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Facultad de Medicina
Departamento de Microbiología
PRÁCTICA DE LABORATORIO
INTRODUCCIÓN
La Familia Mycobacteriacea comprende en total cinco géneros:
La Familia Mycobacteriacea está constituida por bacilos ácido alcohol resistentes (BAAR), que
se colorean con la tinción de Ziehl Neelsen (Fig 1.), aerobios estrictos, intracelulares
facultativos, rectos o ligeramente curvos, miden de 1- 10 µm de largo por 0.2 - 0.6 µm ancho,
inmóviles, no producen conidios, son catalasa positivo con pocas excepciones (como es el
caso de algunas cepas de M. tuberculosis con alta resistencia a isoniazida).
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mientras que el tiempo de generación de M. leprae es de 14 días, en modelos in-vivo.
En 2020, se prevé que la TB se ubique como la segunda causa principal de muerte por un
solo agente infeccioso, después de COVID-19 y se encuentra entre las 13 primeras causas de
muerte en el mundo.
La OMS utiliza cinco categorías para clasificar los casos de tuberculosis resistente a los
medicamentos: (i) TB resistente a isoniazida; (ii) TB resistente a Rifampicina (TB-RR); (iii) TB-
MDR, resistente a Isoniazida y Rifampicina; (iv) TB- pre-XDR, resistente a Rifampicina y a una
fluoroquinolona (moxifloxacina, levofloxacina) y (v) TB extensiva o extremadamente resistente
(TB-XDR), resistente a rifampicina, a una fluoroquinolona, y a bedaquilina o linezolid o a los dos.
Tanto la TB-RR como la TB-MDR, requieren tratamiento de segunda línea.
A nivel mundial en 2020, el 71 % (2,1/3,0 millones) de las personas diagnosticadas con TB
pulmonar confirmada bacteriológicamente, se sometieron a pruebas de resistencia a la
rifampicina, frente al 61 % (2,2/3,6 millones) en 2019 y al 50 % (1,7/3,4 millones) en 2018. Entre
estos, se detectaron 132.222 casos de TB-MDR/RR y 25.681 casos de TB pre-XDR o TB-XDR, para
un total combinado de 157.903, comparado con 201.997 personas detectadas con TB
farmacorresistente en 2019, registrando una disminución del 22 %.
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Las causas principales de la aparición de TB farmacorresistente son: (i) la administración
de tratamientos erróneamente prescritos; (ii) la falta de supervisión terapéutica; (iii) el uso
de fármacos de mala calidad y (iv) la falta de adherencia del paciente al tratamiento. La
farmacorresistencia surge principalmente en zonas donde los programas de lucha
antituberculosa son deficientes.
Según el Instituto Nacional de Salud, en el año 2020 en Colombia se notificaron 11.529 casos
de TB, de los cuales 10.755 eran nuevos para una incidencia nacional de 21,35 casos /100.000
habitantes, comparado con el año 2019 en el que se notificaron 14.902 casos de TB y la
incidencia fue de 27,69 casos /100.000 habitantes. En 2020 El grupo poblacional de los
trabajadores de la salud aportó el 2,0 % de los casos del país, se registraron 235 casos, siendo el
sexo mujer el más afectado con 66,4 % de los casos.
En el mismo año 2020 se notificaron al sistema de vigilancia (Sivigila) 175 casos nuevos
farmacorresistente (todas las formas), que corresponden a una tasa de incidencia de 0,3 casos
por 100 000 habitantes, siendo el Archipiélago de San Andrés, Providencia y Santa Catalina el de
mayor incidencia.
En nuestro país en el año 2021 se notificaron 14.470 casos de TB (todas las formas), de los
cuales 13.542 fueron casos nuevos para una incidencia nacional de 26,53 casos/ 100.000
habitantes. De acuerdo a las comorbilidades para tuberculosis sensible se presentó con mayor
frecuencia: la desnutrición (15,3 %), coinfección TB-VIH (12,1 %) y diabetes (9,7 %). Este año
se notificaron 351 casos farmacorresistentes, con una incidencia de 0.47/100.000 habitantes,
pcon predominio de la monorresistencia con 36.75 % (129), seguido de resistencia a rifampicina
con 35.33% (124) y en tercer lugar MDR con 26.49% (93).
DIAGNÓSTICO DE TUBERCULOSIS
DIAGNÓSTICO FENOTÍPICO
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BACILOSCOPIA
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COLORACIÓN DE ZIEHL NEELSEN (ZN)
Una vez formados estos complejos, no pueden ser decolorados con el alcohol ácido o
con ácidos minerales. Los colorantes usados son compuestos aniónicos en soluciones
fenoladas, los BAAR se verán rojos si se utiliza fucsina, violeta púrpura si se utiliza
cristal violeta y amarillo verdoso cuando se utiliza la coloración fluorescente de
auramina O.
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La lectura de los cultivos en medios sólidos se hace de la siguiente manera:
Lectura Interpretación
(-) No se observan colonias
No. de colonias 1 a 20 colonias
(+) 20 – 100 colonias
(++) Más de 100 colonias separadas
(+++) Colonias confluentes
Contaminado Desarrollo de microorganismos no AAR
El medio líquido más utilizado en la actualidad es el MGIT, que se incuba y lee en el medio
semiautomatizado BACTEC MGIT 960 o 320.
La siguiente es la composición del medio MGIT: Middlebrook 7H9 modificado; OADC (ácido
oleico, albúmina, dextrosa y catalasa); PANTA (polimixina B, anfotericina B, ácido nalidíxico,
Trimetoprim, azlocilina); Indicador de crecimiento (compuesto fluorescente embebido en
silicona.
Si no se dispone de los equipos Bactec MGIT 960 o 320, los tubos se pueden incubar a 37°C, y
se pueden observar manualmente bajo luz ultravioleta.
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Diagnóstico Molecular de Tuberculosis
La OMS recomienda utilizar una prueba molecular como prueba diagnóstica inicial para
detección de CMTB y resistencia por lo menos a R, con el fin de evitar retrasos en el inicio del
tratamiento. Estas pruebas deben reemplazar o complementar las pruebas convencionales por
ser más sensibles.
Las pruebas rápidas aprobadas por la OMS para el diagnóstico de TB y TB-DR son las
siguientes.
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Prueba in-house
PCR-IS6110
Prueba in-house
PRA (PCR restriction analysis)
Es un método sencillo y rápido, descrito por Telenti y col, que permite diferenciar micobacterias
a nivel de especie. Se basa en la evaluación por PCR del gen hsp65 que codifica para una proteína
de shock térmico de 65 KD. El método involucra el análisis con enzimas de restricción, de los
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productos de PCR obtenidos empleando iniciadores comunes para todas las micobacterias. Se
utilizan dos enzimas de restricción BstEII (diana G↓GTCACC) y HaeIII (diana GG↓CC). La proteína
de 65 kD, contiene epítopos que son únicos, así como epítopos que son comunes a varias
especies de micobacterias. El gen hsp65, es un gen conservado en bacterias y se encuentra una
copia por genoma. Este método es uno de los más ampliamente utilizados en la identificación
de especies de micobacterias.
En esta PCR se va a amplificar un fragmento de DNA de más o menos 441 pb, perteneciente
al gen hsp65 que codifica para una proteína de shock térmico, el cual está presente en todas
las micobacterias y para el cual se utilizan los primers Tb 11 y Tb 12
qPCR – IS6110
El kit MTB REAL-TM permite la detección del complejo Mycobacterium tuberculosis a partir de
cualquier muestra, mediante la determinación de la secuencia de inserción IS6110, utiliza sondas
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Tagman marcadas con dos fluorocromos (FAM/JOE) que aumentan la especificidad de esta
determinación, además maneja un control interno para todas las muestras.
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1. Criterio epidemiológico: antecedentes de contacto con pacientes tuberculosos
2. Criterio clínico: presencia de un cuadro compatible con la enfermedad
3. Criterio tuberculínico: hallazgo de una prueba de tuberculina positiva PPD>10mm
4. Criterio radiológico: anormalidades en la radiografía de tórax, descartadas otras causas
de dichas anormalidades.
MÉTODO FENOTÍPICO
Se siembran dos tubos MGIT con el cultivo a estudiar y a uno de ellos se le adiciona una
concentración conocida del fármaco a probar y el crecimiento en este tubo es comparado
con el crecimiento del tubo sin fármaco (control de crecimiento). Si el cultivo es sensible al
fármaco la bacteria no crece y no hay detección de fluorescencia por el equipo, mientras que
en el tubo sin fármaco si debe haber crecimiento reflejado en la fluorescencia detectada. Si
la bacteria es resistente al fármaco los dos tubos deben presentar crecimiento y producir
fluorescencia, que será detectada por el equipo automáticamente.
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Concentraciones de Fármacos
Concentració Alta Concentración Alta
Farmaco n Crítica concentració Farmaco Crítica concentració
n n
Estreptomicina 1µg/ml 4µg/ml Kanamicina 2.5µg/ml No Aplica
Isoniazida 0.1µg/ml 0.4µg/ml Amikacina 1µg/ml No Aplica
Rifampicina 1µg/ml No Aplica Capreomicin 2.5µg/ml No Aplica
a
Etambutol 5µg/ml 7.5µg/ml Ofloxacina 2µg/ml No Aplica
Pirazinamida 100µg/ml No Aplica
MÉTODOS GENOTÍPICOS
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Flujo de trabajo en el GeneXpert
Es un sistema comercial cerrado de la casa Cepheid, basado en PCR en tiempo real, que
permite determinar la presencia de miembros del Complejo M. tuberculosis, así como la
resistencia a Rifampicina a partir de muestras directas de esputo o cultivos positivos.
Esta técnica identifica las mutaciones más frecuentes presentes en el gen rpoB que confieren
resistencia a Rifampicina, hallazgo considerado como importante marcador de TB-MDR.
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Método GenoType® MTBDRplus (Ensayo de Prueba en Línea)
Las tiras de ensayo contienen 6 controles: el control de conjugado (CC), control de amplificación
(AC), el control de tuberculosis (TUB) representa la región del gen rARN 23s presente en todos
los miembros del Complejo M. tuberculosis y el control de las zonas de los loci rpoB, katG e inhA.
Todas deben estar presentes para la validación del resultado. El CC indica la eficiencia del
conjugado para unirse al substrato, la banda CA indica amplificación de la reacción y ausencia
de inhibidores de la muestra, la banda TUB confirma la presencia de complejo Mycobacterium
tuberculosis. Mientras que las bandas correspondientes a los loci rpoB, katG e inhA permiten
conocer si se amplificaron dichas regiones y deben aparecer cuando la banda “TUB” está
presente. Para estudiar el aislado la tira consta de 21 sondas adicionales.
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Tira Genotype
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Mutaciones en la región promotora del gen inhA y su correspondiente WT y bandas de mutación
DIAGNÓSTICO DE LEPRA
“Si hay un diagnóstico que no pueda formularse sin tener la absoluta certeza, es el de la lepra. Si
existe la más mínima duda en el diagnóstico, el enfermo debe mantenerse en observación hasta
que nuevos datos confirmen la enfermedad. Esto evitará el daño sicológico, social y de otro tipo
que podría causársele innecesariamente en caso de diagnóstico equivocado”
EXAMEN CLÍNICO
La Baciloscopia para lepra se utiliza para la clasificación bacteriológica de los pacientes con
lepra en: paucibacilares (índice bacilar igual a 0) y multibacilares (índice bacilar mayor a 0).
En la Baciloscopia para lepra se deben tomar 6 muestras: linfa de oreja derecha, linfa de
oreja izquierda, linfa de 2 lesiones si existen o linfa de codos, rodillas o falange proximal del
tercer dedo de la mano tanto derecha como izquierda. Las 6 muestras tomadas se colocan
en la misma lámina, se hacen las 6 baciloscopias y se saca el Índice Bacilar (I.B.). Para ello
se informa el resultado de cada una de las 6 baciloscopias realizadas, anotando el número
de cruces de cada sitio para poder obtener este índice, el cual es igual a la suma de las
cruces dividido por el número de sitios tomados. Cuando se toman 6 muestras, este índice
puede oscilar entre 0.16 y 3 para los multibacilares y para los paucibacilares será 0.
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Figura 2. Baciloscopia para Lepra. Lectura: se emplea la misma escala utilizada en la baciloscopia para
tuberculosis, leyendo cada una de las 6 baciloscopias.
El índice bacilar es el promedio de las cruces encontradas en cada una de las baciloscopias
de las muestras leídas.
IB= 3 + 2 + 1 + 1 + 1 + 0 = 1.3
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En la orden médica, el médico debe marcar de qué lesiones quiere que el laboratorio tome
las muestras:
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IMPORTANCIA CLÍNICA
La baciloscopia de esputo detecta los enfermos de tuberculosis pulmonar los cuales se deben
buscar entre todos los sintomáticos respiratorios (SR), definidos como aquellos pacientes que
presentan sintomatología respiratoria con tos y expectoración de más de 15 días de evolución,
a quienes se les debe practicar baciloscopia seriada de esputo (3 muestras de esputo).
La Baciloscopia para lepra se utiliza para la clasificación bacteriológica de los pacientes con
lepra en: paucibacilares (índice bacilar igual a 0) y multibacilares (índice bacilar mayor a 0). Este
dato junto con la clínica y la histopatología permitirá ubicar a los enfermos en los grupos de:
lepra indeterminada, lepra tuberculoide, lepra dimorfa o lepra lepromatosa; y a su vez definirá el
control del tratamiento a administrar. Desde el punto de vista epidemiológico permite conocer si
aumentan o disminuyen las fuentes de infección, previniendo la aparición de nuevas fuentes
como son las evoluciones de formas indeterminadas a formas lepromatosas. En lo que respecta
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a la evaluación del programa, cuantificando la proporción de casos nuevos clasificados
bacteriológicamente, la proporción de pacientes multibacilares sometidos a control
bacteriológico durante el tratamiento y la vigilancia, se puede determinar el funcionamiento del
programa en una región.
El tratamiento de los pacientes multibacilares se debe hacer con 3 drogas: rifampicina, dapsona
y clofacimina, durante 1 año; se vigilarán durante 5 años, se les practicará baciloscopia cada 3
meses (tanto en el periodo de tratamiento como en el de vigilancia), y se examinarán sus
convivientes cada 6 meses. Los pacientes paucibacilares recibirán como tratamiento 2 drogas:
rifampicina y dapsona durante 6 meses, se les practicará baciloscopia al terminar el tratamiento
y al final del período de vigilancia, se vigilarán durante 2 años, y se examinarán sus convivientes
una vez al año.
OBJETIVOS:
• Realizar la coloración de Ziehl Neelsen (ZN) en muestras de esputo como
herramienta diagnóstica para diagnóstico de TB pulmonar.
• Aprender a leer, informar e interpretar las baciloscopias.
• Observar los diferentes cultivos de micobacterias.
• Conocer las distintas pruebas empleadas para el diagnóstico de Complejo
Mycobacterium tuberculosis.
Coloración de ZN:
a. Colocar las láminas a colorear en los soportes y cubrirlas totalmente con fucsina
fenicada de Ziehl Neelsen, previamente filtrada.
b. Calentar suavemente con la llama, pasando lentamente el mechero por debajo
hasta que se produzca emisión de vapores, evitando que hierva la fucsina. Cuando
estos sean visibles, contabilizar 5 minutos y dejar de calentar, calentando
nuevamente cuando estos desaparezcan. Este procedimiento se repite hasta que
se completen los 5 minutos teniendo cuidado de no dejar hervir el colorante y de
reponerlo cuando sea necesario. Si ocurre evaporación del colorante, agregar
nuevamente fucsina.
c. Dejar enfriar la lámina, descartar la fucsina, lavar con agua corriente.
d. Decolorar con el alcohol ácido al 3% (v/v) cubriendo la lámina durante 3 minutos
y repitiendo el proceso hasta que sea necesario y no se produzca más
desprendimiento de colorante.
e. Lavar con agua y cubrir con azul de metileno que es el colorante de contraste
durante 1 minuto.
f. Lavar suavemente con agua de chorro. Limpiar la parte posterior de la lámina
para retirar residuos de colorante que puedan interferir con la lectura. Dejar secar
la lámina a TºA.
g. Colocar una gota de aceite de inmersión, evitando que la punta del gotero entre 19
en contacto directo con el extendido y observar al microscopio.
LECTURA E INTERPRETRACIÓN
Al enfocar la lámina con objetivo de inmersión (100X), los bacilos ácido alcohol resistentes
se verán rojos sobre un fondo azul. Se debe recorrer la lámina contando el número de BAAR
que se observan en cada campo en superficie y en profundidad con ayuda del ajuste
micrométrico y colocándo el número en cada cuadro de la cuadrícula de 100 cuadros, hasta
completar los campos que sean necesarios de acuerdo a la positividad encontrada, lo cual
será evidente con la lectura de los primeros campos. Recorrer la lámina en línea recta de
izquierda a derecha por el centro hasta el extremo. Baje o suba y regrese de derecha a
izquierda.
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Promedio Bacilos por campo = Sumatoria baar en 100 campos = 100 campos
100
5 0 0 1 8 1 0 0 3 7
0 0 0 4 0 0 0 3 8 0
1 0 0 0 6 2 0 9 0 5
4 0 0 4 2 5 7 0 0 0
0 0 4 0 0 6 0 0 0 0
8 0 2 0 5 4 0 3 0 0
1 8 1 0 0 0 7 3 0 2
6 0 4 0 0 6 2 2 5 1
0 3 0 4 0 0 0 0 0 0
2 1 0 0 2 0 0 5 4 0
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Informe de resultados
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CUESTIONARIO
Resultado Genotype
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