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Tema-8-Funcion-de-los-Acidos-Nuc...
n_aranda02
Bioquímica
2º Grado en Biología
Facultad de Ciencias Biológicas

Universitat de València
Reservados todos los derechos.

No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
TEMA 8 – FUNCIÓN DE LOS ÁCIDOS NUCLEICOS
1.- Flujo de la información genética
En la expresión de la información genética

(secuencias de DNA) se sintetizan moléculas
(principalmente proteínas) que realizan funciones.
El molde para la síntesis de proteínas es mRNA.

Además, en la síntesis participan tRNA y rRNA.
La expresión génica consta de dos procesos:
 Transcripción: Síntesis de los RNA a partir

de DNA molde.
 Traducción: Síntesis de proteínas a partir
de un molde de mRNA.
2.- Replicación
2.1 – Características generales
 La replicación es semiconservativa.
o Cada hebra de una cadena doble de DNA sirve
de molde para la síntesis de una hebra
complementaria.
 Síntesis de copias nuevas de DNA a partir de un “molde”
preexistente.
o Ocurre una sola vez en la vida de la célula, antes
de la división celular.
o Proceso rápido y exacto, con mecanismos de
reparación eficaces.
o Siempre se da en la dirección 5’→3’.
 Es bidireccional
o Desde el origen de replicación (es una secuencia específica con una
concentración de timinas y adeninas elevada conocida como OriC para
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Reservados todos los derechos. No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
facilitar el reconocimiento a las
proteínas e iniciar el proceso) se dirige
hacia el sitio de terminación en las dos
direcciones.
o En procariotas tiene un único origen.
o En eucariotas, dependiendo del
tamaño de DNA, tiene varios orígenes.
2.2 – Requerimientos para el proceso de replicación
 Molde de DNA preexistente

o Cadena (o fragmento de cadena) simple.
 Cebador ("primer”)
o Pequeño fragmento de RNA (~5
nucleótidos) con el grupo 3’-OH libre,
unido al DNA molde (sintetizado por la
primasa del primosoma) (no es posible
para las polimerasas unirse
directamente y añadir el primer
nucleótido).
 Precursores activados
o Desoxinucleótidos 5’-trifosfato (dATP, dGTP, dTTP, dCTP).
 DNA polimerasas
o Catalizan la formación de enlaces fosfodiéster dirigida por un molde de
DNA (actividad polimerasa 5’→3’) y la corrección de errores (exonucleasa
3’→5’). Son incapaces de iniciar cadena.
o Requieren Mg2+ (bloquean los grupos fosfatos de los nucleótidos que se
están añadiendo. Si le quitamos el magnesio a una célula, la replicación no
se inicia) y un cebador con su extremo 3’-OH libre.
o Hay tres tipos:
- DNA polimerasa I (Pol I): Elimina el cebador mediante una
actividad exonucleasa 5’→3’ y sintetiza DNA en su lugar.
- DNA polimerasa II (Pol II): Función desconocida (quizá similar a Pol
I).
- DNA polimerasa III (Pol III): Síntesis de la nueva cadena de DNA a
partir del cebador.
 Otras enzimas
o Primasa: RNA polimerasa que sintetiza el cebador. Forma parte del
primosoma.
o Helicasa (DNA B): Separa las dos hebras del DNA dúplex. Requiere ATP.
si lees esto me debes un besito

o Girasa (topoisomerasa II): Genera superenrollamiento negativo. Requiere
ATP.
o Ligasa: Une fragmentos nuevos sintetizados.
3.- Requerimientos para el proceso de replicación en procariotas
3.1 – Requerimientos: DNA polimerasas
dNTP sufre la rotura de sus enlaces ricoenergéticos favoreciendo que la reacción vaya hacia
la derecha. Lo mismo ocurre con la rotura del enlace del pirofosfato (ricoenergético).
 Catalizan la formación de enlaces 3’→5’ fosfodiéster.

P𝛾 – Pβ – Pα → Se produce la rotura entre de Pβ – Pα que se une al azúcar en
el sentido 5’.
3’-OH-P-AZ-B. Realmente se adquiere la forma O-P-O de donde viene el
nombre del enlace (fosfo-di-ester).
 Necesitan DNA preexistente: Molde y cebador (primer).
 Crecimiento de la nueva cadena en dirección 5’→3’.
 Funcionan procesivamente.
Procesividad: Capacidad de añadir
nucleótidos sin soltarse.
La Pol III es la más importante ya
que es capaz de añadir muchos
nucleótidos al ser un proceso muy
favorable.
 Procariotas
Pol I: Replicación y reparación
Pol II: Reparación
Pol II: Enzima replicativo (dímero:
holoenzima de la DNA-Pol III)
Eucariotas
Polimerasas con funciones especializadas: α,
β, 𝛾, 𝛿, …, 𝜎. Hay hasta 9 enzimas diferentes
con especializaciones concretas (pueden
distribuirse las funciones de replicación. Una
enzima puede dedicarse a copiar un grupo de
genes concreto en un cromosoma específico)

Tiene actividad exonucleasa 3’→5’ para la corrección de errores.
 Apareamiento incorrecto (T en lugar de C)

 Distorsión en DNA
La polimerasa es capaz de detectar la distorsión producida por la falta de unión
entre nucleótidos no parejos que no forman puentes de hidrógeno (la cadena no es
capaz de cerrarse en esta parte). La enzima cambia su posición para pasar de la
parte con actividad polimerasa a la parte con actividad exonucleasa que elimina el
nucleótido (la misma enzima tiene actividad polimerasa y exonucleasa).
 La actividad exonucleasa 3’→5’ hidroliza nucleótidos incorporando erróneamente.
 Tasa de error (nucleótidos que quedan mal incorporados después de la actividad de
la enzima) de 10-6-10-8 (1 nucleótido cada millón – 1 nucleótido cada 100 millones)
(sigue siendo una tasa de error muy alta).

Los genes son copiados muchísimas veces mientras que el DNA sólo se duplica una vez. Por
este motivo, es muy importante asegurarnos de que la duplicación es correcta. Una
proteína mal formada dentro de un grupo de muchas proteínas funcionales puede ser algo
despreciable.
3.2 – Requerimientos: Otras proteínas y otras enzimas

DNA girasa: La DNA girasa está encargada de desempaquetar el DNA. En eucariotas se
entra unida a proteínas y sufre procesos de enrollamiento que lo hacen inaccesibles para la
DNA-Pol III. Por esta razón es necesario su desenrollamiento para que la replicación se
pueda llevar a cabo.
Helicasa: Esta enzima está encargada de separar la doble hebra de tal forma que se
puedan formar los primers y luego se lleve a cabo la replicación. Utiliza ATP para cortar los
puentes de hidrógeno.
Proteínas SSC: Se encargan de mantener estables las cadenas separadas del DNA
impidiendo su reasociación espontánea.
Primasa: Enzima encargada de la síntesis de los primers para la síntesis del DNA en E.coli.
Ésta inicia los fragmentos de Okazaki. En eucariotas este proceso lo llevaría a cabo la DNA-
Pol I.
DNA polimerasa I: Esta enzima cuenta con tres actividades. Tiene actividad polimerasa
para la síntesis en dirección 5’→3’. Actividad 3’→5’ exonucleasa para la remoción de
nucleótidos erróneos o conocida como proofeading o revisora. Y actividad 5’→3’
exonucleasa, que a partir de un nick (rotura del enlace entre dos nucleótidos vecinos)
resintetiza una porción de DNA removiendo la ya existente. Esta enzima no lleva a cabo el
proceso de replicación. Estaría involucrada en la síntesis de los primers.
DNA polimerasa II: Con actividad exonucleasa 3’→5’ está involucrada en procesos de
reparación de DNA.
DNA polimerasa III: Esta enzima es la que realiza el proceso replicativo, su función es la
síntesis de DNA. También cuenta con actividad revisora 3’→5’ exonucleasa.
Ligasa: La ligasa va a unir los fragmentos de Okazaki o aquellas zonas del DNA donde se
hayan producido nicks con el uso de energía.
4.- Proceso de replicación

4.1 – Iniciación
1. La replicación se inicia en lugares específicos.
 En procariotas el origen es único, y se
llama locus OriC.
o Contiene secuencias ricas en
AT y específicas para el
reconocimiento de OriC, y
cuatro sitios de unión para la
proteína DNA A.
 La unión de la DNA A inicia el proceso.
OriC reconoce la secuencia y la DNA A abre
de 4 a 6 nucleótidos para que la helicasa
comencé a abrir el resto de la cadena y
comience el proceso.
2. La helicasa, DNA B, separa las dos hebras de
DNA.
 Se forma un ojo y dos horquillas de replicación.
 El proceso genera tensión (se produce un superenrollamiento positivo
generados delante de la cadena de replicación por el que ni la helicasa ni la
polimerasa son capaces de pasar) que es relajada por la acción de la DNA
girasa.
o La topoisomerasa II/girasa introduce superenrollamiento negativo
(con consumo de ATP). Corta una de las dos cadenas para que se
pueda desenrollar y continuar con la replicación.
3. Las cadenas simples se estabilizan por las SSB (proteínas de unión a cadena simple).
el podcast para entender que la vida da mas vueltas que la silla de un peluquero
4.2 – Elongación
4. La primasa del primosoma sintetiza
cebadores de RNA doble en las hebras
simples de la horquilla.
5. La Pol III (formada por un dímero que tiene
que copiar las dos cadenas a la vez por lo que
hay una en dirección 5’→3’ y otra en
dirección 3’→5’) sintetiza nuevo DNA a partir
del cebador.
 Siempre en dirección 5’→3’.
o La hebra guía se sintetiza de
manera continua.
o La hebra retardada forma un
bucle donde la síntesis de
DNA ocurre de manera
discontinua en fragmentos
de Okazaki.
6. La Pol I elimina los RNA cebadores y sintetiza DNA en su lugar.
 Tiene actividad exonucleasa 3’→5’ y polimerasa
5’→3’.
7. Los fragmentos de la hebra retardada son ligados por la
DNA ligasa.
La replicación es semidiscontinua.

5.- Mutaciones
Las mutaciones son cambios en la secuencia del DNA. Hay varios tipos:
 Sustitución de un par de basas por otro.

 Eliminación/Deleción de parte de la secuencia.
 Inserción de pares de bases.
Pueden ocurrir de forma espontánea:
 Transiciones A↔G o T↔C debidas a tautomerizaciones.

o Amino (NH2) → Imino (=NH)
o Ceto (>C=O) → Enol (≥C-OH)
Pueden deberse a agentes mutagénicos:
 Radiación ultravioleta
 Reactivos químicos
 Moléculas aromáticas planas (agentes intercalantes) (utilizados como
antitumorales)
Mutación por tautomerización: Apareamiento anómalo de las bases debido a una

transición.
Mutación por radiación: La luz ultravioleta produce dímeros de pirimidina.
6.- Mecanismos de reparación

La elevada fidelidad de las copias de ADN se debe a:
 La especificidad enzimática de la maquinaria replicativa.

 La corrección de errores de las DNA polimerasas.
o Detectan nucleótidos incorrectos y los eliminan “hacia atrás” (exonucleasa
3’→5’).
 Los mecanismos de reparación post-replicativos.
o Reparación directa
- La DNA fotoliasa con energía de la luz elimina dímeros de
pirimidina.
o Reparación por escisión de bases
- Las bases dañadas se retiran y se reemplazan
o Reparación por escisión de nucleótidos
- Se elimina y se reemplaza un fragmento en torno a la zona dañada
 La escinucleasa urvABC escinde 12 nucleótidos en la zona
dañada.
 Regeneración a cargo de la DNA Pol I y la DNA ligasa.
 Tasa de error de 10-9-10-10 (1 hasta 1000 billones).
7.- Replicación en eucariotas

Es más compleja y más lenta que en procariotas debido a que hay un mayor tamaño y
mayor complejidad del genoma.
En procariotas hay múltiples orígenes de replicación. Cada uno representa una unidad de
replicación (replicón) bidireccional.
La replicación se encuentra regulada de acuerdo con el ciclo celular. Síntesis de DNA

limitada a las fases, y coordinada con la división celular (mitosis).
8.- Transcripción
Se produce la síntesis de RNA a partir de un “molde” de DNA.
 Siempre se da en la dirección 5’→3’.

 No requiere cebador (las RNA polimerasas pueden iniciar cadena).
 Implica segmentos cortos (regiones codificadoras) que no se transcriben
necesariamente de manera simultánea.
Sólo una hebra del DNA actúa como molde.
 El nuevo RNA es complementario de la habrá molde (-).
 El nuevo RNA tiene la misma secuencia que la hebra codificadora (+).
 Tiene U en lugar de T.
Como referencia, la dirección de la hebra codificadora se utiliza como dirección del gen.
Las secuencias codificadoras (genes) pueden encontrarse en cualquiera de las dos cadenas
de DNA.
La dirección de los genes se indica con flechas
8.1 – Requerimientos
Unidad de transcripción de DNA con promotor y terminador.
 Promotor
o Secuencia específica de tamaño variable.
o Poseen dos secuencias consenso a ~-35 (secuencia primo) y -10 (secuencia
TATA) pb respecto TSS.
o Indica a la RNA polimerasa el sitio, la fuerza y la frecuencia de unión.
- Promotor fuerte: La secuencia consenso es similar al promotor.
Transcripción frecuente.
- Promotor débil: La secuencia consenso no es parecida.
Transcripción infrecuente.
 RNA polimerasas dependientes de DNA

Mecanismo:
o Utiliza ribonucleótidos activados (NTP): Trifosfatos de ribonucleósidos.
o Enlaces 3’→5’ fosfodiéster, siguiendo reglas apareamiento DNA-RNA.
o La cadena de RNA crece dirección 5’→3’.
o No tiene actividad exonucleasa 3’→5’ correctore de errores.
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o La velocidad de polimerización lenta 35-90N/s y tasa de error 10-5. (Da igual
que cometa errores ya que copia un fragmento muchísimas veces por lo
que no son significativos)
o La RNA polimerasa se une a la cadena y lee de 3’→5’ la cadena molde y crea
la cadena 5’→3’ por lo que la cadena que se genera es igual a la cadena
codificante.
o Similar estructura en procariotas y eucariotas: Origen evolutivo.
o Procariotas (E.coli): Una única, sintetiza todos los RNA (mRNA, rRNA, tRNA)
o Polimerasa en eucariotas
- RNA-pol I (nucleolo, rRNA 18S, 5.8S, 28S)
- RNA-pol II (nucleoplasma, mRNA)
- RNA-pol III (nucleoplasma, tRNA, rRNA 5S y otros RNA pequeños)
o Polimerasa en procariotas
Complejo de cinco tipos polipéptidos:
α, β, β’, 𝜔, 𝜎 (en eucariotas tiene más
complejos).
El factor 𝜎 reconoce el sitio de inicie
permite la unión a la cadena molde.
α2, β, β’ y 𝜔 forman la enzima central
que cataliza la síntesis de RNA.
8.2 – Iniciación, elongación, terminación
 Iniciación
1. La holoenzima α2ββ’𝜔𝜎 reconoce el promotor de una unidad de
transcripción
o El reconocimiento se debe al factor 𝜎.
- Existen distintos factores 𝜎 para distintos tipos de
promotores.
2. Apertura del promotor
o Desenrollamiento y separación de las cadenas de DNA en la zona
de inicio.
3. Unión del primer nucleótido trifosfato a la RNA polimerasa
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o Suele ser ATP o GTP
o Se une por apareamiento de bases a la hebra molde de DNA
 Elongación
4. Unión sucesiva de los siguientes nucleótidos
o Cada uno se une al 3’-OH libre del anterior por enlace 3’→5’
fosfodiéster.
o Se van seleccionando por apareamiento específico con la hebra de
DNA molde.
- Se forma una hélice dúplex híbrida DNA/RNA de ~8 pb.
o La región que contiene la RNA polimerasa y la hélice híbrida se
llama burbuja de transcripción.
5. Avance de la burbuja de transcripción
o La hélice de DNA se ha desenrollado por delante y enrollado por
detrás.
Tenemos una burbuja de unos 8-10 nucleótidos que desenrolla por
delante y enrolla por detrás por lo que no se produce
superenrollamiento y no necesitamos una enzima extra que abra la
hebra.
 Terminación
6. Llegada a la señal de terminación en la hebra molde.
o Región autocomplementaria rica en GC seguida de secuencia rica
en AT.
- Se forma una estructura en horquilla en el RNA transcrito.
- La polimerasa se para y el híbrido DNA/RNA se vuelve
inestable.
- La transcripción finaliza en los residuos de U que siguen a la
horquilla (la secuencia de terminación es rica en A que se
une a U por dobles enlaces que son más fáciles de romper
que los triple enlaces).
7. Disociación
o Disociación del híbrido DNA/RNA
o Fusión y enrollamiento del DNA abierto.
o Desprendimiento de la RNA polimerasa
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Hay varias formas de terminar dependiendo de los genes de los
organismos.
o Terminación dependiente del factor 𝝆 (en algunos casos)
- Actividad de la DNA/RNA helicasa dependiente de ATP, que
disocia el complejo de transcripción (en este caso no se
produce por desestabilización como en el caso anterior,
sino por la adición de una enzima con función helicasa que
la separa).
8.3 – Regulación de la transcripción en procariotas

Es el principal control de la expresión génica.
El primer nivel de control regula la afinidad de la RNA polimerasa por promotor que
depende de la secuencia del promotor y del tipo de factor 𝜎.
Hay genes de expresión constitutiva que producen una transcripción continua.
También hay genes inducibles con una transcripción dependiente de las condiciones o las
necesidades metabólicas. Se regulan a través de centros reguladores que unen activadores
o represores transcripcionales.
La relación conjunta en genes que participan en una misma ruta son unidades de expresión
llamadas operones.
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8.4 – Modelo del Operón de Jacob y Monod
 Gen regulador (i)

o Contiene su propio promotor
o Codifica la proteína represora (represor)
 Operón
o Secuencias de regulación
- Promotor
- Operador
o Genes estructurales
- Genes estructurales (codifican proteínas que participan en una
misma adaptación)
Puede regularse por inducción o por represión.
 Ejemplo de regulación por inducción: Operón de la lactosa

Regula en paralelo la expresión de encimas relacionadas con la utilización de
lactosa en ausencia.
o Β-galactosidasa (z) (rotura de la galactosa para dar glucosa)
o Galactosido permeasa (y) (introduce lactosa en la célula)
o Tiogalactosido transacetilasa (a)
(modifica la molécula para que sea
reconocible y sea posible utilizarse)
o En ausencia de lactosa
- No hay inductor
- El represor sin inductor se
une al operador
- Impide a la RNA polimerasa
transcribir z, y, a.
o En presencia de lactosa
- Se forma el inductor
alolactosa
- El represor con inductor
inactiva al represor
- Los genes z, y, a se
transcriben
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 Ejemplo regulación por represión: Operón del Triptófano
Regula en paralelo la expresión de enzimas relacionadas con la síntesis de Trp que
actúa como “correpresor”.
o En ausencia de Trp
- El represor no puede
unirse al operador
- La RNA polimerasa
transcribe los genes
relacionados con la síntesis
de Trp
o En presencia de Trp
- El Trp se une al represor
- El complejo activo
represor/Trp se une al
operador
- La RNA polimerasa queda
bloqueada
El Trp se unen al represor inactivo
volviéndolo activo y cambiando su
conformación estructural que es capaz de unirse y evitar el paso de la polimerasa y
evitar la síntesis de Trp.
9.- Procesamiento post-transcripcional

Intervienen RNAs catalíticos.
 mRNA
Los mRNA no se procesan (sólo
eliminación y adición de nucleótidos y
modificación química de bases).
 tRNA y rRNA
Modificación post-transcripción de
transcritos primarios.
Corte y modificación de transcripción
primarios.
El tRNA se modifican para hacerlo más
específico.
El rRNA sufre transcripción, metilación de
bases y cortes endonucleotídicos (dentro
de la secuencia de nucleótidos) liberando
el RNA ribosomal.
La maduración de los rRNA y ensamblaje
con proteínas para formar los ribosomas ocurre al mismo tiempo (en eucariotas en
el núcleo).
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10.- Transcripción en eucariotas
Tiene lugar en el núcleo.
Existen tres tipos de RNA polimerasas (cada una reconoce un tipo de promotor).
 RNA polimerasa I (sintetiza precursores de los rRNA)

 RNA polimerasa II (sintetiza precursores de los mRNA)
 RNA polimerasa III (sintetiza precursores de los tRNA)
Promotores complejos y secuencias potenciadoras.
 Caja TATA entre -30 y -100 aa.

 Otras secuencias (caja CAAT, caja GC).
Son necesarios los factores de transcripción (señales celulares que se integran en el

promotor de sus genes y producen la transcripción de genes).
 Se unen a los promotores y secuencias potenciadoras

 Guían la unión de la polimerasa
10.1 – Procesado en eucariotas

En eucariotas, todos los productos de la transcripción deben procesarse. Hay 1 promotor
para 1 gen.
En los pre mRNA se modifican los extremos 5’ y 3’.
 La caperuza 5’ (CAP) se coloca en el extremo 5’ se añade 7-metilguanosina y se

metilan algunas ribosas. Se produce el reconocimiento del primer triplete para la
traducción.
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 En el extremo 3’ se añade una cola de poli (A) de ~250 residuos. Es un sistema de
protección contra la degradación.
 Maduración
o Eliminación de intrones por corte y empalme
- Llevada a cabo por partículas ribonucleoproteicas nucleares
pequeñas (snRNPs).
 Contienen RNA catalítico (ribozimas)
- El conjunto mRNA + snRNPs se llama ayustosoma.
o Algunos RNA son capaces de automadurarse (RNA autocatalítico)
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 Ejemplo de procesado en eucariotas: Ovoalbúmina
 Procesado en eucariotas: Ayuste alternativo

o No a la teoría “un gen, una proteína”.
o Varias isoformas de mRNA, codifican proteínas distintas con funciones
diferentes.
o Hasta un 60% enfermedades genéticas por mutaciones de ayuste.
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o Se pueden obtener secuencias distintas a partir de un mismo fragmento.
Puede deberse a la adicción de colas de poli-A, tener múltiples
promotores… Pueden producirse formas malignas que produzcan
enfermedades.
o Isoforma canónica = Conformación habitual.
11.- Traducción
Síntesis de proteínas a partir de un molde de mRNA.
 En procariotas ocurre inmediatamente después de la

transcripción.
o El transcrito primario sirve de mRNA.
o Transcripción y traducción pueden ocurrir
simultáneamente.
 En eucariotas está separada de la transcripción en
espacio y tiempo.
o El transcrito primario se procesa y el mRNA se
transporta fuera del núcleo.
o Transcripción y ayuste (procesado) al mismo
tiempo.
o Permite una regulación más compleja.
11.1 – Requerimientos para la traducción
 mRNA
o Molde con la secuencia organizada en codones.
- Los codones son tripletes de bases del mRNA.
- Son “leídos” por apareamiento específico con anticodones de los
aminoacil-tRNA.
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- Debe contener al menor una pauta abierta de lectura (en fase).
 En procariotas suelen existir mRNAs policistrónicos (o
poligénicos) que contienen varias pautas abiertas de
lecturas en tándem.
 tRNA
o Específicos para cada uno de los 20 aminoácidos (al menos uno por
aminoácido).
- Transportan los aminoácidos activados hasta el ribosomas.
o Cada uno contiene un anticodón (complementario con un codón del
mRNA).
 Aminoacil-tRNA sintetasas
o Activan y unen un aminoácido a cada tRNA
- Específicas para cada aminoácido
- Interpretan el código genético
o Requieren ATP
 Ribosoma
o Complejo ribonucleoptoteico de rRNA y proteínas.
o Une el mRNA molde y los distintos tRNA.
o Cataliza la formación de los enlaces peptídicos de la nueva proteína.
 Diversos factores proteicos
11.2 – Características del código genético

Es la relación entre la secuencia de bases del DNA (o de su mRNA transcrito) y la secuencia
de aminoácidos de las proteínas.
 No tiene ambigüedades (1 codón → 1 aminoácido)

 Está degenerado
o 64 tripletes posibles para 20 aminoácidos más la parada
 Todos los aminoácidos, excepto Trp y Met, se codifican por más de un codón
 Hay tres codones de terminación (UAA, UAG y UGA)
 Los codones sinónimos difieren casi siempre en la última base (las dos primeras
especifican la identidad del aminoácido)
 Es casi universal (mitocondrias y protozoos ciliados tienen algunos codones
diferentes)
 Las secuencias se leen a partir de un punto de inicio (AUG)
o El codón de iniciación establece el marco o pauta de lectura
o El resto de codones se leen a partir del de iniciación
o El código no solapa
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11.3 – Requerimientos
 mRNA
Marco abierto de lectura (ORF, Opened Reding Frame) desde un codón de inicio
(AUG) a un codón de parada (Stop).
Polisomas o polirribosomas (varios ribosomas traduciendo a la vez).
o Procariotas
- mRNA policistrónicos (una secuencia de mRNA codifica para varias
proteínas) consecuencia de operones.
- mRNA no sufre modificación post-transcripcional.
o Eucariotas
- mRNA siempre monocistrónicos (una secuencia de mRNA codifica
para una proteína).
- mRNA se modifica durante la maduración (CAP, cola poli-A, ayuste).
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 tRNA
Moléculas “adaptadoras”. Transforman lenguaje de nucleótidos a lenguaje de
aminoácidos.
o Se unen a codones específicos y transportan aminoácidos específicos.
o Anticodón y sitio aceptor del aminoácido están en brazos opuestos.
Estructura Modificaciones Estructura

secundaria que hacen únicos terciaria
e identificables los
tRNA
Muchas bases poco comunes.
o Impiden el apareamiento normal.
o Facilitan interacciones especiales.
- Relacionadas con su estructura
terciaria.
- Relacionadas con interacciones con la aminoacil-tRNA sintetasa y
proteínas ribosómicas.
Aminoacil t-RNA.
o Intermediario de la síntesis de proteínas.
- Éster de tRNA + aminoácido.
 Aminoacil-tRNA sintetasa
Catalizan la adición de un aminoácido sobre su tRNA.
Dos etapas catalizadas por la misma enzima:

o Activación del aminoácido
- Formación del intermediario activado aminoacil-AMP (posee un
enlace ricoenergético que al romperlo permite añadir el tRNA).
 Se consume ATP y se desprende pirofosfato (PPi).
- Una pirofosfatasa hidroliza el PPi para impulsar la reacción.
 Consume una segunda molécula de ATP.
o Transferencia del aminoácido activado a su tRNA específico
- Se transfiere sobre el grupo 2’-OH o 3’-OH libre del tRNA.
- Se forma un aminoacil-tRNA mediante enlace éster.
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Es enormemente específica por reconocimiento molecular doble.
o Para cada aminoácido:
- Reconocen propiedades de carga, hidrofobicidad, tamaño.
o Para cada tRNA correspondiente:
- Interacción específica con brazo aceptor y con brazo del anticodón.
o Conocen e interpretan el código genético.
Con actividad correctora de errores. A partir de este punto ya no hay capacidad
correctora de errores
o Conocen sitios especiales de “revisión”.
- Si el aminoácido es incorrecto se hidroliza el enlace éster del tRNA
con el aminoácido.
Alta fidelidad.
Es el aminoacil-tRNA sintetasa la que evita las mutaciones en proteínas.
 Ribosoma
Coordina interacciones entre el molde (mRNA) y los adaptadores (tRNAs).
Complejo supramolecular de RNA y proteínas (70S, procariotas; 80S eucariotas).
o La funcionalidad principal se debe a los rRNA (ribozimas).
o Tres tipos de rRNA (23s, 16s, 5s en procariotas).
o Cuatro tipos de rRNA (28S, 18S, 5.8S, 5S en eucariotas).
o 2 subunidades (no son adicionales):
23

- Grande
 50S, procariotas; 60S eucariotas
 función de catálisis (actividad peptidil transferasa)
- Pequeña
 30S procariotas, 40S eucariotas
 Función de reconocimiento
Las proteínas del ribosoma tienen una función estructural.
En procariotas el proceso de traducción y transcripción es simultáneo.

Estructura interna:
o Sitio A (aminoacil-): tRNA cargado con el AA siguiente.
o Sitio P (peptidil): Con el tRNA (último AA adicionado) con cadena
polipeptídica en crecimiento.
o Sitio E (salida): Con el tRNA descargado de su AA en polipéptido.
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La cadena polipeptídica naciente sale
por un túnel de la subunidad grande.
12.6 – Características de la traducción

La dirección de la síntesis de proteínas es siempre N-terminal → C-terminal (a este último es
donde se añaden aminoácidos).
El mRNA molde se lee en dirección 5’ → 3’.
El aminoácido que se incorpora viene determinado sólo por las interacciones codón-
anticodón.
Excepto en el caso del 1er aminoácido, donde se reconoce específicamente un

aminoacil-tRNA de iniciación por el factor de iniciación 2 (IF2).
Se reconocen principalmente las dos primeras bases del codón (balanceo de las bases).
Existe cierta libertad en el apareamiento de la tercera base (la tercera base se lee con
menos eficiencia para que el código genético pueda desarrollarse).
La estereoespecificidad es importante para la formación del enlace peptídico.
No pueden utilizarse D-aminoácidos (L-aminoácidos forman proteínas ya que hay una

estructura estereoespecífica en el ribosoma y aminoacil-tRNA-sintetasa y sólo
selecciona a conformaciones L).
 Iniciación
1. Formación del complejo de iniciación 70S
Previamente se ensambla un complejo de 30S junto con factores de
iniciación (proteínas) que contiene:
o mRNA unido a la subunidad 30S con la secuencia de Shine-Dalgarno
interaccionando con rRNA 16S.
25
o fMet-tRNAmet (el codón de iniciación es una forma modificada de
metionina, así nos aseguramos del correcto reconocimiento) unido
en el sitio P y apareado con el codón de iniciación.
El ensamblaje es ayudado por los factores de iniciación IF1, IF2, IF3
(requiere GTP).
Si la unión del primer AUG es
correcto, se hidroliza el GTP.
Los factores de iniciación 1 y 3
aseguran el reconocimiento de la
secuencia de Shine-Dalgarno.
Después enganchamos la
subunidad grande que hidroliza
GTP (factor de iniciación 2).
o Procariotas
- Tras la identificación del codón AUG de iniciación, se une
fMet-tRNAmet.
- En el extremo 5’ de mRNA, cerca del AUG, existe secuencia
Shine-Dalgarno complementaria al segmento de rRNA 16S
(subunidad 30S).
En la secuencia del mensajero hay una secuencia Shine-
Dalgarno que se encuentre a 5-6 sitios de la secuencia que
se tienen que leer. La subunidad 30S se une a esta
secuencia que se encuentre a la distancia adecuada para
añadir el primer ftRNA correspondiente.
o Eucariotas
- Poseen un tRNA especial iniciador Met-tRNAiMet (las
metioninas iniciadoras son diferentes a las que aparecen en
el medio de la cadena en ambos casos).
- No tienen secuencia Shine-Dalgarno (se reconoce el primer
AUG gracias a la estructura CAP. El primer AUG a partir de
esta estructura será el de iniciación. Necesitaremos más
factores de iniciación para asegurar de que todo es
correcto).
26

- CAP reconocido por 40S por movimiento 5’→3’, ayudada
por eIF-4. Una vez se ha leído la estructura CAP, la
estructura se mueve con consumo de energía hasta llegar al
AUG iniciación. La cola de poli-A ayuda en la estabilización.
 Elongación
2. Transporte del segundo aminoacil-tRNAs (y sucesivos) al sitio A.
o Depende de factores de elongación EF-Tu y EF-Ts y de GTP.
o Transferencia de grupo peptidil al tRNA del sitio A.
3. Formación del enlace peptídico.
o Transferencia de grupo peptidil al tRNA del sitio A.
4. Translocación simultánea tRNAs y mRNA.
o Depende del factor de elongación EF-G y de GTP.
- Movimiento del mRNA en la distancia de un codón.
- Movimiento del tRNA vacío al sitio E.
- Movimiento del peptidil-tRNA al sitio P (sitio A queda libre).
5. Disociación del tRNA libre.
La actividad peptidil-transferasa precisa de actividad enzimática.
27
 Terminación
Formación del enlace peptídico gracias a la actividad peptidil-transferasa.
La peptidil-
transferasa es una
ribozima, es decir, la
actividad la actividad
enzimática tiene
lugar por el RNA de
la subunidad
pequeña.
6. Llegada de codón de parada (UAA, UGA, UAG) del mRNA al sitio A.

o El codón reconocido por factor de liberación (RF1 o RF2) (sólo
proteínas no tRNA).
o Reconocimiento ayudado por factor de liberación RF3 (requiere
GTP).
7. Hidrólisis del enlace éster que une el polipéptido al tRNA y liberación del
polipéptido.
8. Liberación del mRNA y del último tRNA y disociación del complejo de
traducción.
o Requiere el factor de liberación del ribosoma (RRF) y GTP.
28

RF1 o RF2 son factores de liberación, no es tRNA.
Es una enzima que hidroliza el carboxilo del
último aminoácido y el tRNA unido al sitio P.
Para separar las subunidades utilizamos otros
factores que utilizan energía
12.7 – Mecanismo de traducción: Modificaciones y exportación de proteínas
 Modificaciones post-traduccionales de las proteínas

o Co-traduccionales: Elimicación del grupo formilo, o formil-met o Met en
eucariotas o de un péptido N-terminal.
o Post-traduccionales: Glicosilación, fosforilación, hidroxilación, muchas más,
etc.
 Destino de las proteínas
o En la región Nt hay secuencia de hidrófobica de aa (péptido señal).
o Péptido señal dirige ribosoma al RE y proteína sale al lumen del RE.
o Proteínas de secreción o de membrana plasmática: Síntesis en ribosomas
asociadas a RE (o MP en procariotas), en formación de vesículas y proteínas
a secreción o a membrana plasmática.
o Proteína de núcleo o la mitocondria o cloroplastos: Fabricadas en
ribosomas del citosol, con aminoácidos (secuencias señal) internas (núcleo)
o en N-terminal (mitocondrias, cloroplastos) que las dirigen a destino final.
o Péptido señal eliminado por proteólisis específica.
29
12.- Regulación de la expresión génica

30

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Tema-8-Funcion-de-los-Acidos-Nuc...

Facultad de Ciencias Biológicas

Reservados todos los derechos.

En la expresión de la información genética

El molde para la síntesis de proteínas es mRNA.

La expresión génica consta de dos procesos:

 Transcripción: Síntesis de los RNA a partir

2.2 – Requerimientos para el proceso de replicación

 Molde de DNA preexistente

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3.- Requerimientos para el proceso de replicación en procariotas

 Catalizan la formación de enlaces 3’→5’ fosfodiéster.

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 Apareamiento incorrecto (T en lugar de C)

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3.2 – Requerimientos: Otras proteínas y otras enzimas

4.- Proceso de replicación

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 Sustitución de un par de basas por otro.

Pueden ocurrir de forma espontánea:

 Transiciones A↔G o T↔C debidas a tautomerizaciones.

Pueden deberse a agentes mutagénicos:

Mutación por tautomerización: Apareamiento anómalo de las bases debido a una

Mutación por radiación: La luz ultravioleta produce dímeros de pirimidina.

6.- Mecanismos de reparación

 La especificidad enzimática de la maquinaria replicativa.

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7.- Replicación en eucariotas

La replicación se encuentra regulada de acuerdo con el ciclo celular. Síntesis de DNA

 Siempre se da en la dirección 5’→3’.

Sólo una hebra del DNA actúa como molde.

La dirección de los genes se indica con flechas

 RNA polimerasas dependientes de DNA

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8.2 – Iniciación, elongación, terminación

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8.3 – Regulación de la transcripción en procariotas

Hay genes de expresión constitutiva que producen una transcripción continua.

 Gen regulador (i)

Puede regularse por inducción o por represión.

 Ejemplo de regulación por inducción: Operón de la lactosa

9.- Procesamiento post-transcripcional

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 RNA polimerasa I (sintetiza precursores de los rRNA)

Promotores complejos y secuencias potenciadoras.

 Caja TATA entre -30 y -100 aa.

Son necesarios los factores de transcripción (señales celulares que se integran en el

 Se unen a los promotores y secuencias potenciadoras

10.1 – Procesado en eucariotas

En los pre mRNA se modifican los extremos 5’ y 3’.

 La caperuza 5’ (CAP) se coloca en el extremo 5’ se añade 7-metilguanosina y se

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 Procesado en eucariotas: Ayuste alternativo

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 En procariotas ocurre inmediatamente después de la

11.1 – Requerimientos para la traducción

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11.2 – Características del código genético

 No tiene ambigüedades (1 codón → 1 aminoácido)

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Estructura Modificaciones Estructura

Dos etapas catalizadas por la misma enzima: