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Wuolah Free Bioquimica 1 Completo
Wuolah Free Bioquimica 1 Completo
ABM18
Bioquímica I
1º Grado en Farmacia
Facultad de Farmacia
Universidad de Salamanca
Tema 1
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
Introducción
1. DEFINICIÓN
- Ciencia que estudia la estructura química, y las funciones de los seres vivos (RAE)
- Ciencia que aborda el estudio de los fenómenos vitales, bajo el punto de vista de
la química y la física
- Ciencia que estudia la lógica molecular del estado viviente (Lehninger).
2. ESTUDIO DE LA BIOQUÍMICA
Los compuestos químicos de los seres vivos, sus funciones y transformaciones, y los
procesos que controlan dichas transformaciones.
3. BIOELEMENTOS
Elementos estructurales: g/día (H, Na, K, Ca, C, N, O, P, S, Cl)
Elementos traza: <mg/día (Mg, V, Cr, Fe, Co, Ni, Cu, Zn, Mo, W, Se, I)
Solo 30 elementos son esenciales (número atómico < 34 en la mayoría)
- Según abundancia:
o Bioelementos primarios: H, C, O, N (99%)
o Biolementos secundarios: Ca, P, K, S, Na, Cl, Mg, Fe (0,7%)
o Oligoelementos: Mn, I, Cu, Co, Zn, F, Mo, Se… (>0,01%)
- Según función:
o Plástica/Estructural: H, O, C, N, P, S (mantienen estructuras)
o Esquelética: Ca, Mg, P, F, Si (aportan rigidez)
o Energética: C, O, H, P (moléculas energéticas)
o Catalítica: Fe, Co, Cu, I (catalizan)
o Osmótica y electrolítica: Na+, K, Cl- (mantienen y regulan fenómenos
osmóticos y potenciales (electro)químicos)
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Bioquímica I
Tema 1: Introducción
4. BIOMOLÉCULAS
Hay dos clases de biomoléculas:
- Pequeñas/Metabolitos: glucosa, glicerol
- Macromoléculas: proteínas
Hay 5 bloques de construcción: aminoácidos,
bases nitrogenadas, azúcares de 5C, lípidos y
grupo fosfato.
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
5. AGUA
Los seres humanos están formados por más del 60% de agua. El oxigeno tiene carga
negativa, y los hidrógenos positiva, por lo que la molécula es un dipolo permanente. El
oxígeno tiene mayor electronegatividad que los hidrógenos, y por lo tanto, estos son
atraídos hacia el oxígeno.
Las moléculas de agua se atraen entre sí por puentes de hidrógeno. Este tipo de
enlace también se forma entre el grupo hidroxil de un alcohol y el agua; entre el
6. HIDROFOBICIDAD
- Hidrofílico: molécula que interactúa fácilmente con el agua. Estas moléculas
adquieren fácilmente en carácter iónico en disolución; facilitan la formación de
puentes de hidrógeno; y poseen momento dipolar.
- Hidrofóbico: no interactúan con el agua (enlaces C-C // C-H). En disolución se
agrupan por empuje del agua.
- Anfipática: moléculas con estructuras con compuestos hidrofílicos e
hidrofóbicos.
7. pH
- Equilibrio iónico: todas las reacciones tienen lugar en medio acuoso (excepto las
que ocurren en lugares hidrofóbicos). La mayoría de sustancias disueltas
incluyen iones libres, y moléculas con grupos ionizables. El comportamiento de
estas moléculas dependen del grado de ionización.
- Ácido: sustancia que libera H+
- Base: sustancia que capta H+
HA + H20 H30+ + A-
Los ácidos y las bases del organismo, suelen ser débiles (un caso contrario, es el
jugo gástrico).
Un ácido o base fuerte es aquel que se disocia totalmente. En el caso de los
débiles, hay equilibrio entre el ácido/base, y su base/ácido conjugado.
Cuanto mas fuerte es la sustancia, más débil es su conjugado. La fuerza se mide
con Ka/Kb y pKa/pKb.
El agua es una sustancia anfótera y neutra.
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
Ka= [H+][OH-]/[H2O]= 1.8 * 10-16 Kw =Ka [H2O]= [H+][OH-] = 10-14M
log[𝐴− ]
𝑝𝐻 = 𝑝𝐾𝑎 +
[𝐻𝐴]
9. TITULACIÓN
Proceso en el que se añade un volumen conocido de base,
a una disolución de un ácido, mientras se monitorizan los
cambios de pH.
La curva de titulación es la representación gráfica del pH
frente al número de equivalentes, o de mL añadidos.
Los puntos de inflexión indican que pH=pKa
El punto de equivalencia indica que las moléculas de
equivalentes añadidos coinciden con las del ácido. Estos puntos
se miden por cambios de pH. En este punto solo está presente la base conjugada.
El punto isoeléctrico es el valor de pH para el que un aminoácido presenta una carga
neta igual a 0. Cuando coexiste la forma zwitteriónica. El zwitterion es una molécula con
igual carga positiva y negativa (-1 y +1//-3 y +3).
Los buffers del cuerpo humano tienen pKa cercanos a 7. A mayor concentración de
ácido y base conjugada, mayor capacidad amortiguadora.
La sangre se mantiene constante gracias a sustancias disueltas en ella, como por
ejemplo el tampón carbónico-carbonato, obtenido del CO2.
Los riñones mantienen el pH gracias a la eliminación de la orina (eliminan H +). Los
pulmones también actúan como tampones, gracias al intercambio O 2 y CO2.
Los principales tampones del cuerpo humano son:
o H2PO-/HPO42-: tampón fosfato; en el interior de las células.
o HCO3-/H2CO3: tampón carbonato; en la sangre.
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o Proteínas: gracias a sus cadenas laterales.
“Emia”: condición de la sangre. Las alteraciones del pH de la sangre se denominan
acidemia (pH<7.35) y alcalemia (pH>7.45). El pH suele variar entre 7.35 y 7.45. Los
límites son 6.8 y 7.8.
“Osis”: pH más bajo de lo normal. Describe un proceso. Acidosis (produce acidemia.
La causa es el exceso de ácido, o disminución de sustancias alcalinas. Puede ser
metabólica o respiratoria (hiperventilación)). Alcalosis (produce alcalemia. La causa es
el exceso de alcalosis, o disminución de sustancias ácidas. Puede ser metabólica o
respiratoria (hipoventilacípon)).
Tema 2
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Carbohidratos
1. DEFINICIÓN
Compuestos con fórmula Cn(H2O)n. Solo los monosacáridos o azúcares simples
se ajustan a esta fórmula. Pueden ser muy sencillos, o bastante complejos. Los
carbohidratos pueden ser polihidroxicetonas o polihidroxialdehídos.
2. FUNCIONES
Fuente y almacén de energía; componentes estructurales de pared celular y
exoesqueletos; moléculas portadoras de la información en la señalización celular.
Quiralidad
D si el OH del primer carbono quiral está a la derecha.
L si el OH del primer carbono quiral está a la izquierda.
Son enantiómeros, es decir, imágenes especulares no superponibles.
Las cetosas tienen un carbono quiral menos que las aldosas. Destacan la
dihidroxicetona (3C), ribulosa y xilulosa (5C) y fructosa (6C).
Proyección de Fischer
Monosacáridos: el carbono mas oxidado, el de más arriba. Los carbonos se
numeran desde arriba. El carbono quiral es el que tiene mayor número. Los azúcares en
la naturales suelen encontrarse en la forma D.
La galactosa y glucosa son epímeros (estructuras con el mismo número de
carbonos, que solo difieren en la posición de un carbono. No son superponibles, y tienen
varios carbonos quirales
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Bioquímica I
Tema 2: Carbohidratos
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4. MONOSACÁRIDOS
Los monosacáridos con más de 4 carbonos existen en forma cíclica. Un grupo
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Los monosacáridos de 6 carbonos, como la glucosa, pueden estar en 5 formas
diferentes: lineal, α-D-glucopiranosa; β-D-glucopiranosa; α-D-glucofuranosa; y β-D-
glucofuranosa. Esto también ocurre con la fructosa. Las formas pirano son mas estables
a mayores temperaturas, y las formas furano a bajas temperaturas.
Derivados de monosacáridos
Oxidados: un ácido aldónico se obtiene por oxidación del grupo funcional
aldehído de una aldosa, para formar un grupo carboxílico. La oxidación del grupo
hidroxilo en lugar del aldehído forma un ácido urónico. La oxidación de ambos produce
ácido aldárico.
La oxidación del carbono aldehídico C1 de la glucosa forma glucanato. La
oxidación del C6 forma glucoronato.
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La ruta metabólica del ácido glucorónico tiene lugar en dos fases; en la fase 1 se
produce la biotransformación, donde la molécula se hace mas hidrofílica. En la fase 2, la
conjugación, se hace que la molécula se haga mas fácilmente eliminable.
En la fase 2, la mayoría de los fármacos y sustancias tóxicas se excretan como
Sustitución de monosacáridos
- Fosforilación: los -OH de los monosacáridos
reaccionan con el ácido fosfórico, para formar
ésteres fosfato (glucosa-6-fosfato; y
dihidroxiacetona fosfato). Muy importantes en el
metabolismo intermediario.
Formación de glicósidos
Mediante enlaces glicosídicos entre compuestos con -OH; -NH2; -SH, que
reaccionan con el OH hemiacetálico/hemicetálico, y se libera una molécula de agua,
para formar glucósidos. Enlace O-glicosídico (metilglucosa), enlace N-glicosídico (AMP),
enlace S-glicosídico (glucosinolatos).
También destacan los aminoazúcares (con frecuencia en las cadenas de
glicoconjugados). Un ejemplo es el ácido siálico, que actúa como llave para virus, para
entrar en el interior celular.
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Reservados todos los derechos.
5. DISACÁRIDOS/GLICÓSIDOS
El enlace O-glicosídico se forma entre los monosacáridos, entre sus grupos
hemiacetales, liberándose una molécula de agua.
Los disacáridos son sólidos cristalinos, blancos, dulces y solubles, con cacrácter
reductor, excepto si se enlazan por el carbono anomérico. Es reductor si queda un
carbono anomérico libre, si el enlace se forma por los dos carbonos anomérico, no tiene
poder reductor.
Maltosa
Unión de dos α-glucosas, en enlace 1->4. Se denomina α-D-glucopiranosil-(1->4)-
D-glucopiranosa. El carbono anomérico de la segunda glucosa está libre, y puede seguir
polimerizando. Se encuentra de forma libre en la naturaleza. Tiene poder reductor.
Isomaltosa
Formada por dos α-glucosas, en enlace 1->6. No se encuentra
de forma libre en la naturaleza. Se llama α-D-glucopiranosil-(1->6)-D-
glucopiranosa. Tiene poder reductor.
Sacarosa
Formado por una α-glucosa, y una β-fructosa, por enlace 1->2. Se denomina
α-D-glucopiranosil-(1->2)-β-D-fructosa. No tiene poder reductor. El azúcar más habitual
y consumido. La lactosa es el azúcar de la leche de los mamíferos. Los disacáridos son
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Bioquímica I
Tema 2: Carbohidratos
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Lactosa
Formado por una β-galactosa y una α-glucosa, unidas por enlace 1->4. Tiene
poder reductor y se denomina β-D-galactopiranosil-(1->4)- α-D-glucopiranosa.
6. POLISACÁRIDOS
Formados por la unión de mas de 10 monosacáridos. Sus enlaces O-glucosídcos,
con liberación de agua por la formación del enlace. Gran tamaño y peso molecular. Son
insolubles en agua (dispersiones coloidales), sólidos de color blanco. En general, no son
dulces.
Homopolisacáridos
- Almidón: forma de almacenamiento de glucosa en plantas (glucosas por
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enlace α (1->4) y α (1->6). El polímero de enlace 1->4 se denomina amilosa
(lineal y helicoidal, con 6 glucosas por giro). Si está el enlace 1->6 se llama
amilopectina.
- Glucógeno: carbohidrato de
almacenamiento en animales. Polímero
ramificado (similar a la amilopectina),
con mas ramificaciones, cada 8 y 12
unidades. Cadena muy larga. Para su
hidrólisis se necesita la
glucógeno-fosforilasa, y α (1->6)
glucosidasa, liberándose glucosa. Se
almacena en hígado y músculos.
Sus cadenas van formando microfibrillas, que se unen para dar fibrillas, y a
su vez producen fibras visibles.
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
- Quitina: forma el exoesqueleto de artrópodos, y la pared celular de hongos.
Polímero no ramificado de N-acetilglucosamina con enlaces β (1->4). Se
hidroliza gracias a las quitinasas.
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Reservados todos los derechos.
o Hialuronato: componente de la matriz extracelular de cartílagos y
tendones. Enlace 1->3 . En el liquido sinovial y humor vítreo.
o Dermatán sulfato: piel, vasos sanguíneos, corazón, válvulas cardíacas,
tendones y pulmones. Enlace 1->3.
o Queratán sulfato: córnea, cartílagos, discos intervertebrales. Enlace
1->6.
o Condroitín-6-sulfato: componente del cartílago. Enlace 1->3.
o Condroitín-4-sulfato: enlace 1->3.
o Heparina: anticoagulante. Inhibe la conversión de fibrinógeno a
fibrina; la agregación de plaquetas y los factores de conversión.
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Bioquímica I
Tema 2: Carbohidratos
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o Grupo 0: D-galactosa
o Grupo A: N-acetil-D-galactosamina
o Grupo B: D-galactosa
Esto es gracias a las glicosiltransferasas. Estas tienen 3 formas de actuar: sin
transferencia (grupo 0), o con transferencia (grupo A y B).
Tema 3
Aminoácidos
1. AMINOÁCIDOS
Se encuentran en microorganismos, plantas y animales, cerca de 300 aminoácidos.
Solo 20 son codificados por el DNA para formar proteínas. Muchas proteínas poseen
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aminoácidos modificados, y partes no proteicas (grupos prostéticos no formados por
aminoácidos).
La prolina es el único que no posee la misma “cabeza” (estructura) que los demás,
debido a que el grupo carboxilo se une al R.
2. FUNCIONES
- Estructural: proteínas
- Informativa:
o Hormonas: T3 T4
o Neurotransmisores: Glu, Gly, GABA
o Mediadores químicos: histamina
Todos los aminoácidos proteicos son invariablemente de la serie L. Definimos L o D
según su parecido al L o D gliceraldehído (nos fijamos en esta disposición). También
está la forma S o R. En los seres humanos predominan las formas L y R.
La glicina es el único aminoácido que no posee carbono quiral.
Hay D-aminoácidos en las paredes celulares de las bacterias, y algunos antibióticos.
Treonina e Isoleucina poseen otro carbono asimétrico, además del Cα
4. CLASIFICACIÓN
- Proteinogénico codificable: forman parte de nuestras proteínas, y se encuentran
en nuestro código genético.
- No proteinogénicos codificables: no forman parte de nuestras proteínas.
- No proteinogénicos no codificables: no forman parte de nuestras proteínas, y no
se encuentran en nuestro código genético. Se sintetiza el aminoácido, y después
sufre modificaciones post-traduccionales.
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Reservados todos los derechos.
5. CLASIFICACIÓN SEGÚN FUNCIÓN
- Aminoácidos neutros o alifáticos: cadena lateral hidrocarbonada.
- Aminoácidos aromáticos: con grupo aromático en la cadena lateral.
- Hidroxiaminoácidos: con grupo alcohólico en la cadena lateral.
- Tioaminoácidos: con S en la cadena lateral.
- Aminas secundarias: el carbono alfa aparece sustituido por la cadena lateral.
- Aminoácidos dicarboxílicos y sus amidas: un grupo carboxilo o amida.
- Aminoácidos dibásicos: grupo básico en la cadena lateral.
Aminoácidos neutros o alifáticos
Su característica fundamental es la hidrofobicidad de la cadena lateral (con
excepción de la glicina; la glicina no tiene cadena lateral hidrofóbica).
Suelen ocupar el interior de las proteínas globulares, donde contribuyen a la
estructura global de la proteína, debido al efecto hidrofóbico (“micela proteica”).
Glicina (Gly, G, NE) / Alanina (Ala, A, NE) / Leucina (Leu, L, E) / Valina (Val, V, E) /
Isoleucina (Ile, I, E)
Son los principales responsables del plegamiento, la reactividad química es muy
escasa. La glicina tiene un destacado papel estructural, suele ser invariable en series
filogenéticas.
La serie filogenética molecular es la rama de la filogenia (relación de parentesco
entre las especies), que analiza las diferencias moleculares hereditarias en las secuencias
de ADN; ARN y proteínas, para obtener información sobre las relaciones evolutivas de
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una familia.
El resultado de un análisis filogenético molecular se expresa en un árbol filogenético.
Aminoácidos aromáticos
La presencia de sistemas aromáticos hace que absorban luz UV en torno a 280 nm,
la absorción UV de las proteínas se debe a su contenido en estos aminoácidos
Fenilalalina (Phe, F, E) / Tirosina (Tyr, Y, NE) / Triptófano (Trp, W, E)
Son muy poco reactivos, y sus cadenas laterales se orientarán mejor en un entorno
apolar, alejado de componentes acuosos. Son muy voluminosos, e interfieren en el
plegamiento de las proteínas. La fenilalalina y la tirosina son precursores metabólicos
de componentes muy importantes, como catecolaminas, hormonas tiroideas, y
melanina.
El triptófano es precursor metabólico de neurotransmisores, como setotonina,
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Bioquímica I
Tema 3: Aminoácidos
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Aminoácidos dibásicos
La lisina sirve para formar intermediarios covalentes en catálisis enzimáticas (bases
de Schiff).
La arginina es un importante intermediario en el ciclo de la urea.
La histidina forma parte del centro activo de muchas enzimas, debido al carácter
nucleófilo del imidazol. Contribuye al tamponamiento de los medios biológicos, por
tener un pKa cercano al pH intracelular.
Lisina (Lys, K, E) / Arginina (Arg, R, NE) / Histidina (His, H, E)
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modificación aparece en la elastina, proteína que abunda en el tejido elástico.
Cadenas laterales con carga eléctrica
Hay 7 aminoácidos que con su cadena lateral pueden ser ionizados (catálisis
ácido-base). Estos aminoácidos son Arginina (+), Aspártico (-), Cisteína (-), Ácido
glutámico (-), Histidina (+), Lisina (+), Tirosina (-).
A pH fisiológico pueden aceptar o ceder protones, según sea un grupo carboxilo
o amino. Estas cargas favorecen el plegamiento de las proteínas (puentes salinos).
La histidina posee una cadena lateral, con un pK cercano al pH intracelular, por
lo que es un reactivo en el centro activo de algunas enzimas.
Tema 4
Proteínas
1. ENLACE PEPTÍDICO
Enlace que une aminoácidos en una proteína. También se puede llamar enlace
amida. Cuando se forma, se produce una pérdida de agua y gasto de energía.
Cuando se forma una cadena polipeptídica, va desde el extremo N terminal, al C
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terminal.
Este enlace presenta un momento dipolar en la dirección del grupo amino,
debido a la tautomería ceto-enólica. Tiene un 40% de doble enlace en trans (la
prolina es el único que es cis).
Tiene estructura plana, debido al doble enlace. Este enlace no tiene libertad de
giro, pero sí los enlaces C-C α y N-C α anterior y posterior.
El enlace peptídico no permite rotación, por su estructura resonante. Sí se puede
alrededor del C α.
2. CADENA POLIPEPTÍDICA
Algunas combinaciones de φ y ψ son más favorables, y otras menos, debido a los
enlaces de H, y los impedimentos esféricos.
Las gráficas de Ramachandran muestran la
distribución de los ángulos φ y ψ de una
proteína. Estas gráficas determinan la estructura
secundaria más favorable.
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
3. NIVELES ESTRUCTURALES
- Primaria: secuencia de aminoácidos unidos entre si por enlaces peptídicos.
- Secundaria: la cadena lineal se pliega sobre si misma. Enlaces de H entre
grupos -CO- y -NH- del enlace peptídico (intracatenarios) (α-hélice; β-laminas
y giros). Estructura súper secundaria (mezcla de iguales o distintas
estructuras secundarias).
- Terciaria: tridimensional, determinada por las propiedades químicas de los
aminoácidos, y otro tipo de enlaces (muchas proteínas se quedan en este
nivel), clave para su función. Conformación de mínima energía (menor de 10
Kcal/mol).
- Cuaternaria: asociación de distintos polipéptidos, para formar una proteína
funcional (proteínas oligoméricas). Homoméricas (mismas subunidades) u
oligoméricas (distintas subunidades).
La estructura de las proteínas esta determinada por las interacciones entre los
distintos aminoácidos. En orden de fortaleza: covalentes (puentes disulfuro); iónicas
(puentes salinos); electrostáticas (puentes de hidrógeno, interacciones dipolares,
fuerzas de Van der Waals); entrópicas (interacciones hidrofóbicas).
4. ESTRUCTURA SECUNDARIA
- Hélice α: estabilizada por enlaces de H entre residuos cercanos.
- Hoja β: estabilizada por enlaces de H entre segmentos adyacentes que
pueden no estar cerca.
- Giro β: consecuencia de la hoja beta.
- Random coil: también llamada bobina aleatoria, plegamiento o espiral al azar
o azaroso. Disposición irregular de la cadena de polipéptidos.
(Los principales son hélice α y hoja β).
α-hélice
Mantenida por enlaces H intracatenarios (la cadena principal helicoidal se
mantiene unida por enlaces de H, entre las amidas de la cadena principal de un N y el
carboxilo todo de un N + 4 aminoácido).
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Bioquímica I
Tema 4: Proteínas
Es una hélice dextrógira, con 3.6 residuos (5.5 A (paso de rosca)) por vuelta. La
traslación por residuo es de 0.15nm.
Para saber si es dextrógira o levógira, se mira la cadena, colocando el grupo
amino abajo
Los enlaces peptídicos están alineados aproximadamente paralelos con el eje
helicoidal. Las cadenas laterales son aproximadamente perpendiculares al eje helicoidal.
Dentro de la α hélice hay entre 4-5ª, por lo que no puede entrar nada. El ancho
total, teniendo en cuenta las cadenas lateral es de 10-12ª (la medida justa para
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acoplarse en un surco de ADN).
Según se producen las vueltas, están casi alineados el aminoácido 1 y el 8.
No todas las secuencias de aminoácidos adoptan esta estructura. Los
aminoácidos alifáticos como Ala y Leu son los que mas propician esta formación.
La Pro es un disruptor de esta estructura secundaria, por la rotación N-C α
(ángulo ψ). La Gly tampoco favorece la α hélice, debido a la “ausencia” de cadena lateral,
favorece otras conformaciones. Las interacciones atractivas o repulsivas entre las
cadenas laterales separadas por 3-4 aminoácidos afectarán la formación.
La propensión de un aminoácidos hacia una estructura dada: cociente de dividir
la frecuencia relativa de un aminoácido, por la frecuencia relativa de aparición en dicha
estructura de todos los aminoácidos.
Ejemplo: mioglobina (proteína globular, transporta oxígeno en el músculo);
Giro β
El giro ocurre siempre que haya un
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cambio de dirección de 180º en una lamina
β. Este giro tiene lugar entre 4 aminoácidos.
El giro se estabiliza mediante un enlace de
hidrógeno, de un oxígeno de carbonilo y el
protón de la amida de tres aminoácidos en
la secuencia. La Pro en la posición 2 o la Gly
en la posición 3 son comunes en el giro β.
Hay dos tipo: los de tipo II tienen la
Pro en la posición 2, y el tipo I la Gly en la posición 3. Es más común el tipo II.
Hay aminoácidos que estabilizan y otros que desestabilizan esta estructura.
Ejemplo: tetrapéptido FGHR (giro β), hay proteínas con los tres tipos de
estructura secundaria.
5. ESTRUCTURA TERCIARIA
Disposición tridimensional de todos los
átomos de una proteína. Es el equivalente
de configuración absoluta en moléculas de
bajo PM. Podemos determinar las
coordenadas X, Y, Z de cada uno de los
átomos de una estructura terciaria.
Las fuerzas que mantienen esta
estructura:
- No covalentes: efecto
hidrofóbico, enlaces de
hidrógeno, e interacciones
iónicas o salinas.
- Covalentes: enlaces disulfuro,
enlace amida.
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aminoácidos con carga eléctrica, contribuyen al mantenimiento de la estructuras
terciaria de las proteínas. En forma de anión (D, E) y en forma de catión (Lisina ,Arginina
e histidina).
Enlaces amida: con bastante menor frecuencia podemos encontrar estos enlaces,
establecidos entre cadenas laterales de lisina y ácidos aspártico o glutámico. (D, E. K).
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Se ha podido comprobar que muchas proteínas están formadas por distintas
combinaciones de dominios, o que hace ofensa en arquitectas “modulares” en las
proteínas. Se representan gráficamente, con distintas bandas, de colores distintos.
6. ESTRUCTURA CUATERNARIA
Se dice que una proteína tiene estructura cuaternaria cuando consta de mas de una
cadena polipeptídica. Se denominan proteínas oligoméricas. Cada uno de los
polipéptidos recibe el Niobe de subunidad. La menor unidad plenamente funcional se
denomina protómero, y puede no coincidir con una subunidad. El PM es superior a
70kDa.
** El número de aminoácidos: la proteína de mayor tamaño que se conoce es la
titina (27000 aa), (facilita la contracción muscular).
** El peso molecular medio de un aminoácido es 110 g/mol. La titina (3-4 x 106
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Bioquímica I
Tema 4: Proteínas
Plegamiento de proteínas
Una proteína recién sintetizada posee solamente su estructura primaria, para que
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sea plenamente funcional ha de plegarse correctamente en una forma tridimensional
única.
1) Autoensamblamiento: la proteína se pliega sin ninguna ayuda.
2) Ensamblamiento dirigido: se pliega gracias a la acción de otras proteínas.
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Proteínas fibrosas
Estructuras relativamente simples, regulares y lineales. Tienen un papel
estructural, generalmente son insolubles en agua, o en disoluciones salinas diluidas.
Son proteínas con una alta concentración de estructuras alfa-helice y hoja-beta.
Algunos ejemplos de proteínas con función estructural son: alfa-queratinas,
colágeno y fibroina de la seda (las dos primeras pueden soportar esfuerzos mecánicos).
-COLÁGENO
El colágeno es una proteína fibrosa alargada, resistente al
esfuerzo mecánico, insoluble, estable un tiempo medio de vida
alto, y contráctil.
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
molécula. Tras esto, tenemos el tropocolágeno. En la matriz extracelular se produce el
entrecruzamiento por oxidación, dando lugar al colágeno.
La asociación de tropocolágeno forma
fibrillas de colágeno, estas se unen para formar
fibras de colágeno (fascículos), que se condensan,
para formar tendones.
Hay diferentes patologías relacionadas con
el colágeno: escorbuto (falta de Vit.C, no hay
hidroxilación), osteogénesis imperfecta (huesos
muy débiles), síndrome de Ehlers-Danlos
(debilidad en articulaciones). Debidas a
sustituciones de Gly, por Cys o Ser.
-HEMOPROTEÍNAS
Son proteínas conjugadas cuyo grupo prostético es una porfirina coordinada a
un ion metálico. Suelen estar relacionadas con todos los aspectos del metabolismo
aeróbico.
Son transportadores de oxigeno como la hemoglobina y la mioglobina.
Las clorofilas son porfirinas coordinadas con un ion de magnesio.
También lo son los citocromos (transportadores electrónicos).
Algunas son enzimas con el transporte electrónico como la citocromo oxidasa.
También lo son las enzimas relacionadas con el estress oxidativo, como las
peroxiasas.
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
con un catión de Fe2+), con 8 alfa-hélices,
designados desde A a H.Esta formada por
un anillo tetrapirrólico.
La porfirina es la protoporfirina IX. Las 6
posiciones de coordinación del Fe son: 4
de ellas coordinadas con los anillos, una
está coordinada con una histidina
proximal (se encuentra en la alfa-hélice F8), y la otra al oxígeno. Debido a la
unión con la histidina, se produce un abombamiento de los anillos, cuando
se une el oxígeno, se recupera la planaridad.
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Bioquímica I
Tema 4: Proteínas
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
disminuye porque el Oxígeno es usado por los tejidos. El
plasma sanguíneo se hace más ácido, porque se libera
CO2. La combinación de baja pO2 y pH en tejidos
perféricos causa una disminución en la saturación de la
Hb por el O2. (El oxigeno se libera por la hemoglobina).
La pO2 es mucho mayor en los pulmones, que en
los tejidos.
La liberación de CO2 de los tejidos disminuye la
afinidad de la Hb por el O2 de dos maneras:
- Parte del CO2 se convierte en bicarbonato,
donde se liberan protones, que contribuye al
efecto Bohr.
Efectos alostéricos
Los estados R o T pueden estabilizarse por la unión de ligandos distintos al
oxígeno.
H+, pH bajo favorece el estado T, que hace que la Hb libere el oxigeno unido. Este
fenómeno se como Efecto Bohr.
CO2, la liberación del CO2 baja el pH, por la conversión en HCO3- (CO2 + H2O —
HCO3- + H+), esto refuerza el efecto Bohr.
Biofosfoglicerato (BPG), regulación de la actividad por su unión más fuerte al
estado T, ayuda a la liberación deO2.
Anemia falciforme
Causada por mutación en Hb. La Glu A3 se transforma en Val en cadena beta
produce una asociación inadecuada de tetrámeros de Hb.
Produce eritrocitos alargadas, con impedimento para pasar por los capilares,
provocando un flujo reducido. Estos eritrocitos son más frágiles y susceptibles de lisis lo
que desemboca en anemia.
La Hb polimeriza, y se forman fibrillas, que llevan a la fama falciforme de los
eritrocitos. Es la primera enfermedad caracterizada como una mutación que cambia las
ecuaciones de la proteína (Venom Ingram)
Proteínas de membrana
Asociadas a las membranas biológicas por medio de interacciones hidrofóbicas
con los lípidos de membrana a(por medio de las cadenas apolares). Son insolubles en
soluciones acuosas, pero sin con detergentes.
8. PROTEÍNAS CONJUGADAS
Según la composición química de las proteínas:
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
- Proteínas simples: la proteína esta formada exclusivamente por aminoácidos
unidos entre sí, formando cadena(s) polipeptídicas.
- Proteínas conjugadas: las proteínas pueden conjugarse con otro grupos
químicos de naturaleza no aminoacídica (grupo prostético). Una
holoproteína está formada por la unión de apoproteína y grupo prostético.
Las proteínas conjugadas se suelen clasificar por la naturaleza del grupo
prostético.
- Núcleo
Nucleoproteínas
Se encargan del mantenimiento y transmisión de la información genética. El ADN
actúa como grupo prostético (nucleosomas, cromosomas). El ARN actúa como grupo
Biocatalizadores o enzimas: canalizan (casi) todas las reacciones química que tienen
lugar en los seres vivos
Tema 5
Enzimología
1. ENZIMAS
Son proteínas catalizadores naturales. Presentan una alta especificidad de sustrato.
Son capaces de acelerar las velocidades de reacción (por un factor superior a 10 6,
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
respecto a las mismas reacciones no catalizadas).
Se denomina centro activo al centro de unión al sustrato. Es un centro catalítico.
El sustrato se une de manera específica a la enzima, y forma el complejo ES que
posteriormente se rompe para dar el producto, y cuerear la enzima.
3. ESTRATEGIAS DE CATÁLISIS
- Pasos de la catálisis:
o Fijación estereoquímicamente complementaria del substrato.
o Transformación catalítica del mismo.
- Participantes:
o Cadenas laterales de los aas.
o Grupos o moléculas no proteícas:
▪ Iones metálicos
▪ Cofactores (coenzimas, componente no peptídico, anclado
permanentemente)
• Grupos prostéticos
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
Unión del sustrato
Se produce de manera muy específica. Debe haber una complementariedad
geométrica y de cargas. Hay 3 modelos que explican esto:
- Ajuste inducido
- Llave – Cerradura
- Estado de transición
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Bioquímica I
Tema 5: Enzimología
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
Oxidoreductasas
Catalizan reacciones de oxido-reducción. Transferencia de electrones.
(oxidoreductasas o deshidrogenasas)
Transferasas
Transfieren un grupo de una molécula a otra. (Transaminasas o transcarboxilasas).
Hidrolasas
Rompen enlaces con intervención de una molécula de agua: hidrólisis. (Fosfatasas o
peptidasas).
Liasas
Catalizan la liberación de grupos para formar dobles enlaces o a la inversa.
Isomerasas
Catalizan reordenaciones intramoleculares (Epimerasas o mutasas)
Ligasas
Unen dos moléculas por enlace C-C; C-S; C-O; C-N. Muchas de ellas se denominan
sintetasa, ligadas a la ruptura ATP o similares (Carboxilasas).
5. CINÉTICA ENZIMÁTICA
Cinética es el campo de la química que estudia la velocidad y el mecanismo de una
reacción. La velocidad se mide normalmente en términos de cuanto moles de sustatro
o producto desaparecen o se forman por unidad de tiempo.
S —> P
Velocidad inicial:
[𝑆] [𝑃]
𝑉=− =
𝑡 𝑡
[S]: molaridad
T: tiempo
Primer orden:
[𝑆]
𝑉= = 𝑘[𝑆]1
𝑡
6. CINÉTICA DE MICHAELIS-MENTEN
Esta cinética explica el comportamiento de enzimas no alostéricas. Asume que se
forma un complejo enzima – sustrato.
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
A bajas concentraciones de S, la reacción es de primer orden respecto al sustrato.
A altas concentraciones de S, la enzima está saturada por el sustatro. La reacción es
de orden cero y se alcanza la velocidad máxima.
Si Km tiene un valor grande quiere decir que k1 es pequeño, lo que indica poca
concentración de ES o lo que es lo mismo, poca afinidad de E por S.
Si Km tiene un valor pequeño, quiere decir que k1 es grande, lo que indica gran
concentración de ES o lo que es lo mismo, gran afinidad de E por S.
Si KM= [S], entonces Vo=1/2 Vmax, KM es la [S] cuando V0 es la ½ Vmax
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
La constante de Michaelis-Menten es la combinación de las constantes de reacción:
Significado de la constante KM
- Constante de equilibrio de disociación del complejo ES (en condices de velocidad
inicial).
- Medida inversa de la afinidad de la enzima por el sustrato (en condiciones de
velocidad inicial).
- COncentracion de sustrato para la que la velocidad se hace igual a la mitad de la
máxima (S0.5), es decir, la mitad de los centros activos están ocupados.
- Se define para una pareja enzima-sustrato es unas condiciones experimentales
dadas (pH, temperatura y fuerza iónica).
- Se mide en unidades de concentración.
- Los valores de KM varían ampliamente, para la mayoría de las enzimas se
encuentran entre 10-1 y 10-7M.
- Proporciona una medida de la concentración de sustrato necesaria para que
tenga lugar una catálisis significativa.
- Para algunas enzimas KM representa una aproximación a la concentración de
sustrato in vivo.
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
Número de recambio
Es útil definir una constante de velocidad más general, para describir la velocidad
limitante de cualquier reacción enzimática a saturación
El número de recambio equivale a la constante de velocidad K2, si se conoce el
número de centros activos, entonces se cumple esta ecuación
Cada reacción catalizada ocurre en un tiempo que ocurre a 1/K2. Kcat es una
constante de velocidad con unidades de tiempo -1. Los números de recambio de la
7. ECUACIÓN DE LINEWEAVER-BURK
Antes de disponer de ordenadores, la determinación de los valores de K M y Vmax se
tenía que hacer a través de transformación algebraica. EL mejor método de determinar
los valores de KM y Vmax es utilizando una representación doble recíproca (o Lineweaber-
Burk). Tomando inversos en la reacción de Michaelis-Menten.
1 𝐾𝑚 1 1
= ( )+
𝑉𝑜 𝑉𝑚𝑎𝑥 [𝑆] 𝑉𝑚𝑎𝑥
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Bioquímica I
Tema 5: Enzimología
8. INHIBICIÓN ENZIMÁTICA
La unión de moléculas pequeñas específicas e iones, así como cambios en el pH,
pueden inhibir la actividad de muchas enzimas.
Los inhibidores de enzimas actúan de manera reversible o irreversible. ¿Utilidad?
- Control del sistema – regulación de la actividad
- Fármacos y venenos
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
- Herramientas científicas para análisis de mecanismos enzimáticos.
Inhibición irreversible
Unión covalente e irrevocable a la enzima, eliminan la eficacia catalítica de la enzima.
Estos inhibidores reaccionan con un grupo químico de la enzima, modificándola
covalentemente.
A diferencia de la inhibición reversible, el efecto de los inhibidores irreversibles
depende del tiempo de actuación del inhibidor. Estos inhibidores, son en general,
altamente tóxicos.
Ejemplo: metales pesados, gas venenoso del sistema nervioso, y algunos
insecticidas.
- Reactivos de grupos -SH
Inhibición reversible
Se caracteriza por la rápida disociación del complejo enzima-inhibidor. En función de
la naturaleza de la interacción entre la enzima y el inhibidor, y los efectos del inhibidor
sobre la cinética enzimática:
- Competitiva
- No competitiva
- Acompetitiva
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
Reservados todos los derechos.
La sulfanialmida es un fármaco de la familia de las sulfamidas, que se parece
mucho a un metabolito que necesitan las bacterias para la síntesis de ácido fólico
(PABA), no afecta a los humanos, porque nosotros asimilamos el PABA de la
dieta.
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
Reservados todos los derechos.
- Inhibición reversible acompetitiva (incompetitiva): el inhibidor (que no se une al
centro activo) se une a la enzima solamente si ya se ha unido el sustrato. Los
efectos que tiene son que disminuye el valor de KM y también el de Vmax
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
9. CINÉTICA DE LAS ENZIMAS ALOSTÉRICAS
Son enzimas cuya estructura proteica está
formada de varias subunidades, presentan
estructura cuaternaria. Posee diferentes sitios
activos, por lo que se unen mas de una molécula
de sustrato. La unión del sustrato es
cooperativa.
Además del sitio o centro activo, tienen
sitios alostéricos o de regulación. La relación
entre la velocidad de reacción y la
concentración de sustrato sigue una cinética
sigmoídea. No se rigen por la cinética de
Michaelis-Menten.
Resumen enzimología
- Las enzimas son proteinas que catalizan las reacciones biológicas
(biocatalizadores).
- Presentan especificidad por su sustrato.
- Cada enzima presenta dos parámetros importantes, Vmax (saturación de la
enzima) y la KM (medida de la afinidad por el sustrato).
- La actividad enzimática puede ser inhibida, por inhibidores competitivos
(similares al sustrato), por inhibidores no competitivos y acompetitivos.
- La temperatura y el pH afectan a la enzima en su actividad catalítica.
- Algunas enzimas requieren de coenzimas y/o cofactores para su actividad.
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Bioquímica I
Tema 6: Lípidos
Tema 6
Lípidos
1. INTRODUCCIÓN
Su característica fundamental es la insolubilidad en agua y la solubilidad en
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
disolventes orgánicos.
- Derivados por esterificación y otras modificaciones de ácidos orgánicos
monocarboxílicos, llamados ácidos grasos.
- Derivados por condensación y posteriores modificaciones de unidades
isoprenoides
2. FUNCIONES
1. Energética: Los lípidos son una importante reserva energética. Poseen el mayor
valor calórico de todas las biomoléculas (10 kcal/g)
2. Estructural: Los lípidos son los constituyentes fundamentales de todas las
membranas biológicas y de las vainas de mielina del SN
3. Informativa: Muchas señales químicas son de naturaleza lipídica: hormonas
3. CLASIFICACIÓN
Los lípidos pueden clasificarse conforme a su comportamiento en la reacción de
saponificación:
- Saponificación: los ácidos grasos reaccionan con bases y forman sales de ácido
graso o jabones (esteres de ácidos grasos). Si en presencia de una base se forma
un jabón, es un lípido saponificable.
Los saponificables están formados por unidades C2 y los no saponificables
formados por C5 (condensación de acetil coA: C2 /condensación de unidades C5).
Ácidos grasos
Larga cadena carbonada con carboxilo terminal, en los seres vivos los más
abundantes son con número par de carbonos.
- Saturados: sin dobles enlaces
- Monoinsaturados: un doble enlace configuración cis/trans
-Poli-insaturados: múltiples dobles enlaces. Configuración cis
Numerosas configuraciones cis trans
Propiedades físicas:
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
- Anfipáticos: son moléculas anfipáticas, la cabeza es polar (-COOH) por tanto
hidrofílica y la cadena es apolar o hidrofóbica.
- Solubilidad: en medios acuosos forman micelas.
- Punto de fusión: aumenta a medida que aumenta el N° de C y el grado de
saturación
4. LÍPIDOS SAPONIFICABLES:
Todos ellos presentan o GLICEROL O ESFINGOSINA como esqueleto carbonado
(estructuras en rojo pálidos). A este esqueleto carbonado se anclan uno o más grupos
alquilo (en amarillo) y una cabeza polar (en azul). En los triacilgliceroles,
glicerofosfolipidos los grupos alquilo son ácidos grasos unidos por un enlace ÉSTER,
mientras que los esfingolípidos contienen un único ácido graso unido por enlace AMIDA
al esqueleto de esfingosina.
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
Reservados todos los derechos.
Acilglicéridos
1.Monoacilgliceroles (monoglicéridos)
2.Diacilgliceroles (diglicéridos)
3.Triacilgliceroles (triglicéridos)
De éstos, los triacilgliceroles o triglicéridos son, con mucho, los más abundantes. Se
almacenan sobre todo en el Tejido Adiposo.
Aparecen también en las semillas y frutos de las plantas oleaginosas (Olivo, soja,
girasol, etc.)
-Triacilglicéridos:
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
Cuando los tres grupos alcohólicos del glicerol forman ésteres con ácidos grasos
se produce una molécula de triacilglicerol (triglicérido). Son completamente
hidrofóbicos.
Fosfolípidos
Grupo de lípidos que poseen en su molécula algún grupo fosfato. Existen diferentes
variantes
- Fosfoglicéridos (glicerol)
- Esfingolípidos (esfingosina)
Son lípidos anfipáticos tienen, dentro de la misma molécula, una parte polar, que
interacciona fácilmente con el agua, y una parte hidrofóbica.
Por eso se llaman “anfipáticos”, que viene a significar “ambos afectos”, “ambas
afinidades”
- Contienen dominios hidrofóbicos e hidrofílicos.
- Son componentes estructurales de las membranas
- Agentes emulsificantes.
- Suspendidos en agua forman espontáneamente estructuras ordenadas.
- Grupos hidrofóbicos en el centro Grupos hidrofólicos en contacto
con el agua. (Base de la estructura de membrana)
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Bioquímica I
Tema 6: Lípidos
5. FOSFOGLICÉRIDOS
Glicerol unido a dos ácidos grasos. Cuando el tercer OH del glicerol está esterificado
con ácido fosfórico o con un ester de ácido fosfórico, en lugar del grupo carboxilo,
resulta un fosfoacilglicerol.
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
Reservados todos los derechos.
Existen fosfoglicéridos que actúan como moléculas señalizadoras. Las fosfolipasas
(existen 4, A/B/C/D) hidrolizan los enlaces de tipo éster en los fosfolípidos (son
específicas), convirtiendo los fosfolípidos en moléculas señalizadoras.
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
Reservados todos los derechos.
Los eicosanoides son importantes derivados de ácidos grasos poliinsaturados :
- Prostaglandinas
- Tromboxanos
- Leucotrienos.
6. ESFINGOLÍPIDOS
Tipos
Ceramidas:
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
Si la ceramida se le une a través del -OH la fosfocolina entonces se trata de la
esfingomielina. Las esfingomielinas son componentes importantes de las membranas
1) Esfingolípidos-Glicolípidos:
Glicolípidos tiene un carbohidrato unido al alcohol de un lípido por un enlace
glicosídico.
Los glicolípidos no llevan fosfato.
Frecuentemente una glucosa o galactosa está unida a la función alcohol primario de
la ceramida. El compuesto se llama CEREBRÓSIDO.
El –OH terminal de la esfingosina está sustituido por una hexosa (glucosa, galactosa)
o un polísacárido.
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
Reservados todos los derechos.
Cuando está unido el ácido siálico, el compuesto se llama GANGLIÓSIDO. Estos
compuestos son especialmente abundantes en las membranas de las células nerviosas
y cerebrales.
Los gangliósidos intervienen en procesos de:
- Termoregulación
- Neuroprotección
- Apoptosis
- Cáncer
- Neuropatías autoinmunes
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Bioquímica I
Tema 6: Lípidos
- Membranas celulares
- Precursor de los ácidos biliares
- Precursor de hormonas esteroideas
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
Reservados todos los derechos.
Es una molécula
anfipática con gran
componente apolar. Forma
parte de las membranas
lipídicas. Además de ser
una importante molécula
estructural, se encarga de
ser precursor de otras
moléculas. Un ejemplo son
los ácidos biliares digieren
las grasas al ser moléculas
anfipáticas con
propiedades detergentes
(el ácido cólico es el más
importante, cuyas sales
son el glicolato o
taurocolato).
El colesterol:
1. Es el principal regulador de la fluidez en membranas animales.
2. Es el precursor metabólico de importantes hormonas: corticoides, estrógenos,
gestágenos y andrógenos.
3. Es asimismo el precursor de los calciferoles (vitamina D), requeridos en la
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
correcta absorción intestinal de calcio.
4. Nuestro organismo es capaz de sintetizar metabólicamente el colesterol, pero
no existen sistemas enzimáticos capaces de romper su estructura cíclica.
5. El exceso de colesterol se elimina a través de la secreción biliar. Pero dada su
insolubilidad, tiende a depositarse en la íntima de las arterias, dando lugar a ateromas,
lesión propia de la arteriosclerosis.
Coenzima Q
Coenzima Q10, o ubiquinona, ubidecarenona, coenzima Q, CoQ10, CoQ, o Q10. (1o
subunidades de isopreno y quinona).
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
1,4-benzoquinona, Q se refiere al grupo químico quinona, y el 10 se refiere al
número de subunidades del producto químico isoprenilo en su cola.
Está presente en la mayoría de las células eucariotas, principalmente en la
mitocondria.
Es un componente de la cadena de transporte de electrones y participa en la
respiración celular aeróbica, generando energía en forma de ATP…
7. TRANSPORTE DE LÍPIDOS=LIPOPROTEÍNAS
Los lípidos son insolubles en agua, por lo que para su transporte deben de unirse a
una serie de proteínas para formar las lipoproteínas
Lipoproteína: Asociaciones dinámicas de lípidos y proteínas unidos por medio de
interacciones hidrofóbicas y electroestáticas con el fin de transportar los lípidos por el
ambiente acuoso de la sangre.
Tipos de proteínas:
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Bioquímica I
Tema 7: Transporte a través de membranas
Tema 7
Transporte a través de membranas
1. MEMBRANAS
Las membranas celulares siguen el modelo del mosaico fluido:
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
- Lípidos organizados como bicapa.
- Proteínas insertadas en la bicapa lipídica.
- Red de proteínas interiores y marcadores de superficies.
Las bicapas de fosfolípidos son fluidas. Los puentes de H del agua mantienen estas
capas unidas. Los fosfolípidos y las proteínas no ancladas, pueden moverse en la
membrana.
Los ácidos grasos saturados hacen la membrana menos fluida que los insaturados.
EL calor hace la membrana más fluida que el frio.
2. PROTEÍNAS DE MEMBRANAS
Estas proteínas tienen diferentes
funciones:
- Transportadores
- Enzimas
- Receptores de membrana
- Marcadores de identidad celular
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
- Proteínas de adhesión entre células
- Uniones al citoesqueleto
Difusión simple
Movimiento de moléculas de un compartimento con alta concentración a otro con
baja concentración.
Ocurre a favor de gradiente de concentración, esto quiere
decir que el movimiento de partículas ocurre desde la zona
más concentrada a la menos concentrada.
No intervienen proteínas transportadoras. La velocidad del
transporte es directamente proporcional al gradiente de
concentración (no saturable/cinética de primer orden).
Depende de la liposolubilidad y tamaño de la molécula.
Ejemplos: gases respiratorios, colesterol, ácidos grasos,
vitaminas liposolubles,
Transporte mediado
Puede ser de 2 tipos:
- Transporte pasivo o Difusión facilitada
- Transportadores
- Canales iónicos
- Canales de agua: Aquaporinas
- Transporte activo
– Primario (bombas iónicas, ATPasas)
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
– Secundario (acoplado)
Intervienen proteínas de membrana. Esto hace que sea selectivo ante las sustancia,
y debe haber especificidad química y estereoespecificidad.
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
- Transporte activo: dependiente de energía, se produce en contra de gradiente
de concentración (cuesta arriba, uphill). Hay dos tipos de transporte activo.
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Bioquímica I
Tema 7: Transporte a través de membranas
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
componentes fundamentales: base hidrofóbica (atraviesa la membrana
y está formada por un haz de 9 a 13 cadenas polipeptídicas), y una
cabeza asociada mediante un tallo a la base. La hidrólisis del ATP ocurre
en la cabeza.
Las ATPasas de tipo F bombean protones a través de la membrana
interna mitocondrial, lo que proporciona energía para la síntesis de ATP.
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
nefronas en el riñón (SGLT1 y SGLT2).
Su función es reabsorber glucosa desde el lumen del los túbulos renales
o desde el lumen del intestino delgado a las células del tejido. El proceso
de transporte requiere de una fuente de energía para su realización
proveniente del gradiente eletroquímico creado por el transporte
primario.
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
- Exocitosis: salida de material hacia fuera de la célula. Unas vesículas en el
citoplasma se funden con la membrana celular y liberan su contenido hacia el
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
Tema 8
Metabolismo mitocondrial
1. INTRODUCCIÓN
La energía se conserva en forma de compuestos ricos en energía; intermediarios
metabólicos cuyo potencial de transferencia de grupo ≤ -7kcal/mol.
El potencial de transferencia de grupo, es la energía que se transfiere de un
metabólico a otro junto con el grupo funcional transferido.
El ATP es un compuesto rico en energía. Los nucleótidos de adenosina pueden ser
trifosfato, difosfato o monofosfato. Hay otras molécula que también poseen energía:
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Bioquímica I
Tema 8: Metabolismo mitocondrial
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
1
[𝐴𝑇𝑃] + [𝐴𝐷𝑃]
𝐶𝐸𝐶 = 2 = 0.9
[𝐴𝑇𝑃] + [𝐴𝐷𝑃] + [𝐴𝑀𝑃]
Los nucleótidos de adenina, tanto en forma de ATP, ADP como de AMP; sus
concentraciones son muy distintas.
En condiciones normales, por cada 100 molécula de ATP, hay 10 de ADP y 1 de AMP.
Durante una actividad, se gasta ATP, que se transforma en ADP y AMP. Disminuye la
concentración de ATP, y aumenta la del ADP y AMP.
La concentración de ATP disminuye un 10 %, el ADP aumenta un 50% y el AMP
aumenta 500%. Esto quiere decir que una pequeña variación en la cantidad de ATP,
genera incrementos muy grandes de ADP y AMP, lo que hace que la mejor manera de
detectar si una célula necesita energia es mediante el cociente [AMP]/[ATP].
Las proteínas kinasas dependiente de AMP (AMPK) se activa por AMP, y fosforila
enzimas del metabolismo.
3. ESTRUCTURA DE LA ATPsintasa
Dentro de la membrana interna es donde se realiza la síntesis de ATP, mediante la
ATPsintasa. Esta, sintetiza ATP mediante la energía obtenida al disiparse el potencial
producido entre la zona de las dos membrana. En este espacio intermembranal la
concentración de protones es muy alta, y van a intentar entrar a la matriz, a través de la
ATPsintasa.
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
Una sintetasa requiere gasto de ATP, mientras que una sintasa no
requiere gasto de ATP.
La ATP sintasa está formada por dos estructuras, una subunidad
F0, y otra F1. La F0 se encuentra metida en la membrana mitocondrial
interna, y la F1 está en la matriz mitocondrial. Ambas subunidades
están formadas por distintas proteínas.
La entrada de los protones por el espacio intermembranal mueve
la subunidad F0, la hace girar, y esto permite que la F1 también gire, y
al hacerlo, la subunidad delta se mueve sobre cada una de las alfa y
4. FOSFORILACIÓN OXIDATIVA
El proceso de síntesis de ATP ocurre en 3 etapas.
Cada 3 protones hacen mover la subunidad F1, haciendo que el ADP y el ATP pasen
por distintos sitios, de forma que en un momento entra el ADP + Pi, en otro el ATP, y en
otro sale el ATP.
La síntesis de ATP es reversible, si añadimos ATP podemos hacer que la molécula gire
al revés. Para demostrar el movimiento, la F1 se pegó a un complejo de níquel que la
mantenía quieta. Esto hace que el eje gire en sentido contrario. Se colocó un filamento
de actina a uno de avidina, y a estas una molécula fluorescente, compobándose así que
se movía.
Para que la ATPsintasa funcione es necesario que haya H+ para que funcione, y ADP
y fosfato para sintetizar el ATP.
El ATP sale de la mitocondria mediante la Adenina Nucleótido Translocasa
(mecanismo antiporte electrogénico). Por cada ATP que sale, cada uno tiene 4 cargas
negativas, por cada ADP que entra tiene 3 cargas negativas, al final con cada intercambio
sale una carga negativa, que se acumula en el espacio intermembranal, neutraliza
parcialmente los H+.
Al mismo tiempo la entrada de un grupo fosfato mete una carga negativa, mediante
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
un sistema simporte, la fosfato translocasa, acompañado de un H+.
El resultado final es que entra un H+ en la mitocondria, sin sintetizar ATP (no todos
los H entran sintetizando ATP).
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
Reservados todos los derechos.
El complejo I transporta los electrones desde el NADH hasta el CoQ. El II desde
FADH2 a CoQ. El CoQ lleva estos electrones hasta el complejo III. El complejo III hasta el
CitC, el cual los lleva al IV. Finalmente, este se los pasa al O2, que con 2 protones de la
matriz y los 2 electrones, forman agua.
La energía liberada por estos electrones es usa para bombear protones al espacio
intermembranal. Por cada pareja de electrones que entra por el complejo I, salen 10 H+.
Si entran una pareja de electrones por el complejo II, salen 6 H +.
Transportadores de electrones
El NAD funciona como transportador de electrones, gracias a la nicotinamida (centro
activo), se usa en su forma reducida, y se obtiene en reacciones redox, donde NAD actúa
como sustrato. El NADH cede sus electrones a la cadena respiratoria para conseguir
energía, y la NADPH cede electrones para la biosíntesis de biomoléculas, y también para
mantener los mecanismos antioxidantes. Un mol de NADH2 produce 2.5 moles de ATP.
El FAD recoge los electrones en sus centros activos. Aquí es una flavina. Los
electrones van en cascada, y la energía libre va cada vez siendo mayor. Un mol de FADH2
produce 1.5 moles de ATP.
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Bioquímica I
Tema 8: Metabolismo mitocondrial
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
El NADH no es un compuesto rico en energía, ya que los electrones no los cede
directamente al oxigeno, si no a una cadena transportador de electrones.
La variación de energía en la transferencia de electrones entre el NADH al O2 es muy
alta, de -52.5 kcal/mol.
Inhibidores de complejos
Se pueden usar inhibidores para ver
cuales son las moléculas que están oxidadas,
y cuales reducidas.
Complejo I: Rotenona y Amital (bloquean
la oxidación de las agrupaciones Fe-S).
Complejo II: Carboxina y
2-Thenoiltrifluoroacetona (bloquean el
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
transporte de electrones)
Complejo III: Antimicina (bloquea el transporte de electrones entre el CoQ y el CitBH,
impidiendo la reducción de los citocromos A, A3 y C).
Complejo IV: KCN, CO, NO, azida (N3+) y HCN (azida y cianuro se unen al átomo de Fe
del CitA3 cuando está en estado férrico) (El CO se une cuando el Fe está en estado
ferroso).
ATPsintasa: Oligomicina y Diciclohexilcarbodiimida (bloquean la síntesis de ATP y la
acumulación de H+ en el espacio intermembranal, termina por paralizar la cadena
transportadora de electrones).
6. CICLO DE KREBS
También llamado ciclo del ácido cítrico, es un ciclo oxidante, que tiene lugar en el
interior mitocondrial, y del cual la cadena respiratoria obtiene energía.
El ciclo consiste en 8 reacciones, catalizadas por enzimas, la primera parte del ciclo
es muy oxidante, se generan dos moléculas de CO2 (isocitrato deshidrogenasa y alfa-
cetoglutarato deshidrogenasa) porque entra una molécula con dos carbonos, el Acetil-
CoA, que acopla el grupo acetilo al oxalacetato, dando lugar al citrato. El citrato se
transforma en isocitrato mediante la aconitasa, y del isocitrato se libera una molécula
de CO2. Tras esto, tenemos el alfa-cetoglutarato, y se produce la segunda
descarboxilación, por la alfa-cetoglutarato deshidrogenasa. En ambas reacciones
también se libera NADH.
En esta última reacción se acopla una molécula de CoA, dando lugar al succinil CoA.
El enlace del CoA al carbono es un enlace con mucha energía. La succinil CoA sintetasa
libera la CoA, y esa energía se libera en forma de ATP, originando el succinato. La enzima
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
deshidrogenasa, con liberación de NADH(H+), obteniendo al final el oxalacetato.
Rendimiento final
El ciclo produce 1 GTP o ATP, dependiendo de que el ciclo sea de organismos
superiores (ATP) o inferiores (GTP), 3 moléculas de NADH (3x2.5=7.5 ATP), 2 de CO2,
una de FADH2 (1x1.5=1.5 ATP) y un ATP. Se produce 8 electrones por cada molécula
reductora (NADH o FADH2). Todo esto se produce a partir de una molécula de dos
carbonos, el Acetil-CoA.
Por cada molécula de Acetil-CoA se producen dos moléculas de CO2 ( al final: 10
moléculas de ATP en la cadena respiratoria y fosforilación oxidativa) estas dos salen del
oxalacetato, es decir, salen en la 2ª y 3ª vuelta respectivamente, no en la primera.
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
Utilización de sus metabolitos
Hay algunos metabólicos del ciclo que pueden usarse para la biosíntesis de otras
moléculas en otras rutas metabólicas.
El citrato puede sacarse para sintetizar ácidos grasos y esteroles. El alfa-
cetoglutarato para sintetizar glutamato, que dará lugar a otros aminoácidos y purinas.
El succinil-CoA para porfirinas, grupo hemo y colorofilas. El oxalacetato, si se transamina
da lugar a aspartato, a partir del cual bases nitrogenadas y otros aminoácidos; o para
producir glucosa.
Si los intermediarios del ciclo de sacan, el ciclo pararía.
Para no perder moléculas, se usa una transformación. La enzima piruvato
carboxilasa transforma el piruvato en oxalacetato, es decir, lo carboxila. Luego este
grupo carboxilo se pierde, por lo que no hay una fijación neta de CO 2. Esta reacción se
denomina reacción a()
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Bioquímica I
Tema 8: Metabolismo mitocondrial
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
Una vez que lo ha transferido, el ácido lipoico queda reducido, y se vuelve a oxidar
mediante al E3 o dihidropoil deshidrogenasa mediante la reducción de FAD, que se
regenera con NADH, es que quien se lleva los equivalentes de reducción (dos
electrones).
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
importantes, la PDH y la alfa-cetoglutarato
deshidrogenasa. El ATP inhibe la PDH, porque cuando
hay mucho ATP, la célula ya no necesita más. Si hay
mucho Acetil-CoA ocurre lo mismo.
Cuando hay mucho ADP, es porque ha habido gasto
de ATP, por lo que la PDH se activa. Lo mismo si hay
piruvato, porque puede indicar que hay que gastarlo.
Ocurre algo similar con la enzima isocitrato
deshidrogenasa y la alfa-cetoglutarato deshidrogenasa.
Si la PDH se inhibe por su producto, la Acetil-CoA. La alfa-cetoglutarato
deshidrogenasa se inhibe por el succinil-CoA.
Hay inhibidores internos (los ya mencionados) y otros externos, como el
8. CONSERVACIÓN DE LA ENERGÍA
Las principales vías metabólicas que tienen lugar en la mitocondria cuya finalidad es
conservar energía son:
- Transformación de piruvato en acetil-CoA
- Oxidación de acetil-CoA por el ciclo de los ácidos tricarboxílicos (ciclo de Krebs), con
reducción de NAD+ a NADH(H+) y producción de CO 2.
- Oxidación de ácidos grasos (ß-oxidación) con producción de acetil- CoA y reducción
NAD+ a NADH(H+).
- Transporte electrónico a través de la cadena respiratoria con bombeo de protones
(H+) y consumo de O2
- Síntesis de ATP por la ATP sintasa
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
Conociendo los valores de potencial de oxidorreducción de los metabolitos que
intervienen en la reacción.
E0’= Diferencia de potencial eléctrico entre ánodo (electrodo cargado +) y el cátodo
(electrodo cargado -) con respecto al electrodo de referencia (H2)
Los electrones viajan desde los metabolitos con valor de E0’ más negativo (cátodo)
hacia los metabolitos con valor de E0’ más positivo (ánodo).
Aplicando la ecuación de Nernst: ∆G0’= - n F ∆E0’
Siendo:
∆E0’= E0’ánodo -E0’cátodo ; n= número moles de electrones transferidos;
F=carga (en Faradays)=96,472 kJ/Vmol=coulombios/mol (1 cal=4,184 J)
Tema 9
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
Metabolismo glucídico
1. VÍAS METABÓLICAS DE LA GLUCOSA
La síntesis de piruvato tiene lugar principalmente a partir de glucosa.
La glucosa se puede metabolizar de distintas formas. La principal es la
transformación de glucosa en piruvato, mediante glucolisis. Para sintetizar ribosa-5-
fosfato mediante la vía de las pentosas-fosfato; para sintetizar disacáridos y
polisacáridos (reserva energética) y para crear polisacáridos estructurales.
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Bioquímica I
Tema 9: Metabolismo glucídico
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
deshidrogenasa.
La PFK-1 también se regula por metabolitos. Esta enzima es inhibida por ATP y
citrato, y activada por AMP, ADP y fructosa-2,6-bisfosfato.
La regulación de esta enzima es alostérica.
Regulación de la piruvato quinasa (PK)
En todos los tejidos (piruvato quinasa L/M): esta enzima se inhibe por alanina
(transaminación del piruvato), ATP (ya hay energía, por lo que no se necesita más),
acetil-CoA (porque si la mitocondria tiene acetil-CoA, puede indicar que se están
sintetizando otras cosas, y que por lo tanto no es necesario sintetizar piruvato) y ácidos
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
grasos (si se sintetizan aportan energía, y por lo tant, no es necesario sintetizar piruvato)
y se activa por fructosa-1,6-bisfosfato y fructosa-6-bisfosfato.
En el hígado (piruvato quinasa L): esta enzima tiene dos isómeros. La proteína kinasa
A, se activa por AMPc. Esta PKA inactiva a la PK L/M mediante fosforilación, para
mantener los niveles de glucosa en sangre normales. Esto hace que la glucosa no se
transforma en piruvato, y se pueda usar.
La PK se puede activar mediante la PP
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
regenerándose el NAD+.
Formas de recuperar NAD+ para la glucolisis en condiciones anaeróbicas
- Fermentación láctica: cuando no hay
oxígeno, y por tanto el NADH no se
puede usar, el piruvato que se forma en
glucolisis, por medio de la lactato
deshidrogenasa (LDH) se transforma en
lactato, usando los equivalentes de
reducción del NADH, formándose en
NAD+ pudiendo ser usado en la glucolisis.
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
Este proceso se da en células de organismos superiores, tanto en hipoxia como
durante el ejercicio.
- Fermentación alcohólica: se da en levaduras. Usa dos enzimas, una piruvato
descarboxilasa (PDC) que descarboxila el piruvato formando acetaldehído con
liberación de CO2. Y este mediante la alcohol deshidrogenasa se transforma en
etanol, liberándose en el espacio extracelular.
La alcohol deshidrogenasa es una enzima reversible.
En levaduras, en situaciones de hipoxia, el piruvato producido puede ser usado
para regenerar el NAD+ mediante su transformación en etanol. Este proceso se
da en organismos eucariotas inferiores.
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Bioquímica I
Tema 9: Metabolismo glucídico
Para que las células usen precursores no glucídicos para producir glucosa, es porque
les sobra la energía, y no necesitan el piruvato.
Esta vía es muy importante en el metabolismo renal y hepático. La gluconeogénesis
solo se lleva a cabo cuando las necesidades energéticas de la célula, están cubiertas.
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
Regulación de la fructosa-1,6-bisfosfatasa (FBPasa-1)
Si no hay F26BP, es decir, si no se activa la glucolisis, se activa la gluconeogénesis. Y
por el contrario, si hay F26BP, la enzima es inhibida.
La F26BP regula de forma inversa a la fosfofructoquinasa-1, y a la fructosa-1,6-
5. SÍNTESIS Y DEGRADACIÓN DEL RESERVORIO GLUCÍDICO
Es una reacción reversible, es decir, hay
una vía de síntesis, y otra de degradación.
El mayor reservorio de glucógeno es el
músculo, y solo les sirve a ellos, ya que no
pueden exportar al glucosa al exterior de las
células, aunque las células que más capacidad
de almacenaje de glucógeno tienen son los
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
hepatocitos.
Las partículas de glucógeno hepático son
cadenas de glucosa que crecen a partir de un
cebador (región con 6 moléculas de glucosa), unido a su vez a una proteína, la
glucogenina.
Cada cadena de glucógeno tiene entre 12 y 14 residuos de glucosa. Las partículas de
glucógeno maduras tienen hasta 12 niveles y unos 55.000 residuos de glucosa.
Es una molécula muy ramificada, lo que permite a la célula obtener energía muy
rápidamente y fácilmente.
Metabolismo del glucógeno: Degradación
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
numero elevado de glucosas, la enzima ramificante coge parte de esta cadena lineal y la
transfiere mediante un enlace alfa (1->6) al carbono 6 de un residuo de glucosa que está
4 subunidades antes.
Regulación de la síntesis
Este proceso tiene una regulación hormonal, hay glucógeno sintasa (sintetiza
glucógeno) y glucógeno fosforilasa (degrada glucógeno).
La glucógeno sintasa tienen dos formas, una activa (a) y otra inactiva (b). Para pasar
de una a otra al glucógeno sintasa tiene que ser fosforilada, producido por (la glucógeno
sintasa quinasa 3, GSK3). Cuando es fosforilada se inactiva (esta fosforilacion se
producen en residuos de grupos hidroxilo de serina). Esta fosforilación está regulada por
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
La insulina provoca la inactivacion de la GSK3, manteniendo activa a la glucógeno
sintasa, y facilitando la acumulación de glucógeno.
La insulina se une a su receptor de membrana, el cual tiene actividad de tirosina
quinasa, esto hace que se fosforile el sustrato del receptor, el IRS-1. Una vez fosforilado,
activa a la fosfatidil inositol-3-quinasa (PI-3K) produciéndose el fosfatidilinositol-
trifosfato (PIP3), el cual, a través de la proteína PDK-1 y PKB, la GSK3 se inactiva
mediante fosforilación. Esta inactivación impide que la glucógeno sintasa se inactive.
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Bioquímica I
Tema 9: Metabolismo glucídico
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
Reservados todos los derechos.
Es más correcto el termino ciclo de las pentosas fosfato que vía, ya que empieza con
glucosa-6-fosfato y termina en gliceraldehído-3-fosfato y fructosa-6-fosfato.
Si mediante esta vía metabolizaramos 6 moléculas de glucosa-6-fosfato, las 6
moléculas contienen 36 átomos de carbonos, de los cuales 6 se desprenden en forma
de CO2. Como cada molécula de glucosa desprende 2 moléculas de NADPH, en la fase
oxidativa se obtienen 6 moléculas de CO2 y 12 de NADPH. Esto origina 6 moléculas de
ribulosa (5 carbonos cada una) por lo que tenemos 30 carbonos.
En la fase no oxidativa se obtienen 4 moléculas de fructosa-6-fosfato (6 carbonos
cada una, 24 carbonos) y 2 moléculas de gliceraldehído-3-fosfato (3 carbonos cada una,
6 carbonos).
Es decir, de las 6 moléculas de glucosa, recuperamos en la glucolisis 5, de ahí su
importancia. En la vía de las pentosas, la fructosa que se obtiene al final puede
interconvertiste gracias a la fosfoglucosa isomerasa, en glucosa-6-fosfato y empezar el
ciclo de nuevo.
En condiciones de gluconeogénesis, también el gliceraldehído-3-fosfato puede
convertirse en glucosa-6-fosfato; por ello se dice que es mejor usar el término ciclo.
Esta vía de las pentosas es paralela a la glucolisis.
Utilidad de la vía de las pentosas
Modo 1: si la fase oxidativa no funcionara, las
células pueden llegar a sintetizar ribosa-5-fosfato a
partir de intermediarios metabólicos de la glucolisis,
necesario para la síntesis de ácidos grasos.
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
reducción en la cadena respiratoria, y el NADPH sirve para aportar equivalentes de
reducción cuando se sintetizan biomoléculas.
Modo 4: aquí funciona la vía de las pentosas y la glucolisis. Se usa para obtener
piruvato, con liberación de 2 moléculas de ATP.
La glucolisis desde fructosa-6-fosfato y gliceraldehído-3-fosfato funciona hacia
abajo, y la glucosa-6-fosfato se incorpora a la glucolisis a través de la vía de las pentosas,
por lo que no es necesario el paso de fosfoglucosa isomerasa.
En este caso, las moléculas de glucosa que se desvían a la vía de las pentosas, no
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
entran en la glucolisis y viceversa. Esto es lo que ocurre en las neuronas.
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Bioquímica I
Tema 10: Metabolismo lipídico
Tema 10
Metabolismo lipídico
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
de Krebs, donde se producía NADH que se usa en la cadena respiratoria para la síntesis
de ATP.
El Acetil-CoA suele venir de la reacción catalizada por la piruvato deshidrogenasa, es
decir, de la glucolisis. En el caso de los ácidos grasos, a partir de la β-oxidación de la
Acil-CoA. Es decir, los ácidos grasos de cadena larga se van a oxidar hasta obtener
Acetileno-CoA, con liberación de NADH, que será usado en la cadena respiratoria.
El Acil-CoA procede de los ácidos grasos, que se almacenan en los triglicéridos del
tejido adiposo. Es necesario convertir estos triglicéridos en ácidos grasos, los cuales se
liberan, viajan por el torrente sanguíneo hasta llegar al tejido donde se van a usar
(principalmente hígado y músculo).
Los ácidos grasos libres no pueden encontrarse en esta forma en las célula, ya que
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
se encuentran los triglicéridos. Esta proteína es
fosforilada por la PKA cuando es necesario degradar
los triglicéridos. Esta proteína se reorganiza
permitiendo la entrada de otras proteínas que
degradaran los lípidos.
La PKA también fosforila a la enzima Lipasa
sensible a hormona (Triacilglicerol lipasa),
provocando que pueda entrar en las gotas de grasa,
y una vez aquí, hidroliza los lípidos. Los ácidos grasos
son transportados hasta el torrente sanguíneo
(gracias a la albúmina), donde viajarán hasta el tejido
correspondiente.
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
Una vez en el interior, la carnitina se desprende y se vuelve a sustituir por CoA.
Este transporte es el punto de regulación del metabolismo de los ácidos grasos en el
hígado.
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
La síntesis de ácidos grasos es exactamente igual que la degradación, pero a la
inversa.
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Bioquímica I
Tema 10: Metabolismo lipídico
se usa cuando no hay glucosa, para convertirlo en cuerpos cetónicos y así sustituir a la
glucosa en sangre.
Dos moléculas de Acetil-CoA se condensan para formar Acetoacetil-CoA, gracias a la
Acetoacetil-CoA tiolasa. Esta molécula es condensada con otra molécula de Acetil-CoA,
obteniéndose una molécula de 6 carbonos, gracias a la HMG-CoA sintasa, formándose
3-hidroximetilglutaril-CoA.
Con la enzima HMG-CoA liasa libera acetoacetato y Acetil-CoA. Este Acetoacetato
suele convertirse en acetona, pero para evitar esto, la enzima 3-hidroxibutirato
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
deshidrogenasa reduce esta molécula, formando 3-hidroxibutirato.
5. DIABETES MELLITUS
Cuando no hay glucosa en sangre, el glucagón activa la lipolisis. Esto tiene un
mecanismo opuesto, la presencia de insulina inhibe la lipolisis.
En las personas diabéticas, que tienen alterados los receptores de la insulina, o que
no producen insulina, su insulina no puede frenar la lipolisis, por lo que se producen
gran cantidad de ácidos grasos, los cuales viajan al hígado y producen cuerpos cetónicos.
En el hígado no se puede metabolizar el Acetil-CoA, porque además de que son
cantidades muy grandes, no se produce oxalacetato (metabolito que se condesa con el
Acetil-CoA para dar citrato).
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
produce una reducción, convirtiendo el enlace doble en uno simple, y finalmente ocurre
una translocación, de esta molécula a la Cisteína, para permitir la unión de otra molécula
de Acetil-CoA, para aumentar el tamaño del ácido graso, (hasta 16 carbonos).
Para la síntesis de una molécula de ácido palmítico se han consumido 7 de malonil
CoA; 1 de Acetil-CoA, 7 de ATP y 14 de NADPH.
El Ácido palmítico es el ácido graso base para la síntesis del resto (excepto de los
esenciales).
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
Lanzadera aspartato-malato
El oxalacetato se transforma en malato con gasto de NADPH. Este entra en el interior
de la mitocondria con regeneración del NADH convirtiéndose en oxalacetato.
Cada molécula de Citrato que sale de la mitocondria, lleva Acetil-CoA que se
transforma en ácidos grasos, y el oxalacetato, que aporta el NADPH necesario para esta
síntesis.
Regulación de la síntesis
La insulina (cuando las concentraciones de glucosa en sangre son altas) activa la
Citrato Liasa, que lleva a cabo la conversión del citrato a Acetil-CoA.
El citrato activa a la enzima Acetil-CoA carboxilasa que lleva a cabo la reacción de
transformación del Acetil-CoA a Malonil-CoA. Esta enzima es inhibida por glucagón y la
adrenalina (la enzima es fosforilada, y por tanto inactivada).
Finalmente el Malonil-CoA dará lugar a Palmitil-CoA mediante una serie de
reacciones.
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
Regulación de la Ácido Graso Sintasa
Esta enzima se regula, además de por los metabolitos y hormonal, también por
fosforilación y desfosforilación (llevado a cabo por hormonas).
La insulina activa a la Proteína fosfatasa 2A, la cual desfosforila a la carboxilasa,
activando a esta enzima (se activa a síntesis de ácidos grasos).
El glucagón y la adrenalina activan a la AMPK y PKA, estas provocan la fosforilación
de la carboxilasa, inactivándola.
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Bioquímica I
Tema 10: Metabolismo lipídico
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
ello va a aceitar varias vías metabólicas.
Tanto para la síntesis de fosfolípidos como para la de triglicéridos se necesita
Glicerol-3-Fosfato, el cual se obtiene de la glucolisis.
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
El ácido fosfatídico también se usa para la síntesis de fosfolípidos. Para ello debe
activarse, formando un intermediario con el nucleótido CTP, dando lugar al CDP-
Diacilglicerol.
Síntesis de fosfolípidos
Se pueden sintetizar por dos vías distintas. El fosfolípido, el grupo fosfato está unido
Síntesis de esfingolípidos
Se sintetizan a partir de Palmitil-CoA y Serina. Ambos, mediante una condensación
dan lugar a la 3-cetodihidroesfingosina, esta sufre una reducción de su grupo ceto a uno
alcohólico, consiguiéndose Dihidroesfingosina (esfingosina), la cual incorpora un grupo
acilo (Acil-CoA), el cual lo hace mediante un enlace amida, dando lugar a
Dihidroceramida.
Una vez que se ha formado esta molécula, esta se oxida, originando un doble enlace,
obteniéndose la ceramida.
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
Todo este proceso está regulado principalmente por la Ácido Fosfatídico Fosfatasa
(la enzima que quita el grupo fosfato al ácido fosfatídico para dar lugar a DAG).
Esta enzima se activa por las cardiolipinas y fosfatidilinositol, ya que ambos se
sintetizan del ácido fosfatídico, por lo que activan a la enzima cuando hay grandes
cantidades de estas moléculas, haciendo que el ácido fosfatídico se transforma en DAG,
que dará lugar a Fosfatidiletanolamina, Fosfatidilcolina, Triacilglicerol, Fosfatidilserina.
Los esfingolípidos (Dihidroesfingosina y Esfingosina) actúan como inhibidores de
esta enzima.
Tanto el Diacilglicerol como el Ácido Fosfatídico actúan como segundos mensajeros.
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
Los mecanismos de regulación de una enzima son complejos.
La expresión o actividad de la 3HMGC Reductasa aumenta cuando la transcripción
de su gen se activa. Para que este gen se transcriba es necesario que el elemento de
regulación por esteroides (ERS), es una secuencia promotora del gen.
Esta secuencia debe interactuar con una proteína, y cuando lo hace la HMGC se
transcribe y por tanto aumenta la cantidad de enzima.
El fragmento de proteína que activa al gen, procede de una enzima que se encuentra
anclada en la membrana del RE. Esta proteína es la SREBP, la cual en el RE está unida a
otra proteína (SCAP), la cual detecta la cantidad de colesterol que hay en membrana.
Cuando la concentración de colesterol baja, este conjunto de proteínas por medio
de vesículas, viajan desde el RE hasta Golgi. Una vez aquí, una Proteasa de Serina
específica, rompe la SREBP y libera un fragmento, que interactúa con la Metalo-Proteasa
unida a un átomo de Zinc.
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Bioquímica I
Tema 10: Metabolismo lipídico
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
reacción de equilibrio, por medio de la Isopentenil Pirofosfato Isomerasa.
Una molécula de Isopentenil Pirofosfato y Dimetilalil Pirofosfato se unen con
desprendimiento de un pirofosfato, para dar lugar a Geranil Pirofosfato. A esta molécula
se le puede añadir por medio de la Preniltransferasa, una molécula de Isopentenil
Pirofosfato para dar lugar al Farnesil Pirofosfato.
Dos moléculas de Farnesil Pirofosfato se unen por medio de la Escualeno Sintasa
(cabeza-cabeza) para formar al Escualeno (con aporte de NADPH y liberación de dos
moléculas de Pirofosfato).
Al Escualeno en una forma más “cíclica” solo es necesario la generación de un
epóxido entre los carbonos 2 y 3, mediante la Escualeno Monooxigenasa, generando el
Escualeno-2,3-Epóxido.
Esta molécula en las plantas se usa para la síntesis del Estigmasterol, en los hongos
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Reservados todos los derechos.
11. LIPOPROTEÍNAS
Estructuras esféricas con una cubierta de monocapa de fosfolípidos. Esta monocapa
también posee proteínas (Apoproteínas) que mantienen la forma, y “conocen” a qué
célula deben llevar su contenido.
Los quilomicrones son lipoproteínas con gran cantidad de triglicéridos, poco
colesterol, fosfolípidos y proteínas. A medida que aumenta la densidad de las
lipoproteínas, la proporción de proteínas, colesterol y fosfolípidos aumenta.
Los quilomicrones y VLDL se usan para transportar lípidos, las IDL y LDL transportan
colesterol y ésteres de colesterol, las HDL son lipoproteínas residuales cuando las
lipoproteínas han soltado su carga lipídica y retornan al hígado para volver a transportar
lípidos; también se usan cuando hay que mandar lípidos al hígado.
Apoproteínas
Cada una de ellas tienen distintas funciones, algunas de regulación (interaccionan
con receptores de la membrana plasmática.
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célula.
Ateroesclerosis
Un aumento de la síntesis de colesterol, provoca esta enfermedad, caracterizada por
la formación de placas de ateroma en los capilares.
Tratamiento:
- Colestiramina: bloquea la reabsorción de las sales biliares.
- Estatinas (p. ej. Lovastina): inhibe la 3-HidroxiMetilGlutaril-CoA Reductasa
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Tema 11
Metabolismo nitrogenado
1. COMPUESTOS NITROGENADOS
Son compuestos orgánicos que contienen nitrógeno en su estructura molecular. En
los seres vivos son:
- Aminoácidos
- Bases nitrogenadas
- Carbohidratos (glucosamina, N-acetil galactosamina…)
- Lípidos (fosfolípidos, esfingolípidos…)
- Vitaminas (riboflavina, niacina…)
- Hormonas (adrenalina, dopamina…)
Estas enzimas cortan todas las proteínas a veces de forma específica y otras de
manera inespecífica.
Las proteínas ingeridas, debido a las proteasas, forman una mezcla de aminoácidos
y oligopéptidos, los cuales mediante una peptidasa específica (que poseen las células
intestinales) son degradados en aminoácidos y tripéptidos o dipéptidos, que por medio
de peptidasas se transforman en aminoácidos. De este modo, todas las proteínas
ingeridas son transformadas en aminoácidos, los cuales pasan al corriente sanguíneo.
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Bioquímica I
Tema 11: Metabolismo nitrogenado
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Si queremos usar los aminoácidos para obtener energía, tenemos que separar el
grupo amino del esqueleto carbonado, que serán usados para la obtención de energía.
El grupo amonio que se forma puede ser usado para la biosíntesis de aminoácidos,
nucleótidos, y otras aminas, o para formar Carbamil Fosfato.
Los esqueletos carbonados son metabolizados en el Ciclo de Krebs, además usando
Ciclo Alanina-Glucosa
Cuando es necesario que el músculo degrade proteínas, los aminoácidos que se
producen transfieren su grupo amino a la Alanina, el cual es un aminoácido que viaja
por la sangre hasta el hígado, donde cede este grupo amino al Glutamato, y esta se
transforma en piruvato que mediante una gluconeogénesis da lugar a glucosa, que viaja
hasta el tejido donde sea necesaria.
Estos aminoácidos que proceden de la degradación de proteínas, pueden usarse
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para la síntesis de esqueletos carbonados para la respiración celular. El ion amonio es
un desecho que hay que eliminar.
Este amonio se une con piruvato para formar alanina, y esto establece un ciclo
alanina-glucosa, de modo que todo el ion amonio es eliminado por el hígado en forma
de urea.
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Reacción de la Carbamilfosfato Sintetasa I
Es una reacción con gasto de ATP, donde se unen cosas volátiles.
El bicarbonato (CO2 en disolución) es fosforilado mediante ATP para formar
Carboxifosfato, a la cual se le incorpora NH3, donde se desprende el grupo fosfato que
habíamos incorporado antes (este primer ATP solo sirve para activar al bicarbonato).
La molécula que se ha formado es Ácido Carbámico, la cual vuelve a ser fosforilada
para formar Carbamilfosfato. Todo esto se ha realizado por la Carbamilfosfato Sintetasa
I.
Hemos dicho que la urea se forma a partir de Carbamilfosfato y Aspartato. Este
aminoácido lo que hace es recibir el grupo amino del glutamato (mediante la Aspartato
Ciclo de la urea
Es un ciclo constituido por 4 reacciones. La primera reacción la
realiza la Ornitina transcarbamilasa (enzima mitocondrial), que
condensa el Carbamilfosfato con un aminoácido no
proteinogénico, la Ornitina, dando lugar a la Citrulina. Es un ciclo
que solo tiene lugar en un sentido.
Esta citrulina sale de la mitocondria (mediante un
transportador específico), y se une con el Aspartato y gasto de 2
moléculas de ATP, que mediante la ArgininoSuccinato Sintetasa,
forma el Argininosuccinato.
Por medio de la ArgininoSuccinasa, se desprende Fumarato y
queda Arginina, que mediante la Arginasa libera la urea y se
transforma de nuevo en Ornitina. Tiene un gasto global de 4 moléculas de ATP.
Fase mitocondrial
La primera reacción del ciclo de la urea es la condensación del Carbamilfosfato con
Citrulina. Para que se sintetice la urea es necesario Aspartato e ion amonio.
Estos compuestos proceden de vías diferentes.
El aspartato procede de la transaminación de glutamato y oxalacetato. El Glutamato
le cede su grupo amonio (se transforma en alfa-cetoglutarato) al oxalacetato,
formándose Aspartato.
La reacción de transaminación la cataliza la Aspartato Aminotransferasa. La
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transformación de glutamato a alfa-cetoglutarato es realizada por la Glutamato
Deshidrogenasa.
El ion amonio puede venir de la Glutamina que se descompone en ion amonio y
glutamato, por medio de una Desamidación (Glutaminasa).
Si la concentración de Glutamato es muy alta, la N-acetil glutamato sintasa sintetiza
N-acetil glutamato, el cual es un activador de la Carboamil Fosfato Sintetasa I. Una
concentración de glutamato alta, indica que hay muchos aminoácidos, que por medio
de aminotransferasas, le están cediendo su grupo amino al glutamato.
Fase citosólica
La Argininosuccinato Sintetasa, la cual gasta energía en forma de ATP (2 moléculas
de ATP). La reacción catalizada por esta enzima consiste en obtener ArgininoSuccinato.
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- Transaminación: (requiere PLP), el grupo amino se transfiere a glutamato y
glutamina para su liberación, o a aspartato para su envío al ciclo de la Urea.
Las transaminasas o aminotransferasas son específicas para cada aminoácido.
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Principales aminotransferasas
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4. CONEXIÓN ENTRE CICLO DE UREA Y CICLO DE KREBS
En la fase mitocondrial del ciclo de la urea usa Carbamilfosfato y Ornitina para dar
lugar a Citrulina, la cual sale de la mitocondria por un transportador específico y en el
citoplasma se transforma en ArgininoSuccinato, este en Fumarato y Arginina, y esta en
Ornitina con liberación de urea. La Ornitina vuelve a entrar en la mitocondria por un
transportador específico, para completar el ciclo.
El oxalacetato del ciclo de Krebs se transamina con glutamato para dar lugar a
aspartato, el cual puede salir de la mitocondria, e interviene junto con la citrulina en la
formación de Argininosuccinato. El oxalacetato se transforma en Aspartato por medio
de la Aspartato Amino Transferasa.
Al mismo tiempo el Fumarato que se libera en el ciclo de la urea, puede entrar en la
mitocondria para formar parte del ciclo de Krebs, de esta manera el ciclo de Krebs no
pierde moléculas.
Además, el alfa-cetoglutarato se transamina con cualquier aminoácido para formar
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Bioquímica I
Tema 11: Metabolismo nitrogenado
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6. ELIMINACIÓN DE AMONIO EN TEJIDOS EXTRAHEPÁTICOS (OTROS TEJIDOS)
La glutamina sintetasa sintetiza glutamina a partir de glutamato e ion amonio libre.
Esta enzima cataliza una reacción de equilibrio en la cual se usa ATP. La enzima gasta
ATP en la síntesis de glutamina porque forma un intermediario, el gamma-
glutamilfosfato.
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7. UTILIZACIÓN DE LOS CUERPOS CARBONADOS
Son metabolizados (según el aminoácido) por distintas vías.
Los aminoácidos se pueden dividir en 3 grandes grupos:
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-Mezcla de ambos grupos: aminoácidos cuyo metabolismo puede dar
precursores glucídicos como de cuerpos cetónicos.
Estos aminoácidos son Fenilalanina, Triptófano Tirosina, Isoleucina y Treonina.
8. SÍNTESIS DE AMINOÁCIDOS
De los 20 aminoácidos proteinogénicos, 11 son no esenciales, es decir, que los
podemos sintetizar.
- Alanina <- Piruvato (transaminación)
- Arginina <- Ciclo de la urea
- Asparagina <- Asparatato (amidación)
- Aspartato <- Oxalacetato (transaminación)
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Síntesis de Glicina y Serina
La síntesis de la serina es a partir del 3-fosfoglicerato, el cual se reduce por medio
de la Fosfoglicerato deshidrogenasa, dando el 3-fosfohidroxipiruvato. Este por medio de
la Fosfoserina aminotransferasa, dando lugar a 3-fosfoserina.
Esta se desfosforila por medio de Fosfoserina fosfatasa, obteniéndose Serina.
Esta serina, usando el Ácido Tetrahidrofólico y liberando Metilentetrahidrofolato,
por medio de la Serina Hidroximetil Transferasa produce Glicina.
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Bioquímica I
Tema 11: Metabolismo nitrogenado
Síntesis de Tirosina
Tiene lugar a partir de la Fenilalanina, por medio de una incorporación de un grupo
hidroxilo a través de la Fenilalanina Hidroxilasa, que usa oxígeno para incorporar el
grupo hidroxilo y generar una molécula de agua.
Para ello se necesitan hidrógenos, que se obtienen de un intermediario, la
Tetrahidrobiopterina, un compuesto especial que se usa mucho en el anabolismo, para
proporcionar átomos de hidrógenos.
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Reservados todos los derechos.
Moléculas transportadoras de grupos químicos
Son principalmente cuatro, aunque hay alguna más. Destacan:
- Tetrahidrofolato/Ácido fólico
- Pterina
- Biotina
- S-Adenosil metionina (adoMet)
En general todos los aminoácidos en sus vías de síntesis van a regular por retro-
inhibición el primer paso de la vía de síntesis. Esta retro-inhibición suele ser de tipo
alostérico.
Tema 12
Metabolismo de nucleótidos
1. SÍNTESIS DE PIRIMIDINAS
Lo primero es la síntesis del Fosforribosil pirofosfato (PRPP). Esta molécula se sintetiza a
partir de la PRPP Sintetasa, y es precursora de la síntesis de purinas, pirimidinas, histidina y
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triptófano.
Hay una molécula de ATP que se gasta y se forma una de AMP, para recuperar esta molécula
es necesario gastar otra, por lo que el gasto global de ATP es de 2 moléculas.
El aumento de la concentración de ADP indica que en la célula hay poca energía, por ello, el
ADP es un inhibidor de la PRPP sintetasa.
Esta enzima también es regulada por los metabolitos finales de las vías donde participan, de
manera alostérica.
La Aspartato Transcarbamilasa también está regulada por los metabolitos finales de la vía
metabólica de la síntesis de purinas.
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Una vez obtenido el Orotato, este debe unirse a PRPP (Fosforribosil Pirofosfato), por medio
de la Orotato Fosforribosil Transferasa, con desprendimiento de PPi, obteniéndose Orotidilato
u Ácido Orotidílico.
Esta molécula se descarboxila por medio de la Orotidilato Descarboxilasa y se obtiene el
2. GENERACIÓN DE DESOXIRRIBONUCLEÓTIDOS
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Se consiguen por eliminación del hidroxilo en posición 2 de la ribosa. Esto lo realiza la
Ribonucleótido Reductasa, la cual actúa sobre los nucleótidos difosfato.
Esta enzima que posee dos grupos sulfhidrilo provoca la eliminación de una molécula de
agua, y transforma los nucleótidos difosfato en desoxinucleótidos difosfato. Esta enzima, tras la
reacción se queda un puente disulfuro entre sus grupos sulfhidrilo, de modo que queda oxidada
y debe ser regenerada.
Para su regeneración se necesita la Glutaredoxina, que tiene 2 grupos sulfhidrilo, de modo
que si una se oxida, la otra se reduce (hay una transferencia de protones, entre las dos enzimas).
La Glutaredoxina oxidada, se regenera a partir de Glutaredoxina Reductasa, la cual usa
equivalentes de reducción en forma de NADPH, a través de Glutatión, dando lugar al glutatión
reducido, el cual cede los protones a la Glutaredoxina, que a su vez los cede a la Ribonucleótido
Reductasa, para que esté en su forma reducida y pueda actuar.
Otra forma es mediante la Tioredoxina. El mecanismo es similar al anterior, excepto que la
proteína que mantiene a la Ribonucleótido Reductasa en su forma reducida es la Tioredoxina, la
3. SÍNTESIS DE PURINAS
En la síntesis de pirimidinas se sintetizaba por un lado el PRPP
y por otro el Orotato (molécula similar a una base pirimidínica), y
luego se condensaban y sufrían pequeñas modificaciones.
En el caso de las purinas se sintetizan directamente sobre el
PRPP (Fosforribosil Pirofosfato). El primer paso es la
incorporación de un grupo amino en el C 1 de la PRPP (a partir de
una Glutamina, con desprendimiento de PPi), por medio de la
Glutamina PRPP Amidotransferasa, dando lugar a la Fosforribosil
Amina.
Sobre esta molécula se va a sintetizar parte por parte, todo el esqueleto carbonado de las
purinas.
Cada uno de sus componentes procede de una molécula diferente.
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Bioquímica I
Tema 12: Metabolismo de nucleótidos
Tras todas las reacciones, se obtiene IMP (Inosina Monofosfato), la cual es la base para la
posterior síntesis de los nucleótidos de Guanina y Adenina.
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
Reservados todos los derechos.
A partir del IMP, para sintetizar AMP, lo
primero es usando un Ácido Aspártico (donador
de grupos amino) se forma un intermediario, el
Adenilosuccinato, por medio de la
Adenilosuccinato Sintetasa. Tras esto debe
desprenderse el Ácido Succinico, por medio de
la Adenilosuccinato Liasa, obteniéndose
finalmente AMP.
Para la síntesis de GMP, lo primero que le
sucede al IMP es una reducción por medio de la
IMP Deshidrogenasa, con lo cual se obtiene un
grupo ceto en el C 2, obteniéndose la Xantilato.
Este por medio de la GMP sintetasa (Guanidil
Monofosfato Sintetasa), que usa Glutamina
como donador de grupos amino y ATP (se
gastan 2 moléculas de ATP), produce el GMP.
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
El ATP activa a la Carbamil Fosfato Sintetasa II.
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
Reservados todos los derechos.
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Tema 13
Integración del metabolismo
2. COMUNICACIÓN HÍGADO-MÚSCULO
El ciclo de Cori, es un ciclo lactato – glucosa. El músculo cuando está haciendo
ejercicio consume glucosa, y si no tiene oxígeno suficiente, empieza a funcionar la
fermentación láctica, produciéndose lactato, el cual se manda a la sangre, y llega al
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Bioquímica I
Tema 13: Integración del metabolismo
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el grupo amino y piruvato. El piruvato por gluconeogénesis se transforma en glucosa y
viaja hasta el músculo de nuevo.
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
Esta AMPK que es el regular del estado energético celular en el interior celular, tiene
diferentes funciones dependiendo del tejido.
La AMPK en el metabolismo oxidativo, va a permitir la entrada de glucosa al músculo,
pero no para ser almacenado en forma de glucógeno (proceso anabólico), sino que
favorece la glucolisis. Lo mismo ocurre con los ácidos grasos, estos entran en el músculo,
y son usados para obtener energía, mediante la beta-oxidación.
En el hígado, estimula la degradación de los ácidos grasos, pero inhibe la síntesis de
colesterol, de ácidos grasos, y la gluconeogénesis.
En el corazón es prácticamente igual que en el músculo esquelético, estimula la
producción de glucolisis anaerobia, y por tanto, la producción de lactato.
5. INGESTA NORMAL
6. AYUNO SUAVE
Es el tiempo de 4 – 5 horas que transcurre entre que comemos, hasta que volvemos
a comer.
Cuando no incorporamos glucosa, el hígado es el encargado de usar su glucógeno
para que al transformarse en glucosa, la glucemia se mantenga constante, y se pueda
alimentar al cerebro y músculo. Al mismo tiempo el riñón también libera glucosa para
colaborar.
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
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7. AYUNO PROLONGADO
Correspondería a un ayuno donde no hay glucógeno hepático, y sería a partir de las
5 horas.
En un ayuno prolongado el glucógeno hepático se ha acabado, por lo que el hígado
proporciona poca glucosa, que manda una señal al páncreas y sintetiza glucagón, que
actúa directamente sobre el hígado y el tejido adiposo. En el tejido adiposo provoca la
liberación de triglicéridos, que se transforman en ácidos grasos y viajan por la sangre,
formando un complejo con la albúmina, y es usado como combustible.
La metabolilzación de los triglicéridos también libera glicerol, que viaja hasta el
hígado y el riñón, donde se hace gluconeogénesis para producir glucosa.
El hígado con los ácidos grasos procedentes del tejido adiposo, produce acetil-CoA
que usa para producir cuerpos cetónicos, los cuales son liberados a la sangre, para
alimentar a los músculos, al cerebro y al riñón.
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8. AYUNO EXTREMO
La concentración de glucosa en sangre es muy baja, el glucagón sigue actuando, el
tejido adiposo va perdiendo masa, el hígado ya no tiene glucosa.
El glucagón sigue produciendo la metabolización de los triglicéridos, que se
transforman en ácidos grasos y glicerol, este es usado en el hígado , y los ácidos grasos
son usado por los tejidos. Se mantiene la alimentación del cerebro por cuerpos
cetónicos y glucosa.
El músculo empieza a movilizar proteínas musculares que se transforman en
aminoácidos, y estos en alanina, la cual viaja por el torrente sanguíneo hasta el hígado
y riñón, para eliminar el grupo amino.
Entonces, en el hígado y en el riñón, tanto la alanina como el glicerol procedente
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Bioquímica I
Tema 13: Integración del metabolismo
del tejido adiposo, se usan por gluconeogénesis para producir glucosa, pemitiendo que
la glucemia se mantenga prácticamente constante.
Esta glucosa procede del metabolismo de proteínas musculares.
Otra cosa que sucede en el caso del ayuno extremo, es que se produce amonio, el
hígado lo usa para producir urea, que viaja hasta el riñón. La urea se transporta en
forma urea, y también en forma de glutamina, la cual, cuando llega al riñón, libera sus
dos grupos amino, se transforma en alfa-cetoglutarato, el cual es usado para producir
glucosa. Por lo que el riñón produce glucosa por gluconeogénesis por glutamina y
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alanina.
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obtener glicerol y ácidos grasos. Los ácidos grasos viajan a los músculos e hígado para
proporcionar energía. El glicerol en el hígado produce gluconeogénesis, para mantener
la glucemia.
Los ácidos grasos en hígado son metabolizados para obtener energía, o para ser
transportados de nuevo a otros tejidos donde se necesiten, (en el caso en el que los
niveles de glucosa descendieran, los ácido grasos serían usados para sintetizar cuerpos
cetónicos).
Cuando el músculo gasta mucha glucosa, llega un momento en el que el aporte de
oxígeno al músculo no es suficiente, y por tanto, este comienza a realizar fermentación
láctica, se produce lactato, y en la sangre sirve para alimentar otros tejidos, como el
corazón (el cual consume mucho lactato) o el cerebro, que consume el lactato, y de
este modo la glucosa es preservada para usarse en el músculo.