Ácidos nucleicos.

Enzimas
vitaminas y cinética

Bioquímica
2023
 1. Introducción
•Los ácidos nucleicos son polímeros derivados de la aldopentosa
ribosa, que contienen la información genética de un organismo.
•Una pequeña cantidad de ADN (ácido desoxirribonucleico) en
una célula de huevo fecundado determina las características
físicas del animal completamente desarrollado.
•La diferencia entre una rana y un ser humano está codificada
en una parte relativamente pequeña del ADN.
•Los ácidos nucleicos más importante son los ácidos
ribonucleicos (ARN) y ácidos desoxirribonucleicos (ADN).
 2. Composición de los ácidos nucleicos
Los ácidos nucleicos son polinucleótidos o polímeros de nucleótidos, es decir,
polímeros resultantes de la unión mediante enlace fosfodiéster de un número variable
de unidades monoméricas básicas, denominadas nucleótidos.

Cada nucleótido está formado por tres componentes. Una pentosa, un compuesto
heterocíclico nitrogenado, que constituye junto con la pentosa un nucleósido, y el ácido
fosfórico.
 2. Composición de los ácidos nucleicos
Pentosa:
Las pentosas son monosacáridos (glúcidos simples) formados por una cadena de cinco
átomos de carbono. Como en los demás monosacáridos aparecen en su estructura
grupos hidroxilo (OH). Además, también pueden contener grupos cetona o aldehído.

La ribosa, en particular la -D-ribofuranosa, es la pentosa característica de los ARN (ácidos

ribonucleicos) y la desoxiribosa o 2-desoxi-β-D-ribofuranosa la de los ácidos
desoxiribonucleicos (ADN)

ARN

ADN
 2. Composición de los ácidos nucleicos
Compuestos heterocíclicos nitrogenados:
Las cuatro bases que se suelen encontrar en el ARN y el
ADN están divididas en dos clases: bases pirimidínicas y
bases púricas.
Las bases pirimídinicas son los compuestos monociclicos Purina Pirimidina
Citosina, Timina y Uracilo.
La bases púricas son los compuestos bicíclicos Adenina y
Guanina.
 2. Composición de los ácidos nucleicos
La interacción entre las bases tiene lugar mediante enlaces de hidrógeno.
 2. Composición de los ácidos nucleicos
Es importante destacar el carácter aromático de las bases nitrogenadas, que hace que
los ácidos nucleicos absorban en el UV a longitudes de onda cercana a 260 nm.
Son estructuras casi planas y tienen la peculariedad de que pueden presentar diferentes
formas tautómeras.

6 diferentes tautómeros de la citosina

 2. Composición de los ácidos nucleicos
Por ejemplo, la citosina puede encontrarse en forma lactámica (normal) y entonces se
empareja con la guanina, pero puede también adoptar forma lactímica y entonces es
más estable su unión con la adenina, esto facilita las mutaciones espontáneas y por
tanto la evolución.

Adenina-Citosina(Taut) Guanina-Citosina(Taut)

Además de estas cinco bases mayoritarias los ácidos nucleicos pueden contener
pequeñas proporciones de otras bases, normalmente derivados metilados o
hidroximetilados de las bases principales
 3. Estructura de los nucleósidos y nucleótidos
Un nucleósido es el compuesto resultante de la unión de la pentosa y de una base
nitrogenada. Su unión tiene lugar, con pérdida de una molécula de agua, a través del
átomo de carbono 1' del azúcar y el átomo de nitrógeno 1 de la base pirimidínica o el
átomo de nitrógeno 9 de la base púrica, como se indica en la Figura.
Los nucleósidos comunes del ARN son :

Los nucleósidos comunes del ADN son :

3. Estructura de los nucleósidos y nucleótidos
Los nucleótidos son los ésteres fosfóricos de los nucleósidos. Todos los nucleótidos
naturales poseen el grupo fosfato unido al átomo de carbono 5' de la pentosa. En la Figura
5 se indica cómo se une el ácido fosfórico con dos nucleósidos diferentes para formar los
correspondientes nucleótidos, en una reacción que también implica pérdida de una
molécula de agua.

Los nucleótidos se nombran combinando el nombre del nucleósido del que proceden con la
palabra monofosfato. Así, el éster fosfórico de adenosina se denomina 5'-monofosfato de
adenosina (AMP)
3. Estructura de los nucleósidos y nucleótidos
Los cuatro desoxirribonucleósidos que constituyen el ADN son:

Los grupos fosfato de los nucleótidos pueden encontrarse en cualquiera de los tres
estados de ionización dependiendo del pH de la solución. Aunque en la mayoría de los
organismos el pH es prácticamente neutro (pH=7.4), por convenio, estos grupos se
representan completamente ionizados.
 4. Estructura de los ácidos nucleicos
Podemos distinguir varios niveles estructurales en los ácidos nucleicos. La estructura primaria o
secuencia, indica el orden en que se encuentran los nucleótidos. La ordenación regular y estable que
adopten los nucleótidos puede denominarse estructura secundaria, la más conocida es la estructura
de la doble hélice del ADN, descubierta por Watson and Crick en 1953.  
Los diagramas de rayos X realizados a principios de los 50 por Rosalind Franklin y Wilkins, indican que
las moléculas de ADN son largas cadenas helicoidales con dos periodicidades a lo largo de su eje.

Foto 51

El análisis químico del ADN pone de manifiesto diversos aspectos. La composición en bases
nitrogenadas es la misma para todas las células de una especie. En los ADN la proporción molar de
adenina es siempre igual a la de timina, y análogamente la proporción molar de citosina es
equimolar con la de guanina.
 4. Estructura de los ácidos nucleicos
El ADN suele estar formado por dos cadenas complementarias, con todos los pares unidos
mediante enlaces de hidrógeno donde cada base se asocia con su correspondiente (A-T y
C-G). Las cadenas son antiparalelas colocándose en sentidos opuestos.
 4. Estructura de los ácidos nucleicos
El ARN suele estar formado por una cadena. Aunque en algunos casos se pueden
encontrar dos cadenas enlazadas por enlace de hidrógeno entre las bases constituyentes.

Una Cadena de ARN

 5. Diferencias entre el ADN y el ARN

Principalmente a nivel estructural se pueden destacar tres diferencias:

1) El azúcar en el ARN es la ribosa en vez de la deoxirribosa del ADN.
2) La timina presente en el ADN esta reemplazada por el uracilo en el ARN.
3) El ADN suele estar formado por dos cadenas complementarias mientras el ARN,
en la mayoría de los casos, esta constituido por una única cadena. Esto no excluye que,
en algunos casos, en el ARN se pueda encontrar una doble cadena parcial.

Con respecto a sus funciones, el ADN almacena la información genética de las células
mientras que el ARN es el polímero que participa en los procesos que usan esta
información.

Existen tres tipos diferentes de ARN, cada uno de los cuales desempeña una función
diferente, el mensajero (ARNm), el transferente (ARNr) y el ribosómico (ARNr).
 6. Funciones de los nuleósidos y nucleótidos

Los ribonucleósidos y desoxirribonucleósidos corrientes aparecen en las células no

solamente en forma monofosfato, sino que también pueden aparecer en forma de 5'-
difosfatos (con dos moléculas de fosfórico) o bien 5'-trifosfatos (con tres moléculas).

Así los derivados del la adenosina, serían:

AMP : 5'-monofosfato de adenosina
ADP : 5'-difosfato de adenosina
ATP : 5'-trifosfato de adenosina.
 

Los nucleótidos trifosfato (NTPs) desempeñan diversas funciones en las células. Así, el ATP,
es un transportador de fosfato y de pirofosfato en diversas reacciones enzimáticas en las
que se requiere aporte energético (aunque también pueden realizar esta función el GTP, el
UTP y el CTP). Por otro, lado algunos NTPs, pueden actuar como transportadores de restos
de azúcares (energetizados) en la biosíntesis de polisacáridos. Por supuesto, la función
principal de los NTPs, es la de actuar como precursores en la biosíntesis enzimática de los
ácidos nucleicos.
 7. Herencia y replicación del ADN
Cuando la célula se divide cada nueva célula que se forma debe portar toda la información
genética, que determine sus características y funciones. Para eso, antes de dividirse, el
ADN debe replicarse, es decir generar una copia de sí mismo. Durante la replicación, la
molécula de ADN se desenrolla, separando sus cadenas. Cada una de éstas servirá como
molde para la síntesis de nuevas hebras de ADN. El proceso de replicación del ADN es
semiconservativo, ya que al finalizar la duplicación, cada nueva molécula de ADN estará
conformada por una hebra "vieja" (original) y una nueva.
 7. Herencia y replicación del ADN
La replicación se lleva a cabo gracias a la ADN polimerasa, este enzima cataliza la unión de los
desoxinucleótidos trifosfato que son abundantes en el fluido del núcleo celular. Estos
desoxinucleótidos trifosfato se desplazan hacia la parte desenrollada de la molécula de ADN y se
colocan por complementariedad enfrente de la base que les corresponde (A=T; C=G) de la cadena
que actúa como molde y una vez que están en el sitio adecuado se unen entre si por acción de la
polimerasa III.

La adición de dos unidades nucleótidicas consecutivas tiene lugar mediante la unión del grupo
hidroxilo del carbono 3’ de un nucleótido con el grupo fosfato del extremo 5’ del siguiente, el
mecanismo por el que se produce esta unión es por ataque nucleofílico del grupo 3’-OH de un
nucleótido al 5’-trifosfato del nulceótido adyacente, eliminándose el pirofosfato y formándose un
enlace fosfodiéster. La polimerasa lee la hebra que hace de molde en el sentido 3’ 5’ y sintetiza la
nueva hebra en el sentido 5’ 3’.
 Enzimas
• Catalizadores biológicos. Proteínas de forma globular
• Específicas para un substrato particular (Estéreo especificidad)
• Aceleran reacciones específicas químicas (103-10 20)
• Actúan en disolución acuosa, a pH y temp. Óptimos
• Son las unidades funcionales del metabolismo celular
• Reacciones acopladas (catabolismo – anabolismo)
Enzima pH óptimo
Pepsina 1.5

Tripsina 7.7

Catalasa 7.6

Arginasa 9.7

Fumarasa 7.8

Ribonucleasa 7.8
 Enzima Temp. Óptima (oC)

Mamíferos 37

Bacterias y algas aprox. 100

Bacterias Árticas aprox. 0

Bacterias en muestra de hielo antigua

 Enzima : fermento
1800´s Fermentación del azúcar por levaduras

1926 James B. Summer Ureasa

Pepsina
1930´s Tripsina
Quimotripsina
Carboxipeptidasa
Enzima Amarillo viejo (flavoproteína NADPH)
Medicina Transaminasas

Industria
Química Penicilina

Transformación Fermentaciones
de Alimentos Quesos
Vinos

Agricultura Rhyzobium
 Estructura
globular

 Hervir con HCl

 Tripsina
 Temperatura elevada
 pH extremo
Funcionalidad Inactiva
 S: PM 250, 0.8 nm Ø

Cofactor
E: PM 100000, 7 nm Ø
Inorgánico:
Fe2+, Mn2+, Zn2+,etc.

Orgánico:
Coenzimas
NAD,
FAD,
CoASH.
Grupo Prostético
Apoenzima Holoenzima
 Enzimas que requieren
elementos inorgánicos
Citocromo oxidasa Fe2+, Fe+,
Catalasa, peroxidasa
Citocromo oxidasa Cu2+
DNA polimerasa
Anhídrasa carbónica Zn2+
Alcohol deshidrogensa
Hexoquinasa Mg2+
Glucosa 6-fosfatasa
Arginasa Mn2+
Piruvato quinasa K+, Mg2+
Ureasa Ni2+
Nitrato reductasa Mo2+
Coenzimas: Actúan como transportadores eventuales de
átomos específicos o de grupos funcionales
Coenzimas Entidad transferida
Pirofosfato de tiamina . Aldehídos
Dinucleótido de flavina y adenina. Átomos de hidrógeno
Ion hidruro (H-)
Dinucleótido de nicotinamida y de adenina
Coenzima A . Grupos acilo
Fosfato de Piridoxal . Grupos amino
5’-Desoxicobalamina (Coenzima B12) Átomos de H y grupos
alquilo
Biocitina . CO2
Tetrahidrofolato . Otros grupos
monocarbonados
Coenzimas

Adenosine Triphosphate (ATP)

Coenzyme A (CoA)

Nicotinamide Adenine
Nicotinamide Adenine Dinucleotide
Dinucleotide (NAD+)
Phosphate (NADP+) Flavin Adenine Dinucleotide (FAD)
 Enfermedades
VITAMINAS FUNCIONES
carenciales
• C (ácido •Coenzima de algunas peptidasas. Interviene
• Escorbuto
ascórbico) en la síntesis de colágeno

•Coenzima de las descarboxilasas y de las

• B1 (tiamina) • Beriberi
enzima que transfieren grupos aldehídos
• B2 • Dermatitis y lesiones en
•Constituyente de los coenzimas FAD y FMN
(riboflavina) las mucosas
• B3 (ácido • Fatiga y trastornos del
•Constituyente de la CoA
pantoténico) sueño
• B5 (niacina) •Constituyente de las coenzimas NAD y NADP • Pelagra

• B6 •Interviene en las reacciones de transferencia

• Depresión, anemia
(piridoxina) de grupos aminos.
• B12 •Coenzima en la transferencia de grupos
• Anemia perniciosa
(cobalamina) metilo.
•Coenzima de las enzimas que transfieren
• Biotina grupos carboxilo, en metabolismo de • Fatiga, dermatitis
aminoácidos.
 Clasificación y nomenclatura
Nombre sistemático:
Grupo transferido

ATP: hexosa fosfotransferasa

Donador Aceptor Tipo de reacción catalizada

Grupos químicos
Número Enzyme Commission:

Enzyme
Comission
EC 2.7.1.1 Enzimas

Grupo Subgrupo

Nombre común (sustrato+”asa”): Hexokinasa

Clasificación y nomenclatura

Clasificación de enzimas por Grupos

EC 1.x  Oxidorreductasas
EC 2.x  Transferasas
EC 3.x  Hidrolasas
EC 4.x  Liasas
EC 5.x  Isomerasas
EC 6.x  Ligasas
 Clasificación y nomenclatura
Grupo 1: Oxidorreductasas
Catalizan reacciones de oxidorreducción, en que átomos de oxigeno ó hidrogeno son
trasladados entre moléculas:

Ared + Box Aox + Bred

AH2 + B A + BH2

En las reacciones redox, siempre tienen que estar presentes a la vez el aceptor y
el dador electrónico.
 Clasificación y nomenclatura
Grupo 1: Oxidorreductasas

Nombre: Dador:Aceptor oxidorreductasa

b-D-Glucosa : O2 1-oxidorreductasa EC 1.1.3.4

Dador Aceptor

Nombre común:
Glucosa oxidasa
 Clasificación y nomenclatura
Grupo 1: Oxidorreductasas
Nomenclatura del subgrupo en oxidorreductasas:
EC 1.1.x - Deshidrogenasas
EC 1.2.x - Oxidasas
EC 1.3.x - Peroxidasas
EC 1.4.x - Oxigenasas
EC 1.5.x - Hidroxilasas
EC 1.6.x - Reductasas
etc.

Aplicaciones: Ensayos de diagnostico clínico (glucosa oxidasa y colesterol oxidasa

Deslignificación ó Bioblanqueamiento
 Clasificación y nomenclatura
Grupo 2: Transferasas
Catalizan reacciones de transferencia de átomos ó grupo de átomos
entre moléculas:

A-X + B A + B-X

Dador: Aceptor Grupo transferido - transferasa

ATP: D-Hexosa Fosfotransferasa EC 2.7.1.1

Nombre común: hexokinasa
 Clasificación y nomenclatura
Grupo 2: Transferasas
Clasificación de subgrupo de las transferasas:
EC 2.1.x - Grupos monocarbonados
EC 2.2.x - Grupos aldehido o ceto
EC 2.3.x - Aciltransferasas
EC 2.4.x - Glicosiltransferasas
EC 2.5.x - Alquil- o Ariltransferasas
EC 2.6.x - Grupos nitrogenados
EC 2.7.x - Grupos fosfato
EC 2.8.x - Grupos sulfato
EC 2.9.x - Grupos selenio

Aplicaciones: Síntesis de oligosacáridos

 Clasificación y nomenclatura
Grupo 3: Hidrolasas
Catalizan reacciones de hidrólisis y también su reverso. Son las más comunes en
el dominio de la tecnología enzimática:

A-B + H2O A-OH + H-B

No se suelen utilizar nombres sistemáticos en las
hidrolasas. Muchas de ellas conservan el nombre
Primitivo. Ejemplo: Quimosina EC 3.4.23.4.
 Clasificación y nomenclatura
Grupo 3: Hidrolasas
Clasificación de las hidrolasas:
3.1.-.- Esterasas (carboxilesterasas, fosfoesterasas, sulfoesterasas)
3.2.-.- Glicosidasas
3.3.-.- Éter hidrolasas
3.4.-.- Péptido hidrolasas
3.5.-.- Acil anhídrido hidrolasas
etc.

Aplicaciones: Lipasas → Síntesis de tensioactivos

Proteasas → Fabrico de quesos
Glicosidasas → Clarificación de jugos; liberación de aromas en los
vinos; aplicaciones textiles
 Clasificación y nomenclatura
Grupo 3: Hidrolasas
Caso particular  Péptido hidrolasas: clasificación común (no
sistemática)

I. Según la situación del enlace atacado:

- Exopeptidasas (extremos de la cadena) (Peptidasas)
- Endopeptidasas (interior de la cadena) (Proteinasas)
II. Según el mecanismo catalítico:
- Serin proteinasas
- Tiol proteinasas
- Aspartil proteinasas
- Metaloproteinasas
 Clasificación y nomenclatura
Grupo 4: Liasas
Catalizan reacciones reversibles de remoción de grupo de átomos del sustrato
(este grupo no incluye las hidrolasas):

A-B A+B
Ejemplo
Nombre sistemático:
Histidina amonio-liasa (EC 4.3.1.3)

Nombre común:
Histidasa
 Clasificación y nomenclatura
Grupo 4: Liasas
Clasificación de las liasas:
4.1.x - Actúan sobre enlaces C-C
4.2.x - Actúan sobre enlaces C-O
4.3.x - Actúan sobre enlaces C-N
4.4.x - Actúan sobre enlaces C-S
4.5.x - Actúan sobre enlaces C-Haluro (S-, Cl-, Br-, I- At-)
4.6.x - Actúan sobre enlaces P-O
4.99.x - Otras liases

Aplicaciones: Pectato liasa – Remueve los compuestos indeseables (ceras, pectinas,

proteínas) en fibras en la industria textil – “bioscouring”
 Clasificación y nomenclatura
Grupo 5: Isomerasas
Catalizan reacciones de isomerización moleculares

A B
Ejemplo:
Glucosa isomerasa (EC 5.3.1.5)
 Clasificación y nomenclatura
Grupo 5: Isomerasas
Clasificación de las isomerasas:

5.1.x - Rasemasas y Epimerasas

5.2.x - cis-Trans-Isomerasas
5.3.x - Oxidoreductasas Intramolecular
5.4.x - Transferasas Intramoleculares (mutases)
5.5.x - Liasas Intramoleculares
5.99.x - Otras Isomerasas
 Clasificación y nomenclatura
Grupo 6: Ligasas
Catalizan la unión de dos grupos químicos a expensas
de la hidrólisis de un nucleótido trifosfato (ATP, GTP, etc.).

A + B + ATP A-B + ADP + Pi

Ejemplo: Glutationa sintasa (EC 6.2.2.3)

Nombre sistémico:
G-L-glutamilo-L-cisteina:glicina ligase
 Clasificación y nomenclatura
Grupo 6: Ligasas
Clasificación de las ligasas:

6.1.x - Forman enlaces C-O

6.2.x - Forman enlaces C-S
6.3.x - Forman enlaces C-N
6.4.x - Forman enlaces C-C
6.5.x - Forman enlaces ésteres fosfóricos
6.6.x - Actúan sobre enlaces N-metal