CONSORCIO T2T

NUEVOS AVANCES EN LA SECUENCIACIÓN DEL GENOMA HUMANO

Carmen De la Iglesia Martín, Marta Gómez Fleitas, Claudia Pérez-Falces López, Sandra Rodríguez-Parets Mazo y Daniela Seghers Niebla
01 INTRODUCCIÓN AL CONSORCIO T2T
o
o
Línea celular chm13
Tecnologías empleadas

02 PRIMERA SECUENCIA COMPLETA DEL

GENOMA HUMANO ÍNDICE
03 REGIONES REPETITIVAS Y CENTRÓMEROS.
CROMOSOMAS ACROCÉNTRICOS

04 APLICACIONES

05 RETOS A FUTURO
CONSORCIO T2T

T2T “telómero a telómero”

más de 100 investigadores de 32 instituciones

diferentes.

Objetivo completar aquellos huecos

KAREN MIGA ADAM PHILLIPPY desconocidos que existían en la secuencia de
Universidad de california instituto Nacional de referencia GRCh38
Investigación del Genoma
santa cruz
Humano (NHGRI)

2019
LÍNEA CELULAR EMPLEADA CHM13

Mola hidatidiforme Homocigosis

OXFORD NANOPORE

1 La hebra de adn
atraviesa el nanoporo 3 Información en
tiempo real

2 Se mide la corriente
eléctrica mediante un
capaz de leer un
sensor
millón de bases
de ADN

Menor precisión
Pacbio hifi

1 Doble hebra de
adn 4 Adn
circular

2 Se añaden los
adaptadores 5 Lectura de la
polimerasa

3 Primer y
polimerasa
Secuenciación hifi
99,9% de precisión
 PROYECTO GENOMA HUMANO

• INICIO: 2000
2003 descifrado 92%.

• OBJETIVO: Localizar y secuenciar los genes para conocer la estructura, organización y

fusión.

• APLICACIONES:
➢ Resistencia a padecer una enfermedad.
➢ Estrategias para el control de enfermedades.
➢ Desarrollo de formas de diagnostico y prevención.
➢ Tratamientos personalizados de las enfermedades.
PUBLICACIÓN DE LA PRIMERA SECUENCIACIÓN COMPLETA DEL
GENOMA HUMANO: “REVISTA SCIENCE”

Publicación de la noticia en la revista Science: “Filling the gaps”

EVOLUCIÓN EN LA SECUENCIACIÓN DEL GENOMA HUMANO

GRCh 38 CHM 13

92% 8% 100%
• “Zona gris del mapa genético”
• Regiones altamente repetitivas
difíciles de secuenciar.
Genes codificantes de proteínas
Visión completa de los centrómeros
• Contiene Brazos cortos acocéntricos de los cromosomas
13, 14, 15 y 21
EVOLUCIÓN EN LA SECUENCIACIÓN DEL GENOMA HUMANO
SECUENCIA COMPLETA DEL GENOMA
HUMANO

Esta gráfica representa la evolución de la

secuenciación del genoma humano a lo largo de los
años las nuevas bases que se han ido descubriendo
hasta llegar a la secuencia completa denominada
CHM13.
APLICACIONES E IMPACTO EN LA MEDICINA ACTUAL

INICIO DE LA ERA GENÓMICA

1 FARMACOGENÓMICA o 2 ENERMEDADES
MEDICAMENTOS A LA
GENÉTICAS RARAS
CARTA
APLICACIONES E IMPACTO EN LA MEDICINA ACTUAL
ENFERMEDADES GENÉTICAS RARAS
• 350M de personas en el mundo.
• 200K personas diagnosticadas.
• 80% por causas genéticas.
• Comparación del genoma: descubrimiento de genes causantes de
enfermedades.
Ejemplos:
Fibrosis quística (gen CFTR)
Tratamiento: Atrofia muscular espinal
APLICACIONES E IMPACTO EN LA MEDICINA ACTUAL

FARMACOGENÓMICA
MEDICINA PERSONALIZADA

DOSIS EFICACIA

TIPO DE
TOLERANCIA
TRATAMIENTO
RETOS A FUTURO
NUEVO RETO
CONSORCIO T2T
GENOMA ACTUAL: GRCH38 +
NO REPRESENTA LA CONSORCIO PANGENOMA HUMANO DE
DIVERISDAD GENÉTICA REFERENCIA

GENOMA DE REFERENCIA QUE

MUESTRE TODA LA VARIACIÓN
GENÉTICA DE LOS HUMANOS
HPRC

350 personas
La detección de las distintas variantes
estructurales es complicada

Secuencias idénticas o que se

superponen

Combinación y mejora de
técnicas
MEJORA EN EL PRECISIÓN

ASPECTO
MÉDICO ERRORES

Diagnóstico genético y RIESGO ENFERMEDADES

anotación de variantes O VARIANTES RARAS