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El índice de casi todas las reacciones catalizadas por enzima muestra una dependencia
importante de la concentración de ion hidrogeno. Casi todas las enzimas intracelulares
muestran actividad óptima a valores de pH entre 5 y 9. La relación entre actividad y
concentración de ion hidrogeno refleja el equilibrio entre la desnaturalización de enzima a
pH alto o bajo, y los efectos sobre el estado cargado de la enzima, los sustratos o ambos.
Para enzimas cuyo mecanismo comprende catálisis acido básica, los residuos comprendidos
deben estar en el estado de protonación apropiado para que la reacción proceda. La unión y
el reconocimiento de moléculas de sustrato con grupos disociables típicamente también
comprenden la formación de puentes salinos con la enzima. Los grupos cargados más
frecuentes son grupos carboxilato (negativos) y aminas protonadas (positivos). La ganancia
o pérdida de grupos cargados cruciales afecta de manera adversa la unión a sustrato y, así,
retrasara o suprimirá la catálisis.
En 1913, Leonor Michaelis y Maud Menten propusieron un modelo sencillo que explica
estas características cinéticas, El aspecto critico de su desarrollo es que se necesita un
complejo específico ES intermediario en la catálisis. El modelo que propusieron es el
más sencillo de los que pueden explicar las propiedades cinéticas de muchos enzimas.
Una enzima E se combina con S para formar un complejo ES con una constante de
velocidad K1, el complejo ES tiene dos destinos posibles, puede disociarse hasta E y S
con una constante de velocidad K_1 o bien puede continuar hasta formar un P con una
constante de velocidad K2. El complejo ES también puede ser generado a partir de E y
P mediante la relación inversa en una constante de velocidad de K_2, sin embargo,
como anteriormente, podemos simplificar estas reacciones, considerando la velocidad
de reacción próxima a tiempo 0 (es decir Vo), cuando la formación de producto es
insignificante y de esta forma la reacción no revierte (K_2 [P] = 0)
Así, para la gráfica de la fig. 8.12 Vo se determina para cada concentración de sustrato
midiendo la velocidad de formación de producto a tiempos previos a la acumulación de
P
Necesitamos una expresión que relacione la velocidad de catálisis con las concentraciones
de sustrato y enzima y la velocidad de las etapas individuales. Sea parte de la base de que la
velocidad catalítica es igual al producto de la concentración del complejo ES por K2:
Para simplificar esta materia, en 1924 George Briggs y John Haldane sugirieron el uso del
estado estacionario. En el cual, las [] de los intermediarios, en este caso [ES], permanecen
invariables, mientras que las concentraciones de los materiales de partida y de los productos
van cambiando, Esto ocurre cuando las velocidades, de formación y de destrucción del
complejo ES son iguales, igualando las ecuaciones anteriores, tenemos
Dicha ecuación puede simplificarse definiendo una nueva constante el Km, denominada
constante de Michaelis:
En lo que sigue, las reacciones enzimáticas se tratan como si solo tuvieran un sustrato único
y un producto único. Para enzimas con múltiples sustratos, los principios que se comentan a
continuación se aplican con igual validez. Los científicos pueden estudiar la dependencia
del índice de reacción en un reactivo individual por medio de la selección apropiada de
sustratos fijos y variables. En otras palabras, en condiciones de seudoprimer orden, la
conducta de una enzima con múltiples sustratos imitara a la de otra que cuenta con un solo
sustrato. Sin embargo, en estas circunstancias, la constante de índice observada estará en
función de la constante de índice de k1 para la reacción, así como la concentración del (o
los) sustrato(s) fijo(s). Para una enzima típica, a medida que la concentración de sustrato
aumenta, Vo se incrementa hasta que alcanza un valor máximo Vmax (Fig. 8-4). Cuando
los aumentos adicionales de la concentración de sustrato no aumentan más la vi, se dice que
la enzima esta “saturada” con sustrato. Note que la forma de la curva que relaciona la
actividad con la concentración de sustrato, es hiperbólica. A cualquier constante dada, solo
las moléculas de sustrato que se combinan con la enzima como un complejo ES pueden
transformarse en producto. En segundo lugar, la constante de equilibrio para la formación
del complejo de enzima-sustrato no es infinitamente grande. Por ende, aun cuando el
sustrato está presente en exceso (puntos A y B de la fig. 8-5), solo una fracción de la
enzima puede estar presente como un complejo ES. Por tanto, de los puntos A o B,
aumentar o disminuir [S] aumentara o disminuirá el número de complejos ES con un
cambio correspondiente de vi. En el punto C (fig. 8-5), en esencia toda la enzima está
presente como el complejo ES. Dado que no queda enzima libre disponible para formar ES,
los aumentos adicionales de [S] no pueden aumentar el índice de la reacción. En estas
condiciones de saturación, la vi depende solo de —y, de este modo, está limitada por— la
rapidez con la cual el producto se disocia de la enzima de modo que logre combinarse con
más sustrato.
6. Definir Km, relacionarlo con la afinidad de la enzima y explicar la importancia
fisiológica
Los valores de los enzimas varían ampliamente, para la mayoría de los enzimas Km
varía entre 10 a la -1 y 10 a la -7 M el valor de Km para un enzima depende de cada
sustrato partículas y también de las condiciones ambientales como pH, temperatura y
fuerza iónica. La Km tiene dos significados, primero Km es la concentración de sustrato
a la cual la mitad de los centros activos están ocupados, así Km proporciona una medida
de la concentración de sustrato necesaria para que tenga lugar una catálisis significativa,
de hecho, para muchos enzimas, las evidencias experimentales sugieren que la Km
proporciona una aproximación en vivo de la concentración de S
Inhibidores enzimaticos
existen agentes quimicos que inhiben la accion de las enzimas, algunos de ellos ejercen su accion
uniendose a sitios o grupos funcionales esenciales de la molecula en enzima, esas sustancias son
de gran utilidad para estudiar algunos aspectos de la accion enzimatica, principalmente los grupos
funcionales que participan en la catalisis o son responsables de asegurar los requerimientos
estructurales para la union enzima-sustrato, la inhibicion puede ser reversible o irreversile. El
mecanismo de accion de un inhibidor se estudia mediante determinaciones de actividad
enzimatica a varias concentraciones de sustrato en ausencia y presencia de una concentracion dija
del inhibidor, la epresentacion grafica de los resultados permite establecer el tipo de inhibicion.
inhibidores irreversibles
inhibidores reversibles:
Enzimas alostericas, En algunas vías metabólicas, las enzimas que catalizan la primera
etapa de la serie es inhibida por el producto de la última, cuando la cantidad de este
producto final excede las necesidades, se frena el funcionamiento de la vía reduciendo la
actividad de la enzima regulador.
En enzimas alostericas, además del sitio catalítico, existen otros sitios reguladores a los
cuales se unen específicamente las moléculas que actúan sobre su actividad catalítica, estos
agentes reciben el nombre de moduladores, modificadores o efectores Alostericos. Serán
positivos si estimulan y negativos si deprimen la actividad de la enzima. Cuando el
modulador alostérico es distinto del sustrato, el efecto es denominado heterotropico, si el
agente modificador es el mismo sustrato, es homotropico
11. Comparar, mediante gráficos, la cinética de una enzima Alosterica, con la clásica
cinética de una enzima (no modulada) tipo Michaelis Menten.
13. Definir isoenzimas: en el organismo y aun en una célula, pueden existir proteínas
diferentes dotadas de la misma actividad enzimática, Esas distintas formas moleculares
de una enzima se denominan Isoenzima o Isozimas, se ha probado la existencia de
formas moleculares múltiples o isozimas en cientos den enzimas, desde este punto de
vista, ha sido muy estudiado la lactado deshidrogenasa (LDH), que presenta cinco
isozimas en la mayoría de los tejidos animales, se numeran de acuerdo con movilidad
electroforética, designando I a la que migra más hacia al ánodo, la distribución relativa
de actividad enzimática entre las cinco formas, es característica de cada tejido, en
extractos de musculo diafragma se revelan las cinco isozimas con intensidad
aproximadamente similar. En cambio, en corazón hay un franco predominio en las
isozimas 1 y 2; en hígado y musculo voluntario, la fracción 5 es la más abundante.
14. Citar ejemplos de isozimas de interés para el diagnóstico clínico:
Enzima Isozima/s
Hexoquinasa Glucoquinasa
Lactato Deshidrogenasa LDH 1, 2,3,4 y 5
Amilasa Amilasa P y Amilasa S
Creatin fosfo quinasa (CPK) CPK M y B
IMPORTANTE:
En la creación de esta guía se ha utilizado material didáctico obtenido de los libros:
Bioquímica Lehninger 4taEd
Harper Bioquímica Ilustrada 28Ed
Bioquímica de Blanco 8ed. Lubert Styer Bioquímica 6ta ed.