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PROBLEMAS DE BIOQUMICA, 1 BIOLOGA

-2do PARCIALIV. ENZIMOLOGA


49. Un enzima con Km=3x10-4 M se ensay con una concentracin inicial de sustrato de 10 6
M. En un minuto, el 5% del sustrato haba reaccionado. a) Qu porcentaje de
sustrato habr reaccionado en 5min?. b) Si la concentracin inicial de sustrato fuese de
8x10-7 M, qu porcentaje de sustrato habr reaccionado en 5min?. c) Calcular Vmax. d)
A concentracin 9x10-7 M, cunto tardar en reaccionar el 50% del sustrato?. e) A
concentracin 10-6 M, cunto tardar en reaccionar el 75% del sustrato?.
Sol: a) 23%. b) 23%. c) 1,5x10-5 mol/lxmin. d) 13,58 min. e) 27,15 min.
50. Una enzima se ensay con una concentracin inicial de sustrato de 10 -5M. La Km para el
sustrato era de 2x10-3 M. Despus de transcurrido 1min, el 2% del sustrato se haba
convertido en producto. a) Qu porcentaje del sustrato se habr convertido en
producto despus de 3min?. Cules sern las concentraciones de producto y sustrato
en ese momento?. b) Si la concentracin inicial de sustrato fuese de 10 -6 M, qu
porcentaje de sustrato se habr convertido en producto tras 3min de reaccin?. c)
Cul es la Vmax alcanzable con la concentracin de enzima dada?. d) Con qu
concentracin de sustrato, aproximadamente se observar Vmax?. e) Con esta
concentracin de sustrato, qu porcentaje de sutrato se convertir en producto en
3min?.
Sol: a) 6%, 0,6x10-6 M, 9,4x10-6 M. b) 6%. c) 40 moles/lxmin. d) 0,2 M. e) 0,0603%.
51. Una enzima con una Km para el sustrato de 1,2x10 -4 M se ensay con una concentracin
inicial de sustrato de 0,02 M. En 30seg se obtuvo una cantidad de producto de 2,7mol
x l-1. Qu cantidad se obtendr en: a) 1min, b) 95seg y c) 5,3min?. d) Cul es el
porcentaje del sustrato original que habr reaccionado a esos tiempos?.
Sol: a) 5,4x10-6 M. b) 8,55x10-6 M. c) 28,62x10-6 M. d) 2,7x10-2 %, 4,27x10-2%, 14,31x102
%.
52. Un volumen de 0,1ml de una preparacin homognea de nitrato reductasa (pm=500.000
mg/mmol), que contiene 0,5mg de protenas ml-1, cataliza la produccin de 20moles de
NO2- en 5 min, utilizando una mezcla de reaccin cuyo volumen final es de 1ml. Calcular:
a) la actividad de la preparacin enzimtica en U/ml, b) la actividad especfica c) la
actividad total en katales, de 100 ml de preparacin enzimtica,;d) la actividad molar de
la preparacin; e) la actividad por centro activo, sabiendo que la nitrato reductasa tiene
dos sitios para la reduccin del nitrato; y f) el tiempo requerido para que se transforme
una molcula de sustrato en producto.
Sol: a) 40U/ml. b) 80U/mg. c) 66,6x10-6 katales. d) 40.000 min-1. e) 20.000 min-1. f) 3
mseg.
53. a) Qu concentracin de inhibidor competitivo se requiere para dar un 75% de
inhibicin, cuando la concentracin de sustrato es de 1,5 x 10 -3 M, sabiendo que la Km de
la enzima por dicho sustrato vale 2,9 x 10 -4 M, y que la Ki para el inhibidor es de 2 x 10 5
M?. b) Hasta que concentracin debe elevarse el sustrato para restablecer el valor
de velocidad obtenido en ausencia del inhibidor?.
Sol: a) 3,7x10-4 M. b) 2,93x10-2 M.
54. La actividad de una aminocido descarboxilasa puede ensayarse manomtricamente
siguiendo el desprendimiento de CO 2. En un experimento realizado con esta enzima en
presencia o ausencia de un hidroxicido (0,05 M) se obtuvieron los siguientes
resultados:

[aa] (M)
V (u.a.)

12,5

16,67

25

50

100

-Hidroxicido

13,3

17,2

22,2

33,3

40

+Hidroxicido

4,6

6,4

11,8

20,0

Se pide: a) indicar el tipo de inhibicin que ejerce el hidroxicido en la reaccin


enzimtica, y b) calcular los valores de Km, Vmax, y Ki.
Sol: a) inhibicin competitva. b) Km=39M, Km=179 M, V=60 unidades arbitrarias y
Ki=13,92mM.
55. Una isomerasa tiene, en ausencia de inhibidor, una Km para su sustrato de 6,7 x 10 -4 M,
y su Vmax es de 300 mol/min. Calclese la Ki y el porcentaje de inhibicin para un
inhibidor competitivo, sabiendo que con [S]= 2 x 10 -5 M y [I]= 10-5 M, se obtiene una
velocidad inicial de 1,5 mol/min.
Sol: 2,02x 10-6M, 82%.
56. Una preparacin de glutamato deshidrogenasa (PM= 60.000 mg/mmol) contiene 10mg
prot por ml. Si 20l de esta preparacin se ensaya a concentracin saturante de piridn
nucletido, variando las concentraciones de glutamato, y en presencia o ausencia de un
inhibidor, se obtienen los siguientes resultados:
[S] (mM)
0,25
0,33 0,50
1,00
V (mmol x min-1)

[I]= 0

2,00

2,48

3,33

5,00

[I]= 2mM

0,47

0,62

0,91

1,67

A partir de estos datos calcular: a) los valores de Vmax y Km en presencia y ausencia


de inhibidor, b) el tipo de inhibicin ejercida y el valor de Ki correspondiente, c) la
actividad enzimtica en U/ml y U/mg, as como el nmero de recambio, d) el grado de
inhibicin cuando [S]= 0,5 mM, e) la cantidad de sustrato desaparecido en 3 min,
cuando se ensayan, en 1ml de mezcla de reaccin, 50 l de la preparacin enzimtica en
presencia de [S]= 0,5 M.
Sol: a) V=V=10mmoles/min, Km=1mM, Km=5mM. b) Inhibicin competitiva, Ki 0,5mM. c)
500.000 U/ml, 50.000 U/mg, 3x10-6 min-1. d) 72 %. e) 75.000 moles.
57. Al ensayar una fumarasa de levadura frente a un sustrato especfico en presencia o
ausencia de un inhibidor, se obtienen los siguientes resultados:
[S] (mM)
0,5
0,66 1,00
2,00 4,00
V(mmol x min-1) [I]=0
[I]= 0,1M

24,4

30,03 35,71

50,00 57,14

10,00

11,90

19,23

14,81

22,73

Se pide: a) determinar el tipo de inhibicin, b) calcular los valores de Km para el


sustrato y de Ki para el inhibidor, c) estimar la concentracin del inhibidor necesaria
para inhibir un 50% la reaccin, cuando la concentracin de sustrato es 3 mM.
Sol: a) Inhibicin no competitiva. b) Km 1mM, Ki 66x 10-2M. c) 0,06 M.
58. Una glutaminasa de hepatocito hidroliza distintas concentraciones de glutamina, en
presencia o ausencia de dos inhibidores diferentes, obtenindose los siguientes
resultados:
[S] (mM)
0,2
0,4
0,8
1,6
3,2

V (mmol x min-1)

[I]=0

1,67

2,86

4,44

6,15

7,62

[Ia]= 1,5 mM

0,63

1,18

2,11

3,48

5,16

[Ib]= 1,5 mM

0,83

1,43

2,22

3,08

3,81

Calcular: a) en cada caso el tipo de inhibicin existente, b) el valor de los


correspondientes parmetros cinticos (Km, Ki, Vmx).
Sol: a) Ia inhibidor competitivo, Ib inhibidor no competitivo. b) Km 1mM, Km(a)
3,33mM, km(b) 1mM, v=v(a)=10 mmol/min, v(b) 5 mmol/min, Ki(a) 0,64mM, Ki(b) 1,5mM.
59. Calcular la velocidad inicial que se obtendr en una reaccin enzimtica si la velocidad
mxima es de 10 mol/min y la concentracin de sustrato es a) 10Km, b)Km/3.
Sol: a) 9,09 mol/min. b) 2,5 mol/min.
60. La descarboxilacin enzimtica de un cetocido muestra las siguientes velocidades para
las concentraciones que se citan:
V0 (moles CO2/2min)

[Cetocido](M)

0,588

2,500x10-3

0,500

1,000x10-3

0,417

0,714x10-3

0,370

0,526x10-3

0,252

0,250x10-3

A partir de estos datos calcular grficamente la Vmx y la KM de esta reaccin


enzimtica.
Sol: Vmx 0,77moles /min , KM 5,8x10-4 M.
61. Calcular la velocidad y el grado de inhibicin de una reaccin enzimtica en presencia
de 3,5x10-5M de substrato. (KM=2x10-4M) y 4x10-5M de inhibidor no competitivo
(KI=2x10-5M), sabiendo que la velocidad observada a 0,03M de substrato en ausencia de
inhibidor es de 295 moles /min.
Sol: 14,6 moles /min, 66%.
62. Calcular qu concentracin de substrato, expresada en funcin de la K M nos dar una
velocidad de reaccin igual al 60% de la Vmx.
Sol: 1,5 KM.
63. Calcular la relacin entre la concentracin de substrato necesaria para una velocidad
90% de la Vmx y la requerida para una velocidad 10% de la V mx para una enzima cuya
cintica sigue la ecuacin de Michaelis-Menten.
Sol: 9KM, 0,11KM, 81,81.
64. Calcular la concentracin de un inhibidor competitivo (K I= 10-7M) necesaria para que la
velocidad sea un 20% de la Vmx de una reaccin enzimtica (KM=1,6x10-4M cuando la
[S]=0,4 mM).
Sol: 9x10-7M.
65. Una enzima se ensay para distintas concentraciones de su substrato especfico, en
ausencia y presencia de un inhibidor ([I]=1mM),obtenindose los siguientes resultados:
[S] mM
V (mol/min)+ Inhibidor
V(mol/min)- Inhibidor
0,02
0,05
0,10
0,5
0,8

6,25
10
12,50
15,62
16

8,33
16,67
25
41,67
44,44

Calcular la KM y la Vmx en ambos casos y la KI para el inhibidor. Qu clase de inhibicin se


produce?.

Sol: Vmx 50 mol/min, KM 0,1mM, Vmx 19,23 mol/min, KM0,034 mM, KI 5,15x10-4M.
Inhibicin acompetitiva o incompetitiva.
66. Un enzima tiene un KM de 4,7x10-5M, y muestra una Vmx de 22x10-3 moles/lxmin. Para
una [S] de 2x10-4M y [I] de 5x10-4M, qu velocidad y qu grado de inhibicin (i%) se
observar en el caso de que el inhibidor sea un:
a) inhibidor competitivo (KI= 3x10-4M).
b) inhibidor no competitivo (KI= 3x10-4M).
c) inhibidor acompetitivo (KI= 3x10-4M).
Sol: a) 13,5x10-3 mol/lxmin, 24%. b) 6,6x10-3 mol/lxmin, 63%. c) 7,6x10-3 mol/lxmin,
57%.
V. GENTICA MOLECULAR
67. Indicar la secuencia de aminocidos es codificada por la siguiente secuencia de bases
de una molcula de ARNm: 5-UUGCCUAGUGAUUGGAUG-3.
68. Cul es la secuencia del poliptido formado por la adicin de poli (UUAC) a un sistema
de sntesis de protenas libres de clulas?.
69. Un qumico de protenas comunic a un genetista molecular que haba encontrado un
nuevo mutante de la hemoglobina en el que Asp era reemplazado por Lys. El genetista
molecular expres su sorpresa y realiz un examen minucioso del problema propuesto.
Por qu dudaba el genetista molecular de la referida sustitucin del aminocido? Qu
aminocidos sustituidos habran sido mucho ms aceptados por el genetista molecular?.
70. Una hebra de ADN contiene la siguiente secuencia, leda de 5 a 3:
TCGTCGACGATGGATCCCATCGGCTACTGCA. Escribir: a) la secuencia de bases de la
otra hebra del ADN, b) la secuencia de bases del ARNm transcrito por la segunda
hebra de ADN, c) la secuencia de aminocidos codificada por el ARNm, d) la secuencia
aminoacdica codificada si la segunda T del extremo 3 del ADN inicial est suprimida.
71. Utilizando un polirribonucletido con un 47% de adenina y un 53% de citosina
distribuidas al azar, Jones y Nremberg obtuvieron las siguientes frecuencias de
aminocidos que haban sido incorporados en protenas: 10,8% de Lys, 11,6% de Asn,
9,3% de Gln, 9,4% de His, 26,3% de Thr y 32,6% de Pro. Concuerdan estas
frecuencias observadas con las que caba esperar?

72. Un segmento de ARNm codifica el siguiente polipptido: Met- Thr-Phe-Ile-Trp. La


proflavina induce la supresin de una sola base del gen codificador de este ARNm. El
nuevo pptido, fruto de la traduccin del ARNm alterado, es el Met-Pro-Ser-Tyr-Gly.
En qu codn tuvo lugar la supresin? En qu posicin del codn original estaba
sustituida la base suprimida? Qu secuencias de bases tendrn los ARNms salvaje y
mutante? Cul sera la secuencia de aminocidos resultante si una guanina se insertase
despus de las tres primeras bases en la secuencia del ARNm mutante?.
73. Una protena A de una bacteria tipo salvaje (cepa 1) tiene un resto de Trp en la
posicin 26. La protena A de la cepa 2, derivada de la 1 por mutacin, contena Leu en
la posicin 26. La mutacin de la cepa 2 produjo la cepa 3, en la que no se detect una
nueva protena A mutante. La mutacin de la cepa 3 form la cepa 4 que contena Pro en
dicha posicin 26. Suponiendo que todas las mutaciones eran sustituciones de bases, y
que la cepa progenitora y la hija no diferan mas que en una sola base del codn del
resto 26 de la protena A, se pregunta si estas observaciones estn de acuerdo con el
cdigo gentico e indicar el curso de los cambios del codn durante esta serie de
mutaciones.

74. Si un ARNm presentase la misma cantidad de bases adenina y uracilo situadas al azar,
qu proporcin de tripletes codificaran: a) Phe, b) Ile; c)Leu y d) Tyr?.
75. Suponer que el ARN de cadena simple del virus del mosaico del tabaco fuera tratado
con un mutgeno qumico, que los mutantes obtenidos tuvieran Ser o Leu en el lugar de
la Pro en una posicin especfica y que el tratamiento posterior de estos mutantes con
el mismo mutgeno diera lugar a Phe en esa posicin. Cules son los posibles codones
asignados para estos cuatro aminocidos? Cul fue el efecto del mutgeno empleado?
76. Las secuencias de aminocidos de una parte de la lisozima del bacterifago T 4, tipo
salvaje y de un mutante son respectivamente: -Thr-Lys-Ser-Pro-Ser-Leu-Asn-Ala-AlaLys- y Thr-Lys-Val-His-His-Leu-Met-Ala-Ala-Lys. Cmo puede producirse este
mutante? Cul es la secuencia de bases de los ARNm que codifican a los cinco
aminocidos diferenciales de las cepas salvaje y mutante?.
77. A partir de la secuencia de aminocidos del extremo de una protena se puede
predecir la secuencia de bases del ARNm que la codifica?.
78. Las secuencias de aminocidos del extremo NH 2 de un polipptido en cepas salvaje y
mutantes de una especie bacteriana son:
CEPA
SECUENCIA DE AMINOCIDOS
Salvaje

Met-Ser-Gly-Leu-Val-Ser-His-Thr

Mutante 1

Met-Tyr-Trp-Ile-Ser-Val-Ser-His

Mutante 2

Met-Ser-Gly-Ser-Val-Ser-His-Thr

Mutante 3

Met-Ser-Gly-COOH

Mutante 1

Met-Tyr-Trp-Leu-Val-Ser-His-Thr

Sabiendo que las cepas mutantes 1,2 y 3 derivan de la salvaje y la 1 de la mutante 1, y


que cada una de ellas se origin por una mutacin puntual, deducir la secuencia de
nucletidos del ARNm que corresponde a ese polipptido en cada una de las cepas.
79. Se sintetiz un polinucletido, sin molde, a partir de una mezcla de ribonucletidos
difosfatos de uracilo (40%) y citosina (60%), utilizndolo como mensajero en un
sistema acelular. Se obtuvo un polipptido en el que slo aparecan 4 aminocidos en las
siguientes proporciones: Phe (16%), Ser (24%), Leu (24%) y Pro (36%). En otro
experimento se utiliz un ARNm de secuencia conocida, poli (UCA) con el que se obtuvo
una mezcla de tres polipptidos: poliserina, polihistidina y poliisoleucina. Utilizando los
datos de los dos experimentos, teniendo en cuenta que el cdigo gentico es
degenerado y que normalmente los tripletes de bases que codifican a un mismo
aminocido suelen tener las dos primeras bases iguales, determinar qu codones
especifican los aminocidos Phe, Ser, Leu y Pro.
80. Utilizando un ARNm sinttico en el que se repite la secuencia (CCAA) y un extracto
celular de E. Coli, se ha sintetizado un polipptido en el que se repite la secuencia de
aminocidos (Thr-Asn-Gln-Pro)n. Si el codn para Asn es AAC. Cules son los de los
otros tres aminocidos?.

81. En una cadena proteica de 100 aminocidos, las posiciones 21, 54 y 97, se encuentran
normalmente ocupadas por leucina; durante el estudio de diversos mutantes de esta
protena se han encontrado los siguientes aminocidos en las posiciones indicadas
anteriormente: posicin 21: Val, Pro Ile, posicin 54: Ile Ser, posicin 97: His, Arg
Val. Cul sera el codn utilizado para la leucina en cada una de las tres posiciones,

suponiendo que ha sido una mutacin puntual la que ha dado origen al cambio de
aminocido?.
VI: TERMODINMICA.
82. En el msculo la creatina-P es una reserva de energa: Creatina-P + ADP + H + ATP +
creatina.
El ATP producido queda disponible para la contraccin muscular. En las condiciones de
equilibrio (msculo en reposo), las concentraciones de ATP, ADP, creatina-P y creatina
son: 4mM, 0,013 mM, 25 mM y 13 mM, respectivamente. Sabiendo que G para la
hidrlisis del ATP es de 7,3 Kcal/mol, calcular: a) Keq de esta reaccin en el msculo;
b) G de la reaccin, y c) G de la hidrlisis: Creatina-P + H 2O Creatina + Pi.
Sol: a) 160, b) 3Kcal/mol, c) 10,3 Kcal/mol.
83. Calcular el desplazamiento de la situacin de equilibrio debido al acoplamiento de la
hidrlisis de una molcula de ATP, en la reaccin: A B; G= 4 kcal/mol, G para la
hidrlisis del ATP=7,3 Kcal/mol.
Sol: -3,3Kcal/mol.
84. La glucosa-6P se hidroliza enzimticamente a pH 7 y 25 C hasta glucosa y Pi. Si la
concentracin inicial de Glucosa-6P fue de 0,1 M y en el equilibrio el 0,05% de la
glucosa-6P permaneci como tal, calcular: a) Keq e G para la hidrlisis de la Glucosa6P y b) Keq e G para la sntesis de la Glucosa-6P.
Sol: A) Keq 199,8, G-3136.09cal/mol, b) Keq 5,005x 10-3 G 3138cal/mol.
85. Calcular los valores de G del estado estndar para la disociacin del cido actico a
los siguientes valores de pH: a) pH 0 y b) pH 5. Ka=1,75x10-5.
Sol: a) 6485,7cal/mol b) 13304 cal/mol.
86. Calcular G para la hidrlisis del ATP a pH 7 y a 25 C en condiciones de estado
estacionario (anlogas a las que pueden darse en una clula viva) en las que las
concentraciones de ATP, ADP y Pi se mantienen igual a 10 -3, 10-4 y 10-2 M,
respectivamente. G a pH 7y 25C= -7,7 kcal/mol.
Sol: -11792 cal/mol.
87. El G de la hidrlisis del ATP a pH 7 y a 25C es 7,7 kcal/mol. El G de la hidrlisis
de la glucosa-6P a pH 7 y a 25C es 3,14 kCal/mol. Calcular G y la Keq para la
reaccin entre la glucosa y el ATP, catalizada por la hexoquinasa.
Sol: G -4,56Kcal/mol, Keq 2,21x 103.
88. Calcular la Keq total y el G total a pH 7 y a 25C para la conversin del cido
fumrico en cido ctrico en presencia de los enzimas, cosustratos y cofactores
adecuados.
Sol: Keq 18,72, G -1735 cal/mol.
89. La Keq para la reaccin de la Fructosa-1,6-difosfato aldolasa (FDP) a 25C y pH 7
(escrita en la direccin de formacin de triosa fosfato) es aproximadamente 10 -4, G
= 5,456 kcal/mol. Calcular las concentraciones de FDP, de dihidroxiacetona fosfato
(DHAP) y de gliceraldehido 3 fosfato (GAP) en el equilibrio cuando la concentracin
inicial de FDP es: a) 1M; b) 10-2 M; c) 2 x 10-4 M d) 10-5 M.
Sol:a) 0,99M y 0,0095M, b) 0,999M y 0,000951M, c) 0,0001M y 0,0001M d) 0,999M y
9x 10-6M.
90. La enzima lactato deshidrogenasa cataliza la reaccin:
NADH + Piruvato Lactato + NAD+
Calcular la reaccin espontnea que se produce y su G cuando a pH 7 se dan las
siguientes relaciones entre concentraciones: a) Lactato/piruvato=1, NAD+/NADH=1;
b)Lactato/piruvato=1000,
NAD+/NADH=
1000.
E0 NADH/NAD+=-0,32
V;
0
E Lactato/piruvato=-0,19V.

Sol: a) reaccin espontnea, b) reaccin espontnea.


91. La conversin de glucosa en cido lctico a pH 7 y 25C tiene una G total de 52,0
Kcal/mol. En una clula anaerobia esta conversin se acopla a la sntesis de dos
molculas de ATP por molcula de glucosa. Calcular: a) G de la reaccin total
acoplada, b) eficiencia de la conservacin de energa en el proceso, c) con esa eficiencia
cuntos moles de ATP por mol de glucosa podrn obtenerse en condiciones de
metabolismo aerobio, dnde la glucosa se oxida hasta CO2 y H 2O (G = -686,0
kcal/mol), d) calcular el G para la oxidacin total acoplada a la sntesis de ATP.
Sol: a) 36,6Kcal/mol. b) 29,6%. c) 26 moles. d) -482950cal/mol.

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