Genetika eta Garapenaren-Biologia 2.

IKASGELAKO PRAKTIKA

Polimorfismo genético

El polimorfismo genético es una variación en la secuencia de un lugar determinado del DNA entre los
individuos de una población.
Aquellos polimorfismos que afectan a la secuencia codificante o reguladora y que producen cambios
importantes en la estructura de la proteína o en el mecanismo de regulación de la expresión, pueden traducirse
en diferentes fenotipos (por ejemplo, el color de los ojos). Un polimorfismo puede consistir en la sustitución de
una simple base nitrogenada (por ejemplo, la sustitución de una A (adenina) por una C (citosina) o puede ser
más complicado (por ejemplo, la repetición de una secuencia determinada de DNA, donde un porcentaje de
individuos tenga un determinado número de copias de una determinada secuencia).
Los cambios poco frecuentes en la secuencia de bases en el DNA no se llaman polimorfismos, sino más bien
mutaciones. Para que verdaderamente pueda considerarse un polimorfismo, la variación debe aparecer en al
menos el 1% de la población.
Tipos de polimorfismo
• Polimorfismo de nucleótido simple (SNP, del inglés Single Nucleotide Polymorphism).
• Polimorfismos de longitud de fragmentos de restricción (RFLP, del inglés Restriction Fragment
Length Polymorphism).
• Polimorfismos en el número de repetición en tandem (VNTR, del inglés Variable Number Tandem
Repeat y STR, del inglés Short Tandem Repeat).

Polimorfismo de nucleótido simple (SNPs)

La cadena de DNA en 1 difiere

de la del DNA en 2 en un sólo
par de bases

Un polimorfismo de un solo nucleótido o SNP (Single Nucleotide Polymorphism, pronunciado esnip) es una
variación en la secuencia de DNA que afecta a una sola base (adenina (A), timina (T), citosina (C) o guanina
(G)) de una secuencia del genoma. Sin embargo, algunos autores consideran que cambios de unos pocos
nucleotidos, como también pequeñas inserciones y deleciones (indels) pueden ser consideradas como SNP,
donde el término Polimorfismo de nucleótido simple es más adecuado.[1] Una de estas variaciones debe darse
al menos en un 1% de la población para ser considerada como un SNP. Si no se llega al 1% no se considera
SNP y sí una mutación puntual.
Los SNP constituyen hasta el 90% de todas las variaciones genómicas humanas, y aparecen cada 1,300 bases
en promedio, a lo largo del genoma humano. Dos tercios de los SNP corresponden a la sustitución de una
citosina (C) por una timina (T). Estas variaciones en la secuencia del DNA pueden afectar a la respuesta de los
individuos a enfermedades, bacterias, virus, productos químicos, fármacos, etc.
Los SNP que se localicen dentro de una secuencia codificante pueden modificar o no la cadena de aminoácidos
que producen, se llama SNP no-sinónimos los primeros y SNP sinónimo (o modificación silenciosa) a los
segundos. Los SNP que se encuentren en regiones no codificantes pueden tener consecuencias en el proceso de
traducción, en procesos como el splicing, la unión de factores de transcripción o modificando la secuencia de
RNA no codificante.
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Debido a que los SNP no cambian mucho de una generación a otra, es sencillo seguir su evolución en estudios
de poblaciones. También se utilizan en algunos tipos de pruebas genéticas y su estudio es de gran utilidad para
la investigación médica en el desarrollo de fármacos.
Los SNP se consideran una forma de mutación puntual que ha sido lo suficientemente exitosa evolutivamente
para fijarse en una parte significativa de la población de una especie.
Un método extendido para la detección de SNP es el de polimorfismo en la longitud de fragmentos de
restricción (SNP-RFLP). Si un alelo contiene un punto de reconocimiento para una enzima de restricción
mientras que otro no, la digestión de los dos alelos genera fragmentos de diferente longitud.

Polimorfismos STR y VNTR

Las secuencias con grado máximo de polimorfismo son muy útiles para el análisis de DNA en casos de
medicina legal y en pruebas de paternidad. Un análisis habitual consiste en examinar la herencia de un tipo de
polimorfismos de DNA conocido como "repeticiones cortas en tándem" o, de forma abreviada, STR (del inglés
Short Tandem Repeats, Tandem-errepikapen laburrak), también llamados microsatélites. Las STR son
secuencias cortas de DNA, normalmente con una longitud de 2 a 5 pares de bases, que se repiten muchas veces
de forma consecutiva, cabeza con cola; por ejemplo, la secuencia de 16 pb "gatagatagatagata" representaría 4
copias dispuestas cabeza con cola del tetrámero "gata". Los polimorfismos en STR se deben al distinto número
de copias del elemento repetido que puede aparecer en una población de individuos.

Otras repeticiones en tamdem compuestas por una unidad básica de secuencia de 6-25 nucleótidos constituyen
los minisatélites. Aproximadamente el 90% de los minisatélites se sitúan en los telómeros de los cromosomas.
Algunos de ellos, por su gran inestabilidad presentan una notable variabilidad entre individuos distintos. Se
consideran polimorfismos multialélicos, dado que pueden presentarse en un número de repeticiones muy
variable, y se denominan VNTR (acrónimo de Variable number tandem repeat, Zenbaki aldakorraren tandem-
errepikapenak). Son marcadores muy utilizados en genética forense, ya que permiten establecer una huella
genética característica de cada individuo.

Polimorfismos de longitud de fragmentos de restricción

En biología molecular, el término polimorfismos en la longitud de los fragmentos de restricción o RFLP
(del inglés Restriction Fragment Length Polymorphism) se refiere a secuencias específicas de nucleótidos en el
DNA que son reconocidas y cortadas por las enzimas de restricción (también llamadas endonucleasas de
restricción) y que varían entre individuos.
Las secuencias de restricción presentan usualmente patrones de distancia, longitud y disposición diferentes en
el DNA de diferentes individuos de una población, por lo que se dice que la población es polimórfica para estos
fragmentos de restricción.
La técnica RFLP se usa como marcador para identificar grupos particulares de personas con riesgo a contraer
ciertas enfermedades genéticas, en ciencia forense, en pruebas de paternidad y en otros campos, ya que puede
mostrar la relación genética entre individuos.
El DNA de un individuo se extrae y se purifica. El DNA purificado puede ser amplificado usando la técnica
molecular Reacción en cadena de la polimerasa o PCR (del inglés Polymerase Chain Reaction), luego tratado
con enzimas de restricción específicas para producir fragmentos de DNA de diferentes longitudes. Los
fragmentos de restricción se separan mediante electroforesis en geles de agarosa. Esto proporciona un patrón de
bandas que es único para un DNA en particular.