Resuelve los siguientes ejercicios y entrégalos en físico (únicamente la hoja de respuestas).

Se requiere conocer la composición de aminoácidos de un péptido, para la cual se trató

de manera independiente con fenilisotiocianato en el primer ciclo y resulto PTH-Leu.

Al tratarse con termolisina los péptidos obtenidos fueron los siguientes:

Val-Lys, Met-Thr, Leu-Asn-Asp-Phe-His, Met-Ala-Trp

Los péptidos obtenidos con quimiotripsina con los siguientes:

Leu-Asn-Asp-Phe , His-Met-Thr-Met-Ala-Trp , Val-Lys

a. Deduce la secuencia original.

b. Calcula su pI
c. ¿Qué carga tiene el péptido a pH 1, 7.1 y 10.3?

Dado el péptido siguiente:

Ser–Glu–Pro–Ile–Met–Ala–Pro–Val–Glu–Tyr–Pro–Lys

a. ¿Cuántos y cuáles son los péptidos que se producirían si este péptido se tratarse con:
1. bromuro de cianógeno
2. tripsina
3. quimotripsina
b. Sugerir un método para identificar los péptidos producidos por el tratamiento con
quimotripsina.
c. Calcula su pI
d. ¿Qué carga tiene el péptido a pH 1, 7.1 y 10.3?

Una forma mutante de la hormona polipeptídica angiotensina II tiene la siguiente

composición de aminoácidos:
Asp, Arg, Ile, Met, Phe, Pro, Tyr, Val

Se realizan las siguientes observaciones:

a. La tripsina produce un dipéptido que contiene Asp y Arg, y un hexapéptido que
contiene todo el resto.
b. La fragmentación con bromuro de cianógeno produce un dipéptido que contiene
Phe y Pro, y un hexapéptido que contiene todos los demás.
c. La quimotripsina fragmenta la hormona en dos tetrapéptidos con la siguiente
composición (Asp, Arg, Tyr, Val) y (Ile, Met, Phe, Pro)
 d. El dipéptido de composición (Pro, Phe) no puede fragmentarse por la
quimotripsina ni por la carboxipeptidasa.
e. ¿Cuál es la secuencia?
f. Calcula su pI

Se ha secuenciado una proteína tras la destrucción de los enlaces -S-S- . Se sabe que
contiene 3 residuos de Cys, situados del modo que se muestra a continuación. Sin
embargo, sólo uno de ellos es un -SH libre; dos de ellos forman parte de un enlace S-S.

La única metionina y el único aminoácido aromático (Phe) de esta proteína se encuentran

en las posiciones indicadas. La fragmentación de la proteína intacta (con el puente -S-S-
intacto) con bromuro de cianógeno o quimotripsina no divide la proteína en dos péptidos.
a. ¿Dónde está el puente -¿S-S- (AB, BC o AC)?

Un investigador ha aislado un oligopéptido de secuencia y composición de aminoácidos

desconocidas. Todos los intentos para secuenciarlo por la degradación de Edman han
fracasado; la reacción no funciona.

a. Sugerir una explicación para este problema.

b. Sugerir un experimento para determinar el amino terminal.

Usted está en proceso de determinación de la secuencia de aminoácidos de un péptido.

Después de la digestión con tripsina y seguida de la degradación de Edman observa los
siguientes fragmentos:
Leu—Gly—Arg
Gly—Ser—Phe—Tyr—Asn—His
Ser—Glu—Asp—Met—Cys—Lys
Thr—Tyr—Glu—Val—Cys—Met—His
a. ¿Son lógicos los fragmentos obtenidos? Si, no. Justifica tu respuesta.
 Una muestra de un péptido de secuencia desconocida fue tratada con tripsina; otra
muestra del mismo péptido fue tratada con quimiotripsina. Las secuencias (de extremo
N-terminal a C-terminal) de los péptidos más pequeños producidos por la digestión con
tripsina fueron los siguientes:
Met-Val-Ser-Thr-Lys
Val-Ile-Trp-Thr-Leu-Met-Ile
Leu-Phe-Asn-Glu-Ser-Arg
Las secuencias de los péptidos más pequeños producidos por la digestión con
quimiotripsina fueron los siguientes:
Asn-Glu-Ser-Arg-Val-Ile-Trp
Thr-Leu-Met-Ile
Met-Val-Ser-Thr-Lys-Leu-Phe
a. Deduce la secuencia del péptido original
b. Una vez obtenida la secuencia del péptido, calcula su pI
c. ¿Qué carga tiene el péptido a pH 3, 8 y 11?