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Ultima unidad de Bioquímica.

VIII

PARTE 1

Ácidos Nucleicos o nucleoproteínas:

La célula tiene una membrana citoplasmática, que la


delimita de su entorno que sería el espacio extracelular
en su interior tiene organelos nadando en el citoplasma
los cuales están todos delimitados por una membrana
celular, por eso se dice que es una estructura
compartimentalizada, es decir, tiene distintos
compartimientos separados por membranas celulares, en
su interior tiene el nucléolo y el núcleo es en el
nucleoplasma en donde encuentra el material genético el
cual está conformado por ADN en el caso de las células
eucariotas, en el caso de las células procariotas están
delimitadas igual por una membrana celular que las
separa del espacio extracelular, en su interior el
contenido genético se encuentra disperso, los organelos
más el contenido genético están todos contenido dentro del mismo espacio, tiene cilios y flagelos. PERO, OJO
LO IMPORTANTE AQUÍ ES QUE LAS PROCARIOTAS TIENEN EL MATERIAL GENETICO
DISPERSO.

Las células eucariotas son de un nivel de especialización mayor que las células procariotas, el hecho de que las
procariotas tengan el material genético disperso hace que cuando ellas se dividan puedan tener más errores en
su transcripción, replicación en la formación de nuevas células, mientras que las eucariotas son más precisas y
exactas en su proceso debido a su alto nivel de especialización que las hace de mejor estructura es relación con
las procariotas.

Tenemos la célula, dentro de ella vemos el núcleo y dentro del núcleo


vemos el material genético, el cual se encuentra enrollado de una forma
exacta y específica y es lo que forma los cromosomas, si se estira el
material genético, observamos la estructura del ADN.

Ácidos nucleicos:

Sustancias poliméricas constituidas por nucleótidos unidos en una


secuencia específica a través de enlaces 3´  5 ´ fosfodiester.

Representados por el ADN y el ARN.

ADN: ácido desoxiribonucleico.

ARN: ácido ribonucleico

Los ácidos nucleicos contienen la información genética de una célula, cada especie tiene una formación
genética, sin embargo el ADN de un individuo u organismo es el mismo en todas las células que lo forman.
( es
decir si tomamos una neurona, glóbulo blanco, rojo.. todos van a contener el mismo ADN) Las modificaciones
ocurren en las especies.

UBICACIÓN DE LOS ACIDOS NUCLEICOS:

Están dentro del núcleo de la célula.

ADN: Presente principalmente en el núcleo de la célula. También se localiza en las mitocondrias (recordar que
la mitocondria se encuentra en el citoplasma), siendo este de origen materno.

ARN: La mayor cantidad se encuentra en el citoplasma y una pequeña parte en el núcleo. (ARNm tiene una
información que la toma del núcleo y la lleva al citoplasma)

Los dos se encuentran dentro del núcleo. (Recordar las excepciones)

NUCLEOTIDOS:

El nucleótido tiene la letra T que es de 3 mensas.

 Conforman los AN
 Está formado por 3 cosas:
1. 1. Azúcar: que es una ribosa, pentosa de 5 atomos de
carbono.
2. 1 Bases nitrogenadas que son de dos tipos Puricas
y Pirimidinicas. En total son 5 BN.
3. 1. Grupo fosfato

ESTOS 3 ELEMENTOS FORMAN UNA UNIDAD


MONOMERICA, entonces, el ácido nucleico es una
cadena polinucleotidica (varios nucleótidos).

 Bases Nitrogenadas Pirimidinicas:

Están conformadas por un solo anillo. Son 3


bases nitrogenadas Pirimidinicas:

1. Uracilo (u): 2,4 dioxipirimidina presente en el ARN


2. Tiamina (T): 2,4 dioxo-5-molilpirimidina presente en
el ARN Y ADN
3. Citosina (C): 2-OXO-4- aminopirimidina presente en el
ARN Y ADN

La numeración de sus elementos es en sentido de


las agujas del reloj.

 Bases nitrogenadas Purinas:


Están conformadas por 2 anillos son 2 bases nitrogenadas purinas. Tienen un anillo principal el más
grande numerado en sentido antihorario y un anillo pequeño de Imidazol en sentido horario.
1. Adenina (A) 6- aminopurina
2. Guanina (G) 2- AMINO-6OXOPURINA

EL AGUA ES PURA, SON 5 BASES NITROGENDAS 2 de purina y


3 de pirimina. A de adenina y Gua de guanina. Y o sea si son puras
son de PURINA (éxitos con las nemotecnias de la prf.)

 AZUCAR:

Siempre es una ribosa que es una pentosa que ES UN GLUCIDO


que tiene 5 átomos de carbono ya sea una desoxirribosa en el ADN o
una ribosa en el ARN.

Lo que ocurre es que la ribosa en el carbono 2 cuando esta mantiene el grupo hidroxilo (oh) es ribosa. Pero
cuando el grupo OH pierde el oxígeno y queda el hidrogeno va a ser desoxirribosa.
El ADN SOLO tendrá un hidrogeno en el carbono 2
Mientras el ARN va a tener un grupo OH en el carbono
2

La presencia del Oxigeno es quien determinara si es ARN O ADN

Si se une el azúcar y la base nitrogenada forman un NUCLEÓSIDOS


(no posee grupo fosfato). Es con S dos cosas.

Para que se dé la formación del nucleosido tienen que unirse la B.N


con la ribosa mediante un enlace N-Glucosidico con el carbono C1 de
la ribosa siempre y el nitrógeno 1 N1 de la Pirimidina o N9 de la
pirina.

Cuando se forma un nucleosido se genera una molécula de


agua (H2O).
 GRUPO FOSFATO:

Es el elemento acido que le da el carácter de ácido nucleico.


Es capaz de ceder hidrogeniones para quedar como fosforo inorgánico
que es como se encuentra mayormente en los A.N.

Ahora para la formación del nucleótido tenemos el enlace N-glucosidico en


el carbono 1 de la ribosa pero también se une el ácido fosfórico en el
carbono 5 de la glucosa (el OH del carbono 5 C5 de la glucosa con el OH
del Ácido fosfórico) cuando se da este enlace ESTER se libera agua.
Adenosin -5-Monofosfato AMP
Adenosin por ser una adenosina, 5 monofosfato por ser en el carbono 5 de la ribosa donde esta ubicado el grupo
fosfato, si al grupo fosfato se le unen otros fosfatos pasa a ADP Y ATP.
DATOS DE LA RIBOSA:
 EN EL CARBO 1 SE UNE LA BASE NITROGENADA N-GLUCOSIDICO
 EN EL CARBONO 2 LO QUE ESTA EN EL NOS INDICA SI ES ADN O ARN
 EN EL CARBONO 3 SE PUEDE ENLAZAR CON UN PROXIMO NUCLEOTIDO CON EL OH
DEL CARNONO 3.
 EN EL CARBONO 5 SIEMPRE EL FOSFORO. ENLACE ESTER

Abreviatura A G U T C
Base Adenina Guanina Uracilo Timidina Citosina
Nucleosido Adenosina Guanosina Uridina Timidina Citidina
Nucleótido Adenilato Guanilato Uridilato Timidilato Citidilato
(Nucleosido Adenosina 5 Guanisina 5 Uridina 5 Timidina 5 Citidina 5
monofosfato, monofosfato monofosfato(GMP) monofofato monofosfato(TMP) monofosfato
NMP) (AMP) (UMP) (CMP)

Funciones de los nucleótidos:

 Son las unidades monomericas de los A.N


 Sirven como donadores de grupos fosforilos (ATP,GTP) azucares (UDP O GDP-azucares) o lípidos
(CDP- acilglicerol)
 Segundos mensajeros (AMPc).
 Derivados de nucleótidos son donadores de equivalentes reductores (NADH Y FADH)

 FORMACION DE UN POLINUCLEOTIDO:

El enlace se va a dar entre el OH del grupo fosfato del 2do


nucleótido y el OH del C3 de la pentosa del 1er nucleótido, este es
un enlace fosfodiester y se libera una molécula de H2O al
formarse y así tenemos un Dinucleótido en este tenemos 2
extremos un extremo 5 superior donde está el grupo fosfato
disponible y el extremo 3 inferior donde está el OH disponible.

Si se va a leer desde el extremo 5 al extremo 3 de arriba abajo.

Estructura Primaria:
Una hebra de ADN es un polímero lineal con direccionalidad de
un extremo a otro.
Por convenio se leen las moléculas en dirección 5 3
“secuencia de nucleótidos”.
UNIDAD VIII A.N PARTE 2
El ADN está conformada por 2 hebras.
(01:28) ADN: Depositario de la información Genética
En 1868 se hicieron los Primeros estudios químicos sistemáticos del
núcleo celular, por parte de Friedrich Miescher.
-Se realizo el Aislamiento de una sustancia que contenia fosforo,
llamada nucleina, a partir del pus de vendajes quirurgicos. La
nucleina tenia una porcion acidica (actualmene ADN) y una
proteica.
-Se observo nucleina presente en las cabezas de los espermatozoides
de salmon.
-Se sospechaba que lo que estaba adentro de esa parte proteica de la nucleina estaba asociada con la herencia
celular.
(02:16) Luego en 1949, se describieron postulados por Erwin Chargaff:
1. La composicion de las bases nitrogenadas de ADN varia de una especie a otra.
2. El ADN de tejidos dieferentes de un mismo organismo tiene la misma composicion de bases.
3. La composicion de las bases no varia con la edad, estado nutricional ni el ambiente.
4. Independientemente de la especie, siemprela cantidad de denina y guanina (Purinas) va a ser igual a la
cantidad de Timina y Citosina (Pirimidinas)
5. El % de Adeninas es igual al de Timina. Asi como el % de Guanina es igual al % de Citosina.
(03:22) En 1950, Rosalin Franklin y Maurice Wilkins, haciendo
investigaciones para tratar de indentificar que habia dentro del nucleo,
estudiaban la estructura del ADN con difraccion de rayos X.
Obtuvieron una imagen clave para dilucidar la estructura del ADN, la cual
tenia 4 astas similar a una imagen en X, lo que les hizo pensar que la
molecula de ADN podia tener una estructura helicoidal. (Dieron las primeras
ideas de que la estructura podia ser helicoidal)
Finalmente, hacia 1953, James Watson y Francis Crick postulan el modelo
tridimensional para la estructura del ADN, el cual se mantiene hasta la actualidad. Recibieron el premio Nobel
de Medicina en 1962, junto a Wilkins, por dilucidar la estructura 2daria del ADN (Pinches hombres excluyeron
a la Rosalin,ojala le haya jalado las patas a esos bichos).
MODELO DE WATSON Y CRICK (05:17)
Watson y Crick concluyen que:
-La molecula de ADN es de 2 hebras de disposicion espacial helicoidal.
-Estan estabilizadas por puentes de H (A-T-C-G) entre las bases que se apilan una sobre la otra
perpendicular al eje de las helices (Interaccion de Van der Waals) con una rotacion de 36°.
Las hebras quedan hacia el lado externo, y cuando se disponen las 2 hebras para enrrollarse, las
BN se orientan hacia el interior de la cadena (Recordar que las BN son hidrofobicas, son
anillos), mientras que los fosfatos se van a disponer hacia el exterior y entran en contacto con el
medio acuoso en el que estan. Ademas de los puentes de H, al momento del enrollamiento hay
una estabilidad por las interacciones electrostaicas de las interacciones de Van de Waals que
ayuden a mantener la estabilidad.
-La distancia de repeticiones es de aprox. 3,4 nm, es decir, la distancia entre una base y la siguiente es de aprox.
0,34nm
-Existen 10 residuos de bases por vuelta
Estructura Secundaria del ADN (08:03)
Se debe tener en cuenta que se tiene una hebra donde con un exremo
5’ y otro extremo 3’.
En la imagen, la porcion transparente es la ribosa, y las rayitas azules
son los puentes, estos ueden romperse, y ciando eso sucede la
molecula se separa (se que es obvio pero igual lo anoto xD).
(NOTA: Ubiquense en la primera linea, a la profe no se le veia el cursor)
De la hebra ubicada a la izquierda, hacia el interior (de izq a der),
enlazada al C1, esta la base nitrogenada (En la imagen corresponde a
una citosina).
A la derecha esta la 2da hebra, se observa una base nitrogenada que tienen 2 anillos (G= Guanina)
Los grupos fosfato estan hacia la parte externa, y las BN hacia el interior. Para que esas 2 hebras se enlacen, se
forman puentes entre las bases nitrogenadas: SIEMPRE, Citosina y Guanina se van a enlazar con 3 puentes de
H, mientras que Adenina y Timina se van a enlazar con 2 puentes, por lo tanto los enlaces C-G van a ser algo
mas fuertes que los de A-T.
Caracteristicas:
-Hebras antiparalelas
-Bases Internas (Recordar que son anillos, y siemrpre donde hay anillos son estructuras hirdrofobicas)
-Azucar en el centro
-Fosfato externo
(10:16) A la estructura secundaria del ADN se le describe complementariedad. La complementariedad es
fundamental en la molecula como portadora de la informacion genetica. Las hebras son complementarias
porque SIEMPRE citosina se va a enlazar con guanina (o viceversa, y
siempre adenina con timina, y esto siempre se va a dar de la
misma manera.
Antiparalelismo: Otro aspecto a tener en cuenta es que una
hebra esta en sentido 5’ – 3’, pero la otra hebra esta en sentido
3’ – 5’. Las hebras a pesar de estar ubicadas paralelas una respecto
a la otra, tienen direcciones opuestas, por lo que se describen de
forma ANTIPARALELA.
Por lo tanto, la estructura 2daria del ADN es complementaria
pero antiparalela.
Aunque las moleculas esten formadas por las 2 hebras unidas, en
algun momento, ellas se pueden separar y para ello se deben roper
los enlaces de hidrogeno que une una hebra con la otra.
Coplanariedad, apilamiento de las bases y carácter hidrofobico. (15:58)
-Las bases se encuentran dirgidas hacia el interior de la doble helice, superpuestas (Se giran a la derecha y
comienzan a apretarse, similar a lo que ocurre con un cordon de zapato)
-Forman un apilamiento similar a un monton de monedas (Parte central de las bases). Como consecuencia de
las proximidades y paralelismo de los anillos aromaticos, se originan entre ellas fuerzas de atraccion de tipo
Van der Waals (Fuerzas hidrofobicas), contribuyendo a la estabilidad de la molecula y la proteccion de la
informacion genetica.
Superficie de la Molecula: Surcos en el ADN (17:18), se describen 2: un surco
mayor y otro menor.
Variacion de la Estructura Secundaria (17:51)
Aun cuando la estructura secundaria matiene sus fosforos en la parte externa, las
BN apiladas en el centro de la molecula, tiene disposiciones diferentes:
FORMA A: Predomina en soluciones deshidratadas. En este caso la molecula es
dextrogira, es mas ancha y corta que la forma B y tiene 11 pares de base por
vuelta (Acepta 1 par de bases mas).
FORMA B: Estructura de Watson y Crick. ES la mas estable que adopta el ADN
en condiciones fisiologicas. Se le describe surco mayor y surco menor.
FORMA Z: La rotacion de la helice es levogira ( a la izq). Contiene 12 pares de
base por vuelta y la estructura es las mas estrecha y larga. (Recordar la iZquierda
tiene Z, la forma Z gira a la izquierda).
NOTA: NO SE HAN ENCONTRADO LA FORMA A A NIVEL CELULAR, PERO SI LA FORMA Z
VARIANTES LOCALES DE LA ESTRUCTURA SECUNDRIA B-
ADN (19:55)
Palíndromo: Es toda frase que puede deletrearse igual de izquierda a
derecha y de derecha a izquierda. (Ej: radar).
Secuencia Palindromica: En biologia molecular una secuencia es
palindromica cuando la secuencia de una hebra, leida de izq a derecha,
es igual que la de la otra hebra leida de derecha a izquierda. Por lo que
se puede observar en las 2 cadenas cojuntamente.
Se conserva el paralelismo y la complementariedad.
La secuencia palindromica puede encontrarse en las cadenas complementarias (la secuencia presente en las 2
hebras), o peuden encontrarse en la misma hebra (con secuencias repetidas).
22:18
Como siempre se va a dar el enlace de Timina con adenina, y citosina
con Guanina, en algun momento dado dichos palindromos pueden
generar modificaciones en la estructura.
ES decir, una hebra que esta plana puede hacer un bucle, porque las
bases se pueden unir. Por lo tanto una hebra que es larga en algun
momento puede tener esas formas o estucturas de Bucle. Se conoce
como Palindromos Interrumpidos de Hebra Sencilla.
Basado en eso, se tienen los Palindromes interrumpidos de doble hebra, donde se tienen las hebras normales
y luego se generan los bucles en ambas hebras, y adopta una forma Cruciforme.
ESTRUCTURA TERCIARIA O DE ORDEN SUPERIOR
La estrcutura Terciaria es lo suficientemente compacta para acomodar el ADN dentro del nucleo.
LA ESTRUCTURA TERCIARIA adopta una CONFIGURACION DE ORDEN SUPERIOR dando lugar
a los cromosomas.

Aquí se tiene una hebra de ADN helicoidal, y se va a unir a proteina


llamadas Histonas, y se van a organizar de manera tal que van a quedar
apiladas y apretadas y finalmente da la forma final de los cromosomas.
PERO ESTO ES UNA ESTRUCTURA DE ORDEN SUPERIOR.
EL CROMOSOMA CORRESPONDE A UNA ESTRUCTURA
TERCIARIA DE ORDEN SUPERIOR QUE COMPRENDE UN
SUPERENROLLAMIENTO

25:22
La capacidad del ADN de poder alojarse en el nucleo,
se debe al superenrollamiento
En la imagen se observan un circulos verdes muy
pequeños, que corresponden a las Histonas, estas
permiten que la hebra se enrrolle (se enrollan sobre las
histonas) y forman el nucleosoma.
Los nucleosomas se van compactando, superenrollando
y organizando perfectamente hasta qu queden
compactos formando la Cromatina y el cromosoma.
Si en un organismo diploide todo el ADN de un
cromosoma se extiende, se obtendria una longitud de
2m.
27:01 Recordar que la estructura terciaria es una estructura de orden superior, y que tiene que ver con el
enrollamiento y superenrollamiento (similar al cordon de zapato). El superenrollamiento genera una fuerza, si se
quiere separar se debe generar una fuerza importante para lograr separarlo y que se quede estable, eso ocurre
por una accion de una serie de enzimas que van ayudar a desenrollar la molecula eliminandola fuerza de torsion
que e genera dentro de la molecula para que ella se qeude abierta y de manera estable.
¿Cómo se alivia la tension que se produce in vivo cuando se desenrolla una parte del ADN y se incrementa el
superenrollamiento?
Mediante Enzimas denoinadas TOPOISOMERASAS.
Estas eliminan la fuerza de torsion de algun lugar del ADN para que ella pueda abrirse o separarse
Parte 3 AN
Recordar que el ADN está dentro del núcleo y este último contiene la información Genética. Al comenzar a
extender los cromosomas se observa en su estructura las Histonas, sobre las cuales se enrolla la molécula de
ADN para que pueda disponerse de manera perfecta. Existen proteínas Histonas y proteínas No Histonas, y la
unión de esta con el ADN forma el Nucleosoma.
Nucleosoma Contiene: Parte de la hebra de ADN con una proteína central.
GEN: Fracción de la cadena de ADN.
 CONDENSACION DEL ADN (Nucleoproteínas) 02:53
También se le llama nucleoproteína por la composición (Ácidos Nucleicos + Proteínas). Esto permite que al
ADN se le describan distintos niveles de condensación.
Cromatina: Complejo de ADN, Histonas y proteínas no histonas a partir de las cuales se forman los cromosomas.
Las Histonas son proteínas que estabilizan la estructura del ADN, contienen un elevado contenido de AAs básicos
(Arginina y Lisina)
Tipos de Histonas: H1, H2A, H2B, H3, H4
En relación a los niveles de condensación.
1. La forma más simple es la Doble Hélice
2. Luego, se dispone como un collar de Cromatina, donde
comienza a unirse con las proteínas y comienza a formar
una especie de collar.
3. Luego, las proteínas se acomodan y condensan en una
estructura mayor y formar los Nucleosomas. (Estas
proteínas se agregan entre ellas para dar la estructura
mayor)
Pueden formarse los Bucles.
4. Se describen los espirales condensados. Siguen teniendo un
superenrollamiento y superdisposición uno sobre otro, y se
mantienen perfectamente alineados.
5. Cromosoma
PRIMER NIVEL DE CONDENSACION DE LA CROMATINA
(06:46)
EL NUCLEOSOMA CONSTITUYE LA UNIDAD
ESTRUCTURAL DE LA CROMATINA. (Por
favor, no lo olviden, soñare con esto: Nucleosoma=
Proteínas MAS hebra de ADN). Los nucleosomas
unidos forman una estructura mayor.
ESTÁ FORMADO POR UN NÚCLEO PROTÉICO (DE 9 HISTONAS)
RODEADO POR ADN (146 pb)
Lo primero que se forma es el Nucleosoma, luego en otro nivel de condensación esta la cromatina, y en otro
nivel de condensación está el cromosoma.
A medida que se van enrollando, adoptan una secuencia similar a un rosario.
Una vez formados los nucleosomas, comienzan a agruparse formando una estructura
mayor, más gruesa, se le llama fibra, y se le observa con un grosor mayor (30nm).

CONDENSACION DE GRADO MAYOR (09:00)


Tiene lugar el superenrollamiento para dar lugar a la estructura del cromosoma
En esta imagen se observa cómo se va enrollando todo y se va formando un armazón
nuclear.

GENES (09:55)
GEN: Es la secuencia de ADN necesaria para la síntesis de un producto génico funcional (Proteína o
ARN). Recuerden la PRIMERA unidad Niñas: Las enzimas, el colágeno, las IgG son proteínas.
La información Genética que está dentro del Gen, va a ser la secuencia de las bases nitrogenadas que conforman
el nucleótido y es lo que permite generar una información para sintetizar una proteína, pudiendo ser insulina,
enzimas necesarias para el metabolismo. Por lo tanto la información genética va a ser la información que estará
a disposición para posterior generar la síntesis de una molécula de ARN o de una proteína (acuérdense que el
ARN es codificado en el ribosoma para sintetizar las proteínas muchachonas).
Composición de un gen: Conformado por 2 partes:
• Intrones: Segmentos de ADN no traducidos (no codificantes). No generan
ninguna información. (Es el Intruso que no tiene código =no codifica)
• Exones: Segmentos codificantes de la cadena de ADN, si generan
información que va a generar la producción de un elemento funcional.

CROMOSOMAS EUCARIÓTICOS: La cadena de ADN tiene mayor cantidad de


intrones que de exones

Intrón Exón Intrón


El 1,5% DEL DNA HUMANO ES CODIFICANTE O EXÓNICO.
GEN: 30% DEL ADN (INTRONES Y EXONES)

CROMOSOMAS PROCARIÓTICOS: NO CONTIENEN INTRONES. Todo, sea


bueno o malo codifica algo
PROPIEDADES FISICOQUIMICAS DE LOS ACIDOS NUCLEICOS (15:12)

La DESNATURALIZACIÓN del ADN es la pérdida de la conformación


nativa, es decir, desaparece la estructura secundaria y por ende los órdenes
superiores de organización. Al desnaturalizarse la molécula se desenrolla,
se abre y pierde su conformación y se pierde la estructura 2daria
La Ruptura de los enlaces de hidrógeno de los pares de base y del
apilamiento de bases, provoca desenrollamiento de la doble hélice total o
parcial (parcial porque mantiene una fuerza de torsión).
Las hebras, al romperse los puentes de H, quedan separadas, y pueden
asociarse nuevamente mediante apareamiento de las bases (Esto último es
lo que permite que se mantengan unidas).
Una vez que las hebras se separaron, quedan con fuerza de torsión natural
por la disposición que tenían anteriormente
°NO SE PRODUCE LA ROTURA DE NINGÚN ENLACE
COVALENTE (estructura
primaria)

Inductores de la Desnaturalización (17:50)


• Valores extremos de pH.
• Acción de sustancias como: urea, formamida, formaldehido.
• Temperatura superior a 80 ºC
• Los enlaces G≡C → Pto de fusión aumenta (tienen punto de
fusión mayor)
• Los enlaces A=T → Pto de fusión disminuye

Al restablecerse los valores de temperatura y pH el ADN se renaturaliza.


El ADN puede desnaturalizarse y renaturalizarse

En esta imagen vemos el efecto de la temperatura, el ADN se mantiene


estable, pero al aumentar el ADN comienza a desnaturalizarse y queda en
forma de ovillo, pero al bajar la temperatura (o quitar el elemento que
provoco la desnaturalización) el ADN tiene la propiedad de volver a su
estructura natural o su forma helicoidal. Esto último se denomina
Capacidad de Renaturalización.
(19:23)
Basados en la capacidad de renaturalización, los ácidos nucleicos también
pueden sufrir hibridación.
Propiedad de hibridación
• Desnaturalización de muestras de ADN de dos especies distintas (1 y 2)
• Durante la renaturalización, la mayor parte de las cadenas de ADN de la
especie 1 se unirán a cadenas complementarias de la especie 1. Igual en el
caso de las cadenas de ADN de la especie 2.
• Una parte de las moléculas de ADN de la especie 1 se unirán con una
parte de las moléculas de ADN de la especie 2 y darán lugar a dúplex
híbridos
En la imagen se observan moléculas de ADN desnaturalizadas en Azul, y otras
cadenas desnaturalizadas en rojo. Ellas luego pueden volver a unirse, y formar
hebras de ADN de una misma especie, sin embargo, quedaron otras hebras
Hibridas = Duplex Hibrido (formadas por una cadena roja y otra azul)

Radiación (20:48)
La radiación UV produce la condensación de 2 grupos Formación de dímeros de
etileno para formar un anillo de ciclobutano. pirimidina inducida por la luz

La radiación UV puede formar dímeros de pirimidina, se


van a condensar algunos dímeros de pirimidina para crear
una estructura distinta o anormal a lo que debería estar en
condiciones fisiológicas. Dicha condensación va a ser un
efecto de las luces UV sobre Los ácidos nucleicos, esto
puede generar errores en la producción de una proteína
haciendo que no sea funcional o que no se pueda
sintetizar.
(ESTO ESTABA EN UNA Diapo que me pasaron
Además, Procesos oxidativos pueden ser la causa más
importante de alteraciones mutagénicas del ADN. Entre
los causantes destacan las especies que contienen oxígeno
reactivo (peróxido de hidrógeno, radicales hidroxilo y los
radicales superóxido.
Algunas de las especies de oxígeno reactivo escapan de su destrucción por las enzimas que las descomponen a
productos inocuos (catalasa y superóxido dismutasa)
Efectos: Oxidación de la desoxirribosa, Ruptura de las hebras)
HIDROLISIS QUIMICA (22:10)
Los ácidos nucleicos son susceptibles de sufrir hidrolisis química (acida o alcalina), lo que ha permitido su
estudio.
1. Hidrolisis Acida: SE utiliza un acido
Ácidos fuertes rompen tanto los enlaces fosfodiester (entre el Fosfato en el C5 de un nucleótido y el OH
del C3 del siguiente nucleótido) como N-glicosidicos (enlace entre en C1 de la glucosa con la base
nitrogenadas). Por lo tanto, sirve para determinar la composición de bases pero no la secuencia.
(Porque si se tiene una molécula de ADN en un envase y se le coloca un ácido, se logra romper los
enlaces
y se tendrá de forma dispersa y separada sus componentes, pero no voy la secuencia de las bases porque
al romperse la unión de la base con la pentosa queda libre en la disolución, por ende no sabremos la
secuencia

Los Ácidos Débiles respetan los enlaces fosfodiester pero rompe los N-glicosidicos. En este caso se
mantiene la estructura lineal de la hebra de ADN pero sin las bases nitrogenadas porque este rompe los
enlaces N-glucosidicos.

2. Hidrolisis Alcalina: Se utiliza un álcalis o una Base


Rompe los enlaces fosfodiester del ARN pero no los del ADN y respeta los enlaces N-glicosidico (lo
que mantiene la secuencia de las bases), por lo que se utiliza para aislar y purificar ADN.

Recuerden que el ADN contiene desoxirribosa, lo que la hace más estable ante un álcalis o base,
mientras que si va a ser susceptible la Ribosa porque tiene un OH, de allí a que se rompan los enlaces
fosfodiester del ARN, mientras que mantiene estable a la molécula de ADN.

De igual manera va a permitir conocer la secuencia porque esta hidrolisis no rompe los enlaces N-
glucosidicos.

 METABOLISMO DE LOS NUCLEOTIDOS (25:25) Para la parte 4

RUTA DE NOVO Y DE SALVAMENTO

Sintesis de Novo: Síntesis de nucleótidos de purinas y pirimidinas a partir de precursores de bajo peso
molecular (sencillos) (aminoácidos, ribosa-5-fosfato, CO2 y NH3).

Rutas de Recuperación o de Salvamento: Síntesis de nucleótidos a partir de bases o nucleósidos que


se dispone por haberlos obtenidos tras la digestión extracelular de A.N ingeridos en el alimento o por
degradación de A.N. por muerte celular.

OJO: Ni los nucleótidos ni las bases son necesarios para satisfacer los requerimientos nutricionales

Esto estaba en las diapos que me pasaron: A diferencias de las demás clases de metabolitos que hemos
encontrado, ni los nucleótidos ni las bases son necesarios para satisfacer los requerimientos
nutricionales. La mayoría de los organismos puede sintetizar nucleótidos de purina y pirimidina a partir
de precursores de bajo peso molecular, en cantidades suficientes para satisfacer sus necesidades. Estas
son las rutas conocida como de novo y son prácticamente idénticas en todo el mundo biológico. O
también puede provenir de la ruta de salvamento que ensambla los nucleótidos a partir de sus
constituyentes provenientes de la dieta o degradación enzimática de los A.N.
BQ AN PARTE 4
 METABOLISMO DE LOS NUCLEOTIDOS
Existen 2 rutas metabólicas de los Nucleotidos: RUTA DE NOVO Y DE SALVAMENTO
1. Síntesis de Novo: Síntesis de nucleótidos de purinas y pirimidinas a partir de precursores de bajo peso
molecular (más sencillos) (aminoácidos, ribosa-5-fosfato, CO2 y NH3). ES UNA NUEVA SINTESIS
2. Rutas de Recuperación o de Salvamento: Síntesis de nucleótidos a partir de bases o nucleósidos que
se dispone por haberlos obtenidos tras la digestión extracelular de A.N ingeridos en el alimento o por
degradación de A.N. por muerte celular. Hay una degradación de nucleótidos que se van a reutilizar para
volver a sintetizar nucleótidos.
(Cuando ingerimos un trozo de carne, o vegetales, estamos consumiendo células. Al ingerir la carne
tenemos las fibras musculares y tenemos el miocito. Todas las células en su interior contienen ácidos
nucleicos. Una vez que ocurre el proceso de digestión, ocurre la degradación celular y vamos a tener
disponibles esos ácidos nucleicos que están en el interior del núcleo)
También tiene lugar la muerte celular, no todos los tejidos son de recambio rápidos, pero tenemos
tejidos que tienen un mayor recambio celular y el organismo tiene que terminar de eliminar esas células
muertas y degradar esos detritos celulares. Cuando ocurre esa muerte celular, esa célula contiene en el
interior de su núcleo ácidos nucleicos que van a estar disponibles para hacer una nueva síntesis o
terminar de ser degradados, todo dependerá de las necesidades orgánicas del organismo.
OJO: Ni los nucleótidos ni las bases son necesarios para satisfacer los requerimientos nutricionales o
energéticas del organismo, aun cuando es un metabolismo y generan un producto final, energéticamente no
aportan ningún tipo de energía al organismo.
En ninguna de las 2 formas los nucleótidos satisfacen las necesidades energéticas
Esto estaba en las diapos que me pasaron:.La mayoría de los organismos puede sintetizar nucleótidos de
purina y pirimidina a partir de precursores de bajo peso molecular, en cantidades suficientes para satisfacer sus
necesidades. Estas son las rutas conocida como de novo y son prácticamente idénticas en todo el mundo
biológico. O también puede provenir de la ruta de salvamento que ensambla los nucleótidos a partir de sus
constituyentes provenientes de la dieta o degradación enzimática de los A.N.
DEGRADACION DE LOS ACIDOS NUCLEICOS E
IMPORTANCIA DEL SALVAMENTO DE NUCLEOTIDOS
(03:43)
Esta degradacion puede producirse intracelularmente, bien sea un
recambio de ARNm o una reparación del ADN que puede ocurrir
por muerte celular o por ingestión.
En el caso de los animales, proviene principalmente de la
ingestión, y la degradación es muy similar a la digestión proteica,
donde ocurre al inicio una fragmentación.
La fragmentación se inicia en los enlaces internos (fosfodiéster)
por endonucleasas pancreáticas (son ribonucleasas y/o
desoxiribonucleasas) que actúan en el intestino delgado, y van a
generar oligonucleotidos.
Los oligonucleotidos resultantes se degradan por sus extremo por enzimas inespecíficas llamadas
fosfodiesterasas; que originan como producto mononucleotidos (pueden ser nucleósidos 5 fosfato o 3
monofosfato dependiendo de donde la enzima haya cortado el enlace fosfodiester).
Los nucleótidos pueden luego fragmentarse por nucleotidasa para dar ortofosfato y dejar el correspondiente
nucleósidos. Este nucleósido va a ser fragmentado luego por una fosforilasa (que al igual que la glucógeno
fosforilasa) la nucleótido fosforilasa, que puede romper el enlace glucosídico mediante la adicción de un Pi
originando la base nitrogenada correspondiente (nucleobase) y la ribosa1Pi.
Si las nucleobases no se llegan a utilizar a través de la ruta de salvamento continúan degradándose hasta generar
2 elementos: ácido úrico (en el caso de las purinas) y ureidopropionato (pirimidina).
En el caso de que las nucleobases vayan a ser utilizadas para sintetizar estructuras más complejas, se utiliza un
compuesto que se denomina PRPP, con intervención de la enzima fosforibosil transferasa.

PRPP: Metabolito Central en las Rutas de NOVO de los anillos de purinas y pirimidinas (07:12)

PRPP: 5 fosfo Ribosil-1-Pirofosfato. Es un azúcar fosfato activado.


El PRPP va a ser útil tanto en la síntesis de novo como en la ruta de salvamento, de allí a que se considere como
un metabolito central en la rutas de formación de purinas y pirimidinas.
Sintesis: Inicia a partir de la Ribosa-5-Fosfato, y por acción de la enzima PRPP sintetasa (FosfoRibosil
Pirofosfato sinteTASA), que utiliza una molécula de ATP y transfiere 2 átomos de Fosfato (grupo pirofosfato) al
C-1 de la ribosa, y se genera el 5-Fosforribosil-1-pirofosfato (mantiene su fosfato en el C5, pero en el C1 va a
unir 2 grupos fosfato).
SINTESIS DE NOVO DE LOS NUCLEOTIDOS DE PURINAS: Transferencia de un grupo amino al PRPP.
Luego de la formación del PRPP, la siguiente reacción importante en las síntesis de purinas va a ser la
transferencia de grupos Amino el cual es aportado por la Glutamina, que va a salir como Glutamato y va a
liberar un Pirofosfato, por la enzima Glutamina-PRPP amidotransferasa, y se forma la 5-Fosfo-β-D-
Ribosilamina (Fosforribosilamina) también abreviada como PRA.

Síntesis de Purinas a Partir de PRPP hasta Acido Inosínico. (09:56)


Se lleva a cabo en una ruta de 10 pasos donde se consume 4 ATP a ADP en donde se van incorporando cada
uno de los precursores hasta originar el primer compuesto de purinas el IMP o ácido inosínico.
Esta síntesis va a iniciar a partir del PRPP: Se tiene al inicio la Ribosa-5-Monofosfato, que luego se fosforila
con una molécula de ATP por la PRPP sinteTASA, y se genera el PRPP. Luego se incorpora una Glutamina, y
forma la Fosforribosilamina, sobre este compuesto van a ocurrir 11 reacciones (Tomando en cuenta desde la
primera, es
decir la activación). Esta ruta tiene alta carga energética o demanda energética, debido al consumo de ATP. El
producto final es el Ácido Inosínico o IMP. También utiliza el Tetrahidrofolato (Ácido Fólico en su forma
activa) para aportar algunos elementos a los anillos, siendo una de las razones por las cuales a las embarazadas
se les indica ácido fólico desde el inicio del embarazo (se forman Bases nitrogenadas para la síntesis de
nucleótidos, y ácidos nucleicos dentro del núcleo de las células de los tejidos en formación).
Esto es en relación a la síntesis de Purina, donde se inicia con la ribosa y el fosfato y termina con la ribosa que
todavía se mantiene igual, pero tiene una base con 2 anillos característico de las Purinas.
- Las reacciones 2 y 5 son por una aminotrasferansa, la diferencia es que la Rx 2 no requiere ATP pues el
compuesto ya ha sido activado en el paso anterior (Recuerden, durante la formación del PRPP).
- En la Rx 3 se trasfiere una molécula de glicina con ayuda de ATP al nitrógeno de la fosforibosilamina.
- Luego va seguido una reacción (4) de transformilasa en el que el grupo formilo se transfiere desde 10-
formiltetrahidrofolato al anillo de purina en formación.
- Rx6 un cierre de anillo dependiente de ATP que da origen al anillo de imidazol de purina.
- Rx 7 es una carboxilación reversible (no requiere biotina).
- Rx 8 y 9 da lugar a la transferencia de nitrógeno del aspartato (idéntica a la del ciclo de la urea).
- Rx 10 transformilasa contransferancia de un carbono desde 10-formiltetrahidrofolato.
- Rx 11 reacción de condensación interna
SINTESIS DE NOVO DE LOS NUCLEOTIDOS DE PURINA
Origen de los Componentes de Anillo de Purina (13:36)
En la sintesis de novo de los nucleótidos de purina, cada
elemento es aportando por un compuesto específico:
Tetrahidrofolato (Formato), Aspartato, CO2, Glicina, Glutamina

RUTAS DEL ACIDO INOSICO AL


GMP Y AL AMP. (14:24)
Seguimos en la síntesis de Bases
Nitrogenadas de Purinas (Bases
Puricas), esta tiene lugar a partir de un
precursor inicial que es el PRPP, cuyo
producto intermediario es el IMP y
finalmente este será el que de origen a
la síntesis los Productos Finales que
van a ser Guanina y Adenina.
Una vez obtenido el IMP va a haber una
bifurcación, y se tienen 2 rutas: Una para sintetizar Adenina, que sale en forma de Adenilato (o AMP), y otra
para la síntesis de Guanina, que sale como Guanilato.
Síntesis de Adenilato o AMP: El ácido inosínico constituye un punto de ramificación de la síntesis de purinas.
El ácido inosínico tiene su ribosa y su grupo fosfato. La ruta de la producción de AMP involucra la acción de la
enzima adenilato succinato sintasa, que incorpora una molécula de aspartato y utiliza un GTP, (hay
transferencia de N desde el aspartato al IMP), y se forma un intermediario adenilosuccinato, que luego se
fragmenta o separa por la enzima adenilato succinato liasa, liberando fumarato y el producto resultante es el
AMP o AdenilatoMonofosfato, que tiene la ribosa, el fosfato y el anillo de adenina.
Síntesis de Guanilato o GMP: La ruta de los nucleótidos de guanina se inicia con la incorporación de una
molécula de H2O, y utiliza NAD que sale en forma reducida (NADH) (Estos permite la hidroxilacion del anillo
de purina), lo que da lugar a xantina monofosfato, luego se incorpora un amino de la glutamina (y esta queda
como glutamato) por acción de la XMP aminasa, con el gasto de 1 ATP (AMP+PPi), y origina GMP o Guanina
Monofosfato, que tiene el anillo de Guanina, la ribosa y el fosfato.
Están siendo sintetizados o producidos como un nucleótido (con su ribosa y su fosfato pegados) y como
Monofosfato, en cada caso.
Podemos observar como en la síntesis de AMP se requiere es GTP y no ATP, esto indica que un aumento en las
concentraciones de GTP promueve o favorece que la ruta se dirija a la síntesis de AMP. Y con la otra ruta es lo
inverso, se utiliza ATP en la síntesis de GMP.
1. Adenilosuccinato sintetasa
2. adenilosuccinato liasa
3. IMP deshidrogenasa (Inositol Monofosfato deshidrogenasa dependiente de NADH)
4. XMP aminasa (Xantina Monofosfato aminasa, realiza la aminación con la glutamina)
FORMACION DE GTP y ATP a partir de GMP y AMP
Para obtener ATP o GTP a partir de GMP y AMP, simplemente van a fosforilarse.
- En el caso del GTP, se produjo originalmente como GMP, y para llegar a GTP va a sufrir 2
fosforilaciones con la Guanilato Quinasa:
1era fosforilacion: GMP + ATP  GDP + ADP
2da fosforilacion: GDP + ATP  GTP + ADP
El GTP también actúa como una moneda energética, porque en algún momento puede aportar grupos fosfato para
energizar o favorecer alguna reacción.
- En el caso del ATP sucede diferente, la adenina sale como AMP y se puede fosforilar solo 1 vez, utiliza
una molécula de ATP y se forma ADP. En este caso resultan 2 ADP, uno de la fosforilacion del AMP y
el ATP que dono el fosfato al AMP queda con uno menos y se convierte en ADP. La enzima que media
la reacción es la adenilato quinasa.
AMP + ATP  2ADP

Luego, los 2 ADP se convierten en ATP pero en la cadena


respiratoria. Allí, por la ATP sintasa (Complejo V), los ADP
son fosforilados y salgan como ATP y serán útiles en cualquier
actividad metabólica que se necesiten.
CONTROL DE LA BIOSINTESIS DEL ACIDO INOSINICO POR
RETROALIMENTACION (21:22)

Los productos finales o más importantes de la síntesis de purinas son el IMP,


AMP y GMP. Un aumento de las concentraciones de estos compuestos van a
inhibir o estimular a las enzimas reguladoras de esta ruta metabólica.
Altas Concentraciones de AMP, GMP e IMP inhiben a la enzima Pirofosfato
Sintetasa La enzima Glutamina Pirofosfato amidotransferasa, es inhibida por
altas concentraciones de esos 3 productos que se generan (AMP. GMP e IMP).
El IMP inhibe por retroalimentación, es decir, si tengo mucho IMP va a
generar inhibición de las enzimas.

Los productos finales el IMP: AMP y GMP van a generar retroalimentación


negativa o inhibición en las enzimas Adenilato Succinato Sintasa y la
Adenilato Succinato Liasa, en el caso del AMP; En el caso del GMP, inhibe a
la enzima IMP deshidrogenasa y la Xantina Glutamino Amidotransferasa.
De estas, la
regulación más importante va a estar al inicio, en la PRPP sintetasa y en la Glutamina PRPP
amidotransferasa.
LA DEGRADACION DE PURINAS: Formación de Acido Urico
El AMP y el GMP van a tener una actividad de degradación, cuyo producto final sera el acido urico
UNIDAD 8

Clase 5

Degradación de las purinas

Formación de ácido úrico

(00:22) Las primeras enzimas en actuar serán las nucleotidasas donde en el AMP le van a quitar su
grupo fosfato y va a quedar Adenosina. En el caso de GMP, actúa esta misma enzima
(nucleotidasa), quita el fosforo y queda guanosina.

Para efectos del AMP, luego que dijimos que quedaba una adesonina. Va a aparecer la adenosina
deshidratasa que va a liberar un grupo amino y quedará como inosina

Tenemos también otra opción donde en el caso del AMP pierde a su grupo amino por una
desaminasa y forma igualmente el IMP

Luego de quedar como Inosina, mediante una nucleosido fosforilasa libera la ribosa 1 fosfato
y queda entonces HIPOXANTINA

En caso del GMP, cuando queda en guanosina mediante una fosforilasa va a liberar el grupo ribosa
con el fosfato y sale Ribosa 1 fosfato y queda como GUANINA

Luego esta guanina por una guanina desaminasa pierde otro grupo amino y queda finalmente
XANTINA

 En ningún momento forma ácido inosinico como la degradación del AMP

La HIPOXANTINA por medio de una xantina oxidasa se transforma en xantina y esta nuevamente
por la xantina oxidasa que utiliza oxígeno y forma peróxido y se va a formar ácido úrico

¿Qué sucede? Si no tenemos la enzima xantina oxidasa por alguna razón se acumulan los
productos previos a él

GOTA: es una patología que se refiere a la acumulación excesiva de ácido úrico.

 3 de cada 1000 individuo la padecen


 Hay personas que por asuntos metabólicos tienen una degradación mayor de esas bases de
purinas y tienen un aumento excesivo de ácido úrico.
 El ácido úrico precipita en urato (cristales) que se acumula en el organismo, básicamente
en las articulaciones, principalmente líquido sinovial. Es por ello que ocurre deformidad
en las articulaciones, siendo estas dolorosas
 Los pacientes deben llevar una dieta baja de purinas

Etiología de la gota
o Una actividad elevada de la PRPP sintetasa, pérdida de la sensibilidad a la retroinhibición
ejercida por los nucleótidos de purina por lo tanto tendré un aumento de la degradación de
ellos y aumenta la excreción o como producto final la concentración de ácido úrico.
o Pueden haber mutaciones de la PRPP aminotransferasa, pérdida del control por
retroalimentación
o Puede haber también disminución de la enzima hipoxantina guanina fosforribosiltransferasa
(HGPRT)
o Deterioro en la excreción renal de ácido úrico
o La gota puede ser una consecuencia de quimioterapia del cáncer o terapias oncológicas.
Toda situación donde se produzca lisis celular, habrá un aumento de productos de desechos
y todas las células tienen núcleo y tienen nucleoproteínas.
o Pues toda esa cantidad de ácidos nucleicos contenidos en esas células que están malas o
muertas tienen que degradarse. Un paciente oncológico presenta un aumento o
elevación del ácido úrico

Tratamiento para la gota: Alopurinol. Que es un análogo estructural de la hipoxantina que inhibe a
la xantina oxidasa para que no produzca ácido úrico y se quede como xantina.

Esto hace que se acumule xantina y por ser soluble puede excretarse por riñon.

Síndrome de Lesch - Nyhan (07:01)

 Es un déficit grave de hipoxantina guanina fosforibosil transferasa (HGPRT).


 Artritis gotosa grave
 Disfunción dramática del S.N que se manifiesta con:
- Trastorno de conducta
- Discapacidad para el aprendizaje
- Comportamientos agresivos
- Automutilaciones graves

La persona rara vez sobrevive por encima de los 20 años de edad

(No se va a preguntar en el examen, importante solo conocer)

(08:05) Síntesis de Novo del anillo de pirimidina

Sabemos que tienen un solo anillo y son distintas a la guanosina y adenosina.

 Esto comienza por la unión de una molécula de amoniaco y CO2 en esta primera
reacción que estará a cargo por la enzima Carbamoilfosfato sintetasa II y se formará el
carmaboil fostato, esta reacción utiliza dos moléculas de ATP
 Al Carbamoil fosfato se le va a unir una molécula de aspartato, donde actuará la
enzima aspartato transcarbamoilasa y formará el compuesto carbamoil fosfato
 Del carbamoil fosfato va a ocurrir una deshidratación, se le conoce como la tercera reacción
y se libera una molécula de agua y la enzima que interviene en este caso es la
dihidrooratasa y forma el dihidrooratato
 Luego ocurre una reducción que va a utilizar una deshidrogenación que va a utilizar el
NAD+ como transportador de los equivalentes, la enzima que actúa en este proceso es la
dihidroorotato deshidrogenasa y formará orotato

(09:56) Del orotato vemos un anillo pero aquí no tenemos la ribosa ni el fosforo. Por lo que una de
las diferencias de la síntesis de purinas ya comenzábamos con el PRPP y allí en su base teníamos
la ribosa y el fosfato mientras que la síntesis de la pirimidinas estamos sintetizando de inicio el
anillo y todavía no tenemos a la ribosa

- Carbamoilfosfato sintetasa II
Estas enzimas conforman un sistema
- aspartato transcarbamoilasa
multienzimático, es decir, una mega
- dihidroorotato deshidrogenasa
enzima que tiene esas 3 enzimas asociadas

Siguiendo con la síntesis quedamos en orotato, luego a mitad de la cadena es cuando se va a


incorporar el PRPP, quien va a aportar a la ribosa y al fosfato, se libera y parte del fosforo se
hidroliza y finalmente queda el anillo de orotato con la ribosa y un fosfato, esto es por la enzima
orotato fosforribosiltransferasa y se forma el compuesto orotidina monofosfato (OMP)

Posterior a esto ocurre una descarboxilación mediante la enzima orotidilato descarboxilasa y va a


formar uridina monofosfato (UMP), la cual se puede fosforilar por una 7ma y 8va reacción donde se
incorpora ATP y el UMP se conivierte entonces en UDP y luego UTP

Más tarde, el UTP se va a convertir en CTP mediante la enzima CTP sintetasa (cintocina fosfato),
tiene 3 fosfatos.

El aumento de la concentración de este producto va a inhibir a la enzima CTP sintetasa mientras


que el GTP, la alta cantidad de energía va a favorecer la actividad de esta enzima.

En esta última reacción podemos ver la glutamina que va a aportar un grupo nitrogenado y sale
como glutamato y se utilizó una molécula de ATP

Ya tenemos sintetizado la CTP que es una de las bases nitrogenadas del tipo de pirimidinas.

Defecto en el metabolismo de las pirimidinas

Los intermediarios del catabolismo de pirimidinas son hidrosolubles por lo que existen pocas
alteraciones conocidas

Acidurias oróticas
1. Tipo I: deficiencia de orotato fosforribosiltransferasa y orotidilato descarboxilasa
2. Tipo II: deficiencia de orotidilato descarboxilasa
3. OTRO TIPO: se observa en el Síndrome de Reyes, disfunción mitocondrial en la utilización
del carbamoil fosfato, aumentando su disponibilidad en citosol para producir ácido úrico.
Deficiencia de transcarbamoilasa de ornitina (ciclo de la urea)

(13:27) bases sintetizadas, hasta ahora

PURINA como ribonucleotidos

o ATP Adenina
o GTP Guanina

PIRIMIDINAS como ribonucleotidos

o UTP Uridina
o CTP Citosina

Esta faltando TTP y esta faltando convertirlos a la forma DESOXI, para que puedan formar parte de
la cadena de ADN

(14:26) síntesis de desoxiribonucleósidos trifosfatos

Primero deben transformarse en su forma de difosfato porque la enzima la ribonucleotidos


reductasa va a recibir siempre a los ribonucleotidos en forma de difosfato

 El ADN está formado por DNTPs, dGCTP, dCTP y dTTP


 La concentración de dNTPs (desoxinucleotidos trifosfatos) aumenta sólo durante
la replicación del ADN
 Los dNTPs se sintetizan a partir de sus nucleósidos difosfatos (lo sintetizamos como TP,
trifosfato, ellos deben convertirse en difosfato para que luego puedan actuar la
ribonulceotido reductasa y pueda entonces convertir el OH que está en el carbono 2 de la
ribosa, lo transforme a H solamente y quede entonces un desoxiribunucleosido difosfato.
 Luego por una quinasa ese desxoribinucleosido que ya está formado más una molécula de
ATP se va a fosforilar y va a salir como desoxinucleotido dNTP, con sus tres fosfatos y el
ATP se transforma a ADP

(15:51) Esquema
Aquí vemos como teníamos los 4 ribonucleotidos que luego por la acción de la rNP
reductasa ya salieron todos como desoxirribonucleotidos porque tienen solamente dos
fosfatos que luego se van a fosforilar y van a generar entonces el desoxiribonucleotido con
sus tres fosfatos
Igual con el Uracilo, la citosina, la guanina y la adenina seguimos pendiente con la
timina…

(16:31) síntesis del nucleótido de timidina (dTTP)


 Comenzamos con CDP y UDP, por acción de la rNDP reductasa se CONVIERTE en dCDP
y dUDP
 De dCDP a dCTP ocurre una desaminación en la cual de dCTP mediante una
desaminasa pasa a dUTP

 Esta pierde su grupo fosfato y se transforma en dUMP


 Del dUMP mediante la timidilato sintasa puede formar dTMP
 (tiene que estar en su forma desoxi para que la timidilato sintasa funcione)
 De dTMP se fosforila y pasa a dTDP a dTTP
 Esta timina siempre va a salir en su forma desoxi, es por eso que, en el ADN
tenemos timina y en el ARN uracilo

La síntesis de dTMP a partir de dUMP permite mantener bajas las concentraciones de dUTP, el cual
podrías ser incorporado erróneamente en ADN por la ADN polimerasa.

El uracilo en el ADN puede ser mutagénico.

(18:32) síntesis de dTMP

La timidilato sintasa es una enzima blanco de agentes quimioterapéuticos

(19:07) aquí tenemos la acción de la timidilato sintasa que va a formar timidina pero utiliza el
tetrahidrofolato

THF: tetrahidrofolato, derivado del ácido fólico, transfiere un grupo metilo al dUMP

(20:42) en la parte de replicación vemos la molécula original de ADN, que sabemos forma parte
del cromosoma, la hebra en cualquier momento se va a replicar y se va a separar en dos hebras y da
origen a dos nuevas hebras donde la que se ve en rojo es la nueva, y se mantiene la hebra madre que
es la azul

 Luego en la transcripción fíjense como tenemos esta hebra de ADN, vemos el ARN
polimerasa, una súper gran enzima que rueda como un cierre en la cadena de ADN y en su
proceso de desplazamiento sale una cuerdita que representa el ARN, continúa
desplazándose y va a soltar finalmente una hebra de ARN, la enzima ARNm polimerasa
está suelta y quedó indemne la molécula de ADN pero esta molécula de ARN como se
copio de manera fiel a una de las hebras, esta molécula de ARN tiene información
genética que es exacta a la que está adentro la molécula de ADN
 Luego ese ARN va a servir para el proceso de traducción, donde se va a leer lo que
estaba dentro de esa hebra y se va a sintetizar por fin una proteína, en la imagen se ven
unos aminoácidos, ellos se van uniendo para formar un péptido.

- Cada aminoácido está codificado por un codón


- Un codón es una secuencia de tres bases nitrogenadas
 Tenemos una enzima que va a generar o va a permitir que un aminoácido se una con otro
 El ARNm trae la información que estaba contenida en la hebra del ADN
 El ARNt viene con su aminoácido pegado y lo pega según la información que tenga al
codón y según eso se van uniendo los aminoácidos que forma un péptido o una molécula
que va a sufrir modificaciones post traduccionales para que pueda hacerse una proteína
funcional
Ribonucleotido reductasa
Se encarga de reducir a un ribonucleotido hacia desoxirribonucleotido, es la sustitución de un grupo
hidroxilo (OH) por un H, se pasa de rNDP a dNDP. La ribonucleotido reductasa esta compuesta por 2
subunidades alfa que son parte de la parte R1 y 2 subunidades beta R2:
 En la subunidad beta R2 tiene una tirosina que forma una especie de radical, estabilizada por un centro
de hierro dinuclear
 En la subunidad alfa se encuentran 2 residuos de cisteína (SH) que forman unos grupos tioles, ellos son
los que van a aportar los H que reducen al nucleótido.
 La subunidad alfa posee 2 sitios de regulación, uno regula la especificidad donde se une ATP, dATP,
dGTP y dTTP. Y el otro sitio actua como regulador alosterico donde se une el ATP y dATP.

1. Primer paso: Se transfiere un H+ del C-3 del


1) Form ribonucleotido hacia el grupo tirosilo de la subunidad R2, quedando
aci el radical reducido.
ón 2. Segundo paso: Uno de los grupos tiol de la subunidad R1
de de la rNDP reductasa va a transferir un H+ hacia el OH del C-2 del
ribonucleotido, quedando una molecula de agua en el C-2 (H2O).
un 3. Tercer paso: Eliminacion de la molecula de agua mediante
radi deshidratación, quedando en el C-2 un catión libre (+).
c al 4. Cuarto paso: Transferencia de H+ desde el grupo tiol que
3’ queda de la subunidad R1 hacia el C-2 del ribonucleotido,
reduciendo el catión libre, quedando los grupos tioles de la enzima
rib oxidados.
o 5. Quinto paso: Transferencia del H+ del grupo tirosilo
nuc nuevamente al C-2, regenerando al radical libre tirosilo. El
l ribonucleotido sale como desoxirribonucleotido.
6. Sexto paso: Reducción de la rNDP reductasa, obtiende los
eoti
H+ del NADPH+H desde la tiorredoxina o glutarredoxina.
do
me
Tiorredoxina: Es una enzima que se puede reducir por la tiorredoxina
reductasa, la cual es una flavoproteina. Esto ocurre porque el NADPH+H le
entrega los H+ a un FAD quedando como NADP, ese FAD sale como FADH2 y
le entrega los 2 H+ a la tiorredoxina reductasa (TRrH2) y se los pasa a la
tiorredoxina (TRH2), la cual se los entrega a la ribonucleotido reductasa (RNR)
y queda reducida (RNRr).
Glutarredoxina: El NADDPH+H le va a entregar sus dos H+ al glutatión
(GSSH) y queda reducido (2GSH), el glutatión reducido (2GSH) va a reducir a
la glutarredoxina reductasa (GR) y queda (GRrH2) esta reduce a la
glutarredoxina (GR) y queda reducida con los 2 H+ (GRH2), esta va y reduce a
la ribunocleotido reductasa para volver a ser usada.
REPLICACIÓN
Ya aprendimos que el ADN esta conformado por 2 hebras y cada una esta formada por nucleótidos
(cadenas polinucleotidicas con las bases hacia el interior), en la replicación la hebra se tiene que abrir para
formar otra hebra.
Se tiene a la hebra, las cuales son antiparalelas,
una hebra se sintetiza hacia dentro y otra hacia afuera
porque la síntesis siempre ocurre en sentido 5´-3´. Se
observa que la que va hacia dentro va de manera
continua y la que va hacia afuera forma fragmentos de
Okasaki y cada uno posee un cebador o primer o
iniciador del fragmento. Dice ARN porque es una sola
cadena, si estuvieran las dos seria ADN. Como la
síntesis es en dirección 5´-3´la hebra madre debe estar
en dirección 3´-5´, ya que las hebras son antiparalelas y
complementarias. Existe una helicasa, la cual ayuda a
que la cadena se habrá y poder formar las partes
internas o hebras hijas.
Se describe un origen, iniciación, elongación y terminación.
La replicación es el proceso mediante el cual a partir de una molecula de adn progenitora se sintetiza una
nueva, originandose asi dos moleculas hijas, de secuencia identica al adn origen. La replicación es necesaria
cada vez que se divide una célula, ya que las dos células hijas han de tener exactamente la misma dotación
genética que la célula progenitora. Entendiéndose que este proceso ha de llevarse con la máxima exactitud y
fidelidad para asegurar así la perpetuación de las especies.
La replicación ocurre en forma coordinada con la división celular
 Se lleva a cabo en la fase S el ciclo celular.
 El inicio de la replicación obliga a la célula a ir a emprender una división celular.
 El final de la replicación es una señal para comenzar la división.
Características de la Replicación
 Semiconservador: Ya que se va a conservar siempre una hebra original o hebra madre.
 Simultanea: Porque ocurre sobre las dos hebras al mismo momento.
 Secuencial: Porque se adicionan secuencialmente nucleótidos.
 Bidireccional: Porque una va de izq a der y otra de der a izq dependiendo del sentido que tenga la
hebra, que debe ser 5´-3´.
 Semidiscontinuo: Porque una
hebra es continua y la otra
discontinua (Fragmentos de
Okasaki)
La hebra que es continua se le llama
hebra conductora y la discontinua se
llama hebra retardada y cada fragmento
se llama hebra de Okasaki.
Origen de la replicación
Son los segmentos de ADN únicos presentes en el genoma de un organismo
donde comienza la replicación del ADN. el cromosoma eucarionte contiene
múltiples orígenes, mientras que el cromosoma bacteriano contiene solo uno. Son
regiones ricas en Adenina y Timina. En células procariotas tienen un solo origen
de replicadion.
- Replicón: Región del ADN que puede ser replicada por un mismo origen.
Se define como Ori C al sitio de origen y este posee dos puntos de
crecimiento (PC), de donde la celula se divide y genera 2 nuevas
células de primera generación. Es semiconservativo y bidireccional.
La replicación se lleva a cabo de manera SIMULTÁNEA en ambas
cadenas llevando una dirección en sentido 5’ → 3’. Dado que las 2
hebras del ADN son antiparalelas su separación con el avance de la
horquilla progresa en sentido opuesto, para una hebra de 3`a 5`y
para otro de 5`a 3`.
 Hebra conductora: cadena hija
que se extiende en la misma
dirección que la horquilla, la
horquilla siempre va en sentido
5´-3´.
 Hebra retardada: cadena hija
que se sintetiza en sentido
contrario a la dirección de la
horquilla.
Sobre la hebra parental se esta sintetizado la hebra en sentido 5´-3´yluego sobre la 3´-5´los fragmentos de
Okasaki en sentido opuesto.
Visión general del modelo de replicación del
DNA
En esta imagen podemos observar a la enzima
Topoisomerasa, la cual es una de las enzimas
que va a tratar de aliviar la fuerza de torsión que
tiene la hebra de ADN para que ella pueda
abrirse.
Las SSB son proteínas fijadoras que tratan de
mantener la hebra abierta y bien fija para que
pueda posarse sobre ella otras enzimas como la primasa y helicasa, que en caso de la helicasa va a ayudar a
que se vaya abriendo la horquilla suavisando la torsión helicoidal.
Se sintetiza la molecula a través de un ARN cebador, que es una estructura polinucleotidica pequeña de 2 o 3
nucleotidos sobre la que se van a seguir añadiendo nucleótidos que serán desoxinucleotidos para poder formar
la hebra complementaria.
La ADN polimerasa actua en ambas hebras.
- Replisoma: constituye todo el conjunto de proteínas que se requieren para la síntesis del ADN, ADN girasa
alivia la torsión helicoidal, helicasa, primasa, SSB, ADN polimerasa (agrega nucleótidos en forma de desoxi) y
ADN ligasa, la cual une los fragmentos de Okasaki y que la hebra discontinua quede completa-
PROTEÍNA FUNCIÓN
Proteína DnaA Reconoce la secuencia origen, abre el dúplex en
secuencias específicas del origen
Proteína DnaB (helicasas) Desenrrolla el ADN
Proteína Dna C Requerida para la unión del DnaB en el origen.
HU Proteína de unión al DNA, estimula el inicio.
Primasa (proteína DnaG) Sintetiza cebadores de ARN. Agarra 2 o 3
ribnucleotidos para que en ellos se integren otros
nucleótidos en forma desoxi.
Proteína de unión al ADN de cadena sencilla (SSB) Se une al ADN de cadena sencilla (1 sola hebra)
RNA polimerasa Facilita la actividad de la DnaA
DNA girasa (DNA topoisomerasa II) Libera la tensión torsional generada por el
desenrrollamiento de DNA

Iniciacion de la replicación
El origen es reconocidos por varias proteínas (Dna A, DnaB, Dna C, Hu) las cuales se
unen al ADN formando un complejo de reconocimiento del origen. Utiliza ATP,
proteínas DNA A intervienen en el origen y HU intervienen en la iniciación. Y se
observa la helicasa en cada hebra para mantenerla abierta.
Suele haber una secuencia especifica que se repite como origen, puede variar pero se
repite con bastante frecuencia.
Elongación
Es llevada a cabo por un complejo multiprotéico que promueve la síntesis de ADN en
la horquilla de replicación, denominado REPLISOMA. Proteínas que componen al
replisoma:
 DNA polimerasa:
o Procariotas (DNA polimerasa I, II y II) E.Coli.
o Eucariotas (DNA polimerasa α, δ, ε)
 Helicasas; junto con la Primasa conforma el primosoma.
 Primasas
 Topoisomerasas
 Proteínas de unión al ADN de cadena sencilla (SSB)
 DNA ligasas
ADN polimerasa:
 Requiere la presencia de una
hebra molde.
 Un extremo 3’ OH libre de una
base. complementaria a una
hebra molde para que pueda
unir otro nucleótido.
 Sustrato: dNTPs
 Mg+2
Todas las DNA polimerasas sólo
pueden añadir nucleótidos a una
cadena preexistente
NO ES AUTOINICIADORA.
En la imagen se observa la hebra molde en sentido 5´-3´, una desoxirribosa y un primer que va a dar
origen a la unión de otros nucleótidos, el extremo 3´OH libre, vemos que viene una adenina y su comlemntario
será una timina, una vez que se una como dNTP queda unido liberando un pirofosfato y mediante un enlace
fosfodiester, asi se van agregando y agregando por acción de la ADN polimerasa. Deben estar en forma desoxi,
porque en replicación se esta sintetizando mas ADN, una nueva hebra de ADN que debe quedar igual a la
original.
Tipos de ADN polimerasa:

Molécula Sintetizada Molécula Molde Nombre Completo Nombre Comun

ADN ADN Polimerasa de ADN dirigida por ADN ADN polimerasa

ARN ADN Polimerasa de ARN dirigida por ADN ARN polimerasa, primasa

ADN ARN Polimerasa de ADN dirigida por ARN Transcriptasa inversa


ARN ARN Polimerasa deARN dirigida por ARN ARN replicasa

Existen 3 polimerasas, pero la que es realmente activa es la polimerasa III y se dice que la polimerasa I y
II son auxiliares en el proceso de polimerización, la polimerasa III tiene capacidad de reparación, ella tiene
actividad exonucleasa 3 y cuando se incorpora un nucleótido que no corresponde porque no es complementario
a la hebra materna, ella misma puede hidrolizar el enlace porque tiene capacidad de identificar el error, puede
hidrolizar el enlace en el extremo 3´OH donde se está agregando y sacarlo para esperar al nucleótido
correspondiente.
La fidelidad de la replicación esta dada
por la adn polimerasa ya que tiene actividad
exonucleasa 3´-5´. Esta enzima en su estructura
tiene 2 sitios activos, el de la derecha es el que
tiene actividad exonucleasa, se observa que viene
una adenina hacia la citosina, ella identifica que la
adenina no corresponde y el extremo 3´OH
bloquea la elongación y la adn polimerasa se
desliza hacia atrás para colocar la base incorrecta
en el sitio de exonucleasa, donde rompe el enlace y el nucleótido apareado de manera incorrecta es eliminado,
una vez que ocurre ella sigue y se posa sobre la siguiente base para buscar el nucleótido que le corresponde.
ADN polimerasa I
 Alto grado de fidelidad (error cada 109 o 1010 nucleótidos
incorporados) Está formada por dos fragmentos:
 Fragmento grande (Fragmento de Klenow) → posee la actividad
polimerasa y 3’exonucleasa (CORRECCIÓN DE PRUEBA)
 Fragmento pequeño: posee la actividad 5’ exonucleasa. Escisión de
cebadores y elimina nucleótidos dañados y los sustituye por nuevos.
El error retarda la actividad polimerasa, dejando el nucleotido mal apareado
en el extremo 3’. El retardo permite la fusión espontánea y libera el extremo
3’ para que contacte el lugar de la exonucleasa que elimina el mal
apareamiento
 Actividad 5`exonucleasa permite eliminar los cebadores de ARN
(están en los fragmentos de Okasaki) y sintetizar ADN.
 Proceso que permite madurar los fragmentos de Okazaki, por acción
de la ADN ligasa se unen para formar una sola hebra y la polierasa
quita los cebadores de ARN mediante la incorporación del dNTP.
Pinzas y cargadores de pinzas que favorecen la procesividad
Si las hebras están bien fijas la polimerasa puede actuar con mas precisión y puede ser mas rápido la prosecución.
Para que se complete un ciclo de replicación la DNA polimerasa III debe permanecer unida a su molde, es decir,
debe actuar con procesividad. Se han identificado proteínas que actúan como pinza (complejo B) y cargadores
de pinza (complejo Y), como proteína accesoria de la polimerasa, las cuales son directamente responsables de
potenciar la procesividad.
Helicasa
Son hexámeros de proteínas que se unen al ADN en el origen separando sus dos hebras, proceso que requiere
ATP. Se crean asi dos horquillas de replicación comienzan a avanzar en sentido opuesto alejándose del origen.
Proteínas de unión a hebra sencilla (SSB)
Se unen en su forma simple a una sola hebra. Una vez separadas las hebras por las helicasas intervienen estas
proteínas que evitan el apareamiento de las bases y mantiene despegadas las hebra.
Topoisomerasas
 Son enzimas que modifican el estado de superenrollamiento, de la molécula de ADN tras la apertura
de las horquillas.
 Crea topoisomeros modificando el número de enlace del ADN.
 Hay de tipo 1 (corta una sola hebra) y de tipo 2 (corta las 2 hebras).
Primasas (ARN pol dirigida por ADN)
Ya que las ADN pol no son capaces de sintetizar ADN desde novo, es decir, unir los primeros nucleótidos, sino
solo elongar una cadena preexistente, se requiere un cebador al inicio de la síntesis de una hebra nueva.
ADN ligasa
Va a unir los fragmentos de Okasaki para que se genere una sola hebra. Se una una molecula ATP hasta AMP,
se requiere de energía.
Terminación de la replicación
 Existe una región terminl d aproximadamente 20 pares de bases denominadas Ter.
 Las secuencias Ter son sitios de unión de proteínas Tus.
 El complejo Tus.Ter detiene la horquilla de replicación desde una sola dirección.
 Cuando una horquilla de replicación se encuentra un complejo Tus-Ter, se detiene.
 La otra horquilla se detiene cuando encuentra la primera horquilla que se detuvo.
Parte 8: Tema de transcripción
No hacer caso a la numeración que está en la imagen, pero va a explicar
que la en la imagen hay una gran célula que tiene un núcleo, dentro de
este núcleo está el ADN, nosotros ya aprendimos la replicación. Con la
replicación sabemos que una cadena de ADN, en algún momento se
identifica un origen y se va a replicar hacía los dos sentidos y se van a
generar dos orquídeas de replicación y se generaron dos nuevas hebras
que tienen la misma información genética que la original, porque la
hebra que se conformó pues, se hizo de manera complementaria, por lo
tanto, cada
una de estas dos quedaron con una información exactamente igual a la original. Tenemos la molécula de ADN, que tiene
información genética exactamente igual a la original.

El siguiente proceso que vamos a ver es el de la transcripción, sobre esta hebra que estamos hablando (mi cadena de
ADN) se va a sintetizar una sola hebra (la rojita) Esa hebra nueva se llama ARN.

Si seguimos acá, vemos que tenemos nuestra hebra de ARN, que no es lineal ya que puede tener torsiones o bucles en su
disposición espacial y esta se llama Pre-MRNA (Pre-ARN mensajero) mensajero porque ella se formó copiada
exactamente de una de las hebras del ADN original, pero en este caso el ARN tiene una sola hebra pero ya sabemos que
su secuencia de nucleótidos que la conformó es exactamente complementaria a una de las hebras madres.

Este ARN mensajero tiene que sufrir transformaciones pro-transcripcionales. Una de ellas es que tienen que sufrir
cambios en la caperuza o en la cola, se hace una cola de poli AAAA porque se agrega varios nucleótidos de adenina, esto
es por dos razones:

1) La cola de poli AAAA le permite movilidad y este ARN sale del núcleo y sale al citoplasma parte las modificaciones
pro-transcripcionales es para que ese ARN cuando esté en citoplasma, él no sea degradado por enzimas citoplasmáticas
entonces ese capuchón y esa cola lo van a proteger de esas enzimas en el citoplasma.

Ya una vez que tengo esa molécula de ARN en el citoplasma. En el citoplasma están los ribosomas, ellos tienen dos
subunidades, una grande y una pequeña y en el citoplasma hay aminoácidos libres, también hay ARN de tranferencia. Un
codón es una secuencia de 3 bases nitrogenadas y a un codón se le describen el anticodón. El anticodón es una secuencia
de 3 bases nitrogenadas que va ser complementario al codón.

Entonces el ARN mensajero tiene dos codones y tiene la secuencia nucleotídica que es exactamente igual a la que estaba
adentro en el ADN ya estamos en el citoplasma.

Resumen: Se ubica el ribosoma y se adosa al ARN mensajero y entonces el ARN de transferencia que tiene el anticodón
y en unos de estos dos brazos EL ARN de transferencia va a unir a su aminoácido, eso va a ocurrir de manera consecutiva
y a medida que va rodando el ribosoma, va creciendo la cadena peptídica para finalmente hacer la síntesis proteica,
finalmente que se fue codificando la información de este ARN mensajero, ya cuando se termina la info de esa proteína
pues se disocia las dos subunidades del ribosoma y queda libre la proteína. A partir de la información genética que está
contenida
en la hebra madre del ADN ocurre la replicación para generar una nueva molécula de ADN, luego ocurre la transcripción
y generar una molécula de ARN, hay modificaciones pro-transcripcionales que debe sufrir ese ARN mensajero, él va a
salir al citoplasma y luego se dará la síntesis de proteínas, también ese proceso de síntesis de proteínas va a ser el proceso
de traducción porque la info que estaba en el ribosoma fue traducida en una proteína.

Pero esta proteína aún no es funcional, la proteína debe presentar modificaciones pro-traduccionales para que se dé una
proteína que sea funcional. Vamos a partir de la información del ADN hasta sintetizar proteínas (las proteínas son
enzimas, tejido de sostén, transportadores que cualquier cantidad de productos o de elementos son proteicos dentro del
organismo.

Transcripción
Proceso enzimático a través del cual la información genética contenida en una hebra de
ADN se utiliza para especificar una secuencia de bases complementaria en una cadena de
ARN.

La Transcripción es el 2do paso de la transmisión de la información genética. El


producto de la transcripción va a ser la formación de una molécula de ARN a partir de la
información contenida de una hebra de ADN.

Min 08:03 GEN: ES EL CONJUNTO DE SECUENCIAS DE ADN DE TODO TIPO,


ESTRUCTURALES (INTRONES Y EXONES) Y REGULADORAS, NECESARIAS
PARA CODIFICAR UN PRODUCTO GÉNICO, SEA ESTE UN ARN MADURO DE
CUALQUIER TIPO O UNA PROTEÍNA FUNCIONAL.

Recordemos que un gen estaba conformado por intrones y exones, donde una parte eran no codificables y otro sí

Nemotecnias: Intrones son los intrusos y por tanto esos eran los que no se codificaban y los exones son los que si
se codifican.

En la imagen tenemos la unidad de transcripción en el caso de procariotas que es donde son estudiados. Tenemos:

♥ Una región promotora


♥ Una región terminal
En la transcripción siempre habrá una región promotora y una parte final o terminación que va a definir cuál es el
gen o molécula de ADN que va a transcribir.

Nombres que reciben las hebras de ADN durante la Transcripción


Min 09:22 Explicación de la imagen: Recordemos que tenemos una hebra que va en sentido 5-3 y otra que va a en
sentido 3-5.

Si la transcripción va en sentido 5-3 pues nuestra hebra molde va a ser en este caso la de azul oscuro que es la hebra 3-5
porque recordemos que siempre esa polimerización es de manera complementaria y antiparalela, sobre esta secuencia de
bases nucleotídicas sobre nuestra hebra 3-5 se van agregando los nucleótidos de manera complementaria según lo que se
vaya consiguiendo en la secuencia de nucleótidos de la hebra de ADN. Estas hebras van a tener su nombre, la hebra que
va en el mismo sentido de la transcripción es la que no vamos a utilizar que es la hebra 5-3 es la hebra no molde,
mientras que la hebra 3-5 que es la hebra que si se va a codificar va servir de molde para sintetizar la hebra de ARN que
va naciendo, esa va a ser nuestra hebra molde.

Esto es lo que vimos anteriormente, pero en un esquema plano, teníamos


nuestras moléculas de ADN con una hebra en sentido 5-3 y otra en sentido
3-5, la hebra 5-3 es la no molde y la hebra molde es la 3-5 (es
antiparalela), tenemos secuencias de bases nitrogenadas y se va a estar
formando la nueva hebra de ARN que nucleótidos que son ribonucleótidos
(ARN) y se añaden nucleótidos que son complementarios a la base que se está codificando la hebra molde.

Pregunta: hebra no molde codificante y hebra molde no codificante. Así se identifica

Característisticas:

♥ Asimétrica (no simultánea en las dos hebras)


♥ Independiente para cada gen (no todo el genoma)
♥ En sentido contrario en cada hebra
♥ Existencia de genes solapantes (transcripción en ambas hebras de forma independiente y no simultánea, cada espacio
que se transcribe porta mensajes diferentes porque el final de esto es una síntesis de proteínas).
REACCION DE LA ARN POLIMERASA
Min 13:00 Tenemos la hebra molde que está en sentido 3-5 y se une nuestro 1er
nucleótido reciente y requiere de ATP, sería el primero en entrar que va a ser con la
base nitrogenada complementaria con la que está en la hebra molde del ADN,
luego va a venir un 2do nucleótido, pero tenemos que tener nuestro extremo OH
del carbono 3 de la ribosa disponible actúa la ARN polimerasa y se enlaza con este
2do nucleótido y se libera Pirofosfato (PPI), en este caso se viene el nucleótido que
tiene
la base nitrogenada complementaria a la base que está en la cadena de ADN.
RECORDAR: Con la secuencia de 3 bases nitrogenadas se llama CODÓN.
ARN Polimerasa Bacterianas
Min 14:26 Características del ARN Polimerasa Escherichia coli:
♥ Hexámero 465 kD (α2ββωσ)
♥ Requiere de un molde de DNA
♥ Utiliza NTP y libera PPi
♥ No necesita cebador, ella viene y agarra el 1er nucleótido
♥ Carece de 3’exonucleasa (corrección)
♥ Transcribe todos los tipos de ARN, recuerden que esto es en bacteria y no es tan bueno.
♥ Ellas tienen una secuencia de proteínas que se unen para hacer un ensamblaje del holoenzima que es todas las
unidades proteicas juntas.
♥ 1 porción que se liga a la molécula de ADN. Lo que va en naranja es la molécula de ADN y toda la enzima la abraza.
♥ 1 porción que recibe a los nucleótidos trifosfato.
♥ 1 porción que se le desconoce la función.
♥ 1 sitio de reconocimiento del promotor para que ella empiece a rodar como un cierre sobre la hebra (En la
transcripción siempre habrá una región promotora y una parte final o terminación que va a definir cuál es el gen o
molécula de ADN que va a transcribir).

ARN POLIMERASAS EUCARIOTAS


Tipo de Polimerasa Producto génico

I la capacidad de ARNr de 28S, 18S y 5,8S


sintetizar otras
unidades proteicas

II la capacidad de proteinas y ARNsn


sintetizar otras
unidades proteicas

III es la más activa ARNt, ARNr 5S y ARN pequeños

ARN POLIMERASA II (CASI NO LO PREGUNTAN EN EL EXAMEN)


Explicación min 17:43, preste atención porque no voy a escribir lo que sale en
la imagen, jeje.

ETAPAS DE LA TRANSCRIPCIÓN
Ubicamos un promotor ADN (está en negro), la que actúa es la ARN polimerasa y
tenemos un gen que es la parte que será transcrita y tenemos secuencia de
terminación.

Ocurre la iniciación, luego de eso empieza a rodar la ARN polimerasa sobre la


cadena y va sacando la polimerización de nucleótidos para formar la cadena de
ARN (en gris) eso sería el proceso de elongación, siguió rodando hacía la región
de
terminación, cuando llega acá todas las estructuras se disocian y quedó indemne el gen, sin nadie asociado a esa cadena, la
ARN polimerasa libre para transcribir otra área por codificar y tenemos el producto de la transcripción que es un ARN
MENSAJERO, Para que el proceso de transcripción se lleve a cabo es necesaria la unidad de transcripción completa (La
unidad de transcripción completa va desde la región promotora hasta la región de terminación) Hay una parte que el gen
transcrito, digamos que está en el medio de las regiones.

PROMOTOR
♥ Secuencias Basales: ubicada en posición adyacente al origen. Eucariota: Lo
más típico es la Caja TATA Timina Adenina, Timina, Adenina (regiones la
cadena -15 a -25) y secuencia iniciadora Inr (-3 a +5)
♥ Secuencias proximales: Ayudan a que se de el inicio a ese lugar promotor. Ubicado entre -30 y -200. No
especifican la posición de inicio sino la frecuencia de la transcripción. Caja CAAT (-60 y - 80) y la Caja GC
con cualquiera orientación a ambos lado de la caja CAAT.
♥ Secuencias Distales: Señales de regulación. Ubicadas a gran distancia del punto de inicio. Pueden ser de
tipo activadoras o inhibidoras. Regulan la expresión de genes que son ampliamente regulados por señales
(Ej. Genes de Hormonas).
Se necesitan proteínas adicionales que se fijen a ese espacio para que se dé en definitiva el inicio de
la transcripción.
ETAPAS DEL PROCESO
♥ Iniciación:
Reconocimiento del promotor:
♥ Reconocimiento del promotor por la subunidad σ .
♥ Unión de la polimerasa (formando complejo cerrado).
♥ Contacto con la caja TATAAT (-10),

♥ Separación del ADN (formando complejo abierto).


♥ Unión de ribonucleótidos.
♥ Formación de enlaces fosfodiéster. Para ir formando la cadena de ADN
♥ Disociación de σ.
♥ Movimiento de la ARN polimerasa sobre el ADN.

♥ Elongación: Interviene Núcleo catalítico α2ββ’.


♥ Terminación:
♥ Reconocimiento de señales de terminación.
♥ Participación de la proteína Rho.
Min 23:19 Explicación de la imagen: Tenemos la ARN polimerasa que indentifica al promotor y se una a la molécula de
ADN, LAS DOS HEBRAS ESTÁN CERRADAS POR ESO FORMAN UN COMPLEJO CERRADO, pero más adelante COMIENZA A
SEPARARSE LA HEBRA Y FORMAN UN COMPLEJO ABIERTO, luego se inicia la elongación con la unión secuencial de
ribonucleótidos y finalmente se disocia la subunidad de la ARN polimerasa para que ella pueda seguir avanzando en el
sentido 5-3 que es el avance de la transcripción y se va formando la nueva cadena.

Esta cadena que se forma es exactamente igual a la habra no molde y la llaman codificante porque esta
es la que realmente tiene la información, el ADN que se está formando es exactamente igual a la hebra
no molde, ella es codificante.
INICIACIÓN DE LA TRANSCRIPCIÓN
1) Formación del complejo de iniciación: Esto involucra la unión de varios
factores de transcripción a la región promotora del ADN y la incorporación de la
enzima.
Luego que se incorporó la enzima participa la formación del dominio CTD que es
no fosforilado en el caso de las eucariotas y en el caso de las procariotas la
subunidad σ que se disociaba luego del complejo.

2) Desnaturalización del Promotor


Con la burbuja de transcripción o complejo abierto (17-19 pb). El complejo de inicación produce un
desenrrollamiento y separación de las dos hebras del ADN y ocurre una desnaturalización que es local, esencial
para que se expongan las bases de la cadena de ADN y la ARN polimerasa pueda leerlo. Esta zona de la hebra
separada es lo que forma la burbuja de transcripción o complejo abierto que es el lugar donde ocurre la síntesis
del ARN, en esta zona también va a intervenir una enzima ADN helicasas-ATPasas y algunos factores de
transcripción que se necesitan para estabilizar la zona del ADN desnaturalizada, así como teníamos las proteínas
SSB en la replicación que se mantenían fijas para que pudieran rodar la ADN polimerasa, pues en este caso eso
FT son factores de transcripción que intervienen en esa fijación de las hebras para poderlas transcribir.
3) Formación de los primeros enlaces fosfodiéster
Este proceso de iniciación es autoiniciadom no necesita de ningún promotor, el ARN polimerasa es
autoiniciadora y comienza a usar ATP, luego se añaden los nucleótidos trifosfato y la hebra de ARN comienza a
crecer esto siempre ocurre en sentido 5-3 sobre la hebra molde que está en sentido contrario porque se mantiene
siempre el antiparalelismo, se le describe cadena molde, cadena no molde, sitio activo y el desenrollamiento que
lo va permitiendo la ADN helicasa.
4) Liberación del promotor
El promotor permite que se dé la iniciación y se libera de ese
promotor para que ella pueda seguir rodando hacía la derecha en este
caso y pueda seguir transcribiendo el genoma.
Procariotes: Salida de subunidad del complejo, es lo que permite
que ellas prosigan en el proceso de transcripción
Eucariotes (Polimerasa II ella puede ser regulable): fosforilación del CTD por y por factores de
transcripción TFII H.
ELONGACIÓN O ALARGAMIENTO DEL ARN
Hay factores de elongación van a evitar que se detenga la transcripción, todavía no
están identificados pero si existen y ellos impulsan la procesidad del ARN polimerasa
sobre la cadena para que ella todo ese gen, agregando todos sus nucleótidos trifosfatos
ATP, UTP, CTP, GTP.

♥ Es procesiva
♥ Fidelidad media: 10-4 errores (adecuado para transcriptos de menos de
1000 nt) Velocidad: 20-50 bases/seg (más lento en zonas ricas en G/C)
♥ La transcripción debe tener muy pocos errores.
♥ A medida que avanza, se desenrrolla pero en la parte posterior, vuelve a haber un enrrollamiento de la hebra y
finalmente la hebra queda exactamente igual como estaba.

Terminación de la transcripción PROCARIOTAS


Terminación independiente de r (ro): Secuencia señal de terminación:
palíndromo rico en G-C: horquilla segido de una secuencia rica en A que al
transcribirse da varios residuos de uridina. Son secuencias basales, ricas en
guaninas y citocinas y ricas en adenina y tinina, son secuencias nucleotídicas
con bases nitrogenadas que son señales de terminación. En caso de la hebra
nueva
de ARN no hay timinas sino uracilos (recuerden que la timina nace como dexotimina y solo está en ADN)

Min 33:03 Explicación de la imagen: Viene rodando el ARN polimerasa y sobre la


hebra del ADN y en algún momento está ARN polimerasa se consigue esta
secuencia que puede estar precedida de esta orquilla, la ARN polimerasa puede
tener distinta disposición espacial y sigue siendo hebra de ARN y se consigue con
la secuencia que será una información de terminación.Una vez que eso ocurre pues
se disocian todas las partes, se disocia la ARN polimerasa de la hebra del adn y se
desocia el ADN que se había transcrito.

Terminación dependiente de r (ro): Min 35:00 Explicación de la imagen: La ARN


polimerasa que está sobre la cadena de ADN y el ADN que se formó.

Viene la proteina RO que es una estructura aparte que se asocia a ellas. Y


basicamente ella se enrolla sobre esa hebra única de ARN (eso requiere de ATP) y
se desplaza de manera contraria al sentido que lleva la replicación, eso hace como
un tirón y se desplaza de manera contraria al sentido que lleva la
replicación y
finalmente se desnaturaliza ese híbrido que estaba formado y quedan todas las estructuras disociadas, queda la ARN
polimerasa libre, la molécula de ADN, la proteína RO y el 1er transcrito o transcrito primario, este sufre una modificación
para que cuando salga al citoplasma no se lo coman las enzimas del citoplasma.

Terminación de la transcripción Eucariotas Min 35:00 Explicación de la imagen:


36:32 Está descrito que hay una secuencia o proteína terminadora en este caso la
llaman de pausa que permite que hasta ahí se dé el proceso esta secuencia rica en
Timina en la hebra no molde. Entonces existe una secuencia específica que
resulta un punto
informativo para la ARN polimerasa y que hasta ahí llegó el proceso y ya debe
disociarse.

Inhibidores de la transcripción
Si tenemos alguna infección por bacterias por ejemplo la
Escherichia coli ella se va a multiplicar y forma más
Escherichia coli y produce más número de bacterias. ¿Qué
hacemos? Damos antibióticos.

♥ Α-Amanitina
♥ Rifampicina
♥ Actinomicina D
Estos son inhibidores de transcripción y al inhibirse este proceso de transcripción, regulamos la multiplicación
bacteriana y podemos entonces regular la infección.

INHIBIDORES DE LA TRANSCRIPCIÓN

Tipo I (directos) Tipo II (indirectos) Tipo III (indirectos)

Rifamicinas (subunidad b Actinomicina D (unión al Cumermicina (bacterias)

RNApol bacteriana y ADN), inhibe elongación

mitocondrial (menor) eucariotas y procariotas Novobiocina

Estreptolidigina Acridina Ácido nalidíxico

(subunidad b RNApol

bacteriana) Daunomicina(quimiotera

a-amanitina (elongación) peutico)

eucariotes Bromuro de etidio


DIFERENCIAS ENTRE LA TRANSCRIPCION EN PROCARIOTAS Y EUCARIOTAS
PROCARIOTAS: Todo el contenido estará disperso EUCARIOTAS: Es más específica y es compartimentalizada.
en el interior de la célula y esta no es
compartimentalizada. ♥ La cromatina debe descondensarse para que pueda
darse el proceso. La cromatina de ADN condensada
♥ ADN menos condesando.
para caber en el núcleo.
♥ El genoma se transcribe en mayor
♥ Solo se transcribe una pequeña parte del genoma
cantidad. Se hace el cualquier lugar
♥ El transcripto primario debe pasar por una maduración
♥ El transcripto primario ya es funcional.
postranscripcionales para que sea funcional.
Salga como salga
♥ Existe una separación espacial y temporal entre la
♥ Existe una asociación temporal
transcripción y la traducción. Tiene varios
espacial intima entre la transcripc. y compartimientos.
la traducción. AL no estar
♥ Existe 3 tipos de ARN polimerasa para cada uno de
compartimentalizada todo ocurre en un
los ARN.
mismo espacio y eso da mayor
♥ Un promotor-un gen-un producto. Es para un gen
posibilidad de error.
específico

TRANSCRIPTASA INVERSA: ACCIÓN DE LOS RETROVIRUS (TAREA)


La transcriptasa inversa es una enzima característica de retrovirus
que permite la replicación del material genético viral, el ARN, y
lo transforma en ADN, simplificando mucho el proceso. También
ayuda en la formación de una doble hélice de ADN una vez que
el ARN ha experimentado una transcripción inversa en una sola
cadena de cDNA. Esta enzima fue descubierta por David
Baltimore y Howard Temin en 1970, aunque la descubrieron por
separado.

Bien, ¿y cómo actúa esta enzima? Cuando el ARN de una sola


hebra del retrovirus entra en la célula, lleva consigo la
transcriptasa inversa. La transcriptasa primero sintetiza una hebra
de ADN complementaria al ARN y se forma un híbrido ARN-
ADN. A continuación, se degrada la hebra de ARN y se
reemplaza por ADN, así el resultado es una doble hebra de ADN
que normalmente se integra en el genoma de la célula infectada.
Este
genoma integrado utiliza la maquinaria celular para transcribir sus genes y proteínas.
Sin embargo, la transcriptasa inversa no es una enzima exclusiva de virus. Nosotros, los humanos, al igual que otros seres
vivos poseen en sus cromosomas una enzima llamada telomerasa que actúa como una transcriptasa inversa. A partir de un
molde de ARN que lleva consigo, alarga el ADN de los telómeros con el fin de evitar la senescencia celular antes de
tiempo. Aun así, esta enzima no está activa durante toda la vida de la célula (sólo en los estadíos de desarrollo tempranos,
ya que, si lo estuviera toda la vida celular, la célula no moriría y se transformaría en una célula cancerosa).

MODIFICACIONES POSTRANSCRICIONALES
La maduración del ARN confiere estabilidad a la molécula, básicamente por una
mayor resistencia frente a nucleasas y por un plegamiento tridimensional.
Igualmente, facilita su reconocimiento por otros componentes celulares, que mejora
la funcionalidad para la traducción.

Recordemos que este transcrito primario tiene que salir al citoplasma y ocurren dos
modificaciones:

Los azul es el transcrito primario: Se coloca una capuchón en el extremo 5 y se


habla de 5-metil-guanosina. Esta caperuza protege al ARN mensajero de la
degradación de las exonucleasas afuera en el citoplasma que reconoce solo el enlace
5-3 fosfodiester.

Como aquí hay un enlace peculiar que es el enlace 5-5 PPi (trifosfato) pues esa
identificación no se da y es suceptible a exonucleasas, además esta caperuza sirve
como punto de unión posteriormente al ribosoma para marcar ese lugar o sitio de
unión para que se dé el proceso de TRANSDUCCIÓN.

Lo otro que ocurre en este transcrito es la cola poli AAAA, se agregan una
secuencia de nucleótidos de Adenina y esta cola de poli AAAA jaja, le permite
movilidad a este transcrito para que salga al citoplasma.

♥ En el extremo 5, tenemos los 3 fosfatos, una fosfatasa elimina este


fosfato y por guanosiltransferasa o guanidiltransferasa se va a agregar la
caperuza 5-metil-guanosina, esa va a ser la caperuza del extremo 5 del ARN
que es producto de la transcripción.

♥Extremo 3’ terminal: poliadenilación, tenemos factores de rupturas que


estimulan la poliadenilación, se van colocando varios nucleótidos de adenina
para finalmente dar en ese extremo para dar esa cola de poli AAAA.
Las modificaciones protranscripcionales la ubicamos en dos:
1) La caperuza de 5-metil-guanosina
2) La poliadenilación o cola de poli A, en el extremo 3.
Mecanismo de Corte de Intrones y Empalmes de los Exones
Existe el corte de los intrones (zonas no codificables)
Y empalmes de los exanones (zonas codificables) , pero ellas se
van transcribiendo de manera continua, solo que el intrón no
tiene una información que genere el producto mientras que
los exones si, luego se genera el corte: Se cortan los intrones
y empalme: Se empalman los exones.
La eliminación de intrones está determinada por su
secuencia y no por su tamaño.
Hay secuencias específicas que determinan donde se hacen los cortes y empalmes (no hay que conocer
eso, solo que existen los cortes y empalmes).
Formación de complejos y empalmes

Después que se dan los cortes y empalmes, da lugar al ARN maduro.


Traducción
Comprender el significado del ARNm que sabemos es una copia fiel del ADN.
La traducción es que se formara una proteína.

Síntesis de Proteínas
Es el proceso por el cual la secuencia de nucleótidos de un ARNm es utilizada para ordenar los
aminoácidos de una cadena polipeptídica.
Tenemos la molécula de ADN que sufre replicación y se forma mas ADN, luego este ADN se
abría y por transcripción se sintetiza un ARNm, este llega al citoplasma hasta el ribosoma y estos
juntos van a sintetizar una cadena polipeptídica que es una proteína.

Producto de la Replicación: más ADN


Producto de la Transcripción: Producción de una hebra de ARN
Producto de la Traducción: Síntesis Proteica

Tanto en células eucariotas y procariotas ocurre el proceso de síntesis proteica, la diferencia es


que en la procariota al no estar compartimentada todo ocurre de manera desordena y tiene mas
posibilidad de error, mientras que las eucariotas todo esta compartimentado, el ARN sufre un
proceso de maduración y este llega al ribosoma para la síntesis proteica. Ver que el ribosoma
posee forma de hamburguesa debido que tiene 2 partes, una grande o sub unidad mayor y otra
pequeña o sub unidad menor, el ARNm pasa sobre la sub unidad menor. IMPORTANTE, la
proteína que se produce al principio no es funcional siempre sufrirán modificaciones post
traduccionales para poder ser funcionales.
La traducción es el único proceso que se está realizando en el citoplasma, Transcripción y
replicación ocurrieron en el núcleo.

El código Genético
Cada aminoácido posee su
secuencia de bases nitrogenadas
que lo codificara (serian cada 3
bases nitrogenadas y esto se le
llama codón)
Cada codón va a codificar
específicamente a un AA, a
medida que avanza se formara una
cadena de AA que formara un
péptido.
Se dice que es:
Degenerado por poseer codones sinónimos, más de un codón codifica a un mismo AA, pero
siempre será específico para cada AA.
Codón de inicio AUG (algo que tiene auge es algo que inicia según Brett) y este codifica
metionina, toda cadena de Aas comenzara con una metionina
Codones de parada UAA, UAG y UGA.
SOLO PREGUNTAN SOBRE EL DE INICIO.
 Hay 3 marcos de lectura, esto serian la parte
intermedia que es codificable ya que tanto el
inicio como el final no solo son.
 Los tripletes no se solapan.
 Es casi universal.

Componentes moleculares de la Traducción


o ARNm con su secuencia de codones en sentido 5-3.
o ARN de transferencia ARNt (lo rosado enrollado en
la imagen) este posee el anti codón y traerá el AA
correspondiente. Cada ARNt será específico para cada
AA
o Ribosomas
o Aminoácidos
o Aminoacil-ARNt es la unión del ARN de
transferencia con el aminoácido y esto se lleva acabo por
medio de la enzima, Aminoacil-ARNt sintetasa
o Factores de traducción
o Energía: ATP y GTP

Estructura primaria y secundaria del


ARN Conformación: Hebra sencilla, Helicoidal
dextrógira Secuencias complementarias que pueden
formar:
Doble hélice (dextrógira) conformación más común del ARN, ella puede enlazarse sobre si
misma y esta disposición espacial hace que tenga diferentes formas, bucle, cruces, ETC
Si existe interrupciones donde la hebra no tiene complementariedad se forman protuberancias o
bucles internos
Estructura del ARNm en Eucariotas
El ARNm se traduce en sentido 5’-3’
El ARNm de eucariotas es monocistrónico, codifica para una sola proteína. Mientras que las
procariotas son policistrónicas porque codifican más de una proteína.
Las regiones 5’ y 3’ son no traducibles, pueden tener secuencias de regulación. (secuencia de
inicio y fin)

ARN ribosómico

Se le llama ribosómico porque el


ARNm se unió al ribosoma.
Se observan las 2 sub unidades,
mayor y menor.
ARN de Transferencia (ARNt)
Moléculas Adaptadoras
Estructura tridimensional en forma de L y bidireccional en
forma de trébol
Todos los ARNt terminan en su extremo 3’ con la
secuencia CCA, en este extremo es donde se unirá el AA
Contiene bases nitrogenadas modificadas (pseudourina,
ribotimidina, isonina, etc) UNICO ARN QUE POSEE
ESTO.
Ojo en la imagen, es una sola hebra, pero se en algunas
partes se une y por su disposición espacial adopta esa forma
como en cruz.
Al final se ve como el ARNm tiene el codón y el ARNt el
anticodón, de colores están las bases nitrogenadas
modificadas.

El Ribosoma

Subunidad menor, coeficiente de sedimentación 40s, en esta


se encuentra el sitio de unión para el ARNm y el centro de
codificación.
En la subunidad mayor, 60s, se le describen 3 sitios:
 El Sitio A es para la unión del aminoacil-ARNt
 El sitio P es para la unión del peptidil-ARNt, es el
ARNt con su AA pegado y el anticodón
 El sitio E, de salida, es la unión del ARNt deacilado,
sin el AA
En la subunidad mayor, se ubica el centro peptidil-tranferasa
y un túnel de salida para el peptido
Fases de la Traducción
Previa o de Activación (aminoacilación)
La enzima Aminoacil-ARNt sintetasa, en este caso especifica para fenilalanina, esta esta adosada
a su Phe y por otra parte agarrara el ARNt específico para la Phe, reconoce la secuencia AAA
que es para la codificación de Phe, utilizando ATP y liberando PPi queda como resultado el
Aminoacil- ARNt. El AA y el ARNt quedan unidos por un enlace de alta energía de ester.

La activación ocurre en etapas:


El Aminoacil-ARNt sintetasa posee 3sitios de unión para un AA, un ATP y un ARNt , el AA y el
ATP se ligan entonces el ATP pierde 2 grupos fosfatos y se unen el AMP con el AA produciendo
PPi, el fosfato restante es que se une con el AA, se puede imaginar como si el AA se carga con
ese fosfato.
Luego de esto se a unir el ARNt que corresponda al AA y por la acción de la enzima se va a unir
el AA con el ARNt para formar el Aminoacil-ARNt y este se dirige al ribosoma para entregar su
AA.
Especificidad del punto de inicio
En procariotas esta secuencia de Shine-Dalgarno. Una secuencia que indica el inicio.
En eucariotas es la secuencia de Kozak que es AUG que codifica la metionina.

Iniciación
Las subunidades del ribosoma se separan por
factores de iniciación, a la subunidad menor se
la van a unir otros factores de iniciación, un
GTP y un ARNt con su metionina formando el
primer complejo, complejo pre-iniciación.
Se van a seguir agregando factores de
iniciación, todos estos factores se van a unir a
la caperuza del ARNm que seria el extremo 5,
este extremo hace que el ribosoma reconozca
el sitio de inicio y la unión de todos los
factores de iniciación, se formara el complejo
de iniciación y comenzar la traducción en
sentido 5-3.

Una vez formado el complejo de incitación, la


estructura secundaria desenrollada buscando el
sitio de inicio, se le agrega ATP.
Vemos que el complejo se movió hasta su codón
de inicio (AUG), cuando el Aminoacil-ARNt se
colocó en su sitio de AUG ahora viene la
subunidad mayor, esta se coloca sobre la
subunidad menor y completa la estructura del
ribosoma, quedando el ARNm lineal con el
ribosoma completo con el sitio P por la unión del
anticodón del Aminoacil-ARNt con el codón del
ARNm.
Tenemos el sitio P donde esta mi primer AA que
la metionina, también observamos el sito A y E,
más atrás vienen los demás Aminoacil-ARNt cada
uno con su GTP ya que es un proceso de síntesis
por ende necesitan energía, entra el próximo
Aminoacil-ARNt en el sitio A después de esto
ocurre la hidrolisis del GTP donde se produce el
primer gasto energético para la elongación,
también hay un cambio de conformacional del
ribosoma que pasa de ser una estructura redonda a
rectangular.
Ya tenemos el Aminoacil-ARNt 1 y 2 en los sitios
P y A correspondientes, ambos AA van a formar
un enlace peptídico.

Ya formado en enlace peptídico, este enlace


queda sobre el sitio A, esto porque la cadena
se va rondando hacia la derecha, ocurre la
translocación del ribosoma y el Aminoacil-
ARNt que estaba en el sito P paso al sito E y
el que estaba en el A paso al P. En que pasa al
sitio E queda sin AA ya que se unió al
anterior por eso queda como ARNt, también
vuelve a haber un cambio conformacional del
ribosoma con el segundo gasto de energía de
elongación.
Terminación de la Traducción
Observamos como queda disponible el sitio A para un nuevo
AA y como se va formando la cadena polipeptídica en el sitio
P y en el sitio E queda el ARNt sin AA.
Mas adelante aparecen factores de terminación, al llegar al
codón de terminación que es codón donde no codifica nada, el
complejo se disocia y hay liberación del complejo, se liberan
los factores de liberación, se vuelven a separar las
subunidades del ribosoma, quedan libre los ARNt y queda
finalmente mi cadena polipeptídica.
RECORDAR esta cadena en células eucariotas no es
funcional tiene que pasar por un proceso de maduración, en
las procariotas ya sale funcional y esto hace que no funcionen
de la mejor manera.

Polisoma
Agrupamientos de ribosomas (10-100), muy activos en el proceso de síntesis proteica, que
traducen simultáneamente un ARNm.
Cada ribosoma codificara una parte del ARNm para la síntesis de la proteína.
Inhibidores de la Síntesis de Proteína

Modificaciones Post traduccionales


Plegamiento Proteico
Intervienen las chaperonas que son proteínas que ayudan que el plegamiento de la proteína recién
sintetizada sea de una manera definida y de manera correcta para que se funcional. Sus funciones
son:
 Mantener las proteínas desplegadas para permitir el paso a través de membranas.
 Facilitar el desplegamiento de segmentos mal pegados.
 Impedir la formación de intermediarios incorrectos
 Impedir interacciones con otras proteínas
Las Chaperonas o Proteínas Auxiliares
Las chaperonas no solo actúan para facilitar el
correcto plegamiento de las proteínas durante e
inmediato a la traducción, sino también en
condiciones de estrés donde se puede ver
afectada el plegamiento de la proteína
 Altas temperaturas (heat shock)
 estrés oxidativo
 Altas concentraciones salinas
Estas condiciones favorecen la desnaturalización
de proteínas celulares.
¿Qué pasa si por algún motivo se plegó mal?
Simplemente no funcionará y habrá enzimas y
proteínas que va a degradar ese producto sin
funcionamiento.

Incorporación de sustituyentes a las AAs


Se le agrega cualquiera de los siguientes productos la cadena polipeptídica para que finalmente se
una cadena funcional.
 Acetilaciones
 Glicosilaciones
 Fosforilaciones
 Metilaciones
 Hidroxilaciones
 Carboxilaciones
Procesamiento proteolítico
 Remoción de la metionina inicial del
extremo animo terminal de muchos
polipéptidos, no todos tiene que
quedar con la metionina inicial para
ser funcional.
 Remoción de secuencias animo
terminales, que son secuencias señal,
pero no son útiles para hacer funcional
a la proteína.
 Formación de enzimas u hormonas
activas, mediante escisión o ruptura de
precursores inactivos de mayor
tamaño

Ejemplo la insulina:

Eliminación del péptido señal en el R.E y se transporta


al Golgi
Digestión por proteasas en el Golgi y eliminación del
péptido C no funcional.
En la imagen se puede observar cada proceso de
maduración de la insulina hasta llegar a ser funcional.
Bueno aquí estamos en final de bioquímica quien iba a pensar eso hace unos meses donde ni
siquiera sabíamos si íbamos a ver esta materia o no, en la vida siempre hay situaciones de
improviso pero todas las cosas pasan por un motivo, sin darnos cuenta debido al tema pandemia
pasamos por una de las materias filtros de las mas fuertes de la carrera vía online, que ojo
tampoco fue más fácil por eso pero nos quitamos del medio los exámenes orales por ejemplo y
clases de horas donde solo las ves una vez y listo.
Yo mas que nadie se cómo cada uno sufrió esta materia, otros más que otros, pero yo estoy
seguro que cada uno de nosotros no se va a dejar superar por esta materia y menos rendirse,
llegamos hasta el final ya de BIOQUIMICA le decimos ADIOS o todos los ciclos que parecían
infinitos y se que todos aprendimos algo que nos a ayudar en un futuro.
Para terminar solo les recuerdo, a partir de 3ero es donde de verdad te comienzas a sentir medico
y poder ver las caras de los pacientes a interactuar con ellos, comenzamos a dejar a atrás los
exámenes de papel para ver de carne y hueso, después de este año NADA NOS PARA HASTA
ALCANZAR NUESTRA META.
Gracia por todas chicas de verdad ustedes hacen de esta carrera algo mucho mejor que jamás
llegue a imaginar, espero que todos, y sé que será así, podamos llegar a la meta.
Un abrazo y vamos por el 20 el viernes y el lunes y para rematar el martes, SIEMPRE ESTARE
AGRADECIDO POR TODO LO QUE HACEN.

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