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BIOQUÍMICA
GENERAL
Primero de Medicina 2016/2017
JOAQUÍN ALONSO
Introducción al tocho:
La gran mayoría de la información de este tocho se ha obtenido directamente de otros
tochos: Nacho y Mario y Ramón.
De hecho, si comparais, muchas partes son directamente copiar+pegar del tocho de
Nacho y Mario y otras partes son capturas de pantalla o copiar+pegar del tocho de
Ramón.
También hay partes que son de mi puño y letra, de apuntes de clase y del Lehninger.
Mi labor ha sido principalmente ACTUALIZAR el tocho, sobre todo porque en Nacho y
Mario y Ramón a veces no se seguía el ORDEN de clase, había cosas de más (que no
entran) y, supongo que, debido a los años, faltaban por poner cosas. En este tocho se
sigue diapositiva a diapositiva el temario de la asignatura, lo que facilita
tremendamente el estudio de ésta.
IMPORTANTE: Debido a que este tocho lo hacía antes de estudiar, cometía errores, los
cuales me daba cuenta mientras estudiaba (una vez que ya entendía la materia). Como
estaba estudiando, muchos de esos errores no me los apuntaba para corregirlos por lo
que siguen allí. A mi no me supusieron ningún problema ya que no son errores en
nombres de moléculas o proteínas sino más bien en algún proceso. Por ello, supongo
que tampoco tendreís problema en percataros de ellos. ESPERO QUE ESTOS ERRORES
VAYAN DESAPARECIENDO A MEDIDA QUE LOS VAYA ENCONTRANDO. Si encontrais
alguno, enviádmelo y lo corrijo.
Otra cosa a tener en cuenta es que, con las más de 200 páginas que tiene este tocho,
hay información más que de sobra para sacar un 10, así que yo creo que intentar
ampliar más es masoquismo.
Los primeros dos temas (agua y pH) son especialmente breves porque por un lado era
nuevo en la uni y ni siquiera sabía que existían tochos y por otro lado porque es un
tema facilísimo. Del tema de agua y pH hacen preguntas facilísimas y muy pocas. Yo
me estudíe ph y agua de estos apuntes y no tuve ningún problema, pero si os parece
poco, supongo que Nacho y Mario y Ramón estarán más amplios (pero vamos, que no
conviene entretenerse en esa parte).
2. Agua:
Propiedades físico-químicas: 1- Puntos de fusión y ebullición elevados
2- Elevada tensión superficial
DISOLVENTE UNIVERSAL:
SUSTANCIAS HIDROFÓBICAS:
El agua no disuelve sustancias apolares. Éstas se unen por interacciones hidrofóbicas. Las
interacciones hidrofóbicas no existen de forma intrínseca entre sustancias hidrofóbicas, sino
que son resultado de la tendencia del sistema a adquirir una mayor estabilidad termodinámica
“debido a la 2ª ley de la termodinámica – La entropía del universo siempre aumenta. Como
vemos, muchas moléculas de agua en la imagen de la derecha han quedado en estado libre.
3.pH:
[𝐻+][𝑂𝐻−]
𝐾𝑒 = =10-16
[𝐻2𝑂]
El agua es un electrolito muy débil.
Aunque hablemos de protones (H+) nunca habrá protones aislados sino H3O+.
[𝐻+][𝐴−]
Ka= Cuanto mayor es Ka más fuerte es el ácido. Característico de cada ácido.
[𝐴𝐻]
[𝐴𝐻] [𝐴𝐻]
[H+]=ka [𝐴−] -log[H+]=-logKa-log[𝐴−]
[𝐴−]
Ph=Pka + log Ecuación de Henderson-Hasselbach. ¡IMP ECUACIÓN!
[𝐴𝐻]
TAMPONES:
El tampón no anula las variaciones de pH, sino que lo SUAVIZA. Es decir, al añadir una base el
Ph aumentará mucho menos que si no hubiese tampón. Igualmente, si añadimos un ácido el
pH disminuirá mucho menos que si no hubiese tampón.
Cuanta más concentración absoluta del tampón mejor ya que nos durará más tiempo. Es decir,
la suma AH/A- cuanto más grande mejor. Ej: Concentración AH/A- 1/1 es mejor que 0,1/0,1.
[𝐴𝐻]
Además el tampón ideal es aquel cuya relación AH/A- es 1, es decir [𝐴−] = 1, y por lo tanto la
concentración del ácido y la base conjugada es la misma.
TAMPONES BIOLÓGICOS:
Tampones orgánicos:
Tampones inorgánicos:
Tampón bicarbonato.
¿Por qué no usamos el tampón fosfato si nos es tan útil? Simplemente porque no tenemos
tanto fosfato en el cuerpo y en cambio sí que tenemos bastante CO2 para hacer bicarbonato.
Además, pese a que su pk es de 6,1 y NO ES MUY EFECTIVO a pH 7,4 ya que la diferencia de pH
es de más de 1 (1,3 más) el CO2 lo regeneramos muy rápidamente al respirar y nunca se nos
acabará, por lo que siempre tendremos CO2 para acidificar. El problema por el que los
tampones solo se usan en el rango +-1 de su pK es que si salimos de ese rango la
concentración de una de las dos especies será tan baja que no podrá tamponar. Sin embargo,
en el caso del CO2 la especie acida (el CO2) nunca se acabará y siempre habrá suministro.
POSIBLE PREGUNTA EXAMEN: Cual será el tampón más común/útil a determinado Ph? Solo
tenemos que prestar atención a que tampón se encuentra en el margen de +-1 de su pKa.
Funciones:
• Formar parte de las proteínas:
➢ Transporte y almacenamiento
➢ Estructurales: en la célula, en los tejidos
➢ Contracción muscular
➢ Respuesta inmune
➢ Coagulación de la sangre
➢ Catálisis (enzimas)
➢ Hormonas
➢ Otras funciones
• Sirven de sustrato para la biosíntesis de compuestos nitrogenados. Algunos compuestos
no proteicos contienen nitrógeno que requieren aminoácidos para su síntesis.
• Función energética. En ciertos casos pueden usarse para obtener energía como
combustible metabólico.
Estructura: Todos los aminoácidos tienen una estructura común formada por un carbono-𝛼
asimétrico (excepto en la glicina) al cual se unen un grupo carboxilo (llamado 𝛼‐carboxilo (-
COOH), un grupo amino (llamado 𝛼‐amino (-NH3), un átomo de hidrogeno y una cadena lateral
variable R que depende de cada aminoácido.
Los átomos de carbono de un aminoácido se nombran con números o letras griegas según la
imagen:
La presencia del carbono asimétrico 𝛼 implica la existencia de isomería: Los enlaces alrededor
del carbono-𝛼 adoptan una configuración tetraédrica adoptando
dos formas especulares NO SUPERPONIBLES (formas quirales
enantiómeras) independientemente del grado de rotación de la
molécula. Estas formas se denominan D y L según el grupo 𝛼‐
amino se localice a la izquierda (L) o derecha (D). Solo los
aminoácidos L forman parte de las proteínas mientras que los D forman algunos antibióticos.
Importante:
aprender ambas
abreviaturas.
Un aminoácido especial:
Otros aminoácidos:
Existe un aminoácido poco frecuente considerado como el aminoácido 21 que se incorpora a la
proteína durante el proceso de traducción. Se trata de la selenocisteína (SEC; U) que forma
parte de la glutatión reductasa. El aminoácido 22 es la pirrolisina (PYL;O) presente en
membranas de arqueobacterias.
Cambios según el pH
Representación de
Ramachandran
5.2 Péptidos:
Por la unión de aminoácidos mediante enlaces peptídicos se forman péptidos. Todos tienen un
extremo N-terminal (izda.) y uno C-terminal (dcha.) Según el número de aminoácidos existen:
Ruptura del enlace peptídico: El enlace peptídico es muy estable y requiere de enzimas
hidrolasas que introducen una molécula de agua para separar dos aminoácidos. Destacan
las enzimas segregadas desde el páncreas al duodeno en su forma inactivada, y se activan
ante cambios de pH del tubo digestivo. Existen enzimas endoproteasas, que actúan en el
interior de la cadena peptídica, y exoproteasas, que comienzan a romper la cadena desde
alguno de los extremos.
Características:
5.3 Proteínas.
Son péptidos cuyo peso es superior a 5500 Dalton. Pueden ser de dos tipos:
Clasificación:
• Según su función:
o Enzimas: Catalizan las reacciones.
o Transportadoras: Transportan lípidos insolubles en agua, como las que
acompañan al colesterol LDL y HDL.
o De reserva: Ovoalbúmina, proporciona energía.
o Contráctiles: Como la actina, miosina o dineína.
o Estructurales: Una de las más importantes, muchas son los principales
elementos estructurales de la célula (citoesqueleto).
o Defensa: Como las inmunoglobulinas.
o Reguladoras: Como las hormonas.
• Según su forma:
o Fibrosas: Con forma alargada, se repite una sola estructura secundaria.
Resistentes e insolubles con función normalmente estructural. Como la
queratina.
o Globulares: Más o menos esféricas y abundantes estructuras secundarias. Son
solubles, flexibles y dinámicas (cambios conformacionales). Como la
hemoglobina.
• Según composición:
• Simples: Solo por aminoácidos.
• Conjugadas: Formadas por sustancias peptídicas y un grupo no proteico,
llamado grupo prostético. Diferenciamos:
▪ Lipoproteínas: Contienen lípidos.
▪ Glucoproteínas: Contienen glúcidos.
▪ Fosfoproteínas: Con grupos fosfato.
▪ Hemoproteínas: Con grupos hemo.
▪ Flavoproteínas: Con flavina.
▪ Metaloproteínas: Con metales (Fe, Zn…)
C: Corta por
el carbonilo.
N: Corta por
el amino.
Estudiar tripsina,
quimiotripsina , pepsina y
carboxipeptidasa
Tipos de hélice:
Giros- β: Son elementos de conexión entre segmentos de hélices- α y láminas- β o entre ambos
tipos de estructuras secundarias. Sin embargo, SON ESPECIALMENTE COMUNES EN LOS GIROS
QUE CONECTAN DOS EXTREMOS ADYACENTES DE DOS HOJAS-β ANTIPARALELAS. En los giros se
forma un puente de hidrógeno entre el residuo n y el residuo n+3. En los giros abundan los
aminoácidos glicina y la prolina.
Si nos piden calcular longitud de una proteína y nos dan solo su peso: Los residuos
aminoacídicos pesan unos 110 Da (no los aminoácidos ya que estos pesan más)
(normalmente el peso nos lo darán en KDa). Dividimos el peso entre el peso por residuo
aminoacídico y nos dará el número de residuos aminoacídicos. Multiplicamos esto por la
distancia entre cada residuo: 0,35nm en láminas-β y 0,15 en hélices-α. Además, si nos
piden que calculemos la longitud de una lámina-β nos dirán en cuantas hebras se pliega y
cuantos residuos se pierden en el giro para saber cuántos residuos quedan en la hebra y
con ello multiplicarla por la distancia por residuo. Ej : Suponer que un segmento proteico de
40 residuos se pliega en una estructura β antiparalela de dos hebras con un giro en horquilla
de 4 residuos. ¿Cuál es la longitud de esta estructura secundaria? -- serían 18 residuos en cada
hebra (40 menos 4 de la vuelta entre 2). Ya que la elevación por residuo es de 0.35 nm, la
longitud es de 6.3 nm. (0.35 por 18)
Giros
Sin embargo, no todas las zonas de la proteína se pueden clasificar como hélice-α,
lámina-β o giros; sino que hay regiones estructuradas irregularmente según una
conformación al azar o ovillo aleatorio.
Cada proteína posee una estructura terciaria distinta, sin embargo, puede haber cambios
conformacionales debido a determinadas circunstancias. La estructura tridimensional de una
proteína depende también de la secuencia de aminoácidos, y SU FUNCIÓN DEPENDERÁ DE SU
ESTRUCTURA TRIDIMENSIONAL. Encontramos ciertos patrones que se repiten
en las estructuras tridimensionales llamados dominios.
Las proteínas formadas solo por una cadena peptídica (monoméricas) no tienen
estructura cuaternaria. La estructura cuaternaria consiste en el ensamblaje estable y
funcional de al menos dos cadenas peptídicas (homodímeros o heterodímeros). De igual
manera que en la terciaria, las proteínas con estructura cuaternaria podrán tener
cambios conformacionales que modifiquen su funcionalidad.
6.4. Plegamiento y desnaturalización
El plegamiento de una proteína consiste en la adquisición de su estructura tridimensional
funcional o estructura nativa a partir de su/s cadena/s polipeptídica/s. El plegamiento de
numerosas proteínas requiere la asistencia de proteínas específicas, las chaperonas. Otras
chaperonas pueden impedir su plegamiento para permitir el paso a través de las membranas de
la mitocondria.
EL GRUPO HEMO:
MIOGLOBINA:
La mioglobina (o Mb) es una proteína presente en todos los mamíferos, especialmente en el tejido
muscular, que se encarga de la difusión del O2 dentro del músculo. Es una proteína monomérica, por lo
que consta de un único polipéptido de 153 aminoácidos con una molécula de Hemo y peso de 16700 Da.
Dicho polipéptido está formado por 8 segmentos (8 hélices-α) (que se nombran de la A a la H) unidos por
giros (que se nombran según los segmentos que unen, desde el AB hasta el GH). Los residuos de
aminoácidos individuales se pueden nombrar de dos maneras.
A) Por su localización dentro del segmento, en cuyo caso se especifica el segmento al que
pertenece y la posición que ocupa dentro de él (XF8, XD3, etc.)
HEMOGLOBINA:
La hemoglobina es una proteína casi esférica. Se trata de una proteína tetramérica (cuatro
cadenas polipeptídicas), que contiene 4 grupos Hemo, cada uno asociado a una subunidad. En
la hemoglobina de un adulto encontramos dos tipos de globina.
Ambas estructuras (α y β) son muy similares tridimensionalmente entre ellas y a mioglobina. Sin
embargo, estructuralmente (secuencia de aminoácidos) son bastante más diferentes. Estas tres
cadenas polipeptídicas son del grupo de las globinas.
Cambios estructurales por unión del oxígeno: La hemoglobina cuenta con dos estados
conformacionales: el estado R (“relajado”=truco nemotécnico) y el estado T (“tenso”=truco
nemotécnico). EL O2 SE UNE A ELLA EN CUALQUIERA DE AMBOS ESTADOS, pero tiene mayor
afinidad en el estado R (el cual se estabiliza con la unión del O2). Mientras tanto, el estado T es
más estable si el O2 está ausente (desoxihemoglobina). Cuando el oxígeno se une a la
hemoglobina en estado T, promueve su transformación al estado R, rompiendo algunos enlaces
ionicos y desplazándose los pares de subunidades αβ. Cuando se une el oxigeno, la porfirina
(curvada en estado T
hacia la histidina
proximal F8) se
aplana.
Función de la Mb y Hb:
Como ya hemos descrito anteriormente, la función de la Mb y la Hb puede resumirse en el
transporte de O2, que implica lógicamente una unión con el mismo, un transporte propiamente
dicho y una disociación entre ambas moléculas. Este proceso de unión y disociación es
fundamental, y puede expresarse con un equilibrio donde P representa la proteína (Hb o Mb) y
L el ligando (O2). P + L ↔ PL Mb + O2 ↔ MbO2
La reacción de equilibrio presenta lógicamente una constante de equilibrio, Ka, de manera que:
[𝑃𝐿]
Ka=[𝑃][𝐿] Por tanto [MbO2]=Ka[O2][Mb]
[𝑀𝑏02]
Ka=[𝑀𝑏][𝑂2]
Todo este
Mb + O2 ↔ MbO2
desarrollo es
[𝑀𝑏𝑂2] 𝑀𝑜𝑙é𝑐𝑢𝑙𝑎𝑠 𝑂2 para la
Y(grado de saturación) =[𝑀𝑏]+[𝑀𝑏𝑂2]=𝑀𝑜𝑙é𝑐𝑢𝑙𝑎𝑠 𝑡𝑜𝑡𝑎𝑙𝑒𝑠 𝑀𝑏 Mioglobina, la
También se le hemoglobina
llama Ө(teta). tiene su propia
Sustituimos [MbO2]
[𝑀𝑏][𝑂2]𝐾𝑎 forma en la
Por tanto Y= por Ka[O2][Mb]
siguiente hoja.
[𝑀𝑏][𝑂2]𝐾𝑎 +[𝑀𝑏]
Simplificamos
SOLO PARA
MIOGLOBINA
Si consideramos que la concentración de una sustancia
volátil en solución es proporcional a la presión del gas,
obtenemos
NOTA: Otro aspecto a destacar de esta deducciones la relación inversa que existe entre P50
(Presión parcial de oxigeno a la que la mitad de sitios ligantes están ocupados por O2) y la Ka
(constante de afinidad).
1
𝑃50 =
𝐾𝑎
P50: punto en el que la mitad de
los espacios están ocupados.
K= Constante de solubilidad.
Observamos en la foto superior que la histidina distal en estado T está casi en la periferia,
mientras que en estado R ésta rota hacia el interior, favoreciendo la unión del O2.
Modelo concertado:
Existen dos formas y el
cambio de una a otra es
espontáneo e implica
una rotación de 15º de
las dos subunidades α1
y β1 sobre las α2 y β2
Por tanto, el oxígeno y los protones se unen a la Hb, pero con afinidades diferentes. A altas
concentraciones de O2 se liberan protones y se capta oxígeno y viceversa. Tampoco comparten
lugares de unión ya que el oxígeno se une al Fe del grupo Hemo y el H+ a diferentes residuos
aminoacídicos. La unión del H+ favorece la estabilidad de la Hb estado T.
Los tejidos periféricos son más ácidos porque hay más CO2 (fruto de un mayor metabolismo) y
por lo tanto la Hb tiene menor afinidad por el O2, favoreciendo su liberación. Esto es una gran
ventaja ya que favorece la difusión del O2. Este efecto se añade a la menor presión parcial de
O2 en la periferia (recordemos que cuanta menor presión parcial de O2 menor afinidad por el O2
tendrá la Hb y estará mayormente en forma T). Así, ya conocemos dos fenómenos que
favorecen la liberación del oxígeno en la periferia: el efecto Bohr del pH y la menor presión
parcial.
Ambas moléculas (CO2 Y H+) actúan de moduladores alostéricos de cooperación negativa y por
tanto, cuanto menor sea el pH y mayor la cantidad de CO2 se transporte, la afinidad de la
hemoglobina por el oxígeno disminuye y lo libera en los tejidos. Por ello ocurre la situación
contraria en los capilares sanguíneos: según se libera CO2 para expulsarlo, aumenta la afinidad
por el oxígeno y lo “captura” para llevarlo al resto de tejidos. Este efecto del pH y el O2 se
conoce como efecto Bohr.
El BFG es importante en relación con la unión del oxígeno según la presión parcial del
mismo. Por ej. A gran altitud (montaña) aumentan los niveles de BFG para
contrarrestar la escasez de oxígeno, ya que el BCG hace que la Hb libere más O2.
También aumenta en los casos de hipoxia. La regulación por parte del BFG es vital en el
desarrollo fetal ya que la Hb fetal tiene una mayor afinidad por el O2 para poder extraerlo de la
sangre materna, lo que dificulta su posterior liberación.
Derivados de la Hemoglobina:
Carboxihemoglobina: Transporta CO.
Metahemoglobina: El Fe del grupo Hemo se encuentra en estado férrico en lugar de ferroso, por
lo que no puede transportar O2.
Hemoglobina A1C: Es la Hb normal de un adulto pero que por una hiperglucemia se encuentra
modificada, en este caso glucosilada, causando algunas complicaciones serias.
En resumen:
La Hb capta el O2 en los capilares pulmonares a altas presiones de Oxigeno, lo que favorece la
unión del O2 al estado R de la Hb. A medida que avanza hacia las venas periféricas aumenta el
pH, la [CO2] (ambos efectos ligados) y disminuye mucho la presión parcial de O2, provocando la
liberación de éste. Es notable la regulación del BFG, que también favorece la liberación del O2
uniéndose a la Hb. Así, la sangre arterial está saturada casi al 100% mientras que la venosa al
55-65%. Por ello, en los tejidos se desprende un 30-40%.
Hb adulto HbA1 ( α2 β2 )
Las cadenas ε y δ dejan de
Embrión: -Hb Gower 1 expresarse en la 6ª semana. Al
nacer cae rápidamente la
-Hb Porland
producción de γ y aumenta la de β
-Hb Gower 2
Diferencias entre γ y β.
La His143 de la cadena β
se sustituye por Ser, la
cadena γ tiene menor
afinidad por el 2,3-
bifosfoglicerato y
mayor afinidad por el
O2. En definitiva, la Hb fetal tiene mayor afinidad por
el oxígeno para poder extraerlo de la sangre
materna.
Hb anormales:
-HbS (Hb drepanocítica): Debido a una sola mutación en el gen de la cadena β,
cuando disminuye la [O2] en los tejidos periféricos las HbS tienden a
polimerizar, lo que afecta a la estructura cristalina por interacciones
hidrofóbicas y la priva de gran parte de su capacidad de transporte de O2. El
cambio de forma puede provocar hemolisis, obstrucción de vasos
sanguíneos… Sin embargo, hacen falta los dos genes de la Hb (paterno y
materno) para desarrollar la anemia grave.
9.Enzimas:
Las enzimas son catalizadores biológicos, generalmente de naturaleza proteica que catalizan de
forma específica determinadas reacciones bioquímicas uniéndose al metabolito o molécula que
se va a transformar, la cual recibe el nombre de sustrato. Su misión es incrementar la velocidad
de las reacciones sin afectarse de forma permanente ya que una de las condiciones para que
haya vida es que el organismo sea capaz de catalizar reacciones químicas de forma eficiente y
selectiva.
Centro activo: El centro o sitio activo de la enzima es la zona que interacciona con el sustrato
por interacciones debiles. Contiene residuos de
aminoácidos que participan en la unión del
sustrato, y aminoácidos que intervienen en la
catálisis. Representan una pequeña parte en el
tamaño de la proteína que se localiza en su
superficie en forma de una hendidura o bolsillo
donde se introduce el sustrato.
Nombre sistemático: “ATP: glucosa fosfotransferasa” que indica que cataliza la transferencia de
un grupo fosforilo (en las transferasas se indica lo que se transfiere) desde el ATP a la glucosa.
Clase: Transferasa
Subclase: Fosfotransferasa
Sub-subclase: Fosfotransferasa que utiliza hidroxilo como receptor
Número de serie: indica que es glucosa el receptor del grupo fosfato
Abzimas: Los anticuerpos. Existen Ig que se desarrollan contra análogos del estado de transición
con capacidad del mismo, forzando la catálisis del sustrato.
ΔG=ΔH – TΔS
Una reacción es espontánea cuando su ΔG es negativa (ΔG<0). Sin embargo, los procesos en los
que ΔG>0 no suceden espontáneamente. LAS ENZIMAS NO MODIFICAN ΔG. LO QUE MODIFICAN
Y DISMINUYEN ES LA ENERGÍA DE ACTIVACIÓN.
E + S ↔ ES ↔ EP ↔ E+ P
Como vemos, los estados de energía basales de S y P son iguales con y sin enzima, es
decir, su ΔG es igual. La principal diferencia es que la Ea (ΔG*) (Energía de activación) sin
enzimas (línea negra) es mucho mayor que la necesaria con enzimas (línea clara). Por ello,
lo que hace es “suavizar la colina energética”)
Un equilibrio favorable no significa que la reacción sea rápida (la velocidad depende de otro
parámetro distinto). Existe una barrera energética entre el sustrato
y el producto que representa la energía necesaria para que todos
los sustratos pasen al estado de transición. Esta barrera,
representada como una “colina energética”, se denomina Energía
de activación (ΔG* -el asterisco indica que es de activación-). La
diferencia entre el estado basal S y el P se denomina energía libre
de Gibbs (ΔG). La velocidad de una reacción depende de ΔG* por
lo que las enzimas aumentan la velocidad de reacción al disminuir
ΔG* (No disminuyen ΔG). Esto se debe a que las enzimas se unen
mejor a los estados de transición que a los sustratos.
El equilibrio de una reacción se relaciona con ΔG mientras que su velocidad con ΔG*.
[𝑃]
Constante de equlibrio: Keq=[𝑆]. Un equilibrio favorable no indica que la reacción sea rápida.
• Efecto de proximidad: Las enzimas logran en su centro activo una concentración local
de reactivos mucho mayor que la de estos en disolución. Además, crean un ambiente
que excluye el agua simulando un solvente orgánico.
• Efecto de orientación: La fijación al centro activo se hace en la orientación correcta para
que las colisiones sean efectivas.
Conceptos teóricos: Uno de los factores que más afecta a la velocidad de una reacción
enzimática es la concentración de sustrato presente [S]. Sin embargo, ésta cambia
continuamente en el transcurso de la reacción según se transforma en producto. A pesar de
que cuanto mayor sea la [S] mayor será la velocidad, se observa que hay un punto en el que por
mucho que aumentes la concentración, la velocidad no aumenta, es la Vmax.
Michaelis y Menten observaron que al ser la velocidad de la segunda ecuación (ES↔E+P) más
lenta que la primera (E+S↔ES), es la segunda la que limita la reacción y por tanto, la velocidad
global será proporcional a la especie intermedia (ES). La Vmax se observará cuando todas las
enzimas formen el complejo ES y la [E] sea pequeña, es decir, esté saturado y por tanto un
aumento de [S] no supondrá un aumento de la velocidad.
Calculando velocidades de reacción: A+B↔P+Q
Ley de acción de masas: La velocidad de una reacción es directamente proporcional al producto
de las concentraciones de los reactivos. V=K[A][B]
Ecuaciones de velocidad enzimática:
Cuando un enzima se mezcla inicialmente con una gran cantidad de sustrato, podemos decir
que existe un periodo inicial denominado estado pre-estacionario, durante el cual aumenta la
concentración del complejo Es. Normalmente es un estadio muy corto y que dura unos
microsegundos.
Ecuación de Michaelis y Menten: La curva que representa la relación entre [S] y Vo tiene la
misma forma en la mayoría de enzimas. Esta curva puede expresarse algebraicamente a través
de la ecuación de Michaelis-Menten, los cuales aceptaban la hipótesis de que el paso limitante
de velocidad es la descomposición del complejo ES para formar producto y enzima libre. La
ecuación a la que llegamos tras tener en cuenta la ley de acción de masas y la hipótesis del
estado estacionario es:
𝑉𝑚𝑎𝑥 ∙[𝑆]
V= En definitiva, el limitante de la
𝐾𝑚+[𝑆]
velocidad es la reacción
ES↔E+P y no E+S↔ES
Los términos importantes son [S], Vmáx y una constante llamada de Michaelis o KM, que se
pueden medir de forma experimental.
Si lo estudiamos desde el punto de vista de la hipótesis del estado estacionario, al deducir esta
ecuación partirnos de los siguientes supuestos:
V0=k2 [ES]
Esto además corresponde a la Vmáx del enzima en cuestión, algo que tendremos en cuenta en
la deducción de la ecuación de Michaelis-Menten.
La formación y descomposición del complejo ES están ocurriendo a la misma velocidad. Como
hemos dicho que la formación de ES desde P no cuenta, las velocidades son:
2. Significado de Km:
La ecuación de Michaelis y Menten puede obtenerse teniendo en cuenta por separado la
hipótesis del estado estacionario y la teoría de Michaelis y Menten. Únicamente varían en cómo
sustituiremos KM en un caso u otro:
En equilibrio rápido Michaels y Menten:
Si k+2 es limitante de la velocidad, y por lo
tanto, k+2<<k-1 entonces KM se simplifica a
KM=k-1/k1=Kd (cte de disociación). En este
caso KM representa una medida de la
afinidad de la enzima por su sustrato en el
Si k2>>k-1: complejo ES.
𝑘
KM=𝑘2
1
En hipótesis del estado estacionario:
k−1
Sin embargo, si k+2 <<< k-1 Km= =Kd (Se relaciona con la afinidad)
k+1
La KM en este caso sería una constante de disociación del complejo ES, Kd, útil para reacciones
en dos pasos como proponen Michaelis y Menten, pero no es un caso válido para la mayoría de
enzimas, ya que a veces se da la situación inversa, k2>>k-1, con los cambios que conlleva en la
KM:
𝑘+2
Sin embargo, si k+2 >>> k-1 Km (En este caso KM sería una cte cinética)
𝑘+1
3. Significado de Vmax:
• Para alcanzar la velocidad máxima se requiere que todas las moléculas de enzima estén
unidas a sustrato.
• Mide función de transformación catalítica.
• Se expresa en unidades de velocidad. µmol/min o en katal (kat) = moles/s.
• Directamente proporcional a la [S]. (se prefiere caracterizar a la enzima por k+2 o Kcat).
• Vmax es la velocidad máxima teórica de la reacción, aunque nunca se alcanza en
realidad por el equilibrio químico.
4. Parámetros cinéticos
Número de recambio (Kcat):
Kcat define el poder catalítico, número de moléculas de sustrato transformadas por centro
activo en unidad de tiempo. Es independiente de [E]t, porque define lo que ocurre por centro
activo. Si alteramos alguna condición (pH, temperatura, sustrato…) la Kcat cambia. Su rango es
10-108 s-1
𝑉
𝑚𝑎𝑥
Kcat= [𝐸]𝑡 (número de recambio) donde Vmax=k+2[E]t y es la velocidad limitante de
cualquier reacción enzimática en condiciones de saturación.
Constante de especificidad:
1
Se mide en M-1s-1 ( ). Es una constante de velocidad de segundo orden aparente y define
𝑀∙𝑠
la eficiencia catalítica de una enzima.
𝐾𝑐𝑎𝑡 1
Constante de especificidad= ( )
𝐾𝑀 𝑀∙𝑠
𝑉𝑚𝑎𝑥 ∙[𝑆]
Esta ecuación proviene de la de Michaels-Menten V=
𝐾𝑚+[𝑆]
en la que Vmax se sustituye por Kcat•[E]t
𝑉𝑚𝑎𝑥
y si [S]<<<KM entonces: ya que Kcat=
[𝐸]𝑡
𝐾𝑐𝑎𝑡
Por tanto define la eficiencia de los encuentros entre E y S
𝐾𝑀
en la generación de producto. Es como la “k” en las ecuaciones
1º Medicina cinéticas.
UAM – Bioquímica General – Joaquín Alonso
Ej. V=K[A][B]
47
𝐾𝑐𝑎𝑡
El caso de mayor eficiencia de es que K-1 sea despreciable y el máximo podrá ser K+1.
𝐾𝑀
La pendiente es
KM/vMAX
La variable
es 1/[S]
Esta representación gráfica permite conocer Vmax de forma más precisa, ya que mediante la
gráfica V/[S] normal sólo lo determinamos de forma aproximada.
1. Tipos de inhibición.
1.1. Inhibición reversible.
1.1.1 Inhibición competititva.
En este caso, el sustrato y el inhibidor son mutuamente excluyentes y ambos compiten por
unirse al centro activo de la enzima libre. Si el inhibidor se une a la enzima, impide la entrada
del sustrato. Por ello, gran parte de estos inhibidores tienen gran parecido estructural con los
sustratos de la enzima que inhiben.
Un gran aumento de [S] evita la inhibición y tiende a la formación de productos, ya que esto
favorece el desplazamiento del equilibrio hacia la formación del complejo ES en lugar del
complejo EI.
La presencia del inhibidor aumenta el valor de la KM, a la que no llamaremos KM sino KM´ (KM
prima) o αkM siendo siempre MAYOR a KM
αkM= KM´> KM
La fórmula de Michaelis
y Menten quedará así
Ejemplo:
El metotrexato es un análogo estructural
del dihidrofolato (FH2). El FH2 genera
tetrahidrofolato (FH4) por acción de la
dihidrofolato reductasa. El FH4 es
necesario para la síntesis de dTMP (base
nitrogenada del ADN), y por ello utilizamos
el metotrexato, para saturar la
dihidrofolato reductasa, lo que sirve para
frenar el crecimiento tumoral al no
generarse FH4 y por ello dTMP.
La presencia de inhibidor hace que la formación del complejo ES se produzca a mayor velocidad,
disminuyendo el valor de KM, así como el valor de Vmáx. Por tanto, la [I] hará que el enzima sea
más afín por el sustrato, pero disminuirá la Vmáx al impedir la formación de producto.
Gráfica de recíprocos
La fórmula de Micheelis
Menten quedaría así
Gráfica de recíprocos
Es igual que la no competitiva, la diferencia entre estas se encuentra en que las KI de las
uniones al complejo E y complejo ES son distintas (KI y K’I), por lo que la afinidad por una vía u
otra varía. En función de las KI, KM se modifica de forma distinta, y puede subir y bajar. Si, por
Los inhibidores suicidas o basados en el mecanismo son un tipo de inhibidor irreversible que se
caracteriza por su poca reactividad a priori, hasta el momento en que se unen al centro activo
de un enzima específico. Actúan como un sustrato normal del enzima, atravesando las primeras
etapas de la catálisis enzimática, hasta que en un momento dado se vuelven muy reactivos
respecto al enzima y se unen irreversiblemente con éste en lugar de transformarse en
producto.
Este tipo de inhibidores es muy útil en la elaboración de fármacos, porque se elaboran a medida
que se van conociendo más mecanismos enzimáticos, y si está bien diseñado es muy específico
para un cierto enzima, por lo que tendrá pocos efectos
secundarios.
3. Se ionizan los grupos del centro activo que participan en la unión al sustrato o en la
transformación del sustrato, de modo que la catálisis sólo puede llegar hasta cierto punto.
La mayoría de las reacciones enzimática involucra a dos sustratos, como son las catalizadas por
transferasas y oxidoreductasas, como por ejemplo la fosforilación de la glucosa:
2.1. Cooperatividad:
Si existe más de un sitio de unión para los ligandos en la proteína, en este caso el enzima,
existe la posibilidad de interacción entre los sitios de unión durante el proceso de
ligamiento. Esta interacción se denomina cooperatividad, que afecta a las afinidades de
cualquiera de los restantes sitios de fijación no ocupados, y puede ser principalmente de
dos tipos:
1. Cooperatividad positiva:
Este tipo se da cuando la unión de una molécula de sustrato o ligante aumenta la afinidad de la
proteína por otras moléculas iguales o diferentes al sustrato o ligante.
2. Cooperatividad negativa
Es cuando la unión de una molécula de sustrato o ligante disminuye la afinidad de la proteína
por otras moléculas iguales o diferentes al sustrato o ligante.
Es, por ejemplo, el caso de la Hb. Hill propone una reacción que sigue el siguiente esquema,
para una proteína con n sitios de fijación:
P + nL PLn
Esto podemos extrapolarlo a la cinética enzimática de equilibrio rápido, de tal modo que un
enzima cooperativo seguiría los siguientes pasos:
Donde n sería el número de moléculas de sustrato. De aquí, podemos realizar deducciones para
averiguar la relación entre la concentración de sustrato y la velocidad máxima del enzima, es
decir, para averiguar la cooperatividad que puede presentar un enzima alostérico.
Esta curva
sigmoidea nos
recuerda a las
curvas de saturación
de la Hb (debido a
que esta tiene dos
formas T y R.)
La n que aquí aparece se interpreta como el índice de Hill, conocido como nH, h o napp. Ésta
representa el número de sitios de unión del sustrato o efector/modulador en el enzima.
La nH es siempre menor que n ya que por temas de equilibrio nunca van a estar TODAS las
enzimas con el máximo número de ligandos unidos, y no necesariamente un número entero.
Esto es debido a que no todos los sitios de unión de la proteína van a poder ser ocupados, y nH
es un valor experimental. La nH mide lo fuerte que es la cooperatividad, es decir, cuanto mayor
o más próximo a la n teórica sea nH, mayor será el efecto cooperativo. Esto puede dar varios
resultados:
a) nH = 1 No existe cooperatividad, por lo que la curva es hiperbólica. Curva
Michaeliana.
b) nH < 1 La cooperatividad es negativa, la unión del ligando reduce la afinidad.
c) nH > 1 Existe cooperatividad positiva, mayor cuando más grande sea n.
Como n>nH, si nos dan nH podremos decir que existen al menos una unidad mayor a nH lugares
de unión. Por ej: nH Hb=3.4 Podemos decir que la Hb tiene AL MENOS 4 lugares de unión.
nH=2 Podemos decir que esa enzima tiene al menos 3 lugares de unión.
Los enzimas cooperativos muestran una respuesta cinética diferente a las concentraciones de
sustrato con respecto a los enzimas con cinética Michaeliana. Esto se refleja al comprobar la
relación entre los valores de nH y los cambios de concentración necesarios para modificar la
velocidad del enzima:
2.2. Alosterismo:
Los enzimas alostéricos presentan conformaciones inducidas por la unión de moduladores, que
interconvierten estados más o menos activos del enzima. Un modulador alostérico puede ser
inhibidor o estimulador. No hay que confundir los moduladores inhibidores con los inhibidores
enzimáticos, ya que los últimos (los inhibidores) no provocan necesariamente cambios
conformacionales, y su modo de unión con el sustrato es distinto. Los moduladores se adhieren
al enzima alostérico en los sitios de unión por fuerzas no covalentes. Hay varias teorías sobre los
efectos que produce la unión de los moduladores al enzima:
Todas las subunidades sufrirían la transición de un estado a otro de manera simultánea, cambio
favorecido por la unión de un efector alostérico. El equilibrio también se rompería si se une
sustrato a los enzimas en forma R, desplazándolo hacia la transformación de T en R. Por otro
lado, la unión de efectores en la forma de baja afinidad T promovería la conversión en la forma
relajada R de alta afinidad.
Este modelo es más complejo que el concertado, puesto que considera formas intermedias en
la reacción de unión sustrato-enzima. Este modelo se empleó en 1925 para explicar la unión
entre hemoglobina y O2, y propone múltiples posibilidades tras cada unión, incluyendo cambios
de forma T a R o viceversa.
Generalmente estos grupos son añadidos y eliminados de los residuos aminoácidos por otros
enzimas. La modificación de un residuo es igual que introducir un nuevo aminoácido con
propiedades alteradas dentro del enzima. De este modo, introducir una carga puede alterar las
propiedades locales del enzima e inducir un cambio conformacional, y la introducción de un
grupo hidrofóbico puede promover la asociación con una membrana. Estos cambios suelen ser
críticos para la función del enzima.
3.1.1. Fosforilación
La fosforilación es probablemente la modificación reguladora más importante. Se calcula que un
tercio de todas las proteínas de la célula eucariótica están fosforiladas, y que prácticamente en
todos los procesos reguladores participan uno o varios pasos de fosforilación. Este tipo de
modificación covalente juega un papel central en un gran número de rutas reguladoras.
Ejemplo:
La glucógeno fosforilasa a debe ser fosforilada desde su estado menos activo, glucógeno
fosforilasa b, para poder fosforilar la molécula de glucógeno y extraer una molécula de glucosa
1-fosfato de éste.
Esta fosforilación corre a cargo de la fosforilasa b kinasa, que debe ser activada por la
proteínkinasa A (PKA) dependiente de cAMP. El enzima glucógeno fosforilasa b pasa a ser activo
o inactivo si se le añade o se le quita un fosfato.
Consiste en el gasto de una molécula de ATP para conseguir la unión de una molécula de AMP al
enzima.
3.1.3. ADP-ribosilación.
El cambio consiste en la adición al enzima de una molécula de ADP.
3.1.4. Metilación.
Consiste en la adición de un grupo metilo obtenido desde la S-adenosil-metionina (quedando
convertida en S-adenosil-homocisteína), para modificar el enzima.
3.1.5. Acetilación y miristoilación.
Hay enzimas cuya actividad depende de que su zimógeno, o proteína precursora, sufra un
proceso de proteólisis limitada, desprendiéndose una fracción que se convertirá en el enzima
activo. Muchos enzimas proteolíticos (proteasas) del estómago y del páncreas se regulan de esta
manera (ya que si lo expulsásemos activado atacaría a la propia célula antes de salir). La
quimotripsina y tripsina se sintetizan inicialmente en forma de quimiotripsinógeno y
tripsinógeno,
respectivamente. La rotura
específica produce cambios de
conformación que exponen el
sitio activo del enzima. Dado
que este tipo de activación es
irreversible, se necesitan otros
mecanismos para inactivar
estos enzimas. Las proteasas
son inactivadas por proteínas
inhibidoras que se fijan muy
fuertemente al sitio activo del
enzima.
Iones activadores:
Unión débil a las enzimas, papel más estructural que catalítico.
Iones metálicos (metaloenzimas):
Uniones fuertes a las enzimas, intervienen en la catálisis. (Fe2+, Fe3+,Zn2+, Cu2+…)
Ejemplo de metaloenzimas: Anhidrasa carbónica, con un catión Zn2+, cataliza la reacción:
CO2+H2OHCO3-+H+
Las metaloenzimas que contienen hierro pueden sufrir oxidación y reducción reversible.
Fe3++e- +sustrato reducido Fe2+ + sustrato oxidado
BIOENERGÍA Y METABOLISMO.
La energía libre de Gibbs (G) es la cantidad de energía que puede realizar un trabajo en una
reacción a presión y temperatura constantes y define si una reacción será espontánea (ΔG<0) o
no (ΔG>0). Se mide en J (normalmente se dicen los julios por mol en J/mol)
ΔG=ΔH-TΔS
Entalpía es el contenido calórico de un sistema. Refleja el número y clase de enlaces químicos
en los reactivos y productos. Si libera calor, la reacción es exotérmica y el contenido calórico de
los productos es menor que el de los reactivos. Por ello, la variación de entalpía (ΔH) es
negativa. Aquellas reacciones que adquieren calor se denominan endotérmicas. Se mide en
J/mol o Cal/mol
Encontramos una gran cantidad de cambios metabólicos en la naturaleza, como los ciclos del
carbono y el nitrógeno.
Bacterias nitrificantes muy
importantes porque son las
únicas que pueden fijar N2
ΔG´0= -RTlnKeq (por ello depende de cada reacción -obviamente también depende de la
temperatura- ya que R es cte y Keq es típico de cada reacción)
Reacciones redox:
Las reacciones redox implican la pérdida de electrones por una especie química. El flujo de
electrones entre las especies reductora y oxidante genera trabajo. La fuerza electromotriz por el
transporte de electrones es responsable de la producción de energía, como en algunos
procesos como el gradiente de protones en contra de gradiente, para la formación posterior de
ATP. En los pares red-ox siempre hay una especie reductora y otra oxidante. En estos casos se
llaman pares redox conjugados, y entre ellos hay una transferencia electrónica. Esta
transferencia se hace siempre mediante un potencial de reducción estándar, desde más a
menos electronegativo. El potencial estándar se define a pH 0 y a concentración de especies 1
M. Adaptado a las condiciones estándar es E’0, que tiene también concentración de especies
1M pero a pH 7 fisiológico. Este potencial se mide en voltios.
Si en una solución hay dos pares redox conjugados, puede haber una reacción espontánea en
función de la afinidad de las sustancias por los electrones. El E’0 es la medida de esta afinidad.
Según esta relación, si el signo de la variación de potencial es positivo, significa que la energía
libre tiene signo negativo. Esto significa, por tanto, que la reacción redox y el paso de los
electrones de una semicelda a otra es un proceso exergónico, y por tanto espontáneo. Dado el
caso contrario, la energía libre tendría signo positivo, y por ello se trataría de un proceso
endergónico y no espontáneo, y que necesitaría de un suministro de energía para producirse.
Además de estos sistemas, existen otros que emplean la fem de forma indirecta para generar
trabajo. Un ejemplo de esto es el sistema ATPsintasa de las mitocondrias. En este caso, el flujo
de electrones pasa a través de enzimas en la membrana, produciendo un cambio de pH y una
diferencia de potencial intermembrana. Esto hace que se origine una fuerza protón-motriz
debido al potencial de membrana, y el trabajo de los protones pasando de un lado a otro de la
membrana lo aprovecha la ATP-sintasa, que lo convierte en energía mediante la formación de
ATP.
Los electrones van del elemento más electronegativo al menos.
Los electrones fluyen del del que tiene un Ered más pequeño al que tiene uno más alto.
Fosforilación:
La transferencia de grupos fosfato es muy importante en los seres vivos y una gran cantidad de
compuestos biológicos (como proteínas) están fosforilados. Se puede encontrar en forma de
H3PO4, H2PO4-, HPO42- o PO43- (conocido como Pi).
El ATP es una de las moléculas más importantes del organismo. Las células obtienen energía
libre de forma química a través del catabolismo de moléculas nutrientes, y utilizan esta energía
para producir ATP a partir de ADP y Pi, un proceso muy endergónico. A continuación, el ATP
cede parte de su energía química a procesos endergónicos. La energía libre liberada por la
hidrólisis del ATP es la fuente de energía de todas las reacciones del organismo, y esta hidrólisis
es un proceso que está muy favorecido en condiciones estándar. Por esto se llama moneda
energética universal al ATP, porque absorbe la energía de la combustión de grandes moléculas y
cede luego esta energía a todos los procesos del organismo.
La cesión de energía del ATP implica generalmente la participación covalente del ATP en la
reacción que ha de ser impulsada, con el resultado final de que el ATP se convierte en ADP y Pi
o, en algunas reacciones, en AMP y 2 Pi. Sin embargo, existen procesos que no implican la unión
covalente, y la simple hidrólisis es necesaria para la reacción. Cada molécula de ATP puede
tener uno o dos iones de magnesio unidos. La reacción de los enzimas que utilizan ATP utilizan
realmente Mg2+, y no el ATP, por lo tanto necesitan una concentración de 1mM de magnesio
para funcionar. El sustrato real de las reacciones en las que el ATP es dador de un grupo
fosforilo es el MgATP2-. Por esto que, aunque la ΔG’0 de la hidrólisis del ATP es igual a -30,5
kJ/mol, la ΔG real es distinta, y dependiente de la ΔG’0 del MgATP2-, además de las
concentraciones de ADP y Pi en el medio celular. La ΔG real se denomina potencial de
fosforilación, ΔGp. La ΔGp varía según la célula, el ambiente (pH, temperatura, concentraciones
de reactivos y productos)…
El producto ADP2- se ioniza inmediatamente tras la hidrolisis del ATP. Además hay un factor que
favorece la hidrólisis del ATP, y es el mayor grado de solvatación de los productos Pi y ADP con
relación al ATP, lo que contribuye a estabilizar más los productos en relación a los reactivos. En
resumen, el ADP es más estable que el ATP.
Los enlaces fosfato no tienen gran cantidad de energía realmente ya que hay otros
compuestos tienen enlaces mucho más energéticos.
• El ATP tiene gran número de cargas negativas, lo que lo hace muy inestable. Es por ello
que hay una gran diferencia de energía libre entre ATP y ADP, y no es porque el ATP
tenga mucha energía, ya que el nivel de energía es bajo comparado con otros sino que
es porque el ADP es más estable que el ATP. Esto es debido a que el ADP tiene también
gran tendencia a estabilizarse, ya que por ejemplo se desprotona muy fácilmente y se
estabiliza por unión con el agua y hay menos repulsión.
• Todo esto hace que no sea muy difícil sintetizar ATP, ya que no requiere gran cantidad
de energía hacerlo, y sin embargo proporciona una gran cantidad de energía libre al
hidrolizarse, lo que hace su uso preferente frente a otras moléculas fosfatadas cuyos
enlaces sí poseen realmente gran cantidad de energía y cuyas reacciones de hidrólisis sí
tienen una gran variación negativa de energía libre real.
• Como se observa en la imagen, la energía liberada por la hidrolisis del ATP se encuentra
más o menos en la mitad de la tabla. Se piensa que por esto se ha seleccionado el ATP,
entre otras razones, debido a que no cuesta tanto sintetizarlo mediante reacciones de
catabolismo y libera una cantidad de energía suficiente.
Para la obtención de energía se emplean las vías metabólicas. Una vía metabólica es una
secuencia de reacciones encadenadas que empieza y termina con un compuesto importante.
Este compuesto habitualmente inicia o finaliza la vía, o sale al exterior, o es el sustrato de una o
múltiples nuevas vías.
Las vías metabólicas se entrecruzan dando lugar a mapas metabólicos. Cada compuesto que
forma parte de una vía metabólica, producto de una reacción y sustrato de la siguiente, se llama
metabolito, y cada reacción es catalizada por una enzima distinta. Algunas vías son cíclicas,
otras lineales, y otras ramificadas.
Los metabolitos en los que convergen numerosas rutas metabólicas se denominan encrucijadas
metabólicas.
Dirección de las vías: Existen reacciones que pueden ser catalizadas por las mismas enzimas
pero en sentido contrario. Como una reacción muy exergónica tendrá una reacción en sentido
contrario muy endergónica, la dirección de la vía cambia mucho el panorama general. Las
reacciones irreversibles, aquellas que solo se pueden efectuar en un sentido por ser muy
exergónicas en condiciones bioquímicas estándar, son las que imponen una unidireccionalidad a
las vías.
Los monosacáridos presentan una serie de propiedades físicas carácterísticas, que son:
• Son sólidos cristalinos
• Son de color blanco.
• Tienen sabor dulce.
• Son compuestos solubles en agua.
• Presentan un mínimo de tres átomos de C.
• Si se introducen en una disolución sufren un proceso de ciclación.
• Presentan un carbono asimétrico (excepto la dihidroxicetona)
• El grupo hidroxilo (OH) unido al carbono asimétrico tiene carácter reductor, es decir,
puede reducir a otro compuesto mediante su oxidación.
18.1.2. Triosas:
Pueden ser aldotriosas (gliceraldehido) o cetotriosas (dihidroxiacetona).
En el caso del gliceraldehido el C2 se encuentra con sus cuatro valencias saturadas por 4
radicales/sustituyentes distintos, es decir, es un carbono asimétrico y por lo tanto comporta la
existencia de isomería . Todos los glúcidos menos la dihidroxiacetona presentan al menos un
carbono asimétrico.
Tanto triosas como todos los monosacáridos presentan varios tipos de isomería:
• Isomería óptica: Los glúcidos con carbono asimétrico son capaces de hacer elrar el plano
en el que vibra la luz polarizada cuando están en disolución, desviándola:
o Hacia la derecha Dextrógiros (+)
o Hacia la izquiera Levógiros (-)
• Isomería estructural o esteroisomería: Se diferencian en la posición de sus grupos
hidroxilo (OH) por la presencia de carbonos asimétricos. Pueden ser de dos tipos:
o Cuando dos monosacáridos o compuestos son imágenes especulares son
enantiómeros.
o Cuando dos monosacáridos u otros compuestos NO son imágenes especulares
por la conformación de un solo carbono son epímeros
o Cuando no son imágenes especulares por más de un carbono asimétrico son
diasteroisómeros.
La posición del grupo OH del carbono asimétrico más alejado del grupo carbonilo nos permite
diferenciar en:
➢ Esteroisómeros D: Con el grupo OH en la derecha en la proyección de Fisher o
abajo en la de Haword.
➢ Esteroisomeros L: Con el grupo OH en la derecha en la proyección de Fisher o
abajo en la de Haword.
18.1.2. Tetrosas:
Aldotetrosas: Cetotetrosas:
17.1.3. Pentosas:
Aldopentosas:
Cetosas:
18.1.4. Hexosas:
Aldohexosas:
Cetohexosas:
Identificar los
recuadrados
• La forma cíclica de las aldosas deriva del grupo pirano. Es por ello por lo que las aldosas
cicladas llevan el sufijo -piranosa, como la α-D-glucopiranosa.
• La forma cíclica de las cetosas deriva del grupo furano. Es por ello por lo que las
cetosasas cicladas llevan el sufijo -furanosa, como la α-D-fructofuranosa.
18.2.1. Anómeros:
En la naturaleza todos los monosacáridos ciclados tienen esteroisomería D. Como ya se ha
dicho antes, los monosacáridos ciclados pueden tener una forma α, o β en función de la
posición (abajo la α o arriba la β) del grupo hidroxilo de su carbono 1. Este carbono es
asimétrico y se denomina carbono anomérico. Estas dos formas se denominan anómeras.
El grupo hidroxilo sigue teniendo poder reductor.
Representación de Haworth:
Aminoazúcares.Son glúcidos en los que un grupo hidroxilo es sustituído por un grupo amino. Un
ejemplo es la glucosamina o la galactosamina.
Azúcares ácidos. Son monosacáridos que han sufrido un proceso de oxidación en su grupo
carbonilo. Un ejemplo es el ácido glucurónico (gluconato).
18.4. Disacáridos:
Se producen por la unión de dos monosacáridos por un enlace O-glucosídico entre el OH
hemiacetálico del primer monosacárido y un grupo OH del segundo monosacárido (puede ser
hemiacetálico o no). En este enlace se libera una molécula de H2O. En función del segundo OH
puede ser:
Principales disacáridos:
Lactosa: La lactosa es el azúcar de la leche. Está formada por la unión entre la β-D-
galactopiranosa y la β-D-glucopiranosa. Posee carácter reductor y no forma polímeros. La
lactosa posee poder reductor, debido a que el carbono anomérico de la α-D-glucopiranosa
queda libre. El enzima que la rompe es la lactasa.
β -D-galactopiranosa + β -D-glucopiranosa β -D-galactopiranosil (14) β -D-glucopiranosa
Sacarosa. La sacarosa es el azúcar de caña y remolacha. Está formada por la unión entre la α-D-
glucopiranosa y la β-D-fructofuranosa. Su unión es dicarbonílica, por lo que la sacarosa no posee
poder reductor. El enzima que la rompe es la sacarasa.
β-D-fructofuranosa + α -D-glucopiranosa β-D-fructofuranosil (1↔2) α -D-glucopiranósido
18.5. Oligosacáridos:
Son el resultado de la unión de pocos monosacáridos, como los que se añaden en la
glucosilación de proteínas o los que se añaden a las glucoproteínas y glucolipidos que forman el
glicocalix.
18.6. Polisacáridos.
Se trata de polímeros formados por la unión (polimerización) de monosacáridos o sus
derivados. Podemos clasificar los polisacáridos por su constitución: homopolisacaridos
(formados por la repetición de un mismo monosacárido) o heteropolisacáridos (formados por
la repetición periódica de determinados monosacáridos). Sin embargo, una clasificación muy
importante es la clasificación por función:
• Función de reserva:
o Almidón: Se trata de un homopolisacárido formado por subunidades de
maltosa que se puede dividir en dos tipos de polímeros.
Amilosa: Está formada por cadenas largas y NO ramificadas de
unidades de α-D-glucosa unidas mediante enlaces O-glucosídicos
α(14). Debido al ángulo que adoptan estos enlaces α se forma una
estructura helicoidal
• Función estructural:
o Quitina: Es un homopolímero de N-acetil-D-glucosamina unido con enlaces
β(14). Es lineal. La única diferencia que tiene respecto a la celulosa es el
cambio del grupo hidroxilo en el C-2 por un grupo amino acetilado. La quitina
no es digerible por los vertebrados. Es el principal componente de los
exoesqueletos de los artrópodos.
o Celulosa.Es un homopolisacárido formado por glucosas unidas mediante
enlaces β(14) Los rumiantes son capaces de romperla gracias a la presencia
del enzima celulasa en las bacterias del rumen. Las moléculas de celulosa se
organizan en haces de cadenas paralelas que forman fibrillas. Estas cadenas se
unen unas con otras mediante enlaces por puentes de hidrógeno
intercatenarios que crean un gran empaquetamiento. También existen puentes
de hidrógeno intracatenarios.,
o Peptidoglucanos o mureína de la pared bacteriana.Se trata de
heteropolisacáridos formados por N-acetil glucosamina y ácido N-acetil
murámico unidas por enlaces β(14). Son polisacáridos ácidos que forman el
componente rígido de las paredes bacterianas, rodeando así a la bactería
entera. Es un compuesto
Glucosaminoglucanos:
• Heparina: Está formada por N-acetil glucosamina con restos de fosfato. Es una
sustancia anticoagulante.
Los grupos sanguíneos están determinados por la presencia de N-acetil galactosamina (grupo
A), galactosamina (grupo B), ambas (grupo AB) o ninguna (grupo 0). Paracada tipo de
compuesto hay enzimas específicos que catalizan el enlace, por lo que se genera antigeneidad.
El grupo 0 es el donante universal debido a que no presenta compuesto alguno, tiene la
estructura común a todos. Frecuenteente se añade un OLIGOSACÁRIDO aunque también puede
añadirse un polisacárido
19. Glicolisis:
La glucólisis es la degradación de una molécula de glucosa en una serie de reacciones
catalizadas enzimáticamente, dando lugar a dos moléculas de tres átomos de carbono. Se forma
piruvato. Este piruvato formará normalmente lactato.
El objetivo principal de esta vía metabólica es obtener energía libre de la degradación de los
enlaces entre los átomos que componen la molécula de glucosa para formar ATP. Es la via más
antigua, conservada por la gran mayoría de organismos, aerobios (usándola como preparación
al metabolismo aerobio) y anaerobios.
La glucólisis es también una vía de emergencia que suministra ATP rápidamente cuando no se
dispone de oxígeno (en el ejercicio rápido, por ejemplo).
Consiste en un conjunto de 11 reacciones. Son las que tienen que ser y todas tienen una lógica.
Podemos dividir la glicolisis en dos estapas: hasta la ruptura de la fructosa 1,7-bifosfato y la
segunda hasta la formación de piruvato. También hay procesos redox.
Estas reacciones son posibles porque el enzima tiene dos centros activos (dominios de unión);
uno para la glucosa y otra para el ATP4- unido a Mg2+ (MgATP2-). Todas las hexokinasas se
comportan así (adición de grupos fosfato -quinasa=enzima que fosforila-
(IMP).
La importancia de esta reacción viene determinada porque:
1. A partir de la acción de la hexokinasa todos los metabolitos están fosforilados,
excepto el piruvato, impidiendo así atravesar la membrana celular. Las moléculas
fosforiladas no pueden atravesar la membrana y por lo tanto no abandonaran la celula
hasta transformarse en piruvato, por lo menos
2. La reacción puede estar catalizada por dos isoenzimas o isoformas de la hexokinasa:
glucokinasa y hexokinasa.
Si esta reacción no existiera, habría dos baterías diferentes de enzimas. Es por ello que, de esta
manera, se ha seleccionado el gliceraldehído 3-fosfato para así utilizar una única batería de
enzimas para toda la vía glicolítica a partir de este punto. Es decir, la lógica de esta reacción es
que así conseguimos que tras romper la fructosa 1,6 bifosfato tengamos dos moléculas iguales
(gliceraldehido 3-P) y por lo tanto solo necesitaremos una batería de enzimas y no dos como
hubiera pasado si no cambiásemos la dihidroxiacetona por gliceraldehido)
La función de esta reacción es la conversión de la dihidroxiacetona fosfato en gliceraldehído 3-
fosfato, que es el sustrato de la siguiente reacción glicolítica.
Aunque en condiciones estándar es débilmente endergónica, la concentración de gliceraldehído
3-fosfato es baja intracelularmente, y por ello la reacción se desplaza a la derecha.
Hasta aquí, la glicolisis ha gastado dos moléculas de ATP y hemos conseguido, a partir de una
hexosa, dos triosas. Catalizado por la triosa fosfato isomerasa.
En esta reacción el grupo aldehído del G3P es oxidado, pero no a un grupo carboxilo libre sino a
acil fosfato (COO-PO4). Catalizada por la gliceraldehido 3-fosfato deshidrogenasa.
El aceptor de hidrógeno en la reacción de la gliceraldehído 3-fosfato deshidrogenasa es el
NAD+, que se reduce a NADH+H+ y actúa como el transportador de electrones hasta que los
cede al piruvato.
Es una reacción cuya ΔG’0= 6,3 kJ/mol y, por tanto, totalmente reversible.
7. Transferencia de fosfato desde el 1,3-BPG a ADP (fosforilación a nivel de
sustrato).
Este enzima actúa en dos pasos, tiene que fosforilar al carbono 2 del 3-PGA formando 2,3-
bifosfoglicerato, y a continuación el grupo fosforilo del 2,3-BPG se transfiere al enzima,
dejándolo como inicialmente.
Esta es una reacción ligeramente endergónica, por tanto reversible, aunque en el medio
intracelular (no estándar) el equilibrio está ligeramente desplazado a la derecha, porque la
concentración de 2-PGA es muy baja en comparación a la de 3-PGA. Catalizada por la
fosfoglicerato mutasa.
Balance de la glicolisis:
Es un proceso exergónico e irreversible, debido a que hay tres reacciones (1, 3 y 10) que son
irreversibles por sí mismas.
En cuanto al rendimiento energético, de toda la energía libre que se puede generar de glucosa a
dos moléculas de lactato (ΔG’0= -196kJ/mol), sólo se aprovecha el 31% (61kJ/mol) para
sintetizar dos moléculas de ATP, los restantes -135kJ/mol se disipan en forma de calor y no se
puede volver a utilizar.
Primera
irreversible
Segunda
irreversible
Tercera
Primera irreversible y
fosforilación a Segunda
nivel de fosforilación a
sustrato. nivel de
Produce 1 ATP sustrato.
por cada vía Produce 1
ATP por cada
vía
20. Gluconeogénesis:
1. Inicialmente, el piruvato es
transportado desde el citosol hasta
la mitocondria (o se genera
directamente dentro de la
mitocondria).
2. La piruvato carboxilasa es un enzima no presente en la glucólisis (por eso esta
etapa no es la inversa de la glucólisis) que se crea solo en la mitocondria (es por
eso por lo que hemos transportado el piruvato dentro de esta). Debido a que la
reacción de conversión del piruvato a fosfoenolpiruvato es una reacción muy
endergónica, requiere de este enzima para realizarse. La piruvato carboxilasa
transforma el piruvato en oxalacetato. Como el oxolacetato tiene 4C, es
Además del piruvato y el lactato (que pasa a ser piruvato, produciendo NADH+H+, reacción
catalizada por la enzima Lactato deshidrogenasa), existen más precursores:
• Aminoacídicos: El más importante es la alanina, que se transforma en piruvato en una
reacción denominada transaminación, en la que participa el α-cetoglutamato.
Catalizada por la alanina transaminasa.
• Otro precursor importante es el glicerol.
• Otro precursor importante es el propinil-CoA, que se genera a partir de la degradación
de aminoácidos o a partir de la oxidación de ácidos grasos con un número de átomos de
C impar. Para formar oxalacetato (mediante el ciclo del ácido cítrico) se necesita su
conversión previa en Succinil CoA. Esto es una excepción ya que no puede formarse
glucosa de ácidos grasos.
4 carbonos
En la gluconeogénesis se emplean rodeos para sortear estas reacciones irreversibles. Cada una
de las reacciones de rodeo también tiene una ΔG’ grande y negativa.
Las reacciones opuestas no pueden ser catalizadas al mismo tiempo, ya que sería un gasto de
energía sin ningún propósito metabólico.
21.1. Hexokinasa:
Las isozimas de hexokinasa de baja Km (isozimas 1 a 3) se inhiben alostéricamente por la
glucosa-6-fosfato, es decir, por su propio producto. Por ello, se autoinhibe cuando la
concentración de G6P es alta. Sin embargo, la glucokinasa (isozima 4 de hexokinasa) NO se
inhibe por la glucosa-6-fosfato. La glucokinasa se tendrá que regular de otras maneras (algunas
proteínas reguladoras, transcripción…)
Por ello, vemos que en este paso la inhibición no es muy eficaz y la inhibición por la
fosfofructokinasa será mucho más importante.
La regulación más importante es mediante los niveles de F-2,6-BP (la fructosa 2,6 bifosfato no
debe confundirse con la F-1,6-BP. La F-1,6-BP es la que participa en la glicolisis y la
gluconeogénesis mientras que la F-2,6-BP es un regulador), que es un gran activador de la PFK y
un gran inhibidor de la F1-6BPasa (que transforma la F-1,6-BP en F6P, con lo cual si hay un nivel
elevado se activa la glucólisis (catalizada por la PFK-1) y se inhibe la gluconeogénesis (catalizada
por la FBPasa-1), y viceversa.
La F2-6BP actúa como efector alostérico para la FPK, aumentando la afinidad de este enzima
por su sustrato, y disminuyendo la afinidad por los inhibidores alostéricos ATP y citrato. En
condiciones fisiológicas de activadores y e inhibidores normales de la PFK, ésta es inactiva si se
da la ausencia de F2,6BP.
La concentración de F2,6BP se controla en última instancia por el cAMP (AMPc o AMP cíclico),
por acción de la proteinkinasa A (PKA) dependiente de cAMP.
La glucosa-6-fosfato puede:
• Músculos: La glucosa-6-fosfato se incorporta a la vía glicolítica.
• Hígado: Se busca liberar glucosa a la sangre. Para ello es necesario de la
enzima glucosa-6-fosfatasa, solo presente en células hepáticas y renales
y que defosforilan la G6P a glucosa, que puede atravesar la membrana y
salir de la célula.
22.2.1. Glucogenina:
La concentración de cAMP está regulada así mismo a nivel hormonal, recibiendo el estímulo de
las hormonas glucagón, en el hígado, y adrenalina, en el tejido muscular. El glucagón se une a su
receptor específico en la parte externa de la membrana plasmática. Este receptor puede ser de
dos tipos:
• β-adrenérgicos
• α-adrenérgicos
El glucagón se une al receptor β-adrenérgico y cambia la conformación de éste. Dicho receptor
está unido a la proteína G, que tiene tres subunidades: α, β y γ, de la cuales es la α la que va
asociada a una molécula de GTP. El cambio conformacional del receptor hace que se
suelte la subunidad α unida a la molécula de GTP. Este GTP unido a la subunidad α se
dirige a un enzima llamada adenilatociclasa, que es una proteína integral cuyo centro
activo está dirigido hacia el citoplasma, y que cataliza la reacción:
ATPcAMP+PPi
Por ello, la liberación de GTP al unirse el glucagón da como resultado un aumento en los niveles
de GTP, que gracias a la adenilatociclasa, lo transforma en AMPc, que activa la PKA y por lo tanto
la degradación de glucógeno.
Enzimas activadas
ESQUEMA
IMPORTANTE:
Enzimas inactivas
Se puede observar
como la cascada
multiplica la reacción
enzimática.
Empezando por 20
moleculas y acabando
con 10000
-Fosfoproteína fosfatasa 1 (PP1): Como vemos un solo enzima, la PP1, es capaz de desfosforilar
tres enzimas diferentes: la glucógeno fosforilasa, la fosforilasa quinasa y glucógeno sintasa.
Inhibidor de la PP1,
activado al ser
fosforilado por
parte de la PKA.
Como truco nemotécnico, la PP1 lo que “quiere” es que haya mucho glucógeno, favoreciendo la síntesis de glucogeno
manteniendo desfosforilada la glucógeno sintasa e inhibiendo la degradación de glucógeno desfosforilando a la
glucógeno fosforilasa (y por lo tanto inactivándola). Tiene su propio inhibidor (inhibidor de la PP1), que es activado por
fosforilación por parte de su “enemigo” la PKA.
La PKA lo que “quiere” es que haya mucha glucosa, favoreciendo la degradación de glucógeno fosforilando a la
fosforilasa b quinasa, la cual fosforilará y activará a la glucógeno fosforilasa (que degrada el glucógeno). Además, la
PKA inhibe la síntesis al activar al inhibidor de la PP1 y al fosforilar en posición 2 a la Gm.
Por sacarasa,
lactasa y maltasa
Inciso:
Metabolismo
disacáridos
La vía de los pentosa-fosfato es una vía cuyo funcionamiento depende de la capacidad para la
síntesis de lípidos (debido a que el NADPH interviene en dicha síntesis), por lo que su
funcionalidad dependerá del tipo de tejido donde se dé, apareciendo más en tejidos que
sinteticen lípidos.
23.4. Sistemas lanzadera (no tiene que ver con la vía de las pentosas-P):
Conjunto de reacciones que nos permiten el transporte citoplasma-mitocondria y formar
equivalentes a uno u otro lado.Todas tienen un paso irreversible (o reacción irreversible o
transporte irreversible). Se distinguen dos tipos de sistemas lanzadera: la lanzadera del
glicerolfosfatoy la lanzadera del malato-aspartato:
23.5.1. Lanzadera del glicerolfosfato:
2.
1.Irreversible
3. Irreversible. 4. Irreversible
1 NADH + H+.
1 NADH + H+. 5. GTP
Entra CoA.
Sale CoA
6. 1 FADH2
7. Entra 8. 1 NADH +
H2O H+.
1NADH + H+.
24.4.1.Reacciones:
1. En la primera reacción se forma citrato a partir de una molécula de oxalacetato, una molécula
de H2O y otra de AcetilCoA, desprendiéndose una molécula de CoA.
➢ Esta reacción está catalizada por el enzima citrato sintasa.
➢ El cambio neto de energía libre es muy negativo (-33,2KJ/mol), por lo que la
reacción es muy exergónica e irreversible, ya que se produce para que la
molécula de AcetilCoA entre en la vía.
2. En la segunda reacción se forma isocitrato a partir del citrato. Consta de dos partes:
▪ Primeramente se forma un compuesto intermedio llamado cis-aconitato
desprendiéndose H2O. La molécula de cis-aconitato es un intermedio de
reacción y es aislable.
▪ La segunda reacción consiste en que el cis-aconitato se transforma después en
isocitrato consumiéndose además una molécula de H2O.
De esta reacción sabemos que:
AcetilCoA + 3NAD+ + GDP + Pi + FAD + 2H2O---->2CO2 + CoA + 3NADH + 2H+ + GTP + FADH2
Para 1 glucosa:
2AcetilCoA + 6NAD+ + 2GDP + 2Pi + 2FAD + 4H2O---->4CO2 + 2CoA + 6NADH + 4H+ + 2GTP +
2FADH2
Balance energético:
En la fosforilación oxidativa:
• Por cada molécula de NADH (dentro de la mitocondria) se obtienen 3 moléculas de ATP.
• Por cada molécula de FADH2 (dentro de la mitocondria) se obtienen 2 moléculas de
ATP.
• Por cada molécula de GTP se obtiene 1 molécula de ATP.
➢ Con el ingreso de una molécula de AcetilCoA en el ciclo del ácido cítrico se producen 3
moléculas de NADH, una de FADH2 y una de GTP. Por lo tanto, por cada molécula de
2x AcetilCoA que ingresa en el ciclo del ácido cítrico se obtienen 12 moléculas de ATP.
En resumen, la regulación es sensible al nivel energético de la célula, y que cuando esté bajo se
activará el ciclo.
Es una vía anfibólica, es decir, sirve tanto para procesos anabólicos como para procesos
catabólicos.
Es un ciclo polivalente, es decir, no sólo sirve para formar ATP o CO2, sino que tiene la
capacidad de sintetizar algunos precursores necesarios para otras vías biosintéticas, como:
El oxalacetato, que, junto con una molécula de GTP, forma fosfoenolpiruvato, GDP y CO2 en una
reacción catalizada por el enzima fosfoenolpiruvato carboxikinasa como parte de la
GLUCONEOGÉNESIS.
El citrato, que forma oxalacetato en una reacción catalizada por el enzima ATP-citratoliasa. En la
reacción también participan una molécula de ATP y otra de CoA, que se transforman en ADP + Pi
y AcetilCoA. Esto ocurre en el citoplasma celular y como el acetil-CoA y oxalacetato no pueden
regresar a la mitocondria (a no ser que sea por lanzaderas) se usan para sintetizar acidos grasos.
Que el ciclo del ácido cítrico permita sintetizar intermediarios de otras reacciones metabólicas
hace que exista el peligro de que el ciclo se desangre, es decir, que se pierdan sus
intermediarios y deje de producirse. Esto se evita con reacciones de relleno que son capaces de
reponer los intermedios.
Las reacciones anapleróticas son aquellas cuyo objetivo es reponer los intermediarios del ciclo
del ácido cítrico. Existen varias clases de reacciones, pero la más común es la catalizada por la
piruvato carboxilasa, que transforma una molécula de piruvato y otra de CO2 en una molécula
de oxalacetato mediante el gasto de una molécula de ATP.
Ubiquinona (coenzima Q): benzoquinona con una cadena larga lateral isoprenoide. La
ubiquinona puede aceptar un electrón, transformándose en el radical semiquinona (·QH), o dos
electrones, formando ubiquinol (QH2).
Esta molécula puede actuar como puente entre un dador y un aceptor de electrones gracias a
sus propiedades, ya que es pequeña e hidrofóbica al mismo tiempo, lo que le permite difundir
libremente por la membrana y ponerse en contacto con una molécula aceptora de electrones
de menor movilidad. Puede transportar tanto protones como electrones.
Citocromos: Son proteínas de intensa absorción de luz visible característica, ya que contienen
un grupo prostético hemo. Las mitocondrias contienen tres clases de citocromos que se
distinguen por diferencias en su espectro de absorción luminosa, y que se denominan a, b y c.
En su estado reducido, cada uno de ellos tiene una banda de absorción en el espectro visible.
Para distinguir citocromos de un tipo estrechamente relacionados, se distinguen añadiendo a su
nombre la longitud de onda exacta a la cual tienen su máxima absorción (por ejemplo
citocromo b562).
Los citocromos a y b tienen sus grupos hemo unidos de forma no covalente a sus proteínas
asociadas. Los del citocromo c, sin embargo,, están unidos de forma covalente a través de
residuos Cys. Es por esto que, en el caso del citocromo c, el potencial de reducción del grupo
hemo depende de la proteína, y es distinto del del grupo hemo libre.
Proteínas ferro-sulfuradas de Rieske: Son una variante de los citocromos, en las que un átomo de
hierro está coordinado con dos residuos Cys (con azufre) en lugar de con dos residuos His (como es el
caso normal en el que, por ej, en la Hb, el grupo Hemo se coordina con la His proximal y la distal).
El complejo I es, por tanto, una bomba de protones impulsada por la energía de transferencia
electrónica. Al ser un proceso vectorial, donde los protones se mueven de una localización a
otra, se suele a indicar en la reacción global: p para la cara positiva (p=positivo) y n para la cara
negariva (n=negativo).
NADH + 5H+N + Q NAD+ + QH2 + 4H+p
Glicerol 3-fosfato deshidrogenasa: flavoproteína que obtiene electrones del glicerol 3-fosfato,
pasándolos al coenzima Q.
Posteriormente, y como paso final por el complejo III, los electrones son transferidos al
citocromo c, que es una proteína soluble del espacio intermembrana. Cada uno de estos puede
aceptar un electrón, y cuando lo han transferido a su grupo hemo, se movilizan para unirse al
complejo IV y transferir los electrones.
(lado N), convirtiendo el O2 en 2H2O. Es decir, no solo consume protones del lado N sino que
además bombea al lado P.
La energía liberada por esta reacción redox se emplea para bombear un protón hacia el espacio
intermembrana (lado P) por cada electrón que pasa, añadiéndose al potencial electroquímico
por el transporte del protón impulsado por el potencial redox a través de los complejos I y III. La
reacción global del complejo IV es:
La reacción real, con los electrones de una sola molécula de NADH+H+, sería en realidad:
Se puede observar como los electrones fluyen desde los compuestos con menos potencial de
reducción a los que más tienen.
La oxidación del FADH2 (que provenía del succinato) permite bombear 6 protones al
espacio intermembrana.
25.2.3. Respirosomas:
La observación de estos respirosomas hace creer que la transferencia electrónica pueda darse
entre moléculas en estado sólido, y no por complejos de funcionamiento independiente. La
cinética enzimática apoya esta teoría, según la cual los electrones pasarían de forma directa de
molécula a molécula, sin ser transportados por la ubiquinona ni por el citocromo c.
26.2. ATP-sintasa:
F1: Proteína periférica de la membrana. Formada por numerosas subunidades (α, β, γ, δ, ε).
Cada unidad β posee un sitio catalítico para la síntesis de ATP. Las unidades α y β forman la
parte que sobresale hacia la matriz mitocondrial y se encuentran en torno al eje γ.
F0: Proteína integral que tiene el canal por el que pasan los protones desde el espacio
intermembrana a la matriz. Los protones pasan por la subunidad a del F0 (no confundir
subunidad “α” de F1 con “a” de F0). Las subunidades c forman el cilindro/anillo que rota en
sentido antihorario (visto desde arriba) y que hacen rotar también la subunidad F1. La
subunidad b une la parte F0 a la δ de la F1.
27.1. Triacilglicéridos:
Los triacilglicéridos son compuestos formados por glicerol y tres ácidos grasos unidos a los tres
carbonos de este por un enlace éster que se forma en un proceso de esterificación. Los TAG son
compuestos apolares, hidrofóbicos y prácticamente insolubles en agua.
Funciones:
La principal función de los TAGs es de reserva energética en los animales.
En cuanto que son combustibles almacenados, los TAGs tienen dos ventajas sobre los hidratos
de carbono polisacáridos como el glucógeno o el almidón:
• La elevada reducción de los átomos de carbono de los ácidos grasos hace que haya más
e- disponibles para llevarlos a la cadena de transporte de electrones que los que hay
cuando los polisacáridos están reducidos. Esto supone que se obtenga más del doble de
energía de un TAGs que de un polisacárido cuando los hidratos de carbono están
oxidados.
• Otra razón por la cual los TAG desempeñan esta función es porque son compuestos
altamente apolares, por lo que se almacenan en un volumen más pequeño que los
compuestos polares (al no almacenarse en agua). Es decir, SE ALMACENAN DE FORMA
ANHIDRA. Para almacenar glucosa en forma de glucógeno se necesita agua para
neutralizar sus grupos polares. De esta manera, almacenar 1g de glucosa implica añadir
2g de agua. Por ello, almacenar hidratos de carbono implica ocupar el triple de volumen
que almacenar TAGs.
Es la principal
forma de
almacenamiento
de energía.
¿Cómo se metabolizan?
Estructura:
Están formados por una molécula de glicerol que ha sido esterificada por tres ácidos grasos que
pueden ser iguales o diferentes. Los TAGs (triacilglicéridos) formados por el mismo tipo de ácido
graso se denominan TAG simples. Se nombran según el ácido graso que portan (por ejemplo,
tripalmitina = tres ácidos palmíticos). Los TAG mixtos están formados por dos o más ácidos
grasos distintos. Para nombrarlos se ha de especificar el nombre y la posición de cada ácido
graso. Ej: 1-estearoil, 2-linoleoil, 3- palmitoil glicerol.
Los TAG son compuestos apolares, hidrofóbicos y prácticamente insolubles en agua debido a
que los grupos hidroxilo del glicerol y los grupos carboxilos de los ácidos grasos (ambos
polares) se encuentran unidos e inactivados por enlaces éster.
• Los dobles enlaces suelen estar en posición CIS. Los TRANS son normalmente resultado
del procesamiento de los alimentos y no pueden ser metabolizados por el organismo.
Nomenclatura y formulación:
Clasificación:
• Glicerolípidos:
o Glicerofosfolípidos (FOSFOLÍPIDOS más habituales): Los glicerolfosfolípidos o
fosfoglicéridos son lípidos formados por dos ácidos grasos unidos por enlaces
éster a los dos primeros carbonos de una molécula de glicerol. Al tercer
carbono de este se le une un fosfato unido a este por un enlace éster. Este
compuesto formado por ácidos grasos+glicerol+fosfato es el ácido fosfatídico y
por ello todos estos lípidos se dice que son derivadossuyos y se nombrarán
como fosfatidil+ “nombre del polialcohol o compuesto nitrogenado que se
unirá al fosfato”.
Los glicerolfosfolípidos varían según el alcohol polar o compuesto aminado que
forme su “cabeza” polar. Este sustituyente puede estar cargado negativamente,
ser neutro o estar cargado positivamente. Las cargas contribuyen a las
propiedades superficiales de las membranas biológicas. Los glicerolfosfolípidos
también varían de unos a otros en función del tipo de ácido graso que
presenten.
Los glicerolfosfolípidos más importantes son:
27.3. Ceras.
Las ceras son compuestos formados por un ácido graso de cadena larga saturado o insaturado
unido por un enlace éster con un alcohol unido a una larga cadena alifática. Sus puntos de fusión
son más altos que los de los TAGs. Son moléculas muy hidrofóbicas y consistentes.
Las ceras realizan funciones de protección debido a su carácter consistente, apolar,
impermeable e insoluble. Por ejemplo, ciertas glándulas de la piel en vertebrados secretan ceras
para proteger el pelo y la piel, manteniéndolos flexibles, lubricados e impermeables. En la
industria farmacéutica y cosmética se usan ceras para la fabricación de lociones, ungüentos y
pulimentos.
27.3.3. Ubiquinona.
Es la coenzima Q. Transporta electrones, por ejemplo, en la cadena respiratoria. Al recibir dos
electrones se transforman en ubiquinol.
27.4. Eicosanoides.
Son derivados del ácido araquidónico, un ácido graso 20:4 (5, 8, 11, 14).
27.4.1. Sintesis.
Prostaglandinas: La familia incluye varios miembros como PGD2, PGE2, PGF2, ...etc., que
actúan a través de diversos receptores. Producidas por ciclooxigenasa.
Acciones metabólicas:
• Vasodilatación
• Inhibición de la agregación plaquetaria
• Inhibición secreción ácida estomacal
• Estimulación de las terminales nerviosas del dolor
• Control de la temperatura corporal
• Inflamación
• Provocan la contracción de la musculatura lisa. Esto es especialmente importante en
la del útero de la mujer.
• En el cáncer favorecen la angiogénesis y la progresión tumoral.
Tromboxanos: Se producen en las plaquetas. La familia incluye
varios miembros como A2, B, etc., que actúan a través de
diversos receptores. Producidos por ciclooxigenasa.
Acciones metabólicas:
• Vasoconstricción.
• Estimulación de la agregación plaquetaria.
Leucotrienos: Se aislaron por primera vez de los leucocitos. La familia incluye varios miembros
como LTC4, LTD4, LTE4 , etc., que actúan a través de diversos receptores. Producidos por
lipooxigenasa.
Acciones metabólicas:
Fuentes:
• Grasas ingeridas en la dieta (exógena).
• Grasas almacenadas en inclusiones lipídicas. Principalmente en el tejido adiposo.
• Grasas sintetizadas y exportadas. Principalmente en el hígado.
Circulación:
• Exógena: Lípidos dieta Aparato digestivo Órganos y tejidos
• Endógena: Hígado ↔ Órganos y tejidos Tejido adiposo
29.2. Digestión.
Dos etapas:
a) 30% Boca y estómago con la lipasa lingual y gástrica.
b) 70% Duodeno con las lipasas pancreáticas.
____________________________________________________________
B) 70% DUODENO.
2. Deconstrucción de los lípidos- Los distintos lípidos son hidrolizados para poder ser
absorbidos posteriormente.
1. TAGs 2-monoacilglicerol + 2 AG (catalizado por la lipasa pancreática)
Primeramente, los productos deben entrar a unas células llamadas enterocitos. Los
ácidos grasos, el glicerol y el 2-monoacilglicerol difunden libremente a través de la
membrana o son transportados por transporte pasivo. Este transporte pasivo se realiza
a través de los transportadores FABP (fatty acid binding protein). El colesterol entra en
la célula por un transportador específico. A continuación, los productos deben
desplazarse dentro de cada célula hasta el retículo endoplásmico (y el Golgi) para
regenerarse.
29.3.1. Lipoproteínas.
Diferentes combinaciones de lípidos y proteínas dan lugar a partículas de lipoproteínas distintas
con densidades diferentes:
La lipolisis y la lipogénesis nunca se dan a la vez y están reguladas por las enzimas glucagón e
insulina. Cuando se activa una se desactiva la otra y viceversa (como glucolisis y
gluconeogénesis o glucogénesis y glucogenolisis).
• El glucagón activa a la adenilatociclasa, que produce cAMP y activa la PKA. Esta fosforila
a la lipasa, activándola y a la proteína
fosfatasa 2A (PP2A), inactivándola. Se
inhibe entonces la lipogénesis y se
activa la lipolisis.
Una vez dentro de la célula, los AG tienen que ir al compartimento donde se encuentran los
enzimas que realizan la oxidación: la mitocondria (para oxidarse, ciclo de Krebs, cadena de
transporte de e-…).
30.5. Activación de los ácidos grasos.
La acil-CoA sintetasa cataliza la activación de los AG, pasando a ser acil graso-CoA. La reacción
de este enzima une el AG libre a una molécula de coenzima A formando un acil graso-CoA. Se
consume una molécula de ATP que pasa a AMP+PPi.
Hay distintos tipos de isozimas:
AG con más de 14C En la mitocondria.
AG con menos de 14C proteína integral membrana plasmática.
Lanzadera de carnitina:
30.6. β-oxidación.
La mayor parte de los AG que van a la mitocondria son largos. Un complejo multienzimático
provoca un mayor rendimiento en la oxidación (menor dispersión de productos y menor tiempo
de transferencia de un enizma a otro).
IMP ENZIMAS DE LA
BETA-OXIDACIÓN
Acil graso-CoA (n C) + CoA + FAD + NAD+ Acil graso-CoA (n-2 C) +Acetil-CoA + FADH2 +NADH
Ejemplo β- oxidación
ácido graso 10C
1- INSATURACIÓN IMPAR
• Los ciclos antes de llegar a la insaturación se realizan por β oxidación normal.
• Cuando se encuentra con una insaturación en el carbono Δ3 (cis- Δ 3-enoil no es
sustrato de la Acil-CoA deshidrogenasa) este se transforma por medio de la Δ3 Δ2enoil-
CoA isomerasa en trans Δ2enoil-CoA.
• El proceso consiste en convertir el enlace cis 3 en trans 2.
• Este compuesto si es sustrato de la enoil-CoA hidratasa (enzima (2) de la β oxidación).
• Se continúa oxidando por el resto de los procesos de la β oxidación, pero se salta la
producción de un FADH2 (2 ATP menos) por cada doble enlace impar en la cadena ya
que la acil-CoA deshidrogenasa no actúa (ella producía un FADH2), sino que actúa la Δ3
Δ2enoil-CoA isomerasa que no produce FADH2.
El producto de la Δ3
Δ2enoil-CoA isomerasa es
el mismo que el de la acil-
CoA deshidrogenasa pero
sin haber producido
FADH2
2- INSATURACIÓN PAR
Los ciclos antes de llegar a la insaturación se realizan por β-oxidación normal.
Cuando la insaturación está en el Δ4 y se lleva a cabo la primera deshidrogenación, da como
resultado un Δ4 Δ2 enoil CoA. Este compuesto no es sustrato de la enoil-CoA hidratasa (2).
Por lo tanto requiere una vía alterna que consiste en dos reacciones
a) Hidratación del Δ4 Δ2 enoil CoA mediante la 2,4-dienoil CoA reductasa, que da lugar a
la transΔ3enoil CoA, consumiendo un NADPH + H+
Para llevar a cabo este proceso se consume 1 NADPH + H+. Por lo tanto en el rendimiento
energético se forman 3 moléculas de ATP menos. (se sigue produciendo el FADH2 y el NADH,
pero se consume un NAPDH que es equivalente a 3 ATP).
1. PropionilCoA carboxilasa:
• Lleva a cabo una carboxilación similar a la de la piruvato carboxilasa (gluconeogénesis).
• Lleva biotina (B7) como cofactor.
2- Metilmalonil CoA mutasa:
• Lleva como cofactor a la coenzima cobalamina (B12). Esta es sintetizada por
microorganismos intestinales. Se requieren 3μg/día
• La deficiencia de Vitamina B12 provoca anemia perniciosa.
• Sólo hay dos enzimas que llevan coenzima B12 como cofactor:
o Metilmalonil-CoA mutasa
o Homocisteína metil transferasa (para producir SAM, el donador de metilos
universal)
• La deficiencia de Metilmalonil-CoA mutasa da lugar a la acidemia metilmalónica. El pH
sanguíneo disminuye debido a la excreción de metilmalonil de las células lo que da lugar
a una acidosis grave que puede perjudicar al cerebro.
El proceso consiste en la oxidación de los AG hasta que tienen una longitud de 8C, cuando ya no
son sustrato del enzima del peroxisoma, y pueden pasar a la mitocondria para ser degradados
normalmente mediante la β-oxidación.
Diferencias:
2.- Los ácidos grasos no requieren carnitina para el transporte, entran a través de un
transportador tipo ABC (que requiere 2ATP para introducirlos en el peroxisoma)
4.- La Tiolasa es específica para ácidos grasos de >8 átomos de carbono (en la mitocondria
degrada hasta de 4C, por lo que se dirigen hasta este orgánulo).
30.13. ω-oxidación:
32.4. Sintesis del palmitato. Catalizado por el complejo Acido graso sintasa
(AGS)
Este ácido graso se consigue producir mediante una reacción cíclica, a través de 7 ciclos
catalizados por el complejo ácido graso sintasa (AGS o FAS en inglés). Tiene las siguientes
etapas.
1. Transferencia del grupo malonilo desde CoA a ACP
2. Condensación de la molécula de malonil-CoA
3. Reducción del carbono β
4. Deshidratación del carbono β
5. Reducción del carbono β
En primer lugar se transfiere un grupo acetil desde acetil-CoA a la ACP en una reacción
catalizada por el malonil/acetil-CoA-ACP transferasa (MAT). Entonces, se da una
transferencia del grupo acetilo desde el ACP al centro activo β-cetoacetil-ACP sintetasa
(KS), de modo que el ACP se desplaza para transferir el grupo acetilo al centro activo KS,
eliminando la CoA-SH.
De este modo, en este momento hay un grupo acetilo unido al –SH de la Cys del centro
activo KS y un grupo malonilo unido al ACP.
De este modo, tras finalizar un ciclo, queda una molécula de 4 átomos de carbono. El
grupo butirilo es ahora transferido desde el ACP al grupo –SH de la Cys de la KS, que
originalmente portaba el grupo acetilo. Para empezar el siguiente ciclo, debe unirse otra
molécula de malonil-CoA, para repetir los pasos que hemos comentado ya. De este
modo, la condensación produce una molécula de 6 carbonos, que sufrirá las
modificaciones que hemos mencionado en todo este ciclo de reacciones, ya que el
carbono beta introducido ahora está en forma oxidada, y el ACP lo lleva de nuevo por
todos los enzimas reductores e hidratantes, obteniendo una molécula completamente
reducida. Este paso se sigue repitiendo hasta que se forma palmitilo, de 16 átomos de
carbono, para lo cual se requieren 7 ciclos completos. Para desprender del complejo
enzimático esta molécula, entra en juego una tioesterasa (TE) que cambia el grupo ACP
por el CoA.
5 ciclos más
Tras 7 ciclos (5 ciclos desde el 2º ciclo en el que se forma hexanoil), se van añadiendo carbonos
de 2 en 2 (2 por cada ciclo) hasta llegar a 16 C (palmitoil). En el 7º ciclo se produce la ruptura
tiólica y se libera el ácido palmítico.
RESUMEN ENZIMAS IMPLICADAS:
Se puede inhibir la ácido
graso sintetasa (AGS), lo cual
impide que se formen AG y En otros reinos como hongos y
por lo tanto que se acumulen bacterias hay otras enzimas
TAGs en el tejido adiposo. (algunas algo modificadas) o
Por ej: el inhibidor C75 directamente faltan enzimas.
Síntesis de malonil-CoA:
7 Acetil-CoA + 7 CO2 + 7 ATP 7 Malonil-CoA + 7 ADP + 7 Pi
Ciclos de reducción:
Acetil coa (cebador) + 7 malonil CoA + 14 NADPH + 14H+
IMP
• Activadores alostéricos
o Citrato: Al aumentarse los niveles de ATP y acetil-CoA intramitocondriales
• Inhibidores alostéricos
o Palmitil-CoA
• Fosforilación (modificación covalente): El método de fosforilación e interconversión
hace que el enzima oscile entre una configuración dimérica y polimérica, siendo la
forma polimérica y defosforilada la forma activa. En este caso, la acetil-CoA carboxilasa
es fosforilada por la AMP-PK (no PKA), y defosforilada por la proteína fosfatasa 2A
(PP2A). A su vez, la PKA (que se activa con AMPc producido al unirse el glucagón a su
receptor, inactiva a la PP2A, lo que favorece también que la acetil-CoA carboxilasa esté
fosforilada e inactiva).
Resumen:
Todos estos cambios vienen producidos en respuesta a la síntesis de las hormonas glucagón e
insulina, que activan una serie de mecanismos en respuesta a las necesidades de combustible.
• El glucagón activa a la adenilato ciclasa, que produce cAMP y activa la PKA. Esta fosforila
a la lipasa, activándola y a la proteína fosfatasa 2A (PP2A),
inactivándola. Se inhibe entonces la lipogénesis y se activa la lipolisis.
activada
El proceso comienza con la adición de un ácido graso al glicerol 3-fosfato, transfiriendo el ácido
graso desde una molécula de acil-CoA para formar lisofosfatidato. Otra molécula de acil-CoA
vuelve a acilar al lisofosfatidato para dar lugar al fosfatidato.Las acilaciones están catalizadas por
el enzima glicerolfosfato aciltransferasa. Generalmente se une al C1 un ácido graso saturado,
pero el C2 suele llevar un ácido graso insaturado.
Los acil-CoA son formados por la acción del enzima acil-CoA sintetasa, que con gasto de ATP y
formando una molécula de pirofosfato y AMP, a partir de ácidos grasos.
El colesterol, al igual que los ácidos grasos de cadena larga, se forma a partir de una molécula
de AcetilCoA. Sin embargo, su ruta difiere totalmente de la de los ácidos grasos.
ESTUDIAR CONTROL
HORMONAL POR EL
DIBUJO
Recordemos que…
El colesterol es componente de
las membranas celulares de
animales. Sin embargo, en las
plantas su homólogo es el
stigmasterol, y en los hongos el
ergosterol.
3. Vitamina D
4. Vitamina K: En un proceso complejo se pasa del corismato a la naftoquinona. De ésta formamos
Vitamina K al unir isopentenil pirofosfato.
5. Vitamina E: En un proceso complejo se pasa de la tirosina a al ácido homogentisicico. De éste
formamos Vitamina E al unir isopentenil pirofosfato.
6. Vitamina A: Se obtiene a partir de precursores obtenidos en la dieta como el β-caroteno
(dieta vegetal) o ésteres de la Vitamina A (dieta animal).
33.4.4.1. Prostaglandinas.
La síntesis de prostaglandinas (y de tromoxanos), comienza con la formación de la
prostaglandina H2 (PGH2). Esta molécula es precursor inmediato de muchas otras
prostaglandinas y de los tromboxanos.
Las dos posibles reacciones que dan lugar a PGH2 desde el ácido araquidónico están catalizadas
por un enzima bifuncional, la ciclooxigenasa (COX) o prostaglandina H2 sintasa, que realiza una
reacción de dos pasos. Existen dos isoformas o isozimas, con función diferente pero con
mecanismos de reacción similares. Existe una COX1, que sintetiza prostaglandinas responsables
de regular la secreción de la mucina gástrica, mientras que la COX2 sintetiza las prostaglandinas
que intervienen en la inflamación, el dolor y la fiebre.
33.4.4.2. Tromboxanos.
Existe un enzima tromboxano sintasa que convierte el producto obtenido de la transformación
del ácido araquidónico, la PGH2, en tromboxano A2. La función de estas moléculas es la
constricción de los vasos sanguíneos y la agregación plaquetaria, que son las etapas iniciales de la
coagulación sanguínea.
33.4.4.3. Leucotrienos. A partir del ácido araquidónico en una ruta lineal diferente a
tromboxanos y prostaglandinas.
Visto esto, la velocidad de paso de una molécula a través de la membrana plasmática (J) se
puede calcular mediante la siguiente expresión:
De la expresión anterior se deduce que cuanto mayor sea el grosor de la membrana plasmática,
menor será la velocidad de difusión. Por el contrario, cuanto más apolar sea una molécula y más
pequeña y esférica, mayor será la velocidad. Si la diferencia de concentración es muy grande, la
velocidad también será mayor. Finalmente, cuanto mayor sea la superficie de transporte a
través de la membrana, mayor será la velocidad de dicho transporte.
Las principales características del transporte por difusión simple son las siguientes:
• Es un transporte inespecífico, es decir, válido para cualquier molécula apolar o para
cualquier molécula polar sin carga de pequeño tamaño.
• Es un transporte bidireccional, es decir, puede producirse en ambas direcciones en
función del gradiente de concentración.
• Es un transporte equilibrativo, es decir, el transporte continúa hasta que las
concentraciones a ambos lados de la membrana se equilibran.
• Es un transporte no saturable, cuanto mayor sea el gradiente de concentración, mayor
será la velocidad de transponte.
• Es un transporte no regulable ni inhibible mediante ningún mecanismo.
• No requiere gasto de energía de ningún tipo.
El transporte mediado es aquel en el que la entrada de una molécula está regulada por
proteínas integrales de la membrana plasmática que reconocen y transportan de forma
específica a una sustancia determinada. Estas proteínas reciben el nombre genérico de
permeasas y pueden ser de diversos tipos y se encargan tanto del transporte pasivo como del
activo.
Las permeasas pueden ser de varios tipos como los carriers y los canales, que se encargan del
transporte pasivo, o las ATPasas y las proteínas encargadas del simporte y el antiporte, que se
encargan del transporte activo.
Pasivo Activo
CARACTERÍSTICAS TRANSPORTE MEDIADO.
• El transporte mediado es un transporte
saturable, ya que la velocidad del mismo
no aumenta indefinidamente en función
del gradiente de concentración, sino que
llega un momento en el que se alcanza
una velocidad máxima que no se puede
superar. En ese momento, las permeasas
se encuentran saturadas. La cinética del
transporte mediado es similar a la
cinética enzimática convencional: la
velocidad va aumentando
progresivamente conforme aumenta el
gradiente de concentración hasta que se
llega a una velocidad máxima en la que el transportador se encuentra saturado.
• Además, el transporte mediado es un transporte específico: cada tipo de permeasa
reconoce a un sustrato determinado al que transporta a través de la membrana
plasmática. Alguna permeasa puede reconocer a más de un sustrato y la velocidad de
transporte será mayor para aquel sustrato por el que la permeasa tenga mayor
especificidad.
• El transporte mediado es un transporte inhibible. Las permeasas pueden ser inhibidas
de distintas formas como por ejemplo mediante inhibidores competitivos (la velocidad
máxima no cambia pero se necesita un mayor gradiente de concentración para
alcanzarla) y además los transportadores pueden ser inactivados.
Transportador
glucosa
Un ejemplo muy característico de canales pasivos son las acuaporinas. Las acuaporinas
son una familia de proteínas integrales de la membrana plasmática que se encargan de
formar canales en la misma para el transporte rápido de moléculas de agua.
Como ya se ha dicho anteriormente, los canales activos son aquellos que permanecen
cerrados y solo se abren para dejar pasar sustancias al interior de la célula ante
determinados estímulos como la unión a un ligando, un potencial de membrana o
tensión en la membrana plasmática.
Existen dos tipos de transporte activo secundario: el simporte, cuando las dos moléculas se
transportan en el mismo sentido y el antiporte, cuando las dos moléculas se transportan en
sentidos contrarios. El transporte activo secundario es diferente en animales y en vegetales. En
animales, la molécula que se emplea para generar el gradiente y poder transportar a la otra es
el ión Na+. Por el contrario, en los vegetales, el gradiente está generado por protones (H+).
Ejemplos:
• Simporter
o Absorción de glucosa en el intestino mediante sistema Na+/glucosa.
• Antiporter
o Transporte de Ca2+ para la relajación del musculo cardiaco. Sistema Na+/Ca2+.
o Transporte de H+ para acidificar el estómago. Sistema Na+/H+
Debido a que no podemos “crear” nitrógeno ni “fijar” nitrógeno, en un individuo adulto sano
existe un balance nitrogenado equilibrado en el que Nitrógeno ingerido=Nitrógeno excretado.
Sin embargo, cuando estamos creciendo existe un balance nitrogenado positivo (nos quedamos
con más N del que excretamos). A la vez, cuando perdemos más N
del que podemos incorporar, el balance es negativo (por ej. al final
del cáncer).
INTESTINO DELGADO
Estas enzimas pancreáticas hidrolizan los péptidos pequeños provenientes del estómago en
oligopéptidos y aminoácidos libres. Las enzimas son sintetizadas en forma de zimógenos
inactivos para evitar la autodigestión del páncreas. Esto ocurre en la pancreatitis.
1. Activación del tripsinógeno mediante una enteropeptidasa de la pared apical del enterocito
duodenal. Corta parte del tripsinógeno convirtiéndolo en tripsina (forma activa)
Para evitar la activación inoportuna del tripsinógeno dentro del páncreas existen inhibidores de
tripsina en los conductos pancreáticos.
Por transaminación
TRANSAMINACIÓN
Mecanismo de la reacción
Ocurre mediante una reacción de ping pong (los dos
sustratos entran en momentos distintos)
1. El aldehído del PLP se une al α-amino de la Lys del
enzima (Base de Schiff, aldimina interna).
2. El aminoácido1 desplaza al enzima uniéndose al
PLP (aldimina externa).
3. El NH3+ se queda unido al PLP y se libera un α-
cetoácido1.
4. La formación del aminoácido2 ocurre invirtiendo
este proceso al introducir el α-cetoácido2.
Por ello, lo más normal es que la mayoría de aminoácidos cedan su grupo amino al α-
cetoglutarato para formar glutamato, liberándose el α-cetoácido del aminoácido que cedió el
grupo amino. Las más importantes transaminasas son la alanina transaminasa y la aspartato
transaminasa.
Muchos aminoácidos tienen una parte gluconeogénica y otra cetogénica. Es decir, que
pueden dar lugar a piruvato y también a acetil-CoA. Es el caso del triptófano (TRP), que
tiene una parte que dará alanina y otra (la cadena R de triptófano) que solo dará acetil-CoA
Muchos aminoácidos
están tanto en los
gluconeogénicos como
cetogénicos (como el
Trp). Los únicos SOLO
cetogénicos son leucina
y lisina.
Son aquellos aminoácidos que tienen tres carbonos o en algún momento del catabolismo
generarán compuestos de 3C. Estos aminoácidos van a dar lugar a piruvato. Esto puede dar
lugar a acetil-CoA y ser oxidado por la vía del ácido cítrico, o bien ir por vía glucogénica y
transformarse en oxalacetato.
• Serina
• Glicina (no es frecuente, se suele transformar en bicarbonato)
o Puede originar glioxilato, y de ahí oxalato, lo que es importante para piedras
renales de oxalato
o Se transforma en serina por la adición enzimática de un grupo hidroximetilo
o Se puede transformar en bicarbonato en una reacción reversible.
• Cistina
• Triptófano (se elimina su cadena lateral y es alanina)
• Alanina
• Algunos autores incluyen también treonina.
✓ Las oxidasas de función mixta usan oxígeno molecular. En las reacciones catalizadas por estos
enzimas, un átomo de oxígeno se utiliza para oxidar el sustrato, mientras que el otro se reduce
a agua. Los protones provienen del cofactor, que se oxida como resultado de la reacción.
a) El ciclo redox que regenera al coenzima. Lo cual es más grave porque esta coenzima es
necesaria para más procesos como la síntesis de neurotransmisores. El tratamiento
sería suministrar precursores de estos neurotransmisores.
b) La enzima fenilalanina hidroxilasa.
La PKU provoca retraso mental (por causas desconocidas) si no se “trata”. La manera de evitar
el retraso y “tratar” la enfermedad es limitar la ingesta de Phe, disminuyéndola drásticamente.
La PKU es la enfermedad metabólica más común.
Ciclo de regeneración de la
coenzima.
38.8. Alcaptonuria.
La alcaptonuria es otro de los defectos hereditarios del
catabolismo de la fenilalanina. El enzima defectuoso en
este caso es la homogentisato dioxigenasa. Los efectos
adversos de este defecto son mínimos. La orina es de
color negro.
En el hígado, la glutaminasa
forma glutamato. Este
glutamato también puede
desaminarse a α-cetoglutarato.
IMP
• Aminoácidos esenciales: son aquellos que no pueden ser sintetizados por el organismo y
que deben ser ingeridos necesariamente con la dieta. Los aminoácidos esenciales son:
fenilalanina (Phe), triptófano (Trp), valina (Val), leucina (Leu), isoleucina (Ile), metionina
(Met), treonina (Thr), lisina (Lys) e histidina (His).
• El aspartato (Asp), se puede sintetizar a partir del oxalacetato también mediante una
reacción de transaminación catalizada por la aspartato aminotransferasa (AST) o
glutamato – oxalacetato transaminasa (GOT). Posteriormente, a partir del aspartato, se
puede sintetizar asparagina (Asn) mediante una reacción de amidación en la que la
glutamina cede el grupo amino y se transforma en glutamato.
La síntesis de los aminoácidos no esenciales condicionados (Cys, Tyr, Arg) se realiza de varias
formas diferentes en función del aminoácido del que se trate.
• La arginina (Arg) es un intermediario del ciclo de la urea que se obtiene con la ruptura
del arginino – succinato en fumarato y arginina mediante una reacción reversible
catalizada por el enzima arginino – succinato liasa. Pero como las cantidades de arginina
sintetizadas por este aminoácido son insuficientes para abastecer las necesidades del
organismo (ya que la arginina continua en el ciclo de la urea), se debe complementar la
producción de arginina con su consumo en la dieta.
Existen patologías debidas a fallos en los enzimas que catalizan la síntesis de cisteína.
Concretamente, un fallo en la cistationina – β – sintasa, produce una patología denominada
homocistinuria. Debido a la deficiencia en este enzima se acumula homocisteína en sangre y en
orina (donde se detecta fácilmente). La acumulación de homocisteína produce graves daños al
tejido muscular cardiaco.
Sin embargo, algunos de los derivados más importantes de los aminoácidos son los
neurotransmisores, que se obtienen a partir del glutamato, la tirosina y el triptófano. Además,
en la síntesis de estos neurotransmisores, se obtienen otros compuestos que son
intermediarios en la síntesis de otros productos con una gran importancia biológica.
A partir del glutamato, mediante una reacción catalizada por un enzima denominado glutamato
descarboxilasa (que utiliza como coenzima el piridoxal fosfato) se obtiene un importante
neurotransmisor: el GABA (γ – aminobutirato).
A partir de la tirosina se obtiene, mediante la acción del enzima tirosina hiroxilasa, el L – DOPA,
que es una molécula precursora de la melanina. Posteriormente, a partir del L – DOPA se
obtiene la dopamina, un importante neurotransmisor, con la intervención del enzima
aminoácido aromático descarboxilasa, que emplea el piridoxal fosfato como coenzima. A partir
de la dopamina, mediante una reacción catalizada por la dopamina hidroxilasa, se obtiene la
noradrenalina, una hormona y
un importante
neurotransmisor. Por último, a
partir de la noradrenalina, se
obtiene la adrenalina, gracias a
la acción del enzima
feniletanolamina – N – metil
transferasa, que cataliza la
metilación de la adrenalina
con un grupo metilo
procedente de la metionina.
El grupo hemo se va a sintetizar a partir del succinil – CoA (intermediario del ciclo del ácido
cítrico) y del aminoácido glicina (Gly).
La síntesis del grupo hemo comienza con la condensación del succinil – CoA y de la glicina en
una reacción catalizada por el enzima ALA – sintasa. La condensación de estos dos compuestos
da lugar al δ – aminolevurinato (δ – ALA).
Para formar el anillo de protoporfirina IX que es la estructura fundamental orgánica del grupo
hemo, se necesitan cuatro anillos de pirrólicos de porfobilinógeno y por tanto se necesitarán
ocho moléculas de δ – aminolevurinato. La síntesis de la protoporfirina IX se consigue entonces
con cuatro moléculas de porfobilinógeno y mediante una serie de pasos, cada uno de ellos
catalizado por un enzima específico.
¿DÓNDE SUCEDE? La síntesis del grupo hemo comienza en la matriz mitocondrial, donde se
encuentra el succinil – CoA (ya que este compuesto es un intermediario del ciclo de Krebs) y
también la glicina. Posteriormente, el δ – aminolevurinato sale al citoplasma, donde se van a
sintetizar los anillos de porfobilinógeno y va a comenzar la síntesis de la protoporfirina IX.
Finalmente, los últimos dos pasos de la síntesis del anillo de protoporfirina IX transcurren de
nuevo en la matriz mitocondrial, donde también se añade el ión Fe2+ para completar así la
síntesis del grupo hemo.
REGULACIÓN. La síntesis del grupo hemo se encuentra regulada, al igual que la gran mayoría de
las rutas metabólicas. La regulación de este proceso se realiza a nivel del primer enzima de la
vía, es decir, a nivel de la ALA – sintasa que puede es susceptible de regulación alostérica. El
control alostérico lo realiza el propio grupo hemo, una vez ha sido sintetizado por completo, ya
que inhibe la actividad de la ALA – sintasa. De este modo, cuando ya se ha sintetizado una cierta
cantidad de grupo hemo, este inhibe el primer enzima de la vía de síntesis, deteniendo así la
síntesis de más grupos hemo. Este mecanismo de regulación es uno de los motivos por los
cuales los últimos pasos de la síntesis del grupo hemo se realicen en la matriz mitocondrial, que
es donde se encuentra la ALA – sintasa. Los metales pesados (como el plomo) inhiben la síntesis
del grupo hemo bloqueando diversos enzimas de la vía como la ferroquelatasa o la
porfobilinógeno sintasa.
PROCESO DE SÍNTESIS
Para sintetizar los nucleótidos purínicos, primero se formará un nucleótido de inosinato (IMP) a
partir de PRPP (fosfo-ribosa pirofosfato) y otros precursores que formarán la parte de la base
nitrogenada como glicina, formil-THF, glutamina…
La síntesis de nucleótidos purínicos, al igual que todas las rutas metabólicas, es un proceso
estrictamente regulado para evitar que se sinteticen demasiados nucleótidos. De esta forma la
regulación de esta vía se produce mediante un control alostérico ejercido por los propios
intermediarios de la vía. De esta forma se puede decir que la síntesis de nucleótidos purínicos
está regulada por retroalimentación o feed – back.
En primer lugar, los productos de la vía: el AMP, el GMP, y sus nucleótidos bifosfato
correspondientes (ADP y GDP) inhiben al enzima PRPP sintetasa, impidiendo así la síntesis de
PRPP y por tanto la síntesis tanto de nucleótidos purínicos como de nucleótidos pirimidínicos.
Por otro lado, el AMP, el GMP y el propio IMP, inhiben diferentes enzimas de la vía de síntesis
del IMP, como la glutamina – PRPP amidotransferasa. Esta inhibición es una “inhibición
sinérgica”, es decir, por separado, los nucleótidos inhiben parcialmente al enzima, pero los tres
juntos la inhiben prácticamente del todo.
Además, el GMP inhibe su propia síntesis a partir del IMP, mediante la inhibición alostérica del
enzima IMP – deshidrogenasa. Lo mismo sucede con el AMP, que inhibe su propia síntesis a
partir del IMP al inhibir a la adenilosuccinato sintetasa.
Finalmente, también existen activadores alostéricos de esta vía como es el caso del propio
PRPP, que activa la síntesis de IMP a partir de él mismo al activar alostéricamente al enzima
glutamina – PRPP amidotransferasa.
Sin embargo, esto podría poner en peligro las vías de degradación de purinas (ya que si nada
más ser degradados se vuelven a unir no solucionaríamos nada) esás dos enzimas, HGPRT y
APRT se inhiben con su producto (por lo que si hay mucho producto dejarán de actuar para
degradar los nucleótidos.
1. CARBAMIL-P SINTETASA II
Reacción análoga a la primera del Ciclo de la Urea, catalizada por la Carbamoil-P sintetasa I
- En la CPS-I se utilizaba NH2 directamente. En esta el grupo amino es donado del NH2
de la cadena lateral de la Glutamina.
- La CPS-I es mitocondrial mientras la CPS-II es citosólica. En el citosol no hay mucho NH2,
razón por la cual no se utiliza en la reacción.
- La CPS-I utiliza HCO3- en vez de CO2
2. ASPARTATO TRANSCARBAMILASA
El aspartato es el aminoácido base de la formación de las pirmidinas (aporta 4/6 átomos
centrales del anillo).
42.4. Regulación.
CPSII: inhibición por producto final de la vía
Inhibida por:(-) UTP, CTP
Activada por:(+) ATP, para equilibrar. Se requiere igual cantidad de ATP que de UTP, por
lo que al haber mucho ATP se estimula la producción del segundo.
Asp transcarbamilasa:
Inhibida por:(-) CTP
Activada por:(+) PRPP, ATP
CTP sintasa:
Inhibido por:(-) CTP retroinhibición, regula cantidad de producto
Activada por:(+) GTP, es pareja del CTP, para equilibrar.
MECANISMO DE REACCIÓN
1) Tiorredoxina reductasa los electrones
del NADPH reducen a la tiorredoxina (lo
pasan de S-S a SH SH)
2) Ribonucleótido reductasa es reducida
por la tiorredoxina. Finalmente estos
electrones pasan del enzima a la ribosa,
permitiendo la reducción a desoxirribosa
(con liberación de una molécula de agua).
La diferencia con las vías de recuperación de nucleótidos de purina es que obtendremos SOLO
el nucleósido (ya que el Pi se pierde en la reacción en la que se mete la Ribosa-1-P).
42.9. Resumen.
ALGUNOS SEMINARIOS:
SEMINARIO 1: Agua y pH (Glez Sancho)
1. Calcular el pH de las siguientes disoluciones: 0,1 M HCl, 0,05 M NaOH, 0,05 M HNO3.
2. El pH del plasma es normalmente 7,4. Sin embargo, en una diabetes severa puede disminuir
hasta 6,8. Calcular la relación de protones del plasma de una persona diabética respecto a la
del plasma de una persona normal.
Relación=0,252
3. Al pH sanguíneo normal de 7,4, la suma de [HCO3-] + [CO2] = 25,2 mM. ¿Cuáles son las
concentraciones de HCO3- y CO2?
7,4-6,1=log([A-]/[AH])=1,3 19,95[CO2]=[HCO3-]
[CO2]+[HCO3-]=25,2 x 10-3
7,03=6,1+log([HCO3-]/[CO2]) 0,93=log([HCO3-]/[0,0011]8,51x0,0011=[HCO3-]=0,009361
𝟎,𝟎𝟎𝟗𝟑𝟔𝟏
[HCO3-]=0,009361 𝟎,𝟎𝟐𝟒
=0,39 1-0,39=0,61 Ha perdido un 61%
85x0,03=2,55mM
(Datos: pKa para HCO3-/CO2 = 6,1; Constante de solubilidad del CO2 a 37 ºC = 0,03 mmol l-1
mm de Hg-1)
c. Actividad del enzima por gramo de hígado, sabiendo que el extracto se ha realizado a una
dilución p/v de 1/4.
4 mL – 1g
1mL – 0,25g
Actividad del enzima en el extacto=3U/ml (es decir, en 0,25g)
3(U/mL) • (1mL/0,25g)=12U/g
V=Vmax[S]/(Km+[S]) Michaelis-Menten
Vglucosa= 17•10-5/(10-5+10-5)=8.5 U/mg proteína Se trata de 1/2Vmax (ya que [S]=Km)
Vfructosa=25•10-6/(10-3+10-6)=0,025U/mg proteína Se trata de 1/100 Vmax
Km=4,7•10-5M
[S]= 2•10-4M [I]=5•10-4M (competitivo) Ki=3•10-4M
Vmax=22μmol/(L•min)
α=1+[I]/Ki= 1+(5•10-4M/3•10-4M)=8/3
𝑽𝒎𝒂𝒙[𝑺] 𝟐𝟐∙ 𝟐∙𝟏𝟎−𝟒
𝑽= =𝟖 = 13,54 μmol/(L•min)
𝑲𝒎+[𝑺] ∙𝟒,𝟕∙𝟏𝟎−𝟒 +𝟐∙𝟏𝟎−𝟒
𝟑
INICIAL
800 40 100 1
Act especifica0=
40/800=0,05U/mg
Act específicaetapa=
32/80=0,4U/mg
Enriquecimiento= Act
espetapa/Act esp0 =
TRATAMIENTO 0,4/0,05=8
32=Act.incial*rendimi
80 ento=40*0,8=32 80 8
CON CALOR
Act especifica0=
40/800=0,05U/mg
Act específicaetapa=
16/1=16U/mg
Enriquecimiento= Act
16/40=0,4=
espetapa/Act esp0 =
CROMATOGRAFÍA 40% 16/0,05=320
1 16 320
AFINIDAD