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Sistemática

1. Buscar en Genbank dos marcadores moleculares de su elección dependiendo el grupo de


interés. Tener mínimo 12 OTUs incluyendo los outgroups.
2. Hacer la curaduría de las secuencias mediante Geneneous
3. Realizar el alineamiento de la secuencias mediante MAFFT
4. Concatenar las matrices alineadas en Genenous
5. Realizar un análisis de Máxima Parsimonia mediante TNT y hacer un bootstrap como
soporte de rama con 10.000 repeticiones.
6. Buscar el modelo de sustitución nucleotídica o evolutivo para sus marcadores.
7. Realizar un análisis de Máxima Verosimilitud mediante Iqtree haciendo un
Utrabootstrap y SH-aLRT como soporte de rama con 10.000 repeticiones cada
análisis.
8. Inferir un análisis de Inferencia Bayesiana por MrBayes
9. Analizar y discutir los resultados obtenidos en cada análisis filogenético y compararlos.
10. Concluir.

Solución

Evaluación y comparación de las regiones mitocondriales de los marcadores COX1 y


COI para análisis genéticos en pulpos del Mar Caribe Colombiano

Introducción

En el mar Caribe Colombiano se reconocen unas 48 especies de cefalópodos en diversos


ambientes marinos con unas 17 familias y 33 géneros. Se evidencia la presencia de una Spirula,
siete sepiolidos, veintiún calamares y dieciocho pulpos (Guerrero, 2021). La revisión de los
cefalópodos del Caribe colombiano mostró que la gran mayoría de especies son bentónicas y de
aguas someras.

La falta de especies oceánicas se debe a que no hay investigaciones en aguas oceánicas en el


país, así mismo investigaciones sistemáticas de aguas profundas, por lo que solo se tiene
conocimiento de reportes fragmentarios y casuales de estas zonas (Guerrero, 2021).

Como todos los pulpos del caribe, el pulpo caribeño (Octopus briareus) puede variar su
coloración y textura gracias a sus cromatóforos; normalmente luce una coloración marrón sobre
fondo verde o azulado e incluso blanco en estado de excitación. Alcanza un tamaño de unos 50
cm incluyendo los brazos, se alimenta de una gran variedad de animales como locrustáceos,
bivalvos, poliquetos, etc (Animalandia, 2022).
Descripción de los especímenes utilizados

Octopus defilippi se caracteriza por tener brazos extremadamente largos, es habitante en aguas
litorales en fondos arenosos a fangosos de 6 a 60 m de profundidad. Las hembras alcanzan tallas
más grandes que los machos (El-Ganainy y Riad, 2008). Su manto es relativamente pequeño en
comparación con sus brazos largos, su piel es suave y sin ocelo o anillo pigmentado, sus brazos
tienen extremos cónicos, frágiles y asimetría con tres ventosas primarias en cada brazo
(Sundaram y Deshmuj, 2010).

El pulpo manta o pulpo de velos (Tremoctopus violaceus) habita en aguas profundas a 120 - 750
m, se cree que sus crías son planctónicas en funcion el tamaño del huevo, se describe que el velo
de estos pulpos va del rejo I a II con la capacidad de contraerse y ampliarse, estos movimientos
ocurren gracias a que los músculos que forman las bandas transversales están rodeados por fibras
elásticas, los rejos dorsales y el velo se desenvuelven para usarse cuando el animal nada, por lo
tanto se puede decir que el velo posee función defensiva y nadadora ( Castañeyra et al, 2011).

Octopus joubini es una especie bentónica, que se halla ubicada en arrecifes de coral y en fondos
arenosos. Morales y Robaina (1988) determinaron que estos pulpos pierden la capacidad
reproductiva en condiciones de confinamiento, no existe una etapa larvaria, los individuos
juveniles tienen un ritmo elevado de crecimiento y su alimentación es a base de pequeños
crustáceos.

Octopoda incirrata, son pulpos bentónicos y se distinguen de los pulpos cirriados por la ausencia
de los filamentos “cirri” y por la falta de una concha interna. La forma de cuerpo blando y aletas
pequeñas a grandes a modo de paleta, se encuentra principalmente en aguas profundas y someras
(Franco et al, 2014).

En cuanto a Octopus vulgaris es una especie bentónica cuyo desarrollo es continuo, su ciclo de
vida es corto, con inteligencia motora y agudeza visual; En la puesta de huevos ocurre de manera
grupal y la hembra recupera la puesta con su cuerpo, cada cierto tiempo renueva el agua
alrededor de los huevos a través de contracciones del manto y los limpia con los brazos
(González et al, 2015).

Octopus insularis, tiene brazos medianamente cortos y robustos, en especímenes conservados


tienen la piel marrón rugosa, cuenta con 8 a 11 laminillas branquiales en las demibranquias
externas, lígula pequeña , rádula´espermatóforo y pico simétrico característico, sus huevos son
pequeños y de alta fecundación. Habita en arrecifes y hábitats asociados a aguas poco profundas
(Leite et al, 2008).

Octopus burryi tiene el manto, la cabeza y brazos densamente cubiertos por papilas redondeadas,
de las cuales son más notorias en el dorso del manto; Su manto es sacular y redondeado
posteriormente, su anchura es cerca de 67-85% la longitud del manto, con ojos prominentes y
cabeza tan amplia como en manto (Gracia, Ardila y Diaz, 2002).
Los estudios sobre la región control del ADNmt del gen Citocromo c Oxidasa I (COI)
demuestran que es una herramienta rápida, económica y muy utilizada, debido a que solo
requiere de pequeñas muestras del espécimen permitiendo la identificación de especies crípticas
(Daza, 2018).

La Ciclooxigenasa 1 (COX1) desempeña un papel relevante en la síntesis de los prostanoides con


fines fisiológicos y regula funciones como la protección gastrointestinal, la homeostasis vascular,
la hemodinámica, entre otras. Este gen mide aproximadamente 22 kb, tiene 11 exones y proviene
de una duplicación del gen común ancestro (García y Gomez, 2000).

INGROUP: Marcadores: COX1 - COI


Octopus briareus
- COX1:
>MN933636.1_Octopus_briareus
CGAACAGAATTAGGACAACCTGGTTCCCTCCTTAATGATGATCAACTATATAATGTAATCGTCACAGCTC
ATGCATTCGTAATAATTTTCTTCCTTGTTATACCAGTCATAATTGGAGGATTTGGAAATTGATTAGTACC
ATTAATATTAGGTGCCCCTGATATAGCATTCCCTCGAATAAATAATATAAGCTTTTGACTTCTCCCCCCA
TCATTAACTCTCTTATTATCTTCTGCTGCAGTAGAAAGTGGTGTTGGAACTGGATGAACCGTTTACCCCC
CTCTTTCAAGAAATTTAGCTCATATAGGACCATCTGTCGATTTAGCTATTTTTTCACTTCATCTAGCAGG
TATTTCTTCAATTCTTGGAGCTATTAACTTTATCACAACTATTATTAATATACGATGAGAAGGAATATTT
ATAGAACGACTTCCACTATTTGTATGATCCGTCTTCATTACTGCTATTCTACTTCTCCTTTCATTACCAG
TTCTTGCTGGAGCAATTACTATACTCCTAACCGATCGAAATTTTAATACCACATTTTTTGATCCTAGAGG
AGGA

- COI:
>MG778069.1_Octopus_briareus
GGTTTGTTAGGAACCTCCTTAAGTTTAATAATCCGAACAGAATTAGGACAACCTGGTTCCCTCCTTAATG
ATGATCAACTATATAATGTAATCGTCACAGCTCATGCATTCGTAATAATTTTCTTCCTTGTTATACCAGT
CATAATTGGAGGATTTGGAAATTGATTAGTACCATTAATATTAGGTGCCCCTGATATAGCATTCCCTCGA
ATAAATAATATAAGCTTTTGACTTCTCCCCCCATCATTAACTCTCTTATTATCTTCTGCTGCAGTAGAAA
GTGGTGTTGGAACTGGATGAACCGTTTACCCCCCTCTTTCAAGAAATTTAGCTCATATAGGACCATCTGT
CGATTTAGCTATTTTTTCACTTCATCTAGCAGGTATTTCTTCAATTCTTGGAGCTATTAACTTTATCACA
ACTATTATTAATATACGATGAGAAGGAATACTTATAGAACGACTTCCACTATTTGTATGATCTGTCTTCA
TTACTGCTATTCTACTTCTACTTTCATTACCAGTTCTTGCTGGAGCAATTACTATACTCCTAACCGATCG
AAATTTTAATACCACATTTTT

Octopus defilippi Verany


- COX1:
>MT111602.1_Macrotritopus_defilippi
GATTAATAATTCGAACAGAATTAGGACAACCAGGATCTCTCTTAAATGATGACCAATTATATAATGTAAT
TGTAACAGCTCATGCATTCGTAATAATTTTTTTTCTAGTTATACCTGTAATAATTGGAGGGTTTGGAAAT
TGATTAGTGCCTTTGATATTAGGAGCTCCTGATATAGCTTTCCCTCGAATAAATAACATAAGATTTTGAT
TACTTCCCCCCTCATTAACACTACTTTTATCTTCAGCTGTAGTTGAAAGAGGTGTAGGAACCGGATGAAC
TGTATATCCTCCACTCTCAAGAAATCTAGCTCACATGGGACCCTCAGTCGATCTTGCTATTTTTTCTCTT
CATTTAGCTGGTATTTCGTCAATTCTTGGAGCCATTAATTTTATTACTACTATTATTAATATACGATGAG
AAGGAATACTAATAGAACGTCTCCCCTTATTCGTCTGATCTGTTTTTATTACAGCAATTCTACTACTCCT
ATCACTCCCAGTTTTAGCAGGTGCGATTACTATATTATTAACAGATCGAAACTTTAACACTACATTTT
- COI:
>MW125083.1_Macrotritopus_defilippi
TACATTATATTTTATTTTTGGAATTTGATCAGGTTTATTAGGAACCTCCCTAAGATTAATAATTCGAACA
GAATTAGGACAACCAGGATCTCTCTTAAATGATGACCAATTATATAATGTAATTGTAACAGCTCATGCAT
TCGTAATAATTTTTTTTCTAGTTATACCTGTAATAATTGGAGGATTTGGAAATTGATTAGTGCCTTTGAT
ATTAGGAGCTCCTGATATAGCTTTCCCTCGAATAAATAACATAAGATTTTGATTACTTCCCCCCTCATTA
ACACTACTTTTATCTTCAGCTGCAGTTGAAAGAGGTGTAGGAACCGGATGAACTGTATATCCTCCACTCT
CAAGAAATCTAGCTCACATGGGACCCTCAGTCGATCTTGCTATTTTTTCTCTTCATTTAGCTGGTATTTC
GTCAATTCTTGGAGCCATTAATTTTATTACTACTATTATTAATATACGATGAGAAGGAATATTAATAGAA
CGTCTCCCCTTATTCGTCTGATCTGTTTTTATTACAGCAATTCTACTACTCTTATCACTCCCAGTTTTAG
CAGGTGCGATTACTATATTATTAACAGATCGAAACTTTAACACTACATTTTTTGATCCAAGAGGTGGAGG
AGATCCAATCTTATATCAACATTTATTT

Tremoctopus violaceus
- COX1:
>MW351787.1_Tremoctopus_violaceus
TAGGAACCTCCTTAAGATTAATAATCCGAACAGAATTGGGACAACCAGGATCACTATTAAATGACGATCA
ACTCTACAATGTCATTGTAACAGCCCATGCATTTGTCATAATTTTTTTTTTAGTAATACCTGTAATAATT
GGAGGATTTGGAAATTGACTAATTCCCTTAATACTAGGAGCTCCAGATATAGCTTTCCCACGAATAAATA
ACATGAGATTTTGATTACTTCCCCCATCCCTAACACTCCTCTTAACCTCAGCAGCAGTAGAAAGTGGGGT
TGGTACAGGATGAACTGTATATCCTCCCTTATCTAGTAATTTAGCTCATATAGGACCTTCCGTGGATTTA
GCTATTTTCTCCCTTCACTTAGCAGGAATTTCCTCAATTCTAGGAGCAATCAATTTTATTACTACAATTA
TTAATATGCGATGAGAAGGTATGCAAATAGAACGACTTCCTCTATTTGTATGATCTGTGTTAATTACAGC
TGTTCTATTACTCCTTTCTCTTCCAGTTTTAGCCGGAGCAATTACTATACTTTTAACCGACCGAAACTTT
AATACAACTTTCTTTGATCCCAGAGGAGGTGGTGACCCAATCCTTTACCAACACCTATTCTGATTCTTTG
GC
- COI:
>MN443917.1_Tremoctopus_violaceus
AAAGATATTGGTACCCTATATTTCATCTTTGGAATTTGATCAGGACTACTAGGAACTTCCCTAAGATTAA
TAATCCGAACAGAATTAGGACAACCAGGATCACTATTAAATGACGATCAACTGTACAATGTCATTGTAAC
AGCTCATGCATTTGTCATAATTTTTTTTTTAGTAATACCTGTAATAATTGGAGGATTTGGAAATTGATTA
ATTCCATTAATACTAGGAGCCCCAGACATAGCCTTCCCACGAATAAATAACATAAGATTTTGATTACTCC
CTCCATCCCTAACACTCCTCTTAACCTCAGCAGCAGTAGAAAGAGGAGTAGGAACAGGATGAACTGTATA
CCCCCCCTTATCTAGCAATTTAGCTCATATAGGACCTTCCGTAGACTTAGCTATTTTCTCTCTTCACTTA
GCAGGTATTTCCTCAATCCTAGGAGCAATCAATTTTATCACTACAATCATCAACATACGATGAGAAGGAA
TACAAATAGAACGACTTCCCCTATTTGTATGATCTGTGTTAATTACAGCTGTCTTATTACTTCTCTCCCT
TCCAGTTTTAGCTGGAGCAATTACTATACTTCTAACTGATCGAAATTTTAATACAACTTTTTTTGACCCT
AGGGGAGGTGGGGACCCAATCCTTTACCAGCACTTATTCTGATTTTT

Octopus joubini
- COX1:
>MZ958974.1_Octopus_joubini
AGATATTGGCACATTATATTTTATTTTTGGTATTTGGTCAGGACTTCTAGGAACATCTTTAAGATTAATA
ATTCGTACAGAATTAGGTCAACCAGGATCTTTACTAAACGATGATCAATTATATAATGTAATTGTAACTG
CTCATGCTTTTGTTATAATTTTTTTTTTAGTTATACCAGTTATAATTGGAGGATTTGGTAATTGATTAGT
TCCTTTAATATTAGGAGCTCCAGATATAGCTTTCCCCCGTATAAATAATATAAGATTTTGATTATTACCT
CCTTCATTAACACTACTTCTTACTTCAGCTGCTGTTGAAAGAGGTGCTGGAACTGGATGAACTGTATACC
CCCCACTGTCTAGAAATTTAGCTCATATAGGTCCATCAGTTGATCTTGCTATTTTCTCTCTTCATTTAGC
TGGTATTTCATCCATCCTAGGAGCTATTAATTTTATTACTACTATTATTAATATACGATGAGAAGGAATA
TTAATAGAACGTCTTCCTTTATTTGTATGATCTGTTCTTATTACCGCAGTTTTATTACTTCTATCCCTAC
CTGTTCTCGCTGGAGCTATTACTATACTCCTTACTGACCGTAATTTCAATACTACTTTTTTTGACCCTAG
AGGGGGAGGARAMCCAATTCTAWACCAACACCTTTTTTGATTTTT
- COI:
>AY377732.1_Octopus_joubini
ACACTATATTTTATTTTTGGTATTTGATCAGGTCTACTAGGAACATCATTAAGATTAATAATTCGAACAG
AATTAGGCCAACCAGGATCTTTATTAAATGATGATCAATTATATAATGTAATTGTAACCGCTCATGCTTT
TGTTATAATTTTTTTTTTGGTTATACCAATTATAATTGGAGGATTTGGAAACTGACTAGTCCCCTTAATA
TTAGGAGCACCAGATATAGCTTTTCCTCGAATAAACAATATAAGATTTTGATTATTACCTCCCTCTTTAA
CATTACTACTTACTTCAGCTGCTGTTGAAAGAGGTGTAGGAACTGGATGAACTGTATACCCTCCTCTTTC
TAGAAACTTAGCTCATATAGGCCCTTCAGTAGATCTTGCTATTTTTTCTCTTCACTTAGCTGGAATCTCT
TCTATTTTAGGAGCTATTAATTTTATCACCACCATTATTAATATACGCTGAGAAGGAATATTAATAGAAC
GACTTCCTTTATTTGTTTGATCAGTTTTTATTACAGCTGTATTATTACTATTATCCCTTCCTGTTCTAGC
TGGAGCTATTACTATACTTCTTACCGATCGTAATTTTAATACTACTTTTTTTGATCCAAGAGGAGGAGGA
GATCCAATTTTATATCAACATTTATTT

Octopoda Incirrata
- COX1
>GQ900748.1_Wunderpus_photogenicus
ATCAGGATTATTAGGTACCTCCTTAAGATTAATAATCCGAACAGAATTAGGTCAACCAGGATCTCTACTT
AATGATGATCAACTATATAATGTTATCGTGACAGCTCATGCTTTTGTAATAATTTTTTTTTTAGTTATAC
CCGTTATAATTGGAGGATTTGGTAATTGACTAGTACCTTTAATATTAGGAGCTCCCGATATAGCATTCCC
TCGAATAAATAATATAAGATTTTGATTACTTCCACCATCATTAACATTACTCCTCTCCTCAGCCGCAGTT
GAAAGGGGAGTGGGAACTGGATGAACTGTCTATCCTCCACTCTCAAGAAATTTAGCTCACATAGGACCCT
CAGTAGACCTTGCTATTTTTTCCCTTCATCTAGCAGGAATTTCATCAATTCTTGGAGCCATTAATTTTAT
TACTACTATTATTAATATACGATGAGAAGGAATGTTAATAGAACGATTACCACTATTTGTGTGATCTGTA
TTTATTACAGCAATTTTATTACTTTTATCACTCCCAGTTTTAGCTGGTGCAATTACCATACTATTAACCG
ACCGAAATTTTAATACCACATTTTTTGACCCTAGAGGGGGA

- COI
>GU806433.1_Pareledone_cornuta
ACTTTATATTTTATTTTCGGAATTTGATCAGGATTATTAGGTACATCATTAAGACTAATAATTCGAACAG
AACTAGGTCAACCAGGATCTTTATTAAATGATGATCAATTATATAATGTAATTGTTACTGCTCATGCATT
TGTAATAATTTTTTTTTTAGTTATACCTGTAATAATTGGAGGATTTGGTAATTGATTAGTACCATTAATA
TTAGGAGCACCAGATATAGCATTCCCCCGAATAAATAATATAAGTTTTTGATTACTTCCTCCTTCTTTAA
CTCTTCTTCTTACATCAGCTGCAGTTGAAAGTGGAGCAGGAACAGGATGAACTGTCTACCCTCCATTATC
TAGAAACTTAGCACATATAGGTCCTTCAGTTGATTTAGCTATTTTTTCACTACATTTAGCAGGAGTATCC
TCCATTTTAGGAGCCATTAATTTTATTACTACTATTATTAATATACGTTGAGAAGGAATACAAATAGAAC
GTTTACCTTTATTTGTCTGATCAGTATTTATTACTGCAATTCTTTTACTTTTATCACTTCCAGTTTTAGC
AGGAGCTATTACAATACTTTTAACAGACCGTAATTTTAATACAACCTTTTTTGATCCTAGTGGAGGAGGA
GATCCTATTCTTTATCAACACTTATTC

Octopus vulgaris
- COX1:
>MT919752.1_Octopus_vulgaris
GGACTTTTAGGTACCTCCTTAAGTTTAATAATTCGAACAGAACTAGGACAACCAGGATCCCTCCTAAATG
ATGATCAATTATATAATGTAATTGTTACAGCTCACGCATTTGTTATAATTTTTTTTCTTGTTATACCAGT
TATAATTGGAGGATTTGGAAACTGATTAGTTCCTTTAATACTAGGAGCACCAGATATAGCATTCCCACGA
ATAAATAACATAAGCTTCTGACTCTTACCTCCTTCTCTCACTCTTCTCCTTTCATCTGCAGCTGTTGAAA
GTGGTGCAGGTACCGGATGAACCGTTTACCCACCTCTTTCAAGAAATTTAGCTCATATAGGACCCTCTGT
TGATCTAGCAATTTTCTCACTTCACTTAGCAGGTATTTCATCAATTCTTGGAGCCATCAATTTTATTACA
ACTATTATTAATATACGATGAGAAGGTATATTAATAGAACGACTTCCACTATTTGTGTGATCTGTTTTTA
TTACCGCACTTTTAC

- COI:
>MW560654.1_Octopus_vulgaris
TTGGTACTCTATATTTCATTTTCGGAATTTGATCAGGACAAGTTTTAGGTACTTCCCTAAGCTTAATAAT
TCGAACAGAATTAGGACAACCAGGATCTCTCCTCAATGATGATCAATTATATAATGTAATTGTAACAGCC
CATGCATTTGTAATAATTTTTTTTTTAGTAATACCTGTTATAATTGGAGGATTTGGAAATTGACTAGTCC
CATTAATATTAGGAGCCCCTGATATAGCATTCCCACGAATAAATAATATAAGATTTTGATTATTACCCCC
TTCTCTAACATTGCTATTATCTTCAGCCGCAGTCGAAAGAGGTGTTGGAACTGGATGAACTGTATATCCT
CCCCTTTCAAGAAATTTAGCCCATATAGGACCATCTGTTGACCTAGCTATTTTTTCTCTTCATTTAGCAG
GAATTTCGTCAATTCTAGGAGCTATTAATTTTATTACTACCATTATTAATATACGATGAGAAGGTATACT
AATAGAACGACTTCCTCTATTTGTATGATCTGTATTAATTACTGCAGTTCTCTTACTACTATCCCTCCCA
GTTCTTGCAGGCGCAATTACTATATTATTAACCGACCG

Octopus insularis
- COX1
>MN933644.1_Octopus_insularis
CGAACAGAATTAGGTCAACCAGGATCTCTTCTTAATGATGACCAACTATACAATGTAATTGTAACAGCAC
ATGCATTTGTAATAATTTTTTTTCTAGTTATACCTGTTATAATTGGAGGATTTGGTAATTGATTAGTTCC
TTTAATACTAGGAGCCCCAGATATAGCATTCCCACGGATAAATAACATAAGTTTTTGACTTTTACCTCCT
TCTCTTACCCTATTATTATCTTCAGCCGCAGTAGAAAGAGGTGCAGGTACCGGATGAACTGTATATCCTC
CTCTTTCAAGAAATTTAGCCCATATAGGTCCTTCCGTTGATCTAGCTATTTTCTCCCTTCATTTAGCTGG
TATTTCATCCATTCTTGGAGCCATTAATTTTATTACAACTATTATCAATATACGATGAGAAGGAATATTA
ATAGAACGACTCCCATTATTTGTATGAGCAGTATTTATTACTGCAATTTTATTACTACTCTCCTTACCAG
TCCTCGCTGGAGCAATTACTATACTTTTAACAGATCGAAATTTTAATACCACTTTTTTTGACCCAAGAGG
TGGT
- COI
>MK187267.1_Octopus_insularis
GGTCAACCAGGATCTCTTCTTAATGATGACCAACTATACAATGTAATTGTAACAGCACATGCATTTGTAA
TAATTTTTTTTCTAGTTATACCTGTTATAATTGGAGGATTTGGTAATTGATTAGTTCCTTTAATACTAGG
AGCCCCAGATATAGCATTCCCACGAATAAATAACATAAGTTTTTGACTTTTACCACCTTCTCTTACCCTA
TTATTATCTTCAGCCGCAGTAGAAAGAGGTGCAGGTACCGGATGAACTGTATACCCTCCTCTTTCAAGAA
ATTTAGCCCATATAGGTCCTTCCGTTGATCTAGCTATTTTCTCCCTTCATTTAGCTGGTATTTCATCCAT
TCTTGGAGCCATTAATTTTATTACAACTATTATCAATATACGATGAGAAGGAATATTAATAGAACGACTC
CCATTATTTGTATGAGCAGTATTTATTACTGCAATTTTATTACTACTCTCCTTACCAGTCCTCGCTGGAG
CAATTACTATACTTTTAACAGATCGAAATTTTAATACCACTTTTTTTGACCCAAGAGGTGGTGGAGACC
Octopus burryi
- COX1
>MT111599.1_Amphioctopus_burryi
TAAGTTTAATAATTCGAACAGAACTAGGGCAACCAGGATCTCTATTAAATGATGATCAATTATATAATGT
AATTGTAACAGCCCATGCATTTGTAATAATTTTTTTCCTTGTAATACCCGTAATAATTGGAGGATTTGGA
AATTGATTAGTACCTTTAATATTAGGTGCACCAGATATAGCATTCCCCCGTATAAATAATATAAGATTCT
GATTATTACCCCCTTCACTAACCTTACTCCTATCCTCCGCTGCAGTAGAAAGAGGTGTAGGTACAGGATG
AACAGTATACCCTCCTTTATCAAGAAATTTAGCACATATAGGACCATCTGTTGACTTAGCAATTTTCTCC
CTACACTTAGCAGGAATTTCATCAATTTTAGGAGCGATTAACTTCATTACTACTATCATCAATATACGAT
GAGAAGGTATATTAATAGAACGGTTACCGCTATTTGTATGATCTGTATTTATTACAGCCGTTCTATTACT
CCTATCATTACCAGTATTAGCAGGCGCAATTACTATACTTTTAACTGACCGAAACTTCAATACTACATTC
TTTGATCCTAGAGGAGGTGGAGACCCTATTCTATATCA
- COI
>MG778074.1_Amphioctopus_burryi
CTTCATTAAGTTTAATAATTCGAACAGAACTAGGGCAACCAGGATCTCTATTAAATGATGATCAATTATA
TAATGTAATTGTAACAGCCCATGCATTTGTAATAATTTTTTTCCTTGTAATACCCGTAATAATTGGAGGA
TTTGGAAATTGATTAGTACCTTTAATATTAGGTGCACCAGATATAGCATTCCCCCGTATAAATAATATAA
GATTCTGATTATTACCCCCTTCACTAACCTTACTCCTATCCTCCGCTGCAGTAGAAAGAGGTGTAGGTAC
AGGATGAACAGTATACCCTCCTTTATCAAGAAATTTAGCACATATAGGACCATCTGTTGACTTAGCAATT
TTCTCCCTACACTTAGCAGGAATTTCATCAATTTTAGGAGCGATTAACTTCATTACTACTATCATCAATA
TACGATGAGAAGGTATATTAATAGAACGGTTACCGCTATTTGTATGATCTGTATTTATTACAGCCGTTCT
ATTACTCTTATCATTACCAGTATTAGCAGGCGCAATTACTATACTTTTAACTGACCGAAACTTCAATACT
ACATTCTTTGATCCTAGAGGAGGTGGAGACCCTATTCTCTATCAACATTTATTCTGATTTTTGGTCACC

Octopus hummelincki
- COX1
>MN933640.1_Octopus_hummelincki
CGAACAGAATTAGGACAACCAGGATCTCTTCTCAATGATGATCAATTATATAATGTAATTGTTACAGCAC
ATGCATTTGTAATAATTTTTTTTCTAGTTATACCTGTTATAATTGGAGGATTTGGCAATTGATTAGTCCC
CTTAATATTAGGAGCTCCAGATATAGCATTTCCACGAATAAATAATATAAGTTTTTGACTTTTACCACCT
TCTCTTACCCTATTACTATCTTCAGCTGCAGTAGAAAGAGGGGCAGGTACTGGATGAACTGTATATCCTC
CTCTTTCAAGAAACTTAGCTCATATAGGACCTTCCGTCGATCTAGCTATTTTTTCTCTTCACTTAGCTGG
TATTTCATCCATTCTTGGAGCCATTAATTTTATCACAACTATTATCAATATACGATGAGAAGGAATATTA
ATAGAACGACTCCCATTATTTGTGTGAGCAGTATTTATTACCGCAATTCTACTACTACTTTCCTTACCAG
TTCTTGCTGGAGCAATTACAATACTTCTAACAGACCGAAATTTTAATACCACTTTTTTCGATCCAAGAGG
AGGT
- COI
>MH662556.1_Octopus_hummelincki
ATCAGGACTTTTAGGCACCTCCTTAAGTTTAATAATTCGAACAGAATTAGGACAACCAGGATCTCTTCTC
AATGATGATCAATTATATAATGTAATCGTCACAGCACATGCATTTGTAATAATTTTCTTTCTAGTTATAC
CCGTTATAATTGGAGGATTTGGCAATTGATTAGTCCCCTTAATACTAGGAGCTCCAGATATAGCATTCCC
ACGAATAAATAATATAAGTTTTTGACTTTTACCACCTTCTCTTACCCTATTATTATCTTCAGCTGCAGTA
GAAAGAGGTGTAGGTACTGGATGAACTGTATATCCCCCTCTTTCAAGAAACTTAGCTCATATAGGTCCTT
CCGTAGATCTAGCTATTTTTTCTCTTCATTTAGCTGGTATTTCATCCATTCTTGGAGCCATTAATTTTAT
TACAACTATTATTAATATACGATGAGAAGGAATATTAATAGAACGACTTCCATTATTTGTATGAGCAGTA
TTTATTACCGCAATTTTACTACTTCTTTCCTTACCAGTCCTTGCTGGAGCAATTACAATACTTTTAACAG
ATCGAAATTTTAACACCACTTTTTTTGATCCAAGAGGGGG

OUTGROUP:
Pinctada imbricata
- COX1
>MN608250.1 Pinctada imbricata isolate MMB_2_MMB.2 cytochrome c oxidase subunit
1 (cox1) gene, partial cds; mitochondrial
GATGGGCAGCTGTATAATACGGTAGTAACGGCGCATGCTTTGGTTATAATTTTTTTTTTCGTAATGCCGG
TAATGATGGGGGGGTTTGGGAACTGGTTGTTGCCTCTGCTATTGGGAAGGCCTGATATACATTTTCCGCG
CTTGAATAATTTTAGGTTTTGGACTTTGCCTTGAGCTTTAGACTTGGCAGTGGTATCATTGTTTACGGAG
AGGGGTTCGGGGACAGGGTGGACTTTATATCCACCTTTGTCTACGTATTTGTATATGGGGAAGAGGGTAG
ACCTGACGATTTTCTCGCTGCATTTGGCTGGAGTCGGATCTATTTTTGGGTCTATCAATTTTATCGTGAC
GGTGCGGGGTATAAAGTTGGTTGATATGCATCAATTGTCAATGTTTCCCATCAGGATGTTTGTAACCGGT
CACTTGTTAGTGGTAGCGCTACCGGTGTTGGCTGGCGGGTTGACAATGTTGATTACGGATCGTCATTTTA
ATACAAGGTTTTTCTATCCGGTGGGGGGTGGGGATCCGGTTTTATTTCAGCACCTT
- COI
>AB076915.1 Pinctada imbricata mitochondrial COI gene for cytochrome c
oxidase subunit I, partial cds
TTGTTGCCTCTGCTATTGGGAAGGCCTGATATACATTTTCCGCGCTTGAATAATTTTAGGTTTTGGACTT
TGCCTTGAGCTTTAGACTTGGCAGTGGTATCATTGTTTACGGAGAGGGGTTCGGGGACAGGGTGGACTTT
ATATCCACCTTTGTCTACGTATTTGTATATGGGGAAGAGGGTAGACCTGACGATTTTCTCGCTGCATTTG
GCTGGAGTCGGATCTATTTTTGGGTCTATCAATTTTATCGTGACGGTGCGAGGTATAAAGTTGGTTGATA
TGCATCAATTGTCAATGTTTCCCATCAGGATGTTTGTAACCGGTCACTTGTTAGTGGTAGCGCTACCGGT
GTTGGCTGGCGGGTTGACAATGTTGATTACGGATCGTCATTTTAATACAAGGTTTTTCTATCCGGTGGGG
GGTGGGGATCCGGTTTTATTTCAGCACCTTTTTTGGTTTTTCGGGCATCCGGAGGTTTACGTTTTGATTC
TTCCGGGGTTTGGTTTAATCTCCCAGGTAGTTATGCAGACTGCAATAAAAAAGCAGGTTTTTGGTAGGAC
GGGTATGATGTATGCTATAATAGGGATTGGTTTCTTGGGCTTTATTGTTTGGGGCCACCACATGTTTACA
GTGGGGCTGGACGTTGATACGCGGGCTTATTTTAGGAGGGCGACTATAATTATTGCAGTTCCGACAGGGG
TAAAGGTGTTTAGGTGGTTAGCGAGGTTATCGGGGTCCCGGCTTCGAAAAACGGCTGCAATGTGGTTTAC
ACTAGGGTTTCTTTTCCTGTTTACCTTAGGGGGTTTGTCAGGGGTGATCTTGTCAAGGGCGTCTTTGGAT
ATTGTGTTGCATGATACTTACTTTGTAACTGGGCACTTTCACTACGTCTTGAGG

Crassostrea rhizophorae
- COX1
>MN817976.1 Crassostrea rhizophorae isolate MOP10 cytochrome c oxidase
subunit I (COX1) gene, partial cds; mitochondrial
TGGTCAACAAATCATAAAGATATTGGTAGATTTTACATAATTTTTGGGTTTTGAGCAGTTTTAGCTGGGA
CCAGTTTCAGGTCTCTTATTCGCTGAAGTCTTTATACTCCCGGCGCTAAGTTTTTAGAGCCTGTTGTTTA
TAACGCTGTGGTTACTAGTCATGCGTTAGTTATAATTTTCTTCTTCGTTATGCCAGTAATGATTGGAGGA
TTTGGGAATTGGCTCATTCCTCTTATGCTCGAAGTGGCAGATATGCAGTTTCCTCGGCTAAATGCCTTTA
GATTTTGAGTGCTACCGGGGTCGTTATTGCTCATGTTAATGTCTAACATATCTGAAAGAGGAGTGGGCTC
AGGATGGACTATTTACCCTCCTTTGTCGACTTTCTCTTATCACGGGGTTTGTATGGACTTTGCGATTTTA
AGGTTACATTTAGCAGGTATTAGGTCTATTTTCAGATCCATTAATTTCATAGTGACTATTAGGAATATGC
GATCTGTCGGGGGCCACATATTAGCACTGTTTCCCTGATCAATTAAAGTGACATCATTCTTACTGCTTAC
TACATTGCCTGTGCTAGCTGGCGGGCTTACTATGCTTCTAACCGATCGGCACTTCAACACATCTTTTTTT
GACCCTGTAGGCGGAGGTGACCCAGTG
- COI
>HM003493.1 Crassostrea rhizophorae haplotype H19 cytochrome oxidase subunit
I (COI) gene, partial cds; mitochondrial
AGGTCTCTTATTCGTTGAAGTCTTTATACTCCCGGCGCTAAGTTTTTAGAGCCTGTTGTTTATAACGCTG
TGGTTACTAGTCATGCGTTAGTTATAATTTTCTTCTTCGTTATGCCAGTAATGATTGGAGGATTTGGGAA
CTGACTCATTCCTCTTATGCTCCAAGTGGCAGATATGCAGTTTCCTCGGCTAAATGCCTTTAGATTTTGA
GTACTACCGGGGTCGTTATTACTCATGTTAATATCTAACATATCTGAAAGAGGAGTGGGCTCAGGATGGA
CTATTTACCCTCCTTTGTCGACTTTCTCTTATCACGGGGTTTGTATGGATTTTGCGATTTTAAGGCTACA
TTTAGCAGGTATTAGGTCTATTTTCAGATCCATTAATTTCATAGTGACTATTAGGAATATGCGATCTGTC
GGGGGCCACATATTAGCACTGTTTCCCTGATCAATTAAAGTGACATCATTCTTACTGCTTACTACATTGC
CTGTGCTAGCTGGCGGGCTTACTATGCTTCTAACCGATCGACACTTCA

Chiropsalmus quadrumanus
- COX1
>JN700970.1_Chiropsalmus_quadrumanus
TGGTGCTCCCGATATGGCGTTTCCCAGGTTAAATAACATCTCTTTCTGGTTACTACCCCCCTCTTTGTTT
CTTTTACTGGCTTCTTCTCTTGTTGAGCAAGGGGCTGGTACTGGGTGAACTGTATACCCTCCTCTATCTT
CAATTCAGTCTCATTCGGGAGGAGCTGTGGATTTAGCTATCTTTAGTTTACATCTAGCTGGCGCCTCTTC
TATCCTAGGAGCTATGAACTTTATTACGACTATTTTTAATATGAGAGCACCAGGAATAACGTTTGACAAG
ATGCCTCTATTTGTGTGGTCTGTATTAATAACGGCATTTTTACTTCTTTTATCTTTACCTGTTTTGGCAG
GAGCTATCACCATGCTTCTTACTGATAGAAATTTTAATACTACCTTTTTTGACCCTGCAGGAGGGGGGGA
CCCAATCCTCTTCCAACACCTTTTTTGGTTTTTCGGTCATCCAGAGGTTTACATACTAATTTTACCTGGG
TTTGGGATGGTCTCTCAAATAGTTCCTGCTTTTTCTGCTAAGAGACAGATATTTGGTTACTTGGGTATGG
TGTATGCTATGTTAGCAATCGGGTTTTTAGGTTTCATAGTATGGGCTCACCATATGTTTACCGTTGGGAT
GGATGTTGATACAAGAGCTTATTTTACTGCTGCTACCATGA
- COI
>MH612604.1_Chiropsalmus_quadrumanus
ATGGTGGGTACAGCTTTTTCCATGTTAATAAGGTTGGAGCTGTCTGCTCCCGGTTCCATGCTTGGAGACG
ACCAATTATATAACGTTATCGTTACGGCCCACGCCTTTGTGATGATATTCTTCCTTGTTATGCCCGTTAT
GATAGGGGGTTTTGGAAATTGGCTTGTTCCCCTCTATATAGGGGCCCCGGATATGGCCTTTCCCAGGTTA
AACAAAATCTCTTTCTGGTTATTACCCCCGGCCCTATTTCTTCTTCTAGCTTCTTCCCTAGTAGAACAGG
GGGCGGGAACGGGGTGAACGGTTTACCCCCCCCTTTCCTCCATACAGTTCCATTCGGGGGGGGCGGTGGA
TTTAGTGATCTTTAGTTTGCACTTAGCGGGGGCTTCTTCAATACTGGGGGCAATGAACTTTATTACCACC
ATCTTCAACATGAGGGCCCCGGGAATATCCTTGGATAAGATGCCCCTATTCGTTTGATCGGTCCTTGTTA
CGGCTTTTTTGCTGCTTCTTTCTTTACCCGTGCTAGCGGGGGCAATTACCATGTTGCTAACCGATAGGAA
CTTCAATACAACCTTCTTCGATCCGGCGGGGGGGGGGGATCCAATCCTGTTTCAGCACCTCTTCTGGTTC
TTTGGCCACCCGGAGGTTTATATCCTTATCCTTCCCGGTTTCGGGATGGTGTCCCAGATCGTGCCTGCTT
TCTCCTCCAA

2. Hacer la curaduría de las secuencias mediante Geneneous

CURADURÍA COI
Figura 1. Resultados de la curaduría realizada en geneus para el marcador COI.

CURADURÍA COX1

Figura 2. Resultados de la curaduría realizada en genaeus para el marcador COX1

3. Realizar el alineamiento de la secuencias mediante MAFFT

ALINEAMIENTO COI 1

>MG778069.1_Octopus_briareus
-----------------------------------------ATGATCAACTATATAATGT
-ATCGTCACAGCTCATGCATTCGTAATAATTTTCTTCCTTGTTATACCAGTCATAATTGG
AGGATTTGGAAATTGATTAGTACCATTAATATTAGGTGCCCCTG-TATAGCATTCCCTCG
AATAAATAA-TATAAGCTTTTGCTTCTCCCCCCATCATT-ACTCTCTTATTATCTTCTGC
TGCAGTAGAAAGTGGTGTTGGAACTGGATGAACCGTTTACCCCCCTCTTTCAAGAAATTT
AGCTCATATAGGACCATCTGTCGATTTAGCTATTTTTTCACTTCATCTAGCAGGTATTTC
TTCAATTCTTGGAGCTA-TAACTTTATCACAACTATTATTAATATACGA----GAGAAG
GAATACTTAAGAACGACTTCCACTATTTGTA-GATCTGTCTTCATTACTGCTATTCTACT
TCTACTTTCATTACCAGTTCTTGCTGGAGCAATTACTATAC-TCCAACCGATCGA-AA-T
TAATACCACATTTTT
>MW125083.1_Macrotritopus_defilippi
----------GAATTAGGACAACCAGGATCTCTCTTAAATGATGACCAATTATATAATGT
AATTGTAACAGCTCATGCATTCGTAATAATTTTTTTTCTAGTTATACCTGTAATAATTGG
AGGATTTGGAAATTG--TTATGCCTTTGATATTAGGAGCTCCTG-TATAGCTTTCCCTCG
AATAAATA- -CAGATTTTGATTACTTCCCCCCTCATT-ACACTACTTTTATCTTCAGC
TGCAGT-GAAAGAGGTGTAGGAACCGGA-GAACTGTATATCCTCCACTCTCAAGAAA-TC
AGCTCACATGGGACCCTCAGTCGATCTTGCTATTTTTTCTCTTCATTTAGCTGGTATTTC
GTCAATTCTTGGAGCCA-TAATTTTATTACTACTATTAT-AATATACGA-- - -GAGAAG
GAATATAATAGAACGTCTCCCCTTATTCGTC-GATCTGTTTTTATTACAGCAATTCTACT
ACTCTTATCACTCCCAGTTTTAGCAGGTGCGATTACTATATTATTAACAGATCGA-AACT
TAACACTACATTTTTTGATCCAAGAGGTGGAGGAGATCCAATCTTATATCAACATTTATT
T

>AY377732.1_Octopus_joubini
------------AATAGGCCAACCAGGATCTTTATTAAATG-TGATCAATTATATAATGT
AATTGTAACCGCTCATGCTTTTGTTATAATTTTTTTTTTGGTTATACCAATTATAATTGG
AGGATTTGGAAACTG--CTATCCCCTTAATATTAGGAGCACCAGATATAGCTTTTCCTCG
AATAAACAATATAAGATTTTGATTATTACCTCCCTCTTTAACATTACTACTTACTTCAGC
TGCTGT-GAAAGAGGTGTAGGAACTGGA-GAACTGTATACCCTCCTCTTTCTAGAAA-CT
AGCTCATATAGGCCCTTCAGTAGATCTTGCTATTTTTTCTCTTCACTTAGCTGGAATCTC
TTCTATTTTAGGAGCTA-TAATTTTATCACCACCATTAT-AATATACGC-- - -GAGAAG
GAATATAATAGAACGACTTCCTTTATTTGTT-GATCAGTTTTTATTACAGCTGTATTATT
ACTATTATCCCTTCCTGTTCTAGCTGGAGCTATTACTATACTTCTTACCGATCGA-ATTT
TAATACTACTTTTTTTGATCCAAGAGGAGGAGGAGATCCAATTTTATATCAACATTTATT
T

>MK187267.1_Octopus_insularis

---------------------------TATTTTTTTTCTAGTTATACCTGTTATAATTGG
AGGATTTGGTA-TTG--TTATTCCTTTAATACTAGGAGCCCCAGATATAGCATTCCCACG
AATAAATA--CATAAGTTTTTGCTTTTACCACCTTCTCTTACCCTATTATTATCTTCAGC
CGCAGT---GG- - -TGCAGGTACCGGATGAACTGTATACCCTCCTCTTTCAAGAAATTT
AGCCCATATAGGTCCTTCCGT-GATCTAGCTATTTTCTCCCTTCATTTAGCTGGTATTTC
ATCCATTCTTGGAGCCATTAATTTTATTACAACTATTATCAATATACGA----GAGAAG
GAATATAA-AGAACGACTCCCATTATTTGTA-GAGCAGTATTTATTACTGCAATTTTATT
ACTACTCTCCTTACCAGTCCTCGCTGGAGCAATTACTATAC-TTTAACAGATCGA-AATT
TAATACCACTTTTTTTGACCCAAGAGGTGGTGGAGACC----------------------
>MH662556.1_Octopus_hummelincki
-------------------------------------AATGATGATCAATTATATAATGT
AATCGTCACAGCACATGCATTTGTAATAATTTTCTTTCTAGTTATACCCGTTATAATTGG
AGGATTTGGCAATTG--TTATCCCCTTAATACTAGGAGCTCCAGATATAGCATTCCCACG
AATAAATA--TATAAGTTTTTGCTTTTACCACCTTCTCTTACCCTATTATTATCTTCAGC
TGCAGT---GG---GTGT--GTACTGGA-GAACTGTATATCCCCCTCTTTCAAGAAA-CT
AGCTCATATAGGTCCTTCCGTAGATCTAGCTATTTTTTCTCTTCATTTAGCTGGTATTTC
ATCCATTCTTGGAGCCA-TAATTTTATTACAACTATTATTAATATACGA--- -GAGAAG
GAATATAATAGAACGACTTCCATTATTTGTATGAGCAGTATTTATTACCGCAATTTTACT
ACTTCTTTCCTTACCAGTCCTTGCTGGAGCAATTACAATACTTTTAACAGATCGA-AATT
TAACACCACTTTTTTTGATCCAAGAGGGGG------------------------------

>MN443917.1_Tremoctopus_violaceus
TATCCGAACAGAATTAGGACAACCAGGATCACTATTAAATG-CGATCAACTGTACAATGT
CATTGTAACAGCTCATGCATTTGTCATAATTTTTTTTTTAGTAATACCTGTAATAATTGG
AGGATTTGGAAATTG--TTATTCCATTAATACTAGGAGCCCCAGACATAGCCTTCCCACG
AATAAATA--CATAAGATTTTGTTACTCCCTCCATCCCT-ACACTCCTCTTAACCTCAGC
AGCAGTAGAAAGAGGAGTAGGAACAGGATGAACTGTATACCCCCCCTTATCAGC-AATTT
AGCTCATATAGGACCTTCCGTAGACTTAGCTATTTTCTCTCTTCACTTAGCAGGTATTTC
CTCAATCCTAGGAGCAATCAATTTTATCACTACAATCATCAACATACGA-----GAGAAG
GAATACAAAAGAACGACTTCCCCTATTTGTATGATCTGTGTTAATTACAGCTGTCTTATT
ACTTCTCTCCCTTCCAGTTTTAGCTGGAGCAATTACTATACTTCTAACGATCGAA-ATTT
TAATACAACTTTTTTTGACCCTAGGGGAGGTGGGGACCCAATCCTTTACCAGCACTTATT
C GATTTTT

>MG778074.1_Amphioctopus_burryi
TATGT
AATTGTAACAGCCCATGCATTTGTAATAATTTTTTTCCTTGTAATACCCGTAATAATTGG
AGGATTTGGAAATTG--TTATACCTTTAATATTAGGTGCACCAGATATAGCATTCCCCCG
TATAAATA--TATAAGATTCTGTTATTACCCCCTTCACT-ACCTTACTCCTATCCTCCGC
TGCAGTAGAAAGAGGTGTAGGTACAGGATGAACAGTATACCCTCCTTTATCAAGAAATTT
AGCACATATAGGACCATCTGT-GACTTAGCAATTTTCTCCCTACACTTAGCAGGAATTTC
ATCAATTTTAGGAGCGATTAACTTCATTACTACTATCATCAATATACGA-----GAGAAG
GTATATAATAGAACGGTTACCGCTATTTGTATGATCTGTATTTATTACAGCCGTTCTATT
ACTCTTATCATTACCAGTATTAGCAGGCGCAATTACTATACTTTTAACGACCGAA-ACTT
CAATACTACATTCTTTGATCCTAGAGGAGGTGGAGACCCTATTCTCTATCAACATTTATT
C GATTTTTGGTCACC

>GU806433.1_Pareledone_cornuta
-----------AACT--GTCAACCAGGATCTTTATTAAATGATGATCAATTATATAATGT
AATTGTTACTGCTCATGCATTTGTAATAATTTTTTTTTTAGTTATACCTGTAATAATTGG
AGGATTTGGTAATTG--TTATACCATTAATATTAGGAGCACCAGATATAGCATTCCCCCG
AATAAATA--TATAAGTTTTTGTTACTTCCTCCTTCTTT-ACTCTTCTTCTTACATCAGC
TGCAGT-GAAAGTGGAGCAGGAACAGGA-GAACTGTCTACCCTCCATTATCTAG-AAACT
AGCACATATAGGTCCTTCAGT-GATTTAGCTATTTTTTCACTACATTTAGCAGGAGTATC
CTCCATTTTAGGAGCCATTAATTTTATTACTACTATTATTAATATACGT----GAGAAG
GAATACAAAAGAACGTTTACCTTTATTTGTCTGATCAGTATTTATTACTGCAATTCTTTT
ACTTTTATCACTTCCAGTTTTAGCAGGAGCTATTACAATACTTTTAACAGACCGA-ATTT
TAATACAACCTTTTTTGATCCTAGTGGAGGAGGAGATCCTATTCTTTATCAACACTTATT
C

>MW560654.1_Octopus_vulgaris
---TCGAACAGAATTAGGACAACCAGGATCTCTCCTCAATG-TGATCAATTATATAATGT
AATTGTAACAGCCCATGCATTTGTAATAATTTTTTTTTTAGTAATACCTGTTATAATTGG
AGGATTGGAAATTGA--CTATCCCATTAATATTAGGAGCCCCTG-TATAGCATTCCCACG
AATAAATAA-TATAAGATTTTGTTATTACCCCCTTCTCT-ACATTGCTATTATCTTCAGC
CGCAGTCGAAAGAGGTGTTGGAACTGGATGAACTGTATATCCTCCCCTTTCAAGAAATTT
AGCCCATATAGGACCATCTGT-GACCTAGCTATTTTTTCTCTTCATTTAGCAGGAATTTC
GTCAATTCTAGGAGCTATTAATTTTATTACTACCATTATTAATATACGA----GAGAAG
GTATACAA-AGAACGACTTCCTCTATTTGTA-GATCTGT-ATAATTACTGCAGTTCTCTT
ACTACTATCCCTCCCAGTTCTTGCAGGCGCAATTACTATATTATTAACCGACCG------

>MH612604.1_Chiropsalmus_quadrumanus
ACCAATTATATAACGT
TATCGTTACGGCCCACGCCTTTG-GATGATATTCTTCCTTGTTATGCCCGTTATG---TG
GGGTTTTGGAAATTGGCTTGTTCCCCT---CTATATACCCCGGATATGGCCTTTCCCAG
GTTAAACAAAATCTCTTTCTGGTTATTACCCCCGGCCCTATTTCTTCTTCTAGCTTCTTC
CCTAGTAGAACAGGGGGCGGGAACGGGG-GAACGGTTTACCCCCCCCTTTCCTCCATACA
GTTCCATTCGGGGGGGGCGGT-GGATTAGTGATCTT-AGTTTGCACTTAGCGGGGGCTTC
TTCAATACTGGGGGCAA-GAACTTTATTACCACCATCTTCAACAGAGGG- - - -CCCCGG
GAATATCCTTGGAAAGATGCCCCTATTCGTT-GATCGGTCCTTGTTACGGCTTTTTTGCT
GCTTCTTTCTTTACCCGTGC-AGCGGGGGCAATTACCATGTTGCTAACCGAAGGA-ACTT
CAATACAACCTTCTTCGATCCGGCGGGGGGGGGGGATCCAATCCTGTTTCAGCACCTCTT
CTGGTTCTTTGGCCACCCGGAGGTTTATATCCTTATCCTTCCCGGTTTCGGGATGGTGTC
CCAGAT
CGTGCCTGC

TTTCTCCTCCAA

>HM003493.1_Crassostrea_rhizophorae

--TGGTTACTAGTCATGCGTT-GTTATAATTTTCTTCTTCGTTATGCCAGTAATGATTGG
AGGATTTGGGAACTGACTCATTCCTCTTATGCTCCAAGTGGCAGATATGCAGTTTCCTCG
GCTAAATG--CCTTTATTTTGAGTACTACCGGGGTCGTTATTACTCATGTTATATCTA--
CATATCTGAAAGAGGAGTGGGCTCAGGATGGACTATTTACCCTCCTTTGTCGAC---TTT
CTCTTATCACGGGGTTTGTATGGATTTTGCGATTTTAAGGCTACATTTAGCAGGTATTAG
GTCTATTTTCAGATCCATTAATTTCATAGTGACTATTAGGAATATGCGATCTGTCGGGGG
CCACATATTAGCACTGTTTCCC---------GATCAAT-TAAAGGACATCATTCTTACT
GCTTACTACATTGCCTGTGCTAGCTGGCGGGCTTACTATGCTTCTAACCGATCGA-CACT
TCA

>AB076915.1_Pinctada_imbricata

---------------------TGCCTTGAGCTTAGACTTGGCAGTGGTATCATTGTTTAC
G
-------GAGAGGGGTTCGGGGACAGGGTGGACTTTATATCCACCTTTGTCTACGTATTT
G---TATATGGGGAAGAGGGTAGACCTGACGATTTTCTCGCTGCATTTGGCTGGAGTCGG
ATCTATTTTTGGGTCTATCAATTTTATCGTGACGGTGCGAGGTATAAAGTT---GGTTGT
ATGCATCAATTGTCAATGTTTCCCATCAG---GATG- - -TTTGTAACCGGTCACTTGTT
AGTGGTAGCGCTACCGGTGTTGGCTGGCGGGTTGACAATGTTGATTACGGATCGTCATTT
TAATACAAGGTTTTTCTATCCGGTGGGGGGTGGGGATCCGGTTTTATTTCAGCACCTTTT
TTGGTTTTTCGGGCATCCGGAGGTTTACGTTTTGATTCTTCCGGGGTTTGGTTTAATCTC
CCAGGTAGTTATGCAGACTGCAATAAAAAAGCAGGTTTTTGGTAGGACGGGTATGATGTA
TGCTATAATAGGGATTGGTTTCTTGGGCTTTATTGTTTGGGGCCACCACATGTTTACAGT
GGGGCTGGACGTTGATACGCGGGCTTATTTTAGGAGGGCGACTATAATTATTGCAGTTCC
GACAGGGGTAAAGGTGTTTAGGTGGTTAGCGAGGTTATCGGGGTCCCGGCTTCGAAAAAC
GGCTGCAATGTGGTTTACACTAGGGTTTCTTTTCCTGTTTACCTTAGGGGGTTTGTCAGG
GGTGATCTTGTCAAGGGCGTCTTTGGATATTGTGTTGCATGATACTTACTTTGTAACTGG
GCACTTTCACTACGTCTTGAGG

ALINEAMIENTO COX1
>MN933636.1_Octopus_briareus

----------------------------ATGCATTCG-AATAATTTTCTTCCTTGTTATA
CCAGTCATAATTGGAGGATTTGGAAATTGATTAGTACCATTAATATTAGGTGCCCC-GAT
ATAGCATTCCCTCGAATAAATAATATAAGCTTTGACTTCTCCCCCCATC-ATAACTCTCT
TATTATCTTCTGCTGCAGTAGAAAGTGGTGTTGGAACTGGATGAACCGTTTACCCCCCTC
TTTCAAGAAATTTAGCTCATATAGGACCATCTGTCGATTTAGCTATTTTTTCACTTCATC
TAGCAGGTATTTCTTCAATTCTTGGAGCTA-TAACTTTATCACAACTATTATTAATATAC
GA- - - -GAGAAGGAATATTTAAGAACGACTTCCACTATTTGTATGATCCGTCTTCATTA
CTGCTATTCTACTTCTCCTTTCATTACCAGTTCTTGCTGGAGCAATTACTATACTCCTAA
CCGATCGA-AATTTAATACCACATTTTTTGATCCTAGAGGAGGA----------------

>MN933644.1_Octopus_insularis

----------------------------ATGCATTTG-AATAATTTTTTTTCTAGTTATA
CCTGTTATAATTGGAGGATTTGGAAT---GATAGTTCCTTTAATACTAGGAGCCCCAGAT
ATAGCATTCCCACGGATAAA-AACATAAGTTTTGACTTTTACCTCCTTCTCTTACCCTAT
TATTATCTTCAGCCGCAG-AGAAAGAGGTGCAGGTACCGGATGAACTGTATATCCTCCTC
TTTCAAGAAATTTAGCCCATATAGGTCCTTCCGT-GATCTAGCTATTTTCTCCCTTCATT
TAGCTGGTATTTCATCCATTCTTGGAGCCATTAATTTTATTACAACTATTATCAATATAC
GA- - - -GAGAAGGAATATAATAGAACGACTCCCATTATTTGTATGAGCAGTATTTATTA
CTGCAATTTTATTACTACTCTCCTTACCAGTCCTCGCTGGAGCAATTACTATACTTTTAA
CAGATCGA-AATTTAATACCACTTTTTTTGACCCAAGAGGTGGT----------------
>MN933640.1_Octopus_hummelincki

----------------------------ATGCATTTG-AATAATTTTTTTTCTAGTTATA
CCTGTTATAATTGGAGGATTTGGCAATTGATTAGTCCCCTTAATATTAGGAGCTCCAGAT
ATAGCATTTCCACGAATAAA-AATATAAGTTTTGACTTTTACCACCTTCTCTTACCCTAT
TACTATCTTCAGCTGCAG-AGAAAGAGGGGCAGGTACTGGATGAACTGTATATCCTCCTC
TTTCAAGAAACTTAGCTCATATAGGACCTTCCGTCGATCTAGCTATTTTTTCTCTTCACT
TAGCTGGTATTTCATCCATTCTTGGAGCCA-TAATTTTATCACAACTATTATCAATATAC
GA- - - -GAGAAGGAATATAATAGAACGACTCCCATTATTTGTGTGAGCAGTATTTATTA
CCGCAATTCTACTACTACTTTCCTTACCAGTTCTTGCTGGAGCAATTACAATACTTCTAA
CAGACCGA-AATTTAATACCACTTTTTTCGATCCAAGAGGAGGT----------------

>MT111602.1_Macrotritopus_defilippi

-----------------TGTAACAGCTCATGCATTCGTAATAATTTTTTTTCTAGTTATA
CCTGTAATAATTGGAGGGTTTGGAAATTGATTAGTGCCTTTGATATTAGGAGCTCC-GAT
ATAGCTTTCCCTCGAATAAATAACATAAGATTTGATTACTTCCCCCCTC-ATAACACTAC
TTTTATCTTCAGCTGTAG-TGAAAGAGGTGTAGGAACCGGA-GAACTGTATATCCTCCAC
TCTCAAGAAA-TCAGCTCACATGGGACCCTCAGTCGATCTTGCTATTTTTTCTCTTCATT
TAGCTGGTATTTCGTCAATTCTTGGAGCCA-TAATTTTATTACTACTATTATTAATATAC
GA- - - -GAGAAGGAATACAA-AGAACGTCTCCCCTTATTCGT-CGATCTGTTTTTATTA
CAGCAATTCTACTACTCCTATCACTCCCAGTT-TAGCAGGTGCGATTACTATATTATTAA
CAGATCGA-AACTTAACACTACATTTT---------------------------------

>GQ900748.1_Wunderpus_photogenicus
AATGATGATCAACTATA
--------TAATGTTATCGTGACAGCTCATGCTTTTGTAATAATTTTTTTTTTAGTTATA
CCCGTTATAATTGGAGGATTTGGTAAT--GACAGTACCTTTAATATTAGGAGCTCCCGAT
ATAGCATTCCCTCGAATAAA-AATATAAGATTTGATTACTTCCACCATC-ATAACATTAC
TCCTCTCCTCAGCCGCAG-TGAAAGGGGAGTGGGAACTGGA-GAACTGTCTATCCTCCAC
TCTCAAGAAA-TTAGCTCACATAGGACCCTCAGTAGACCTTGCTATTTTTTCCCTTCATC
TAGCAGGAATTTCATCAATTCTTGGAGCCA-TAATTTTATTACTACTATTATTAATATAC
GA- - - -GAGAAGGAATGTAATAGAACGATTACCACTATTTGTGTGATCTGTATTTATTA
CAGCAATTTTATTACTTTTATCACTCCCAGTTTTAGCTGGTGCAATTACCATACTATTAA
CCGACCGA-AATTTAATACCACATTTTTTGACCCTAGAGGGGGA----------------

>MZ958974.1_Octopus_joubini
ATTCGTACAGA-ATTAGGTCAACCAGGATCTTTAC-TAAACGATGATCAATTATA-----
--------TAATGTAATTGTAACTGCTCATGCTTTTGTTATAATTTTTTTTTTAGTTATA
CCAGTTATAATTGGAGGATTTGGTAAT--GATAGTTCCTTTAATATTAGGAGCTCCAGAT
ATAGCTTTCCCCCGTATAAA-AATATAAGATTTGATTATTACCTCCTTC-ATAACACTAC
TTCTTACTTCAGCTGCTG-TGAAAGAGGTGCTGGAACTGGA-GAACTGTATACCCCCCAC
TGTCTAGAAA-TTAGCTCATATAGGTCCATCAGT-GATCTTGCTATTTTCTCTCTTCATT
TAGCTGGTATTTCATCCATCCTAGGAGCTATTAATTTTATTACTACTATTATTAATATAC
GA- - - -GAGAAGGAATATAATAGAACGTCTTCCTTTATTTGTATGATCTGTTCTTATTA
CCGCAGTTTTATTACTTCTATCCCTACCTGTTCTCGCTGGAGCTATTACTATACTCCTTA
CGACCGTA-ATTTCAATACTACTTTTTTTGACCCTAGAGGGGGAG--GAACCAATTCTA-
ACCAACACCTTTTTGATTTTT---------------------------------------
>MT919752.1_Octopus_vulgaris
ATGATCAATTATA
--------TAATG-AATTGTTACAGCTCACGCATTTGTTATAATTTTTTTTCTTGTTATA
CCAGTTATAATTGGAGGATTTGGAAACTGATTAGTTCCTTTAATACTAGGAGCACCAGAT
ATAGCATTCCCACGAATAAA-AACATAAGCTTCGACTCTTACCTCCTTCTCTCACTCTTC
TCCTTTCATCTGCAGCTGTTGAAAGTGGTGCAGGTACCGGATGAACCGTTTACCCACCTC
TTTCAAGAAA-TTAGCTCATATAGGACCCTCTGT-GATCTAGCAATTTTCTCACTTCACT
TAGCAGGTATTTCATCAATTCTTGGAGCCATCAATTTTATTACAACTATTATTAATATAC
GA- - - -GAGAAGGTATATAATAGAACGACTTCCACTATTTGTGTGATCTGTTTTTATTA
CCGCACTTTTAC

>MW351787.1_Tremoctopus_violaceus
ACTCTA
--------CAATGTCATTGTAACAGCCCATGCATTTGTCATAATTTTTTTTTTAGTAATA
CCTGTAATAATTGGAGGATTTGGAAATTGACTAATTCCCTTAATACTAGGAGCTCCAGAT
ATAGCTTTCCCACGAATAAA-AACATGAGATTTGATTACTTCCCCCATC-CCAACACTCC
TCTTAACCTCAGCAGCAGTAGAAAGTGGGGTTGGTACAGGATGAACTGTATATCCTCCCT
TATCAGTAAT-TTAGCTCATATAGGACCTTCCGTGGATTTAGCTATTTTCTCCCTTCACT
TAGCAGGAATTTCCTCAATTCTAGGAGCAATCAATTTTATTACTACAATTATTAATATGC
GA- - - -GAGAAGGTATGCAAAAGAACGACTTCCTCTATTTGTATGATCTGTGTTAATTA
CAGCTGTTCTATTACTCCTTTCTCTTCCAGTTTTAGCCGGAGCAATTACTATACTTTTAA
CCGACCGA-AACTTAATACAACTTTCTTTGATCCCAGAGGAGGTGGTGACCCAATCCTTT
ACCAACACCTATTCGATTCTTTGGC-----------------------------------

>MT111599.1_Amphioctopus_burryi

--------------AATTGTAACAGCCCATGCATTTGTAATAATTTTTTTCCTTGTAATA
CCCGTAATAATTGGAGGATTTGGAAATTGATTAGTACCTTTAATATTAGGTGCACCAGAT
ATAGCATTCCCCCGTATAAA-AATATAAGATTCGATTATTACCCCCTTC-ACAACCTTAC
TCCTATCCTCCGCTGCAGTAGAAAGAGGTGTAGGTACAGGATGAACAGTATACCCTCCTT
TATCAAGAAATTTAGCACATATAGGACCATCTGT-GACTTAGCAATTTTCTCCCTACACT
TAGCAGGAATTTCATCAATTTTAGGAGCGATTAACTTCATTACTACTATCATCAATATAC
GA- - - -GAGAAGGTATATAATAGAACGGTTACCGCTATTTGTATGATCTGTATTTATTA
CAGCCGTTCTATTACTCCTATCATTACCAGTATTAGCAGGCGCAATTACTATACTTTTAA
CGACCGAA-ACTTCAATACTACATTCTTTGATCCTAGAGGAGGTGGAGACCCTATTCTAT
ATCA

>MN817976.1_Crassostrea_rhizophorae
CCAGTTTCAGGTCTCTTATTCGCTGAAGTCTTTATACTCCCGGCGCTAAGTTTTAGAGCC
TGTTGTTTAAACGCTGTGGTTACTAGTCATGCGTTAGTTATAATTTTCTTCTTCGTTATG
CCAGTAATGATTGGAGGATTTGGGAATTGGCTCATTCCTCTTATGCTCGAAGTGGCAGAT
ATGCAGTTTCCTCGGCTAAATGCCTTTAGATTTGAGTGCTACCGGGGTC-GTTATTGCTC
ATGTAATGTCAACATATC-TGAAAGAGGAGTGGGCTCAGGATGGACTATTTACCCTCCTT
TGTCGACT---TTCTCTTATCACGGGGTTTGTATGGACTTTGCGATTTTAAGGTTACATT
TAGCAGGTATTAGGTCTATTTTCAGATCCATTAATTTCATAGTGACTATTAGGAATATGC
GATCTGTCGGGGGCCACATATTAGCACTGTTTCC---------CGATCAAT-TAAAGGA
CATCATTCTTACTGCTTACTACATTGCCTGTGCTAGCTGGCGGGCTTACTATGCTTCTAA
CCGATCGGCACTTCAACAC-ATCTTTTTTGACCCTGTAGGCGGAGGTGACCCAGTG----
>MN608250.1_Pinctada_imbricata

-----AATGATGGGGGGGTTTGGGAACTGGTTGTTGCCTCTGCTATTGGGAAGGCC-GAT
ATACATTTTCCGCGCTTGAATAATTTTAGGTTTTGGACTTTGCCTGAGC-TTAGACTTGG
CAGTGGTATCATTGTTTACGGAGAGGGGTTCGGGGACAGGGTGGACTTTATATCCACCTT
TGTCTACG---TATTTGTATATGGGGAAGAGGGTAGACCTGACGATTTTCTCGCTGCATT
TGGCTGGAGTCGGATCTATTTTTGGGTCTATCAATTTTATCGTGACGGTGCGGGGTATAA
AG-----TTGGTGATATGCATCA----ATTGTCAATGTTTCCCATCAGGATGTTTGTAA
CCGGTCACTTGTTAGTGGTAGCGCTACCGGTGTTGGCTGGCGGGTTGACAATGTTGATTA
CGGATCGTCATTTTAATACAAGGTTTTTCTATCCGGTGGGGGGTGGGGATCCGGTTTTAT
TTCAGCACCTT

>JN700970.1_Chiropsalmus_quadrumanus

CTTTTAC
---TGGCTTCTTCTCTTGTTGAGCAAGGGGCTGGTACTGGG-GAACTGTATACCCTCCTC
TATCTTCAATTCAGTCTCATTCGGGAGGAGCTGT-GGATTAGCTATCTT-AGTTTACATC
TAGCTGGCGCCTCTTCTATCCTAGGAGCTATGAACTTTATTACGACTATTTTTAATATGA
GA-GCACCAGGAATAACGTTTGACAA--GATGCCTCTATTTGTGTGGTCTGTATTAATAA
CGGCATTTTTACTTCTTTTATCTTTACCTGTTTTGGCAGGAGCTATCACCATGCTTCTTA
CTGATAGAAATTTTAATACTACCTTTTTTGACCCTGCAGGAGGGGGGGACCCAATCCTCT
TCCAACACCTTTTTTGGTTTTTCGGTCATCCAGAGGTTTACATACTAATTTTACCTGGGT
TTGGGATGGTCTCTCAAATAGTTCCTGCTTTTTCTGCTAAGAGACAGATATTTGGTTACT
TGGGTATGGTGTATGCTATGTTAGCAATCGGGTTTTTAGGTTTCATAGTATGGGCTCACC
ATATGTTTACCGTTGGGATGGATGTTGATACAAGAGCTTATTTTACTGCTGCTACCATGA

4. Concatenar las matrices alineadas en Genenous

Figura 3. Resultado de concatenado de las matrices de COI y COX1 mediante geneaus


5. TNT y soporte de boostrap

Figura 4. consenso de los árboles arrojados en TNT.

Figura 5. Bootstrap en TNT como soporte de rama.


6. Buscar el modelo de sustitución nucleotídica o evolutivo para sus marcadores.

Figura 6. Resultado de la búsqueda del modelo de sustitución nucleotídica para COX1 y COI

7. Realizar un análisis de Máxima Verosimilitud mediante Iqtree haciendo un Utrabootstrap


y SH-aLRT como soporte de rama con 10.000 repeticiones cada análisis.

COX1

Figura 7. Resultado del análisis de verosimilitud realizada en Iqtree para el COX1


COI

Figura 8. Resultado del análisis de verosimilitud realizada en Iqtree para el COI


Figura 9. Resultado en Iqtree
Figura 10. Resultados arrojados en Iqtree

8. Inferir un análisis de Inferencia Bayesiana por Mr.Bayes


Figura 11. Probabilidad Posterior, soporte del análisis bayesiano

9. Analizar y discutir los resultados obtenidos en cada análisis filogenético y compararlos

En los árboles filogenéticos (Figura 7 y 8 ) se observó que, como era de esperarse, ambos
marcadores genéticos eran capaces de diferenciar con gran confiabilidad las nueve especies de
pulpos y los tres outgroups; El árbol correspondiente a la secuencia COI respecto a los
outgrouops reconoce a Crassostrea rizophorade como especie hermana de Pinctada imbricata,
presentó 1 clado principal que incluye a las nueve especies de pulpos. El árbol correspondiente a
la secuencia COX1 también tiene estas mismas características se diferencia de COI porque las
relaciones filogenéticas entre las especies de pulpos.

Aunque las distancias según el modelo de Nucleótidos GTR con el COX1 fueron mayores a las
del gen mitocondrial COI.

El alineamiento de secuencias evidenció que el gen COI presentaba 657 sitios variables de los
cuáles 222 eran parsimoniosamente informativos mientras que el alineamiento de la secuencia
del gen COX1 presentaba 479 sitios variables de los cuáles 205 eran parsimoniosamente
informativos

En el análisis de máxima parsimonia mediante TNT fue necesario alinear las secuencias
mediante MAFFT para posteriormente realizar el concatenado en geneaus, es decir, la reunión
de los marcadores mitocondriales utilizados para el estudio (COX1 y COI); para lograr realizar
el análisis en TNT cabe resaltar que el resultado del concatenado debe ir en formato «.tnt*» para
correr el programa, ya que evidenciamos que el formato «.fasta» no lo detecta el programa, para
ello se introdujeron los datos en mezquite de tal manera que se generara una matriz que
permitiera exportar en el formato requerido. En TNT se realiza un análisis de máxima
parsimonia en la que se incluye un determinado número de taxones arrojando como resultado las
diversas relaciones filogenéticas posibles (árboles) teniendo en cuenta la información que se le
ha proporcionado, para lo cual se realiza un consenso (opción disponible en el programa) que
permite visualizar el árbol como resultado, posteriormente a esto se realiza un boostrap para ver
los valores de soporte usando las frecuencias absolutas, y así observamos en la figura 5 que
varios de los grupos no tienen soporte, por lo que el bootstrap es para establecer métodos de
confianza en el estimado de una filogenia (Felsenstein, 1985).

Para lograr realizar la inferencia del análisis por Mr.Bayes, es necesario ejecutar los taxones a
formato Nexus. Luego se implementó el modelo con el siguiente comando lset nst=6
rates=gamma, después el comando mcmc ngen=10000 samplefreq=100 define el número de
repeticiones, lo que indica que de cada 100 repeticiones se hace una matrix. El siguiente
comando sump burnin=1000 se encarga de hacer la suma del 10% de todas las muestras,
posteriormente se emplea el comando sumt burnin=1000 para finalmente generar el archivo con
extensión [.TRE] el cual nos proporciona el software Mr.Bayes, para más adelante someterlo en
el software FigTree V 1.4.4 el cual nos proporcionará el árbol filogenético de las diferentes
especies, para a generar una estimación de probabilidad genética, cabe resaltar la importancia del
uso del análisis bayesiano, debido a que la estadística bayesiana se basa en la probabilidad,
necesitando de la hipótesis planteada en la investigación acerca de la «eficiencia de los
marcadores moleculares en especies de pulpos del Mar Caribe Colombiano» (Rendón et al,
2018).

De lo que se puede deducir según la tabla observada en la investigación de Ramos (2020).

Figura 12. Valores de interpretación cuantificable del factor Bayes. Tomada de:
http://scielo.sld.cu/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0864-03002020000400026

El resultado nos muestra un rango de 0,3-0,9 lo que indica un diagnóstico de hipótesis nula con
una clasificación de débil en los marcadores de la especie Pinctada imbricata. Sin embargo, la
gran mayoría de los valores tienen un rango de 1,1- 3 también arroja una clasificación débil pero
con un diagnóstico de hipótesis alternativa.
10. Concluir

Se concluye que nuestra investigación tiene muy pocos datos respecto a los marcadores
mitocondriales, debido a que son limitados los aquellos que sirven para los pulpos, lo que no
permite su buen desarrollo en la metodología utilizada, ya que en los resultados obtenidos nos
muestra que más del 50% de las secuencias contienen gaps demostrando que las secuencias
usadas son de muy baja calidad, lo que demuestra la poco eficiencia para análisis filogenéticos.

Como resultado de lo anterior no se evidencio efectivamente las relaciones entre especies, puesto
que el árbol mostró una gran politomía que quedaría por resolver hallando y haciendo uso de
mejores secuencias para un posterior análisis filogenético de mejores resultados.

Referencias
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