Documentos de Académico
Documentos de Profesional
Documentos de Cultura
E
l agua es barata, cuando no moléculas biológicas en el medio
gratuita, en buena parte del acuoso natural.
mundo. Pero durante el verano Merced al progreso de la técnica
de 1986, uno de los autores (Levitt) informática, con un ordenador de
pagó medio millón de dólares por una sobremesa podemos ahora crear mo-
gota que cabía en la punta de un delos del BPTI y proteínas similares
alfiler. No es que ese mínimo valiera en un par de días y 100 pesetas en
semejante precio. Con el dinero se gastos de energía eléctrica. Se han
pagaron dos semanas de trabajo de creado representaciones en entorno
un superordenador especial, sin el acuoso de más de cincuenta proteínas
cual no se habría podido elaborar y ácidos nucleicos.
un modelo capaz de explicar de qué ¿Por qué es tan importante conocer
modo el agua condiciona la estructura los efectos ejercidos por el agua sobre
y el movimiento de una proteína la forma de las biomoléculas? Por una
particular. razón poderosa: la estructura de una
La proteína en cuestión era el inhi- molécula anuncia su función, lo que
bidor de la tripsina pancreática bovina ayuda a descifrar las interacciones
(BPTI, del inglés “bovine pancreatic bioquímicas que subyacen bajo los
trypsin inhibitor”), que se encuentra fenómenos vitales. En una vertiente
en el páncreas del ganado. El BPTI aplicada, la comprensión de la es-
es una de las moléculas favoritas tructura de las biomoléculas en el
de los modelizadores por ordenador entorno acuoso allana el camino para
por su menguado tamaño, lo que la fabricación de nuevas medicinas
facilita su investigación frente a las que actúen mediante el bloqueo de
demás proteínas. El equipo de Mar- una ruta bioquímica o a través de la
tin Karplus, de la Universidad de potenciación de ésta.
Harvard, había obtenido un modelo
en 1977, pero sólo en el vacío, es
decir, sin que ninguna otra molécula
interaccionara con el inhibidor. Na-
P ara adentrarnos en el modo en
que el agua condiciona la estru-
ctura de las biomoléculas, hemos de
die había representado el BPTI tal empezar por describir las propiedades
y como se encuentra en el interior distintivas del agua. Dichas notas
celular, rodeado de miles de molé- características surgen de su propia
culas de agua. estructura y de la forma en que
Estuvo muy bien empleada la for- esta estructura le permite “adminis-
tuna gastada. No sólo sirvió para que trar” las cargas eléctricas de otras
Levitt y Ruth Sharon, colaboradora moléculas.
suya, comprobaran que el modelo Una molécula solitaria de agua
anterior del BPTI en el vacío no (H2O) presenta geometría tetraédrica,
predecía adecuadamente el aspecto con un átomo de oxígeno en el centro
de la proteína ni su comportamiento del tetraedro, dos átomos de hidró-
en el mundo real, sino que tal des- geno en dos de los cuatro vértices y
cubrimiento contribuyó a preparar nubes de carga negativa en los otros
el camino para que otros químicos dos. Las nubes de carga negativa
simularan las estructuras de nuevas son el resultado de la unión de las
59
estructuras atómicas de oxígeno e oxígeno y los hidrógenos de otras
hidrógeno. De un modo muy sim- dos moléculas de agua. Mas, a
plificado, digamos que el oxígeno diferencia de lo que ocurre en el
tiene ocho electrones, dotados de agua helada, constituida por una
carga negativa, que giran en torno red de moléculas dispuestas en una
al núcleo, portador de carga posi- geometría tetraédrica perfecta, la
tiva: dos electrones en una corteza estructura del agua líquida puede
interior y los seis restantes en la mostrarse caótica e irregular. El
corteza exterior. La corteza interior número real de enlaces de hidró-
admite sólo dos electrones; está, geno por molécula de agua líquida
pues, completa. Pero la corteza oscila entre tres y seis, con una
exterior puede albergar hasta ocho. media aproximada de 4,5. La ne-
El hidrógeno posee un electrón. cesidad de mantener una estructura
Cuando el oxígeno se combina tetraédrica sobre la base de enlaces
con dos hidrógenos, atrae a sus 2. LOS PUENTES DE HIDROGENO dan de hidrógeno confiere al agua una
electrones para completar la corteza al agua sus propiedades singulares. En este estructura “abierta” y apenas com-
exterior. Puesto que cada electrón modelo de agua líquida, la molécula central pactada, si la comparamos con la
del hidrógeno pasa más tiempo al- (una esfera roja y dos blancas) ha tendido estructura de la mayoría de otros
rededor del átomo de oxígeno que puentes de hidrógeno (líneas verdes) con otras líquidos, como los aceites o el
en torno a su propio núcleo cargado cinco moléculas de agua (en forma de V de nitrógeno licuado.
positivamente, la molécula de agua color rosa). Sus átomos de hidrógeno (de co- Para construir un modelo informá-
es polar: tiene dos nubes con una lor blanco) están enlazados con los oxígenos tico del agua, se requiere introducir
ligera carga negativa alrededor del de otras dos moléculas de agua; su átomo dos tipos de fuerzas, las intermole-
átomo de oxígeno, mientras que sus de oxígeno (de color rojo) está enlazado con culares y las intramoleculares. Las
un hidrógeno de cada una de otras tres
dos átomos de hidrógeno soportan moléculas de agua. Cada molécula de agua interacciones que acontecen dentro
cargas ligeramente positivas. Sin líquida suele establecer cuatro o cinco enlaces de una molécula de agua se mode-
embargo, estos dos tipos de cargas de hidrógeno. lizan en términos de corto alcance,
se compensan entre sí y, en con- fuerzas a modo de muelle creadas
secuencia, las moléculas de agua por los enlaces químicos entre los
son eléctricamente neutras. hidrógenos y el oxígeno de cada
Los químicos no suelen representar de enlaces o puentes de hidrógeno. molécula. Las interacciones entre las
las nubes de carga negativa alrededor Reflejando la geometría tetraédrica del moléculas de agua se modelizan en
del átomo de oxígeno de una molé- agua, cada molécula de agua líquida términos de fuerzas eléctricas, de largo
cula de agua; antes bien, acostum- establece cuatro enlaces de hidrógeno: alcance. Las fuerzas intramoleculares
bran optar por figurar la molécula dos entre sus hidrógenos y los átomos acotan dentro de ciertos valores las
de agua en forma de V. Cada brazo de oxígeno de otras dos moléculas longitudes de los enlaces entre el
de la V corresponde a un enlace de agua, y dos entre su átomo de oxígeno de cada molécula de agua
oxígeno-hidrógeno con una longitud
aproximada de 10–8 cm. El ángulo
que generan las dos ramas de la
V vale unos 105 grados, algo por
debajo del ángulo de 109,5 grados
que forman cualquier par de lados
de un tetraedro perfecto.
Por mor de la polaridad de las
moléculas de agua, se privilegian
las interacciones entre un hidrógeno,
dotado de carga positiva, de una
molécula de agua y el oxígeno de
otra, portador de carga negativa. Es-
tas interacciones reciben el nombre