TAREA – ¿CÓMO IDENTIFICAR UNA ESPECIE INTRODUCIDA?

Alumno: Peña Rengifo Oswaldo Marco Antonio

Docente: Baslavi Marisbel Condor Lujan

Fecha: 16 – 09 – 21

Recopilación de información:

- Bezeng BS, van der Bank HF (2019). DNA barcoding of southern African crustaceans reveals a
mix of invasive species and potential cryptic diversity. PLOS ONE 14(9): e0222047.
https://doi.org/10.1371/journal.pone.0222047
- Gotzek D, Brady SG, Kallal RJ, LaPolla JS (2012) The Importance of Using Multiple Approaches
for Identifying Emerging Invasive Species: The Case of the Rasberry Crazy Ant in the United
States. PLOS ONE 7(9): e45314. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0045314

Descripción de los métodos:

Un método para identificar a una especie invasora es mediante los códigos de barras de
la vida. El método consiste en realizar una colecta de los individuos de interés para el
estudio y realizar un reconocimiento morfológico de las especies. Posteriormente, se
deben realizar extracciones de ADN, reacciones en cadena de la polimerasa (PCR) y la
secuenciación de la región COI del gen. La alineación de la secuencia se hizo utilizando
una comparación de secuencia múltiple mediante Log-Expectation MUSCLE; y realizar
un ajuste manual de ser necesario. Lo siguiente es realizar una reconstrucción
filogenética con las secuencias alineadas con el criterio de máxima parsimonia
implementado en el software PAUP. Para reconstruir el árbol filogenético es necesario
además realizar búsquedas heurísticas con 1000 secuencias aleatorias. Para realizar la
correcta identificación de especies se tiene que verificar por el algoritmo de BLAST en
GenBank. Finalmente, se aplicó el método de identificación tree-base para agrupar cada
especie con su pariente más cercano en el árbol filogenético reconstruido. Siguiendo esto,
las secuencias de ADN son simuladas en los árboles filogenéticos y cuando la secuencia
conespecífica de consulta sea incluida en la alineación de referencia, el índice de
identificación positiva estará relacionada con el grado en el que diferentes especies están
diferenciadas las unas de las otras. El último paso es realizar un análisis de la barra de
código. Se tiene que evaluar si existen diferencias significativas entre la media de la
distancia genética intraespecífica e interespecífica basado en el modelo Kimura de 2
parámetros.

El siguiente método corresponde a un estudio sobre Nylanderia fulva en Estados Unidos

por Gotzek Dietrich y otros. Para identificar si esta especie es no nativa, primero se realizó
una investigación profunda sobre la especie en cuestión y posteriormente se hizo un
análisis morfométrico de la misma. Finalmente se hizo una investigación sobre su
secuencia molecular que consistía en 4669 nucleótidos alineados. Con esto se pudo
identificar su filogenética junto a otros individuos de otras especies. Diferenciándolos de
las especies locales de donde se encontraba N. fulva.