DEFINIR TRANSCRIPCIÓN

La transcripción es el proceso por el cual la información cifrada en forma de secuencia de cuatro

bases (A, T, C, G) en una cadena de ADN se plasma en una información escrita en el mismo lenguaje
(cuatro bases: A, U, C, G), en forma de cadena de ARN. Desde un punto de vista químico, es un
proceso de síntesis de ARN a partir de cuatro ribonucleósidos trifosfato (ATP, GTP, CTP y UTP) y de
ADN, que actúa como molde.

Aunque el resultado global de la transcripción es la síntesis de los diferentes tipos de moléculas de

ARN celulares (ARNr, ARNt, ARNm, etc.), cada molécula de ARN es sintetizada de manera individual,
como consecuencia de la transcripción de una zona concreta del ADN (denominada unidad de
transcripción), de pequeña longitud si se compara con la de las moléculas de ADN. De las dos
cadenas de la unidad de transcripción, sólo una de ellas es transcrita. La hebra codificadora o con
sentido (también, hebra +), tiene la misma secuencia que el ARN transcrito (con T, en lugar de U). La
hebra complementaria que actúa como molde para la síntesis de ARN se denomina hebra
antisentido (hebra —).

La transcripción es un proceso selectivo, es decir, la síntesis de ARN no comienza o termina en

puntos al azar, sino que se transcriben zonas concretas, con un principio y un final preestablecido.
Además, no todos los genes o zonas del ADN se transcriben simultáneamente y con la misma
frecuencia. Ello determina que la abundancia de los diferentes tipos de ARN sea variable, a pesar de
que exista un número de copias equiparables de los mismos en el ADN.

La transcripción es un proceso reiterativo, ya que una zona concreta del ADN se puede copiar
repetidamente, dando lugar a la formación de copias múltiples de una determinada molécula de
ARN. Existen mecanismos reguladores que determinan cuándo y con qué frecuencia va a ser
transcrito un gen concreto por la maquinaria de transcripción, siendo estos mecanismos más
complejos en los organismos eucarióticos que en los procarióticos. Por último, la transcripción es un
proceso conservativo del ADN, ya que éste no resulta modificado una vez que ha sido transcrito.

TRANSCRIPCIÓN O SÍNTESIS DE AR EN CÉLULAS PROCARIOTAS

En las bacterias existe una única enzima, denominada ARN polimerasa dependiente de ADN, que se
encarga de transcribir todos los genes del cromosoma bacteriano, dando lugar a la formación de los
tres tipos fundamentales de ARN (ARNr, ARNt y ARNm). La enzima de E. coli está formada por un
conjunto de subunidades diferentes (a, B, 8”, 0) y 0) que forman la denominada holoenzima, la cual
participa sintetizando ARN de manera específica.
La subunidad 0, que se encuentra unida débilmente al resto de la enzima (enzima núcleo), es la
responsable de reconocer los lugares en los que ha de comenzar la síntesis de ARN, mientras que la
enzima núcleo se encarga propiamente de la síntesis del ARN. En la Figura 20-1 se representa
esquemáticamente una unidad de transcripción, en la que el nucleótido +1 representa el punto de
iniciación, es decir, la posición del primer nucleótido que es copiado (y que, por tanto, se
corresponde con el primer nucleótido del extremo 5” del ARN que se va a sintetizar) y el +n
corresponde al último nucleótido que se transcribe. El sentido de la cadena de ADN codificante, que
va desde +1 a +n, se corresponde con el sentido 5"—3”, por lo que la cadena complementaria, o
molde, se lee en el sentido 35”. El sentido que corresponde al desplazamiento de la enzima sobre el
gen se denomina usualmente como en sentido 3' («aguas abajo»). por lo que las secuencias que van
de —I a —n se denominan secuencias en sentido 5' («aguas arriba»).

La zona en sentido 5” adyacente al nucleótido +1 se denomina promotor, y es el lugar reconocido

por la subunidad O, y donde se localiza la ARN polimerasa para comenzar la transcripción. La mayor
parte de los promotores de E. coli tienen secuencias cortas parecidas (secuencias consenso)
localizadas sobre las posiciones —10 y —35 (promotores estándar). La primera de ellas se denomina
secuencia TATA 0 caja de Pribnow, cuya secuencia consenso representante es el hexanucleótido
TATAAT, mientras que la segunda tiene como secuencia consenso TTGAC. La subunidad o más
abundante en E. coli (denominada 0”) reconoce a estos promotores estándar, con mayor afinidad
cuanto más próxima esté la secuencia del promotor a las secuencias consenso (lo que hace que
existan promotores fuertes y débiles). Sin embargo, un número reducido de genes tiene promotores
no relacionados con los promotores estándar, que son reconocidos por formas minoritarias de la
subunidad o (como 0” o 6"), por lo que, en definitiva, el tipo de subunidad 0 unido a la ARN
polimerasa tiene gran influencia para la selección de los genes que se han de transcribir

MECANISMO DE LA TRANSCRIPCIÓN EN LAS BACTERIAS.

La enzima núcleo de la ARN polimerasa se une a la subunidad 0 para formar la holoenzima que
reconoce al promotor, formando el complejo cerrado de iniciación.
Tras la apertura del dúplex, la ARN polimerasa interacciona con los dos primeros nucleósidos
trifosfatos que se aparean con las primeras bases del molde dando lugar al inicio de la síntesis del
ARN.

Tras la iniciación, la subunidad 0 se separa de la holoenzima, y la enzima núcleo continúa elongando

la cadena de ARN en la dirección 5'>3', desplazándose sobre el molde hasta alcanzar el sitio de
terminación, donde acaba la síntesis y se libera el transcrito de ARN.

CARACTERISTICAS, FUNCIONES Y COMPONENTES DEL ARN POLIMERASA

La ARN polimerasa es una enzima de unidades múltiples que sintetiza moléculas de ARN a partir de
una plantilla de ADN a través de un proceso llamado transcripción. La transcripción de información
genética en ARN es el primer paso en la expresión génica que precede a la traducción, el proceso de
decodificación de ARN en proteínas.

La enzima ARN polimerasa es un gran complejo formado por múltiples subunidades 1 . La forma
procariota de la ARN polimerasa tiene cuatro subunidades capaces de transcribir todos los tipos de
ARN. En eucariotas, estas enzimas tienen ocho o más subunidades que facilitan la unión y el
procesamiento del ADN a lo largo de la transcripción.

Las tres etapas de la transcripción involucran varias funciones de la ARN polimerasa que dan como
resultado la síntesis de ARN :

1. Iniciación: En la primera, la holoenzima se une al promotor (formación del complejo cerrado) y

favorece la apertura parcial de las dos cadenas de ADN (complejo abierto), con la consiguiente
ruptura de los enlaces por puentes de hidrógeno de las bases próximas al lugar +1, el
establecimiento de puentes de hidrógeno entre las bases de los dos primeros nucleótidos que van a
formar el enlace fosfodiéster y las bases de la cadena molde, y la formación de un dinucleótido por
ataque del hidroxilo 3' del primer NTP (que suele ser GTP o ATP) al fosfato a de la posición 5' del
segundo nucleótido.

2. Elongación: A partir de aquí comienza la fase de elongación o crecimiento de la cadena, llevada a

cabo por la ARN polimerasa núcleo, tras la liberación de la subunidad 6, en la que se van formando
nuevos enlaces entre nucleótidos seleccionados por el molde, con lo que la cadena de ARN va
aumentando progresivamente sus unidades en la dirección 53”. En la proximidad de la ARN
polimerasa se mantiene la formación del híbrido ADN/ARN (alrededor de 14 pares de bases), pero, a
medida que avanza la polimerasa, el ARN sintetizado se despega del ADN volviéndose a formar la
estructura dúplex del ADN

3. Terminación: La transcripción continúa hasta el punto de terminación, donde cesa el crecimiento

de la cadena y se produce la sepa ración de la ARN polimerasa y el ARN sintetizado, o transcrito
primario, del ADN. Antes de que finalice la síntesis de un ARN, sobre el promotor puede volver a
iniciarse de nuevoel proceso, tras la unión de la holoenzima al promotor.

Cuando la síntesis es rápida se inicia cada 2 segundos, avanzando la enzima núcleo con una
velocidad de aproximadamente 50 nucleótidos por segundo. El mecanismo de la terminación es
poco conocido, aunque se sabe que, tanto ciertas proteínas, como determinadas secuencias en
forma de horquilla en el ARN sintetizado, participan desestabilizandoa la polimerasa, facilitando el
cese de la transcripción y la separación del transcrito primario.

DIFERENCIAS DE TRANSCRIPCIÓN ENTRE PROCARIOTAS Y EUCARIOTAS

CAMBIOS POSTRANSCRIPCIONALES DESPUES DE LA TRANSCIPCIÓN PARA LOS DISTINTOS
ARN

El producto directo de la transcripción o transcrito primario sufre en muchos casos una serie
de modificaciones estructurales necesarias para que la molécula del ARN sea funcional.
Estas modificaciones se producen mediante una serie de procesos, denominados
postranscripcionales, que afectan en mayor o menor grado a los diferentes tipos de ARN,
sobre todo en las células eucarióticas.
El procesamiento postranscripcional comprende tres tipos fundamentales de reacciones:
recorte de la cadena polinucleotídica, modificación de bases y nucleósidos y adición de
secuencias a ambos extremos de la cadena del ARN.
Las moléculas de ARNr y ARNt, tanto en los procariotas como en los eucariotas, sufren
reacciones de recorte y modificación de nucleótidos. En el caso de los ARNr, se sintetizan a
partir de un precursor de mayor tamaño que es recortado por ARNasas, para dar lugar a
varias moléculas de ARNr de tamaño más reducido. En las bacterias, los tres tipos de ARNr
(ARNr 23S, ARNr 16S y ARNr 5S) se forman mediante el recortado de un único precursor de
mayor tamaño. El proceso de síntesis y maduración de los ARNr en el núcleo tiene lugar en
el nucleolo, participando en el proceso de modificación moléculas de ARN guía,
denominadas ARN nucleolar pequeño (ARNsno). Tres de los cuatro ARNr (ARNr 285, ARNr
18S y ARNr 5.85) se forman a partir de un precursor de mayor tamaño, mientras que el
cuarto (ARNr 55) es sintetizado a partir de otro transcrito sintetizado por la ARN polimerasa
III. Un pequeño porcentaje de las ribosas de los ARNr son modificadas por metilación del
hidroxilo 2", así como determinados nucleótidos de uridina se isomerizan hasta nucleótidos
de pseudouridina.
En el procesamiento de las moléculas de ARNt, también se produce un recorte terminal de
los extremos 5” y 3", así como la adición, a las moléculas que no la posean, de la secuencia -
CCA en el extremo 3". Las moléculas de ARNt, sobre todo, sufren igualmente importantes
reacciones de modificación química de bases y nucleósidos, lo que hace que en las
moléculas maduras abunden nucleótidos diferentes a los cuatro típicos que participan en la
síntesis del ARN.
Estas modificaciones contribuyen a hacer más resistentes estas moléculas a los procesos de
degradación celular, aumentando, por tanto, su estabilidad metabólica o vida media.
Las moléculas precursoras de los ARNm de los eucariotas, a diferencia de los ARNm de
procariotas, se sintetizan bajo la forma de moléculas precursoras de un tamaño mucho
mayor (ARN heterogéneo nuclear, ARNhn), que se transforman en el núcleo celular
mediante una serie de recortes especiales (corte y empalme o «splicing») en moléculas de
menor tamaño. Igualmente, se forma una estructura característica en el extremo 5”,
denominada caperuza (adición y metilación de GTP en el extremo 5' con formación de un
enlace fosfodiéster atípico 5'—>5”), mientras que en el extremo 3' se añaden
secuencialmente residuos adenílicos (hasta 200) para formar la cola de poli(A), previo
recorte de parte del extremo 3' del transcrito primario, a la derecha de la señal de
poliadenilación AAUAAA.
Estos procesos de maduración de los ARNm de los eucariotas tienen lugar en el núcleo
celular y son catalizados por una serie compleja de enzimas diferentes.
Algunas de estas enzimas, como las que participan en la formación de la caperuza se
encuentran asociadas al CTD fosforilado de la ARN polimerasa II, lo que permite que estos
ARN se vayan modificando a medida que se sintetizan. Dichos procesos son necesarios para
la salida al citoplasma de las moléculas de ARN «maduro» correspondientes. La eliminación
de los intrones y la unión de los exones se realizan mediante procesos de splicing del ARN
por medio de un mecanismo de trans-esterificación, con la participación de un complejo
ribonucleoproteico nuclear denominado espliceosoma o partícula de splicing y la hidrólisis
de ATP.
El espliceosoma está formado por la asociación de moléculas de ARN de tamaño pequeño,
ricas en U (U1 a UG), con proteínas nucleares (más de 50), dando lugar a diferentes
agregados de ribonucleoproteínas (denominados snurps) que participan en la identificación
de las zonas del ARNhn que se han de cortar y unir, ensamblándose sobre la molécula de
ARNhn. En este proceso, las regiones limítrofes de los intrones (punto de empalme 5” y
punto de empalme 3') y el punto central de ramificación, desempeñan un papel importante,
existiendo secuencias consenso con ciertas características fundamentales para el
establecimiento de los sitios de corte (todos los intrones comienzan por GU y acaban en
AG), lo que hace pensar en la existencia de interacciones específicas entre las secuencias
críticas de los intrones y los ARN nucleares pequeños de los espliceosomas. Un pequeño
porcentaje de los intrones en los mamíferos se elimina mediante mecanismos de splicing
minoritarios, ligeramente diferentes al descrito.
Se estima que sólo un 5% de la masa del ARNhn sintetizado sale del núcleo. El resto, que
corresponde a los intrones procesados y a parte del extremo 3' que se elimina para llevar a
cabo la poliadenilación, es degradado por un complejo multiproteico con actividad
exoARNasa, denominado exosoma. Este sistema enzimático también participa en la
degradación de moléculas de ARNm que no han sido debidamente procesadas,
disminuyendo la probabilidad de que moléculas de ARNm aberrantes alcancen el
citoplasma.
Determinadas moléculas de ARNm eucariótico sufren un tipo especial de inclusión o
sustitución de bases dentro de la secuencia codificante u ORF (pauta abierta de lectura), que
se denomina editado del ARNm. Esta modificación afecta en mayor o menor grado a la
secuencia de la proteína codificada.
En el ARNmt de los tripanosomas y las plantas se produce un editado extensivo que consiste
en la inclusión o eliminación de residuos U en la molécula del ARNm utilizando un ARN guía
que posee en el extremo 3' una cola de poli(U). En los mamíferos, en algunos ARNm tiene
lugar un editado muy específico que consiste en la sustitución de C por U, o de A por 1, por
medio de desaminaciones enzimáticas (citidina desaminasa, ADARs o adenosina desaminasa
de ARN), que tienen como consecuencia la sustitución de un aminoácido por otro o la
generación de proteínas truncadas por cambiar un triplete codificante de aminoácido por un
triplete de terminación. Este editado limitado parece tener importancia en la tesis de
determinados canales iónicos, apolipoproteínas o en el desarrollo del sistema
hematopoyético.
INHIBIDORES DE TRANSCRIPCIÓN
Al igual que ocurre con la replicación, la complejidad bioquímica de la transcripción hace
que, al ser muchas las etapas y agentes participantes, exista una gran variedad de
compuestos que la pueden inhibir.
El antibiótico actinomicina D, así como otros agentes que se unen al ADN, inhiben la
transcripción de manera inespecífica, siendo, por tanto, sustancias muy tóxicas para las
células. La actinomicina D se intercala en el dúplex de ADN preferentemente entre pares G-
C consecutivos. Otros compuestos intercalantes como las acridinas, la adriamicina y la
daunomicina son utilizados como agentes antitumorales.
Otros inhibidores de la transcripción son más específicos, pues inhiben las ARN polimerasas,
enzimas clave en la síntesis del ARN. Las rifamicinas, así como su derivado semi - sintético, la
rifampicina, bloquean la síntesis del ARN en las bacterias, porque inhiben la iniciación de la
cadena del ARN.
Otros compuestos, como la estreptolidigina, inhiben la elongación, a través de su unión a la
subunidad B. Las ARN polimerasas nucleares de mamíferos no son inhibidas por la
rifampicina, por lo que ésta se ha utilizado en el tratamiento antibacteriano. Sin embargo, el
hecho de que inhiba la ARN polimerasa mitocondrial implica que este fármaco debe
utilizarse con precaución para no producir alteraciones mitocondriales.
Los inhibidores de las ARN polimerasas nucleares son, lógicamente, sustancias muy tóxicas
para las células eucarióticas. Así, por ejemplo, una de las toxinas del hongo venenoso
Amanita phalloides, la a -amanitina, es un potente inhibidor de la ARN polimerasa II que
produce el bloqueo de la formación de los precursores de los ARNm. La heparina es un
inhibidor de la transcripción ya que, por su naturaleza polianiónica, al igual que el ADN, se
une fuertemente a las ARN polimerasas. Los inhibidores de las topoisomerasas que
introducen y eliminan súper enrollamientos en el ADN, producen también de manera
indirecta la inhibición de la transcripción.