UNIVERSIDAD DE LA AMAZONÍA

LABORATORIO DE GENÓMICA Y BIOLOGÍA MOLECULAR

Docente: Ángel Alejandro Reyes-Bermúdez
Asistente de enseñanza: Sebastian Valderrama C. GUÍA DE
LABORATORIO VIRTUAL

MUTACIÓN FUENTE DE VARIACIÓN DE PROCESOS EVOLUTIVOS

Curso de Evolución
Introducción
La materia prima de la evolución son las modificaciones aleatorias que se producen durante
el proceso de replicación del ADN, estos cambios se conocen como “mutaciones” (Cabrero,
J., & Camacho, J. 2002). El principal origen de la variabilidad en el genoma son las
mutaciones y recombinación meiótica; la mutación añade nuevos alelos en la población y la
recombinación produce combinaciones nuevas en los genes, siendo claves en la
particularidad de cada organismo. Hay dos tipos de mutación, la génica que involucra sólo a
unos nucleótidos del gen y la cromosómica que afecta la cantidad de cromosomas, los genes
de un cromosoma o el orden de los genes que se encuentran en un cromosoma (Ballesteros
Hernández, M., Guirado Blanco, O., & Rodríguez Pena, A. 2019).

Las condiciones ambientales seleccionan el efecto de las mutaciones, es decir, de una

mutación pueden resultar cambios perjudiciales o no en un individuo dependiendo del medio
en el que se desarrolle (Zamora-Muñoz, C. & Soler, J. 2018). Gracias a la presión ejercida
por la selección natural a las poblaciones, se puede decir que estas están adaptadas al medio
donde se encuentran. Debido a esto, las nuevas mutaciones son principalmente deletéreas,
pero, puede suceder que se genere una mutación que sea beneficiosa para los organismos que
la porten en caso de que surjan cambios en el ambiente o que se vean forzados a emigrar
hacia un hábitat nuevo. Esto puede conducir a que la adaptación de la población en el
ambiente nuevo genere una mejora en su constitución genética (Soler, 2002).

Objetivo

General

Entender el concepto de variación aleatoria de un sistema de información como fuente de

diversidad para procesos evolutivos.
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Asistente de enseñanza: Sebastian Valderrama C. GUÍA DE
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Específicos

• Generar un archivo FASTA con ayuda de los códigos del GenBank.

• Identificar los polimorfismos presentes en el alineamiento por medio de AliView.
• Realizar experimentos para probar hipótesis acerca de mecanismos evolutivos
utilizando “organismos virtuales”.

Metodología

1. Para generar un archivo FASTA con las secuencias de los organismos a analizar se
deben seguir los siguientes pasos:
Familia Especie Código GenBank
Cichlidae Neolamprologus FJ706329.1
calliurus
Cichlidae Neolamprologus FJ706339.1
leloupi
Cichlidae Neolamprologus FJ706338.1
tetracanthus
Cichlidae Neolamprologus FJ706335.1
multifasciatus
Cichlidae Neolamprologus FJ706308.1
fasciatus
Cichlidae Neolamprologus FJ706305.1
similis
Cichlidae Neolamprologus XM_006795380.2
brichardi
Cichlidae Pelmatolapia MF134830.1
mariae
Tabla 1. Taxonomía de especies y códigos de acceso de las secuencias 16s.
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1. Buscar la secuencia de cada organismo en las bases de datos con el código de

GenBank correspondiente.
2. En un bloc de notas escriba el símbolo mayor qué (>) y un ID que represente dicha
secuencia (Deben ser un ID preciso, con abreviaciones. Ejemplo: para
Neolamprologus calliurus sería “>Neolamprologus_calliurus”), luego dar un “enter”
y copiar la secuencia.
3. Repita los pasos con cada una de las secuencias hasta tener completa la base de datos
(No debe haber espacio entre letras o renglones de cada secuencia).
4. Realizar alineamiento múltiple con ClustalW en la siguiente herramienta online:
https://www.genome.jp/tools-bin/clustalw
4.1 Modifique el tipo de secuencia a DNA, luego cargue el archivo FASTA que
realizó.
Nota: verifique que todo en el archivo esté correcto antes de cargarlo.
4.2 Step 2: Seleccione el archivo generado en FASTA (.txt).
4.3 Clic en “Execute multiple Alignment”.
5. Una vez se ejecute el alineamiento, desplácese hacia abajo hasta que encuentre
“clustalw.fasta”.
6. Clic en clustalw.fasta para descargar el archivo final.
7. Descargar la aplicación AliView-Setup. https://ormbunkar.se/aliview/downloads/
8. Ejecutar la aplicación AliView-Setup.
9. Clic en “File”, Luego “open” y busque el archivo del alineamiento que se descargó
en el punto 6.
10. El siguiente paso es identificar los polimorfismos presentes en el alineamiento.

Informe.
Los resultados de la práctica se presentarán en forma de artículo de investigación
por grupos de trabajo. La fecha de entrega de este documento será determinada una
vez finalice el feedback de la práctica. El documento debe tener:
1. Título.
2. Resumen.
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3. Introducción.
4. Resultados (figuras).
5. Discusión.
6. Conclusiones.
7. Referencias.
Referencias

Soler. (2002). La base de la Biología. Proyecto Sur de Ediciones, S.L.

Ballesteros Hernández, M., Guirado Blanco, O., & Rodríguez Pena, A. (2019). Interacción
medio ambiente-genes en la hipertensión arterial esencial: del genotipo al fenotipo.

Soler, J. J. (2016). Comportamiento y Evolución. 71–121.

https://doi.org/http://dx.doi.org/10.20350/digitalCSIC/9071. • Zamora-Muñoz, C., & Soler,
J. J. (2018). LA EVOLUCIÓN.
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