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Estructura Función y Clasificación de Las Enzimas
Estructura Función y Clasificación de Las Enzimas
LAS ENZIMAS
1. Oxidorreductasas
1.1 Grupos CH-OH
1.1.1 NAD+ o NADP + aceptor
1.1.1.1. Alcohol NAD + oxidorreductasa: Deshidrogenasa Alcohólica
1.1.3. O2 como aceptor
1.1.3.4. p-D-glucosa: oxígeno Oxidorreductasa Glucosa oxidasa
(FAD)
1.2. Grupos C = 0
1.2.1.12. Gliceraldehído 3-P:NAD* Triosa-P-deshidrogenasa
Oxidorreductasa (NAD+)
1.2.3.2. Xantina:oxígeno oxidorreductasa. Xantino oxidasa
1.2.4.1. Piruvato: lipoato Oxidoreductasa Piruvato deshidrogenasa
2.6.1 Aminotransferasas
2.6.1.1 L-aspartato: 2-oxoglutarato aminotransferasa Transaminasa glutámico oxalacética
2.6.1.2 L-alanina: 2-oxoglutarato aminotransferasa Transaminasa glutámico pirúvica
2.7.1 Fosfotransferasas
2.7.1.2 ATP: glucosa 6-P transferasa Glucocinasa
2.7.7.10 UTP: galactosa 1-P uridil transferasa UDP-galactosa pirofosforilasa
3. Hidrolasas
3.1 Enlace éster
3.1.1 Carboxílico
3.1.1.7 Acetilcolina acetil hidrolasa Colinesterasa
3.1.2 Tióester
3.1.2.1 Acetil CoA hidrolasa Tiolasa
3.1.3 Ester fosfórico
3.1.3.9 Glucosa 6-P fosfohidrolasa Glucosa 6-fosfatasa
4 Liasas
4.1.1 Carboxiliasas
4.1.1.1 2-oxo-ácido carboxil iasa Piruvato descarboxilasa
4.1.2 Aldehidoliasas
4.1.2.7 Cetona 1-Paldehidoliasa Aldolasa
CONTINUA TABLA 4.4
4.1.3 Cetoacidoliasas
4.1.3.7 Citrato oxalacetato liasa Citrato sintetasa
4.2.1 Hidroliasas
4.2.1.2 L-malatohidroliasa Fumarasa
5 Isomerasas
5.1 Racemasas y epimerasas
5.1.1.1 Alanina recemasa Alanina racemasa
5.1.3.1 D-ribulosa 5-P, 3 epimerasa Epimerasa
6 Ligasas
6.1.1 Aminoácido-RNA
6.1.1.1 L-tirosina: RNAt ligasa(AMP) Tirosil-RNAt sintetasa
a
La NADH-citocromo b, reductasa se ha encontrado en el retículo endoplasmático, Golgi, membrana
mitocondrial externa y en la envoltura nuclear. Varias de las enzimas señaladas en la tabla son comunes a
uno o más organelos membranosos.
Tabla 4.7
Actividad molecular de algunas enzimas
hiba la LDH por lactato y el piruvato se deri- no competitivos de la fosfatasa acida, lo cual
ve al ciclo de Krebs, productor de energía. debe tomarse en cuenta al interpretar los re-
Esta es una ventaja fisiológica que garantiza sultados.
que el corazón tenga un aporte constante de
energía para la contracción (ver unidad de
Bioenergética). 4.6 REGULACIÓN ENZIMÁTICA
Existen algunas aplicaciones prácticas,
desde el punto de vista clínico, de la inhibi- En el tubo de ensayo, las enzimas funcionan
ción enzimática. El suero contiene enzimas en un sistema cerrado y se acumula el pro-
como las fosfatasas acidas producidas por di- ducto de la reacción. Sin embargo, en la cé-
ferentes tejidos, hay una producida por la lula, los productos de la reacción no se
próstata, que se eleva en el carcinoma prosté- acumulan ya que son utilizados como sus-
tico. El ácido L-tartático inhibe competitiva- tratos de otra enzima, y los productos de ésta
mente la actividad de la enzima prostática, son sustratos de otra enzima y así sucesiva-
pero tiene poco efecto sobre las fosfatasas mente hasta llegar al llamado producto final.
acidas de eritrocitos, hígado, riñon y bazo. La secuencia de reacciones entre un sustrato
El formaldehído al contrario, inhibe la de inicial y su producto final se denomina vía
eritrocitos, pero no a la enzima prostática. metabólica, la cual puede presentar ramifi-
Los iones calcio inhiben no competitiva- caciones que constituirán otras vías metabó-
mente muchas fosfatasas acidas, de aquí la licas.
necesidad de agregar quelantes a muestras Aunque todas las reacciones catalizadas
de sangre destinadas a este ensayo. El etanol por enzimas son reversibles en el tubo de
y ciertos narcóticos son también inhibidores ensayo, en la célula, la característica secuen-
cial de las vías metabólicas hace que el flujo mucho en estructura, tamaño y distribución
del metabolismo celular sea irreversible y de cargas; 2) la inhibición por CTP o UTP
permanentemente dinámico. El carácter di- puede abolirse sin pérdida de actividad cata-
námico de los organismos vivos establece lítica; 3) el ATP, que no afecta la velocidad
que el verdadero equilibrio metabólico se al- enzimática, puede impedir la inhibición por
canza sólo con la muerte de la célula. La cé- CTP o UTP, quizá por competencia con el
lula viva es un sistema abierto, en equilibrio sitio regulador y 4) pueden fraccionarse dos
dinámico (estado estacionario), mantenido subunidades una que une aspartato y otra
por un flujo unidireccional de metabolitos. que une CTP o UTP.
El estado estacionario equivale al concepto Pardee, Jacob, Monod y Changeaux, estu-
de homeostasis, propuesto por Claudio Ber- diaron este tipo de inhibición y la llamaron
nard a finales del siglo XIX, que indica que inhibición alostérica (allos=otro) en virtud
los organismos mantienen su medio interno- de que el sitio regulador es distinto del sitio
constante a pesar de las amplias variaciones activo (isostérico, de isos=igual).
en alimentación, actividad física, temperatu- Conviene distinguir este tipo de inhibi-
ra externa, etc. (fig. 4.20). ción con la inhibición por producto, la cual
En un sistema tan complejo como la célula sigue la ley de acción de masas. Las reaccio-
debe haber mecanismos de regulación o con- nes enzimáticas, como cualesquiera otra,
trol de la multitud de reacciones simultáneas obedecen esta ley. Si a la reacción:
que ocurren, reacciones que son, en su mayo-
ría, catalizadas por enzimas. En todas las áreas Glucosa -6-P + H 2 0 -» Pi + glucosa
de las ciencias biomédicas se encuentran
ejemplos de regulación normal o anormal: se le agrega inicialmente glucosa libre o fos-
muchas células cancerosas exhiben anorma- fato, disminuye su velocidad; esto como ya
lidades en la regulación de sus enzimas. se mencionó se considera inhibición compe-
El conocimiento de los factores que regu- titiva o isotérica. A la inhibición alostérica
lan la acción de las enzimas es, por tanto, se le llama también inhibición por producto
esencial para entender el mecanismo de ho- final, por retroalimentación o regulación re-
meostasis celular y para comprender a nivel troactiva ("feedback").
molecular las enfermedades.
La regulación metabólica de una vía tiene
lugar mediante la modulación de la activi- 4.6.1. Regulación alostérica
dad enzimática de una o más enzimas clave
de la ruta, llamada enzima limitante de la La actividad catalítica de algunas enzimas
vía, que generalmente corresponde a la pri- reguladoras es afectada por ciertas molécu-
mera enzima. Uno de los primeros ejemplos las que producen un cambio en la actividad
de regulación fue la síntesis de CTP (citidi- enzimática, pero que no se modifican por la
na trifosfato) a partir de aspartato y carba- acción enzimática. Estas moléculas se deno-
milfosfato (fig. 4.21). minan efectores, modificadores o modula-
La primera enzima del proceso de síntesis dores; por lo general, estos tienen poca o
de CTP, la aspartato transcarbamilasa (a), se ninguna semejanza estructural con el sustra-
inhibe específicamente con CTP y UTP, to. Monod, en 1963 observó esta falta de re-
productos finales del proceso. Se considera lación estructural inhibidor-sustrato y
que la acción de CTP y UTP ocurre en un si- propuso denominar a este tipo de moléculas,
tio regulador distinto del sitio catalítico por- efectores alostéricos. Un efector alostérico
que: 1) CTP o UTP y aspartato difieren cambia la conformación de la enzima, de
manera que cambia la afinidad hacia el sus- inverso. El sitio alostérico donde se une el
trato. Los efectores alostéricos positivos (+) efector positivo se conoce como centro acti-
incrementan la afinidad enzima-sustrato y vador. El efector negativo se une a un centro
los efectores alostéricos negativos (-) hacen lo inhibidor. Una enzima alostérica, es una en-
talizada por una determinada enzima, deno- rrespondiente al estado final. Para que la re-
minado metabolito, se convierte en el sustra- acción tenga lugar, las moléculas reaccio-
to de la subsiguiente reacción nantes deben alcanzar un nivel de energía
suficiente para vencer la barrera energética
B y entrar al estado de transición. La diferen-
metabolito cia entre la energía libre de los reactantes y
el estado de transición se denomina energía
de activación. La función de un catalizador
4.1.3. Funciones generales (inorgánico o enzima) consiste en disminuir
la energía de activación, lo que conduce a
4.13.1. Catálisis enzimática acelerar la reacción debido a que los reac-
tantes pueden alcanzar más fácilmente el es-
Se ha señalado que una enzima incrementa tado de transición (fig. 4.1).
la velocidad de la reacción química pero sin
modificar la constante de equilibrio ni el
sentido de la reacción, es decir, sin variar las 4.1.4. Catalizadores inorgánicos y
propiedades termodinámicas del sistema. biológicos
En un sistema catalizado por una enzima,
un sustrato (A) con determinado nivel ener- Los catalizadores inorgánicos son general-
gético, conocido como estado inicial, tiene mente átomos en estado iónico o metales
que alcanzar un nivel energético superior o con propiedades similares a las atribuidas a
estado de transición antes de convertirse en un catalizador biológico pero, a diferencia
un producto (B) con un nivel energético co- de los catalizadores biológicos, no poseen la
REACCIÓN
Figura. 4.1. Energía de activación de una reacción no catalizada (I) y una reacción catalizada (II).
zima cuya actividad en el sitio catalítico puede Las enzimas alostéricas permiten el control
ser modulada por la presencia de efectores fino de la actividad metabólica mediante pe-
en los sitios alostéricos (fig. 4.22). queñas fluctuaciones en el nivel de sustratos.
En el ejemplo de la aspartato transcarba- Es frecuente la confusión entre los térmi-
milasa, el sitio catalítico radica en subunida- nos de alosterismo y coopera ti vidad. La
des diferentes, a las del sitio alostérico; esta cooperatividad se define como la influencia
enzima posee dos protómeros catalíticos y que tiene la fijación de un ligando a un pro-
tres o cuatro reguladores. Aunque una enzi- tómero sobre la fijación del ligando a un se-
ma monomérica puede, teóricamente, expe- gundo protómero de una proteína
rimentar efecto alostérico, en la práctica oligomérica. Anteriormente se ha discutido,
sólo se han encontrado dos enzimas alostéri- en el capítulo de proteínas de transporte, la
cas monoméricas: ribonucleósido difosfato cooperatividad en la fijación de oxígeno a la
reductasa y piruvato -UDP-n-acetil-gluco- hemoglobina. En la hemoglobina el centro
saminatransferasa. La mayoría de las enzi- de fijación del oxígeno de cada subunidad
mas alostéricas son oligoméricas. corresponde al centro del sustrato y no a un
La cinética de interacción entre sustrato, sitio alostérico; por lo tanto, el cambio con-
enzima e inhibidor alostérico sigue una cur- formacional que induce el oxígeno sobre los
va sigmoidea. Los efectos alostéricos nega- protómeros de hemoglobina, técnicamente
tivos desplazan la curva hacia la derecha, no es un efecto alostérico.
indicando aumento de la Km con pérdida de Las enzimas alostéricas se dividen en dos
afinidad enzima-sustrato. En presencia de un clases según la influencia del efector alosté-
efector positivo se alcanza la 1/2 Vmax a una rico sobre la Km y la Vmax. En la clase K, el
concentración menor de sustrato y se des- efector afecta la Km pero no la Vmax. Para
plaza la gráfica de Michaelis-Menten hacia las enzimas de la clase V, el efector alostéri-
la izquierda (fig. 4.23). co abate la Vmax sin afectar la Km aparente.
4.2. ESTRUCTURA DE LAS ENZIMAS por enzimas que requieren coenzimas están
las de oxidorreducción, las de transferencia
4.2.1. Holoenzima y apoenzima de grupo, las de isomerización y las que for-
man enlaces covalentes. Las reacciones hi-
La parte proteica de la enzima desprovista drolíticas no requieren de coenzimas.
de los cofactores se denomina apoenzima. La coenzima puede considerarse como un
No todas las enzimas requieren cofactores cosustrato, por ejemplo, en las reacciones de
para ser activas, pero en las que los requie- oxidorreducción, una molécula de sustrato es
ren, la apoenzima es catalíticamente inacti- oxidada (deshidrogenada) y una molécula de
va. La adición del cofactor a la apoenzima coenzima es reducida (hidrogenada) (fig. 4.2).
da lugar a la holoenzima, o sea la enzima De modo similar, en las reacciones de
completa y activa. transaminación, el fosfato de piridoxal
(PPal) actúa como segundo sustrato en dos
reacciones combinadas (fig. 4.3).
4.2.2. Cofactores Relación entre vitaminas y coenzimas.
Las vitaminas del complejo B forman par-
Otros componentes de la enzima con bajo te de numerosas coenzimas. Tal es el caso
peso molecular, termostables y no proteicos, de la nicotinamida, riboflavina, tiamina, áci-
unidos a la apoenzima se llaman coenzimas, do pantoténico, ácido fólico y cianocobala-
si la unión es débil y se separa con facilidad mina. Coenzimas de oxidorreducción,
de la apoenzima, o grupos prostéticos, si es- derivadas de la vitamina nicotinamida son el
tán firmemente ligados a la apoenzima. Los nicotkiamida-adenina-dinucleótido (NAD+),
cofactores (coenzima o grupos prostéticos) y el nicotinamida-adenina-dinucleótido-fos-
son en general moléculas pequeñas, orgáni- fato (NADP+). (fig. 4.4). La vitamina C y las
cas e inorgánicas, que requiere la enzima pa- vitaminas liposolubles no tienen actividad
ra su actividad. coenzimática conocida.
nal, embarazo ectópico roto, parotiditis, cálcu- prostático, particularmente si es metastási-
los salivales, administración de morfina (es- co, se elevan los niveles de ACP debido al
pasmo del esfínter de Oddi) y macro-amila- aumento de células prostáticas ectópicas.
semia.
Fosfatasa alcalina (ALP). Incluye isoen-
zimas que hidrolizan fosfatos a pH alcalino. 4.7.4. Como agentes terapéuticos
Se encuentran en hueso, hígado, pared intes-
tinal, glándula mamaria lactante y placenta. Algunas enzimas se han utilizado como me-
En huesos se localiza en los osteoblastos dicamentos en la terapia de problemas médi-
(la enzima es necesaria para los depósitos de cos específicos.
fosfato en hueso). Los niveles normales en La estreptocinasa, preparada a partir de
el adulto provienen específicamente de hí- estreptococos, es útil para disolver coágulos
gado, en niños de la fracción ósea por la ac- de sangre formados en las extremidades infe-
tividad osteoblástica. En el embarazo se riores. Esta enzima activa el plasminógeno
elevan los niveles normales debido a la el cual se transforma en plasmina que es una
isoenzima termoestable de la placenta. proteasa que ataca la fibrina y la degrada.
El método usado en la valoración es el de Utilizando fibrinolisina y estreptodornasa
Bassey Lowry-Brock que utiliza la siguiente (una DNAsa) por vía oral o tópico se puede
reacción. eliminar el material fibrinoso y purulento de
pH 8.5-10 heridas infectadas o necrosadas. Varias en-
p-NITROFENOLFOSFATO — • p-NTTROFENOL + Pi zimas proteolíticas como tripsina y quimo-
tripsina al igual que la estreptocinasa, se
La enzima se eleva en enfermedades he- utilizan en el tratamiento de la trombosis.
páticas con elementos colestáticos junto con Algunas enzimas digestivas (peptidasas,
la enzima 5'-nucleotidasa (NTP) que parece lipasas, amilasa, nucleasa y celulasas), se
tener también origen hepático. Se eleva tam- usan en la deficiencia enzimática por pan-
bién en enfermedades óseas con actividad creatitis crónica, pancreatectomía y trastor-
osteoblástica elevada: osteomalacia y raqui- nos gastrointestinales.
tismo, hiperparatiroidismo, enfermedad de La terapia con asparaginasa se usa en al-
Paget, osteocarcinoma y osteosarcoma; en el gunos tipos de leucemia adulta. En virtud de
raquitismo, la fosfatasa se eleva aun antes de que las células tumorales tienen un requeri-
que aparezcan síntomas de la enfermedad. miento nutricional de asparagina, con aspa-
Fosfatasa acida (ACP). Se encuentra en raginasa los n i v e l e s de asparagina
próstata, hígado, eritrocitos, plaquetas y hue- disminuyen sensiblemente lo que lleva a
so. El método de determinación es similar al disminuir la viabilidad del tumor.
de las fosfatasas alcalinas excepto el pH ópti- En el capítulo de ácidos nucleicos se estu-
mo que es de 5. El principal uso de la valora- diarán algunas enfermedades en las que está
ción es el diagnóstico de carcinoma prostático alterada la codificación de algunas enzimas;
metastásico. Aunque es difícil detectar sólo la su deficiencia o falta de actividad, es la cau-
fracción prostática, esta fracción tiene la pro- sa de la enfermedad. En el futuro será posi-
piedad de ser inhibida por el L-tartrato. Nor- ble el reemplazo enzimático por ingeniería
malmente, la fosfatasa acida de la secreción genética en individuos con deficiencia gené-
prostática drena a los conductos prostáticos y tica que afecte la síntesis de una enzima da-
aparece poco en sangre. En el carcinoma da.
C H0 L - C H - COO" C H3, - C - C O O ~
I II
OH O
Lactato Piruvato
( Sustrato reducido ( Sustrato oxidado )
+
NAD NADH + H
COO"
I COOH
O H - N H 92
I C H - N H 92
CH? I
I
C H 9¿
I Alanina
COOH
Glutamato
COOH
COO" I
i
c=o C=0
I
CH«2 CH3
I
CH«¿
I Piruvato
COOH
oe-Cetaglutarato
Fig. 4.3. Transferencia de grupos ámino con PPal
(fosfato de piridoxal) como cosustrato.
Clasificación de coenzimas
Las coenzimas pueden clasificarse como sigue:
Para la transferencia de grupos Para la transferencia de H:
distintos del H: NAD + ,NADP +
Uridina difosfato (UDP) FAD,FMN
Pirofosfato de Tiamina (TPP) Acido Lipoico
Fosfato de Piridoxal (PPal) Coenzima Q
Coenzima A (CoA-SH)
Acido tetrahidrofólico (TH4)
Biotina
Coenzimas de cobamida (B12)
Acido Lipoico
S-Adenosil metionina (S AM)
Fig. 4.5. Sitio activo de una enzima. Ajuste inducido por un cambio conformacional en la estructura de la
enzima antes y después de la unión del sustrato.
por esto, Koshland en 1967 emitió un modelo láctica, la creatina fosfocinasa y la fosfatasa
del sitio catalítico flexible, al que llamó de alcalina. El caso más ilustrativo es el de la
ajuste inducido (fig. 4.5). En este modelo, el deshidrogenasa láctica, enzima tetramérica,
sustrato induce un cambio conformacional que posee dos subunidades distintas: H (de
en la estructura terciaria de la proteína enzi- corazón) y M (de músculo). Estas dos subu-
mática como hace la mano en el guante. Este nidades se combinan de cinco formas dife-
modelo permite también explicar la influencia rentes para formar cinco isoenzimas: H4,
de otros sitios, llamados reguladores o alos- H3M, H2M2, HM 3 y M4 (Fig. 4.6).
te'ricos, que modifican la actividad de la en- La isoenzima M4 predomina en músculo
zima al provocar cambios conformacionales esquelético y en hígado, la izoenzima H4
en el sitio catalítico; esto se discutirá más predomina en miocardio (Tabla 4.3). La dife-
adelante al hablar de efectores alostéricos. rencia cinética entre estas dos isozimas se ex-
plica en otros capítulos.