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UNIVERSIDAD NACIONA DE

TRUJILLO
FACULTAD DE CIENCIAS
BIOLOGICAS
SEGUNDA ESPECIALDAD DE
BIOLOGIA MOELCULAR Y GENETICA

BIOINFORMATICA

INTRODUCCION A LA BIOINFORMATICA
EXPLORACION DE BASE DE DATOS

DOCENTE: MARIA NOEMÍ LLANOS ROMAN


M.Sc Biología Computacional y Bioinformática ETH Zurich
Doctorado en Ciencias Biomedicas UNT

Alumno: Lic. Manuel Eduardo Chepe Pinglo


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ESPECIALIDAD EN BIOLOGÍA MOLECULAR Y GENÉTICA

Parte 1: Solución de búsqueda de información preguntas:


1.1. BUSQUE LS 3 PUBLICACIONES MAS RECIENTES DE TIPO REVIEW DE LOS ULTIMOS 15 AÑOS
SOBRE SINDROME METABOLICO.HAGA CAPTURAS DE PANTALLA DEL ABSTRACT DE DICHAS
PUBLICACIONES SOLICITADAS

Se realiza la búsqueda del NCBI (Centro


Nacional para la Información
Biotecnológica) en la página de GOOGLE

Luego se realiza clic en National Center for


Biotechnology Information

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Ingresamos al NCBI y luego vamos al buscador en la


opción PUBMED y colocamos nuestro tema de
interés: SINDROME METABOLICO

Vamos a la opción del tiempo, para colocar las


publicaciones de los últimos 15 años, es decir del
2008 al 2023.

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Colocamos la opción de REVIEW y vemos las


diferentes publicaciones del Síndrome Metabólico y
seleccionamos 3 de ellos.

PRIMERA PUBLICACION: Influence of the


microbiota and probiotics in obesity- visualizando
el Abstract

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SEGUNDA PUBLICACION: Obesity and


hypertension in Latin America: Current
perspectives- visualizando el Abstract

TERCERA PUBLICACION: Food portion sizes,


obesity, and related metabolic complications in
children and adolescentes - visualizando el Abstract

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1.2. Indique cuantas publicaciones han estudiado la aneurisma cerebral en mujeres en los últimos
20 años.

8. Entramos al buscador del PubMed, y colocamos


el tema de interés: ANEURISMA CEREBRAL EN
MUJERES.

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1.3. Indique cuantos bioproyectos hay en el NCBI de diabetes mellitus. Y haga captura de pantalla
del primer bioproject.

Ingresamos al NCBI, y vamos


a la opción BioProject.

Colocamos DIABETES MELLITUS


y damos clic en el buscador

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Podemos ver el listado de


BioProject, que va desde el
N°01, en la pagina 1

Podemos ver el listado de


BioProject, hasta el N° 497 en la
pagina 25

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Parte 2: Búsqueda de información de su gen de interés:


2.1. Proponer un tema de estudio/investigación de su interés (como si fuera un problema de
investigación).

2.2. Realizar una búsqueda de 3 genes relacionados con su tema de interés (indicado en 2.1).

1 2 3

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SE VISUALIZA
LA LISTA DEL
GEN ACE1
RELACIONADOS
CON LOS
DIFERENTES
ORGANISMOS

GEN ACE1 RELACIONADO


CON Drosophila
melanogaster(mosca de
fruta), mostrándose:
 Gen relacionado
 Su ID
 Su Localización

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GEN ACE1 RELACIONADO


CON Fusarium poae
(Hongo), mostrándose:
 Gen relacionado
 Su ID
 Su contexto
genómico
 Sus regiones
genómicas, sus
transcritos y sus
productos

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2.3. De un gen de interés (uno de los 3 genes elegidos en 2.2.), haga captura de pantallas de la
información más relevante disponible de dicho gen y explíquela (para explicar puede usar otros
recursos como cuadros de diálogo flechas, etc.).

Localización de gen
ACE1 y su conteo de
exones

Su
secuencia
genómica

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Información general
de la proteína

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2.4. Baje/descargue las secuencias de su gen de interés elegido en 2.3 (secuencia del gen, secuencia
del transcrito y secuencia de proteína) en formato FASTA y muestre con capturas de pantalla y otros
recursos de ayuda visual el proceso de descarga de estas secuencias

Gen de interés

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Se descarga la secuencia
de nucleótidos en
formato FASTA

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Parte 3: Exploración de nuevas bases de datos


3.1. Buscar en otras 2 bases de datos de su gen de interés (del gen elegido). Deben ser 2 bases de
datos diferentes a NCBI (pueden ser de las estudiadas u otras), e indicar/explicar por qué eligió
esas bases de datos (que información le proporcionaron de su gen elegido).

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