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Las proteínas de unión al ADN pueden servir como La secuencia de ADN de la mayoría de los genes
represoras o activadoras de la transcripción, y pueden supera con creces la longitud necesaria para codificar
unirse al promotor, a las regiones reguladoras sus correspondientes proteínas. Esto se explica por el
anteriores o a potenciadores más distantes. Las hecho de que la secuencia de codificación se rompe
proteínas activadoras o represoras se regulan en segmentos, llamados exones, que son
mediante la unión de ligandos específicos. La unión de interrumpidos por segmentos llamados intrones.
los ligandos cambia la confirmación del factor de Algunos exones pueden tener menos de cien bases de
transcripción y puede activarlo o desactivarlo. El longitud, mientras que los intrones pueden tener
ligando es típicamente una pequeña molécula, como varios miles de bases de longitud.
una hormona. Muchos factores de transcripción
Por lo tanto, gran parte de la longitud de un gen
funcionan como un dúo para formar dímeros. Pueden
puede estar dedicada a los intrones no codificantes. El
ser homodímeros de dos proteínas idénticas, o
número de exones en un gen puede ser tan poco
heterodímeros de dos proteínas diferentes. También
como uno o dos, o puede estar en las docenas. El
puede haber proteínas corepresoras o coactivadoras.
procesamiento de la transcripción de ARN en ARNm
Algunos factores de transcripción permanecen en el
maduro requiere la eliminación de los intrones y el
citosol hasta que se produce el ligando o algún otro
empalme de los exones (Figura 1.10). Esto se lleva a
proceso de activación, momento en el que se
cabo mediante un proceso enzimático que se produce
desplazan al núcleo para la activación de su gen diana.
en el núcleo. El extremo 5′ de un intrón siempre
En otras situaciones, los factores de transcripción
consiste en las dos bases GU, siguiendo una secuencia
residen en el núcleo la mayor parte del tiempo e
consensuada que es similar, pero no idéntica, en
incluso pueden estar situados en las secuencias del
todos los intrones. Este es el donante de empalme. El
elemento de respuesta, pero sin el ligando están
extremo 3′, el aceptador de empalme, termina en AG,
inactivos o incluso reprimen la transcripción.
precedido por una secuencia de consenso.
La transcripción comienza con la unión de la enzima
El proceso de empalme requiere una compleja
ARN polimerasa al promotor (Figura 1.9). Hay tres
maquinaria compuesta tanto de proteínas como de
tipos principales de ARN polimerasa, designados como
pequeñas moléculas de ARN (pequeño ARN nuclear, o
tipos I, II y III.
snRNA), que consiste en menos de 200 bases. El
La mayor parte de la transcripción de genes se realiza snRNA también es transcrito por la ARN polimerasa II.
mediante la ARN polimerasa II. El tipo I participa en la El empalme se inicia por la unión de un complejo de
transcripción del ARNr que reside en el ribosoma y el proteína-ARN al donante del empalme, en un punto
tipo III transcribe el ARN de transferencia (ARNt) dentro del intrón llamado punto de ramificación, y el
(véase más abajo). La polimerasa lee la secuencia de aceptador del empalme. Primero el ADN es cortado
la cadena de la plantilla de ADN, copiando una en el sitio del donante y éste se une en un enlace 5′-2′
molécula de ARN complementaria, que crece desde la al punto de ramificación. Luego el sitio aceptor se
dirección 5′ a la 3′. El ARNm resultante es una copia divide, liberando una estructura de lazo que se
exacta de la secuencia de ADN, excepto que el uracilo degrada posteriormente, y los extremos 5′ y 3′ se
toma el lugar de la timina en el ARN. unen. El proceso de empalme también requiere la
función de las proteínas, las proteínas SR, que
Poco después de que comience la transcripción, un
participan en la selección de los sitios para el inicio del
residuo de 7-metil guanina se adhiere a la base de 5′,
empalme. Estas proteínas interactúan con secuencias
formando la "tapa". La transcripción procede a través
conocidas como potenciadores del empalme o
de toda la secuencia de codificación. Algunos genes
silenciadores. El proceso de empalme es vulnerable a
incluyen una secuencia cerca del extremo 3′ que
la interrupción por mutación, como podría predecirse
señala la división del ARN en ese sitio y la adición
por su complejidad.
enzimática de 100 a 200 bases de adenina, la "cola
poli-A". La poliadenilación es característica de los El proceso de empalme de ARN ofrece un punto de
genes de housekeeping, que se expresan en la control de la expresión genética. Bajo la influencia de
las moléculas de control presentes en células parte de otra molécula de ARN llamada ARN de
específicas, determinados exones pueden estar transferencia (ARNt). Las moléculas de ARNt se unen a
incluidos o no en el ARNm debido al empalme aminoácidos específicos definidos por su secuencia de
diferencial (figura 1.11). Esto da lugar a la posibilidad anticodón (Tabla 1.1). Por lo tanto, la traducción de
de producir múltiples proteínas diferentes del mismo las proteínas consiste en la unión de un ARNt
gen, lo que aumenta enormemente la diversidad de específico al codón apropiado, que yuxtapone el
proteínas codificadas por el genoma. Los exones siguiente aminoácido en el péptido en crecimiento, el
específicos pueden corresponder a determinados cual está unido enzimáticamente por un enlace de
dominios funcionales de las proteínas, lo que conduce amida al péptido. El proceso termina cuando se
a la producción de múltiples proteínas con diversas alcanza un codón de parada (UAA, UGA o UAG). El
funciones a partir del mismo gen. Algunos ARNm péptido es entonces liberado del ribosoma para ser
están sujetos a la edición de ARN, en la que una base transportado al sitio apropiado dentro de la célula, o
específica puede ser modificada enzimáticamente. Por para ser secretado por la célula. Una secuencia de
ejemplo, la proteína apolipoproteína B existe en dos péptido líder puede dirigir la proteína a su destino
formas, una forma de 48-kDa hecha en el intestino y final en la célula; este péptido se escinde al llegar. La
una forma de 100-kDa en el hígado. Ambas formas modificación post-traducción, como la glicosilación,
son el producto del mismo gen. Sin embargo, en el comienza durante el proceso de traducción y continúa
intestino, la enzima citidina deaminasa altera una C a después de que la traducción se haya completado.
una U en el codón 2153, cambiando el codón de CAA
El proceso de traducción consta de tres fases,
(que codifica la glutamina) a UAA (un codón de
denominadas iniciación, elongación y terminación. La
parada).
iniciación implica la unión del primer aminoácido
Esto trunca el péptido, dando cuenta de la forma de tRNA, que siempre lleva metionina, al codón de
48-kDa. Recientemente, otro mecanismo de la iniciación, siempre AUG. Un conjunto de proteínas,
regulación post-transcricional, llamada interferencia denominadas factores de elongación, participan en el
de ARN, también se ha identificado (Temas de la proceso, que también requiere ATP y GTP. El ribosoma
actualidad1.1). se une al ARNm en dos codones sucesivos. Uno se
designa como el sitio P y lleva la cadena peptídica en
Traducción
crecimiento. El otro es el siguiente codón, designado
El ARNm maduro se exporta al citoplasma para su el sitio A. La elongación implica la unión del siguiente
traducción en proteína. Durante la traducción, la aminoácido tRNA a su anticodón en el sitio A. Esto
secuencia de ARNm se lee en la secuencia de entrega el siguiente aminoácido de la cadena
aminoácidos de una proteína (Figura 1.13). La peptídica, que se une al péptido en crecimiento, con
maquinaria de traducción consiste en un complejo de la formación de un enlace peptídico catalizado por la
proteína-ARN llamado ribosoma. Los ribosomas peptidil transferasa. El ribosoma pasa entonces al
consisten en un complejo de proteínas y moléculas siguiente codón bajo la acción de una translocasa, con
especializadas de ARN ribosómico (ARNr). El ribosoma la energía proporcionada por el GTP. Cuando se
eucariota está compuesto por dos subunidades, alcanza un codón de parada, un complejo de proteína-
designadas 60S y 40S (la "S" es una medida de factor de liberación-GTP se une y la peptidil
densidad, la unidad Svendborg, que refleja cómo se transferasa agrega un OH al final del péptido, que
caracterizaron inicialmente los complejos). luego es liberado del ribosoma bajo la influencia de
las proteínas llamadas factores de liberación.
Cada subunidad incluye proteínas y una molécula de
ARNr. La subunidad 60S incluye un 28S rRNA y la Inactivación e impresión de genes
subunidad 40S y el ARNr del 18S. Los ribosomas
Los genes individuales pueden ser activados o
pueden ser libres o estar asociados con el endoplasma
reprimidos de forma reversible, pero hay algunas
retículo (ER), también conocido como "ER áspero".
situaciones en las que los genes o conjuntos de genes
La secuencia del ARNm se lee en trillizos, llamados son silenciados permanentemente. Esto ocurre en una
codones, comenzando en el extremo 5′ del ARNm, de las dos copias del cromosoma X en las mujeres, y
que siempre es AUG, codificando la metionina en la copia materna o paterna de un conjunto de
(aunque este residuo de metionina a menudo se genes que se dice que están impresos. El
escinde más tarde). Cada codón se corresponde con silenciamiento de los genes va acompañado de la
un anticodón complementario particular, que forma metilación de las bases de citosina a 5-metilcitosina
(figura 1.14). Esto ocurre en regiones donde la citosina aplicarse sólo a un pequeño subconjunto de genes,
es seguida por la guanina (5′-CpG-3′) cerca del aunque todavía no se conoce el alcance total de la
promotor, sitios denominados islas CpG. Los sitios impronta.
metilados se unen a los complejos de proteínas que
CONCLUSIÓN
eliminan los grupos acetilos de las histonas, lo que
conduce a la represión transcripcional. El Más de medio siglo de investigación en biología
silenciamiento continúa de generación en generación molecular ha dado como resultado un cuadro
de las células porque las enzimas responsables de la detallado de los mecanismos de la estructura y
metilación reconocen la 5-metilcitosina en la hebra función de los genes. Gran parte del resto de este
parental del ADN y metilan la citosina en la hebra hija libro se dedicará a la exploración de las implicaciones
recién sintetizada (Figura 1.15). de la disfunción a nivel del gen o grupos de genes y
sus interacciones con el medio ambiente. Veremos
La inactivación del cromosoma X proporciona un
también que la investigación genética se está
mecanismo para igualar la dosis de genes en el
moviendo hacia un nuevo nivel de integración de los
cromosoma X en los hombres, que tienen un X, y en
mecanismos moleculares básicos, hacia la formación
las mujeres, que tienen dos. La mayoría de los genes
de un panorama de cómo funcionan las células en su
de uno de los dos cromosomas X de cada célula de la
conjunto y los organismos. Sin embargo, es
mujer están permanentemente inactivados al
importante darse cuenta de que algunos mecanismos
principio del desarrollo (figura 1.16). La inactivación
moleculares fundamentales, como el papel de los
del X particular en cualquier célula se determina al
pequeños ARN y la impronta genómica, se han
azar, de modo que en aproximadamente el 50% de las
descubierto sólo en el último decenio
células un X está inactivado y en el otro 50% el otro X
aproximadamente. Incluso a medida que avanza el
está inactivado. Las regiones de homología entre el X
esfuerzo hacia una integración en mayor escala,
y el Y en los dos extremos del X escapan a la
queda mucho por aprender acerca de los mecanismos
inactivación. Estas se denominan regiones
moleculares fundamentales a nivel del gen.
pseudoautomáticas. El X inactivo permanece
condensado durante la mayor parte del ciclo celular, y
puede ser visualizado como un cuerpo densamente
manchado durante la interfase, conocido como el
cuerpo de Barr.