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Los á cidos nucleicos son macromolé culas polimé ricas que se encargan de almacenar,

transmitir y expresar la informació n gené tica de los seres vivos y agente infecciosos. Se
encuentran en todo organismo de dos formas ADN (almacena la informació n hereditaria y
controla su transmisió n a la descendencia) y ARN (expresa la informació n hereditaria
mediante la sı́ntesis de proteı́nas)

4.1 ESTRUCTURA Y COMPOSICIÓN DE LOS ÁCIDOS NUCLEICOS

Þ El ADN y ARN se diferencia en su estructura y composició n quı́mica.

Þ Los á cidos nucleicos está n formados por cadenas largas de nucleó sidos (monó meros)
unidos por enlaces fosfodié ster.

Þ Estructura de un nucleó tido:


- Pentosa: es un glú cido de cinco á tomos de carbono llamado ribosa. Pueden ser de
dos formas D-ribosa (ARN) y 2-desoxi-D-ribosa (ADN).
- Base nitrogenada: es un compuesto heterocı́clico plano de carbono y nitró geno.
Pueden ser de dos tipos: bases pú ricas (A y G) y bases pirimidı́nicas (C, T y U).

- Grupo fosfato: el á cido fosfó rico es el tercer componente de los nucleó tidos y se
encuentra en forma de anió n fosfato (PO4 3-)
Þ Nucleósidos: está formado por la unión de una base nitrogenada y una pentosa por
un enlace N-glucosídico. Hay dos tipos:
- Ribonucleósidos: unión de una base nitrogenada con D-ribosa
- Desoxirribonucleósidos: unión de una base nitrogenada con 2-desoxi-D-ribosa.

Según el tipo de nucleósido se clasifica según unas características, organizadas en una


nomenclatura, que es la siguiente:
- Para las bases púricas: se añade la terminación -osina
- Para las bases pirimidínicas: se añade la terminación -idina
- Si la pentosa es la desoxirribosa: se añade el prefijo (desoxi-).

Þ Nucleótidos: está formado por la unión de un nucleósido + grupo fosfato mediante un


enlace éster entre C5 de la pentosa y el grupo fosfato, con la pérdida de una
molécula de agua. Tipos:
- Desoxirribonuceótidos: contiene 2-desoxi-D-ribosa. (ADN)
- Ribonuclótidos: contienen D-ribosa (ARN).

Según el tipo de nucleótidos, la nomenclatura es:


- Se nombran eliminando la “a” final del nombre del nucleósido del que proceden y
añadiendo 2 5-fosfato”.
Los nucleótidos se unen entre sí por le grupo fosfato mediante un enlace fosfodiéster entre
el C5 de un nucleótido y el C3 del siguiente, formando cadenas lineales de dos tipos:
- Oligonucleótidos: cadena corta de nucleótidos.
- Polinucleótidos: cadena larga de nucleótidos

La cadena de nucleótidos tiene dos extremos libres:


- El extremo 5’ con un grupo fosfato unido al C5 de la persona del primer nucleótido
- El entremo 3’ con un grupo -OH unido al C3 de la pentosa del último nucleótido

4.2 ESTRUCTURA DEL ADN

El ácido desoxirribonucleico o ADN. Las funciones de este son las siguientes:


- Almacenar la información genética del individuo
- Transmitir la información genética a la descendencia
- Dirige la síntesis de proteínas

En organismos eucariotas se localiza en el núcleo de las células formando los cromosomas


y en pequeñas cantidades en mitocondrias y cloroplastos.
En organismos procariotas, en un solo cromosoma y en plásmidos.
En virus pueden contener ADN o ARN como material genético, nunca los dos juntos.

El ADN es un polímero de largas cadenas de desoxirribonucleótidos de A,G, C y T.


Las características de la molécula de ADN:
- Las moléculas de ADN de los cromosomas son de gran tamaño (millones de pares
de bases)
- Los plásmidos y las molécula de ADN mitocondrial son de tamaño menor (miles de
pares de bases).
- Su composición es la proporción de cada desoxinucleótidos.
- Secuencia de bases nitrogenadas: es el orden en el que se localizan las bases
nitrogenadas
Þ Estructura primaria: de una molécula de ADN es la secuencia de bases nitrogenadas
colocadas en dirección 5’-3’. La unión complementaria de dos cadenas de ADN, se
realiza mediante puentes de hidrogeno (cadenas antiparalelas).
- El principio de complementariedad: los nucleótidos se mantienen unidos mediante
puentes de hidrógeno entre las bases nitrogenadas complementarias en función de
su tamaño y estructura. Para que se de esta unión, deben ser estables, los dos
nucleótidos deben situarse los grupos fosfatos en posición opuesta.

Þ Estructura secundaria o doble hélice: en 1953 Waston y Crick propusieron un


modelo para explicar la estructura de la doble hélice. Está formado por dos cadenas
de polinucleótidos (moléculas bicatenarias) que forman una doble hélice alrededor
de un eje central. Estas cadenas son antiparalelas, las secuencias de bases son
complementarias y las dos cadenas se mantienen unidas por puentes de hidrógeno.
Forman una doble hélice, el enrollamiento es dextrógiro y plectonémico, las bases se
sitúan en el interior (hidrofóbicas) y la cadena (hidrófila). Un giro de la doble hélice
equivale a 10 nucleótidos.

Þ Estructura terciaria: es la configuración tridimensional de la molécula de ADN


formando las fibras de cromatina. Formada por moléculas largas, lineales y
bicatenarias, asociado a proteínas básicas de dos tipos:
- Histonas: proteínas con función estructural
- No histonas: proteínas con función estructural, enzimática y reguladora.
El conjunto formado por ADN e histonas es la cromatina (con un aspecto de collar de
perlas, donde cada perlita es un nucleótido.

Þ Propiedades fisicoquímicas: los ácidos nucleicos de cadena larga, poseen las


siguientes características:
- Son ácidos debido al grupo fosfato
- Tienen una elevada viscosidad
- Tienen un pico de absorción de lux UV a una longitud de onda de 260nm y sirve
para medir su concentración.

Las cadenas complementarias del ADN se pueden separar por un proceso de


desnaturalización (rotura de los puentes de hidrógeno entre las bases nitrogenadas
complementarias separando las dos cadenas de nucleótidos que forman la doble hélice).
Se debe a un aumento en la temperatura o aumentando el pH.

Además, dos cadenas de ADN complementarias se pueden unir mediante un proceso de


hibridación (unión por puentes de hidrógeno entre las bases complementarias de dos
cadenas de ácidos nucleicos de origen distinto cuando hay condiciones favorables de
temperatura, pH y fuerza iónica.

Þ Organización del ADN en Eucariotas:


- ADN mitocondrial: molécula bicatenaria y circular formada por miles de nucleótidos.
Contiene enzimas que codifican para ARNr y ARNt y enzimas que se emplean en
procesos metabólicos en las mitocondrias. Se replica de manera independiente del
ADN nuclear y el número de copias por mitocondria es variable.

- ADN de cloroplastos: molécula bicatenaria circular que codifica enzimas de


cloroplastos en células vegetales.

- ADN complementario: es un ADN obtenido in vitro, se obtiene en el laboratorio a


partir de ARNm aislado de una célula mediante la enzima transcriptasa inversa que
se encarga de sintetizar ADN usando como molde ARN, es una herramienta muy útil
para conocer la información almacenada en el ADN.
4.3 ADN EN PROCARIOTAS Y VIRUS

En función de la procedencia del ADN, éste tiene distintos niveles de organización:

Þ Virus de ADN: el ADN se encuentra en una molécula lineal o circular, bicatenaria o


monocatenaria.
Þ Organismos procariotas: el ADN se encuentra en un solo cromosoma (mayor parte)
y en plásmidos (en menor proporción).
- Cromosoma bacteriano
- Es la molécula de ADN bicatenaria y circular de gran tamaño que se encuentra
en el citoplasma sin membrana nuclear que lo separe.
- Formado por millones de nucleótidos y sus extremos se unen formando un anillo
superenrollado para empaquetarse en el interior de la célula, dando lugar al
nucleoide.
- Plásmidos: son pequeñas moléculas circulares bicatenarias de ADN que poseen
algunas bacterias:
Formados por miles de nucleótidos
Desde un único plásmido hasta cientos.
Se replican de manera independiente del cromosoma bacteriano
Poseen genes de resistencia a antibióticos y factores de virulencia.
- ADN de los virus: son organismos no celulares y pueden contener ADN o ARN
(nunca a la vez)

4.4 TIPOS DE ARN


La función del ARN o ácido ribonucleico es controlar la síntesis de proteínas a partir de la
información que contiene del ADN

- Localización del ARN: en organismos eucariotas. (núcleo, citoplasma y ribosomas),


organismos procariotas (citoplasma y en ribosomas) y en los virus (su información
genética puede estar en forma de ARN o ADN.

Algunas zonas tienen secuencias complementarias donde la cadena puede desplegarse


formando regiones de doble hélice: horquillas. En el extremo de la horquilla se pueden
foRmar bucles cuando. Las regiones complementarias están separadas por secuencias no
complementarias. (A y U se forman 2 puentes de hidrógeno) u (C y G se forman 3 puentes
de hidrógeno).
Þ ARN heterogéneo nuclear: formado por largas moléculas lineales precursoras del
ARNm. Se sitúa en el núcleo, después de madurar, forman los ARNm que salen al
citoplasma.

Þ ARN mensajero: formado por una secuencia de nucleótidos que lleva la información
para la síntesis de una proteína, existen de distintos tamaños (FUNCIÓN: el ARNm
transmite la información genética contenida en el ADN para la sintetizar las
proteínas.). Tipos:
- Policistrónicas (organismos procariotas): llevan información para sintetizar varias
proteínas.
- Monocistrónicas (organismos eucariotas): llevan información para sintetizar una
proteína.

Þ ARNt: (FUNCIÓN: transporta los aminoácidos hasta los ribosomas para ser
incorporados a la cadena de proteínas). El ARNt está formado por cadenas cortas
(70-90 n) con estructura secundaria de hoja de trébol formada por cuatro horquillas y
tres lazos.
- Lazo D: sitio de unión de la enzima encargada de unir el aminoácido al extremo
3’ (aminoacil ARNt sintetasa).
- Lazo T: sitio de unión al ribosoma.
- Lazo anticodón: poseen las tres bases complementarias del codón en el ARNm
que codifican para el aminoácido.
4.5 DOGMA CENTRAL DE LA BIOLOGÍA MOLECULAR (FLUJO DE INFO. GENÉTICA)
Conceptos importantes:
- Gen: conjunto de nucleó tidos (pares de bases)- de 1000 a 10.000 pb
- Locus: posició n de los genes dentro de un cromosoma
- ADN: contiene la informació n gené tica
- Expresió n gené tica: producció n de proteı́nas funcionales

Dirección unidireccional de producción de proteínas desde el AD (con el paso intermedio de


formal ARNm), el flujo de información genética no es unidireccional. Los virus pueden pasar
de ARN a ADN (transcripción inversa), y los priones tienen proteínas con capacidad de
multiplicarse.

Para que el ADN pueda llevar a cabo sus funciones son necesarios tres procesos
metabólicos.
Þ La replicación: duplicación del ADN en las células (o se multiplica en los virus),
sintetizando nuevas moléculas de ADN. Núcleo
Þ La transcripción: se sintetizan moléculas de ARNm, encargadas de transportar la
información desde el núcleo al citoplasma. Núcleo
- La transcripción inversa, se da en algunos virus son capaces de sintetizar ADN a
partir de ARN.
Þ La traducción: Se transforma la secuencia de bases del ARNm en la secuencia de
aminoácidos de una proteína. Citoplasma
Þ Maduración (en algunos casos)
4.5.1 LA REPLICACIÓN
- La replicació n es un proceso a travé s del cual una molé cula de ADN se duplica para
formar dos molé culas de ADN hijas idé nticas con la misma secuencia de bases que la
molé cula inicial.

Þ Características de la replicación:
- Es semiconservativa: las dos nuevas moléculas de ADN generadas tendrán una
cadena precedente de la madre (original) y una nueva.
- Comienza por un origen de replicación: comienza en los orígenes de replicación
(puntos de iniciación concretos). El cromosoma de procariotas tiene un origen
de replicación (ori C). El cromosoma de eucariotas tiene varios orígenes de
replicación.
- Bidireccional y secuencial: las dos cadenas de ADN molde se separan y la
síntesis de las nuevas cadenas se produce en las dos direcciones, formando
dos horquillas de replicación.
- Semidiscontinua: las cadenas nuevas se producen en dirección 5’-3’, (ADN
polimerasa), por lo tanto, la cadena molde debe leerse en dirección 3’-5’. Al ser
bidireccional hay dos hebras que se van a sintetizar: la hebra retardada (cadena
sintetizada de manera discontinua, forma los fragmentos de Okazaki) y la hebra
adelantada o continua (cadena sintetizada de manera continua, sin
interrupciones)

Þ Las enzimas:
- Helicasa: desenrolla y separa las dos cadenas de la doble hélice.
- Proteínas de unión de cadena sencilla (SSBP): se unen a las cadenas
desenrolladas para evitar que se vuelva a formar la doble hélice.
- Girasa o topoisomerasa: relajan la tensión de la doble hélice mediante cortes y
empalmes.
- ADN polimerasa: tiene doble función:
1- Sintetiza la nueva cadena, añadiendo desoxinucleótidos al extremo 3’ de una
cadena en crecimiento.
2- Actividad exonucleasa: elimina nucleótidos para corregir errores (rompe los
enlaces de fosfodiéster)
- Primasa: tiene función de ARN polimerasa que sintetiza fragmentos cortos de
ARN (10 nucleótidos) llamados fragmentos de Okazaki. Para sintetizar la hebra
conductora se requiere un cebador, para sintetizar la hebra retardada se
requiere un cebador para cada fragmento de Okazaki.
- Ligasa: une los fragmentos de Okazaki entre ellos y con la hebra continua.
Þ Fases:
- Iniciación: se inicia cuando las proteínas específicas reconocen el origen de
replicación, y se unen a él, activando las helicasas que se encargan de romper
los puentes de hidrógeno entre las bases complementarias, separado las dos
cadenas de ADN y formándose una burbuja de replicación. Las SSBP se unen a
las cadenas separadas para impedir que se vuelvan a formar la doble hélice. Se
activan las girasas y topoisomerasa para relajar la tensión próxima a la burbuja
de replicación. Las helicasas hacen que la burbuja de replicación se extienda a
ambos sentidos por el cromosoma formando dos orquillas de replicación (lugar
donde se sintetizarán las nuevas cadenas de ADN).

- Elongación: la primasa sintetiza cebadores en dirección 5’-3’ (en la hebra


conductora un solo cebador, en la retardada se necesita un cebador para cada
uno de los fragmentos de Okazaki).La primasa se separa de la cadena molde y
entra la ADN polimerasa III para iniciar la elongación del cebador incorporando
desoxinucleótidos en el extremo 3’libre, la ADN polimerasa I se une a la cadena,
elimina los cebadores con actividad exonucleasa 5’-3’ y los sustituye por ADN
con actividad polimerasa. La ligasa une los fragmentos de Okazaki
consecutivos.
4.5.2 LA TRANSCRIPCIÓN
La transcripció n es un proceso a travé s del cual, se sintetiza una molé cula de ARN usando una
cadena de ADN como molde. En el nú cleo.

Þ Enzimas
- Procariotas: un tipo de ARN polimerasa.
- Eucariotas 3 tipos de ARN polimerasa
1. ARN polimerasa I: sintetiza ARNr
2. ARN polimerasa II: sintetiza ARN m
3. ARN polimerasa III: sintetiza ARNt y la subunidad 5s del ARNr
Þ Fases
- Iniciación: la ARN polimerasa reconoce una zona específica del ADN o promotor
con una secuencia de bases específicas para el ARN polimerasa (TATA). Se
unen los factores de transcripción a la región promotora y las dos cadenas de la
doble hélice se separan y comienza la síntesis de una cadena de ARN,
incorporando nucleótidos.
- Elongación: únicamente s transcribe la cadena molde de la molécula de ADN
(es la antiparalela con dirección 3’-5’), la cadena que no se transcribe se llama
cadena no molde. La ARN polimerasa se desplaza a lo largo de la cadena
molde, 3’-5’, seleccionando el ribonucleótido que tiene la base complementaria
de la del ADN y la incorpora en la cadena de ARN en crecimiento mediante un
enlace fosfodiéster. El crecimiento en cadena de ARN se da en dirección 5’-3’

- La terminación: la síntesis de ARN finaliza cuando la ARN polimerasa llega a la


secuencia de terminación. Aquí la cadena de ARN y la ARN polimerasa se
separan del ADN y el ADN recupera su estructura en doble hélice

- La maduración: es el proceso en el que a partir de un ARN transcrito se forma


ARN maduro. En procariotas, a partir de transcrito primario se cortan y pegan
diferentes zonas y se forman los ARNt y ARNr. El ARNm transcrito no requiere
modificaciones posteriores antes de traducirse a proteínas. La maduración en
eucariotas, los ARNt y ARNr maduran de manera similar a los procariotas, el
ARNm requiere de una maduración compleja antes de traducirse a proteína, ya
que en los genes eucariotas hay dos tipos de secuencia: exones e intrones.
Pasos en la maduración del ARN (eucariotas):
1. Adicción de una caperuza 5’: la maduración se inicia en la fase de elongación de
la transcripción, se adiciona una caperuza de 7-metilguanosina-trifosfato
(protege al ARN de la degradación), en el extremo 5’ libre de la cadena de
crecimiento.
2. Adición de una cola de Poli-A en 3’: cuando la molécula de ARN se separa del
ADN y de la ARN la poli-A polimerasa añade una cola de poli-A al extremo 3’ de
la nueva cadena de ARN y permite que el ARNm maduro salga del núcleo al
citoplasma.
3. La eliminación de intrones: corte y empalme (splicing), las ribonucleoproteínas
pequeñas nucleares (RNOsn) se sitúan en los extremos de los intrones y se
agrupan formando el complejo de espliceosona (corte y empalme) dando lugar a
un bucle y la cadena se cortan en base a este bucle, formando el ARNm maduro

4.5.3 LA TRADUCCIÓN

A partir de una molé cula de ARNm se sintetiza una proteı́na, durante la traducció n, los
aminoá cidos se van incorporando a la cadena polipeptı́dica en crecimiento
Þ El código genético: permite traducir las secuencias formadas por los 4 tipos de
bases nitrogenadas del ARN a una secuencia de 20 aminoácidos que forman las
proteínas.
- Codón: cada triplete, conjunto de tres bases nitrogenadas, que codifican un
aminoácido
- Hay 64 codones (4 elevado 3=64, cuatro bases nitrogenadas, tomadas de tres
en tres. 61 codones codifican aminoácidos y 3 son de terminación.
Þ Características del código genético
- Universal: es el mismo código para todos los organismos
- No es ambiguo: cada codón codifica un aminoácido
- Degenerado: cada aminoácido está codificado por más de un codón
- Continuo y no solapado: los codones se disponen unió a continuación del otro,
sin espacios, comas ni compartiendo ninguna base.

Þ Para que se dé la síntesis de proteínas se necesita:


- ARNm contiene la información de la secuencia de aminoácidos
- Los 20 aminoácidos van a componer las proteínas
- ARNt transportan los aminoácidos hasta los ribosomas
- Peptidil transferasa, enlace peptídico
- Ribosomas: orgánulos que llevan a cabo la traducción, están formados por
ARNr, proteínas y por 2 subunidades de distintos tamaños.
- Factores de liberación: proteínas que cortan la cadena polipeptídica del ARNt
terminal y liberan el complejo de traducción.

Þ Fases
- Iniciación: se inicia con la unión de la subunidad menor del ribosoma a un
ARNm en el codón de inicio AUG. Un ARNt con un anticodón (UAC) se
incorpora formando puentes de hidrógeno entre ambos y transporta el
aminoácido metionina formando el complejo de iniciación, se incorpora la
subunidad grande del ribosoma y el ARNt Met se sitúa en el sitio P.
- Elongación: se incorpora en el sitio A de un segundo ARNt un anticodón
complementario al segundo codón del ARNm. La peptidil-transferasa cataliza la
formación de un enlace peptídico entre la metionina del sitio P y el aminoácido
del sitio A. El ribosoma se desplaza por la molécula del ARNm en dirección 5’-3’
mediante translocación. El primer ARNt se separa del complejo, el ARNt que
lleva el dipéptido se traslada al sitio P y en el sitio A entra un nuevo aminoacil-
ARNt. Este ciclo se repite una y otra vez y en cada ciclo se incorpora unnuevo
aminoácido.
- Terminación: se produce cuando el ribosoma llega a un codón de terminación,
los factores de liberación reconocen a los codones de terminación haciendo que
la cadena se libere del complejo, y por último se disocia todo el complejo, las
dos subunidades del ribosoma se separan y se liberan los factores de liberación,
en el ARNm y el ARNt

4.6 ENZIMAS ASOCIADAS

Þ Nucleasas: enzimas de restricción que cortan y degradan los ácidos nucleicos


hidrolizando el enlace fosfodiéster entre dos nucleótidos
- Según el tipo de ácido nucleico
1) Nucleasas de ARN: rompen los enlaces fosfodiéster entre ribonucleótidos
2) Nucleasas de ADN: rompen los enlaces fosfodiéster entre
desoxirribonucleótidos
- Según el tipo de cadena
1) Nucleasas que atacan a moléculas monocatenarias
2) Nucleasas que atacan a moléculas bicatenarias
- Según la especificad del corte
1) Exonucleasas: eliminan nucleótidos desde un extremo
2) Endonucleasas: cortan en puntos intermedios de la molécula
- Según el punto de corte
1) Nucleasas que cortan en sitios aleatorios de la molécula
2) Nucleasas que cortan en sitios concretos de la molécula
Þ Endonucleasas de restricción: reconocen secuencias específicas de ADN: dianas
de restricción, y producen un corte fragmentando la molécula.
- Según el tipo de ácido nucleico: ADNasa
- Según el tipo de cadena: bicatenarias (algunas monocatenarias)
- Según la especificidad del corte: Endonucleasas
- Según el punto de corte: sitios concretos
- Tipo I: reconocen la diana y hacen un corte en una zona cercana de la diana
(1000 pb), generando fragmentos aleatorios
- Tipo II: reconocen la diana de restricción y hacen cortes en puntos específicos
dentro de la diana, generando fragmentos reproducibles
- Tipo III: reconocen dos secuencia invertidas y cortan fuera de la diana a una
distancia corta (20 pb)
4.6.1 NOMENCLATURA

Se nombran con las tres letras en cursiva y un número romano:


- Primera letra (mayúscula): inicial del género del nombre científico de la bacteria
aislada
- Segunda y tercera letra (minúscula): primeras letras de la especie del nombre
científico de la bacteria aislada
- Número romano: orden en el que se ha aislado la enzima de la misma especie

En ocasiones, cuando la enzima se aísla de una cepa se alade una cuarta letra
Mayúscula.

Þ Tipos de corte de las endonucleasas de restricción:


- Extremos romos: el corte se hace en el mismo punto en las dos cadenas, suele ser
en el centro de la diana de restricción.
- Extremos cohesivos. El corte se hace en puntos distintos de las dos cadenas,
suele ser en los extremos de la diana de restricción.

Þ Aplicaciones en biología molecular: se utilizan para crear ARN recombinante y


obtener patrones de restricción
4.6.2 OTRAS ENZIMAS

Þ ADN polimerasa
Þ Retrotranscriptasas o transcriptasas inversas
Þ Desoxinucleotidil tranferasa terminal
Þ Ligasas
Þ

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