1. ¿A qué se refiere el término genómica?

 El término "genómica" se refiere a la disciplina científica que estudia los genomas, es decir,
el conjunto completo de genes presentes en el ADN de un organismo.

2. ¿En qué tipo de células podemos aplicar microarrays?

 Estos microarrays se utilizan en células humanas, animales, vegetales y microbianas, así

como en células de tejidos específicos, para estudiar la expresión génica en diferentes
contextos y comprender los procesos biológicos en profundidad.

3. ¿A qué se refiere el término “¿Perfil de expresión genética”, entre células diferentes?

 El término "perfil de expresión génica entre células diferentes" se refiere al análisis

comparativo de los niveles de expresión de genes en distintos tipos de células o entre
células que pertenecen a diferentes condiciones o estados celulares. La expresión génica
se refiere a la activación o desactivación de los genes para producir ARN mensajero
(ARNm) y, posteriormente, proteínas específicas.

4. ¿Un chip de ADN en lo mismo que un microarray de ADN?

 Sí, un "chip de ADN" y un "microarray de ADN" son términos que se utilizan

indistintamente para referirse a la misma tecnología. Ambos términos se refieren a una
herramienta utilizada en genómica y biología molecular para medir la expresión de miles
de genes de forma simultánea.

5. ¿Qué otros nombres pueden recibir los microarrays de ADN?

 Biochips de ADN
 Matrices de ADN
 Microarreglos de genes
 Microchips de expresión génica
 Microarreglos genómicos
 Microarrays de oligonucleótidos
 Matrices de hibridación de ADN
 Microarrays de transcriptoma
 Microarrays de genómica funcional
 Microarrays de ADN de alta densidad

6. El microarrays se compone de múltiples puntos (spots) ¿Qué contiene cada uno de estos

puntos?

 Cada punto o "spot" en un microarray contiene sondas de ADN o ARN, que son secuencias
cortas de nucleótidos que representan genes o regiones genómicas específicas.

7. ¿Cuál es la diferencia entre una célula sana y una célula de cáncer?

  La diferencia entre una célula sana y una célula de cáncer radica en su comportamiento y
características biológicas. Las células sanas tienen un crecimiento y división controlados,
realizan sus funciones específicas en el organismo y responden a las señales reguladoras
del cuerpo. En cambio, las células cancerosas han perdido el control normal sobre su
crecimiento y división, se multiplican de manera descontrolada, pueden invadir tejidos
circundantes y propagarse a otras partes del cuerpo (metástasis).

8. Mencione al menos 5 materiales que se utilizan para realizar la técnica microarray.

a. Placas o chips de vidrio o silicio.

b. Sondas de ADN o ARN específicas.

c. Muestras de tejido o ARN extraído de las células a analizar.

d. Solventes y reactivos químicos para los procedimientos de hibridación y lavado.

e. Máquinas de escaneo y equipos para analizar las imágenes obtenidas.

9. ¿Cuáles son los 7 pasos de la técnica de microarrays de ADN?

 Extracción del ARN de las muestras de tejido.

 Amplificación y marcado del ARN para su detección.
 Preparación de la sonda de ADN o ARN para el microarray.
 Hibridación: aplicación de la muestra de ARN en el microarray.
 Limpieza o lavado para eliminar el exceso de ARN no unido.
 Escaneo y captura de imágenes del microarray.
 Análisis bioinformático de los datos obtenidos.

10. ¿Por qué razón se agrega un solvente a las muestras de tejido?

 Se agrega un solvente a las muestras de tejido para disolver y liberar el ARN contenido en
las células. El solvente ayuda a romper las membranas celulares y liberar el ARN para su
posterior extracción y análisis.

11. ¿Cuál es el objetivo de mezclar en el vórtex y luego centrifugar las muestras de tejido?

 Mezclar en el vórtex y luego centrifugar las muestras de tejido tiene como objetivo
homogeneizar la muestra y asegurar que los componentes estén bien mezclados antes de
proceder con la extracción del ARN. La centrifugación separa los componentes celulares y
permite recuperar el ARN en el sobrenadante.

12. ¿Qué tipos de ARN se encuentran en la muestra y cuál es tipo de ARN de interés en el

experimento? ¿Por qué?

 En la muestra, se encuentran diferentes tipos de ARN, como ARN mensajero (ARNm), ARN
ribosomal (ARNr) y ARN de transferencia (ARNt). En un experimento de microarray de
expresión génica, el ARN de interés es el ARN mensajero (ARNm), ya que refleja la
expresión de los genes en un momento dado.

13. ¿Qué se utiliza para separar el ARNm, del ARNt y ARNr?

  El ARNm, del ARNt y del ARNr se separan utilizando técnicas de purificación basadas en el
tamaño o propiedades específicas de cada tipo de ARN.

14. ¿Para qué se adiciona una solución buffer?

 Se adiciona una solución buffer para proporcionar un ambiente adecuado para las
reacciones y para mantener la estabilidad del ARN durante los procedimientos de
extracción y análisis.

15. ¿Cuál es la función de la enzima transcriptasa reversa?

 La enzima transcriptasa reversa es utilizada en el proceso de amplificación y marcado del

ARN. Esta enzima convierte el ARN en ADN complementario (ADNc) a partir del cual se
sintetiza el ADN marcado para su detección en el microarray.

16. ¿A qué se refiere el término, hibridación?

 El término "hibridación" se refiere al proceso mediante el cual dos hebras de ADN o ARN
se unen y forman una estructura de doble hélice, cuando se encuentran secuencias
complementarias. En el contexto de los microarrays, la hibridación ocurre cuando las
sondas de ADN en el microarray se unen a las secuencias de ARN de la muestra, lo que
permite medir la expresión de genes específicos.

17. ¿Cada spot o poro del chip de ADN posee una secuencia de ADN igual o diferente entre sí?

 Cada spot o poro del chip de ADN contiene sondas de ADN o ARN con secuencias
específicas, y estas secuencias pueden ser iguales o diferentes entre sí, dependiendo del
diseño del microarray.

18. ¿Qué representan los puntos amarillos en la imagen obtenida?

 Los puntos amarillos en la imagen obtenida representan spots en el microarray donde ha

ocurrido la hibridación exitosa entre las sondas de ADN y las secuencias de ARN de la
muestra. La coloración amarilla indica que esos genes están siendo expresados en la
muestra.

19. ¿Cómo se obtiene la coloración amarilla en los poros?

 La coloración amarilla en los poros se obtiene cuando se utilizan sondas de ADN marcadas
con un colorante fluorescente y se hibridan con el ARN de la muestra durante el análisis
del microarray.

20. ¿Qué representan los puntos rojos en la imagen obtenida?

 Los puntos rojos en la imagen obtenida indican que hay una sobreexpresión de los genes
representados por esas sondas de ADN en la muestra analizada.

21. ¿Qué representan los puntos verdes en la imagen analizada?

 Los puntos verdes en la imagen analizada indican una subexpresión de los genes
representados por esas sondas de ADN en la muestra analizada.
22. Para investigar el cáncer, ¿qué color de poro escogería evaluar y por qué?

 Para investigar el cáncer, se podría escoger evaluar los poros rojos que representan una
sobreexpresión de ciertos genes, ya que esto podría ser relevante para identificar genes
implicados en la patogénesis o progresión del cáncer.

23. ¿Qué color de poro está afectado por el gen 4263?

AMARILLO

24. ¿Por qué se ha de estudiar el gen 6219 en los poros amarillos?

Porque son de dos clases

25. Mencione las ventajas y desventajas de esta técnica.

Ventajas de la técnica microarray:

Permite analizar la expresión de miles de genes simultáneamente.

Proporciona información sobre la actividad de genes específicos en diferentes condiciones.

Contribuye a la identificación de biomarcadores y genes asociados a enfermedades.

Es una herramienta valiosa en la investigación biomédica y la medicina personalizada.

Permite estudiar la diversidad genética y las interacciones moleculares.

Desventajas de la técnica microarray:

Puede ser costosa y requerir equipos y reactivos especializados.

La interpretación de los resultados puede ser compleja y requiere conocimientos bioinformáticos.

La sensibilidad y especificidad pueden verse afectadas por la calidad de las muestras y sondas.

No detecta nuevos genes o secuencias desconocidas que no estén presentes en el diseño del
microarray.

La tecnología de secuenciación de ARN (RNA-seq) ha ganado popularidad como una alternativa

más avanzada para el análisis de expresión génica.