Tema: POLIMORFISMO GENETICO

Docente: MC EDISON SUAREZ

2017-II
IV
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al tema.
 POLIMORFISMO

• Hace referencia a la existencia en una población de múltiples alelos

de un gen. Es decir, un polimorfismo es una variación en la
secuencia de un lugar determinado del ADN entre los individuos de
una población.
• Aquellos polimorfismos que afectan a la secuencia codificante o
reguladora y que producen cambios importantes en la estructura de
la proteína o en el mecanismo de regulación de la expresión,
pueden traducirse en diferentes fenotipos (por ejemplo, el color de
los ojos).
• Los cambios poco frecuentes en la secuencia de bases en el ADN
no se llaman polimorfismos, sino más bien mutaciones. Para que
verdaderamente pueda considerarse un polimorfismo, la variación
debe aparecer en al menos el 1% de la población.
 TIPÓS DE POLIMORFISMO

• Polimorfismo de nucleótido único (SNP, del inglés

Single Nucleotide Polymorphism).
• Polimorfismos de longitud de fragmentos de restricción
(RFLP, del inglés Restriction Fragment Length
Polymorphism).
• Polimorfismos en el número de repetición en tándem
(VNTR, del inglés Variable Number Tandem Repetition).
 Utilidad del estudio de polimorfismos

• Un uso importante de los polimorfismos es la creación de perfiles

genéticos. Para este cometido son especialmente útiles aquellos
polimorfismos que se basan en patrones repetidos un cierto
número de veces.
• Un perfil genético muestra el genotipo (polimorfismo) presente en
un individuo para un determinado número de marcadores
genéticos (diferentes zonas del genoma en las que están
presentes estos polimorfismos). Cuanto mayor sea el número de
marcadores utilizados, menor será la probabilidad de encontrar dos
individuos con el mismo patrón de polimorfismos para dichos
marcadores.
• Se utilizan dichos estudios en pruebas de paternidad, o para
incriminar a individuos que han cometido actos delictivos dejando
muestras genéticas en el proceso.
 Polimorfismo de nucleótido único (snp)

• Es una variación en la secuencia de ADN que afecta a una sola

base (adenina (A), timina (T), citosina (C) o guanina (G) de una
secuencia del genoma. Sin embargo, algunos autores consideran
que cambios de unos pocos nucleótidos, como también pequeñas
inserciones y deleciones (indels) pueden ser consideradas como
SNP, siendo entonces más adecuado el término Polimorfismo de
nucleótido simple
• Una de estas variaciones debe darse al menos en un 1% de la
población para ser considerada como un SNP. Si no se llega al 1%
no se considera SNP y sí una mutación puntual
• Los SNPs por si mismos no proporcionan información sobre genes
específicos; simplemente indican una localización cromosómica que
es probable que esté estrechamente asociada con un fenotipo dado.
 Polimorfismo de nucleótido simple

• Los SNP constituyen hasta el 90% de todas las variaciones

genómicas humanas, y aparecen cada 1,300 bases en promedio,
a lo largo del genoma humano. Dos tercios de los SNP
corresponden a la sustitución de una citosina (C) por una timina
(T). Estas variaciones en la secuencia del ADN pueden afectar a
la respuesta de los individuos a enfermedades, bacterias, virus,
productos químicos, fármacos, etc.
• Los SNP que se localicen dentro de una secuencia codificante
pueden modificar o no la cadena de aminoácidos que producen;
se llama SNP no-sinónimos a los primeros y SNP sinónimos (o
mutaciones silenciosas) a los segundos. Los SNP que se
encuentren en regiones no codificantes pueden tener
consecuencias en el proceso de traducción, sobre todo en
procesos como el splicing, la unión de factores de transcripción o
modificar la secuencia de ARN no codificante.
 Polimorfismo de nucleótido simple
• Ciertos SNP en las regiones no codificantes de algunos genes correlacionan
con un aumento en la probabilidad de desarrollar cáncer​
• Algunos SNP en regiones codificantes consistentes en sustituciones
sinónimas, pese a no modificar la secuencia aminoacídica de la proteína,
podrían alterar su función. Esto ocurre, por ejemplo, en el caso del receptor
de resistencia múltiple a drogas 1 (MDR1), donde un SNP de mutación
silenciosa ralentiza la traducción del péptido naciente, haciendo que se
pliegue adoptando una conformación alternativa menos funcional que la
estructura tridimensional nativa
• Los SNP que implican una sustitución con cambio de sentido alteran la
secuencia aminoacídica y son los que más frecuentemente están asociados
a la aparición de enfermedades. Un ejemplo de esto es el SNP 1580G>T en
el gen LMNA, que provoca el cambio de arginina por leucina en la proteína,
fenotipo relacionado con enfermedades como la progeria o la displasia
mandibuloacral.5​
• Los SNP sin sentido provocan la aparición de un codón de stop prematuro
que trunca la proteína resultante, haciéndola incompleta y normalmente no
funcional. Esto se refleja en la mutación G542X en el gen CTFR, causante
de la fibrosis quística
 SNP Y EVOLUCION
• Debido a que los SNP no cambian mucho de una generación a otra (se
heredan de forma muy estable), es sencillo seguir su evolución en estudios
de poblaciones.
• También se utilizan en algunos tipos de pruebas genéticas y su estudio es
de gran utilidad para la investigación médica en el desarrollo de fármacos.
De esta manera, los SNP permitirán un gran desarrollo de la medicina
personalizada, así como avances en el estudio de la farmacocinética y la
farmacodinamia, puesto que determinan en buena parte el desarrollo de
enfermedades como la fibrosis quística o la β-talasemia, la afinidad por
dianas farmacológicas o la forma en que se metaboliza una determinada
droga.
• Por todo ello, empresas como 23andMe ofrecen análisis genéticos
basados en el análisis de SNPs, que puedan revelar información acerca del
riesgo de padecer ciertas enfermedades, como Parkinson, diabetes,
trastorno bipolar, etc.
GENOMA HUMANO
 CÓDIGO GENÉTICO
• Por ejemplo, la G en las filas de la ‘primera letra’, la C bajo
las columnas de la ‘segunda letra’ y la A en las filas de la
‘tercera letra’ se cruzan en la alanina, el aminoácido
especificado por la secuencia GCA
 CONCEPTOS BÁSICOS RELACIONADOS CON LA
MUTACIÓN
• -El locus se refiere a la posición o localización de un gen en
el genoma.
• Los locus genéticos se definen por la localización
cromosómica, utilizando las bandas de los cromosomas
(banda G o banda R) o marcadores moleculares
(microsatelites) como punto de referencia.
• Ejemplo: Gen de determinación del sexo (SRY) se localiza
en el sitio p 11 del cromosoma Y.
 CONCEPTOS BÁSICOS RELACIONADOS CON LA
MUTACIÓN
• En sentido estricto:
• El polimorfismo se refiere a la ocurrencia de alelos
multiples en un locus, donde al menos dos alelos
aparecen con una frecuencia >1% en la población
general.
• POLIMORFISMO: Una serie de fenotipos alternativos
normales y comunes
 POLIMORFISMOS

• La mayoría de los polimorfismos no tienen efecto sobre el

fenotipo (caen en regiones no codificantes).
• Algunos pocos afectan nuestro fenotipo (Estatura:
alta/baja; Cabello: claro/oscuro; Color de ojos)
• Un numero muy pequeño de polimorfismos son
responsables de enfermedades genéticas
Algunos polimorfismos sanguíneos
GEN UBICACIÓN ALELOS POLIMÓRFICOS

Antígenos eritrocitarios
ABO 9q34.1-34.2 ABO*A1,ABO*A2,ABO*B,ABO*0
Diego DI*A,DI*B
Duffy 1q21-25 FY*A,FY*B,FY
Kell K,k
Kidd 18q11-12 JK*A,JK*B
Lewis 19 LE*LE,LE*Le
Lutheran 19q12-13 LU*A,LU*B
MNSs (2) 4q28-31 MNS*MS,MNS*Ms,MNS*NS,MNS*Ns
P 22q11.2-qter P1*1,P1*2,P1*p
Rh (3) 1p36.2-34 CDE,CDe,CdE,Cde,cDE,cDe,cdE,cde
Secretor FUT2(SE)*Se,FUT2(SE) *se

Proteínas plasmáticas
lfa1-antitripsina 14q32.1 PI*M1,PI*M2,PI*M3,PIS,PIZ
Ceruloplasmina 3q23-25 CP*B,CP*A,CP*C
Componente de
complemento 3 19p13.3-13.2 C3*S,C3*F
Componente específico
de grupo 4q12-13 GC*1F,GC*1S,GC*2
Haptoglobina 16q22.1 HP*1S,HP*1F,HP*2
Algunos polimorfismos sanguíneos
GEN UBICACIÓN ALELOS POLIMÓRFICOS

Inmunoglobulinas
GM (3) 14q32.33 GM*1,17 23' 21,28 GM*1,17 23 21,28
GM*1,2,17 23' 21,28 GM*1,2,17 23 21,28
GM*1,3,17 23' 5*,21,28 GM*1,3,17 23 5*,21,28
GM*1,2,3,17 23' 5*,21,28 GM*1,2,3,17 23 5*,21,28
GM*1,3,17 23' 5* GM*1,3,17 23 5* GM*3 23' 5*
GM*3 23 5*
Transferrina 3q21 TF*C1,TF*C2,TF*C3,TF*,TF*D

Enzimas eritrocitarias
Adenilato kinasa 1 9q34.1-34.2 AK1*1,AK1*2
Adenosín deaminasa 20q13.11 ADA*1,ADA*2
Esterasa D 13q14.1-14.2 ESD*1,ESD*2
Fosfatasa ácida 1 2p25 ACP1*A,ACP1*B,ACP1*C
Fosfoglucomutasa 1 1p22.1 PGM1*1,PGM1*2,PGM1*3,PGM1*4
Peptidasa A 18q23 PEPA*1,PEPA*2

Antígenos leucocitarios
HLA-A 6p21.3 A1,A2,A3,A11,A23,A24,A25,A26,A28,A29,A30,A31,
A32,A33,A34,A36,A43
HLA-B 6p21.3 B7,B8,B13,B14,B18,B27,B35,B37,B38,B39,B41,B42,
B44,B45,B46,B47,B48,B49,B50,B51,B52,B53,B54,
B55,B56,
B57,B58,B59,B60,B61,B62,B63,B67,B70,B73,B75
HLA-C 6p21.3 Cw1,Cw2,Cw4,Cw5, Cw6,Cw7,Cw9,Cw10
 POLIMORFISMOS DE NUCLEÓTIDO
SENCILLO (SNP)
• Pueden estar presentes en regiones codificantes y
provocar un cambio en un aminoácido; Se les conoce
como “no sinónimos”.
• Pueden presentarse en la región promotora del gen,
influenciando la actividad transcripcional del gen
(modulando la unión de factores de transcripción), en
intrones (modulando la estabilidad de la proteína), en
sitios de “splicing” (sitios donde ocurre la eliminación de
intrones y unión de exones) o en regiones intragénicas.
POLIMORFISMOS DE NUCLEÓTIDO
SENCILLO (SNP)
 APLICACIÓN DE LOS POLIMORFISMOS

• El estudio de los polimorfismos tiene muchas aplicaciones

en medicina, investigaciones biológicas y procesos
jurídicos. Los polimorfismos localizados cerca de un “gen
candidato” pueden ser usados para hallar el gen por sí
mismo a través de un mapeo genético. En este proceso el
investigador está en búsqueda de polimorfismos que son
heredados junto con la enfermedad, tratando de delimitar
estos polimorfismos en regiones más y más pequeñas del
cromosoma. Así, la región del cromosoma implicada en la
enfermedad puede ser progresivamente delimitada, y el gen
responsable finalmente puede ser localizado.
 APLICACIÓN DE LOS POLIMORFISMOS

• En un estudio de prueba directa, el supuesto SNP

responsable de una enfermedad es genotipificado
directamente. El reto de este tipo de estudios es predecir
o determinar a priori cuáles SNP’s son los responsables
del fenotipo de interés.
• Los estudios indirectos de asociación genética se basan
en un análisis de ligamiento genético el cual utiliza
“marcadores neutrales”, y no hace predicciones sobre la
localización del gen responsable de la enfermedad en
estudio. Los estudios de asociación indirecta son más
frecuentes en estudios de casos-control.
 APLICACIÓN DE LOS POLIMORFISMOS

• A partir de las pruebas indirectas existen dos

estrategias que han sido utilizadas para identificar
los genes y los polimorfismos que están implicados
con el desarrollo de ciertas enfermedades: el
análisis de ligamiento y estudios de asociación de
genes candidatos. El análisis de ligamiento
requiere el reclutamiento de familias afectadas,
mientras que el estudio de genes candidatos es
probado por estudios de asociación de sujetos no
relacionados.
 APLICACIÓN DE LOS POLIMORFISMOS

• El análisis de ligamiento o escaneo genómico es

un método en el cual se hace una búsqueda
aleatoria en el genoma para tratar de encontrar los
genes asociados a una enfermedad. Requiere
cuando menos dos generaciones de las familias
afectadas.
• En los estudios de asociación genética se buscan
polimorfismos individuales de genes implicados en
la patogénesis de la enfermedad y, así, determinar
si existe algún tipo de relación con ella, para lo que
primero se deben identificar genes candidatos que
se crea o se sepa son importantes en la
patogénesis de una condición.
APLICACIÓN DE LOS POLIMORFISMOS
 IDENTIFICACIÓN DE POLIMORFISMOS

• Geles de electroforesis en gradiente

desnaturalizante/térmico

• Polimorfismo de conformaciones de cadena sencilla

• Cromatografía líquida de alta resolución

• Secuenciación por hibridación

 Orientaciones

Escriba aquí las

orientaciones que
sugiere al alumno.
 Contenidos temáticos

Escriba aquí en forma

ordenada los
Contenidos Temáticos
de la semana de
estudio.
 Subtítulos del tema

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subtítulos del tema y
que servirán para
darle ESTRUCTURA
al contenido de la
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 Conclusiones y/o actividades de investigación
sugeridas

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investigación
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