Veterinaria Ao 2013

La composicin gentica de una poblacin y el modo en que esta cambia a lo largo de tiempo.

Dado que

Una poblacin evoluciona a travs de cambios en su estructura gentica, por consiguiente

La gentica de Poblaciones tambin implica un estudio de la evolucin.

Es un grupo de individuos que comparten un conjunto de genes, que viven en la misma rea geogrfica y que real o potencialmente se cruzan entre s. Todos los alelos compartidos por estos individuos constituyen el Acervo gentico de la poblacin.
Acervo gentico: conjunto de genes.

 Es el clculo de las frecuencias de los

distintos alelos en el conjunto de genes, las frecuencia de los distintos genotipos y los cambios de estas frecuencias de una generacin a la siguiente.

 Nos referimos a

Frecuencia cuando hablamos de la proporcin o porcentaje expresado como una fraccin decimal. Por ejemplo: A representa el 20% de los alelos en un locus

La frecuencia del alelo A en la poblacin ser 0,20

Estara totalmente descripta por la proporcin (o porcentaje) de los individuos que pertenecieran a cada genotipo, en otras palabras, por la frecuencia de los tres genotipos en el grupo de individuos

Frecuencias Genotpicas

Frecuencias Genotpicas
f(AA)= Nmero de individuos AA

N
f(Aa)= Nmero de individuos Aa

N
f(aa)= Nmero de individuos aa

Una Poblacin, en el sentido gentico, no es solo un grupo de individuos, sino tambin, un grupo reproductivo; y el estudio gentico de una poblacin esta interesado no solo en la constitucin gentica de los individuos, sino tambin en la transmisin de los genes de una generacin a la siguiente.

 Refirindose a los alelos (genes) que esta

lleva, se describe por medio de la especificacin de los alelos presentes en cada locus y las proporciones de los diferentes alelos en cada locus.

Frecuencias Gnicas (o allicas )

 f(A) = 2n AA + n Aa

2N
f(a) = 2n aa + n Aa

2N
n AA, n Aa y n aa representan los n de individuos AA, Aa y aa. N es el n total de individuos de la muestra, 2 alelos por individuo diploide.

Ejemplo hipottico
Para dos alelos A1 y A2. Clasificamos a 100 individuos contando las cantidades de cada genotipo:
A1A1 30 60 0 A1A2 A2A2 Total 60 10 100 60 0 120 60 20 80

N de Individuos A1 N de alelos A2

200

La frecuencia de A1 = 120 = 0,6 200

La frecuencia de A2 = 80 = 0,4 200

 Sean las frecuencias gnicas (= allicas)

y genotpicas como siguen:

Genes A1 A2 p q

Frecuencias
Donde,

Genotipos A1A1 A1A2 A2A2 P H Q

p+q=1 y P+H+Q=1 frecuencias gnicas y

Relacin entre genotpicas:

p=P+H q=Q+H

 Los antigenos M y N del grupo sanguneo humano se

determina por dos alelos codominantes, LM y LN. Aqu se clasifican los grupos sanguneos MN y los genotipos correspondientes a 398 finlandeses de Karjala.
Fenotipo MM MN NN poblacin. Genotipo LM LM LM LN LN LN Nmero 182 172 44

Calcule las frecuencias gnicas y genotpicas para esta

 f(LM LM) = N de LM LM = 182 = 0,457

398

f(LM LN) = N de LM LN = 172 = 0,432

398

f(LN LN) = N de LN LN = 44 = 0,111

398

 p = f(LM) = f(LM LM) + (LM LN)

= 0,457 + (0,432) = 0,673

q = f(LN) = f(LN LN) + (LM LN)

= 0,111 + (0,4392) = 0,327 p + q = 0,673 + 0,327 = 1

 Para un locus con 3 alelos : A1, A2 y A3; y seis

genotipos: A1A1, A1A2, A1A3, A2A2, A2A3, A3A3.

Frecuencias gnicas:

p = f(A1A1) + f(A1A2) + f(A1A3)

q = f(A2A2) + f(A1A2) + f(A2A3) r = f(A3A3) + f(A1A3) + f(A2A3)

 Alelos XA y Xa. A partir del n de genotipos:

p = f(XA) = 2n XA XA + n XA Xa + n XAY 2n mujeres + n varones

q = f(Xa) = 2n Xa Xa + n XA Xa + n XaY 2n mujeres + n varones

A partir de las frecuencias genotpicas: p = f(XA) = f(XA XA) + f(XA Xa) + f(XAY) q = f(Xa) = f(Xa Xa) + f(XA Xa) + f(XaY)

 En 1908, el matemtico Geodfrey Hardy y el

fsico Wilhelm Weinberg plantearon un modelo matemtico para explicar las relaciones entre las frecuencias gnicas y genotpicas de una poblacin. Utilizaron los principios mendelianos de la segregacin y de la probabilidad. Efecto de la reproduccin.

Ley de Hardy - Weinberg

 Establece

que en una poblacin suficientemente grande, en la que los apareamientos se producen al azar (panmixia) y que no se encuentra sometida a mutacin, seleccin o migracin, las frecuencias gnicas y genotpicas se mantienen constantes de una generacin a otra.

 1) De los progenitores a las gametas que ellos

producen. La generacin parental tiene las siguientes frecuencias gnicas y genotpicas:

Genes A1 A2 p q Genotipos A1A1 A1A2 A2A2 P H Q

Frecuencias

 2) De la unin de los gametos a los genotipos en los

cigotos producidos. El apareamiento aleatorio de los individuos equivalente a la unin aleatoria ente sus gametas. AA p2 Aa 2pq aa q2

es

Las frecuencias genotpicas dependen slo de las frecuencias gnicas en los progenitores y no de las frecuencias genotpicas de estos, siempre y cuando los progenitores se apareen al azar.

 3)

De los genotipos de los cigotos a las frecuencias gnicas en la generacin filial. Utilizando las frecuencias genotpicas determinamos las frecuencias gnicas en la generacin filial.

Frecuencia de A = p2 + (2pq) = p Frecuencia de a = q2 + (2pq) = q

Son las misma que en la generacin parental !!!!

Demostracin de la Ley de Hardy - Weinberg

Consideremos un locus con dos alelos A y B en frecuencias p y q. Denominamos P, H y Q a la frecuencia de los tres genotipos AA, AB y BB en cada sexo donde P, H y Q representan fracciones positivas tomando valores entre 0 y 1. Si el apareamiento es al azar con respecto a este locus, las frecuencias relativas de los 9 tipos de apareamiento sern los productos de las correspondientes frecuencias genotpicas

Los apareamientos AA x AA AA x Aa Aa x Aa

AA

1/2 AA

1/4 AA

p2 + 2pq + q2

Bajo las condiciones establecidas para un poblacin ideal, la ley de H-W proporciona 2 predicciones:
Las frecuencias gnicas no cambian generacin tras

generacin. Las frecuencias genotpicas en la progenie producida por apareamiento aleatorio esta determinada nicamente por las frecuencia gnicas de los progenitores. Consecuentemente una poblacin en equilibrio de H-W tiene relaciones entre sus frecuencias gnicas y genotpicas en cualquier generacin y estas frecuencias genotpicas se mantienen o se establecen en una sola generacin de panmixia. p2 + 2pq + q2

 Poblaciones considerablemente grandes

Apareamiento al azar
Poblaciones no afectadas por Seleccin, mutacin y

migracin. Todas la poblaciones presentan Mutaciones pero a tasa tan bajas que tiene poco efecto. La seleccin y la migracin son factores significativos en la poblaciones reales, pero el propsito de la Ley de HW es analizar el efecto de la reproduccin. Los supuestos de la Ley de H-W se aplican a un locus individual.

 Para determinar si los genotipos

de una poblacin estn en equilibrio de H-W deben compararse las frecuencias genotpicas observadas con las esperadas segn la ley de H-W. Para esto debemos: - Calcular las frecuencias gnicas - Hallar la frecuencias genotpicas esperadas - Comparar las frecuencias genotpicas Obs. con las esperadas mediante el empleo de la prueba de X2 (Chi-cuadrado).

 Supongamos que en una isla se soltaron bovinos

Shorthon y algunos aos despus volvemos al lugar para hacer un estudio poblacional.
Fenotipos Pelaje negro Genotipos R1 R1 N de Ind. 800 Fre. Genotipicas 0,4 Observadas Pelaje Bayo Pelaje Colorado R1R2 R2 R2 800 400 o,4 0,2

 Frecuencias gnicas:
p = 0,4 + (0,4) = 0,6 q = 0,2 + (0,4) = 0,4
Frecuencias genotpicas esperadas en equilibrio de H-W

son:
R1 R1 = p2 = (0,6)2 = 0,36 R1R2 = 2pq = 2(0,4)(0,6)= 0,48 R2R2 = q2 = (0,4)2 = 0,16
Valores esperados para cada genotipo:

0,36 x 2000 =720 0,48 x 2000 = 960 0,16 x 2000 = 320

X2 = (Observado Esperado)2 Esperado

R1 R1 O (Obs.) 800 E (Esp.) 720 (O E)2 (800 720)2=8,89 E 720
X2= 8,86 + 26,67 + 20 = 55,56

R1R2 800 960 26,67

R2 R2 400 320 20

n-2: 3-2 = 1 g.l.

 Nuestra Hiptesis es que la Poblacin se encuentra en

equilibrio. Tenemos 3 2= 1 grado de libertad Podemos considerar una probabilidad de 0.05 - 0,01 X calc. = 55,56 Si X calc. > X Descartamos nuestra hiptesis

 Si analizamos una poblacin de bovinos de raza

Aberdeen Angus en la cual hay 1000 y de los cuales 910 son negros y 90 son colorados y adems suponemos que es una poblacin panmixtica y en la que no hay seleccin artificial por el hombre.
La nica frecuencia genotpica que conocemos con certeza es la de los homocigotas recesivos: q2 q2 = 90/1000 = 0,09 ; por lo tanto la frecuencia gnica es q = 0,09 = 0,3 p + q =1 1 0,3 = 0,7 = p

 En algunas ocasiones es importante conocer la

frecuencia del heterocigota o portadores de anormalidades recesivas y esto puede calcularse si la frecuencia gnica es conocida. 2pq = 2q(1 q) Ej. Albinismo. Frecuencia de albinos = q2 = 1/20.000 q = 1/141 2q(1 q) = 1/70

1 Persona entre 70 es heterocigota para el albinismo

 Procesos

Sistemticos: tienden a cambiar las frecuencias gnicas en una forma predecible tanto en cantidad como en direccin. - Migracin - Mutacin - Seleccin Proceso Dispersivo: acta en las poblaciones pequeas o finitas debido a los efectos de muestreo, y es predecible en cantidad pero no en direccin. - Deriva gnica - Endogamia

Migracin o Flujo Gnico

 Supongamos que una poblacin grande consiste en

una proporcin m de inmigrantes nuevos en cada generacin, el resto 1 m, son nativos. Sea la frecuencia de un gen: qm en inmigrantes q0 en nativos
La frecuencia de genes en la poblacin despus de la inmigracin ser: q1 = m qm + (1 m) q0

 El q, como resultado de una generacin de

inmigracin es la diferencia entre la frecuencia antes de la inmigracin y la frecuencia despus de inmigracin: q = q 1 - q0 = m(qm - q0 ) La tasa de cambio de las frecuencias gnicas de una poblacin en la que acta la migracin es directamente proporcional a la tasa de migracin y de la en las frecuencias gnicas entre los inmigrantes y los nativos.

 Produce una mayor similitud entre las

dotaciones gnicas de dos poblaciones.

La migracin aumenta la variacin gentica

en las poblaciones.

La mutacin puede influir en la tasa a la cual aumenta una variante gentica a expensas de otra. Ej. 25 individuos Diploides. Alelos: G1 = 45 ; p = 0,9 G2 = 5 ; q = 0,1
Tasa de mutacin: frecuencia con la cual un gen cambia del tipo silvestre a un mutante especfico

G1

G2

G1 = 44 G2 = 6 q = 0,12

La cantidad de G2 que cambiar (q) como resultado de la mutacin depende de : 1) La tasa de mutacin () de G1 a G2 y 2) La frecuencia p de G1 El cambio en G2 como resultado de la mutacin es : q = p

 Cuando los genes mutan en ambos sentidos:

Hay dos alelos: G1 y G2 con frecuencias iniciales p y q G1 G2 tasa u directa G2 G1 tasa v inversa Despus de una generacin: G2 va a tener una ganacia = up y una prdida = vp El cambio de la frecuencia gnica en una generacin:
q= up - vp

 El punto de equilibrio puede alcanzarse igualando el

q a cero:
pu = qv p/q = u/v q= u u+v Con tasas normales de mutacin, estas por s solas pueden producir cambios muy lentos en las frecuencias gnicas; en la escala evolutiva dichas tasas podran ser importantes pero en experimentos no seran fcilmente detectadas

 Valor adaptativo o eficacia biolgica (W):

se define como el xito reproductivo relativo de una genotipo. La W tiene un valor de 0 a 1 . Supongamos que el N promedio de descendencia viable por tres genotipos es:
Genotipos A1A1 A1A2 A2A2

Media del n de descen.

10

Para calcular W: W11 = 10/10= 1,0 W12 = 5/10= 0,5 W22 = 2/10= 0,2

 Coeficiente de Seleccin (s): es la intensidad

relativa de seleccin contra un genotipo.

s=1w Genotipos S=1W A1A1 s11 = 0 A1A2 s12 = 0,5 A2A2 s22 = 0,8

 Si la diferencia en W esta en alguna forma asociada

con la presencia o ausencia de un gen en particular en el genotipo del individuo, entonces la seleccin opera sobre ese gen.
Su frecuencia en la descendencia no es la misma que

en la de los progenitores puesto que los progenitores de los diferentes genotipos pasan sus genes en una forma desigual a la siguiente generacin.

Seleccin cambia las frecuencias genotpicas

 Consideramos un caso de dominancia completa:

la seleccin acta sobre le homocigota recesivo. Genes A1 = p Dominante A2 = q Recesivo Coeficiente de seleccin contra A2A2 = s

El cambio de la frecuencia gnica, q, que resulta de una generacin de seleccin es

El efecto de la seleccin sobre la frecuencia gnica depende no slo de la intensidad de la seleccin, s, sino tambin de la frecuencia gnica inicial.

A2A2 1s

No dominancia A1A2 1- s Dominancia Completa

A1A1 1 A1A2 A1A1 1

A2A2 1s Sobredominancia A1A1 1 s1

A2A2 1 s2

A1A2 1

 La seleccin tambin puede actuar contra el fenotipo

dominante y favorecer al recesivo, en este caso el valor de W para A1A1 y A1A2 ser 1 s

 La

seleccin tambin puede favorecer al heterocigota, condicin conocida como sobredominancia. En este caso 1 s1 y 1 s2 para W de los dos homocigotas. Para este caso q =

 La efectividad de la seleccin, o sea, el valor de q,

depende de la frecuencia gnica inicial, q.

La seleccin es ms efectiva en frecuencias gnicas intermedias, y por lo tanto menos efectiva cuando q es grande o pequea. ii) La seleccin a favor o en contra de un gen recesivo es extremadamente inefectiva cuando el alelo recesivo es raro.
i)

 La ley de H-W supone el apareamiento aleatorio en

una poblacin infinitamente grande. Solo en este tipo de poblaciones las gametas portaran genes que representan de manera real el conjunto gnico parental. Pero en la naturaleza estas poblaciones no existen y por lo tanto las gametas portan una muestra de los alelos presentes en el conjunto gnico parental.

 Debido al azar, la composicin de esta muestra puede

desviarse del conjunto gnico parental, y esta desviacin puede causar cambios en la frecuencias gnicas.
Esta clase de desviacin de una proporcin esperada

debido al tamao limitado de la muestra se denomina: Error de muestreo Deriva gnica (o cambios en la frecuencia gnica) Dado que las desviaciones de las proporciones son aleatorias, la direccin del cambio es impredecible, pero no as la magnitud del cambio.

 La cantidad de deriva gentica puede estimarse a partir

de la varianza de las frecuencias gnicas. La varianza, s2, es una medida estadstica que describe el grado de variabilidad en un rasgo. Despus de una generacin de apareamiento al azar, la deriva gentica expresada en trminos de varianza ser: sp2 = pq/2N La deriva gentica ser mxima cuando p y q sean iguales (0,5 c/u)

 Efecto fundador: establecimiento de una poblacin

por un nmero pequeo de individuos. El azar determina los alelos presentes en los fundadores y tendr una influencia importante en la composicin de la poblacin original. Ej. Casos de inmunodeficiencia combinada (IDC); gen recesivo. Una yeguada rabe fue fundada mediante la importacin de sementales procedente de Inglaterra. Se estima que la f(idc) < 0,1. Los sementales eran heterocigotas con f(idc) =0,5.

 Cuello de botella: ocurre cuando una poblacin sufre

una reduccin drstica de su tamao.

Ej. Elefantes marinos

Antes de 1800 se encontraban miles de estos animales en las costas de California. Entre 1820 y 1880 la poblacin fue devastada por la caza. En 1884 sobrevivan 20 ejemplares que aumentaron en n cuando se restringi la caza. En la poblacin actual todos los elefantes marinos son similares genticamente porque tiene genes genes de los sobrevivientes al cuello de botella.

 1. Produce un cambio en las frecuencias gnicas dentro

de una poblacin. Dado que la deriva es aleatoria puede que la frecuencia aumente o disminuya, y puede variar con el paso del tiempo. 2. Reduccin de la variacin gentica dentro de la poblacin. El cambio aleatorio puede provocar que uno de los alelos alcance una frecuencia de 1 o 0, punto en le cual todos lo individuos son homocigotas para un alelo. Cuando la frecuencia de un alelo es 1 se dice que alcanz la Fijacin. 3. Poblaciones diferente, con el tiempo, divergen desde el punto de vista gentico.

 Es el apareamiento preferencial entre individuos

relacionados.

Aumento de homocigotas y disminucin de heterocigotas Un individuo diploide puede tener: - 2 alelos en el mismo estado pero de origen diferente. - 2 alelos sean idnticos por ascendencia (descendencia), es decir, las dos copias proviene del mismo ancestro.

 La

endogamia se mide por el Coeficiente de endogamia, F, que es una medida de la probabilidad de que dos alelos sea idnticos por ascendencia.

F puede variar de 0 a 1: 0 = indica que el apareamiento es al azar 1 = indica que todos los alelos son idnticos por ascendencia
De esta manera la Endogamia afecta las frecuencias genotpicas !!

 Con la endogamia el heterocigota disminuye en 2Fpq,

y la mitad de este valor se agrega a la proporcin de los homocigotas en cada generacin. Frecuencias genotpicas: f(AA) = p2 + Fpq f(Aa) = 2pq Fpq f(aa) = q2 + Fpq

 La endogamia aumenta la proporcin de homocigotos y

por eso estimula la probabilidad de que los alelos recesivos deletreos y letales se combinen para producir homocigotas con un rasgo perjudicial.

Ej. Tengo un alelo recesivo a que causa una enfermedad

gentica y tiene una q = 0,01, si la poblacin se aparea al azar, F= 0 la f(aa)= q2= 0,0001 1 de cada 10.000 ind. Tiene la enfermedad. Si F = 0,25 (her-her) f(aa)= q2 + Fpq = (0,01) + 0,25 x 0,99 x 0,01 = 0,0026 La enfermedad es 26 veces mas frecuente Depresin por endogamia Medida de la prdida de W ocasionada por la cosanguinidad