CUARTO TALLER DE GENETICA
Taller de dogma central de la biología molecular, daños y reparación del ADN.
1. Complete la siguiente tabla:
*** Con respecto al mecanismo de reparación, mencione a que hacen referencia
las siglas como se observa en el segundo mecanismo.
*** Con respecto a las proteínas clave describa:
a. Cuales se comportan como proteínas que son sensores del daño.
b. Mencione las proteínas involucradas en la reparación de este específico tipo de
daño.
Mecanismo de Tipo de lesión /lesiones
Reparación sobre la que actuaría.
Reparación directa Fotoproductos UV,
metilación de la guanina
BER. Reparación por Oxidación, metilación,
escisión de bases (Base desaminación y pérdida
Excision Repair) espontánea de una base de
DNA formando lo sitios AP
NER. Reparación por daños del DNA que impiden
escisión de nucleótidos la replicación y causan
distorsiones estructurales;
Lesiones voluminosas de
DNA inducidas por radiación
UV, mutágenos
ambientales, y ciertos
agentes quimioterapéuticos.
MMR. Reparación de Daños en el
Proteínas .Clave
P. involucradas en reparación:
Fotoliasa, metilguanina ADN
metiltransferasa.
P. sensoras de daño: ATR
(ataxia-telangiectasia and Rad3
related protein kinase)
P. involucradas en reparaciòn:
● DNA glicosilasa
● AP-Endonucleasa
● exonucleasa
● Polβ
● Ligasas Iy III
● DNA polimerasa
P. sensoras de daño: DNA
glicosilasa
P. involucradas en reparaciòn:
Factor de transcripciòn TFIIH
conformado por las proteinas
(XPB,XPD, GTF2H2, GTF2H3,
GTF2H4, CDK7, CCNH, y MNATI),
XPG, complejo XPF-ERCCI
● Helicasa
● DNA pol I, Polδ,
● Ligasa I
P. sensora de daño: XPC-,
HR23B, RPA-XPA
● Homólogo eucariota de
apareamientos erróneos; emparejamiento de bases
Mismatch repair durante la replicación del
DNA, y pequeños bucles
por error de la DNA pol
MutS
● Homólogo eucariota de Mutl
● proteína sensora de daño:
- hMSH2-MSH6 (MutSα)
-hMSH2-MSH3 (MutS β)
Proteína de reparación:
antígeno nuclear de células
en proliferación, la proteína
de replicación A, el factor de
replicación C, DNA
polimerasas delta/épsilon,
exonucleasa 1,
endonucleasa FEN 1

HR Homologous Radiación ionizante ● P. sensoras:Complejo

recombination; Agentes químicos MRNX, ATM/ATR, H2AX
Recombinación homologa ● P. Involucradas en
reparación: MRE11-Rad5-
NBS1, Rad52, Rad51, RPA,
P53
Cdc25

NHEJ Reparación por unión Ruptura de la doble cadena, P. sensoras: KU80, KU70
de los extremos no inducidas por radiación o P. involucradas reparación:
homólogos químicos Complejo MRNX, DNA ligasa con
XRCC4, XRCC7, MRE11-Rad5-
NBS1, y FEN1

Vía de señalización del Rupturas de doble cadena P. sensoras: ATM,MRN y CHK2

daño al ADN mediada por P. Involucradas en reparación:
ATM MDC1, 53BP1, MCPH1/BRIT1
Ubiquitin ligasas: RNFS,
RNF168/RIDDLIN y BRCA1

2. Dentro de las patologías que se originan por alteración en la reparación del DNA
por escisión de nucleótidos, se encuentra el síndrome de Cockayne describa.

a. El espectro fenotípico de esta entidad.

Crecimiento lento y anormal que se denota al después de unos años tras el
nacimiento, sufren de caquexia (Pérdida de peso corporal, masa muscular y
debilidad); sufren de fotosensibilidad; cabello seco y delgado; son progeriodes
( peso y talla prenatales bajos, macrocefalia relativa, cara triangular y envejecida,
neurodesarrollo con retraso y muerte prematura en la infancia); tienen retinopatía
pigmentaria (degeneración progresiva de fotorreceptores); caries dentales; pérdida
de la audición; presentan extremidades 3 largas; por las piernas largas presentan
una postura en varo;desarrollo mental retardado y degenerativo, rasgos dismórficos
típicos incluyen: microcefalia, orejas grandes, nariz fina y enoftalmia; mueren
alrededor de los 12,5 años
b. Los genes relacionados a la fecha, con su correspondiente localización
cromosómica. ERCC (DNA excision repair protein/proteína de reparación del
DNA por escisión)
ERCC6-cromosoma 10q11
ERCC5-cromosoma 13q33
ERCC3-cromosoma 2q21
ERCC4-cromosoma 16p13

5q12.1; 10q11.23; 2q14.3; 16p13.12; 13q33.1; 4p16.3; 5q14.2; 9q22.33;3p25.1;

10q11.23; 19q13.32; 1p33-p31.1; 17p13.1; 5q35.3; 2q21.3; 8p12; 5q12.1; 20p12.3;
17p13.1; 12q13.13; 17q21.2; 17q25.1; 5q31.1; 8q22

c. El mecanismo de herencia.
Es de herencia poligénica es decir que para que se dé puede haber uno o más
genes alterados de la cantidad de genes alterados también dependerá la gravedad
del fenotipo; se da por mutaciones missense o nonsense.
Transmisión es autosómica recesiva

3. La hemofilia es debida a mutaciones en los genes Factor XIII (tipo A) y Factor IX

(tipo B). Investiga
las principales mutaciones en estos genes, qué tipo de mutación son (emplea
varios criterios), cómo afecta la proteína y su función.
● Hemofilia A(F8)
También denominada hemofilia clásica, gen F8 (Xq28), que codifica para el factor de
coagulación VIII,
Mutaciones en el gen
Inversión intrón 1
Resulta de la recombinación intracromosómica entre una secuencia de 1 kb en el
intrón 1 (int1h1) y una secuencia homóloga (inth1h2) distanciados por 140 kb
aproximadamente en sentido 5’. Esta inversión ha sido descrita en
aproximadamente el 5% de los pacientes con hemofilia A grave.

Inversión intrón 22(Grave): se produce produce debido a la existencia de dos

regiones (int22h2 e int22h3) localizadas a unas 400 Kb del gen F8 hacia la región
telomérica, homólogas a una secuencia que se encuentra en el intrón 22 (int22h1)
pero en orientación opuesta. La inversión tiene lugar por una recombinación
homóloga intracromosómica entre int22h1 y una de las dos copias teloméricas,
resultando un gen F8 truncado a partir del exón 22 F8A y F8B

Deleción en el exón 14, es una mutación de tipo Frameshift, afectan a secuencias de

adeninas del exón 14, en menos de 50pb, hay un cambio en el nucleótido A, el exón 14
codifica el dominio B, se extiende entre los aa 741-1 648, este dominio contribuye a
múltiples funciones esenciales, como el control de la calidad de la síntesis, la secreción,
la unión con los fosfolípidos plaquetarios, la inactivación y el aclaramiento de la molécula
completa.
● Hemofilia tipo A Xq28, recesiva ligada al X, se producen codones de parada
en los exones 9, 18 y 22 esto por el cambio de una C por una T.

● Hemofilia tipo B Xq27.1, recesiva ligada al X en el caso de las mujeres se

presenta mosaicismo; el factor Ix de la coagulación actúa como proteasa, sus
mutaciones más frecuentes cambian pares de base en el gen, un pequeño
porcentaje eliminan o insertan múltiples pares de bases o reorganizan
reorganizan segmentos de DNA dentro del gen la mutación. Estas mutaciones
dan lugar a la codificación de una versión anormal del factor o reducen la cantidad
codificada de esta proteína, la proteína alterada o ausente no puede participar de
manera efectiva en el proceso de la coagulación. Las mutaciones que reducen pero
no eliminan la actividad de la proteína por lo general causan hemofilia leve o
moderada. Mutaciones cerca del comienzo cerca del comienzo de la secuencia del
gen F9 causan una forma inusual de hemofilia B conocida como HB Leyden, estas
personas nacen con cantidades bajas del factor pero los cambios hormonales hacen
que las concentraciones de la proteína aumentan durante la pubertad.
● Una deleción de 2-pb AG entre los 134 - 135 codones, en los casos severos
se puede producir el cambio de una C por una T introduciendo un codón de
parada en el exón 8. Con respecto a la proteína al perder tantos exones la
proteína sufrirá cambios en su estructura polaridad y función dejando de ser
catalítica.
● El exón 8 es el mayor, con 1,9 kb de longitud, representa casi la mitad de la
región codificadora del FIX; el 50 % de las mutaciones se localizan en este
exón. Las mutaciones descritas en el promotor se relacionan con las
variantes de HB Leyden y Branderburg.La regulación de la transcripción del
FIX ha sido estudiada por diversos grupos de trabajo.
● Aproximadamente un tercio de las mutaciones que ocurren en la HB se han
observado en los dinucleótidos CpG, como ocurre en la HA. Alrededor de un
tercio aparecen de novo, consistente con la hipótesis de Haldane y contrario
a la HA, se observa entre el 20-30 % de casos con HB con un número
pequeño de mutaciones debidas al efecto fundador.10,28

4. Contesta a las siguientes cuestiones relacionadas con la replicación:

a) Concepto de replicación.
Se entiende como el proceso que se da durante la duplicación celular, en el cual se
crea una copia idéntica del DNA para permitir que las dos células tengan el mismo
DNA.

b) Tras el descubrimiento de la estructura del ADN, ¿qué modelos se plantearon

para explicar la replicación?; ¿cuál de ellos es el correcto?
 ● Modelo conservativo: En este modelo las dos cadenas de ADN molde se
vuelven a juntar después de que ocurre la replicación. Esto es, una molécula
hija contiene a ambas cadenas molde, y la otra molécula hija contiene al
nuevo material sintetizado.
● Modelo semiconservativo: En este modelo la hebra molde del ADN se separa
y sirve de base para la síntesis de una nueva cadena de ADN. El resultado
son dos dobles hélices de ADN, donde ambas están constituidas de una
cadena molde y una cadena nueva.
● Modelo dispersivo: En este modelo la doble hélice paternal es rota en
segmentos de doble cadena de ADN. Al igual que en el modelo conservativo,
actúan como moldes para la síntesis de nuevas moléculas de doble hélice.
Los segmentos se recomponen en dobles hélices de ADN completas, cada
una con segmentos intercalados de padres e hijos

c) En la replicación de una molécula de ADN de doble hebra y después de tres

ciclos de replicación, ¿cuántas hebras de nueva síntesis habrán aparecido?. Hay
patologías relacionadas con defectos en la replicación, descríbalas en detalle.
Deberían de haber 30 hebras de nueva síntesis. [(2^n)-2]
Patologías:
● La ataxia-telangiectasia (A-T): (ataxia= falta de control muscular o
coordinación de los mov voluntarios)(telangiectasias hace referencia a las
“telarañas” de vasos sanguíneos pequeños que aparecen en piel, mucosas y
esclera). Presenta afectaciones neurológicas, inmunitarias y pulmonares;
aumenta riesgo de padecer cáncer.
Es causada por la inactivación del gen ATM (11q22.3) debido a mutación.
Este gen tiene como función evaluar el daño que el DNA ha recibido y
repararlo mediante fosforilación de sustratos. En caso de que el daño sea
muy grande y la célula deba hacer apoptosis, este gen mejora la fosforilación
de TP53 (proteína mediadora de apoptosis). Por esto la deleción del gen
aumenta el riesgo de padecer cáncer.
El papel de este gen es fundamental en las células de purkinje del cerebelo y
en las células endoteliales.

5. A continuación se escribe la secuencia de nucleótidos de un fragmento de la

cadena
codificante del ADN: 5´; AAG CAA TGT GGG CGG AGA CC AAG CAA TGT GGG
CGG AGA CCA
A AAG CAA TGT GGG CGG AGA CCTGA 3´;
a) Determinar la secuencia de nucleótidos del ARNm correspondiente e indicar su
polaridad.
3´-UUC GUU ACA CCC GCC UCU GGU UCG UUA CAC CCG CCU CUG GUU
UUC ACA CCC GCC GCC UCU GGA CT-5´
5´UCA GGU CUC CGC CCA CAU UGC UUU UGG ACU CCG CCC ACA UUG
CUU GGU CUC CGC CCA CAU UGC UU 3´

b) Utilizando el código genético, determinar la secuencia de aminoácidos que

produce la traducción de este ARNm. Cuantos marcos abiertos de lectura son
posibles?
5´UCA GGU CUC CGC CCA CAU UGC UUU UGG ACU CCG CCC ACA UUG
CUU GGU CUC CGC CCA CAU UGC UU 3´
ser Gly Leu Arg Pro Hist Cys Fenil tript Thre Pro Prol Thre Leu Prol
Gly Leu Arg Prol Hist Cys

Fenilalanina,Valina,Treonina,Prolina,Alanina,Serina,Glicina,Serina,Leucina,Histidina,Prolina,Prolina,Leucina,Valina,Fenilalanin
a,Treonina,Prolina,Alanina,Alanina,,Serina,Glicina
c) ¿Qué cambios tendría que ocurrir para que apareciese en cuarto codón las
siguientes
mutaciones: Missense, Nonsese ,Frame shift ,In frame.

Frameshift: por una microinserción lo cual causaría un cambio en el marco de

lectura requerido, para la aparición de un nuevo aminoácido.
Missense: Una mutación en la cual un codón muta de forma que dirige la incorporación de
un aminoácido diferente. Esta sustitución puede conducir a un producto inestable o inactivo.
Puede producir anemia falciforme, epidermólisis bullosa, esclerosis lateral amiotrófica. El
cambio de nucleótidos también puede producir una mutación silenciosa en la que el cambio
de AA no evidencia un cambio en el fenotipo debido a su similitud con el AA original.
Nonsese: En este tipo de mutación hay un cambio en una de las bases del DNA de forma que
el nuevo triplete que se forma determina la señal de fin de la cadena de aminoácidos. Esto
es, se trunca la proteína, no se continúa formando a partir de ahí. Según dónde quede truncada
la proteína será capaz de preservar algo de función o no.

In frame:Mutación que no produce un cambio en el marco de lectura de tripletes cuando se

produce la transcripción de ADN a ARN mensajero. Estas mutaciones darán lugar a una
proteína anormal en cuanto al contenido de aminoácidos. No todas las mutaciones de este tipo
son patogénicas.