Aminoácidos

Asimetría Molecular: Enantiómeros

L-Isómero D-Isómero

Cuando el grupo amino se

dispone a la izquierda se habla
de -L aminoácidos y a la
derecha de -D aminoácidos

L-Alanina D-Alanina
2
Proyección de Fisher

Carbono α

Alanina
 Formas de representar a los
aminoácidos

Grupo Grupo Modelo de bolas Aminoácidos tienen

AminoGrupo Amino
Carboxilo y palos estructura tetraédrica

Estructura de un amino ácido. Excepto para prolina y sus derivados, todos

los aminoácidos comúnmente encontrado en las proteínas presentan este
tipo de estructura.
Formas de representar a los
aminoácidos

L-alanina D-alanina
L-alanina D-alanina L-alanina D-alanina
 Estereo-isómeros

L-Isómero D-Isómero
Estructura y propiedades de los
aminoácidos

LISINA
 Los amino ácidos más comunes
son 20
Ustedes deberían saber nombres,
estructuras, valores pKa, código de 3-letras
y 1-letra

Amino ácidos non-polares

Amino ácidos Polares, no-cargados
Amino ácidos ácidos
Amino ácidos básicos

Otra clasificación basado en estructura de cadena lateral: Amino ácidos;

aromático, cíclico, hidroxilo, y tiol.
Propiedades de las cadenas laterales de AAs
Propiedades de las cadenas laterales de AAs
 Aminoácidos
Las proteínas están compuestas por 20 aminoácidos, denominados naturales. Estos
20 aminoácidos se diferencian en la estructura de la cadena lateral R.

Según la naturaleza de esta cadena lateral podemos clasificar los aa en 6 grupos.

Alifáticos Apolares: Glicina, Alanina, Valina, Leucina, Isoleucina.

Cíclico: Prolina

Con Cadenas laterales de hidroxilo o azufre: Serina, Treonina, Cisteína, Metionina.

Aromáticos: Fenilalanina, Tirosina, Triptófano.

Con carga positiva (Básicos): Lisina, Arginina, Histidina.

Con carga negativa (Ácidos): Aspartato, Glutamato, Asparagina, Glutamina.

Propiedades de las cadenas laterales de AAs
No polar, grupo R alifático Grupo R aromático

Glicina Alanina Valina

Fenilalanina Tirosina Triptofano

Grupo R cargado positivamente

Leucina Metionina Isoluecina

Polar, Grupo R no cargado

Serina Treonina Cisteina Lisina Arginina Histidina

Grupo R cargado negativamente

Prolina Asparragina Glutamina Aspartato Glutamato

 Aminoácidos no esenciales
Microorganismos.
E. Coli (20 aminoácidos). Aminoácidos
No esenciales
Se sintetizan en reacciones sencillas.
Excepción es arginina (10 etapas). Alanina
Tirosina a partir de Phe (1 paso). Tirosina Arginina
a partir de 0 (10 etapas). Asparragina
Aspartato
Cisteína
Glutamato
Glutamina
Glicina
Prolina
Serina
Tirosina
Aminoácidos Esenciales
 Los seres humanos son incapaces
Aminoácidos de fabricar 9 aminoácidos.
 Dieta.
Esenciales  Balance de nitrógeno negativo.
 Se sintetizan mediante reacciones
Histidina
 Bastante complejas (5 a 16 pasos).
Isoleucina
Leucina
Lisina
Metionina
Fenilalanina
Treonina
Triptófano
Valina
 Amino ácidos no comunes con
función biológica importante
Algunos son:

Hidroxilisina, hidroxiprolina – en colágeno

Carboxiglutamato - sangre- en proteínas de coagulación
Piroglutamato – en bacteriorodopsina Amino ácidos fosforilados – en señalización
β-alanina – encontrada en la vitamina ácido pantoténico y algunos importantes péptidos
naturales.
D-alanina – En polipéptidos de algunas membranas bacteriales.
γ-ácido aminobutírico – Función como neurotransmisor en cerebro y otros tejidos de
animales.
D-ácido glutámico - En polipéptidos de algunas membranas bacteriales.
L-Homoserina – En muchos tejidos, es un intermediario del metabolismo de aminoácidos.
L-ornitina – Muchos tejidos, es un intermediario de la síntesis de arginina.
Sarcosina – Muchos tejidos, es intermediario de la síntesis de aminoácidos.
L-tiroxina – Glándula tiroide, es la hormona tiroide (I=iodina)
Propiedades de las cadenas laterales de AAs
 Propiedades espectroscópicas
Todos los aminoácidos absorben en el rango infrarrojo (vibraciones de enlace).
Solo Phe, Tyr, y Trp absorben en el rango UV (transiciones electrónicas entre niveles de
energía).
Absorbancia a 280 nm es un buen método para determinar la concentración de proteínas.
Espectro NMR son característico para cada residuo de una proteína, y mediciones de alta
resolución NMR pueden ser usados para dilucidar estructura tri-dimensional de proteínas.

Espectro protón de varios aminoácidos Espectro UV

 Propiedad de los aminoácidos
(Zwitterions)
A pH neutro los amino ácidos de los sistemas biológicos
existen predominantemente a la forma doble ionizada llamada
zwitterion.

H O
-
R C C O
+
N H3
 o
-o C
+ 1
H 3 N- C H
1
R
Nonionic Zwitterionic
form form
pH 1 Carga neta +1 pH 7 Carga neta 0 pH 13 Carga neta -1

Forma Catiónica Zwitterion (neutral) Forma Aniónica

 ¿Cuales son las propiedades ácido
base de los aminoácidos?

Los amino ácidos son ácidos polipróticos

débiles
El grado de disociación depende del pH del
medio

El grupo ácido carboxílico siempre se ioniza primero.

Luego la cadena lateral (si es ionizable) o el grupo α-amino.
El orden de ionización siempre procede desde el más ácido al menos ácido.
 ¿Cuales son las propiedades ácido
base de los aminoácidos?

La primera disociación es el grupo ácido

carboxílico (usando como ejemplo glicina:

+NH CH COOH  +NH3CH2COO- + H+

3 2

(+NH3CH2COO-)(H+)
Ka1 = ---------------------------
(+NH3CH2COOH)
 ¿Cuales son las propiedades ácido
base de los aminoácidos?

La segunda disociación es el grupo ámino en el

caso de glicina:

+NH
3CH2COO  NH2CH2COO- + H+
-

(NH2CH2COO-)(H+)
Ka2 = ---------------------------
(+NH3CH2COO-)
 ¿Cuales son las propiedades ácido
base de los aminoácidos?

Forma Ambos grupos

Zwitterionica deprotonados

Ambos grupos
protonados

Las formas iónicas de amino ácidos, se muestran sin consideración de las ionizaciones de cadenas laterales.
 Valor pKa de los Amino Acidos

Estos números deberían ser conocidos por

ustedes, así como su significado
Grupo α-carboxilo : pKa = ~2
Grupo α-amino : pKa = ~9

Estos números son aproximados, pero adecuados para nuestros propósitos.

 Punto Isoeléctrico, pI

El punto isoeléctrico es el pH en el cual la

carga neta es cero (0).

Usando Gly nuevamente:

Carga en la primera ionización: +1  0

Carga en la segunda ionización : 0  -1

De manera que, en el caso de glicina, el pH al cual hay más forma del

aminoácido con carga neta ocurre a mitad de camino de la primera y
segunda ionización.

pI = (pKa1 + pKa2)/2 = 5.95

¿Cuales son las propiedades ácido
base de los aminoácidos?
¿Cuales son las propiedades ácido
base de los aminoácidos?
 Valor pKa de los Amino Acidos

Estos números deberían ser conocidos por

ustedes, así como su significado

Arginina, Arg, R: pKa(grupo guanidino) = 12.5

Acido Aspártico, Asp, D: pKa = 3.9
Cisteina, Cys, C: pKa = 8.3
Acido Glutámico, Glu, E: pKa = 4.3
Histidina, His, H: pKa = 6.0
Lisina, Lys, K: pKa = 10.5
Tirosina, Tyr, Y: pKa = 10.1
 Titulación de amino ácidos polipróticos

Titulación de ácido
glutámico
 Titulación de amino ácidos polipróticos

Titulación de lisina
Un ejemplo de cálculo

¿Cual es el pH de una solución de ácido glutámico si el α-carboxilo está

disociado en 1/4?

pH = pKa + log10 [1]/[3]

• pH = 2.2 + (-0.477)
• pH = 1.723

• Note que, cuando el grupo está disociado en ¼, ¼ está

disociado y ¾ no lo está; de manera que la razón en
términos log es ¼ sobre ¾ ó 1/3.
Otro ejemplo de cálculo

¿Cual es el pH de una solución de lisina si la

cadena del grupo ámino está disociada en 3/4?

[3]
pH  10.5  log10
[1]
pH = 10.5 + (0.477)
pH = 10.977 = 11.0

Note que, cuando el grupo está disociado ¾, ¾ está disociado y ¼ no lo está; de

manera que la razón en términos log es ¾ sobre ¼ ó 3/1.
 Amino Acidos como Buffers
Histidina tiene valores pKa de 1.8, 6.0, y 9.2.

Puede proveer una capacidad buffer efectiva a pH igual a cualquiera de estos

tres pKas.
La curva de titulación tiene tres regiones en las cuales el pH es relativamente
no afectado por la adición de ácido o base.
¿Cual es la forma de His cuando tiene carga neta cero (0)?
¿En que estado de ionización se encuentra?
¿Cual es la carga de His a pH 4?

Reacciones de Amino Acidos

Composición Amino-acídica – El análisis de amino ácidos entrega el número de
cada amino ácido en el péptido o proteína.
• Los enlaces peptídicos son cortados por hidrólisis ácida (6M HCl, 110oC, 18-72
horas). Trp es destruido.
Secuencia Amino-acídica – orden de los amino ácidos en un péptido o proteína.
• Reactivo de Edman (fenilisotiocianato) es el reactivo actualmente de
preferencia. Reacciona con el grupo α-amino libre del un amino ácido o péptido
para producir un derivado de feniltiohidantoina (PTH).
Valores típicos del pKa de grupos ionizables
de proteínas

Los valores de pKa

dependen de la temperatura,
fuerza iónica y del
microentorno del grupo
ionizable.
Proteínas
Son macromoléculas versátiles que desempeñan
variadas funciones en los seres vivos. Como:

• Catalizadores
• Apoyo mecánico
• Protección inmunológica
• Generar movimiento
• Transmitir impulsos nerviosos
• Controlar crecimiento y diferenciación
 Proteínas

1. Son polímeros lineales construidos a partir de monómeros

2. Contienen un amplio surtido de grupos funcionales
3. Pueden interaccionar entre y con otras macromoléculas
biológicas para formar asociaciones complejas
4. Algunas son muy rígidas mientras otras manifiestan una
flexibilidad limitada
 Proteínas
Las proteínas son polímeros biológicos constituidos de muchas moléculas α-amino
ácidos que contienen un grupo amino y un grupo ácido carboxílico.

Las reacciones de condensación entre el grupo carboxilo de un aminoácido y el grupo

amino de un segundo aminoácido resulta en la formación de un enlace C-N.
 Proteínas

Remoción de una
molécula de agua

Dos aminoácidos pueden

reaccionar para formar enlaces
covalentes con la pérdida de
moléculas de agua.

Enlace peptídico

Formación enlace
Carbono - nitrógeno
 Proteínas
Las proteínas son polímeros biológicos constituidos de muchas moléculas α-amino ácidos que contienen un grupo amino y un
grupo ácido carboxílico.

Enlace peptídico
Las reacciones de condensación entre el grupo carboxilo de un aminoácido y el grupo amino de un segundo amino ácido
resulta en la formación de un enlace C-N.

El enlace peptídico es planar Enlace peptídico posee una distancia característica

Resonancia del enlace peptídico

 Aminoácido 1 Aminoácido 2 Di-péptido

La formación del péptido es la creación de un enlace amida entre el grupo carboxilo de un

amino ácido y el grupo amino de otro amino ácido.
 Configuración estructural

Trans Cis Trans Cis

Configuración Trans-Cis

Los ángulos diedros fi (, phi) y psi (), determinan la conformación de un polipéptido.

Estos ángulos representan la rotación libre que se puede encontrar en enlaces peptídicos N-Cα () y
Cα-C ()
 Péptido
Carboxi
terminal

Amino
terminal

Cada unidad aminoacídica del polímero se llama residuo

2 residuos – dipéptido.
3 residuos – tripéptido.
12-20 residuos – oligopéptido.
Más de 20 residuos – polipéptido.
 Péptidos

Tyr Gly Gly Phe Leu

 Carga de un péptido

Dado el péptido: Asp-Met-His-Ala

1. Determine la carga de éste péptido a los pHs 2, 7 y 10.

Use los pKas dados en la Tabla.

2. Determine el pI de éste péptido.

 Carga neta de un péptido

Asp – Met – His - Ala

S-CH 3
O (CH 2)2 H O CH 3
+ -
NH3 - CH - C - N - CH - C - N - CH - C - N - CH - COO -

CH 2 H O CH 2 H
COO -
HN N
 Carga neta de un péptido
Asp – Met – His - Ala

S-CH 3
O (CH 2)2 H O
+
NH3 - CH - C - N - CH - C - N - CH - C -
CH 3
-
N - CH - COO -

CH 2 H O CH 2 H
COO -
HN N

Analizar cada uno de los grupos ionizables

(que tienen propiedades ácido-base).

pKa's: R-COOH imidazol α-carboxilo

4,1 6,0 2,3
α-amino
9,6
 S-CH 3
Charge on a Peptide
O O
+
(CH 2)2 H CH 3
NH3 - CH - C - N - CH - C - N - CH - C - N - CH - COO
--

CH 2 H O CH 2 H
COO -
HN N

pKa's: α-amino 9,6 imidazol α-carboxilo

R-COOH 4,1 6,0 2,3

Análisis de cargas:

pH Carga en cada grupo carga neta

2 + 0 + 0 = +2
5 + - + - = 0
7 + - 0 - = -1
10 0 - 0 - = -2

2,3 + 0 + 0/- = +2/+1 (+1,5)

(50% +2 50% +1)
 S-CH 3
Charge on a Peptide
O O
+
(CH 2)2 H CH 3
NH3 - CH - C - N - CH - C - N - CH - C - N - CH - COO
-
-

CH 2 H O CH 2 H
COO -
HN N

pKa's: α-amino 9,6 imidazol α-carboxilo

R-COOH 4,1 6,0 2,3

Cuando la carga de un péptido es igual a cero, se dice que está en su

punto isoeléctrico (pI).

En nuestro ejemplo, pI =

pH Carga en cada grupo carga neta

2 + 0 + 0 = +2
5 + - + - = 0 pI
7 + - 0 - = -1
10 0 - 0 - = -2
 S-CH 3
Charge on a Peptide
O O
+
(CH 2)2 H CH 3
NH3 - CH - C - N - CH - C - N - CH - C - N - CH - COO
--

CH 2 H O CH 2 H
COO -
HN N

pKa's: α-amino 9,6 imidazol α-carboxilo

R-COOH 4,1 6,0 2,3

El punto isoeléctrico (pI) se calcula como el promedio de los dos valores de pK

que participan en la formación y desaparición de la especie con carga 0.

Análisis de cargas:

pH Carga en cada grupo carga neta

2 + 0 + 0 = +2
5 + - + - = 0 pI
7 + - 0 - = -1
10 0 - 0 - = -2
 S-CH 3
Charge on a Peptide
O O
+
(CH 2)2 H CH 3
NH3 - CH - C - N - CH - C - N - CH - C - N - CH - COO
-
-

CH 2 H O CH 2 H
COO -
HN N

pKa's: α-amino 9,6 imidazol α-carboxilo

R-COOH 4,1 6,0 2,3

El punto isoeléctrico (pI) se calcula como el promedio de los dos valores de pK

que participan en la formación y desaparición de la especie con carga 0.

En nuestro ejemplo, pI = 4,1 + 6,0 = 5,05

Análisis de cargas: 2

pH Carga en cada grupo carga neta

2 + 0 + 0 = +2
5 + - + - = 0 pI
7 + - 0 - = -1
10 0 - 0 - = -2
 Proteínas
En las proteínas se encuentran habitualmente 20 tipos de
cadenas laterales, las cuales varían en:

• Tamaño
• Forma
• Carga
• Capacidad de formar puente hidrógenos
• Carácter hidrofóbico
• Reactividad química
Estructura de las proteínas
 Estructura jerárquica

Primaria Secundaria Terciaria Cuaternaria

Residuos α-hélice Cadena Ensamblaje

Aminoacídicos polipeptídica de subunidades
 Conformación estructural
Enlaces hidrofóbicos, puente disúlfuro
contribuyen a estabilizar
Enlaces iónicos contribuyen a
las proteínas
estabilizar las proteínas
 Fuerzas estabilizadoras

1. Electrostáticas/iónicas 3. Interacciones hidrofóbicas

2. Enlaces de hidrógeno 4. Enlaces disúlfuro
Establecimiento de los puentes
disúlfuro
 Corte de enlaces Disúlfuros

Oxidación por ácido perfórmico (genera ácido cisteico).

Agentes reductores de sulfidrilo:

- mercaptoetanol.
- ditiotreitol or ditioeritritol.
- para prevenir recombinación, continua con
un agente alquilante, como iodoacetato.
 Oxidación: pérdida de H+

Cisteina Enlace
disúlfuro

Cistina

Cisteina

Reducción: ganancia de H+

Puente disulfuro puede ser desestabilizado por reducción con agentes como β-
mercaptoetanol o ditiotreitol.
Dado que las reacciones entre los nuevos grupos reducidos –SH para
reestablecer enlaces disulfuro es alto, la reducción S-S debe seguir por
modificación –SH.
Estructura Secundaria
 Amino terminal

Estructura α-hélice

Aminoácidos frecuentes: alanina – cisteina – leucina –

lisina – metionina – glutamina – glutámico – histidina

Carboxilo terminal
 Amino terminal

Carboxilo terminal

Enlace puente hidrógeno

son intra-catenario
Estructura Beta

Aminoácidos frecuentes en lámina β: valina – isoleucina –

fenilalanina – tirosina – triptofano – treonina
Estructura Giro

Aminoácidos frecuentes: glicina – leucina –

aspártico – asparragina - prolina
Conformación secundaria y
terciaria de una proteína
 Estructura de la Insulina
Insulina es una hormona pancreática compuesta de dos subunidades
peptídicas. La cadena A está compuesta de 21 aminoácidos y la cadena B de
30 aminoácidos. Cada secuencia es única para la proteína.

* * * *
Cadena A

* *
Cadena B
 B30 A8 A10
Humano Thr Thr Ile
Porcino Ala Thr Ile
Bovino Ala Ala Val
Conformación secundaria y
terciaria de una proteína
Hélice –
vuelta - hélice
 Esquina α - α
a-a Corner
Vuelta β-α-β
 La mayoría de las proteínas globulares pertenecen
a una de las cuatro clases estructurales
Proteínas pueden ser clasificadas de acuerdo al tipo y arreglo de estructura secundaria.
Estas clases son:

Proteínas todas α, en la cual predomina α hélices.

Proteínas todas β, en la cual predomina hoja β.
Proteínas α/β, en la cual hay distribución de hélices y hojas β.
Proteínas α+β, que contiene dominios separados de α-hélice y hoja-β.
La mayoría de las proteínas globulares pertenecen
a una de las cuatro clases estructurales
Las proteínas tienen distintos tipos de residuos según su
estructura

Proteína (total residuo) α hélice Conformación β

Quimiotripsina (247) 14 45
Ribonucleasa (124) 26 35
Carboxipeptidasa (307) 38 17
Citocromo (104) 39 0
Lisosima (129) 40 12
Mioglobina (153) 78 0
 Porcentaje de aminoácidos por tipo de proteínas
Aminoácido Clara de Atún Carne Pollo Suero caseína Soja levadura
huevo vacuno lácteo
Alanina 6.6 6.0 6.1 5.5 5.2 2.9 4.2 8.3
Arginina 5.6 6.0 6.5 6.0 2.5 3.7 7.5 6.5
Ácido aspártico 8.9 10.2 9.1 8.9 10.9 6.6 11.5 9.8
Cisteina 2.5 1.1 1.3 1.3 2.2 0.3 1.3 1.4
Ácido glutámico 13.5 14.9 15.0 15.0 16.8 21.5 19.0 13.5
Glicina 3.6 4.8 6.1 4.9 2.2 2.1 4.1 4.8
Histidina * 2.2 2.9 3.2 3.1 2.0 3.0 2.6 2.6
Isoleucina * 6.0 4.6 4.5 5.3 6.0 5.1 4.8 5.0
Leucina * 8.5 8.1 8.0 7.5 9.5 9.0 8.1 7.1
Lisina * 6.2 9.2 8.4 8.5 8.8 3.8 6.2 6.9
Metionina * 3.6 3.0 2.6 2.8 1.9 2.7 1.3 1.5
Fenilalanina * 6.0 3.9 3.9 4.0 2.3 5.1 5.2 4.7
Prolina 3.8 3.5 4.8 4.1 6.6 10.7 5.1 4.0
Serina 7.3 4.0 3.9 3.4 5.4 5.6 5.2 5.1
Treonina * 4.4 4.4 4.0 4.2 6.9 4.3 3.8 5.8
Triptofano 1.4 1.1 0.7 1.2 2.2 1.3 1.3 1.6

Tirosina 2.7 3.4 3.2 3.4 2.7 5.6 3.8 5.0

Valina * 7.0 5.2 5.0 5.0 5.0 6.6 5.0 6.2

* Aminoácidos esenciales
 Tamaño molecular de proteínas
Proteína Peso Molecular (Da) # residuos
Insulina (bovino) 5,733 21 (A)/30(B)
Citocromo C (equino) 12,500 104
Ribonucleasa A (páncrea bovino) 12,640 124
Lisosima (clara huevo) 13,930 129
Mioglobina (caballo) 16,980 153
Quimotripsina (páncrea bovino) 22,600 13 (α)/132 (β)/97 ()
Quimotripsina (bovino) 22,000 245
Hemoglobina (humana) 64,500 141(α)/146(β)
Albumina de suero (humana) 64,500 550
G-globulina (caballo) 149,900 214
Glutamato dehidrogenasa (hígado) 332,694 500
Miosina (conejo) 470,000 2,000 (h)/ 149 (α)/ 160 (α´)/miosina (β)
Hexokinasa (levadura) 96,000 550
RNA polimerasa (E.coli) 450,000 4,158
Apolipoproteina B (humana) 513,000 4,536
Ribulosa bifosfato carboxilasa (espinaca) 560,000 475 (α)/123(β)
Glutamina sintetasa (E.coli) 600,000 468
Titin (humano) 2,993,000 26,926
Existen distintas estructuras
de proteínas de acuerdo a su
función
 La estructura y función no siempre están ligadas

a. Mismo tipo de dominio, diferente función

Debido a que la estructura

depende de la secuencia y que
la función depende de la
estructura, es tentador
imaginar que todas las
proteínas de estructura similar
deberían compartir funciones,
pero eso no siempre es así.
Triosa fosfato isomerasa Aldosa reductasa Fosfotriesterasa
Algunas proteínas de dominios
estructurales similares
presentan diferente función.
b. Misma función, diferente estructura
Algunas proteínas de funciones
similares presentan diferente
estructura.

Aspartato aminotransferasa D-amino àcido aminotransferasa

Barril β
 Estructura
Estructura Bβ

α hélice
 Enlace disúlfuro

Sitio activo
Residuo aspartato

Enlace disúlfuro
Tamaño de proteínas.

Peso Molecular: Insulina, 5,733;

Citocromo c, 12,500;
Ribonucleasa, 12,640;
Lisozima, 13,930;
Mioglobina, 16,980.

Peso Molecular: Hemoglobina, 64,500;

Inmunoglobulina, 149,900;
Glutamina sintetasa, 600,000.
¿Cómo interactúan las subunidades de
una proteína en su conformación
cuaternaria?

Muchas proteínas forman tetrámeros por la

interacción de dos polipéptidos isólogos.

El tetrámero de transtiretina está formado

por interacciones isólogas entre la larga
hoja-β de los dos dímeros de transtiretina.
Dos tipos de simetría cíclica

C3
C2
Dos tipos de simetría dihédrica

Cuatro veces
Dos veces

Dos veces

Dos
veces

Dos veces

Dos veces

D2 D4
Simetría Icosaédrica

Cinco veces

Tres veces

Dos veces
Cápside viral: virus de la polio
Cápside viral: virus mosaico del tabaco
RNA
Subunidad
Proteica
Proteínas multiméricas
presentan arreglos
simétricos de objetos
asimétricos.

Una variedad de simetrías se

pueden encontrar en estas
estructuras multiméricas.
El reconocimiento biomolecular está mediada
por fuerzas químicas débiles

Complementaridad estructural: antígeno (derecho) es una proteína pequeña, lisosima, de

clara de huevo. El anticuerpo (IgG; Izquierda) tiene un pocket que es estructuralmente
complementario a la superficie (rojo) del antígeno
El reconocimiento biomolecular está mediada
por fuerzas químicas débiles

Interacción proteína-proteína (antígeno-anticuerpo).

 Proteínas Conjugadas

Clase Grupo prostético Ejemplo

Lipoproteínas Lípidos B1-lipoproteína de sangre

Glicoproteínas Carbohidratos Inmunoglobulina G

Fosfoproteínas Grupo fosfato Caseina de leche

Hemoproteínas Grupo Hem (porfirina) Hemoglobina

Flavoproteínas Nucleótidos de flavina Succinato dehidrogenasa

Metaloproteínas Hierro Ferritina

Zinc Alcohol dehidrogenasa
Calcio Calmodulina
Molibdeno Dinitrogenasa
Cobre Plastocianina
¿Cómo interactúan las subunidades de una proteína en su
conformación cuaternaria?

Composición de subunidades de varias

proteínas.

Proteínas con dos o cuatro subunidades

predominan en la naturaleza, aunque existen
muchos casos de números superiores.
 Ventaja estructural y funcional de
asociación cuaternaria

Beneficios de estructura 4o
Estabilidad: reducción de superficie y razón de volumen mejora la
interacción con solvente.

Economía y eficiencia genética: se requiere menos ADN para hacer

una subunidad monomérica.

Presenta sitios catalíticos: puede facilitar la actividad enzimática.

Cooperatividad: interacción entre subunidades facilita la función y

regulación.
Proteínas y Complejos estructurales
 Información que obtenemos a partir
de la secuencia aminoacídica

Masa molecular: Se puede calcular a partir del número de aminoácidos que

tiene una proteína. Se calcula la masa de cada residuo aminoacídico (masa
promedio 110 Da) y se le debe agregar la masa del agua.

Punto Isoeléctrico (pI): Es el punto en que la carga neta de la proteína es cero.

El pI de una proteína reflejará el número de grupos cargado positivamente
(grupo amino terminal y las cadenas laterales de Arg, His y Lis) y los grupos
cargados negativamente (carboxilo terminal y las cadenas laterales de Asp y
Glu).
Aminoácidos que pueden establecer enlaces
hidrógenos
Canal hidrofílico
Exterior hidrofóbico
lleno de agua
El colágeno es un componente principal de:

•tejido conectivo
•piel
•tendones
•cartílago
•dientes
•huesos

Tiene forma de cuerda

Queratina se encuentra en pelo y músculo.

Tiene forma espiral y presenta gran
elasticidad
Estructura primaria: repetición periódica
Colágeno la repetición de Gli–X–Y es característica, donde “X” suele ser prolina e
“Y” suele ser prolina o hidroxiprolina.

Glicina es esencial para que las 3 cadenas se empaqueten estrechamente en la hélice

triple.
Prolina e hidroxiprolina, debido a que son iminoácidos, restringen la rotación de las
cadenas polipeptídicas, facilitando la adopción de su estructura.
Además, sus cadenas laterales, que se ubican en la superficie de la hélice triple,
facilitan la asociación de múltiples cadenas de colágeno de una forma ordenada con
precisión.
La hidroxiprolina, por el -OH, establece enlaces hidrógeno que estabilizan la
estructura.
 Keratina α-hélice

Doble cadena

Protofilamento

Proto
fibrilla
 Hidroxi-
Prolina Prolina
Puentes en Queratina
Denaturación lidera una pérdida de estructura
y función de la proteína
El ambiente celular es adecuado para manterner las fuerzas débiles que preservan la estructura y
función de las proteínas

Estrés externos pueden romper esas fuerzas en un proceso llamado denaturación – con pérdida de la
estructura y función. (Calor, pH extremos, detergentes, 10 M urea, 6M-guanidina, agitación mecánica,
agentes de precipitación).

Huevo cocido es un ejemplo diario:

Ovalbumina, la principal proteína del huevo, permanece en su estructura nativa hasta cierta
temperatura de melting, Tm. Por sobre esta temperatura, la estructura se desarma y la función se
pierde.

Monómero de Ovalbúmina
Urea β-mercaptoetanol

Cloruro de guanidina
 % proteína denaturada

Conc. Denaturante
 Denaturada
% proteína denaturada

Plegada

Conc. Denaturante
Denaturada Silvestre

Jugos Gástricos: Pepsina – Tripsina - Quimotripsina

 Exceso de detergente

Proteína nativa Proteína denaturada (reducida)

 Trazas de
β-mercaptoetanol

Renaturación de ribonucleasa Ribonucleasa nativa

Ribonucleasa puede ser denaturada por

tratamiento con urea y b-mercaptoetanol,
rompiéndose los enlaces disulfuros.

Anfinsen mostró que la estructura de la

ribonucleasa (y función) puede ser restaurada
bajo condiciones apropiadas.