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Bioquímica I
1º Grado en Farmacia
Facultad de Farmacia
Universidad de Salamanca
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
¿QUÉ ES LA BIOQUÍMICA?
Ciencia que estudia la estructura química y funciones biológicas de los seres vivos (RAE).
Ciencia que aborda el estudio de los fenómenos vitales bajo los paradigmas de la física y
de la química (Ignacio Núñez de Castro)
Ciencia que estudia la lógica molecular del estado viviente (Albert Lehninger)
• Estudia: composición química se los seres vivos, sus funciones y
transformaciones y los procesos que controlan dichas transformaciones.
•
Se caracteriza por:
• Alto grado de complejidad y organización
• Obtención, transformación y uso eficaz de la energía para crear y mantener
estructuras… y funcionar
• Habilidad para responder a cambios de su entorno, capacidad para reproducirse y
evolucionar.
→ BIOELEMENTOS:
Elementos de la tabla periódica: elementos estructurales (ingerir diario) y elementos
traza.
Unos 30 elementos son esenciales para los seres vivos, la mayoría con número atómico
por debajo de 35 (Z<35).
Según su abundancia:
• Bioelementos primarios: C, H, O, N (99% átomos del cuerpo)
• Bioelementos secundarios: Ca, P, K, S, Na, Cl, Mg, Fe (0,7%)
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• Oligoelementos: Mn, I, Cu, Co, Zn, F, Mo, Se y otros (aparecen como trazas,
menor o igual al 0,01%)
Según su función:
• Plástica o estructural: C, H, O, N, P, S (mantenimiento de estructuras)
• Esquelética: Ca, Mg, P, F, Si (confieren rigidez)
• Energética: C, H, O, P (forman parte de moléculas energéticas)
• Catalítica: Fe, Co, Cu, I (catalizan reacciones y procesos bioquímicos)
• Osmótica y electrolítica: Na+, K+, CL- (Mantiene y regulan
fenómenos osmóticos y el potencial electroquímico
El Carbono es el elemento que actúa un papel muy importante en la Bioquímica.
A partir de bioelementos se forman biomoléculas. Acetyl-Coenzyme A.
Dos clases:
• Metabolitos (pequeñas): glucosa y glicerol
• Macromoléculas: proteínas, ADn, que juegan papeles similares en organismos
diferentes que tienen estructuras similares.
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→ BIOMOLÉCULAS: Se dividen en 5 bloques, biomoléculas (pequeñas):
• Aminoácidos.
• Bases nitrogenadas
• Ácidos nucleicos
• Azúcares
• Grupos fosfato
→ pH Y CURVAS DE TITULACIÓN
El agua:
• El agua es una mezcla homogénea que está formada por 2 hidrógenos y 1 oxígeno.
• El agua produce un dipolo permanente y el oxígeno es + electronegativo que el
hidrógeno y el enlace oxígeno-hidrógeno es polar.
• La fuerza es máxima cuando el enlace covalente O-H apunta a una nube y se
forman en laces de H.
• El agua cubre ¾ partes de la superficie terrestre y existe en 3 estados.
• En el ser humano constituye el 60%.
• Produce un dipolo permanente.
• Las moléculas de agua se atraen entre ellas por su polaridad.
• Enlace de H: átomo electropositivo (H) atrae a otro átomo electronegativo.
• Moléculas que tienen 1 átomo electronegativo unido a 1 H, puede unirse a otro
átomo electronegativo compartiendo dicho H.
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• Enlaces de H entre guanina-citosina y adenina-timina: Proteínas.
• DNA: estructura mantenida por enlaces de H.
• Molécula hidrofóbica: no
interaccionan, enlaces C-C y C-H sin
polarización. Las moléculas
hidrofóbicas tienden a agruparse entre
sí en medio acuoso. La presencia de
agua empuja a moléculas hidrofóbicas
a asociarse entre ellas: bicapa lipídica
y micela.
Ejemplos: benceno, decano y
colesterol (compuestos anfipáticos,
hidrofílicos e hidrofóbicos, como el
gangliósido).
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→ ESCALA DE pH:
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• EQUILIBRIO IÓNICO:
- Todas las reacciones se producen en medio acuoso
(excepto en lugares hidrofóbicos).
- Las numerosas sustancias disueltas en el
citoplasma celular y en líquidos corporales
incluyen iones libres, así como moléculas con
grupos ionizables.
- El comportamiento de esas moléculas, depende de
Ka= = 1,8.10^-16
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- Producto iónico del agua: es constante, ya que las concentraciones de H+ y OH-
son iguales.
Kw= ka (H2O)= 1.10^-7.
- La mayoría de procesos bioquímicos son muy sensibles al pH.
- El control del pH es esencial.
o pH=-log(H+).
o pH de la sangre: 7,4.
o pH extremo: de 6,8 a 7,8 (llevan a la muerte).
→ DISOCIACIÓN DE UN ÁCIDO:
→ SOLUCIÓN AMORTIGUADORA:
Disolución que no modifica el pH cuando se añaden pequeñas cantidades de ácido
fuerte/base fuerte.
Consiste en:
o Ácido débil y base conjugada.
o Base débil y ácido conjugado.
- El máximo efecto amortiguador ocurre en el punto de inflexión (pKa), valores
alrededor de ± 1.
- Las altas concentraciones de ácido y base conjugada dan alta capacidad
tamponante.
- Sistemas de amortiguación, tienen pH en torno a 7.
- El más común es el tampón a pH de la sangre: tampón carbónico-bicarbonato.
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- pH de la sangre: es constante por sustancias con capacidad tamponante disueltas
en ella.
- Otros órganos ayudan a aumentar capacidad de control de pH:
o Riñones: ayudan a eliminar el exceso de protones y otros componentes de
la sangre.
o Pulmones: gracias a la respiración proporcionan camino para controlar el
pH.
• Células: tampón fosfato H2PO4-/HPO4 2-
• Sangre: Tampón bicarbonato
Proteínas: tienen capacidad amortiguadora por las cadenas laterales de los
aminoácidos, ya que pueden aceptar o donar protones.
- Acidemia: pH menor de 7,35
- Alcalemia: pH mayor de 7,45
El pH normal en la sangre es de 7,35-7,45.
- Acidosis: pH menor de 7,35: exceso de ácido o disminución de sustancias
alcalinas.
- Alcalosis: pH mayor de 7,45
- La ecuación H-H permite calcular el pH durante la titulación.
→ TITULACIÓN:
El proceso en el que volúmenes medidos de una base, se añaden a una disolución de un
ácido mientras se monitorizan cambios de pH.
→ CURVAS DE TITULACIÓN:
Representación de pH frente al número de equivalentes o ml añadidos.
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Los puntos de inflexión y equivalencia pueden monitorizarse a través de cambios en el
pH de la reacción frente a la base añadida en una curva de titulación.
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TEMA 2. CARBOHIDRATOS
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→ ESTRUCTURA Y CLASIFICACIÓN:
Isómeros, diastereómeros, epímeros y anómeros. Vienen dados por la ciclación de los
monosacáridos.
ALDOSAS:
• Tres carbonos: D-Gliceraldehido (mirar estructura)
• Cuatro carbonos: D-Eritrosa y D-Treosa (mirar estructura)
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• Cinco carbonos: D-Ribosa (mirar estructura), arabinosa, xilosa, lixosa.
• Seis carbonos: D-Glucosa, D-Manosa, D-Galactosa.
CETOSAS:
Una cetosa tiene un C asimétrico menos que las aldosas, por consiguiente, tiene menos
estereoisómeros.
• Tres carbonos:
• Cinco carbonos: D-Ribulosa, D-Xilulosa
• Seis carbonos: D-Fructosa
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→ FORMAS CÍCLICAS:
ALDOSA CETOSA
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Formas cíclicas de Haworth para D-glucosa.
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→ MONOSACÁRIDOS: PROYECCIONES DE FISHER:
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• Monosacáridos dibujados con las proyecciones de Fisher: Carbono más oxidado
arriba.
• Los C se numeran desde arriba.
• El C quiral con el mayor número tiene el OH a la derecha, serie D.
• Si tiene el OH hacia la izquierda, serie L.
• Azúcares en la naturaleza: fundamentalmente pertenecientes a la serie
D.
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1. DERIVADOS DE LA D-GLUCOSA (OXIDACIÓN & CICLACIÓN):
• Oxidación del aldehído
Ácido aldónico.
• Oxidación de CH2OH.
Ácido urónico.
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→ REDUCCIÓN DE MONOSACÁRIDOS:
El más importante es la desoxirribosa (en DNA).
Cuando se reduce el grupo carbonilo de un monosacárido a un alcohol, se producen
alditoles.
El carbonilo de aldosas y cetosas puede reducirse por agentes reductores
de grupos carbonilo.
Los dos indicados se utilizan como edulcorantes (glicerol e inositol).
- Glicerol: (derivado del gliceraldehído) es un constituyente esencial en
muchos lípidos, y su éster fosfórico es un importante intermediario
metabólico.
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→ FORMACIÓN DE GLICÓSIDOS (SUSTITUCIÓN).
→ DISACÁRIDOS Y POLISACÁRIDOS:
- Enlaces glicosídicos: alcohol+hemiacetal, acetal+hemiacetal
- Propiedades de disacáridos:
• Sólidos cristalinos: blanco, dulce y soluble.
• Carácter reductor: excepto si se enlazan por C
anomérico. Pueden ser reductores si se queda un C
anomérico libre.
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➢ Isomaltosa: enlace entre glucosa- enlace alfa(1,6) son ambos D-Glucosas.
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➢ Sacarosa (glucosa piranosa+fructosa furanosa) alfa(1,2) NO REDUCTOR.
➢ Lactosa (galactosa+glucosa) enlace beta(1,4).
➢ Celobiosa: enlace entre glucosas- enlace beta(1,4).
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• CELOBIOSA: no se encuentra libre en la naturaleza. Se obtiene por hidrólisis de
la celulosa (es el más abundante en la biosfera). Su disposición espacial puede
establecer puentes de hidrógeno entrelazantes dentro de la misma estructura o
entre cadenas formadas entre ellos. Esto hace que esa molécula sea puramente
estructural y sin posibilidades de estar libre y ser utilizada como forma de energía.
Disacárido que va a formar la celulosa. Dos moléculas
de glucosa en forma de piranosa (ambas beta) UNIÓN
beta (1,4) DOS GLUCOSAS. Tiene poder reductor:
permite que sean cadenas lineales.
→ POLISACÁRIDOS:
• Formados por la unión de un número elevado de monosacáridos (>10 a miles).
• Sus enlaces son O-glucosídicos con pérdida de una molécula de agua por enlace.
• Gran tamaño y peso molecular. Insolubles en agua (dispersiones coloidales),
sólidos de color blanco. En general no son dulces.
→ HOMOPOLISACÁRIDOS:
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➢ Almidón: es una forma de almacenamiento de glucosa en plantas, polímeros de
glucosa con uniones alfa. Si las uniones son solo 1-4, el polímero es lineal y se
llama amilosa que adopta una configuración helicoidal con seis unidades de
glucosa por giro. Si existen uniones 1-4 y 1-6 el polímero es ramificado y se llama
amilopectina. El almidón es una mezcla de los dos polímeros.
Procede de la polimerización de la glucosa que sintetizan los vegetales en el
proceso de fotosíntesis, almacenándose en los amiloplastos.
Se encuentra en semillas, legumbres y cereales, patatas y frutos (bellotas y
castañas).
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Las ramificaciones son alfa 1-6 pero las uniones son siempre alfa 1-4.
Es muy parecido a la amilopectina, pero se diferencian con la cantidad de
ramificaciones de las 2.
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➢ Quitina: forma el exoesqueleto en artrópodos y la pared celular de los hongos. Es
un polímero no ramificado de la N-acetilglucosamina con enlaces beta (1-4). Solo
contienen quitinasas algunas especies que se alimentan de insectos o crustáceos.
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• Dermatán-sulfato: se encuentra en la piel, vasos sanguíneos, corazón, válvulas
cardíacas, tendones y pulmones. Aumenta en el proceso de envejecimiento (Serie
L, una de las excepciones- enlaces alfa 1-3).
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→ GLICOCONJUGADOS:
- Son compuestos que presentan uniones covalentes de glúcidos a proteínas y lípidos.
o Proteoglicanos: tienen una proporción de carbohidratos a proteínas de
95:5, y se encuentran en la matriz extracelular. Las cadenas de GAG se
unen a proteínas núcleo por uniones N- y O- glicosídicas en matriz
extracelular, superficie celular y otras localizaciones. Las proteínas son
grandes, hidratadas y viscosas. Proporcionan amortiguación.
▪ Uniones a proteínas en glicoderivados:
1. N-linked (asparagina): GlcNAC. En la asparagina se
anclan los GAGs en proteoglicanos o glicoproteínas
(Examen). ¿Cuál de estos se puede unir con
proteoglicanos? N-glucosídico con asparagina.
2. O-linked (serina): GalNAC. O-glucosídico con serina.
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La porción glucídica de las glicoproteínas juega una función importante
en la determinación de qué parte del anticuerpo (inmunoglobulina) se une
al antígeno.
Oligosacárido: rico en Man (RE): asparagina.
Una glicoproteína: eritropoyetina, presentan 4 glicosilaciones. Para el
tratamiento de anemias o dopaje de alta competición, se la inyectaban los
deportistas para aumentar glóbulos rojos, tener por tanto mayor oxígeno
y ser más efectivos.
Las glicoproteínas son las que dan las características del grupo sanguíneo
(A,B,AB,0). Dependen de la porción glucídica de las glicoproteínas de la
superficie de los eritrocitos.
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Permite reconocer macrófagos, células, adhesión. Otras, que las bacterias
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y virus puedan entrar, y por supuesto las hormonas, que su receptor de
membrana es una glicoproteína: cascada de señalización o la hormona
entra.
→ KAHOOT:
¿Cuál de estos bioelementos no tiene función energética? El potasio
¿Cómo se denomina la molécula con carácter hidrofilico y hidrofóbico a la vez?
Anfipatica
¿Qué se cumple en el punto de inflexión de una curva de titulación de un ácido débil HA?
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Tema 3. Aminoácidos y oligopéptidos.
Solamentente 20 aminoácidos son codificados por el DNA para formar proteínas. Además, muchas proteínas contienen
aminoácidos modificados y partes no proteínas, que esto se denomina grupos protéticos.
características.
Funciones.
• Estructural. Forman parte de las proteínas.
• Informativa.
o Hormonas: T3 y t4.
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o Neurotransmisores. Glutamato, Glicina, GABA.
o Mediadores químicos. Histamina. Se trata de un antistaminicos, que van en contra de la señalización
mediada por la histamina. Esta da información en presencia de una reacción alérgica.
Características generales.
• Anfoterismo. Aquellas moléculas que se pueden comportar como ácidos o como bases dependiendo del pH en el
que se encuentren.
Podemos obtener a los aminoácidos en la forma Zwitterion. Especie donde coexisten las cargas positivas y
negativas, dando una carga total neta neutra.
• Se pueden polimerizar, es decir, se pueden formar péptidos y proteínas. Formándose un enlace peptídico entre los
aminoácidos, con el grupo carboxilo y el grupo amino, desprendiéndose una molécula de H2O.
• Esteroisomeria. Al presenta un carbono anomérico, presentará diferentes formas espaciales, en este caso, 2.
Clasificación.
• Aminoácidos alifáticos o neutros. Presentan una cadena lateral hidrocarbonada.
• Aminoácidos aromáticos. Un grupo aromático en la cadena lateral.
• Hidroxiaminoacidos. Un grupo alcohólico en la cadena lateral.
• Tioaminoacidos. La cadena lateral contiene azufre.
• Aminas secundarias. El carbono alfa aparece sustituido por la cadena latera.
• Aminoácidos dicarboxilicos y su amidas. Presentan grupos carboxílicos o amida en la cadena lateral.
• Aminoácidos dibasicos. Presentan mas de un grupo básico en su cadena lateral.
Dependen de la cadena lateral que presentan
Suelen ocupar el interior de las proteínas globulares, donde contribuyen a la estructura global de la proteína debido al
efecto hidrofóbico, formando una micela proteica. Esta propiedad de hidrofibidad provoca que se encuentren en lugares
más alejados del medio acuoso. Además, también estas proteínas a partir de esta propiedad, son las principales
responsables del plegamiento.
Serie filogenética
La filogenética molecular es la rama de la filogenia (relación del parentesco entre especies) que analiza las diferencias
moleculares hereditarias en las secuencias del DNA, RNA y proteínas, para obtener información sobre las relaciones
evolutivas de un organismo.
El resultado de un análisis filogenético moléculas se expresa en un árbol filogenético.
• Sulfolobus archaea.
• Arabidopsis thaliana.
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• Homo sapiens.
Aminoácidos aromáticos.
La presencia de sistemas aromáticos hace que absorban luz UV en torno a 280nm. La absorción de UV de las proteínas se
debe a su contenido en estos aminoácidos (aromáticos).
Son muy poco reactivos y sus cadenas laterales se orientaran mejor en un entorno apolar alejado de componentes acuosos,
favorecen al plegamiento. No obstante, al ser muy voluminosos y rígidos, interfieren en este plegamiento, siendo una
dualidad.
La fenilalanina y la tirosina son precursores metabólicos de compuestos muy importantes: catecolaminas, hormonas
tiroides y melanina.
Hidroxiaminoaciodos.
Pertenecen a este grupo:
• Serina. (Ser, S, NE)
• Treonina. (Thr, T, E)
El grupo –OH de la serina es fundamental en el centro catalítico activo de muchas enzimas (serin proteinasas, por ejemplo)
Cabe decir que el grupo –OH tanto de Serina como de Treonina es susceptible de forsforilacion: importante modificación
postraducional que regula la actividad de muchas proteínas. Estas modificaciones postraccduccionales son importante
separa activar o desactivar las enzimas.
Además de las fosforilaciones se pueden producir metilaciones en la arginina en la lisina y en esta ultima acetilación,
carboxilacion y acetilaciones en el acido glutámico.
Cabe decir que son reactivos y sus cadenas laterales se orientan hacia el entorno polar acuoso, situándose en la superficie
de las proteínas.
Tioaminoacidos,
Tio indica atomo de axzufre, presentando un atomo de azufre en su cadena lateral.
A este grupo pertenencen:
• Cisteína. (Cys, C, NE)
• Metionina. (Met, M, E)
Presentan un importante papel estructural e la cisteína por la posibilidad de formar enlaces disulfuro con otro residuo de
cisteína y complejos de coordinación con metales.
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La cisteína participa en el centro activo de muchas enzimas. Por otro lado, la metionina es el aminoácido iniciador d ela
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sisntesis de proteína (codón AUG)
Para acabar, son reativos y sus cadenas laterales se orientan hacia el entorno polar acuoso, situanose en la superficie de las
proteínas.
Ademas, forman parte del centro activo de las glicosidasas y de las serin enzimas (triada SHD)
Proveen a la proteína de superficies anionicas que sirven para fijar cationes (Ca 2+). Reacitvos, situados hacia la parte polar
o apolar.
Aminoacidos dibasicos.
Pertenecen a este grupo:
• Lisina. (Lys, K, E)
• Arginina. (Arg, R, E)
• Histidina (His, H, E)
La lisina sirve para formar intermediarios covalentes en la catálisis enzimática (bases de Schiff).
Por otra parte, la arginina es un importante intermediario en el ciclo de la urea.
La histidina forma parte del centro activo de muchas enzimas, debido al carácter nucleofilo del imidazol. esta tamiben
contribuye al tamponamienot d elos medios biológicos por tener un pKa cercano al pH intracelular.
Quiralidad.
Se podrían también establecer a través de la estructura de R y S. (formulación Pablete)
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Cabe decir que los L- Y d- aminoacieos son imágenes especulares. Aparecen D-aminoacidos en las paredes celulares de
bacteria sy en algunos antibióticos.
Aminoácidos no proteinogenicos.
• L-DOPA. Fenil alanina hidroxilada.
• T3. Triyodotironina
• T4. Tetrayodotironina.
Estas provienen de las hormonas tiroideas.
Algunos aminoácidos aparecen modificados químicamente tras ser incorporados en una cadena…
La desmosina, derivado de aminoácido. Se forma por la unión de cuatro cadenas laterales de lisina. Esta modificacion
aparece en la elastina, proteína que abunda en el tejido elástico de las arterias.
Estos 7 aminoacidos tien carga en la cadena lateral, son capaces de donar o aceptar protones (Ionizarse) para facilitar
reacciones. Como la catálisis acido- base, una reacción muy importante en muchas enzimas.
Que existan estos aminoácidos ionizables son importantes para las uniones que se van a establecer de tipo iones entre
diferentes residuos de carga laterales, carga postivia y carga negativa. Formando puentes salinos. Un ejemplo es la unión
entre el grupo amino (+) y el grupo carboxilo (-).
Comportamiento acido-base.
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la histidina tiene una cadena lateral con un pK relativamente cercano al pH intracelular. Pequeñas variaciones en
el pH pueden afectar al estado de ionización de este aminoácido. Esto permite a la histidina itnercambiarse entre
acido base. Por esta razón, la histidina es un reactivo muy versátil en el centro activo de las enzimas.
Separación de aminoácidos.
• Cromatografía. Hay presencia de una mezcla de tres componentes y hay presencia de una fase
estacionaria.
1. Se coloca una muestra que contiene una mezcla de barios componentes sobre la fase estacionaria.
2. Se hace fluir una fase móvil a lo largo de la estacionaria.
3. A lo largo que se va desplazando, dependiendo de la afinidad relativa por las fases, se separan los
componentes de la mezcla.
Se puede clasificar cada aminoácido en función de su tiempo de retención.
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TEMA 4. PROTEÍNAS
→ ENLACE PEPTÍDICO
• Enlace que une los aa en una
proteína.
Peptídico=AMIDA. Pérdida de
agua y gasto de energía.
• En un polipéptido extendido los dos ángulos son 180º. Sin embargo, considerando
las cadenas laterales de los aa, algunas combinaciones ф, Ѱ son más favorables y
otras están más impedidas.
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• En cuanto al científico Ramachandran, podemos hablar de las gráficas que
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muestran la distribución de los ángulos Ѱ y ф de una proteína. En función de la
distribución de los puntos en
los cuadrantes veremos qué
estructura secundaria es más
favorable para la proteína.
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• Terciaria: estructura tridimensional, determinada por las propiedades químicas de
los aa clave para su función. Dan lugar a conformaciones de mínima energía (<
10 Kcal/mol). Dominios estructurales.
Dentro de las estructuras secundaria y terciaria podemos ver super estructuras y dominios
estructurales: son agrupaciones de varias estructuras secundarias dentro de un mismo
oligopéptido.
Para poder ver las diferencias entre las distintas estructuras es importante saber la
fortaleza de los enlaces que las componen para ello vamos a establecer un orden de
fortaleza:
• Covalentes: enlaces que se forman a través de puentes disulfuro.
• Iónicas: se establecen puentes salinos.
• Electroestáticas:
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o Enlaces de Hidrógeno.
o Interacciones dipolares.
o Fuerzas de Van der Waals.
• Entrópicas: son interacciones hidrofóbicas.
→ ESTRUCTURA SECUNDARIA
Disposición espacial local del polipéptido:
• La α-hélice:
o Enlaces de hidrógeno intracatenarios: la cadena principal helicoidal se
mantiene unida por enlaces de Hidrógeno entre las amidas de la cadena
principal de un Nitrógeno y el Carboxilato de un Nitrógeno y un aa.
o Es una hélice dextrógira con 3,6 residuos (5,4 Å paso de rosca) por vuelta.
o Translocación de residuo: 0,15 nm.
o Los enlaces peptídicos están alineados aproximadamente paralelos con el
eje helicoidal.
o Las cadenas laterales señalan y son aproximadamente perpendiculares al
eje helicoidal.
o Los aa alifáticos como Alamina y Leucina son los que más propician la
formación de α-hélice.
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o Prolina es un disruptor de α-hélice por la rotación N-Cα (Ѱ-ángulo) que
no es posible.
o La Glicina tampoco favorece la α-hélice ya que la “ausencia” de cadenas
laterales favorece otras conformaciones.
o Las interacciones atractivas o repulsivas entre los radicales separados por
de 3 a 4 aa afectaran a su formación.
Ejemplos:
▪ Hemoglobina: proteína globular a la que se ancla el grupo hemo.
▪ Mioglobina: transporta oxígeno en el músculo.
▪ Fibrógeno: estructuras α-hélice enlazadas unas con otras. Es un factor
de coagulación.
• Hoja β:
o La planaridad del enlace peptídico y la geometría tetraédrica del Carbono
crean una estructura en forma de lámina plegada/plisada.
o Unión de enlaces de Hidrógeno entre amidas de la columna vertebral de
diferentes cadenas.
o Las cadenas laterales sobresalen de la lámina, alterando en una dirección
(arriba-abajo).
o Múltiples láminas β interaccionan dando una hoja β.
o Uniones por enlaces de Hidrógeno entre amidas y carbonilos del enlace
peptídico de diferentes láminas.
o 2 orientaciones principales:
En la hoja β paralela, las láminas van en la misma dirección. (Doblados,
más débiles).
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En la hoja β antiparalela las láminas van en dirección opuesta. (Rectos,
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más fuertes).
o Giro β:
o El giro β ocurre siempre que haya un cambio de dirección de 180º en una
lámina β.
o Se da siempre entre 4 aa.
o El giro se estabiliza mediante enlaces de Hidrógeno entre el Oxígeno de un
carbonilo y el protón de la amida tres residuos en la secuencia.
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o La Prolina en la posición 2 o la Glicina en la posición 3 estamos clasificando
los giros en:
- Tipo 1: Prolina posición 2 (más común en la naturaleza)
- Tipo 2: Glicina en posición 3.
➢ DICROISMO CIRCULAR
Nos permite saber cuánto de α-hélice, cuánto de lámina β y cuánto de aleatoria tiene una
proteína. (Hay más métodos). Mide el coeficiente de absorción de la luz polarizada D o
L, estudia la diferencia entre las absortividades de las luces polarizadas.
→ ESTRUCTURA TERCIARIA
• Disposición tridimensional de todos los átomos de una proteína.
• Equivalente de configuración absoluta en moléculas de bajo peso molecular.
• Conocimiento de coordenadas X, Y y Z de todos los átomos de las proteínas.
Fuerzas que mantienen la estructura terciaria:
o No covalentes:
- Efecto hidrofóbico.
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- Enlaces de hidrógeno.
- Interacciones iónicas o salinas.
o Covalentes:
- Enlaces disulfuro.
- Enlaces amida.
Efecto hidrofóbico:
En una proteína, las cadenas laterales de residuos hidrofóbicos tienden a ocupar el
centro de la molécula, alejadas del solvente. Por el contrario, los residuos polares
ocupan la superficie de la molécula.
Enlaces de hidrógeno:
o Son fundamentales en el mantenimiento no solo de la estructura secundario,
sino también de la terciaria.
o Hay grupos dadores y grupos aceptores de hidrógeno,
- Grupos aceptores: histidina, cisteína y metionina que son
tioaminoácidos, la glutamina, la glicina, la asparagina y el glutámico.
- Grupos dadores: tirosina, serina, treonina, lisina, arginina y la
glutamina.
Ceden quienes tienen grupos amino o hidroxilo.
Los enlaces se dan entre grupos dadores y aceptores.
Enlaces salinos o iónicos:
o Las interacciones iónicas entre las cadenas laterales de aa con carga eléctrica
contribuyen al mantenimiento de la estructura terciaria de las proteínas.
o Se unen aniones + cationes.
Enlaces covalentes:
o El enlace disulfuro establecido entre dos cadenas laterales de cistina (al
juntarse dos cisteínas se forma las molécula denominada cistina).
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o Enlaces covalentes de estructura terciaria: amida.
Con bastante menor frecuencia podemos encontrar enlaces amida establecidos
entre las cadenas laterales de Lisina y ácidos Aspártico o Glutámico, por otro.
Se unen dos cadenas de polipéptidos al igual que en el disulfuro.
Dominios o motivos estructurales:
o El reconocimiento de un gran número de estructuras ha permitido constatar
que existen muchas irregularidades en la estructura 3D de las proteínas.
o Esto da lugar a que hoy se describan multitud de motivos estructurales, que
aparecen en muchas proteínas distintas, aunque generalmente con la misma
función.
Un ejemplo de motivo estructural es la Hélice-vuelta-Hélice, se pueden encontrar
en el receptor del glucocorticoide.
El motivo hélice-vuelta-hélice aparece en muchas proteínas que interaccionan con
DNA, promoviendo o inhibiendo su transcripción. Se encaja en los surcos del
DNA, es muy importante ya que determina distintas funciones.
Es un recetor cro interaccionando con DNA.
o Dedo de Zinc: entre las proteínas que interaccionan con DNA tenemos
también el motivo “dedo de Zinc” que contiene un átomo de Zn
tetracoordinado a átomos de azufre de cuatro residuos de cisteína que
atrapa a un átomo de Zn.
o Cremalleras de leucinas: también interaccionan con el DNA, está
fromada por tres α helicoides (estructura α, es lo mismo) unidos por
leucinas interdigitadas como una cremallera.
o La mano EF: es típica de las proteínas que interaccionan con el ion Ca2+.
El ion presenta una interacción electroestática con residuos dicarboxílicos
presentes en la proteína. Los residuos dicarboxílicos son Asp y Glu, y los
iones calcio quedan atrapados en su estructura.
o Barril β: las enzimas glicotilicas presentan muy a menudo la estructura
conocida como barril β, una agrupación cilíndrica de tramos β paralelos.
o Motivo β-α-β: el barril β es una variante del motivo más general β-α-β
que se observa en muchas enzimas intracelulares.
o Dominio de inmunoglobulina: doble lamina β antiparalela. Muestran
todas ellas un motivo característico que es la doble lámina antiparalela.
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En muchas proteínas la estructura terciaria se concentra en dominios
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separados por zonas sin estructura secundaria.
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• Fuerzas de la estructura cuaternaria:
o No covalentes: efecto hidrofóbico, enlace de hidrógeno e interacciones
iónicas
o Covalentes: Enlace disulfuro y enlace amida.
Métodos:
o Físicos: calor, radiaciones
o Químicos: todos los agentes que rompen interacciones o enlaces presentes en
la estructura nativa de la proteína: detergente, urea y guanidina a altas
concentraciones, altas concentraciones de sal y extremos de pH, reactivos de
grupos-SH.
La desnaturalización es un proceso cooperativo.
➢ PLEGAMIENTO DE PROTEINAS
Una proteína recién sintetizada posee solamente su estructura primaria. Para que sea
plenamente funcional ha de plegarse correctamente en una forma tridimensional única.
• Autoensamblamiento: la proteína se pliega sin ninguna otra ayuda.
• Ensamblamiento dirigido: la proteína se pliega gracias a la acción de otras
proteínas.
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➢ PROTEINAS TUTORAS O CHAPERONAS
Son un conjunto de proteínas presentes en todas las células, cuya función es la de ayudar
al plegamiento de otras proteínas recién formadas en la síntesis de proteínas. NO forman
parte de la estructura primaria de la proteína funcional a la que modifican, sino que sólo
se unen a ella para ayudar en su plegamiento, ensamblaje y transporte celular.
• HSp70 (Dnak): dependiente de ATP, proceso poco conocido
• HSp60 (GroEL) y HSp10 (GroZS): proceso dependiente de ATP. La proteína
desplegada o parcialmente plegada forma un complejo en la cavidad dejada por
estas dos proteínas y adquiere la conformación correcta.
→ RESUMEN PROTEÍNAS
• Son polímeros no ramificados de aa unidos entre si por medio de un enlace
peptídico (amida sustituida) con estructura cabeza cola (grupo amino-grupo
carboxilo)
• Características:
o La secuencia de aa no es aleatoria, viene determinada por la información
genética (ADN)
o Cada proteína presenta una secuencia de aa característica
o La secuencia de aa de una proteína determinará su estructura tridimensional,
su función y sus propiedades biológicas.
→ CLASIFICACIÓN PROTEINAS
• Por su tamaño: Muy compleja, las proteínas tienen un amplio rango de tamaños y
Pm. Distancia entre péptidos (hasta 100 aa) vs. Proteínas (más de 100 aa).
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o 2 residuos: dipéptido.
o 3 residuos: tripéptido.
o 12-20 residuos: oligopéptido.
o Más de 20 residuos: polipéptido.
• En base al número de cadenas polipeptídicas:
o Proteína monomérica: un solo polipéptido.
o Proteína oligomérica: formadas por más de una cadena polipeptídica:
- Homomultiméricas: todas las subunidades son idénticas.
- Heteromultiméricas: formadas por distintas subunidades.
• Por su forma y solubilidad:
o Fibrosas.
o Globulares.
o De membrana.
➢ PROTEINAS FIBROSAS
• Estructuras simples, regulares y lineales.
• Tienen un papel fundamental en filamentos intermedios, colágeno y queratinas.
• Proteínas con elevada concentración de estructura α-hélice o β lámina.
• Función estructural: fibroína de la seda, colágeno y α-queratinas. Las dos últimas
son capaces de soportar esfuerzos mecánicos.
• Existen como largas moléculas en forma de varillas e insolubles en agua o en
soluciones salinas diluidas: seda, colágeno y lana.
Vamos a ver algunos ejemplos con las características previas:
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• Colágeno: lleva a cabo numerosas funciones y es la proteína más abundante en
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vertebrados. Constituye el 30% total de las proteínas.
o La matriz de o cemento del hueso.
o Tendones.
o Mallas en la piel.
Propiedades fisicoquímicas:
o Insoluble.
o Estable.
o T ½ alto.
o Alta fuerza (Fz) tensora
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o Parte de la rigidez del colágeno se debe a la formación de entrecruzamientos
entre cadenas laterales de residuos de Lys modificados o no.
• Patologías asociadas:
o Escorbuto. Se debe a la falta de vitamina C, NO se hidrolizan las prolinas.
o Osteógenesis imperfecta.
o Síndrome de Ehlers-Danlos.
o Sustitución de Gly por Cys o Ser.
➢ PROTEINAS GLOBULARES
Simetría esférica, solubles en disoluciones acuosas, núcleo hidrofóbico y exterior
hidrofílico.
La cadena polipeptídica se pliega de forma muy compacta: las cadenas laterales
hidrofílicas, exterior.
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• Mioglobina (monomérica): es la hemoproteína que se encarga del transporte de
Oxígeno en los tejidos proveniente del torrente sanguíneo por la hemoglobina y lo
lleva donde el O2 sea requerido para la respiración celular. Es la primera que se
consiguió cristalizar y estudiar su estructura por difracción de rayos X.
o Formada por 8 α-hélice (designadas por las letras A-H), tiene 153 aa.
o Puede llegar a tener hasta 6 posiciones de coordinación.
1. Anillo tetrapirrolico: 4N.
2. O2.
3. Histidina próximas a F8.
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o La diferencia es que la hemo está formada por 4 subunidades muy
similares a la mioglobina.
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o Hemo A1 (HbA1)
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o Hemo A2 (HbA2)
o Hemo fetal (HbF)
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Esas interacciones desaparecen cuando se une una molécula de O2.
A medida que se van enlazando las moléculas de O2, se producen cambios en cada
subunidad, en la estructura general y esta tendrá más afinidad por el O2.
La hemoglobina tiene 5 conformaciones:
➢ EFECTOS ALOSTÉRICOS:
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La saturación de oxígeno en los pulmones es mucho mayor que en los tejidos. En los
pulmones la hemoglobina es mucho más afín al oxígeno.
Los estados R o T pueden estabilizarse por la unión de ligandos distintos que el 02.
• H+: pH bajo favorece el estado T que hace que la Hb libere el O2 unido. Este
fenómeno se conoce como efecto Bohr.
• CO2: La liberación de CO2 baja el pH por la conversión en HCO3-. Refuerza el
efecto de Bohr.
• Biofosfoglicerato (BPG): regulación de la actividad por su unión más fuerte al
estado T, ayuda a la liberación de O2.
Eritrocitos (Contiene. O2-hemoglobina) transportados a los tejidos periféricos.
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➢ ANEMIA FALCIFORME:
Causada por mutación en Hb
Glu→Val en A3 cadena β de la subunidad 3 produce una asociación inadecuada de
tetrámeros de Hb.
• Eritrocitos alargados: con impedimento para pasar por los capilares, flujo
sanguíneo reducido
• Eritrocitos más frágiles y susceptibles de lisis, lo que desenlaza en anemia.
Hb polimeriza en forma de fibrillas, que llevan a la forma “falciforme” de los eritrocitos.
Primera enfermedad caracterizada como mutación que cambia la secuencia de la proteína
➢ PROTEÍNAS DE MEMBRANA:
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Asociadas a membranas biológicas por medio de interacciones hidrofóbicas con los
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lípidos de membrana por medio de las cadenas apolares. Generalmente insolubles en
soluciones acuosas, pero sí solubles con detergentes.
• Proteínas conjugadas: clasificación de las proteínas por su composición química
- Proteínas simples: la proteína está constituida exclusivamente por aa unidos entre
sí formando cadenas polipeptídicas.
- Proteínas conjugadas: las proteínas pueden conjugarse con otros grupos químicos
de naturaleza no aminoacídica= grupo prostético.
Holoproteína= Apoproteína+grupo prostético
Las proteínas conjugadas se suelen clasificar por la naturaleza del grupo prostético.
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TEMA 5. ENZIMOLOGÍA
¿Qué son las enzimas? Proteínas llamadas enzimas, son catalizadores naturales.
• Presentan una alta especificidad de sustrato
• Pueden acelerar las velocidades de reacción (por un factor superior a 10S
respecto a las mismas reacciones no catalizadas)
• Cada enzima presenta dos parámetros importantes: Vmax (saturación de la
enzima) y la Km (medida de la afinidad por el sustrato)
Energía de activación:
• Las enzimas nivelan el camino de S a P
• Disminuyen la energía libre de activación
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• Una enzima acelera una reacción disminuyendo la Ea y con ello el umbral
energético que debe superar la reacción.
Aspectos importantes:
• Una enzima disminuye la Ea pero no cambia la constante de equilibrio Keq o una
reacción endergónica en exergónica y viceversa.
• La mayor parte de las enzimas son sensibles a la temperatura y al pH y no serán
activas fuera de su rango de temperatura y pH óptimos.
ESTRATEGIAS DE CATÁLISIS
Pasos en la catálisis:
• Fijación estereoquimicamente complementaria del sustrato
• Transformación catalítica del mismo
Participantes:
• Cadenas laterales de los aminoácidos
• Grupos o moléculas no proteicas: iones metálicos y cofactores (coenzimas):
grupos prostéticos
Modelos:
▪ Ajuste inducido
▪ Llave-cerradura
▪ Estado de transición
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VELOCIDAD DE REACCIÓN:
EFECTO DE LA Tª:
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CINÉTICA DE MICHAELIS-MENTEN:
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La cinética de M-M explica el comportamiento de enzimas no alostéricas. Asume que se
forma un complejo enzima-sustrato
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ECUACIÓN DE M-M:
Proporcional
(S)= Constante de hidrólisis (No cte de reacción), nos indica afinidad de S por E o de E
por S.
Es una característica importante ya que resulta decisiva para la función biológica. Una
enzima viene caracterizada por su KM y VMAX
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• KM es exclusiva para cada enzima y es independiente de la concentración de
enzima
• KM describe las propiedades de la interacción enzima-sustrato y, por tanto,
variará en el caso de enzimas que puedan utilizar sustratos diferentes
• Si consideramos solo la formación de ES
Si KM tiene un valor grande quiere decir que k1 es pequeño lo que indica poca
concentración de ES o lo que es lo mismo, poca afinidad de E por S.
Si KM tiene un valor pequeño quiere decir que k1 es grande lo que indica alta
concentración de ES o lo que es lo mismo, alta afinidad de E por S.
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PERFILES DE CURVA DE M-M CON DIFERENTES KM
NÚMERO DE RECAMBIO:
• Es útil definir una constante de velocidad más general, para describir la velocidad
limitante de cualquier reacción enzimática a saturación
• El número de recambio equivale a la constante de velocidad K 2, si se conoce el
número de centros activos, entonces se cumple esta ecuación
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LINEWEAVER-BURK
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INHIBICIÓN ENZIMÁTICA
• La unión de moléculas pequeñas específicas e iones, así como cambios en el pH,
puede inhibir la actividad de muchas enzimas
• Los inhibidores de enzimas actúan de manera reversible e irreversible
• ¿Utilidad?
1. Control del sistema-regulación de la actividad
2. Fármacos y venenos
3. Herramientas científicas para análisis de mecanismos enzimáticos
INHIBICIÓN IRREVERSIBLE
Unión covalente e irrevocable a la enzima, eliminan la eficacia catalítica de la enzima.
Ej: metales pesados, gas venenoso del sistema nervioso y algunos insecticidas
INHIBICIÓN REVERSIBLE
• La inhibición reversible se caracteriza por la rápida disociación del complejo
enzima-inhibidor
• En función de la naturaleza de la interacción entre la enzima y el inhibidor y los
efectos del inhibidor sobre la cinética enzimática
1. Competitiva
2. No competitiva
3. Acompetitiva
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Con ello se evita que el sustrato se pueda unir a la enzima
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Sulfanialmida: Fármaco de la familia sulfamidas, se parece mucho a un metabolito que
necesitan las bacterias para la síntesis de ácido fólico (PABA), no afecta a los humanos
porque nosotros asimilamos el ácido fólico de la dieta.
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INHIBICIÓN REVERSIBLE ACOMPETITIVA (INCOMPETITIVA)
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CLASIFICACIÓN DE LAS ENZIMAS:
• La International Union of Biochemistry (IUB) clasifica y nombra a las enzimas de
acuerdo con el tipo de reacción química que catalizan.
• Se asigna a las enzimas una clasificación de 4 nºs y un nombre sistemático con
dos partes.
• Se sugiere también un nombre abreviado
• Alcohol deshidrogenasa es: alcohol: NAD+ oxidotreductasa
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CINÉTICA ENZIMÁTICA:
Cinética es el campo de la química que estudia velocidad y mecanismo de reacción en la
que interviene un catalizador biológico (enzima).
Enzimas alostéricas:
• Son enzimas cuya estructura proteica está formada de varias subunidades,
presentan estructura cuaternaria
• Diferentes sitios activos, unen más de una molécula de sustrato. La unión del
sustrato es cooperativa
• Además del sitio o centro activo tienen sitios alostéricos o de regulación
• La relación entre la velocidad de reacción y la concentración de sustrato sigue
cinética sigmoidea. No se rigen por la cinética de Michaelis-Menten
Moduladores alostéricos:
• También reciben el nombre de efectores y pueden ser positivos o negativos
• Se unen al sitio alostérico que puede estar en la misma subunidad que tiene al
sitio activo o en las subunidades regulatorias
• Su unión produce un cambio conformacional que afecta al sitio activo
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TEMA 6: LÍPIDOS:
ÍNDICE:
➢ Funciones.
➢ Clasificación.
➢ Ácidos grasos.
➢ Lípidos saponificables.
➢ Ecosanoides.
➢ Lípidos isoprenoides.
➢ Lipoproteínas.
→ FUNCIONES:
1. Energética: los lípidos son una importante fuente de energía y esa energía hay
que almacenarla así que las moléculas lipídicas son una importante reserva
energética y poseen el mayor valor calórico de todas las biomoléculas (10kcal/g).
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3. Informativa: muchas señales químicas son de naturaleza lipídica: hormonas
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esteroideas, eicosanoides, etc.
→ CLASIFICACIÓN:
- Saponificación: los ácidos grasos reaccionan con bases fuertes y forman sales de
ácido graso o jabones (esteres de ácidos grasos).
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• ¿Qué quiere decir C2 y C5? Son subunidades mínimas que los van formando.
• Saponificables: son lípidos que contienen ácidos grasos y los ac grasos son ácidos
carboxílicos sintetizados por condensación de unidades C2.
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→ ÁCIDOS GRASOS:
➢ PROPIEDADES FÍSICAS:
La fórmula es:
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Dicha formula puede simplificarse escribiendo el número de C seguido del signo “:”
y de otro número en forma de superíndice que indica la cantidad y la proporción de
insaturaciones.
Ejemplos:
Con mucha frecuencia los ácidos grasos presentan una o más insaturaciones (dobles
enlaces).
Estos son invariablemente del tipo geométrico cis-, lo cual introduce una angulación
de 120º en la molécula. Por lo general, el primer doble enlace está en la posición C9.
Los dobles enlaces son no conjugados y de configuración cis.
La estructura tipo cis hace que los ácidos insaturados tengan puntos de fusión más
bajos que los saturados, siendo por lo general líquidos a temperatura ambiente
(aceites).
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→ LIPIDOS SAPONIFICABLES: se pueden clasificar en lípidos que sirven para
almacenar energía(triacilgliceroles) y otros que forman parte de estructuras como
de membranas lipídicas (glucolípidos y fosfolípidos).
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→ ACILGLICEROLES:
1. Monoacilgliceroles (monoglicéridos).
2. Diacilgliceroles (diglicéridos).
3. Triacilgliceroles (triglicéridos).
De estos, los triacilgliceroles o triglicéridos son, con mucho, los más abundantes. Se
almacenan sobre todo en el Tejido Adiposo.
Aparecen también en las semillas y frutos de las plantas oleaginosas (Olivo, soja, girasol,
etc).
→ TRIACILGLICEROLES
Cuando los tres grupos alcohólicos del glicerol forman ésteres con ácidos grasos se
produce una molécula de triacilglicerol (triglicérido). Son moléculas completamente
hidrofóbicas. En la posición 2 del glicerol es donde está el ácido graso insaturado.
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- Los TAGs que son sólidos a temperatura ambiente, por ser ricos en ácidos grasos
saturados, se llaman grasas.
- Los TAGs que son líquidos a temperatura ambiente, por ser ricos en ácidos grasos
insaturados, se llaman aceites.
Triacilgliceroles almacenan
ácidos grasos como grasas en el cuerpo de los animales. Antes de su oxidación, las grasas
deben hidrolizarse a ácidos grasos ionizados y glicerol. Biológicamente este proceso lo
realizan las lipasas (liberan ácidos grasos de trigliceroles). Químicamente este proceso
de hidrólisis se denomina saponificación.
→ FOSFOLÍPIDOS:
Son lípidos anfipáticos que tienen, dentro de una misma molécula, una parte polar
(hidrofílica), que interacciona fácilmente con el agua, y una parte hidrofóbica. Por eso se
llaman “anfipáticos”, que viene a significa “ambos afectos·”, “ambas afinidades”.
→ FOSFOLÍPIDOS:
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• Contienen dominios hidrofóbicos e hidrofílicos.
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• Son los componentes estructurales de las membranas.
➢ Fosfoglicéridos:
Cuando el tercer OH del glicerol está esterificado con ácido fosfórico o con un éster de
ácido fosfórico, en lugar del grupo carboxilo, resulta un fosfoacilglicerol.
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→ EICOSANOIDES:
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• Importantes derivados de ácidos grasos poliinsaturados:
1. Postaglandinas.
2. Tromboxanos.
3. Leucotrienos.
2. Reacción inflamatoria.
Con la
acción de
la Fosfolipasa A2, tenemos por un lado el ácido araquidónico y una vez que se ha
eliminado, tenemos el ácido lisofosfatídico.
• Ácido lisofosfatídico: interviene en la reparación de las heridas (plaquetas).
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• Ácido lisofosfatídico: molécula de
reparación de las heridas a través de la acción de las plaquetas.
• Cerebrósidos (glicolípidos).
➢ CERAMIDAS:
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La esfingosina se une a un ácido graso de cadena larga a través de un enlace amida para
formar las CERAMIDAS:
Las esfingomielinas
son componentes importantes de las membranas celulares de animales y plantas y
abundan en el tejido nervoso.
Vaina de mielina- defectuosa en algunas
enfermedades neurológicas.
➢ GLICOLÍPIDOS:
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Estos compuestos son especialmente abundantes en las membranas de las células
nerviosas y cerebrales.
✓ Cerebrósidos: el -OH terminal de la esfingosina está sustituido por una
hexosa (glucosa, galactosa) o un polisacárido.
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→ ISOPRENOIDES:
➢ ESTEROLES:
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No aparecen en las membranas bacterianas.
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Encontramos Fitosterol en Plantas, Zimosterol en Hongos y Colesterol en animales.
• Colesterol: componente de las membranas celulares, precursor de los ácidos
biliares y precursor de hormonas esteroideas.
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• Si el ácido cólico se conjuga por acción de enzimas con glicina, se forma
glicocolato; si se conjuga con taurina, se forma taurocolato.
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Datos sobre el
colesterol:
1. Es el principal
regulador de la fluidez en membranas animales.
Además de estar en forma libre, también nos lo podemos encontrar en forma esterificada.
Se forma un enlace éster a través de una enzima; eso significa que tiene un ácido graso
en la posición 3 de su estructura. Es el almacenamiento inmediato que tiene la célula del
colesterol.
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→ TERPENOS:
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➢ COENZIMA Q: coenzima Q10 (10 unidades de isopreno), o ubiquinona,
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ubidecarenona, coenzima Q, CoQ10, CoQ, o Q10.
• 1,4-benquinona, Q se
refiere al grupo químico quinona, y el 10 se refiere al número de subunidades del
Los lípidos son insolubles en agua, por lo que para su transporte deben de unirse a una
serie de proteínas para formar las lipoproteínas.
• ¿Qué es una lipoproteína? Asociaciones dinámicas de lípidos y proteínas unidos
por medio de interacciones hidrofóbicas y electroestáticas con el fin de transportar
los lípidos por el
ambiente acuoso
de la sangre.
Interior
(hidrofóbico,apolar)
Exterior (hidrofílico,polar)
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Apolipoproteína humana: partículas complejas y dinámicas que presentan un núcleo
hidrofóbico con lípidos no polares (CE (éster de colesterol) y TG (triacilglicéridos))
rodeado por una membrana hidrofílica de PL,CL y Apolipoproteínas.
• Estructura de las lipoproteínas:
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TEMA 7. TRANSPORTE A TRAVÉS DE MEMBRANAS
PROTEÍNAS PERIFÉRICAS
• Ancladas a fosfolípidos en un lado de la membrana
• Poseen regiones no polares insertadas en la bicapa lipídica
• Con libertad para moverse lateralmente en un lado de la membrana
PROTEÍNAS INSTEGRALES:
• Atraviesan la bicapa lipídica (proteínas transmembrana), al menos presentan un
dominio transmembrana (pueden ser varios)
• Las regiones no polares que contiene aminoácidos hidrofóbicos de las proteínas
están embebecidas en el interior de la bicapa
• Las regiones polares de las proteínas sobresalen a ambos lados de la membrana
• Las regiones no polares de una proteína integral pueden crear un poro a través
de la membrana
• La estructura secundaria en hojas beta en una proteína integral puede crear un
cilindro (barril beta)
• El interior de un barril beta es polar y permite el paso de agua y pequeñas
moléculas a través de la membrana.
La bicapa lipídica actúa como una barrera selectiva permebale
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• No mediado: difusión simple
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• Mediado: proteínas transportadoras específicas
o Mediado pasivo o difusión facilitada
o Transporte activo
DIFUSIÓN SIMPLE:
Movimiento de moléculas de un compartimento con alta concentración a otro con baja
concentración
• A favor de gradiente de concentración, esto quiere decir que el movimiento de
partículas ocurre desde la zona más concentrada a la menos concentrada
• No intervienen proteínas transportadoras
• La velocidad del transporte es directamente proporcional al gradiente de
concentración (no saturable/cinética de primer orden)
• Depende de la liposolubilidad y tamaño de la molécula
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Aquaporinas: canales de agua que incrementan la permeabilidad al agua de las
membranas. Los canales de agua son necesarios para la mayor parte del flujo de agua a
través de las membranas celulares.
Transportadores ATP-dependientes:
Pueden ser de varios tipos (bombas de clase P, bombas de clase F y V, bombas de la
superfamilia ABC)
CLASE P:
• Transportan activamente cationes
• Componentes: un polipéptido responsable del transporte y de la hidrólisis del
ATP y de la fosforilación
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• En eucariotas este polipéptido tiene un dominio transmembrana (10 hélices) y
un dominio citosólico en donde se encuentra el sitio de hidrólisis de ATP y
fosforilación.
• Normalmente tienen otras subunidades acompañantes (estructura del tipo alfa-
beta: ab)
• Las proteínas activas son, en eucariotas, homodímeros de este dímero
(estructura a2b2)
• NA+/K+ ATPasa (tipo P): Es la responsable de la creación y mantenimiento del
potencial de membrana de las células de animales, y de la creación del gradiente
de iones Na+ cuya entrada al interior de la célula se emplea en los procesos de
cotransporte. De hecho, en una célula en reposo la mayor parte del ATP es
empleado precisamente por esta proteína.
CLASE F y V:
• Proteínas de gran tamaño
• Dos componentes fundamentales:
o “Base” hidrofóbica, que atraviesa la membrana y que está fromado por
un haz de 9 a 13 cadenas polipeptídicas
o “Cabeza” asociada mediante un “tallo” a la base. La hidrólisis del ATP
ocurre en la cabeza.
• H+ ATPasas tipo F bombean protones a través de la membrana interna
mitocondrial lo que proporciona energía para la síntesis de ATP
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El regulador CFTR funciona más como un canal de Cl- y está relacionado directamente
con la fibrosis quística.
Cotransportador Na+/Glucosa:
Su función es reabsorber glucosa desde el lumen del los túbulos renales o desde el
lumen del intestino delgado a las células del tejido. El proceso de transporte requiere de
una fuente de energía para su realización proveniente del gradiente eletroquímico
creado por el transporte primario.
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