UNIVERSIDAD NACIONAL AUTÓNOMA DE

MÉXICO
FACULTAD DE ESTUDIOS SUPERIORES
CUAUTITLÁN
SECCIÓN DE BIOQUÍMICA Y
FARMACOLOGÍA HUMANA

LICENCIATURA EN BIOQUÍMICA DIAGNÓSTICA

CLAVE: 10569

ASIGNATURA:
Genética Aplicada

Reporte de la práctica:

BIOINFORMÁTICA.

ALUMNO:
ORTIZ MAR KEVIN ALEJANDRO

EQUIPO 4

GRUPO 1001

ASESORES (AS):
MARIA LLASBETH HERNANDEZ CALDERON
ROSA MARIA DE LOS ANGELES LOPEZ CABRERA

FECHA DE REALIZACIÓN: 19 DE NOVIEMBRE DE 2019

FECHA DE ENTREGA: 26 DE NOVIEMBRE DE 2019
INTRODUCCIÓN
La bioinformática es considerada por algunos como la biología computacional
gracias a la aplicación de técnicas analíticas y cuantitativas para el modelamiento de
sistemas biológicos, es decir, son “los métodos matemáticos, estadísticos y
computacionales que pretenden solucionar problemas biológicos usando secuencias
de ADN y aminoácidos e información relacionada". Fredj Tekaia, (microbiólogo
Instituto Pasteur).

Ésta ciencia logra conjugarse con otras ramas como la física, química, matemáticas,
estadística, entre otras lo que le permite estudiar la información biológica desde su
almacenamiento en el genoma hasta la obtención de productos génicos en la célula.
Por ello, la secuenciación de genomas lleva la necesidad de obtener conclusiones
de la lectura de esos millones de pares de bases, saber qué codifican, cómo se
relacionan y regulan la expresión de los distintos productos génicos, además de
encontrar la función de proteínas desconocidas y de generar modelos que permitan
estudiar mutaciones puntuales. La rapidez y eficacia de esas conclusiones se ha
generado gracias al desarrollo de la Bioinformática.

La primera industria que comprendió el impacto de la bioinformática fue la

farmacéutica, ésta la utiliza para el desarrollo de nuevos fármacos a partir de la
detección de potenciales dianas. No obstante, también será clave en otras áreas
médicas como la epidemiología, la genética, la investigación clínica y la toma de
decisiones en salud, mediante tecnologías como los biochips o lo que se denomina
"biología in silito". Esta última supone la obtención de nuevos conocimientos a partir
de consideraciones teóricas, simulaciones y experimentos realizados sobre la
tecnología basada en el silicio de un ordenador. Se asiste, por tanto, a los inicios de
la convergencia entre la bioinformática y la informática médica, debido a la cada vez
más estrecha relación entre genes y enfermedades. La unión de información sobre
genotipos y fenotipos parece imprescindible para progresar en el conocimiento
médico.

Gracias a las nuevas tecnologías se está generando una ingente cantidad de datos
biológicos y toda esta información se almacena en bases de datos. Estos datos
pueden ser de cuatro tipos: secuencias biológicas, datos estructurales, datos
funcionales y bibliografía. Cada categoría de datos presenta su propia estructura y
requisitos, lo que influye decisivamente a la hora de diseñar las bases de datos.

Los diversos tipos de datos están

estrechamente relacionados entre sí: las
secuencias codificantes de ADN dan lugar a
proteínas con una estructura tridimensional y
una función característica; con mucha
frecuencia, las proteínas no funcionan solas
sino que forman parte de rutas metabólicas en
las que establecen importantes relaciones con
otros tipos de biomoléculas y, además, toda
esta información está convenientemente
reflejada en las publicaciones científicas.
OBJETIVO GENERAL
El alumno aprenderá a utilizar e interpretar una base de datos bioinformática,
mediante la búsqueda de información de una enfermedad mendeliana en particular,
para que comprenda la utilidad de la tecnología de la información y la aplicación que
tiene en el campo de la salud humana, la investigación básica y en la sociedad.

RESULTADOS
1. Mencione los genes que están involucrados en la enfermedad y su posición
en el cromosoma.

Fenotipo Gene/Locus Localización Gene/locus

número MIM

MSUD tipo II DBT 1p21.2 248610

MSUD tipo Ib BCKDHB 6q14.1 248611

MSUD tipo Ia BCKDHA 19q13.2 608348

2. ¿A qué complejo están relacionados estos genes?

Complejo alfa-cetoácido deshidrogenasa de cadena ramificada (BCKDC).

3. ¿Qué aminoácidos cataliza este complejo?

Cataliza el catabolismo de los aminoácidos de cadena ramificada, leucina,
isoleucina y valina.

4. ¿Cuáles son las características clínicas principales de la enfermedad?

Retraso mental y físico, problemas de alimentación y un olor a jarabe de arce a la
orina. Los cetoácidos de los aminoácidos de cadena ramificada están presentes en
la orina, como resultado de un bloqueo en la descarboxilación oxidativa. Hay 5
subtipos clínicos de MSUD: la forma severa neonatal 'clásica', una forma
'intermedia', una forma 'intermitente', una forma 'sensible a la tiamina' y una forma
'deficiente E3 con acidosis láctica'. Todos estos subtipos pueden ser causados por
mutaciones en cualquiera de los 4 genes mencionados anteriormente, excepto la
forma deficiente en E3, que es causada solo por la mutación en el gen E3 (Chuang
y Shih, 2001).
 5. ¿Cuál es la forma más común de la enfermedad? ¿Qué aminoácido es más
frecuente en esta afección? ¿Cuáles son sus síntomas?
De acuerdo a Chuang y Shih (2001), en la MSUD clásica, (forma más común del
trastorno), el 50% o más de los cetoácidos se derivan de la leucina, y la actividad
del complejo BCKD es inferior al 2% de lo normal. Los recién nacidos afectados
parecen normales al nacer, con síntomas que se desarrollan entre los 4 y 7 días de
edad. Los lactantes muestran letargo, pérdida de peso, alteración metabólica y
signos neurológicos progresivos de hipotonía e hipertonía alteradas, lo que refleja
una encefalopatía grave. Las convulsiones y el coma generalmente ocurren,
seguidos de la muerte si no se tratan .

6. ¿Las mutaciones de qué gen están asociadas a fenotipos más severos?

Entre 15 pacientes con formas variantes de MSUD, Flaschker et al. (2007)
encontraron que los fenotipos más severos tendían a asociarse con mutaciones en
el gen BCKDHA, mientras que las variantes más leves tendían a asociarse con
mutaciones en los genes BCKDHB y DBT.

7. ¿Cuál es la incidencia mundial de MSUD en 2001? ¿Qué animales han sido

utilizados para estudiar la enfermedad?
Chuang y Shih observaron una incidencia mundial de MSUD de 1 en 185,000
nacimientos vivos. Los animales utilizados para estudios de esta enfermedad fueron
terneros Hereford y ratones con MSUD.

8. ¿Cuál es el factor más importante para el pronóstico de los enfermos?

El factor más importante para determinar el resultado fue la identificación temprana
y la implementación de una dieta modificada con proteínas.

9. ¿Qué información proporciona la sección “Clinical features”?

Características clínicas particulares de la enfermedad, en general en esta sección
se pueden observar el tipo de herencia, características particulares en ciertos
aspectos (en particular para la enfermedad sobre el abdomen y sobre cambios
producidos a nivel neurológicos), características metabólicas, anormalidades en
estudios de laboratorio y algunos datos particulares de la enfermedad.

10. Mencione al menos 3 anormalidades en estudios de laboratorio

-Cetoaciduria de cadena ramificada (alfa-ceto isocaproato, alfa-ceto-beta
metilisovalerato, alfa-ceto isovalerato)
- Elevación de aloisoleucina plasmática
- Prueba de detección de DNPH en orina positiva

11. ¿Qué características metabólicas tiene la enfermedad?

- Descompensación metabólica potencialmente mortal
- Cetosis
- Hipoglucemia
- Acidosis láctica en la deficiencia de E3

CONCLUSIONES
La bioinformática como ciencia realiza día a día valiosos aportes mediante la
codificación de genomas y aplicaciones comparativas para determinar a que
corresponde una secuencia determinada. Además apoya a los investigadores
mediante técnicas y herramientas de procesamiento y visualización. La introducción
de nuevas tecnologías ha permitido avances significativos en la investigación
biológica obteniendo resultados confiables y a un menor costo y tiempo. Las bases
de datos se han convertido en un apoyo para el almacenamiento de información de
las distintas secuenciaciones realizadas por diferentes laboratorios y que permiten la
unificación de los datos para posteriores investigaciones, por lo que es importante
aprender a utilizarlas como herramienta imprescindible en la investigación.

BIBLIOGRAFÍA
- Nussbaum, McInnes y Willard. (N/R). GENÉTICA EN MEDICINA. Séptima edición.
ELSEVIER MASSON. México.
- A. Pinzón. (2010). Introducción a la bioinformática.. 23 de Noviembre del 2019, de
Instituto de Biotecnología (Colombia) Sitio web:
http://bioinf.ibun.unal.edu.co/cbib/estudiantes/1-07/bioinfoIntro.pdf
- OMIM. (2014). MAPLE SYRUP URINE DISEASE; MSUD. 23 de Noviembre del
2019, de OMIM Sitio web:
https://omim.org/entry/248600?search=MSUD&highlight=msud