H C H
C O H C OH HO C H HO C H
H C OH H C OH H C OH H C OH
Isómeros Epímeros Familia
H C OH funcionales H C OH H C OH D L HO C H
H C OH H C OH H C OH H C OH
H H H H
H
H C OH
C O
HO C H
H C OH
H C OH
H C OH
H
H H H H
H H H
H COOH
H H H
H H H H
a otro, en otro la ruptura ocurre por adición de un radical fosforilo, con o sin modificación de los
grupos funcionales de los productos resultantes.
5.1. Aldolización
El sustrato de las aldolasas es un diol de una cetosa fosfato, un carbono más adelante del carbono
carbonilo. Al romperse el enlace el carbono más alejado de la cetona queda transformado en
aldehído, mientras que el más próximo se mantiene como alcohol.
H O
H O
H C O P OH
H C O P OH
C O OH
C O OH
C OH
HO C H
H C OH H
H C OH O C O
H C O P OH H C OH O
H OH H C O P OH
H OH
Cetos a -P (m C ) Aldos a -P (m -x C )
x C
Aldos a -P (nC ) Cetos a -P (n+x C )
La transcetolasa transfiere un radical de dos carbonos que incluye el grupo cetónico de la cetosa y
la transaldolasa uno de tres carbonos que incluye el mismo grupo funcional.
El modelo asume que nunca puede quedar un compuesto de menos de 3 átomos de carbono. Los
intermediarios usuales en estos procesos son de 3, 4, 5, 6, o 7 átomos de carbono.
5.3 Tiólisis
Usualmente el sustrato para la tiólisis es un cetoacil activado, el enlace que se rompe es el
proximal del carbono carbonilo el agente tiolítico es la coenzima A, la enzima responsable del
proceso es la tiolasa, los productos formados son un nuevo éster de coenzima A y un radical acilo
formado por los carbonos que anteceden al grupo carbonilo.
O H O CoASH H O
R1 C C C SCoA H C C SCoA
H O H
R1 C SCoA
H H H
R1 C C R2 R1 C C R2
OH H H
H2 O
En el proceso de eliminación del doble enlace por hidratación, el grupo OH va al carbono más
alejado de la función directriz del proceso.
H
C COOH
HOOC C
H
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O
C
H N N H
H C C H
H C C C H 2 C H 2 C H 2 C H 2 C OOH
S
H Biotina
y
O O
-O C N C N H
H C C H
H C C C H 2 C H 2 C H 2 C H 2 C OOH
S
H
Carboxibiotina
Para que el C02 pueda ser transportado mediante biotina debe hidratarse a ácido carbónico y
posteriormente ionizarse al bicarbonato.
ATP
Bica rb o n a to AD P + P
Bio ti n a Carb o xi b i o ti n a
Ace p to r ca rb o xi l a d o Ace p to r
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N N
H2N 7 H H O
3 N C N C (Glutá m ic o)n=3 o 7
N 6 9 10
5 H
OH
Usualmente el ácido fólico presenta dos formas activas: Dihidrofolato {fH2} (reducido en C 7 y C8) y
Tetrahidrofolato {fH4} (reducido en N5, N8, C6 y C7)
7. 3 Transmetilación
Una forma especial de transferencia de grupos metilo es la transmetilación. En la transmetilación,
el agente dador del grupo metilo es la S-adenosil metionina. El aceptor generalmente es un
compuesto nitrogenado. La enzima que cataliza la reacción es un transmetilasa (Metil transferasa).
S-adenosilmetionina Aceptor
H O ADP + P H O
ATP
H2 N C C OH H2 N C C OH
X X
C OH Ligasa C NH 2
O NH 3 H2 O O
8.2 Carbamoil-P
Los carbonos de alto estado de oxidación pueden ser transferidos, junto con nitrógeno, mediante
formación de carbamoil-P. Hay dos fuentes de nitrógeno para este tipo de reacción, el ion amonio y
la glutamina. La enzima para el primer tipo de reacción es la carbamoil sintetasa I y la necesaria
para el segundo tipo es la carbamoilfosfato sintetasa II. La energía necesaria para la formación del
enlace proviene de la hidrólisis de dos moléculas de ATP. Uno de los fosfatos es transferido al
producto y el otro queda como fosfato libre.
Consulte la formación de carbamoil fosfato por medio de la carbamoil sintetasa I y sintetasa II,
analice las diferencias entre las dos reacciones.
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