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PROTEMICA

ALUMMNOS:
ESPINOZA BALDEN JOSELYN
CASTRO CAPISTRN KATHERINE

INTRODUCCIN
PROTEOMA:
ES EL CONJUNTO COMPLEMENTO DE PROTENAS EXPRESADAS POR UN
GENOMA, CLULA U ORGANISMO. ES EL CONJUNTO DE PROTINAS
EXPRESADAS EN UN TIEMPO DADO, BAJO CONDICIONES DADAS.

PROTEMICA:

Existen tres ramas en la


protemica que tratan de caracterizar el proteoma
estudiando distintos aspectos del mismo:
La protemica de expresin se encarga del estudio de la
abundancia relativa de las protenas y de sus modificaciones
postranscripcionales.
La protemica estructural se encarga de la caracterizacin de la
estructura tridimensional de las protenas
La protemica funcional se encarga de la localizacin y
distribucin subcelular de protenas y de las interacciones que
se producen entre las protenas y otras molculas con el fin de
determinar su funcin

USOS

Permite identificar , categorizar y clasificar las protenas con respecto a


su funcin y las interacciones que establecen entre ellas

Identificacin de nuevos marcadores para el diagnstico de las


enfermedades.

Identificacin de nuevos frmacos.

Determinacin de mecanismos moleculares involucrado en la patogenia


de las enfermedades.

Anlisis de rutas de transduccin de seales.

TCNICAS DE PROTEMICA

Tcnicas empleadas para analizar


globalmente el proteoma y separar sus
protenas.

ELECTROFORESIS BIDIMENSIONAL:

-DIGE (Difference In Gel Electrophoresis: electroforesis diferencial en gel)


-ICAT (Isotope-Coded Affinity Tags: marcaje isotpico diferencial)
-MudPIT(Multidimensional Protein Identification Technology: tecnologa de
identificacin de protenas multidimensional)

Tcnicas usadas para analizar


individualmente las protenas.

TIPOS DE ESPECTROMETRA DE MASAS

- MALDI-TOF (Matrix-assisted laser desorption/ionization Time Of Flight:


desorcin/ionizacin mediante lser asistida por matriz en tiempo de
vuelo)

SELDI-TOF-MS (Surface Enhanced Laser Desorpcion Ionization Time Of


Flight Mass Spectrometry: espectrometra de masas en "Tiempo de
Vuelo" mediante desorcin/ionizacin por lser de superficie)

MS/MS (Mass Spectrometry/ Mass Spectrometry: espectrometra de


masas en tndem).
Actualmente hay numerosas bases de datos que recogen las
huellas peptdicas de multitud de protenas conocidas. Estas
bases de datos se pueden rastrear usando programas
bioinformticos para buscar la huella peptdica que
corresponda con la huella peptdica de la protena que se est
estudiando y por tanto poder identificarla.

Tcnicas que se usan para


estudiar interacciones entre
proteinas
los sistemas yeast two hybrids de alto rendimiento

La tcnica Phage Display permite averiguar con qu protenas


interacciona una protena problema o sonda.

Esta tcnica consiste en la expresin en la superficie de un fago


de las protenas que se quieren analizar. La protena problema o
sonda se inmoviliza sobre un soporte o membrana de tal modo
que los fagos que expresan las protenas que se unen a la sonda
quedan inmovilizados sobre el soporte. Estos fagos se pueden
recuperar fcilmente de la membrana y pueden ser empleados
para la expresin de la protena en Escherichia coli y su posterior
identificacin.

El anlisis y la interpretacin de los datos obtenidos


con las tcnicas de protemica descritas
anteriormente, especialmente cuanto se utilizan a
gran escala, necesita herramientas bioinformticas.
Durante los ltimos aos la genmica, la protemica y
la bioinformtica se han desarrollado de forma
sinrgica experimentando un desarrollo sorprendente
que est aportando grandes avances a la medicina

GRACIAS

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