Laboratorio 2

Evolución

Biología Animal 1

Universidad de las Fuerzas Armadas ESPE

INTEGRANTES: Carrera Patricio, Cruz Jaime, Guamán Marcelo, Sivizaca Nina

NRC: 3652

FECHA: 02 – 11 - 2017

1. INTRODUCCIÓN

La habilidad de extraer y secuenciar el ADN de otros organismos vivos proporciona una

nueva dimensión para el estudio de las especies; Éstas secuencias (bajo el esquema de la
presión selectiva) cambian y se adaptan a través del tiempo y en una taza y frecuencia
medible. Es posible así realizar un análisis matemático para establecer el nivel de relación
entre una especie y otra.
Del griego phylon (tribu) genetikós (origen), una filogenia es el sistema de relaciones
propuestas para cada una de las especies en un sistema (planeta) que resulta de un análisis
de las variaciones o mutaciones que pueden ocurrir en específicas secuencias de ADN en
regiones similares de especies que presentan características morfológicas en común.
La filogenia es la historia evolutiva completa de un grupo de organismos [ CITATION
Clu01 \l 3082 ].El análisis filogenético depende del hallazgo en los organismos de rasgos
compartidos que han heredado de un antecesor común. La sistemática filogenética fue
propuesta en 1950 por el entomólogo Alemán William Henning produciendo así la
sistemática clasista. Todos los taxones reconocidos por el sistema filogénico deben ser
monofiletico.[ CITATION Hic02 \l 3082 ]

Antes de que Henning realice su descubrimiento existieron varios científicos que

plantearon diversas formas para la construcción de la filogenia como fueron J.Huxley.
G.G. Simpson y E. Mayr que plantearon a la filogenia representada mediante cuatro
criterios importantes que son: La discrepancia morfológica, el nicho adaptativo, la riqueza
en especies y la monofila mínima, dando lugar a la Sistemática evolutiva,
simultáneamente a esto R.R.Sokal y P.H.A.Sneath, buscaron una manera de hacer de la
filogenia más estable utilizando procesos matemáticos que permita una mejor
clasificación basándose en el máximo número de caracteres disponibles sin preocuparse
de su significado evolutivo, por lo que se produjo la Taxonomía numérica. [ CITATION
Obr11 \l 3082 ]
 "La evidencia de información morfológica, bioquímica y genética sugiere que todos los
organismos en la Tierra están relacionados genéticamente, y la relación genealógica de
los seres vivos puede representarse con un vasto árbol evolucionario: El árbol de la vida".
(Life, 2004)
Este árbol resultante muestra no solo la relación sino el grado de diferencia entre cada
individuo (un cánido se encontrará separado de un félido, y ambos mas separados que un
pez).
Ésta herramienta proporciona una perspectiva para todo tipo de operación entre dos
especies: similitud, diferencias morfológicas, estudio comparativo en regiones homólogas
de su cadena de ADN.

2. OBJETIVOS:

1) Conocer la utilidad de los árboles filogenéticos

2) Conocer los elementos de la evolución.
3) Describir las características de los árboles filogenéticos.
4) Crear un árbol filogenético

3. MATERIAL POR EQUIPO

- Una computadora
- Secuencias tomadas del GenBank

4. PROCEDIMIENTO

A. Obtención de las secuencias del GenBank

1) Para cada uno de los siguientes individuos de lagartijas busque la secuencia en

el en el GenBank según el código proporcionado en la siguiente tabla:

Especie Isla Nicho (Ver gráfico Código Secuencia

en anexo)
Anolis alutaceus Cuba Grass-bush AF055971.2
Anolis angusticeps Cuba Twig AF055967.2
Anolis chlorocyanus Hispaniola Trunk-crown EF531574.1
Anolis cristatellus Puerto Rico Trunk-ground EF531469.1
Anolis cybotes Hispaniola Trunk-ground AF528723.1
Anolis evermanni Puerto Rico Trunk-crown AY296172.1
Anolis grahami Jamaica Trunk-crown AF055938.2
Anolis lineatopus Jamaica Trunk-ground AF055937.2
Anolis occultus Puerto Rico Twig AF055976.2
Anolis olssoni Hispaniola Grass-bush AF055945.2
 Anolis ophiolepis Cuba Grass-bush AF055942.2
Anolis porcatus Cuba Trunk-crown AY654094.1
Anolis pulchellus Puerto Rico Grass-bush KC677351.1
Anolis sagrei Cuba Trunk-ground AY655484.1
Anolis valencienni Jamaica Twig AF055939.2
Leiocephalus Hispaniola Grupo de control EF591774.1
barahonensis

Indicaciones:

2) Vaya a la siguiente dirección:

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/
3) Haga clic en All databases y seleccione nucleotide

4) En el espacio de búsqueda ingrese el número del individuo que va a buscar:

por ejemplo: AF011222

5) Haga clic en FASTA y copie la secuencia:

>Codigo_de_acceso_Nombre_cientifico
GTTCTTTCATGGGGGAGCAGATTTGGGTACCACCCAAGTATTGACTCACCCATCAGCAACCGCTATGTAT
CTCGTACATTACTGTTAGTTACCATGAATATTGTACAGTACCATAATTACTTGACTACCTGCAGTACATA
AAAACCTAATCCACATCAAACCCCCCCCCCCATGCTTACAAGCAAGCACAGCAATCAACCTTCAACTGTC
ATACATCAACTACAACTCCAAAGACGCCCTTACACCCACTAGGATATCAACAAACCTACCCACCCTTGAC
AGTACATAGCACATAAAGTCATTTACCGTACATAGCACATTACAGTCAAATCCCTTCTCGCCCCCATGGA
TGACCCCCCTCAGATAGGGGTCCCTTGAT

6) Luego abra un documento de WORD y pegue la secuencia según el siguiente

formato y continuando con los otros individuos:

>AF055971.2_Anolis_alutaceus
ATGAACCCAACAATTATTATAATTACCCTAACCAGCCTGGCAACTGGTACAGTTATTACCATACATAGCT
TCCATTGATTAATGGCCTGANTCGGATTAGANATCAATACACTATCAATTATTCCAATAATTTCAACATT
ACACCACCCACGATCAACTGAAGCTGCTACAAAATATTTCCTCACCCAAGCAGCTGCTTCANCTTTAATC
CTTTTTTCAAGCACAATTAATGCCTGACAAACAGGATCATGAGACATTACCCAACTATCATCAACCCCCT
CACACATTTTATTAACTATGGCTTTGGCCATAAAACTAGGACTCGCCCCACTTCACTTTTGATTACCAGA
AGTAATTCAAGGGTCTTCCATAAACACAGCCTTAATTATTGTNACTTGACAAAAACTAGCCCCAATATCC
CTAATCTTTTTAACCATAAATAATTTATCAACAACTATTTTAATGATAATAGGACTTGTATCTTCACTTG
TCGGAGGATGAGCAGGACTTAATCAAACACAAACTCGAAAAATTATAGCCTACTCATCTATTGCTCACCT
AGGGTGAATAGCAGCCATTTCCTCAATTATAACAAACATTTTAATCCTCAACCTATTAATTTACCTAATT
ATAACTACCTCAGTATTTTGCTTTATTATTATTACAAAATCAAAAACAATCCAAAACACAGCTACTATTT
GGACAATATCACCAACACTAACAATTACCATAATACTTTCTTTACTTTCACTAGGAGGACTACCGCCACT
AACAGGATTTATACCAAAATGAATAATTATAGAAGAACTTATTAATCAAAACTTTACTACAATTACTACT
ATGATAGCACTATCGTCCTTATTAAGCCTATTTTTTTATATTCGACTAACATATACAACTTCACTTACAC
TATCCCCAAACACAACCCAAACGAAATTTAAATGACGATTTTACCCAAACATAAAAACCACAGTAATTAT
AGTCTCTACAACAGTCACAATTTTTATATTACCGATACTTCCAATAATTTTGATATAAAAACTTAGGATA
AACTAAACCAAGAGCCTTCAAAGCTCAAAAAAGGGGTGTAACCCCCCTAGTTTTTGTAAGACTTGTAAAA
TACTAATTTACATCTCTTGAATGCAACTTAAACACTTTAATTAAGCTAAAACCTTACTGAATAGGCGGGC
TTTTAACCCACGAAAAATTAATTAACAGCTAATTTCCCAAACCAACGGGCTTCTATTCGCTTCCCCCGTC
TGGGGGGGGAAACGGGAGAAGCCCCGGAGCCTTTAAGGGCTCTTCTTCAAACTTGCAATTTGACGTAAAT
CACTTACTTCGGGGCTTGATAAAGAAAGGAATTAAACCAATGTGAATAGGACTACAGCCTACCGCCTACC
ATTCGGCCACTTTACCTGTGTTTATTAATCGTTGA

>AF055967.2_Anolis_angusticeps
ATGAGCCCCCCCATTTTTACAATTATCATCTCAAGTCTAGCAACAGGTACAATTATTACCATAACCAGCT
ACCATTGACTCATAGCCTGAGTTGGTCTAGAAATAAATACACTAGCAATTATTCCTATTATTTCAACAAC
ACATCACCCACGAGCCACAGAAGCTTCCACAAAATATTTTCTTACACAAGCTGCAGCCTCTGCTCTAATT
TTATTTTCTAGTATAATTAACGCATGACACACAGGATCTTGAGACATTACTCAAATATTATCTACCCAAT
CAAATACTATATTGACTATAGCCCTAGCTATAAAACTAGGGCTGGCCCCACTTCACTTTTGACTACCAGA
AGTAATCCAAGGATCAACAATACTAACCGCCTTTATTATTACTACATGACAAAAACTAGCCCCAATATCT
CTAATTTTTTTAACTATAAATAATATATCCACAACAATCCTCCTACTAATAGGAATATTATCCTCACTTG
TTGGCGGTTGAGGGGGGCTAAACCAAACACAAACCCGAAAGATCATAGCATACTCATCAATTGCTCACCT
TGGATGAATAGCCACAATTTCATCTATTATAACCAACATCCTAATCTTAAACCTAGTTCTTTACCTAATT
ATGACTACATCAATGTTTGTCTCTTTAATTATTTCTAAGTCAAAAACAATCCAAAATACAGCAGAAACCT
GAACACTCTCACCTACTCTAACAGTTTTTATGTTACTTTCACTCCTATCTTTAGGTGGACTACCACCCCT
AACTGGGTTTATTCCAAAATGACTAGTTATAGAAGAACTAATTTTACAAAATTTTAATTTTCCAGCTATT
TTAATAGCCATGTCCTCCCTACTAAGTCTATTTTTTTACCTTCGAATTACCTACACAACCACACTATCGC
TATCACCTAATACAACTCAAATAAAATTTAAATGACGTTTTTATCCAAAAACCACAACCACCTTATCCTC
TTCCACCGCAACAATAACAACCCTCCTTCTTCCACTTACACCACTAATTTTGTTATAAAAACTTAGGATA
AAATTAAACCAAGGGCCTTCAAAGCCCAAGACATGGGTTAAACTCCCATAGTTTTTGTAAGACTTGTGAA
ACATTATTACACATCTCCTGAATGCAACTCAAGCACTTTTATTAAGCCAAAGCCTCACTGAATAGGCGGG
CCTTGATCCCACGACAAATTAATTAACAGCTAAATACCCAAACCAGCGGGCTTCTATTCGCTTCTCCCGT
CGGTGAAGAAACGGGAGAAGCCCCCGAGCCTTTAGGGCTCCTCTTCAGACTTGCATTTTGACGTGAAAAC
ACTTCGGGACTTTTGATAAAGAAAGGAATTAAACCTGTGTAAGTAGGTCTACAGCCTACTGCCTAACACT
CGGCCACTTTACCTGTGTTTATTAACCGTTGA

>EF531574.1_Anolis_chlorocyanus
ATGAGCCCAACAATTTATTCAATTATTTTATCAAGCCTAGCAACAGGCACAATCATTACCATAACCAGCC
ACCATTGATTAATAGCCTGAATTGGACTAGAAATTAATACCCTCGCGATTATCCCGATTATCTCAATACA
ACATCACCCACGATCCACAGAAGCCGCCACAAAATATTTTCTAACACAAGCAGCAGCCTCGGCCTTGATT
TTATTTGCTAGCACAACCAATGCCTGATCTACCGGCACATGGGATATTACCCAAACTTCTACCACCCCCT
CCCACATTTTCTTAACCATTGCACTTGCTATAAAACTCGGCTTAGCACCAATACACTTTTGATTACCAGA
AGTTATTCAGGGGTCAACCATATTAACTGCCCTTATTATTATAACATGACAGAAACTTGCCCCAATATCA
CTAATTTATTTAACTATTAATAACCTCTCCCCAACAATTCTTCTTTTGCTAGGAATAATCTCATCTATAC
TTGGCGGATGAAGTGGACTAAACCAAACACAAACCCGAAAAATTATAGCATTTTCATCAATCGCACACCT
CGGATGAATGGCTACAATTTCATCTATTATAACCAACATTCTTATTATTAACCTCTTACTCTATTTAATT
ATAACAACAACCTCATTCTTTACCCTTATTTTATCAAAATCAAAAACAGTCCAAGATACAACAACAGCCT
GAACCTTCTCTCCAACTATAACTATTATTATAATACTATCACTTCTTTCTCTAGGCGGTTTACCGCCACT
AACCGGATTTATACCAAAATGACTAATCCTAGAAGAACTTACTACCCAAAAACTCTTCCCTCTAGCCATT
ATTATAGCAATATCCGCCTTGCTTAGTCTATTCTTTTACCTTCGCTTAACCTACACCACAACACTAACAC
TTTCCCCAAACGCTACACAAACAAAATTTATATGACGATTTAAATCATCTAACCTAATTTTCCCACTAAC
AATTACCACCCCCCTAACAATTTTTCTTCTCCCAATAACGCCACTAATTATAATATAAGAAATTTAGGAT
TATATTAAACCAAGAGCCTTCAAAGCTCAAAATATGGGTGAAACCCCCATAATTTCTGTAAGACTTGTAA
AACACTAATTTACATCTCCTGAATGCAACTCAAGCACTTTCATTAAGCTAAAGCCTCCCTGAATAAGCGG
GCTTCGATCCCGCGACAAATTAGTTAACAGCTAATTACCCAAACCAGCGGGCTTCTATTCGCTTCTCCCG
TCGGTAAGAAACGGGAGAAGCCCCGGAGCCCTTTAGGGCTCTTCTTCAAATTTGCATTTTGATGTGGAAC
ACCCCGGAGCTGTGGTAAAGAGGGGAGTTTAACCCCCATTAGTGGATTTACAGTCCACCGCCTAGCATTC
GGCCACCCTACCTGTGTCTATCAATCGTTGATTTTTCTCAACTAA

>EF531469.1_Anolis_cristatellus
ATGAGCCCTACAATCTACACAATTATTTTATCAAGCCTAGCAACAGGTACTATTGTTACTATAACAAGCT
TCCACTGACTAATAGCCTGAATCGGACTAGAACTCAACACACTAGCAATTATTCCTATTATTTCAACACT
ACACCACCCACGATCAACAGAAGCCGCAACAAAGTACTTTTTAACACAAGCAGCGGCCTCTGCAATAATC
TTGTTTTCTAGCATAATTAATGCCTGAAATACAGGAACATGAGACATTACTCAAATATCTTACGCCCCTT
CAAACATCCTCCTCTCACTAGCACTAGCCCTAAAACTAGGATTAGCCCCAGCACACTTCTGACTTCCAGA
AGTACTACAAGGTTCAACCTTACTCACCGCCCTCATTATTACCACATGACAAAAACTAGCCCCAATATCA
CTTATTTACATAACTATAAACAACCTTCCATCAACAATTCTATTAATATTAGGACTCACCTCCTCTACCA
TCGGAGGGTGATCTGGACTAAACCAGACACAAACTCGAAAAATTATAGCATACTCATCAATTGCACACCT
TGGATGAATGGCTATAATTGCCTCAATTATATCAAACATTATAATTATAAACCTAATAGTTTATTTAATA
ATGACAACCGCCCTATTTACCTCCCTAATTTGTTCTAAATCAAAAACAATTCAAGATACAGCAACCACTT
GAACAACCTCCCCAACCCTGGCTATTATTATAATACTTTTACTTCTCTCACTTGGAGGCCTCCCGCCTCT
TACAGGATTTTTACCAAAATGATTAGTCTTAGAAGAACTGATTATGCAAAACCTAATCCCAATAGCTACG
GCCATAGCAATATCTGCCCTTCTTAGTTTATTTTTTTACCTACGCCTTACATACACTACAACACTAACAC
TTCCCCCAAACACCCTACAAATAAAATTTAAATGACGATTTAAACCAATTATACCGTTTATAATAGTAAC
CCTTTCAACCACGGCTATTCTTATATTGCCACTCACACCACTAATTCTCTTATAAAAACTTAGGATAATA
AAACCAAGAACCTTCAAAGTTCAAAATAAGGGTGCAAACCCCTTAGTTTTTGCAAGACTTGTAAAACATT
AATTTACATCTCATGAATGCAACTCAAGCACTTTTATTAAGCTAAAGCCTCCCTGAATAGGCGGGCCTTG
ATCCCGCGATAAATTAATTAACAGCTAATTACCCAAACCAGCGGGCTTCTATTCGCTTCTCCCGTCGGTT
GGGGAAACGGGAGAAGCCCCGGAGCCCATTAGGGCTCTTTTTCAAACTTGCATTTTGACGTGAAACCACT
ACAGGACTTATGATAAAGAAAGGGTTAAACCAATATAAATAGATTTACAATCTACTGCCTAATATTCAGC
CACTTTACCTGTGTCCATTAATCGTTGA

>AF528723.1_Anolis_cybotes
CAATTCTTACCCATAACCTTGGCTTTATGCTTATGACACACAACACTCCCAATTGCACTATTCTTTTTAC
CCCCACAATGGAAATGTGCCTGAATAAAAGGGTAACTTTGATAGAGTTAATCATAGAGGTTAACCCCTCT
CATTTCCTTAGAAAACCAGGACTTGAACCTGCACTCAATAACTCAAAATTATTTGTACTTCATTATACTA
TCTCCTAGTAAAGTCAGCTAAACAAGCTATTGGGCCCATACCCCAAAAATGTTGGTTTAAACCCTTCCTA
TACTAATGAACCCAACAATTTTCTCAATCATGTTATCAAGCCTATCAACAGGCACAATCATTACTATAAC
AAGCCACCACTGACTAATAGCCTGAATTGGATTAGAACTCAACACCTTAGCGATCATTCCAATTATCTCA
ATACATCACAACCCACGATCAACAGAAGCGGCCACAAAATATTTCTTAACACAAGCAGCTGCATCCTCAT
TAATCTTATTTTCAAGCCTTATTAACGCCTGACAAACAGGCACATGAGACATTACTCAACTATCAACCCC
CCAATCATGCATTCTCTTAACCATGGCACTATCAATAAAACTAGGTCTAGCCCCCCTACACTTTTGACTA
CCAGAAGTAATTCAAGGGTCTACAATATTTTCCGCCTTAATCATTGTGACATGACAAAAACTAGCCCCCA
TATCATTAATTTACTTAACCTCAAACAGCCTATCTACAACAACCCTCTTGATCCTAGGAGCTCTTTCTAC
AACAATTGGAGGGTGGGCAGGACTAAACCAGACACAGACTCGAAAAATCATAGCATACTCATCAATTGCC
CACCTAGGATGAATAGCCACAATCACCTCAATTATAACAAATATTCTTGCCATAAACTTATTTATTTACT
TACTACTTACAACAGCCATATTTCACTCTCTTATTTTTACAAAATCAAAAACAATTCAAGACACATCAAT
AACCTGAACAAACTCACCCTATTTAATGATCTTAATAATATTAACACTACTTTCATTAGGAGGACTGCCC
CCTCTAACAGGGTTTATCCCAAAATGATTAATCTTAGAAGAACTAACAACCCAAAACCTAATTATACTAG
CCTTTTTCATAACAATAGCTGCCCTCCTTAGCCTATTTTTTTATTTACGCCTAACATATACCACTACACT
AACACTTTCCCCAAACACAACGCAAGCCAAATTTAAATGACGGTTTAAACCTAATACCATTACTACCCCT
ATAACTACAACCTTAACAACAGCAATCTTCTTACTTCCTATAACACCAATGTTACTACTTTAAAAACTTA
GGATAAACAAACCAAAAGCCTTCAAAGCTTGAAATAAGGGTGCAACCCCCTTAGTTTTTGTAAAACTTGC
ATTATACTATAATGCATCTCCTGAATGCAACTCAAGCACTTTAATTAAGCTAAAGCTTTACTGAACAGGC
GGGCCTCGATCCCGCGATAAATTAATTAACAGCTAATTACCCAAACCAGCGGGCTTCAATTCGCTTCTCC
CGTTGGTGTAAGAAACGGGAGAAGCCCCGGAGCCTTTTAGGGCTCTTCTTTAAACTTGCATTTTAATGTG
AAACACTTCGGGGCTTGATAGAGAAAGGAGTTAAACCAATATGAGTAGGACTACAGCCTACCGCCTAACA
TTCGGCCACTCTACCTGTGTTCATCAATCGTTGATTTTTCTCAACC

>AY296172.1_Anolis_evermanni
ATGAGCCCTACAATCTATACAATTATTTTGTCAAGCCTAGCAACAGGCACAATCATTACCATGACTAGCT
TTCACTGACTTATAGCCTGAATTGGCCTAGAACTCAATACTCTGGCAATTATTCCAATTATTTCATCACA
ACACCACCCTCGATCTACAGAAGCCGCAACAAAATACTTCTTAACACAAGCAGCAGCATCTGCTATAATT
CTGTTTTCAAGCATAACCAATGCCTGATTTACGGGCATATGAGATATTACTCAAATATCTTACACCCCAT
CTAATATCTTTTTAACCATAGCACTTGCTATAAAACTAGGCCTAGCCCCAACACACTTCTGATTTCCAGA
AGTCCTACAAGGCTCAACCTTATTTACTGCTTTTGTTATTTCAACATGACAAAAACTGGCCCCAATATCA
TTAATTTTTTTAACTGTGGCCAACCTTCCACCTATAATTTTATTAACCTTAGGATTTTTTTCCTCTATTA
TTGGAGGATGAGGCGGACTAAACCAAACACAAACCCGAAAAATTATAGCATATTCATCAATCGCACACCT
TGGATGAATGACTGTAATTTCCTCAATCATAACAAACATCATAGTTATTAATCTATTAATTTATTTAATA
ATAACAACAGCCCTATTTTTAGCCTTAATTTTATCTAAATCAAAAACAATTCAAGATACAACAAACACTT
GAACAATATCACCCACTTTAACCATCACAATAATACTTCTTCTACTATCACTTGGTGGCCTACCTCCACT
AACAGGATTTTTGCCAAAATGACTAATTCTAGAAGAATTAACAACCCAAAACCTTATACCACTAGCAACA
ATTATAGCACTAGCCGCCCTCCTCAGCTTATTCTTTTACTTACGCCTAGCTTATACTACAACCTTAACAC
TTTCTCCAAATACACTACAAATAAAATTTAAATGACGATTTAAACCAACCACCCCGCCCCAACTAATAAT
ACTTTCAACACTAACTATCTTTCTTTTACCCTTAACACCACTAATTTTGTTATAAAAACTTAGGATAATG
TTAAACCAAGAACCTTCAAAGTTCAAAATAAGGGTGTAACTCCCTTAGTTTTTGTAAGACTTGTAAAATA
CTAATCTACATCTCATGAATGCAACTCAAGCGCTTTTATTAAACTAAAGCCTCCCTGAATAGGCGGGCCT
TGATCCCACGACAAATTAATTAACAGCTAACTACCCTAACCAGCGGGCTTCTATTCGCTTCTCCCGTTGG
TTGGGAAACGGGAGAAGCCCCGGAGCCCATTAGGGCTCTTCTTCAAACTTGCATTTTGACGTGAAACCAC
TACAGAGCTTTTAGTAAAGAAAGGAGTTTAACCAATGTAAGTAAGTTTACAGCTTACCGCCTAACACTCG
GCCACTTTACCTGTGTTTATTAATCGTTGA

>AF055938.2_Anolis_grahami
ATGAGCCCATCAGTCCTTATAATTGTTATTTCAAGCCTGGCAACAGGCACTATTATTACTATAACAAGCC
ACCACTGACTTATAGCCTGAATTGGACTAGAAATAAATACCCTAGCAATTATCCCAATTATTTCTGCTAT
ACACACCCCGCGAGCCACAGAGGCCGCTACAAAATATTTTTTAACACAGGCAGCCGCCTCTGCCATAATC
TTATTTTCAAGCATAATCAACGCCTGACAAACAGGCACATGAGACATTACTAATCTAACATATGAGCCCG
CACACATCCTGCTAACCATGGCCCTAGCAATAAAACTAGGCCTTGCACCTATACACTTCTGACTGCCGGA
AGTATTACAAGGCTCAACCTTAACCACCGCACTAATTATTACTACTTGACAAAAACTAGCCCCAATATCC
TTAATTTACATAACCTTAAACAACCTGTCAACCACAACTCTAATCCTACTAGGACTACTATCTTCAATTA
TTGGGGGGTGGGGAGGACTAAACCAAACCCAAACYCGAAAAATTATAGCATTCTCATCAATCGCACATCT
GGGATGAATGATTACTATTTCATCAATTATACCTAATATTATAATTTTAAACCTAACAATTTATCTAATC
ATAACAATTGCCCTATTTTACTCACTAATTTTATCTAAGTCAAAAACAATCCAAGACACAACAACAACTT
GGACATTCTCACCCGCACTAACTATTATAATAATAATCCTTCTTCTTTCCCTAGGGGGACTACCACCACT
AACCGGATTTATACCAAAATGACTTATCTTAGAAGAACTAGTAACCCAAAACCTCACCCCAGCCGCCACT
ATTATGGCCATATCAGCACTACTAAGCCTATTCTTCTACCTACGAYTAACCTATACAACAACACTAACCC
TGTCCCCAAATACTACTCAAACAAAACTCAAATGGCGATTTAAGCCGAACCGCCCAACGCCTCTTATAGG
GGCCTCCTCCACAATCTCAATCTTCCTACTCCCCATAACCCCCTTAATACTTCTATAAAAACTTAGGATA
ATTAAACCAAGGGCCTTCAAAGCCCTAAATAAGGGCCACACCCCCTTAGTTTTTGTAAGACTTATGGGCA
TCTACCCCATATCTCCTGAATGCAACTCAAGCACTTTTATTAAGCTAAAGCCTTGCCTAAACAGGCGGGC
CTTGATCCCACAAAATTAGTTAACAGCTAATTACCCAATCCAGCGGGCTTCTATTTAGCTTCTCCCGTTG
GTGAAGAAACGGGAGAAGCCCCGGAGCCCNTCTAGGGCTCTTTTTCAAACTTGCATTTTGATGTGGATCA
CTTCAGGGCTGTGATAAAGAAAGGAATTAAACCAATGTAAATAGGACTACAGCCTACCGCCTATCATTCG
GCCACTTTACCTGTGTTCATTAATCGTTGA

>AF055937.2_Anolis_lineatopus
ATGAGCCCTGCTATCTTTTCAATTGTCATATCCAGCCTAGCAACAGGCACTATTATTACCATAACAAGCC
ACCACTGACTATTAGCCTGAATAGGGTTAGAAATAAATACCCTAGCAATTATTCCAATTATTTCTATTAC
CCACAACCCCCGAGCCACAGAAGCCGCCACAAAGTACTTCTTAACACAAGCAGCAGCCTCAGCCATAGTT
TTATTTGCAAGCATAACTAATGCTTGACAAACAGGAACATGAGATATTACTAGCCTATCATATATGCCCT
CACATATTTTATTAACTATAGCATTAGCTATAAAACTAGGGCTTGCCCCAATGCACTTCTGACTACCAGA
AGTGCTACAAGGAACAGCCCTACCAACTTCACTTATTATTACTACTTGACAAAAACTTGCCCCAATGTCC
CTAATTTATATAACTATTAATAGTTTATCAACCATAATTCTAATTTCACTAGGCCTACTATCCTCAATTA
TTGGAGGATGGGGAGGACTAAACCAAACACAAACTCGAAAAATTATAGCATTTTCATCAATCGCCCACCT
AGGATGAATAATTACTATTTTTTCACTCATAACAAATATTATAATCTTAAACCTAACAATTTACTTAATC
ATAACAACAGCAATATTTTGCTCACTAATCTTATCAAAATCAAAAACAATACAAGATATTATGATAACTT
GAACAATCTCACCCACCCTTACTACCCTAATAATAATTTTACTCCTCTCCCTGGGCGGCCTACCACCACT
AACCGGATTTATACCAAAATGATTAATTCTAGAAGAATTGGTTGCCCAAAACCTTATCCCAACAGCTACT
ATTATAGCAATGTCGGCACTCCTCAGCCTATTTTTTTATTTACGACTTACCTATGTAACTGNACTTACAC
TCTCCCCAAACACAGCACAAACAAAATTCAAATGACGACTTAAACCAAACTCACCAAAACTGTTCATAAT
AGCTTCCTCCAGCAATATCAATATTTTTACTTCCCTAACCCCCCTTATATTACTATAAAAACTTAGGATA
ATTAAACCAAGGGCCTTCAAAGCCCTAAACAAGGGCACTACCCCCTTAGTTTTTGTAAGACTTATGGACA
ACTACACCATATCTTCTGAATGCAACTCAAACACTTTAATTAAGCTAAAGCCTCTTCCAAATAGGGGGGC
CTTGATCCCACAATAAACTAGTTAACAGCTAATCGCCCAAGCCAGCGGGCTTCTATTTGCTTCTCCCGTT
GGTGAAGAAACGGGAGAAGCCCCGGAGCCTTTAAGGGCTCCTTTTCAAACTTGCATTTTGATGTGAATCA
CTTCGGGGCTGTGATAAAGAAAGGAATTAAACCAATGTAAATAGGACTACAGCCTACCGCCTACCATTCG
GCCACTTTACCTGTGTTTATTAATCGTTGA

>AF055976.2_Anolis_occultus
ATGAGCCCCAATAATCTACTTAATAGTTTAATTAGCTTATTTATANNNACAACACTAGTAACCACTAGCC
ACCACTGATTATTAGCGTGAGTTGGCTTGGAAATTAACACACTTGCAGCTATTCCACTTATCTCAACAAA
ACATCACCCCCGAGCTACAGAATCAGCCACAAAATACTTTTTAATTCAAGCAGCAGCCTCAGCTACAATC
TTATTTTCAAGTACCATTAATGCTTGACACACAGGCTCATGAGACATTACCCAAATAACCACAAACCCAT
CCAATATTTTACTAACTATAGCCCTTGCCATAAAACTAGGCCTAGCCCCAACACACTTCTGACTCCCAGA
AGTACTTCAAGGGTCAACTATAGACACTGCCCTAATTATTACAACATGACAAAAAATTGCCCCAATAACC
CTAATTTACCTCACCATAAACAACCTATACCCAAGCATTCTAATAACAATAGGCCTATTATCTACAATAA
TCGGGGGTTGAGGAGGCCTAAACCAAACACAAACCCGAAAAATTATAGCATACTCATCAATTGCACACTT
GGGTTGAATGGCCGTAATTTCCACCCTAATAACAAACATCTTTATTATAAACCTAATTATGTATCTAATT
ATAACAACAACCGCATTCTGGGCCCTAATCTGCTTAGAATCTAAAACTGTAAAAGACACAACAACTGCCT
GAACAACCTCACCAACCATCACTTTAACACTTCTTATTTCCCTCTTATCCCTAGGAGGCCTTCCCCCTCT
CTCTGGATTCTTACCAAAATGACTAATCCTAGAAGAACTTACAAACCAAAATCTACTACCATTAACCACC
ACTATAGCAGTCTCCTCCCTGCTAAGCCTGTTTTTTTACCTACGACTTACCTATAATACAACACTAACAA
TAGCCCCAAACACAATACAAACAAAATTCAAGTGACGATTTAAACCTAATAACCCACCCTTATTATTAAC
AGCTACTGCCCCACTAACCACTCTACTACTCCCGCTTACACCTCTTATATTAATATAGAAACTTAGATTT
AAACAAACCAAGAGCCTTCAAAGCTCAAAATATGGGTGTAACCCCCATAGTTTCTGTAACACTTACAAAA
CTTTAATTTACATCTTTTGATTGCAACTCAAACACTTTTATTAAGCTAAAGCCTCCTTGAATAGTCGGGC
TTCGATCCCACGACAAATTAATTAACAGCTAACTGCCCAAACCAGCGGGCTTCTACTCGCTTCTCCCGTC
GTGGGGGAGACGGGAGAAGCCCCGGAGCCTTTTGGGGCTCCTTTTCAAACTTGCATTTTGACGTGAAAAC
ACTTCGAGACTTTAATAAGGAAAGGAATCAAACCCCTGTAAATAGGACTACAGCCTACCGCCTAACACTC
GGCCACCTTACCTGTGTCTATTAATCGTTGA

>AF055945.2_Anolis_olssoni
ATGAACCCCACCATCTACATAATTATTTTATCAAGCCTAGCAACAGGAACAATTATTACTATGACCAGCT
TTCATTGATTAATAGCATGAATTGGATTAGAAGTCAACACACTAGCAATTATTCCAATCATCTCAGCCCC
TCACCACCCACGATCAACAGAAGCTGCAACAAAATACTTTCTCACACAAGCAGCTGCCTCCGCTATAATT
CTATTTGCCAGTATAATTAACGCCTGACAAACAGGCACATGAGACATTACTCAACTGTCAACCACCCCTG
CCCACACCCTCCTAACTATAGCACTAGCCATAAAACTAGGACTTGCCCCACTTCACTTCTGATTACCAGA
AGTTATTCAAGGTGCCACCCTTCCCACTGCTTTCATCATTGTAACATGGCAAAAACTTGCTCCTATATCA
CTTATTTTTTTAACCATAAACAACCTAAACCCAACAATTTTACTTCTCCTTGGACTTCTATCTTCTACAG
TAGGAGGATGAGCCGGATTAAACCAAACACAAACCCGAAAAATTATAGCCTATTCATCAATTTCACACTT
AGGCTGAATGGCCGCAATCTCCTCTATTATAACTAATATTCTTATTATAAACCTAACCCTTTATTTAATT
ATAACAACAACCATGTTTTATACCCTAATTTTAACTAAATCCAAAACAATCCAAGACTCAACCCTCACCT
GATCACTTTCACCAGTACTAACAATTATTATAATACTAACACTCCTCTCACTAGGAGGACTACCTCCCCT
AACCGGATTTTTACCAAAATGAATAATCCTAGAAGAACTTACTACCCAAAACCTAACCCCACTGGCCACC
ATAATAGCCATTTCAGCTTTACTAAGCCTATTTTTTTACCTACGCCTAACTTATACAACAACCTTAACAC
TCTCCCCAAACACAATACAAACAAAACTCAAATGGCGATTTAAATTAAATAAACCAACAACACTTATACT
AATAACTTCTACAATTACCACCTTCTTACTCCCCCTATCACCACTCATTTTAATATAAAAACTTAGGTTT
AACCAAACCAAGAGCCTTCAAAGCTCAAAATAAGGGTCAAACACCCTTAGTTTTTGTAAGACTTGTGAAA
TACTAATACACATCTTCTGAATGCAACTCAAACACTTTAATTAAGCTAAAGCCTCTCTGAATAGGCGGGC
CTCGATCCCGCGACAAATTAATTAACAGCTAACTACCCAAACCAGCGGGCTTCTACTCGCTTCTCCCGTT
GGTAAGGGAACGGGAGAAGCCCCGGAGCCGTTTGGGGCTCTTCTTCAAACTTGCATTTTGATGTGAAACA
CTTCGGGACTTTGATAAAGAAAGGAATTAAACCAATGTTAATAGGACTACAGCCTACTGCCTATCATTCG
GCCACTTTACCTGTGTTCATTAATCGTTGA

>AF055942.2_Anolis_ophiolepis
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>AY654094.1_Anolis_porcatus
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>KC677351.1_Anolis_pulchellus
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>AY655484.1_Anolis_sagrei
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ATAACCACAGCCCTATTCCAAGCACTAATATTTTCTAAATCAAAAACAATTCAAGACACAACAACAACCT
GAGCCTTATCACCAGTTATTTCTACTGTAACCATAACACTATTGTTATCGTTGGGAGGCCTTCCTCCACT
AACCGGATTTATACCAAAATGGCTAATTTTAGAAGAACTAGTTTCCCAAAACCTCCTTCCAACAGCAACA
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TTTCCCCAAACACAACTTCTACAAAATTTAAATGACGACTCAAACTAAATCAGCCCACACCACTAATACT
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>AF055939.2_Anolis_valencienni
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CACACATTTTATTAACCATTGCACTAGCAATAAAACTAGGCCTAGCCCCAATACACTTTTGACTACCAGA
AGTACTACAAGGGTCAACCATAACCACAGCACTAGTTATCTCTACTTGACAAAAACTGGCCCCAATAGCC
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TTGGGGGCTGAGGGGGACTTAATCAAACACAAACCCGAAAAATTATGGCATTTTCATCAATTGCACACCT
AGGGTGAATAATTACTGTTTCATCTATTATAACTAATATCATGATTATAAACTTAATAATCTACTTAATT
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AACAGGATTCATGCCTAAATGACTTATTTTAGAAGAACTAATTATTCAAAACCTTATCCCAACAGCCACT
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ATTAAACCAAGGGCCTTCAAAGCCCTAAATAAGGGCCCCACCCCCTTAGTTTTTGTAAGACTTATGGGTG
TCTACTCCATATCTCCTGAATGCAAATCAAACACTTTTATTAAGCTAAAGCCTTGACCAAATAGGTGGGC
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TCGGGGCTGATAAAGAAAGGAATTAAACCAATGTAAATAGGACTACAGCCTACCGCCTACCATTCGGCCA
CTTT

>EF591774.1_Leiocephalus_barahonensis
ATGAGCCCCCTTACAACAACAATTCTACTATCAAGCTTAGCAACCGGCACCATCATTACAGCCACAAGCT
ATCACTGACTATTAGCTTGAATTGGCCTTGAACTAAACACATTAGCTATCATTCCAATTATCTCAAAACA
ACATCACCCCCGAGCGACAGAGGCCGCCACCAAGTACTTCTTAACTCAAGCAGCTGCTTCAGCACTAATC
CTATTCTCAAGTACAATCAACGCTTGACACTCAGGAACTTGGGACATTACACAAATAACAAACAATACAT
CAAACATCTTACTAACAATGGCACTAGCCATAAAATTAGGCCTTGCACCAACACACTACTGACTCCCAGA
GGTTATTCAAGGAACATCAATAACAACAGCCCTAATTATTACTACGTGACAAAAACTAGCCCCTATAGCA
CTCATTATTATTACAAGCAACAACTTATCCTATATAGTCTTAATAACAATGGGGGTATTATCTACCATCG
TAGGAGGATGGGGCGGCCTAAACCAAACCCAAACCCGAAAAATCATAGCGTACTCCTCAATCGCACACCT
TGGCTGAATATCAATGGTTACCCCACTAATAACAAAACTACTCATTTTAAACCTTGGCATTTACATCCTA
ATAACAACAGCTATATTCCTCTCACTAATTTTATCAAAATCAAAAACCTTACAAGATACATCCACACTAT
GGGCACTATCCCCAACACTTATAATTTTAACAATACTAACACTATTATCCCTAGGAGGACTGCCCCCACT
AACAGGATTCATACCCAAGTGACTTATTCTACAAGAATTAACAGCACAAAACCTACTAATAGTAGCCACA
CTTCTAGCCCTATCAGCACTCTTAAGCCTCTTCTTTTACCTCCGACTAACATACACAATGACCCTTACCA
CACCCCCCAACACCACTATATTCAAACACAAATGACGGTTTAACTATTTAAATAATACAACTCCCCTATC
CATCTCCATAGCCCTCTCAACCCTATTATTACCAATTACACCCCTCATCATAATATAGAAACTTAGGATA
ACATTAAACCAAGGGCCTTCAAAGCCCAAAATAGGAGTGAAAATCCCCTAGTCTCTGATAAGACCTGTGA
TATTCTAAAACACATCTTCTGAATGCAACCCAGACAC

7) Cuando ya haya copiado todas las secuencias vayan a la siguiente dirección:

http://phylogeny.lirmm.fr/phylo_cgi/simple_phylogeny.cgi
8) Pongan un título a su trabajo donde dice Name of the Analysis según los
apellidos e inicial del nombre: Apellido1Inicial1Apellido2Inicial2etc
Ejemplo: PerezJGomezS

9) Copien toda la información que tienen en el documento de word y peguen la

información en el recuadro:

10) Escriban su dirección de correo electrónico de la espe en el recuadro your

address para tener un respaldo de su trabajo.

11) Hagan clic en Submit

12) Luego hagan clic en this link para ver los resultados.

13) En Dynamic Tree Edition seleccionar el botón Reroot y hacer click sobre el
grupo control.

14) Seleccionar el botón Add annotations he ir anotando la isla y nicho de cada

especie.

15) Guarden la imagen del árbol en el formato que ustedes deseen (puede ser pdf o
png) e inserten la imagen en la parte de resultados del informe de Laboratorio.

16) Finalmente discutan el árbol que observan en la sección de resultados,

tomando en cuenta los términos de ecología, la zoogeografía, y el patrón
morfológico de las lagartijas (ver anexo), respondiendo a las siguientes
preguntas: ¿Qué patrones generales observa usted en el árbol filogenético?,
¿Las especies del mismo nicho están en la misma rama del árbol filogenético?,
 ¿Las especies de la misma isla están en la misma rama del árbol filogenético?,
¿Qué relación existe entre los diferentes nichos dentro de la misma rama del
árbol filogenético?

5. RESULTADOS
Link: http://phylogeny.lirmm.fr/phylo_cgi/simple_phylogeny.cgi?

workflow_id=5ec5e1f89193af762b05f87e4211cab6&tab_index=last

6. ANÁLISIS DE LOS RESULTADOS

1) ¿Cuál es la importancia de tener un sistema de clasificación de los

animales?

Dado que la cantidad de animales que existen en el planeta tierra es muy

numerosa para poder identificarlos y estudiarlos es necesario un sistema de
divisiones y subdivisiones que permitan el correcto uso de los mismos, además, si
se profundiza más en la importancia de un sistema de clasificación de los animales
se puede mencionar la conservación de los ellos en zona protegida o en una
investigación sobre la producción de cierta sustancia química en una especie, si
está no produce lo necesario se busca una especie con un parentesco y para ello
nos basamos en un sistema de clasificación. (Padilla, 2003)

2) Analice las preguntas del literal 16.

¿Qué patrones generales observa usted en el árbol filogenético?

En el presente árbol filogenético podemos observar que la mayoría de las especies
de lagartijas están de dos en dos en un mismo nicho y las especies más alejadas
filogenéticamente hablando son Puerto Rico twig e Hispaniola Trunk-Crown ya
que se encuentran solas en sus respectivos nichos. Además, se ve que el mínimo
 ancestro más común abarca 100% de las especies de Jamaica, el 100 % de Cuba,
el 75 % de Puerto Rico, y 0 % de la isla Hispaniola. Con esto podemos determinar
que el grupo más disociado es el de la isla Hispaniola con poca relación
filogenética respecto de las demás especies.

¿Las especies del mismo nicho están en la misma rama del árbol filogenético?
Si, con la excepción de las especies Puerto Rico Twig, e Hispaniola Trunk-Crown
que no coinciden en el mismo punto de ramificación con las demás especies, es
decir se encuentran en un punto más alejado con respecto al punto de ramificación
donde coinciden las demás especies.

¿Las especies de la misma isla están en la misma rama del árbol filogenético?
Todas, excepto las especies de Hispaniola y un 25% de Puerto Rico.

¿Qué relación existe entre los diferentes nichos dentro de la misma rama del
árbol filogenético?
Que el punto de ramificación más próximo entre los diferentes nichos está en
promedio a 1,5 puntos de ramificación siguientes, es decir no se aleja mucho el
parentesco entre especies de nicho a nicho.

7. CONCLUSIONES

 Los árboles filogenéticos sirven para estudiar los parentescos entre diferentes
especies, derivándose de una en común.
 Los árboles filogenéticos nos ayudan a clasificar a las especies de acuerdo a la
evolución de las mismas con parentesco en especies que han pasado de generación en
generación.
 Al principio del árbol filogenético se encuentra situada una especie en común, en
algunos casos está se puede encontrar extinta, de esta rama principal salen divisiones
y subdivisiones; y en los extremos se encuentran siempre las especies más actuales.

8. BIBLIOGRAFÍA

 Wikipedia®. (2017). Computational phylogenetics. Retrieved from

https://en.wikipedia.org/wiki/Computational_phylogenetics

 Life, T. of. (2004). What is Phylogeny? Retrieved from

http://tolweb.org/tree/learn/concepts/whatisphylogeny.html
 Padilla, Francisco; Cuesta, Antonio. 2003. Zoología aplicada. Ediciones Díaz de
Santos, S.A. Madrid, España.
 Hickman, Roberts, L., & L'Anson, E. (2002). Madrid: McGrawHill.
  Pizarro, O. (15 de agosto de 2011). Biologia Bl. Obtenido de
http://biologiabi.blogspot.com/2011/08/48-filogenia-y-sistematica.html

 Ville, C. A. (2001). Biologia. MacGrawhill.

ANEXO:
9. ANEXO:

Agregue en esta sección las imágenes obtenidas del árbol filogenético obtenido.
 Leiocepha
lus barahonensis

Anolis occultus

Anolis chlorocyanus
Anolis olssoni Anolis cybotes

Anolis porcatus Anolis angusticeps

Anolis lineatopus Anolis sagrei Anolis ophiolepis

Anolis pulchellus

Anolis evermanni Anolis cristatellus

Anolis grahami Anolis valencienni Anolis alutaceus