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06/08/2021 María Cristina Navas Thomas camilo Sanín Tobón

Una partícula viral puede estar constituida solo por una cápside proteica y dentro de esta
va a estar el genoma que va a ser un DNA o RNA. A veces los virus adicionalmente a la
cápside proteica van a tener una bicapa lipídica que va a ser obtenida de las células de las
que se está replicando y esto implica condiciones para la partícula como para la infección.

Los virus son parásitos intracelulares obligatorios.

La única manera en la que un virus se puede replicar es que infecte una célula viva y
que sea metabólicamente activo.

Glóbulos rojos no se pueden infectar ya que no tienen algunas de las organelas, pueden
ser usados por medio de transporte por virus transmitidos por garrapatas, pero no ser
infectados.

Vivimos en un mundo lleno de virus:

• Los virus infectan toda clase de


organismos vivos. Hay virus que
solo infectan invertebrados o
artrópodos, pero hay otros que
son transmitidos por vectores,
entonces infectan invertebrados
(artrópodos) y vertebrados.

• Regularmente comemos y
respiramos billones de
partículas virales.
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• Tenemos genoma viral como parte de nuestro propio material genético.


Tenemos virioma en el intestino, estos son los bacteriófagos que infectan las bacterias
que colonizan el intestino. Varios estudios que se han realizado en parejas de mellizos
idénticos han demostrado que puede haber cambios en las bacterias que están
colonizando y que ayudan al metabolismo de los alimentos.

Esta proporción de bacterias va a variar y puede estar asociado con algunas patologías
como la obesidad. Estos bacteriófagos infectan las bacterias que tenemos normalmente
como flota, o bacterias que son patógenas.

En la piel también podemos tener virus que hacen parte de nuestro virioma, también
tenemos unos retrovirus endógenos.

Estos son retrovirus que están


integrados en el genoma.

Con nuevas tecnologías se han


descubierto una gran cantidad de virus
en los últimos años, especialmente en
otros organismos. También se
caracterizan virus de muestras de
aguas oceánicas o aguas profundas.

Cuando se inventa el primer microscopio solo se


podían ver hasta bacterias. Para los
investigadores de en esa época, Pasteur había
demostrado que no había una generación
espontánea y que no salían de la nada esos
organismos, y creíamos que podían fermentar el
vino o dañar algunas otras soluciones. Los virus
no podían observarse y tuvimos que esperar
hasta los años 1950 para que se desarrollara la
microscopía electrónica y poder ver las partículas
virales.

El primer concepto que se va a ver en virus es que se generan agentes filtrables. Se ha


diseñado un filtro de porcelana por Pasteur y Chamberland.
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El agente filtrable o forma viviente contagiosa es el primer concepto ya que ellos no


podían explicar cómo algo que no podía observarse, podía pasar por este filtro de
porcelana podían generar enfermedad.

Hay 2 hallazgos muy importantes:

1. La primera descripción del virus del mosaico


del tabaco. Se maceran las hojas que tenían
las lesiones, se pasan por el filtro de porcelana
y luego reproducían estas lesiones en las hojas
del tabaco en plantas sanas que fueron
inoculadas.

Entonces ellos empezaron a pensar sobre esa


forma evidente contagiosa ya que a pesar de que
lo pasaban por el filtro retenían la infectividad
(primer agente filtrable), incluso cuando se diluía
el filtrado no perdía la capacidad infecciosa de
generar las lesiones en la planta, entonces ellos
tenían claro que no era una toxina ya que esta
pierde la efectividad al ser diluida. También
tenían claro de que no la podían replicar en el
laboratorio (como bacterias, parásitos y hongos).

En ese tiempo no había plantas para potabilizar el


agua, entonces había muchas enfermedades que
generaban una morbilidad y mortalidad
importante. Por esto desarrollan un filtro de
porcelana con unos poros tan pequeños que
podían retener las bacterias y parásitos, ya que
para ellos eran los microorganismos más
pequeños que existían (porque podían ver más
en microscopio).

Pasteur observó que algo que había en la saliva de


los perros que estaban enfermos y eran tan
agresivos, había algún agente que generara la
enfermedad en las personas. En ese tiempo había
una epidemia muy grande del Virus de la rabia en Paris.
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Pasteur obtuvo la saliva de los perros para realizar


pases sucesivos en perros (los inoculaban) con médula
espinal de un perro infectado. De esta forma atenuaba
el virus cada vez que hacía pases sucesivos, ya que el
virus acumulaba mutaciones y se hacía una selección
de las partículas del virus, que pueden tener menor
virulencia (atenuación).

Luego de hacerlo en perros infectados, con la médula


espinal infectó un conejo el cuál no era un hospedero
al cual afectara el virus, y luego a partir de la médula
espinal del conejo infectó a otro perro y este no
desarrolló la enfermedad.
Esta vacuna era una vacuna atenuada ya que en los pases
sucesivos en la médula espinal en perros se hizo la
selección de un virus menos virulento, y era menos
virulento porque el virus perdía tropismo por el SNC.
Adicionalmente inactiva el virus, sometiendo a
desecaciones a esa médula espinal y esto fue lo que
inoculó.
Pasteur era un químico, no médico. Empezó a trabajar
en la fermentación del vino.

A partir de una ave con leucemia aviar, maceraron los


tejidos, los pasaron por el filtro de porcelana, y luego
inocularon animales sanos, entre el 30-50% de los
animales inoculados desarrollaron la leucemia. Primer
agente filtrable descubierto con capacidad
oncogénica.

Hizo lo mismo pero con pollitos y con el Virus del


Sarcoma.

Gana el premio nobel porque es la primera evidencia


de un agente filtrable que genera un tumor sólido.
En este caso el virus porta un oncogen y por esto todos los animales que se infectan
generan un tumor.

En humanos no hay un virus que porte un oncogen.


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En el microscopio de luz solo se puede ver


hasta bacterias (pocos virus). Con el
microscopio electrónico permitía ver la
observación de una partícula viral,
ribosomas, proteínas.

Este microscopio electrónico es muy costoso,


normalmente los virólogos no lo utilizan. En
la parte de arriba hay una fuente de
electrones que se dirige hacia la muestra,
esto permite la observación de las partículas
virales. Se da una tinción negativa.

Primera observación de una partícula viral en 1940.


Bacteria infectada por múltiples bacteriófagos.
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Es un medio de cultivo ideal. Hay células vivas,


metabólicamente activas y con diferentes grados de
diferenciación expresando diferentes proteínas y
receptores de membrana nuclear y membrana plasmática.
Fue reemplazado por el cultivo celular

EXCEPTO para Virus Influenza

Para este último sigue siendo el mejor sistema de


replicación, para realizar las vacunas el virus se replica en
estos huevos embrionados.

Se realizan pases sucesivos en cultivo celular de animales.


Se logró obtener una cepa del virus que era atenuada,
tenía una mutación donde perdía el tropismo por el SNC.

Esta es la vacuna que se usa actualmente (la atenuada); el


virus se replica en el niño. Son unas gotas que se dan en la
boca, el virus va al TGI y se replica allí. Respuesta inmune
muy potente en mucosas. En esta puede haber una
reversión de la mutación (poco probable)

Existe una vacuna inactivada, hay que cultivar el virus a


gran escala y luego inactivarlo (con formalina). La
partícula viral está completa pero perdió capacidad de replicación.
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En los años 1970 se


pensaba que la
información iba en sentido
de DNA – RNA – Proteína,
pero aparece la enzima
Transcriptasa reversa que
devuelve de RNA a DNA.

“Las epidemias han tenido mas influencia que los gobiernos, en el


devenir de nuestra historia.”
-George Bernard Shaw
La peste negra, por una bacteria llamada Yersenia pestis

Los españoles trajeron viruela, sarampión, tuberculosis al continente


americano, esto tuvo un impacto fuerte en los indígenas.
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Cuando las personas no morían dejaban unas cicatrices en la cara y en el cuerpo.

Se dio en China, era una práctica en donde se les


inocilaba con escamas de pacientes con la enfermedad.
Como dato curioso, la gente solía enviar a sus familiares
estas costras por correo para que se inocularan.
Las mujeres que ordeñaban vacas no tenían lesiones en la
cara. Edward Jenner deduce que la exposición de las
ordeñadoras a las lesiones que tenían las vacas (parecidas
a las de las personas) de alguna forma las estaba
protegiendo. Jenner empieza a deducir que el virus de la
viruela que infectaba el ganado vacuno (Cowpox Virus)
estaba protegiendo de manera cruzada con el virus de la viruela humana (Smallpox
Virus).

Por esto las vacunas se llaman así, porque el


primer virus utilizado era del virus de la viruela
vacuna.
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Es el único virus que hemos podido erradicar. Desde


1980 ya no se recibe la vacuna del virus de la viruela.
Gran parte de la población actualmente es susceptible
al virus de la viruela.

Es un virus que podríamos erradicar.

En América se dio por la llegada de los españoles.


En el cuadro se ve la mortalidad desde el año 1980 y
se reduce hasta el año 2014. Es un virus muy
contagioso, mucho más que el Coronavirus. 1
persona puede contagiar hasta 18 personas más,
mientras que el coronavirus hasta 3-4 personas.
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La inmunidad de rebaño no siempre es por vacunación,


también puede ser por infección natural. Normalmente
los virus exigen que el 70% de las personas tengan
inmunidad contra ese virus, esto es difícil que se dé por
infección natural. Como Sarampión es tan contagioso
exige una inmunidad de rebaño del 89-94% (ya sea por
vacuna o porque les dio).

En América se declaró la erradicación del virus en


América en 2016, esto bajo las coberturas de
vacunación; pero este volvió a presentarse en
Venezuela y empezó a circular nuevamente. En
Colombia no ha habido circulación debido a la inmunidad de rebaño que hemos tenido.

Es la segunda pandemia más importante,


después de viruela. La más conocida es la mal
llamada “Gripe española”.

Esto se dio porque hubo una migración de


soldados americanos en la primera guerra
mundial hacia el continente europeo, se
diseminó entonces el virus de la influenza al
resto de continentes. Esta es la más famosa y la
que fue más grave, pero hubo varias:

Este virus tiene una particularidad y es que su


genoma es segmentado, este virus puede
infectar las aves y los cerdos. H1N1 es por
Hemaglutina y Nueraminidasa que son las
glicoproteínas de la envoltura del virus.
En el cerdo puede ser infectado por el virus de
origen aviar o humano, entonces tendrá unos
rearreglos del genoma y surge el H2N2 que
tiene mitad de virus aviar y mitad de virus
humano, tiene mayor virulencia.
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Proviene de los primates y pasa


a humanos, específicamente del
chimpancé. Pero hay otras cepas
que pertenecen a otros
primates.

SARS: Aparece en el año 2000 más o menos. Es un


coronavirus, su nombre se relaciona con el Síndrome
Respiratorio Agudo Severo. El SARS circuló en los años 2002-
2003 y luego dejo de circular. Esto pudo ser por un salto de
especie y se cree que perdió capacidad infecciosa debido a la
acumulación de mutaciones (no se sabe realmente porque
fue)

MERS (Middle East Respiratory Syndrome) apareció en el


2012, también es un coronavirus y fue descrito en el oriente
medio.

Estos 3 coronavirus
corresponden a virus que
infectan animales, pero
hacen un salto de especie
hacia el humano
El murciélago está
implicado en el
primer SARS y en el
MERS.
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Virus Ébola también podía provocar una


pandemia. Entre 2014-2016 hubo un número
importante de muertes en áfrica. Se ha
desarrollado una vacuna, el reservorio es el
murciélago y posiblemente puede pasar al
primate. Es un virus muy contagioso y tiene una
mortalidad importante. Al lado derecho vemos
la microscopía electrónica del virus del Ebola.

Actualmente el
principal foco de
infección es América.

El circulo amarillo es
el Covid-19 y el círculo
azul más grande es el
virus de la influenza
H1N1, esta es la
comparación de la
mortalidad.

Como el virus es intracelular obligado, esto tiene


implicaciones en el desarrollo de estrategias antivirales.
Esto ha permitido tener más claro algunos mecanismos
celulares.
Un virus es una cápside proteica muy estable en el medio
ambiente, dentro tiene un genoma que puede ser ARN o
ADN, nunca es híbrido. Algunos virus adicionalmente a la
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cápside tienen una envoltura viral que es una bicapa lipídica. En verde (El redondo de la
imagen de la derecha) tenemos la bicapa lipídica.

En amarillo está la estructura de un bacteriófago que es una estructura un poco más


compleja pero que tendrá también cápside proteica y genoma.

En la clasificación de los organismos no se incluye a los virus ya que estos no tienen


ARN ribosomal.

Hasta hace algunos años decíamos que los virus son más
pequeños que una bacteria

- En amarillo tenemos el Poxvirus viruela que es


uno de los más grande
- El rojo es un bacteriófago y la bolita pequeña es
un Fagovirus
- Lo que está a la izquierda es la bacteria E.Coli
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En aguas oceánicas profundas se empezaron a caracterizar los virus y se dieron cuenta que hay
unos megavirus que pueden ser mas grande de lo que habíamos pensado, como el megavirus
chilenis

Ahora se sabe que existen virus que pueden ser más grandes que algunas bacterias.

Las proteínas estructurales son las que forman


la partícula viral.

Estas proteínas estructurales forman la


cápside, están en la envoltura y son las
glicoproteínas y su función es proteger el
genoma del virus para tener toda su capacidad
infecciosa y tenga toda su información
genética para replicarse y realizar la infección.

Las partículas del exterior del virus van a tener


una función muy importante que es la unión
con los receptores de las células a las cuales
van a infectar.

Normalmente cuando hablamos de las


proteínas estructurales hablamos de las de la cápside y las que envuelven, pero algunos
virus tienen proteínas dentro de la partícula viral, como (diapositiva):

Estas proteínas y proteasas también hacen parte de las proteínas estructurales ya que
también forman la partícula viral.
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El virus solo las utiliza durante la replicación en la


célula, entonces las expresa en este momento, pero
nunca las empaqueta dentro de la partícula viral,
luego cuando se arma la partícula viral deja de
expresarlas; por tanto, no son
estructurales.
En la imagen la Compleja es:
Poxvirus o Virus de la viruela por
microscopía electrónica.

Hay virus que solo sintetizan una proteína de cápside


(Ej: Hepatitis C), la repiten mínimo unas 60 veces. Esto
hace que sea una cápside muy estable en el medio
ambiente. En el caso de virus desnudos (sin bicapa
lipídica) se habla de que esta cápside es muy estable.

Se autoensambla, se forman dímeros, trímeros y luego


subunidades y es muy estable en el caso de los virus
desnudos.

Hay algunos virus que tienen más


subunidades y por tanto no se
notan los ángulos, pero siguen
conservando esta simetría
icosahédrica.

Cada uno de los triángulos que


forman la cápside (son
subunidades) pueden estar
constituidos por varias
repeticiones de una sola
proteína o de varias proteínas.
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• Subunidad es la cadena de polipéptidos plegada


• Unidad estructural es la unidad que forma la cápside.
• Cápside protege el genoma.
• Nucleocápside (core) es cuando tenemos una cápside con el genoma (solo).

• Virión es una partícula viral con capacidad infecciosa. No todas las partículas
virales que se generan cuando el virus se replica en la célula tienen capacidad
infecciosa ya que puede haber mutaciones que generen algunos defectos y no tenga
capacidad infecciosa.

Cuando los virus son desnudos quiere decir que


solo tienen esa cápside icosahédrica.

Son virus muy resistentes en el medio ambiente


debido a su cápside proteica. En la diapositiva dice
lo que puede resistir en agua mineral, y en el
ambiente siendo infeccioso.

Ha habido brotes de hepatitis A con el consumo de


camarones, ostras y alimentos que se pueden
consumir crudos.
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Adicional a la cápside proteica tienen una


bicapa lipídica.

Al lado izquierdo los Herpes virus y al lado


derecho tenemos los Coronavirus.

El virus no tiene interés en llevarse proteínas


celulares (hay excepciones).
Desplaza algunos dominios de la membrana
celular y todas las proteínas celulares;
empieza a crear las proteínas virales para que
cuando haga la salida de la partícula viral esta
se lleve la bicapa lipídica con sus
glicoproteínas. Esta bicapa lipídica lo hace
más susceptible.

Para perder su infectividad, se requiere de un


estrecho contacto entre hospedero-
hospedero, ya sea por convivencia, alguien
estornuda cerca, relaciones sexuales, madre
hijo, etc.

El SARS-CoV-2 si mantiene capacidad infecciosa por hasta 72 horas en superficies inertes.

En el Herpes virus se ve la envoltura que parece que le


queda grande

Microscopía electrónica del Herpes virus.


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El jabón genera unas micelas que dañan la


envoltura al virus.

Si el virus pierde las proteínas de la envoltura


entonces pierde capacidad infecciosa.

Por esto es tan importante el lavado de


manos.

Tienen varios sitios de glicosilación lo que


hace que sean menos inmunógenas.

Las glicoproteínas pueden ser proyectadas


hacia afuera (influenza) o estar más en la
superficie (proteína E de Flavivirus).

Generalmente los virus son RNA de simetría helicoidal


tendrán la estructura de arriba-derecha, con una forma
sigmoidal.

Se repite más de 1000 veces la subunidad que protege


cada una de las hélices del RNA que se ha sintetizado.
Los virus helicoidales siempre son RNA y Siempre un
virus helicoidal tiene que ser envuelto.
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En el virus icosaédrico la unidad esta sellada. En este helicoidal se protege la secuencia,


pero no es una unidad sellada, por esto los virus helicoidales siempre tienen que tener
envoltura.

En la imagen izquierda se ve:

• Amarillo: RNA.
• Rojo: Proteínas de nucleocápside.
• Morado: Proteína Spike, se encuentra en la envoltura
• Amarillo claro: Proteína de hemaglutinina que está en la envoltura.
• Rojo y amarillo de adentro: El genoma del virus que está en simetría helicoidal y
proteína de nucleocápside.

Imagen derecha:

• Azul: Nucleoproteína que protege el genoma


Si se daña la bicapa lipídica (virus no desnudo) se
pierde la glicoproteína externa que es la necesaria
para unirse con el receptor celular. Esta bicapa le da
una ventaja en la patogénesis pero también da
desventajas en cómo se puede transmitir.

Coronavirus es el único virus envuelto que puede


transmitirse por tracto gastrointestinal.
El resto son virus desnudos ya que el tracto
gastrointestinal va a dañar la envoltura.
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A la izquierda tenemos una partícula de Coronavirus


(SARS-CoV-2).
Tiene una proteína Spike que se proyecta desde la
bicapa lipídica (le da la forma de corona). A la
derecha se ve la microscopía electrónica del
coronavirus.

Las micelas de jabón van a dañar la estructura de


bicapa lipídica y alteran la parte externa de la partícula
viral perdiendo capacidad infecciosa.

Tienen otro tipo de estructuras. En el virus de la


viruela tenemos la partícula viral, doble cadena de
ADN, cuerpos laterales, envolturas lipoprotéicas.

Los bacteriófagos tienen una cápside, luego un


conector, luego una cola contráctil y unas fibras
(que parecen patas).

Los bacteriófagos nunca entran a la bacteria, solo


inyecta el genoma del virus. Para esto tiene una
cola contráctil que le permite unirse a la pared
bacteriana e inyectar su genoma.
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Existe un comité internacional que clasifica los Virus. Ej: Virus respiratorio sincitial.

Cuando hacen la amplificación del genoma del


Coronavirus, se ve que la secuencia es muy parecida
a otros coronavirus.

Se ven los aislados de Wuhan (al lado de la persona,


en rojo) y están muy cerca de los aislados de
murciélago.

Están lejanos del coronavirus SARS-CoV de 2002


(arriba del todo en rojo, personita). También se
puede ver en la parte inferior el MERS-CoV (encima
de lo amarilla)

Hay otros 4 coronavirus que llevan a infecciones


benignas, sin mortalidad (o muy baja).
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Cuando están fuera de la célula se cómo una


partícula no encuentra un hospedero pasan unos
días y se inactiva la partícula viral. Cuando entran
una célula si se considerar un microorganismo vivo.

En las bacterias se ve la curva de crecimiento ya que


se dividen por fisión binaria, esto se ve en el
cultivo.

En los virus después de inocular un cultivo celular,


hay un periodo de Eclipse, en este periodo la
partícula viral como tal “desaparece” ya que la
partícula debe liberar el genoma y realizar todo el
proceso para su replicación. Luego se sintetizan
nuevamente el genoma, proteínas, etc, aparece de
nuevo y se replica. El periodo de Eclipse depende
del virus, algunos se demoran 24 horas y otros se
demoran días.
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Lo que más le interesa es la síntesis de proteínas,


pero puede requerir otras cosas (nombradas en la
diapositiva anterior).

Para síntesis de ARNm necesita de la polimerasa


celular.

La gran mayoría de virus necesita que la célula


sintetice sus nucleótidos, pero algunos virus
pueden sintetizar sus propios nucleótidos como el
Virus de la viruela.

1. Adhesión
2. Entrada
3. Descapsidación
4. Síntesis de
proteínas
5. Replicación del
genoma
6. Ensamblaje
7. Maduración
8. Salida de partículas

1. Adhesión de la partícula a la célula


2. Entrada que puede ser por endocitosis
3.Descapsidación donde se desarma la partícula viral para liberar el genoma
4.Traducción de proteínas virales a partir de RNAm (síntesis de proteínas)
5.Replicación del genoma del virus
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6.Ensamblaje
7.Maduración de la partícula viral
8. Salida del virus de la célula por gemación o exocitosis

El virus de la viruela ya que es más


complejo y sintetiza sus propios
nucleótidos y tiene sus DNA
polimerasas, no necesita ir al núcleo de
la célula, se va a replicar en el
citoplasma, este es la excepción.

Siempre los virus de DNA deben


replicarse en el núcleo.
Estos necesitan una forma de
interacción, por medio de la Tubulina
para ir al núcleo (transporte).
Normalmente los virus DNA son de
mayor tamaño. Son más estables que
los virus RNA ya que tienen menor
variabilidad genética.

Se replican siempre en el núcleo de la


célula con excepción de algunos
(influenza, hepatitis B).

Estos virus RNA siempre van a codificar


su propia RNA polimerasa ya que en la
célula no hay una RNA polimerasa que
copie a partir de un mol de RNA, solo
tiene RNA polimerasas que copian a
partir de DNA (excepción el VHB).

Son de menor tamaño, codifican unas


12-15 proteínas pero son suficientes para producir daño.

En la parte interna del triángulo vemos los virus RNA, con un genoma más pequeño,
menor fidelidad de replicación ya que la RNA polimerasa viral no tiene capacidad de
corrección, entonces al sintetizar los genomas tendrá una tasa de error más grande, y
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generalmente son menos complejos ya que sintetizan menos proteínas a comparación de


los virus DNA.

Los virus DNA (triángulo externo) tienen mayor tamaño en su genoma, son más
complejos ya que sintetizan más proteínas y tienen una fidelidad en la replicación mayor
ya que utiliza la DNA polimerasa celular la cual tiene capacidad de corrección.

En un punto intermedio están nos Nidovirus (coronavirus y otros) que a pesar de ser virus
RNA tienen una proteína que puede hacer correcciones (triangulo del medio).

Los virus RNA y DNA debido a su gran capacidad de mutación se generan las
Cuasiespecies. Uno está infectado con un genotipo de un virus en particular, pero cada
vez que el virus se replica puede generar mutaciones (variabilidad genética), estas
pueden ser favorables o no favorables.

Las mutaciones favorables (cambios como aminoácidos de alguna proteína) van a generar
que, para el sistema inmune, cada uno de estos virus que tiene pequeñas modificaciones
es como si fuera un virus diferente. El sistema inmune monta una respuesta nueva para
cada una de estas Cuasiespecies, este es un mecanismo que tienen los virus para generar
persistencia.

Cuando un virus se replica en un organismo se realizan mutaciones en varios puntos del


genoma, si las mutaciones se generan en regiones donde no se compromete la actividad
de la polimerasa del virus, ni el dominio que se va a unir con el receptor celular o cosas
indispensables, esto genera pequeñas variaciones en las proteínas que constituyen la
partícula viral y el sistema inmune reconoce estos nuevos péptidos y por esto monta una
nueva respuesta.

En la figurita de la derecha con colores:

• Fitness landscape: Esto se refiere a la eficiencia de un virus replicándose. Algunas


cuasiespecies tienen mejores fitness, es decir, van a ser más eficientes replicándose
y generarán más partículas virales que otras cuasiespecies.
• Mutaciones neutrales: Aunque se da una mutación la secuencia cambia, pero el
aminoácido no.
• Mutaciones letales: Mutaciones deletéreas para el virus. Ej: Si el virus acumula una
mutación en la región del dominio catalítico de la RNA polimerasa, esta partícula
viral no tendrá como replicarse, entonces se extingue.
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• Puede haber una selección dentro de las variantes que se están generando ya que
la mutación les puede ayudar a replicarse mejor en unas células que en otras, etc.

Si es un virus desnudo va a ser un dominio de la


cápside, si es envuelto será uno de los dominios
de las glicoproteínas (Ej: VIH, es virus envuelto y
su glicoproteína gp120 se va a unir con el
receptor CD4)

La partícula viral puede hacer un movimiento o


desplazarse a lo largo de la membrana de la
célula, ya que puede haber dominios que
facilitan la entrada de la partícula viral. También
porque va a necesitar esos dominios donde este
el receptor y correceptor (EJ: En caso de VIH).

Esa interacción de la partícula viral o del


dominio de la partícula o de su glicoproteína
con el receptor es una interacción muy
específica.
Partículas que acumulen mutaciones en esta
región de adhesión ya no serán infecciosas. Por
esto es bueno dañar la bicapa lipídica al
coronavirus ya que no tendrá la glicoproteína
para adhesión.
La glicoproteína forma unos trímeros de la
Spike, expone un dominio de unión al receptor.

La Spike se une a la ACE2 o enzima convertidora de angiotensina. Este receptor también


es utilizado por otros 2 coronavirus (SARSCoV y otro). El coronavirus actual hizo un
cambio en los aminoácidos de interacción con el receptor celular y ahora tiene una
afinidad 10-20 veces mayor que el coronavirus de hace 18 años.
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En caso de que sea un virus desnudo la


interacción se dará con una región de la cápside
del virus. En la evolución el virus ha adaptado
una proteína para hacer interacción con una
proteína celular que le permita hacer la adhesión
y entrada a la célula.

El receptor ACE2 es muy importante en el


sistema Renina-angiotensina. Cuando el virus
entra por endocitosis se lleva el receptor ACE2 y
deja desprovista a la célula del receptor.

En bacteriófagos solo entra el genoma.


La partícula viral puede hacer movimiento en la
membrana plasmática ya que le interesa buscar
las balsas de lípidos. Son colesterol con
glicolípidos, lectinas, proteínas con dominios
transmembranales. Estos dominios son más
flexibles a la entrada de las partículas virales.

Es la primera forma de entrada. Al lado


izquierdo tenemos la microscopía
electrónica de cómo se va haciendo la
invaginación de la membrana, formación
del endosoma. Cuando se forma el
endosoma, si interviene la proteína
clatrina en la formación de ese endosoma
esta es una forma de marcar que el
endosoma temprano que tiene un pH de
7.0, habrá una acidificación del pH por
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fusión con el lisosoma, pasa a ser un endosoma


tardío con un pH de 6.0. Hay virus que necesitan
utilizar esta vía con clatrina porque necesitan
exponer la partícula viral a ese pH ácido. El
cambio de pH hace una modificación de la
partícula viral lo que le permite la descapsidación
para fusionar la envoltura del virus con la
membrana en el endosoma y se libere el genoma.
(Ej: Adenovirus).

En el caso del coronavirus hay una endocitosis


mediada por clatrina.

En la imagen derecha se ve una fusión de la


membrana del endosoma con la bicapa lipídica del
virus para que se libere el genoma viral.
No todos los virus lo hacen por medio de la clatrina
y dependiente de pH.
06/08/2021 María Cristina Navas Thomas camilo Sanín Tobón

Hay algunos virus que van a


requerir que, aunque entren por
endocitosis NO se cambie el pH
neutro del endosoma, en este
caso los virus van a utilizar en
lugar de clatrina la Caveolina que
permite la formación del
endosoma, y de esta forma
aseguran que el pH se va a
mantener neutro.

Hay otros virus que van a entrar por un


proceso que se llama Fusión, desde la
membrana plasmática van a fusionar la
envoltura del virus con la membrana
plasmática de la célula.
El virus siempre va a tener una proteína o
dominio de glicoproteínas que va a permitir
acercar las 2 bicapas lipídicas.
En la primera imagen vemos la envoltura
del virus, la membrana celular con su
receptor.
Luego habrá un cambio de configuración de
una de las glicoproteínas de la estructura
del virus, este cambio va a exponer el
péptido de fusión.
El péptido de fusión hará interacción con la
bicapa lipídica de la célula y luego estas 2 bicapas
lipídicas (del virus y célula) se van a acercar, se
intercalan los lípidos de las 2 membranas y así
ingresará la partícula viral. Ej: VIH:
06/08/2021 María Cristina Navas Thomas camilo Sanín Tobón

Cuando la partícula viral ya está allí, necesita un transporte. Para esto el virus puede
hacer interacción con el citoesqueleto para hacer movimiento.

Lo siguiente es hacer la
descapsidación para poder liberar
el genoma del virus y que este
pueda utilizar la maquinaria
celular.

En la primera figura las


glicoproteínas del virus quedan en
la membrana plasmática de la
célula y entra solo la
nucleocápside.

Por endocitosis entran desnudos o


envueltos, por fisión solo
envueltos.

Una vez la partícula viral ya está


dentro (completa o la
nucleocápside) va a requerir un
transporte hasta la organela
que necesite.
Para esto el virus puede hacer
interacción con el
citoesqueleto para poder hacer
el movimiento de las partículas
virales.
06/08/2021 María Cristina Navas Thomas camilo Sanín Tobón

• Se puede dar desde la membrana plasmática (1er


esquema) donde el virus entra por fusión y las
glicoproteínas del virus quedan en la membrana
plasmática de la célula, entonces entra solo la
nucleocápside.
• La descapsidación también se puede hacer en la
membrana nuclear (2do esquema en rojo) como en el
coronavirus.
• También se puede hacer en el endosoma (3er
esquema)
06/08/2021 María Cristina Navas Thomas camilo Sanín Tobón

El genoma ya se ha liberado pero sigue


protegido por proteínas celulares ya
que hay RNAsas y DNAsas en la célula.

Si es un virus RNA de cadena positiva


quiere decir que se comporta como un
RNA mensajero entonces van
directamente a los ribosomas.

Se comportan así ya que en su


extremo 5´ tienen un plegamiento y
este forma una estructura secundaria
que es reconocida por los ribosomas.

Puede tener 2 tipos de plegamientos:

1. Una estructura secundaria particular de los virus que van a tener varios segmentos
de doble cadena en este extremo 5´y se conoce como IRES o sitio de entrada
interna al ribosoma. Es reconocido por la unidad ribosomal y empieza a hacer las
síntesis de las proteínas.

Los virus RNA de cadena positiva codifican siempre una poliproteína, quiere decir que
tienen un codón de inicio antes de la proteína de Cápside (C en la imagen de arriba) y un
codón de terminación después de la NS5. Entre las proteínas (C, M, E, etc. en la imagen)
no hay ningún codón de iniciación ni terminación, solo se forma una sola poliproteína que
luego es clivada en proteínas individuales.

2. Los virus RNA de cadena positiva también pueden tener lo mismo que los RNAm
celulares, esto es una 7-metilguanosina (7metG). Esta guanosina metilada en el
extremo 5´ es lo que se conoce como el Cap. Este Cap es reconocido por el
ribosoma. En el caso del coronavirus tienen esta 7-metilguanosina. Es muy
eficiente ya que la célula no se da cuenta que le está sintetizando las proteínas al
virus ya que este ha adaptado completamente su genoma a las exigencias del
ribosoma.

Los coronavirus son virus RNA pero son bastante grandes en el tamaño de su genoma. En
la forma anterior (la número 1) sintetiza en una sola lectura toda la poliproteína. En los
coronavirus se sintetizan en 2 o 3 tiempos las proteínas. Inicialmente el complejo
polimerasa, se traduce una parte del genoma del virus generando una poliproteína, se
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forma el complejo de replicación y este va a permitir la síntesis de otros RNA para luego
hacer la síntesis de las otras proteínas (se explica más completo en lo siguiente):

En la imagen se ve la descapsidación, reconocimiento por el ribosoma de la 7-


metilguanosina, traducción de la primera parte del genoma que son las proteínas no
estructurales que forman el complejo de replicación y a partir de ese RNA genómico
(gRNA) el virus va a sintetizar una cadena complementaria que es el RNA antigenómico
que va a permitir la síntesis de unos RNAs genómicos para sintetizar el resto de las
proteínas como la Spike, Nucleoproteína, proteína E y M. La polimerasa del virus también
se encarga de sintetizar una cadena complementaria completa (la de azul de abajo) que
es el RNA antigenómico y este va a servir de molde para hacer nuevas copias de RNA
genómico que será ensamblado por interacción con la proteína de nucleocápside,
simetría helicoidal y luego por la interacción de las glicoproteínas Spike y E que van a
estar ubicadas en el Retículo endoplásmico para que se ensamble la partícula viral y en
este caso sale por Exocitosis.
06/08/2021 María Cristina Navas Thomas camilo Sanín Tobón

Los virus ARN de cadena negativa (-) es


la cadena complementaria de la positiva.
Este genoma no puede ser reconocido
por los ribosomas celulares. Estos virus
tienen su propia polimerasa pero no la
necesitan dentro del a partícula viral.

Los virus ARN de cadena negativa lo


primero que deben hacer es copiar sus
ARNm. La célula no puede hacer este
trabajo ya que no copia ARNm a partir de
ARN sino a partir de ADN. La polimerasa
del virus sintetiza los ARNm de proteínas
individuales (generalmente) que permite
la síntesis de distintas proteínas.

El virus puede regular cuantas copias de


polimerasa necesita o de proteína de
matriz o de la proteína que debe
requerir ya que son ARNm individuales
para cada proteína, contrario a los ARN
de cadena positiva.
06/08/2021 María Cristina Navas Thomas camilo Sanín Tobón

Si es un virus ADN lo primero que deben hacer es ir


al núcleo, allí en ADN viral va a ser transcrito a
ARNm por la ARN polimerasa celular tipo II y estos
ARNm van a ser transportados al citoplasma para
que se traduzcan las proteínas, se sinteticen y luego
se pueda ensamblar. Ej: Hepatitis B.

El ARN no es traducido por el ribosoma.


Inicialmente la Transcriptasa reversa que viene
dentro de la partícula viral va a hacer una copia
complementaria de ADN (híbrido ADN – ARN),
luego se hace la segunda copia de ADN, se
degrada el ARN, ingresa al núcleo, se integra al
azar en alguna región del genoma celular que es
lo que se conoce como el Provirus. Estando
como Provirus se comporta como si fuera una
secuencia más de la célula y a partir de esta
secuencia de Provirus es que se van a sintetizar
los diferentes ARNm.

Cuando entra la transcriptasa reversa a partir del ARNA hace una copia complementaria
de ADN.
Tendremos el híbrido que luego forma ADN de doble cadena. Luego ingresa al núcleo
junto con la integrasa (proteínas del virus) para poder integrar el genoma y formar el
Provirus, a partir del cual se va a hacer la transcripción.
06/08/2021 María Cristina Navas Thomas camilo Sanín Tobón

No es que no pueda sino que las


dos copias de ARNm que tienen
los retrovirus tienen un ARNt de
origen celular unido al extremo 5´
que va a ser utilizado como
primer para hacer la síntesis de la
cadena complementaria de ADN.
Ese ARNt “bloquea” que se utilice
esta copia del genoma del virus
como ARNm, además de que el
virus necesita formar unas
regiones repetitivas en cada uno
de los extremos y que no podría
hacer si se traduce directamente
el ARNm (esto lo dijo por una
pregunta que hicieron de por qué
no puede utilizar el ARNm)

Después de que se han sintetizado las diferentes proteínas del virus, este debe hacer
nuevas copias de su genoma ya sea: Porque en los virus RNA, su propia RNA polimerasa es
la que hace las nuevas copias del genoma.

Si es un ARN de cadena positiva


hace un molde de RNA
complementario que sería el
negativo a partir del cual se
pueden hacer muchas copias de
RNA genómico. Al contrario, si es
un virus RNA negativo hace un
molde complementario positivo
para hacer nuevas copias. Si es un
virus DNA también hará las
nuevas copias del genoma, puede
utilizar la polimerasa de la célula
o su propia DNA polimerasa.
06/08/2021 María Cristina Navas Thomas camilo Sanín Tobón

Las proteínas no estructurales las deja en la célula porque ya no las necesita.


El virus va a necesitar:
• Chaperonas: de parte de la célula
que le va a ayudar a plegar sus
proteínas.
• Sistema de transporte para
moverse por si van a ingresar otra
vez al núcleo, ya que algunos virus
se ensamblan en el núcleo, otros
en el RER, otros cerca de la
membrana plasmática.
• Péptidos señal en el caso de las
proteínas virales que van a
anclados a membrana.
• Desplazar proteínas o dominios de
membrana en el RE o membrana
plasmática donde van a hacer las
proteínas virales; desplaza las proteínas celulares.

Va a haber interacción, se forman las


subunidades (Ej: poliovirus son 4
proteínas que forman la subunidad
estructural de la cápside) y luego se va a
empezar a ensamblar (autoensamblaje)
de la cápside, interacción con el genoma y
luego la salida de la partícula viral

Si el ensamblaje es con un virus que tiene


envoltura, dependiendo de la ubicación
entonces se dará o en el Retículo
endoplásmico (RE) o en la membrana
plasmática.
06/08/2021 María Cristina Navas Thomas camilo Sanín Tobón

Las partículas virales pueden salir por


gemación en caso de virus envueltos que
ubican sus glicoproteínas en membrana
plasmática.

Por exocitosis cuando ese ensamblaje se


hace en el RER y luego por exocitosis sale
la partícula viral.

También pueden salir por Lisis, los virus


desnudos generalmente salen por lisis,
hacen una replicación muy activa y muy
rápida y generan gran cantidad de
partículas virales que producen poros en
la célula, esta célula muere y se liberan las partículas virales.

Cuando los virus salen por gemación también producen pequeños poros. Si la gemación
es a un ritmo moderado la célula no necesariamente debe morir por la salida de estas
partículas virales. Si van a salir muchas partículas virales por gemación, cada vez que la
célula pierde un pedazo de membrana y electrolitos entonces puede producir la muerte
de la célula.

“Puedo aceptar el fracaso, todo el mundo fracasa en algo, pero lo que no puedo
aceptar es no intentarlo”
Michael Jordan

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