Tema-1

INTRODUCCIÓN A LA ENZIMOLOGÍA

1. Introducción
2. Breve historia de la Enzimología
3. Descripción general de las enzimas
4. Enzimas monoméricas y enzimas oligoméricas
5. Enzimas solubles y enzimas ligadas a membranas
6. Clasificación de enzimas
7. Isoenzimas
8. Enzimas no convencionales
- Ribozimas
-Anticuerpos catalíticos (Abzimas)
- Synzimas
 1. INTRODUCCIÓN
* La vida depende de una serie de reacciones químicas
perfectamente organizadas. Sin embargo, muchas de estas reacciones,
por sí mismas, tienen lugar a una velocidad demasiado lenta como para
dar respuesta a los diversos procesos vitales.
* La Naturaleza ha diseñado los catalizadores biológicos, o
biocatalizadores.
* Los biocatalizadores pueden ser de:
- naturaleza
- naturaleza proteica:
proteica:
-enzimas
naturaleza no-proteica:
(proteína),
 abzymas (anticuerpos catalíticos),
- naturaleza no-proteica:
 ribozimas (RNAs catalíticos)
* De todos ellos, los más abundantes son las enzimas.
Estos biocatalizadores son capaces de acelerar la
velocidad de reacción, varios órdenes de magnitud,
104 – 1018.
-Veamos algunos ejemplos:

Velocidad Velocidad
sin enzima con enzima
CO2 + H2O  HCO3- + H+ 1 107
(Anhidrasa carbónica)

H2O2  H2O + O2 1 109

(Catalasa)
12
G-1-P  G-6-P 1 10
(Fosfoglucomutasa)
14
Urea + 2H2O  NH4+ + 2CO2 1 10
(Ureasa)

* Este poder catalítico de las enzimas es el que hace posible

que los diferentes procesos vitales, en todas las formas de vida
-desde los virus al hombre-, tengan lugar de manera eficiente.
 ¿Cuáles son las propiedades especiales de las enzimas que las hacen
catalizadores tan eficientes?

-La respuesta a esta pregunta no es fácil:

* Este es uno de los aspectos, más importantes, de la Enzimología que

intentaremos estudiar a lo largo del curso.

* E intentaremos, siempre cuando sea posible, justificarla a nivel

molecular.

Pero antes, comencemos fijando ciertas ideas, a nivel formal, tales

como definiciones, símbolos, nomenclaturas, etc.
Las enzimas como catalizadores biológicos
Las enzimas son proteínas, producidas por los seres vivos que tienen
capacidad para catalizar con gran eficiencia procesos muy
específicos.

* Los seres vivos tienen enzimas multitud de Enzimas diferentes

Ej. Escherichia coli 4288 proteínas
2658 (62%) Caracterizadas
1701 (64%) Enzimas
Eucariotas todavía es superior
Naturaleza proteica de las enzimas, apunta a las cuestiones básicas de
la Enzimología:
- Mecanismo catalítico,
- Especificidad.
- Regulación
* Las enzimas ejercercen su poder catalítico en condiciones suaves de
temperatura, pH, presión, etc., compatibles con la vida. Además, las
enzimas son catalizadores susceptibles de regulación en su actividad, lo
que permite armonizar el entramado metabólico de acuerdo con las
necesidades del organismo.
Ausencia de enzimas NO metabolismo celular NO vida
* Aplicaciones de las enzimas:
- Análisis clínico
- Aplicaciones médicas
- Aplicaciones industriales
* Química orgánica
* Química farmacéutica
* Alimentación
* Detergentes
* Textil
 Definición de catalizador
* Un catalizador es una sustancia que aumenta la velocidad de una
reacción, sin verse alterada en el proceso global.
* La mayor parte de los catalizadores biológicos (aunque no todos ellos)
son enzimas.
* La sustancia sobre la que actúa una enzima se denomina
sustrato de esa enzima.
-Veamos todo esto en un ejemplo:

H2O2 ------- H2O + O2

* Esta reacción, aunque fuertemente favorecida
termodinámicamente, es muy lenta, a menos que sea
catalizada.
 Velocidad de Reacción
Sin catalizador 1 100
Con catalizador químico (FeCl3) 1.000 103
En presencia de Hb 1.000.000 106
En presencia de catalasa 1.000.000.000 109

* Este ejemplo nos muestra que la velocidad de una reacción

termodinámicamente favorable depende en gran medida de que exista o
no un catalizador y de la naturaleza del mismo.

* Los catalizadores biológicos, entre ellos las enzimas,

se encuentran entre los más eficaces y específicos que
se conocen.
* En este punto, nos conviene resaltar dos hechos importantes:
1. Un catalizador verdadero, aunque participa en el proceso
de reacción, no se modifica a lo largo de ella.
2. Los catalizadores modifican la velocidad de los procesos,
pero no afectan la posición de equilibrio de una
reacción.

Ya que en el equilibrio:

V1  =  V2
 2. BREVE HISTORIA DE LA ENZIMOLOGÍA
Aplicación
Biocatálisis raíces en la industria alimentaria
Cerveza, queso, etc
Homero (Iliada) Menciona el uso de estómagos animales en la elaboración de
queso 400 bC
(XIX ) Payen y Person investigaron la acción de extractos de cebada en hidrólisis de almidón
Formularon los principios básicos del mecanismo de acción enzimático
a) Pequeñas cantidades de extracto podían hidrolizar grandes cantidades de almidón
b) Termolabil
c) La substancia activa se podía separar del extracto (precipitación alcoholica) y ser purificada
Berzelius (1835) definio la reacción como catalítica (diastasa)
Definió que un cuerpo, por su presencia por afinidad con una
substancia fermentable puede causar su ruptura en otros productos
Proceso industrial de diastasa en industria del pan, cerveza, etc

Richard Kuhne fue el que acuño el termino de enzimas,

tomado del griego, que significa literalmente "en la levadura".
Las bases del proceso catalítico controversia científica

VITALISMO (Pasteur)
Reacciones químicas proceso vital no unido a materia ni energía.

MECANICISMO (Liebing)
Proceso biológico como un engranaje o una máquina y que los
seres vivos para realizar alguna determinada función necesitaban
echar mano de ese engranaje.

DESARROLLO ENZIMOLOGIA MECANICISTA

Wöhler sintetizó el compuesto orgánico (sólo presente en seres vivos) urea
a partir de cianuro de amonio, una sustancia inorgánica

Büchner extractos de levaduras (sin células) producían

fermentación principio separable de ellas, hidrosoluble y termolábil
al que dieron el nombre de zimasa

Nuevo paradigma bioquímico:

La catálisis enzimática es un proceso químico no necesariamente

unido a la presencia y acción de organismos vivos no requiere
una fuerza vital “a vis vitalis”
Fisher (1894)

1. Especificidad
Selectividad:
complementaridad
adaptabilidad

Elementos:
geometría, carga,
puentes de
H, etc.

2. Intuyo la naturaleza proteica (Tardaron varias décadas)

(1900) Kastle Loevenhart Reversibilidad de las reacciones

enzimáticas (Lipasas)
 (1897) Bertrand . Descubre la necesidad de substancias
para ejercer accion catalítica (coenzimas)
A partir de 1926 Confirmación de la Naturaleza protéica de
las enzimas Purificación y cristalización de Ureasa Tripsina,
Pepsina, etc
V. Henri fue el pionero en los estudios de la cinética enzimática,
Cumple "Ley de acción de masas"
los fenómenos de saturación.

Michaelis y Menten (1913), continuaro estudios de Henry.

Formularon Primera ecuación cinética
[S]
v = kcat [Eo] -------------
Ks + [S]
3. DESCRIPCIÓN GENERAL DE LAS ENZIMAS
* Las principales características de las enzimas son:

1. Las Enzimas son proteínas

2. Las Enzimas tienen centro(s) activo(s)
3. Las Enzimas son específicas
4. Las enzimas “modifican” la velocidad de reacción
(incrementándola) pero no el equilibrio químico

1 Las enzimas son proteínas

* Efectivamente, las enzimas son proteínas pero unas proteínas
muy especiales: Proteínas con actividad catalítica
- Así pues, es conveniente tener presente lo siguiente:

* Una proteína se define por lo que es ....

PM
Composición aminoacídica
Secuencia
Tamaño y forma
etc.
Sin embargo,

* Una enzima se define por lo que hace ......

* Reacción que cataliza
* Especificidad Sustrato/Producto
* pH optimo de acción
* Temperatura optima de acción
* Mecanismo catalítico
* etc.
 * Estas proteínas tienen la característica específica de poseer
2 una zona específica de su molécula donde tiene lugar la
reacción química que cataliza: el centro activo.

Región hidrofóbica Región polar

<-Centro activo-><------>Surface recognition site-----

>

3 * Las enzimas son altamente específicas

Especificidad enzimática:
1.) Requerimientos estructurales:
* Los sustratos deben poseer los grupos químicos
funcionales adecuados.
2.) Requerimientos quirales:
* Las enzimas son sensibles a la quiralidad del sustrato.
* Las enzimas mismas son quirales.
* Por regla general existen 3 o más puntos de contacto
entre la E y el S.
 3.) Especifidad de producto

Especificidad de sustrato:
* La mayor parte de las enzimas actúan sobre un número muy reducidos
de sustratos.
Glutamato decarboxilasa
Glutamato + Piruvato --------------------------------> GABA + CO2

X
Glutamato decarboxilasa -Alanina + CO
Aspartato + Piruvato ---------------------------------> 2

* En este ejemplo la especificidad viene dada por el grupo “etilen”,

(-CH2-CH2-)
Especificidad quiral:
Algunas enzimas actúan sólo sobre uno de los isómeros

Glutamato decarboxilasa
L-Glutamato + Piruvato --------------------------------> GABA + CO2

X
Glutamato decarboxilasa
D-Glutamato + Piruvato --------------------------------->
* Las enzimas son catalizadores, pero unos catalizadores muy
especiales, actúan:
i) a temperatura fisiológica, 37ºC
ii) a pHs fisiológicos, 6 - 7,5
iii) a presión atmosférica, 1 atm.

* De acuerdo con las teorías actuales, las enzimas ejercen su función

estabilizando el estado de transición.
4. ENZIMAS MONOMÉRICAS Y ENZIMAS OLIGOMÉRICAS

* Enzimas monoméricas:
- constituidas por una sola cadena polipeptídica,
- no presentan estructura cuaternaria.

* Sin embargo, la gran mayoría de las enzimas son oligoméricas:

- Si estan formadas por:
-dos subunidades  Dímeros
-tres subunidades  Trímero
-cuatro subunidades  Tetrámero
-cinco subunidades  Pentámero
-etc.

* Estas subunidades, a su vez, pueden ser

iguales o distintas. -Homo-oligómeros  iguales
-Hetero-oligómeros  distintas
5. ENZIMAS SOLUBLES Y ENZIMAS LIGADAS A MEMBRANAS

¿Problemática?
- Las enzimas solubles se miden fácilmente en medios acuosos

- Las enzimas unidas a membranas necesitan de un medio,

generalmente, hidrófobo para poder medir su actividad.
6. CLASIFICACIÓN DE ENZIMAS
Necesidad de un sistema de clasificación
* Si el nº de enzimas es pequeño --> NO hay problemas
- Muchos nombres eran poco informativos, cuando no
engañosos, respecto a la reacción catalizada, como:
-emulsina,
-diaforasa,
-enzima amarilla antigua,
-etc.
- En muchos casos se utilizaban varios nombres para una misma
enzima, como:
-invertasa,
-sacarasa,
-invertina y
-fructofuranosidasa.
- Por otra parte, un mismo nombre se aplicaba a enzimas
diferentes, como p. ej.,
-“sintetasa”.
 * En 1956 la Unión Internacional de Bioquímica (IUB) creó la
Comisión de Enzimas (EC).

*La misión de dicha comisión era, según palabras textuales de sus

declaración programática:
“Considerar la clasificación y nomenclatura de enzimas y coenzimas,
sus unidades de actividad y métodos estándar de ensayo junto con los
símbolos utilizados en la descripción de la cinética enzimática.”
* En 1961 la Comisión publicó las bases para una nomenclatura y
clasificación de las enzimas.
* Posteriormente se disolvió la Comisión y la IUB creó el Comité
Permanente de Enzimas que se encargó de la aplicación de la nueva
nomenclatura.
* En 1964 se publica la primera lista de 874 enzimas clasificadas y
nombradas sistemáticamente.
* Finalmente, la IUB formó con la Unión Internacional de Química
Pura y Aplicada (IUPAC), la Comisión de Nomenclatura
Bioquímica, dentro de la cual se formó un Comité de Expertos en
Enzimas que actualizaron las normas anteriores e incluyeron el gran
número de enzimas descubiertos en los últimos años.

En 1961 se publicó una lista con 712 enzimas

En 1964 se publicó una lista con 875 enzimas
En 1972 se publicó una lista con 1770 enzimas.
En 1978 se publicó una lista con 2122 enzimas.
En 1984 se publicó una lista con 2477 enzimas
En 1992 se publicó una lista con 3196 enzimas
En 2003 ....... ?

http://www.iubmb.unibe.ch/
http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/
Clasificación de las enzimas de acuerdo con la Enzyme Commission
(EC)
* La clasificación sistemática de las enzimas de acuerdo con el sistema
propuesto por la EC sigue un criterio funcional según el cual las
enzimas se clasifican según el tipo de reacción catalizada.
* La EC asigna un nombre sistemático y un código numérico
particular a cada enzima conocido.

EC 4.1.1.89 biotin-dependent malonate decarboxylase

(25 November 2008)
Nombre sistemático:

En nombre sistemático consta de tres partes:

a) sustrato sobre el que actúa la enzima,
b) acción química que cataliza,
c) terminación universal –ase (en inglés) –asa (en español).
Ejemplo:
G-6-P  F-6-P
Sustrato: Glucosa-6-P Acción: Isomerización
Nombre: glucosa-6-fosfato isomerasa

* Al ser la reacción reversible, esta enzima también podría haberse

nombrado como:fructosa-6-fosfato isomerasa, en cuyo caso el
sustrato sería la Fructosa-6-P
* Algunas normas a tener en cuenta a la hora de escribir el
nombre sistemático de una enzima:
1. Usar para el sustrato(s) nombres triviales, o incluso
abreviaciones, cuando éstas sean de uso general y corriente:
ATP, NAD+.
2. Usar el verdadero nombre del sustrato, (teniendo en cuenta el
pH a que se encuentra):
acetato vs ácido acético ; lactato vs ácido láctico
3. Cuando el nombre del sustrato esté formado por más de una
palabra, usar guiones para mantener el nombre formando una
unidad.
Glucosa-6-fosfato ; Fructosa-6-fosfato
4. Cuando el sustrato tenga sustituyentes en su molécula, indique
la posición con números: 1,2,3, ... no como alfa, beta, gamma,
etc.
Excepciones a esta regla son:
beta-aspartil y gamma-glutamil;
beta-alanina y gamma-lactona.
- En relación con el nombre de la reacción química catalizada:

1. El nombre debe indicar el tipo de reacción que cataliza la

enzima de acuerdo con la siguiente lista:
1. Oxidorreductasas
2. Transferasas
3. Hydrolasas
4. Liasas
5. Isomerasas
Mutasas
Racemasas
Epimerasas
6. Ligasas
Código numérico:
El código de cada enzima empieza por las letras EC (Enzyme
Commission) seguidas de cuatro números:

EC.n1.n2.n3.n4.
* El primero, n1, indica la clase de reacción, de acuerdo con el siguiente
esquema:
1. Oxidoreductasas
2. Transferasas
3. Hidrolasas
4. Liasas
5. Isomerasas
6. Ligasas o sintetasas.
* Las tres primeras clases catalizan reacciones de transferencia del
tipo
Ax + B ------ A + Bx
* En el caso de las oxidorreductasas “x” consiste en equivalentes de
oxidación-reducción (electrones, hidrógenos).

* Mientras que en las transferasas e hidrolasas son grupos químicos

los que se transfieren.
* Las transferasas transfieren grupos químicos de un sustrato a otro
sustrato, siendo el segundo sustrato distinto del agua

* Las hidrolasas se caracterizan por la ruptura de un enlace con la

adición de agua.
* Las liasas catalizan la eliminación de grupos del sustrato mediante la
ruptura de enlaces, que, en algunos casos, lleva consigo la creación de
dobles enlaces:

HZ-Y-X ---- Z=Y + XH

Grupo saliente

* En sentido contrario catalizan la formación del enlace Y-Z mediante

adición al doble enlace, Z=Y.
 * Las isomerasas catalizan reacciones de isomerización.

* De acuerdo con el tipo de isomerización en concreto, las isomerasas

podrán ser:
- Racemasa
- Mutasas
- Epimerasas
* Las ligasas o sintetasas catalizan la formación de enlaces acoplada a
la hidrólisis de ATP:

XH + YOH + ATP --- X-Y + ADP + Pi (ó AMP + PPi)

 * Veamos a continuación algunas recomendaciones en relación con la
manera de escribir el nombre de una enzima.
- Para lo que tendremos en cuenta las siguientes recomendaciones:

* Las Oxidorreductasas, EC.1 deben nombrarse de acuerdo con el

siguiente convenio:
Donador de e- : Aceptor de e- Oxidorreductasa

Ejemplo: Lactato:NAD+ oxidorreductasa

Nota:
Si no se conoce el verdadero aceptor de electrones, usar “(aceptor)”

Ej.: Succinato : (aceptor) Oxidorreductasa.

* Respecto a los nombres triviales hay que indicar los siguiente:
a) Deshidrogenasas: el aceptor es un coenzima de oxidación-
reducción.
b) Oxidasas: el aceptor es el oxígeno molecular.
c) Reductasas: el donador es NADH o NADPH.
d) Oxigenasas: incorporan oxígeno molecular en el donador;
(monooxigenasas o dioxigenasas, según incorporen
uno o dos átomos de oxígeno).
e) Hidroxilasas: son un tipo de monooxigenasas.
f) Desciclantes: dioxigenasas que rompen ciclos aromáticos.
g) Rompedoras de enlace: dioxigenasas que rompen enlaces
C-C alifáticos;
h) Peroxidasas: el aceptor es el agua oxigenada.
i) Hidrogenasas: el donador es el hidrógeno molecular.
* Las Transferasas, EC.2 deben nombrarse de acuerdo con el siguiente
convenio:
Donador : Aceptor Grupo-transferido-transferasa

Ej.: ATP : acetate fosfotransferasa

* Las subclases se establecen según la naturaleza del grupo transferido.

- En la nomenclatura trivial se puede sustituir la expresión “ grupo
transferasa” por “trans grupo asa”:
aminotransferasa por transaminasa

* Las subclases específican un poco más la naturaleza del grupo

transferido

* Veamos algunos nombres triviales:

a) Transaminasas: transfieren grupos aminos.
b) Fosfotransferasas: transfieren grupos fosfatos.
c) Transcetolasa: transfieren grupos glicoaldehídicos
(CH2OH-CO-)
d) Transaldolasas: transfieren grupos dihidroxiacetona
(CH2OH-CO-CHOH-).
e) Quinasas: transfieren grupos fosfato con el ATP como
donador.
f) Tioforasas: transfieren CoA.
g) Fosforilasas: tienen al fosfato como aceptor del grupo
transferido.
* Las Hidrolasas, EC.3 deben nombrarse de acuerdo con el siguiente
convenio:
Sustrato hidrolasa o
Sustrato grupo-eliminado-hidrolasa

Ej., Adenosina amino-hidrolasa

* Las subclases se establecen según la naturaleza del enlace

hidrolizado y las subsubclases concretan un poco más la naturaleza
de este enlace.

* En el caso de las proteasas las subsubclases se establecen según el

mecanismo catalítico pues la complejidad del sustrato (proteína) hace
inviable una clasificación basada en la naturaleza del mismo.

* Los nombre triviales más importantes son:

a) Fosfatasas: rompen enlaces del tipo monoésteres
fosfóricos (R-O-PO3H2).

b) Fosfodiesterasas: rompen enlaces del tipo diésteres

fosfóricos (R-O-PO2H-O-R’).

c) Pirofosfatasas: rompen enlaces del tipo monoésteres

difosfóricos (R-O-PO2H-PO3H2).

d) Aminopeptidasas: -aminoacilpéptido hidrolasas,

rompen enlaces peptídicos a partir delextremo N-
terminal

e) Carboxipeptidasas: peptidilaminoácido hidrolasa que

rompen enlaces peptídicos a partir delextremo C-
terminal.
 * Las Liasas, EC.4 deben nombrarse de acuerdo con el siguiente
convenio:
Sustrato grupo-eliminado-liasa
Ej., L-malato hidro-liasa

- En la reacción:
HZ-Y-X  Z=Y + XH
Se considera como grupo eliminado, o saliente, Z=Y o XH según
cual de las dos moléculas sea más pequeña.

* Las subclases se establecen según el tipo de enlace Y-X que se

escinde y las subsubclases según el grupo eliminado.

Los principales nombres triviales son:

a) Descarboxilasas: carboxil-liasas, eliminan grupos
carboxilos.

b) Aldolasas: aldehido liasas, eliminan grupos aldehídicos.

c) Dehidratasas: hidroliasas, eliminan agua.

d) Deaminasas: aminoliasas, eliminan grupos aminos.

* Las Isomerasas, EC.5, se clasifican y nombran según el tipo de
isomerización que catalizan, nombrandose de acuerdo con los
siguientes convenios:
i) Sustrato tipo-de-isomerización-isomerasa
Ej.: Maleato cis-tras-isomerasa

ii) Sustrato racemase (convierte formas D & L)

Ej.: Alanina racemasa

iii) Sustrato epimerasa (invierte un centro óptico sencillo

en una molécula con más de uno de dichos centros)

Ej.: Glucosa epimerasa

iv) Sustrato mutasa (transferencia intramolecular de grupo)

Ej.: Metil-malonil-CoA mutasa

 * Las Ligasas o sintetasas, EC.6, se clasifican según el tipo de
enlace que forman entre los sustratos, y deben nombrarse de
acuerdo con el siguiente convenio:

Molécula-1 : Molécula-2 ligasa (nucleótido producido)

Ej., Alanil : tRNA ligasa (AMP)

* La denominación sintetasa se ha aplicado frecuentemente a

enzimas que determinan la formación de un enlace por mecanismos
distintos a los de las verdaderas sintetasas, como por ejemplo a
muchas transferasas y a liasas consideradas en sentido inverso.

* La CE reserva el término “sintetasa” para la formación de enlaces

acopladas a la hidrólisis de ATP, utilizando en los otros casos,
siempre que se quiera recalcar el aspecto sintético, la denominación
de “sintasa”.
* Veamos a continuación la adjudicación de los cuatro números del
código EC:

n1 --> tipo de reacción (1 a 6)

n2 --> tipo de enlace que se rompe o forma (1 a n)
n3 --> subtipo de enlace que se rompe o forma ( 1 a n)
n4 --> número de orden o catálogo
Direcciones de InterNet:
http://www.expasy.ch/enzyme/

http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/
Ejemplos:

Fosfatidil-colina + H2O  1-Acilglicerol-fosfocolina + Acido

Graso
R1 R1

2 R + H2O  HO + 2R-COOH

P Colina P Colina

Nombre sistemático: Fosfatidil-colina-2-acil-hidrolasa

EC. __.__.__.__
3 1 1 X
3  Hidrolasa
3.1  Rompe o hidroliza un enlace
de tipo ester
3.1.1  el enlace ester es del
subtipo ester carboxílico
3.1.1.X  Nº orden
 7. Formas multiples de una enzima: Isoenzimas
Definición:
Según el Diccionario de Oxford de
Bioquímica y Biología Molecular

Isoenzimas o Isozimas son “cualquiera de las múltiples formas de

una enzima, proveniente de diferencias determinadas genéticamente
en la estructura primaria”.
* El término Isoenzima es un término operacional, que hace
referencias a un conjunto de enzimas (con el mismos código EC) que
catalizan la misma reacción en la misma célula o en el mismo
* El término Isoenzima abarca organismo.
también a las alelozimas, que se definen
“como cualquiera de dos o más variantes de una enzima particular (con
propiedades catalíticas semejantes) cuyas secuencias de aminoácidos
están codificadas en genes alélicos.
Localización de las Isoenzimas
Las isoenzimas podemos encontrarlas:
1. En la misma célula y en el mismo compartimento, como ocurre
con las isoenzimas de la enzima Lactato deshidrogenasa
(EC 1.1.1.27) que se encuentran todas en el citosol.

2. En la misma célula pero en diferentes compartimentos

celulares, como es el caso de Glutamato oxalacetato
transaminasa (EC 2.6.1.1) que se encuentra en el citoplasma y
en las mitocondrias.

3. En diferentes tejidos de un mismo organismo, como es el caso

de la Glutaminasa activada por fosfato (EC. 3.5.1.2) de la
que existen dos tipos, tipo riñon (K) y tipo higado (L).

4. En el mismo individuo y en el mismo tejido, pero en diferentes

fases del desarrollo, como es el caos de la Piruvato
quinasa (EC 2.7.1.40), de la que se conocen dos formas la fetal y la
adulta.
 Así pues, cada código numérico de la clasificación EC, por
ejemplo, EC.3.2.1.21, no representa una sola especie de proteína
enzimática sino a un grupo de proteínas con la misma propiedad
catalítica, pero difiriendo en mayor o menor grado en la
especificidad de sustrato y otras propiedades cinéticas, así como
en la estructura proteica.

¿De dónde procede esta multiplicidad o diversidad?

* Una primera fuente de multiplicidad es la especie (animal,
vegetal o microbiana) de la cual procede la enzima.
Pero esto está ya contemplado por el cuarto número del código EC.
* Dentro de una misma especie pueden existir también formas
múltiples de una enzima.
Cuando esta multiplicidad intra-especie se debe a una multiplicidad en
los genes que controlan la estructura primaria de la proteína, las
distintas formas se denominan isoenzimas.
Hay tres tipos de isoenzimas:

a) Los codificados por genes distintos, como las dos

formas de la malato-DH existentes en el citoplasma y en la
mitocondria de las células eucarioticas.

b) Los procedentes de variantes alélicos de un mismo

gen, como ocurre con las isoenzimas de la glucosa-6-P-DH
humana.

c)Los procedentes de heteropolímeros de dos o más

cadenas polipeptídicas, cada una de las cuales es
codificada por un gen distinto. Así la Lactato-DH humana
es un tetrámero con dos tipos de subunidades distintas, H y
M, que están codificadas por dos genes distintos. Pueden
existir cinco tipos de isoenzimas: M4, M3H, M2H2, MH3,
H4.
* Otro tipo de multiplicidad enzimática es el debido a modificaciones
post-traducionales de las enzimas, que pueden ser de varios tipos:
a) Conjugación con grupos no prostéticos, como ocurre con las
enzimas llamadas “interconvertibles” porque pueden existir en dos
estados según estén o no conjugadas a un grupo no prostético. Así,
la forma “a” de la fosforilasa difiere de la forma “b” en contener
grupos fosfato.
 b) Distintas conformaciones de una proteína.
c) Distinto grado de polimerización de una subunidad
común. Así la glutamato-DH puede existir como polímero
de 6 o 24 subunidades idénticas.

d) La familia de proteínas ligeramente distintas que

derivan de la proteolisis de un precursor, como p. ej., las
distintas quimotripsinas. En estos casos el precursor se
nombra con el prefijo “pre-“ o el sufijo “-ógeno”
(quimotripsinógeno, protrombina).

* Vemos por tanto que para especificar claramente a una proteína

enzimática hay que indicar no sólo su nombre sistemático y código
numérico, sino también la especie de que procede y el tipo de
isoenzima o modificación post-traduccional a que corresponde.
* Las isoenzimas suelen caracterizarse por su movilidad electroforética,
ya que un cambio de aminoácidos o una modificación, puede afectar la
carga de la molécula.

* Cuando en una electroforesis se separan varias bandas con la misma

actividad enzimática, las isoenzimas se suelen numerar a partir del ánodo
(isoenzima-1, isoenzima-2, ....).
 8. ENZIMAS NO CONVENCIONALES
Ribozimas
* En efecto, a mediados de los años 80, Arthur Zaug y Thomas Cech comunicaban,
en la revista Science, el descubrimiento de que moléculas de RNA también pueden
tener capacidad catalítica y comportarse como biocatalizadores muy activos.
Thomas Cech descubrió que el RNA L-19 cataliza la hidrólisis del RNA de
manera específica y es capaz de también de ejercer acción polimerasa.
Ribozimas en
cabeza de
martillo
Abzimas
* Los estudios sobre el mecanismo de acción de las enzimas, como
complementarias del estado de transición de los sustratos, tal como ya
había sugerido Pauling en 1948, llevó a varios investigadores, en la
década de los 80, a producir anticuerpos monoclonales frente a
haptenos, análogos estructurales al estado de transición de algunos
sustratos.
Estos anticuerpos que tienen propiedades catalíticas reciben el nombre
de “abzimas” y son, a su vez, fuertemente inhibidos por los haptenos
Tipos de reacciones catalizadas
Rotura de enlaces éster, adiciones, eliminaciones, condensaciones
aldólicas, oxido-reducciones y algunas transformaciones
dependientes de cofactor.

bzimas naturales
Actividades Dnasa, Rnasa e hidrólisis de polisacáridos en
pacientes con enfermedades autoinmunes (lupus, esclerosis
múltiple, artritis reumatoide...) y personas infectadas por VIH .
 Sinzimas
* enzimas artificiales reciben el nombre de “sinzimas”, y
puede que en el futuro sean la solución a algunos de los
problemas que actualmente presenta el uso de las enzimas a
nivel médico-farmacéutico e industrial.

Ejemplos:
Proteínas derivatizadas [Ru(NH3)5]3+ unido a Histidina
Mioglobina (transportador pasivo de oxiogeno) se convierte en una oxidasa
Ácido ascorbico es oxidado con oxigeno molecular.
Synzymes from organic molecules:
Ciclodextrinas estructuras con un exterior hidrofílico y un interior
hidrofóbico.
Piridoxal es anclado en el interior muestra actividad transaminasa.