Ruta Bioquímica

La producción de proteasa es una capacidad inherente de todos los microorganismos, se sabe que
un gran número de especies bacterianas producen proteasas del tipo serina, aunque muy pocas
son reconocidas como productoras comerciales. Sólo aquellos microbios que producen cantidades
sustanciales de enzima extracelular son de importancia industrial. Las subtilisinas son un grupo
prototipo de las serina proteasas bacterianas. Bacillus subtilis es un microorganismo que puede
sintetizar la proteasa a la que se le conoce como subtilisina, pero no se conoce a detalle cómo este
microorganismo crece y qué rutas de fermentación son activas en condiciones anaerobeas. La B.
subtilis en condiciones de limitación de nutrientes comienza a esporular, en esta etapa de
transición es cuando la síntesis de la subtilisina y otras proteasas hidrolíticas están en su máximo.

La síntesis de las enzimas catabólicas sucede cuando se de represión metabólica por glucosa a la B.
subtilis, las enzimas hidrolíticas extracelulares le ayudan este microorganismo a degradar y utilizar
sustratos que le puedan ayudar a sobrevivir.

Figura #: Ciclo de vida de la B. subtilis.

Para que una serina proteasa hidrolice enlaces peptídicos se tienen varios obstáculos que se
deben de superar. El primero es que los enlaces de amidas son fuertes debido a la donación de
electrones del nitrógeno del grupo amida al carbonilo, lo que realizan las proteasas generalmente
es activar el enlace peptídico interactuando con un ácido y el oxígeno del carbonilo. El segundo
problema es que el agua es un nucleófilo débil, las proteasas activan las moléculas de agua con
alguna base. Y el tercero, que las aminas son un grupo de salida malo, por lo que las proteasas
tienen que protonar estos grupos antes de su expulsión.
Las serina proteasas realizan estas actividades de una manera eficiente y pueden hidrolizar otros
tipos de enlaces de grupos acilo, como amidas, anilinas, ésteres y tioésteres.

El mecanismo comúnmente aceptado para describir la catálisis de enlaces peptídicos por las serina
proteasas es el siguiente:

Figura #: Mecanismo de la catálisis por serina proteasas

En la figura # se puede apreciar que la parte de acilación de la reacción la Ser195 ataca el grupo
carbonilo del substrato peptídico, siendo ayudado por His57 que actúa como una base, dando
lugar a un intermedio tetraédrico. La His57 protonada es estabilizada con ayuda del ASp102. El
tetraedro colapsa cuando se expulsa su grupo de salida, dando una acilenzima intermedia,
actuando la His57 como ácido en esta ocasión. La parte de desacilacion siguiente es básicamente
lo mismo que pasó en los pasos anteriores, el agua ataca la acilenzima con ayuda de His57, lo que
da un segundo intermedio tetraédrico, cuando este tetraedro colapsa libera un ácido carboxílico
de producto y Ser195.

Figura #: Triada catalítica de una serina proteasa.

Muchos experimentos prueban la importancia de la triada catalítica para las serina proteasas, para
el caso de la subtilisina se descubrió que es Asp32, His 64, y Ser22. La triada catalítica son grupos
de tres amino ácidos que se encuentran en los sitios activos de las serina proteasas catalíticas.
Modificaciones a alguno de estos grupos decrecen la eficiencia de las enzimas en ordenes de 10 5.
Cabe recalcar que la triada catalítica no es todo lo que le da el poder catalítico a la proteasa.
Bibliografía:

 Espinosa, J.. (2005). Caracterización del proceso de crecimiento de Bacillus subtilis bajo
condiciones anaerobias . noviembre 28, 2016
 Headstorm, L.. (2002). • Serine Protease Mechanism and Specificity. noviembre 28, 2016,
de Brandeis University