La transcripción es el primer paso de la
expresión génica, el proceso por el cual la
información de un gen se utiliza para generar un producto funcional, como una proteína.
El objetivo de la transcripción es producir una copia de ARN de la secuencia de ADN de
un gen. En el caso de los genes codificantes, la copia de ARN, o transcrito, contiene la
información necesaria para generar un polipéptido (una proteína o la subunidad de una
proteína). Los transcritos eucariontes necesitan someterse a algunos pasos de
procesamiento antes de traducirse en proteínas.
En la transcripción, una región de ADN se abre. Una sola cadena, la cadena molde, sirve
como plantilla para la síntesis de un transcrito complementario de ARN. La otra cadena,
la cadena codificante, es idéntica al transcrito de ARN en secuencia, excepto que el ARN
tiene bases de uracilo (U) en lugar de bases de timina (T).
Ejemplo:
Cadena codificante: 5'-ATGATCTCGTAA-3' Cadena molde: 3'-TACTAGAGCATT-5'
Transcrito de ARN: 5'-AUGAUCUCGUAA-3'
En el caso de un gen codificante, el transcrito de ARN contiene la información necesaria
para sintetizar un polipéptido (proteína o proteína subunidad) con una secuencia de
aminoácidos particular. En este caso:
Transcrito de ARN (que actúa como ARN mensajero): 5'-AUGAUCUCGUAA-3'
Polipéptido: Met-Ile-Ser-ALTO
La ARN polimerasa
La principal enzima que participa en la transcripción es la ARN polimerasa, la cual
utiliza un molde de ADN de cadena sencilla para sintetizar una cadena complementaria
de ARN. Específicamente, la ARN polimerasa produce una cadena de ARN en dirección
de 5' a 3', al agregar cada nuevo nucleótido al extremo 3' de la cadena.
La ARN polimerasa sintetiza una cadena de ARN complementaria a la cadena molde de
ADN. Esta enzima sintetiza la cadena de ARN en dirección 5' a 3', mientras que lee la
cadena molde de ADN en dirección 3' a 5'. La cadena molde de ADN y la cadena de ARN
son antiparalelas.
Transcrito de ARN: 5'-UGGUAGU...-3' (los puntos indican que todavía se están
agregando nucleótidos en el extremo 3') Molde de ADN: 3'-ACCATCAGTC-5'
Las etapas de la transcripción
La transcripción de un gen ocurre en tres etapas: iniciación, elongación y terminación.
Aquí veremos brevemente cómo ocurren estas etapas en bacterias. Puedes aprender más
sobre los detalles de cada etapa (y sobre las diferencias que hay respecto a la
transcripción eucarionte) en el artículo sobre etapas de la transcripción.
1. Iniciación. La ARN polimerasa se une a una secuencia de ADN
llamada promotor, que se encuentra al inicio de un gen. Cada gen (o grupo de genes co-
transcritos en bacterias) tiene su propio promotor. Una vez unida, la ARN polimerasa
separa las cadenas de ADN para proporcionar el molde de cadena sencilla necesario para
la transcripción.
La región promotora se encuentra antes de (y sobrelapa ligeramente con) la región
transcrita cuya transcripción señala. Esta región contiene sitios de reconocimiento para
que la ARN polimerasa o sus proteínas auxiliares se unan. El ADN se abre en la región
promotora de forma que la ARN polimerasa pueda inciar la transcripción.
2. Elongación. Una cadena de ADN, la cadena molde, actúa como plantilla para la
ARN polimerasa. Al "leer" este molde, una base a la vez, la polimerasa produce una
molécula de ARN a partir de nucleótidos complementarios y forma una cadena que crece
de 5' a 3'. El transcrito de ARN tiene la misma información que la cadena de ADN
contraria a la molde (codificante) en el gen, pero contiene la base uracilo (U) en lugar de
timina (T).
[¿Qué significan 5' y 3'?]
o
o
La ARN polimerasa sintetiza un transcrito de ARN complementario a la cadena molde de
ADN en dirección 5' a 3'. La enzima avanza a lo largo de la cadena molde en dirección 3'
a 5' y al avanzar abre la doble hélice del ADN. El ARN sintetizado solo se mantiene
unido a la cadena molde por un corto tiempo y luego sale de la polimerasa como una
cadena colgante, para permitir que el ADN se vuelva a cerrar y formar una doble hélice.
En este ejemplo, las secuencias de la cadena codificante, la cadena molde y el transcrito
de ARN son:
Cadena codificante: 5' - ATGATCTCGTAA-3'
Cadena molde: 3'-TACTAGAGCATT-5'
ARN: 5'-AUGAUC...-3' (los puntos indican que todavía se están agregando nucleótidos
en el extremo 3')
Terminación. Las secuencias llamadas terminadores indican que se ha
completado el transcrito de ARN. Una vez transcritas, estas secuencias provocan que el
transcrito sea liberado de la ARN polimerasa. A continuación se ejemplifica un
mecanismo de terminación en el que ocurre la formación de un tallo-asa en el ARN.
El ADN terminador codifica una región de ARN que forma una estructura de tallo-asa
seguida de una cadena de nucleótidos U. La estructura tallo-asa del transcrito provoca que
la ARN polimerasa se detenga. Los nucleótidos U que están después del tallo-asa forman
enlaces débiles con los nucleótidos de A en el molde de ADN, lo que permite que el
transcrito se separe del molde y la transcripción termine.
Modificaciones al ARN eucarionte
En bacterias, los transcritos de ARN pueden actuar como ARN mensajeros (ARNm)
inmediatamente. En eucariontes, el transcrito de un gen codificante se llama pre-
ARNm y debe experimentar un procesamiento adicional antes de que pueda dirigir la
traducción.
Los pre-ARNm eucariontes deben tener sus extremos modificados por la adición de
un cap 5' (al inicio) y una cola de poli-A 3' (al final).
Muchos pre-ARNm eucariontes sufren empalme. En este proceso, partes del pre-
ARNm (llamadas intrones) se cortan y se eliminan, y las piezas restantes
(llamadas exones) se vuelven a unir.
Imagen superior: diagrama de un pre-ARNm con un cap 5' y una cola de poli-A 3'. El cap
5' se encuentra en el extremo 5' del pre-ARNm y es un nucleótido de G modificado. La
cola de poli-A se encuentra en el extremo 3' del pre-ARNm y se compone de una larga
cadena de nucleótidos de A (de los cuales solo se muestran unos cuantos).
El pre-ARNm contiene tanto exones como intrones. A lo largo de la cadena del ARNm
hay un patrón alternante de exones e intrones: exón 1 - intrón 1 - exón 2 - intrón 2 - exón
3. Cada uno se compone de un segmento de nucleótidos de ARN.
Durante el empalme, se eliminan los intrones del pre-ARNm y los exones se vuelven a
unir para formar un ARNm maduro.
Parte inferior de la imagen: un ARNm maduro que no contiene las secuencias de los
intrones (solamente exón 1 - exón 2 - exón 3).
Las modificaciones en los extremos aumentan la estabilidad del ARNm, mientras que el
empalme otorga al ARNm su secuencia correcta (si no se eliminan los intrones, se
traducirán junto con los exones y producirán un polipéptido "sin sentido").
Para aprender más acerca de modificaciones del pre-ARNm en eucariontes, consulta el
artículo sobre procesamiento del pre-ARNm.
La transcripción ocurre para genes individuales
No todos los genes se transcriben todo el tiempo, sino que la transcripción se controla
individualmente para cada gen (o, en las bacterias, para pequeños grupos de genes que se
transcriben juntos). Las células regulan cuidadosamente la transcripción, de forma que
solo se transcriben los genes cuyos productos son necesarios en un momento
determinado.
Por ejemplo, el siguiente diagrama muestra una "fotografía" de los ARN de una célula
imaginaria en un momento dado. En esta célula, los genes 1, 2 y 3, se transcriben, pero no
el gen 4. Además, los genes 1, 2 y 3 se transcriben en diferentes cantidades, lo que
significa que se produce un número diferente de moléculas de ARN de cada uno.
El diagrama muestra que genes individuales se transcriben en diferentes cantidades.
Se muestra una región de ADN que contiene cuatro genes y la región transcrita de cada
gen se resalta en azul oscuro. El número de transcritos de cada gen se indica sobre el
ADN (en un eje Y). Hay seis transcritos del gen 1, un transcrito del gen 2, doce
transcritos del gen 3 y no hay transcritos del gen 4.
Esta no es una ilustración de algún conjunto real de genes y sus niveles de transcripción,
en realidad solo es un ejemplo que muestra el control individual de la transcripción en
genes y otras unidades de transcripción.
En los siguientes artículos, daremos un vistazo con más detalle a la ARN polimerasa, las
etapas de la transcripción y el proceso de modificación del ARN en eucariontes. También
consideraremos algunas diferencias importantes entre la transcripción bacteriana y la
eucarionte.
La traducción es el segundo proceso de la síntesis proteica (parte del proceso general de la expresión génica) que
ocurre en todos los seres vivos. Se produce en el citoplasma, donde se encuentran los ribosomas; en la célula
eucariota ocurre también en el retículo endoplasmático rugoso (RER), y las mitocondrias tienen su propio proceso
de traducción. Los ribosomas están formados por una subunidad pequeña y una grande que rodean al ARN. En la
traducción, el ARN mensajero se decodifica para generar una cadena específica de aminoácidos,
llamada polipéptido (el producto de la traducción), de acuerdo con las reglas especificadas por el código genético.
Es el proceso que convierte una secuencia de ARN mensajero en una cadena de aminoácidos para formar una
proteína.1 Es necesario que la traducción venga precedida de un primer proceso de transcripción. Las fases de la
traducción son tres: iniciación, elongación y terminación,2durante los cuales se va dando el crecimiento del
polipéptido.
Paso 1: transcripción. Aquí la secuencia de ADN de un gen se "vuelve a escribir"
en forma de ARN. En eucariontes como tu y yo, el ARN se procesa (y con frecuencia se
le recortan pedazos) para hacer un producto final llamado ARN mensajero o ARNm.
Paso 2: traducción. En esta etapa el ARNm se "decodifica" para construir una
proteína (o un pedazo/subunidad de una proteína) que contiene una serie de aminoácidos
en específico.
[¿Qué es exactamente un "aminoácido"?]
El dogma central de la biología molecular afirma que la información fluye del ADN
(genes) a ARNm a través del proceso de transcripción y luego a proteínas a través del
proceso de traducción.
_Imagen modificada de "Dogma central de la bioquímica molecular con enzimas", por Daniel Horspool (CC BY-SA 3,0). La
imagen modificada se encuentra bajo una licencia CC BY-SA 3,0._
En este artículo nos concentraremos en la traducción, y obtendremos una visión general
del proceso y de las moléculas que la llevan a cabo.
El código genético
Durante la traducción, una célula "lee" la información contenida en el ARN mensajero
(ARNm) y la usa para construir una proteína. En realidad, y para ser un poco más
técnico, un ARNm no siempre codifica o proporciona las instrucciones para una proteína
completa, sino que podemos decir confiadamente que siempre codifica para
un polipéptido o una cadena de aminoácidos.
[Espera, ¿cuál es la diferencia?]
Tabla del código genético. Cada secuencia de tres letras de nucleótidos de ARNm
corresponde a un aminoácido en específico o a un codón de terminación. UGA, UAG y
UAA son codones de terminación. AUG es el codón de metionina además de ser el codón
de inicio.
_Crédito de la imagen: "The genetic code", de OpenStax College, Biología (CC BY 3,0)_
En un ARNm, las instrucciones para construir un polipéptido son los nucleótidos de ARN
(A, U, C, y G), que se leen en grupos de tres. Estos grupos de tres se conocen
como codones.
Hay 616161 codones para los aminoácidos, y cada uno se "lee" para especificar un cierto
aminoácido de los 202020 que se encuentran comúnmente en las proteínas. Un codon,
AUG, especifica el aminoácido metionina y también actúa como un codón de inicio para
señalar el comienzo de la construcción de la proteína.
Hay tres codones más que no especifican aminoácidos. Estos codones de terminación,
UAA, UAG y UGA, le informan a la célula cuando está completo un polipéptido. En
conjunto, esta colección de relaciones codón-aminoácidos se llama el código genético ,
porque permite que las células "decodifiquen" un ARNm en una cadena de aminoácidos.
Cada ARNm contiene una serie de codones (tripletes de nucleótidos), cada uno de los
cuales especifica un aminoácido. La correspondencia entre codones de ARNm y
aminoácidos es llamada el código genético.
5' AUG - Metionina ACG - Treonina GAG - Glutamato CUU - Leucina CGG - Arginina
AGC - Serina UAG - Alto 3'
Imagen modificada de "RNA-codons-aminoacids", por Thomas Splettstoesser (CC BY-SA 4,0). La imagen modificada se
encuentra bajo una licencia CC BY-SA 4,0.
Resumen de la Traducción
¿Cómo se "lee" un ARNm para formar un polipéptido? Dos tipos de molécula con
papeles clave en la traducción son los ARNt y los ribosomas.
ARNs de transferencia (ARNt)
Los ARN de transferencia o ARNt, son "puentes" moleculares que conectan los
codones del ARNm con los aminoácidos para los que codifican. Un extremo de cada
ARNt tiene una secuencia de tres nucleótidos llamada anticodón, que se puede unir a un
codón específico del ARNm. El otro extremo de ARNt lleva el aminoácido que especifica
el codón.
Hay muchos tipos de ARNt. Cada tipo lee uno o unos pocos codones y lleva el
aminoácido correcto que corresponde a esos codones,
Los ribosomas están compuestos de una subunidad grande y una pequeña, y tienen tres
sitios en los cuales se puede unir el ARNt con el ARNm (los sitios A, P y E). Cada ARNt
transporta un aminoácido específico y se une a un codón que es complementario a su
anticodón.
Imagen modificada de "Translation: Figure 3", de OpenStax College, Biología (CC BY 4,0).
Ribosomas
Los ribosomas son las estructuras donde se construyen los polipéptidos (proteínas). Se
componen de proteínas y ARN (ARN ribosomal o ARNr). Cada ribosoma tiene dos
subunidades, una grande y una pequeña, que se reúnen alrededor de un ARNm, algo
parecido a las dos mitades de un pan para hamburguesa que se reúnen alrededor de la
torta de carne.
El ribosoma proporciona un conjunto de espacios útiles o huecos donde los ARNt pueden
encontrar sus codones correspondientes en la plantilla del ARNm y entregar sus
aminoácidos. Estos huecos se llaman los sitios A, P y E. Pero además el ribosoma actúa
como una enzima que cataliza la reacción química que une los aminoácidos para formar
una cadena.
¿Quieres saber más sobre la estrucutra y función de los ARNt y los ribosomas? ¡Consulta
el artículo sobre ARNt y ribosomas!
Los pasos de la traducción
Tus células están fabricando proteínas cada segundo, y cada una de ellas debe contener el
conjunto correcto de aminoácidos unidos justo en el orden debido. Esto puede sonar
como una tarea difícil, pero por suerte, tus células (junto con las de los demás animales,
plantes y bacterias) están capacitados para ella.
Para ver cómo las células hacen las proteínas, vamos a dividir la traducción en tres
etapas: iniciación (el comienzo), elongación (el agregar a la cadena proteica) y
terminación (la finalización).
El comienzo: la iniciación
En la iniciación, el ribosoma se ensambla alrededor del ARNm que se leerá y el primer
ARNt (que lleva el aminoácido metionina y que corresponde al codón de iniciación
AUG). Este conjunto, conocido como complejo de iniciación, se necesita para que
comience la traducción.
La extensión de la cadena: elongación
La elongación es la etapa donde la cadena de aminoácidos se extiende. En la elongacón,
el ARNm se lee un codón a la vez, y el aminoácido que corresponde a cada codón se
agrega a la cadena creciente de proteína.
Cada vez que un codón nuevo está expuesto:
Un ARNt correspondiente se une al codón
La cadena de aminoácidos existente (polipéptido) se une al aminoácido del ARNt
mediante una reacción química.
El ARNm se desplaza un codón sobre el ribosoma, lo que exponde un nuevo codón
para que se lea.
La elongación tiene tres etapas:
1) El anticodón de un ARNt entrante se aparea con el codón expuesto del ARNm en el
sitio A.
2) Se forma un enlace peptídico entre el nuevo aminoácido (en el sitio A) y el aminoácido
que se añadió previamente (en el sitio P), y se transfiere el polipéptido del sitio P al sitio
A.
3) El ribosoma avanza un codón en el ARNm. El ARNt en el sitio A (que lleva el
polipétido) se despalaza hacia el sitio P. El ARNt en el sitio P se mueve hacia el sitio E y
sale del ribosoma.
Imagen basada en un diagrama similar en Reece et al.^22squared
Durante la elongación, los ARNt pasan por los sitios A, P, y E como se muestra arriba.
Este proceso se repite muchas veces conforme se leen los nuevos codones y se agregan
los nuevos aminoácidos a la cadena.
Para más detalles sobre los pasos de la elongación, consulta el artículo etapas de la
traducción.
Finalizando el proceso: terminación
La terminación es la etapa donde la cadena polipeptídica completa es liberada.
Comienza cuando un codón de terminación (UAG, UAA o UGA) entra al ribosoma, lo
que dispara una serie de eventos que separa la cadena de su ARNt y le permite flotar
hacia afuera.
Después de la terminación, es posible que el polipéptido todavía necesite tomar la forma
tridimensional correcta, se someta a procesamiento (tal como el retiro de aminoácidos),
sea enviado a la parte correcta en la célula, o se combine con otros polipéptidos antes de
que pueda hacer su trabajo como una proteína funcional.