PROBLEMAS DE BIOQUÍMICA, 1º BIOLOGÍA

-2do PARCIAL-
 
IV. ENZIMOLOGÍA
 
49. Un enzima con Km=3x10-4 M se ensayó con una concentración inicial de sustrato de 10 -6
M. En un minuto, el 5% del sustrato había reaccionado. a) ¿Qué porcentaje de sustrato
habrá reaccionado en 5min?. b) Si la concentración inicial de sustrato fuese de 8x10 -7
M, ¿qué porcentaje de sustrato habrá reaccionado en 5min?. c) Calcular Vmax. d) A
concentración 9x10-7  M, ¿cuánto tardará en reaccionar el 50% del sustrato?. e) A
concentración 10-6 M, ¿cuánto tardará en reaccionar el 75% del sustrato?.
      Sol: a) 23%. b) 23%. c) 1,5x10-5 mol/lxmin. d) 13,58 min. e) 27,15 min.
50. Una enzima se ensayó con una concentración inicial de sustrato de 10 -5M. La Km para el
sustrato era de 2x10-3 M. Después de transcurrido 1min, el 2% del sustrato se había
convertido en producto. a) ¿Qué porcentaje del sustrato se habrá convertido en
producto después de 3min?. ¿Cuáles serán las concentraciones de producto y sustrato
en ese momento?. b) Si la concentración inicial de sustrato fuese de 10 -6 M, ¿qué
porcentaje de sustrato se habrá convertido en producto tras 3min de reacción?. c)
¿Cuál es la Vmax alcanzable con la concentración de enzima dada?. d) ¿Con qué
concentración de sustrato, aproximadamente se observará Vmax?. e) Con esta
concentración de sustrato, ¿qué porcentaje de sutrato se convertirá en producto en
3min?.
      Sol: a) 6%, 0,6x10-6 M, 9,4x10-6 M. b) 6%. c) 40 µmoles/lxmin. d) 0,2 M. e) 0,0603%.
51. Una enzima con una Km para el sustrato de 1,2x10 -4 M se ensayó con una concentración
inicial de sustrato de 0,02 M. En 30seg se obtuvo una cantidad de producto de 2,7µmol
x l-1. ¿Qué cantidad se obtendrá en: a) 1min, b) 95seg y c) 5,3min?. d) ¿Cuál es el
porcentaje del sustrato original que habrá reaccionado a esos tiempos?.
      Sol: a) 5,4x10-6 M. b) 8,55x10-6 M. c) 28,62x10-6 M. d) 2,7x10-2 %, 4,27x10-2%, 14,31x10-
2
%.
52. Un volumen de 0,1ml de una preparación homogénea de nitrato reductasa (pm=500.000
mg/mmol), que contiene 0,5mg de proteínas ml-1, cataliza la producción de 20µmoles de
NO2- en 5 min, utilizando una mezcla de reacción cuyo volumen final es de 1ml. Calcular:
a) la actividad de la preparación enzimática en U/ml, b) la actividad específica c) la
actividad total en katales, de 100 ml de preparación enzimática,;d) la actividad molar de
la preparación; e) la actividad por centro activo, sabiendo que la nitrato reductasa tiene
dos sitios para la reducción del nitrato; y f) el tiempo requerido para que se transforme
una molécula de sustrato en producto.
      Sol: a) 40U/ml. b) 80U/mg. c) 66,6x10-6 katales. d) 40.000 min-1. e) 20.000 min-1. f) 3
mseg.
53. a) ¿Qué concentración de inhibidor competitivo se requiere para dar un 75% de
inhibición, cuando la concentración de sustrato es de 1,5 x 10 -3 M, sabiendo que la Km de
la enzima por dicho sustrato vale 2,9 x 10-4 M, y que la Ki para el inhibidor es de 2 x 10-5
M?. b) ¿Hasta que concentración debe elevarse el sustrato para restablecer el valor de
velocidad obtenido en ausencia del inhibidor?.
      Sol: a) 3,7x10-4 M. b) 2,93x10-2 M.
54. La actividad de una aminoácido descarboxilasa puede ensayarse manométricamente
siguiendo el desprendimiento de CO2. En un experimento realizado con esta enzima en
presencia o ausencia de un hidroxiácido (0,05 M) se obtuvieron los siguientes
resultados:
 [aa] (M) 12,5 16,67 25 50 100
V (u.a.) -Hidroxiácido 13,3 17,2 22,2 33,3 40
  +Hidroxiácido - 4,6 6,4 11,8 20,0
      Se pide: a) indicar el tipo de inhibición que ejerce el hidroxiácido en la reacción
enzimática, y b) calcular los valores de Km, Vmax, y Ki.
      Sol: a) inhibición competitva. b) Km=39µM, Km’=179 µM, V=60 unidades arbitrarias y
Ki=13,92mM.
55. Una isomerasa tiene, en ausencia de inhibidor, una Km para su sustrato de 6,7 x 10 -4 M,
y su Vmax es de 300 µmol/min. Calcúlese la Ki y el porcentaje de inhibición para un
inhibidor competitivo, sabiendo que con [S]= 2 x 10-5 M y [I]= 10-5 M, se obtiene una
velocidad inicial de 1,5 µmol/min.
      Sol: 2,02x 10-6M, 82%.
 
56. Una preparación de glutamato deshidrogenasa (PM= 60.000 mg/mmol) contiene 10mg
prot por ml. Si 20µl de esta preparación se ensaya a concentración saturante de piridín
nucleótido, variando las concentraciones de glutamato, y en presencia o ausencia de un
inhibidor, se obtienen los siguientes resultados:
[S] (mM) 0,25 0,33 0,50 1,00
-1
V (mmol x min ) [I]= 0 2,00 2,48 3,33 5,00
  [I]= 2mM 0,47 0,62 0,91 1,67
      A partir de estos datos calcular: a) los valores de Vmax y Km en presencia y ausencia
de inhibidor, b) el tipo de inhibición ejercida y el valor de Ki correspondiente, c) la
actividad enzimática en U/ml y U/mg, así como el número de recambio, d) el grado de
inhibición cuando [S]= 0,5 mM, e) la cantidad de sustrato desaparecido en 3 min,
cuando se ensayan, en 1ml de mezcla de reacción, 50 µl de la preparación enzimática en
presencia de [S]= 0,5 M.
      Sol: a) V=V’=10mmoles/min, Km=1mM, Km’=5mM. b) Inhibición competitiva, Ki 0,5mM. c)
500.000 U/ml, 50.000 U/mg, 3x10-6 min-1. d) 72 %. e) 75.000 µmoles.
57. Al ensayar una fumarasa de levadura frente a un sustrato específico en presencia o
ausencia de un inhibidor, se obtienen los siguientes resultados:
[S] (mM) 0,5 0,66 1,00 2,00 4,00
V(mmol x min-1) [I]=0 24,4 30,03 35,71 50,00 57,14
  [I]= 0,1µM 10,00 11,90 14,81 19,23 22,73
      Se pide: a) determinar el tipo de inhibición, b) calcular los valores de Km para el
sustrato y de Ki para el inhibidor, c) estimar la concentración del inhibidor necesaria
para inhibir un 50% la reacción, cuando la concentración de sustrato es 3 mM.
      Sol: a) Inhibición no competitiva. b) Km 1mM, Ki 6´6x 10-2M. c) 0,06 µM.
58. Una glutaminasa de hepatocito hidroliza distintas concentraciones de glutamina, en
presencia o ausencia de dos inhibidores diferentes, obteniéndose los siguientes
resultados:
[S] (mM) 0,2 0,4 0,8 1,6 3,2
  [I]=0 1,67 2,86 4,44 6,15 7,62
V (mmol x min-1) [Ia]= 1,5 mM 0,63 1,18 2,11 3,48 5,16
  [Ib]= 1,5 mM 0,83 1,43 2,22 3,08 3,81
      Calcular: a) en cada caso el tipo de inhibición existente, b) el valor de los
correspondientes parámetros cinéticos (Km, Ki, Vmáx).
      Sol: a) Ia inhibidor competitivo, Ib inhibidor no competitivo. b) Km 1mM, Km’(a)
3,33mM, km’(b) 1mM, v=v’(a)=10 mmol/min, v’(b) 5 mmol/min, Ki(a) 0,64mM, Ki(b) 1,5mM.
59. Calcular la velocidad inicial que se obtendrá en una reacción enzimática si la velocidad
máxima es de 10 µmol/min y la concentración de sustrato es a) 10Km, b)Km/3.
      Sol: a) 9,09 µmol/min. b) 2,5 µmol/min.
60. La descarboxilación enzimática de un cetoácido muestra las siguientes velocidades para
las concentraciones que se citan:
 
V0 (µmoles CO2/2min) [Cetoácido](M)
0,588 2,500x10-3
0,500 1,000x10-3
0,417 0,714x10-3
0,370 0,526x10-3
0,252 0,250x10-3
      A partir de estos datos calcular gráficamente la V máx y la KM de esta reacción
enzimática.
      Sol: Vmáx 0,77µmoles /min , KM 5,8x10-4 M.
61. Calcular la velocidad y el grado de inhibición de una reacción enzimática en presencia
de 3,5x10-5M de substrato. (KM=2x10-4M) y 4x10-5M de inhibidor no competitivo
(KI=2x10-5M), sabiendo que la velocidad observada a 0,03M de substrato en ausencia de
inhibidor es de 295 µmoles /min.
      Sol: 14,6 µmoles /min, 66%.
62. Calcular qué concentración de substrato, expresada en función de la K M nos dará una
velocidad de reacción igual al 60% de la Vmáx.
      Sol: 1,5 KM.
63. Calcular la relación entre la concentración de substrato necesaria para una velocidad
90% de la Vmáx y la requerida para una velocidad 10% de la Vmáx para una enzima cuya
cinética sigue la ecuación de Michaelis-Menten.
      Sol: 9KM, 0,11KM, 81,81.
64. Calcular la concentración de un inhibidor competitivo (K I= 10-7M) necesaria para que la
velocidad sea un 20% de la Vmáx de una reacción enzimática (KM=1,6x10-4M cuando la
[S]=0,4 mM).
      Sol: 9x10-7M.
65. Una enzima se ensayó para distintas concentraciones de su substrato específico, en
ausencia y presencia de un inhibidor ([I]=1mM),obteniéndose los siguientes resultados:
 [S] mM V (µmol/min)+ Inhibidor V(µmol/min)- Inhibidor
0,02 6,25 8,33
0,05 10 16,67
0,10 12,50 25
0,5 15,62 41,67
0,8 16 44,44
 
Calcular la KM y la Vmáx en ambos casos y la KI para el inhibidor. ¿Qué clase de inhibición se
produce?.
      Sol: Vmáx 50 µmol/min, KM 0,1mM, Vmáx´ 19,23 µmol/min, KM´0,034 mM, KI 5,15x10-4M.
Inhibición acompetitiva o incompetitiva.
66. Un enzima tiene un K M de 4,7x10-5M, y muestra una Vmáx de 22x10-3 moles/lxmin. Para
una [S] de 2x10-4M y [I] de 5x10-4M, ¿qué velocidad y qué grado de inhibición (i%) se
observará en el caso de que el inhibidor sea un:
a)      inhibidor competitivo (KI= 3x10-4M).
b)      inhibidor no competitivo (KI= 3x10-4M).
c)      inhibidor acompetitivo (KI= 3x10-4M).
Sol: a) 13,5x10-3 mol/lxmin, 24%. b) 6,6x10-3 mol/lxmin, 63%. c) 7,6x10-3 mol/lxmin,
57%.
 
V. GENÉTICA MOLECULAR
67. Indicar la secuencia de aminoácidos es codificada por la siguiente secuencia de bases
de una molécula de ARNm: 5’-UUGCCUAGUGAUUGGAUG-3’.
68. ¿Cuál es la secuencia del polipétido formado por la adición de poli (UUAC) a un sistema
de síntesis de proteínas libres de células?.
69. Un químico de proteínas comunicó a un genetista molecular que había encontrado un
nuevo mutante de la hemoglobina en el que Asp era reemplazado por Lys. El genetista
molecular expresó su sorpresa y realizó un examen minucioso del problema propuesto.
¿Por qué dudaba el genetista molecular de la referida sustitución del aminoácido? ¿Qué
aminoácidos sustituidos habrían sido mucho más aceptados por el genetista molecular?.
70. Una hebra de ADN contiene la siguiente secuencia, leída de 5’ a 3’:
TCGTCGACGATGGATCCCATCGGCTACTGCA. Escribir: a) la secuencia de bases de la
otra hebra del ADN, b) la secuencia de bases del ARNm transcrito por la segunda
hebra de ADN, c) la secuencia de aminoácidos codificada por el ARNm, d) la secuencia
aminoacídica codificada si la segunda T del extremo 3’ del ADN inicial está suprimida.
71. Utilizando un polirribonucleótido con un 47% de adenina y un 53% de citosina
distribuidas al azar, Jones y Nüremberg obtuvieron las siguientes frecuencias de
aminoácidos que habían sido incorporados en proteínas: 10,8% de Lys, 11,6% de Asn,
9,3% de Gln, 9,4% de His, 26,3% de Thr y 32,6% de Pro. ¿Concuerdan estas
frecuencias observadas con las que cabía esperar?
 
 
 
72. Un segmento de ARNm codifica el siguiente polipéptido: Met- Thr-Phe-Ile-Trp. La
proflavina induce la supresión de una sola base del gen codificador de este ARNm. El
nuevo péptido, fruto de la traducción del ARNm alterado, es el Met-Pro-Ser-Tyr-Gly.
¿En qué codón tuvo lugar la supresión? ¿En qué posición del codón original estaba
sustituida la base suprimida? ¿Qué secuencias de bases tendrán los ARNms salvaje y
mutante? ¿Cuál sería la secuencia de aminoácidos resultante si una guanina se insertase
después de las tres primeras bases en la secuencia del ARNm mutante?.
73. Una proteína A de una bacteria tipo salvaje (cepa 1) tiene un resto de Trp en la
posición 26. La proteína A de la cepa 2, derivada de la 1 por mutación, contenía Leu en
la posición 26. La mutación de la cepa 2 produjo la cepa 3, en la que no se detectó una
nueva proteína A mutante. La mutación de la cepa 3 formó la cepa 4 que contenía Pro en
dicha posición 26. Suponiendo que todas las mutaciones eran sustituciones de bases, y
que la cepa progenitora y la hija no diferían mas que en una sola base del codón del
resto 26 de la proteína A, se pregunta si estas observaciones están de acuerdo con el
código genético e indicar el curso de los cambios del codón durante esta serie de
mutaciones.
74. Si un ARNm presentase la misma cantidad de bases adenina y uracilo situadas al azar,
¿qué proporción de tripletes codificarían: a) Phe, b) Ile; c)Leu y d) Tyr?.
75. Suponer que el ARN de cadena simple del virus del mosaico del tabaco fuera tratado
con un mutágeno químico, que los mutantes obtenidos tuvieran Ser o Leu en el lugar de
la Pro en una posición específica y que el tratamiento posterior de estos mutantes con
el mismo mutágeno diera lugar a Phe en esa posición. ¿Cuáles son los posibles codones
asignados para estos cuatro aminoácidos? ¿Cuál fue el efecto del mutágeno empleado?
76. Las secuencias de aminoácidos de una parte de la lisozima del bacteriófago T 4, tipo
salvaje y de un mutante son respectivamente: -Thr-Lys-Ser-Pro-Ser-Leu-Asn-Ala-Ala-
Lys- y –Thr-Lys-Val-His-His-Leu-Met-Ala-Ala-Lys. ¿Cómo puede producirse este
mutante? ¿Cuál es la secuencia de bases de los ARNm que codifican a los cinco
aminoácidos diferenciales de las cepas salvaje y mutante?.
77. ¿A partir de la secuencia de aminoácidos del extremo de una proteína se puede
predecir la secuencia de bases del ARNm que la codifica?.
78. Las secuencias de aminoácidos del extremo –NH 2 de un polipéptido en cepas salvaje y
mutantes de una especie bacteriana son:
CEPA SECUENCIA DE AMINOÁCIDOS
Salvaje Met-Ser-Gly-Leu-Val-Ser-His-Thr
Mutante 1 Met-Tyr-Trp-Ile-Ser-Val-Ser-His
Mutante 2 Met-Ser-Gly-Ser-Val-Ser-His-Thr
Mutante 3 Met-Ser-Gly-COOH
Mutante 1’ Met-Tyr-Trp-Leu-Val-Ser-His-Thr
      Sabiendo que las cepas mutantes 1,2 y 3 derivan de la salvaje y la 1’ de la mutante 1, y
que cada una de ellas se originó por una mutación puntual, deducir la secuencia de
nucleótidos del ARNm que corresponde a ese polipéptido en cada una de las cepas.
79. Se sintetizó un polinucleótido, sin molde, a partir de una mezcla de ribonucleótidos
difosfatos de uracilo (40%) y citosina (60%), utilizándolo como mensajero en un
sistema acelular. Se obtuvo un polipéptido en el que sólo aparecían 4 aminoácidos en las
siguientes proporciones: Phe (16%), Ser (24%), Leu (24%) y Pro (36%). En otro
experimento se utilizó un ARNm de secuencia conocida, poli (UCA) con el que se obtuvo
una mezcla de tres polipéptidos: poliserina, polihistidina y poliisoleucina. Utilizando los
datos de los dos experimentos, teniendo en cuenta que el código genético es
degenerado y que normalmente los tripletes de bases que codifican a un mismo
aminoácido suelen tener las dos primeras bases iguales, determinar qué codones
especifican los aminoácidos Phe, Ser, Leu y Pro.
80. Utilizando un ARNm sintético en el que se repite la secuencia (CCAA) y un extracto
celular de E. Coli, se ha sintetizado un polipéptido en el que se repite la secuencia de
aminoácidos (Thr-Asn-Gln-Pro)n. Si el codón para Asn es AAC. ¿Cuáles son los de los
otros tres aminoácidos?.
 
 
 
 
81. En una cadena proteica de 100 aminoácidos, las posiciones 21, 54 y 97, se encuentran
normalmente ocupadas por leucina; durante el estudio de diversos mutantes de esta
proteína se han encontrado los siguientes aminoácidos en las posiciones indicadas
anteriormente: posición 21: Val, Pro ó Ile, posición 54: Ile ó Ser, posición 97: His, Arg ó
Val. ¿Cuál sería el codón utilizado para la leucina en cada una de las tres posiciones,
 suponiendo que ha sido una mutación puntual la que ha dado origen al cambio de
aminoácido?.
 
VI: TERMODINÁMICA.
82. En el músculo la creatina-P es una reserva de energía: Creatina-P + ADP + H +  ↔ ATP +
creatina.
      El ATP producido queda disponible para la contracción muscular. En las condiciones de
equilibrio (músculo en reposo), las concentraciones de ATP, ADP, creatina-P y creatina
son: 4mM, 0,013 mM, 25 mM y 13 mM, respectivamente. Sabiendo que ΔG’º para la
hidrólisis del ATP es de –7,3 Kcal/mol, calcular: a) K’eq de esta reacción en el músculo;
b) ΔG’º de la reacción, y c) ΔG’º de la hidrólisis: Creatina-P + H 2O↔ Creatina + Pi.
      Sol: a) 160, b) –3Kcal/mol, c) –10,3 Kcal/mol.
83. Calcular el desplazamiento de la situación de equilibrio debido al acoplamiento de la
hidrólisis de una molécula de ATP, en la reacción: A ↔ B; ΔGº= 4 kcal/mol, ΔGº para la
hidrólisis del ATP=–7,3 Kcal/mol.
      Sol: -3,3Kcal/mol.
84. La glucosa-6P se hidroliza enzimáticamente a pH 7 y 25° C hasta glucosa y Pi. Si la
concentración inicial de Glucosa-6P fue de 0,1 M y en el equilibrio el 0,05% de la
glucosa-6P permaneció como tal, calcular: a) K’eq e ΔG’º para la hidrólisis de la Glucosa-
6P y b) K’eq e ΔG’º para la síntesis de la Glucosa-6P.
      Sol: A) K’eq 199,8, ∆G’º-3136.09cal/mol, b) K’eq 5,005x 10-3 ΔG’º 3138cal/mol.
85. Calcular los valores de ΔGº del estado estándar para la disociación del ácido acético a
los siguientes valores de pH: a) pH 0 y b) pH 5. Ka=1,75x10-5.
      Sol: a) 6485,7cal/mol b) 1330 4 cal/mol.
86. Calcular ΔG para la hidrólisis del ATP a pH 7 y a 25° C en condiciones de estado
estacionario (análogas a las que pueden darse en una célula viva) en las que las
concentraciones de ATP, ADP y Pi se mantienen igual a 10 -3, 10-4 y 10-2 M,
respectivamente. ΔG’º a pH 7y 25°C= -7,7 kcal/mol.
      Sol: -11792 cal/mol.
87. El ΔGº’ de la hidrólisis del ATP a pH 7 y a 25°C es –7,7 kcal/mol. El ΔG’º de la hidrólisis
de la glucosa-6P a pH 7 y a 25°C es –3,14 kCal/mol. Calcular ΔG’º y la K’eq para la
reacción entre la glucosa y el ATP, catalizada por la hexoquinasa.
      Sol: ΔG’º -4,56Kcal/mol, K’eq 2,21x 103.
88. Calcular la K’eq total y el Δ G’º total a pH 7 y a 25°C para la conversión del ácido
fumárico en ácido cítrico en presencia de los enzimas, cosustratos y cofactores
adecuados.
      Sol: K’eq 18,72, ΔG’º -1735 cal/mol.
89. La K’eq para la reacción de la Fructosa-1,6-difosfato aldolasa (FDP) a 25°C y pH 7
(escrita en la dirección de formación de triosa fosfato) es aproximadamente 10 -4, ΔG’º
= 5,456 kcal/mol. Calcular las concentraciones de FDP, de dihidroxiacetona fosfato
(DHAP) y de gliceraldehido 3 fosfato (GAP) en el equilibrio cuando la concentración
inicial de FDP es: a) 1M; b) 10-2 M; c) 2 x 10-4 M d) 10-5 M.
      Sol:a) 0,99M y 0,0095M, b) 0,999M y 0,000951M, c) 0,0001M y 0,0001M d) 0,999M y
9x 10-6M.
90. La enzima lactato deshidrogenasa cataliza la reacción:
      NADH + Piruvato  Lactato + NAD+
      Calcular la reacción espontánea que se produce y su ΔG cuando a pH 7 se dan las
siguientes relaciones entre concentraciones: a) Lactato/piruvato=1, NAD+/NADH=1;
b)Lactato/piruvato=1000, NAD+/NADH= 1000. E’0 NADH/NAD+=-0,32 V; E’0
Lactato/piruvato=-0,19V.
      Sol: a) reacción espontánea, b) reacción espontánea.
91. La conversión de glucosa en ácido láctico a pH 7 y 25ºC tiene una ΔG’º total de –52,0
Kcal/mol. En una célula anaerobia esta conversión se acopla a la síntesis de dos
moléculas de ATP por molécula de glucosa. Calcular: a) ΔG’º de la reacción total
acoplada, b) eficiencia de la conservación de energía en el proceso, c) con esa eficiencia
¿cuántos moles de ATP por mol de glucosa podrán obtenerse en condiciones de
metabolismo aerobio, dónde la glucosa se oxida hasta CO2 y H 2O (ΔG’º = -686,0
kcal/mol), d) calcular el ΔG’º para la oxidación total acoplada a la síntesis de ATP.
      Sol: a) –36,6Kcal/mol. b) 29,6%. c) 26 moles. d) -482950cal/mol.
 

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