Ana Ximena Alcántara Santiago <ximenaalcantara@ciencias.unam.

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Biotecnología, Tarea 4
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Formularios de Google <forms-receipts-noreply@google.com> Thu 4 May 15:36

To: <ximenaalcantara@ciencias.unam.mx>

Gracias por rellenar Biotecnología, Tarea 4

Esto es lo que se recibió.

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Biotecnología, Tarea 4
En base a lo que revisamos en clase y a lo que aparece en este capítulo
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK26887/ o en tu libro favorito de biología molecular.

Correo *

ximenaalcantara@ciencias.unam.mx

Nombre *

Ana Ximena
Apellido *

Alcántara Santiago

Observa el siguiente video:

http://youtube.com/watch?v=SMtWvDbfHLo

Indica al menos 3 omisiones que se hacen en el video

1. La estructura detallada de la RNA polimerasa, pues contiene poros conocidos como exit
Groove, así como el cofactor Mg2+ en el sitio activo necesario para polimerizar.
2. No menciona que después de que el complejo se abra, se inicia la iniciación abortiva
3. No hace la distinción entre rho dependiente y rho independiente

Elabora una lista con los pasos, enzimas, moléculas necesarias para pasar de una
secuencia de DNA a el transcrito ya maduro.

REPLICACION DNA
Se necesitan OriC u otros sitios de origen de la transcripción, Proteínas que reconocen el
origen de Replicación (en bacterias DnaA y en eucariotas ORC (Complejo de Orígen de
Replicación)), así como otras enzimas como las helicasas, ligasas, topoisomerasas,
DNApolimerasas, cebadores, y en eucariontes telomerasas.
En resumen, la replicación se produce en tres pasos principales: la apertura de la doble hélice
y la separación de las hebras de ADN, el cebado de la hebra de la plantilla y el ensamblaje del
nuevo segmento de ADN. Durante la separación, las dos hebras de la doble hélice de ADN se
desenrosca en una ubicación específica llamada origen. Varias enzimas y proteínas trabajan
juntas para preparar, o preparar, las hebras para la duplicación. Finalmente, una enzima
especial llamada ADN polimerasa organiza el ensamblaje de las nuevas hebras de ADN

TRANSCRIPCIÓN
Se necesita: Factor Sigma (σ), Secuencias que se reconoce en el DNA para iniciar la
transcripción, RNApol, (en eucariotes RNA pol I: pre – rRNA (excepto la subunidad 5S)
RNA pol II: pre – mRNA, RNA nucleares pequeños (snRNA)
RNA pol III: pre – tRNA, rRNA 5S, otros snRNA)
En resumen, la transcripción se lleva a cabo de la siguiente manera:
Paso 1: Iniciación

La iniciación es el comienzo de la transcripción. Ocurre cuando la enzima ARN polimerasa se

une a una región de un gen llamado promotor. Esto indica que el ADN se desenrolle para que
la enzima pueda "leer" las bases de una de las hebras de ADN. La enzima ahora está lista
para hacer una hebra de ARNm con una secuencia complementaria de bases.

Paso 2: Alargamiento

El alargamiento es la adición de nucleótidos a la hebra de ARNm. La ARN polimerasa lee la

hebra de ADN desenrollada y construye la molécula de ARNm, utilizando pares de bases
complementarias. Durante este proceso, una adenina (A) en el ADN se une a un uracilo (U) en
el ARN.

Paso 3: Terminación

La terminación es el final de la transcripción, y ocurre cuando la ARN polimerasa cruza una

secuencia de parada (terminación) en el gen. La hebra de ARNm está completa y se
desprende del ADN.

MADURACIÓN
1. Modificación covalente de los extremos del DNA (5’capping y 3’ poliadenilación). Para el 5’
capping se necesita un nucleotido de Guanina modificado y tres enzimas; una fosfatasa, una
guanil transferasa, y una metil transferasa, estas se unen a la posición Ser5 de la cola de la
RNApol.
2. Remover las secuencias de intrones vía RNA splicing. Vía dos reacciones de fosforil-
transferencia secuenciales. Se necesitan ataques núcleo filicida. Primero, un nucleotido de
adenina específico de la secuencia del intrón ataca el sitio 5’ de splice para cortar el esqueleto
de azúcar fosfató del RNA, así el corte del 5’ se une covalentemente al nucleotido de adenina
y se forma un loop en la molécula de RNA. Luego, el extremo libre 3’OH al final del expón
reacciona con el inicio del siguiente exon y, gracias a esto, forma un lariat con la secuencia del
intron ya afuera, donde después se rompen en distintos nucleotidos que se reciclan. Esto es
catalizado por snRNPs y otras proteínas que forman juntos el spliceosoma, que cataliza la
formación del lariat. Este spliceosoma produce una serie de reacomodaciones de RNA vía
ATP hidrolisis
La larga cola C-terminal de la RNApol coordina esos procesos.
3. Poliadenilación. Se necesitan proteínas de unión al RNA como la CPSF y la CstF, un
hexámero AAUAAA, una secuencia CA , PAP, proteína de unión poliA, RNApol. Se aclara que
la poliA polimerasa no necesita un molde. Ya que el clivaje ocurre, el RNA sintetizado emerge
de las polimerasas sin 5’cap, por lo que lo degrada una exonucleasa y eventualmente esto
hace que la RNApol suelte su grip del molde y se termine la transcripción.

¿Qué características tiene una proteína de unión a DNA?

Necesita un dominio de unión al DNA, por lo que tiene que tener especial afinidad ya sea por
dna bi o monocatenario. Los dominios pueden incluir dedos de Zinc o Zipper de leucinas.
Suelen tener afinidad al major groove del DNA.

Define cada uno de los elementos de la siguiente lista: BZIP, Leucine Zipper,
Helix-Loop-Helix, Helix-Turn-Helix

1. BZIP. Proteínas básicas de leucina, son factores de transcripción multifuncionales que se

pueden identificar en los genomas de eucariontes por una región de vinculación al DNA
seguida por un motif de Zipper de leucina.
2. Leucine Zipper. Motif estructural súper secundario de proteínas que contiene alfa hélices
paralelamente que crea así fuerzas de adhesión, así como residuos de Leu en una cara de la
hélice y sirve como un módulo de dimerizacion
3. Helix-Loop-Helix. Otro motivo estructural proteico propio de factores de transcripción. Este
medía la dimerización protéica
4. Helix-turn-Helix. Es igual que el anterior pero la diferencia recae en que este último regula la
expresión génica a través del DNA binding

Secuencia del problema de hoy

considera que la secuencia superior empieza en 5' y termina en 3' Si se replicara
la secuencia de la cadena lider escribe la secuencia de la nueva cadena
sintetizada y su polaridad (5'-AAAA-3')
contesta en minúsculas

5’aga ctg tgg gua acc gaa gca tct gga3’

De la misma secuencia, busca el marco de lectura más probable (sin codones de

paro) y pon la secuencia del posible gen (5'-AAAA-3')
contesta en minúsculas

5’ tccag atg ctt cgg tta ccc aca guc u 3’

Del marco de lectura probable, pon la secuencia de DNA que se usa de molde
para la transcripción (5'-AAAA-3')

5’ aga ctg tgg gta acc gaa gca tct gga3’

De la secuencia anterior, escribe la secuencia de la proteína resultante

(N-Val-Glu-Gly-N)

R L W V T E A S G

Código genético
Procesamiento
 ¿Qué otras posibilidades de transcritos maduros se pueden obtener de la
combinación anterior?

EXON1-EXON3

EXON1-EXON2

EXON2-EXON3

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