Convocatoria 2019

TEMA 2: BIOLOGÍA MOLECULAR

2.1 Moléculas para el metabolismo
Basada en la presentación de Stephen Taylor. http://i-biology.net/ibdpbio , Chris
Paine http://www.bioknowledgy.info/. Gretel Von Bargen
https://www.biologyforlife.com

BIOLOGÍA
CARMEN TERESA OLARTE VILLEGAS
Programa del Diploma del Bachillerato Internacional. Biología. Primera evaluación: 2016

TEMA 1:
BIOLOGÍA MOLECULAR
• SUBTEMA 2.1: MOLÉCULAS PARA EL METABOLISMO

Idea fundamental:
Los organismos vivos controlan su composición
mediante una compleja red de reacciones químicas
Basada en la presentación de Stephen Taylor. http://i-biology.net/ibdpbio
 1.1 Introducción a las células
Naturaleza de las ciencias:
Aplicaciones
• Refutación de teorías: la síntesis artificial de la urea ayudó a refutar el
vitalismo. (1.9) • La urea como ejemplo de un compuesto producido por organismos vivos,
pero que también puede sintetizarse artificialmente.
•

Comprensión:
• La biología molecular explica los procesos vivos aludiendo a las
sustancias químicas implicadas. Habilidades experimentales:
• Los átomos de carbono pueden formar cuatro enlaces covalentes, y • Habilidad: Dibujo de diagramas moleculares de la glucosa, la
permiten así la existencia de toda una serie de compuestos estables. ribosa, un ácido graso saturado y un aminoácido común.
• La vida se basa en los compuestos de carbono, entre ellos glúcidos, • Habilidad: Identificación de compuestos bioquímicos tales como los
lípidos, proteínas y ácidos nucleicos. azúcares, los lípidos o los aminoácidos a partir de diagramas
moleculares y práctica de laboratorio.
• El metabolismo es el conjunto de todas las reacciones catalizadas por
enzimas en una célula o un organismo.
• El anabolismo es la síntesis de moléculas complejas a partir de moléculas
más simples, incluida la formación de macromoléculas a partir de
monómeros, por reacciones de condensación.
• El catabolismo es la descomposición de moléculas complejas en
moléculas más simples, incluida la hidrólisis de macromoléculas en
monómeros.

Orientación: Los alumnos deben ser capaces de nombrar y explicar brevemente las siguientes funciones vitales:
nutrición, metabolismo, crecimiento, respuesta, excreción, homeostasis y reproducción.
• Chlorella y Scenedesmus son organismos unicelulares fotosintéticos adecuados, en tanto que Euglena debería evitarse,
ya que puede alimentarse heterotróficamente.
• Las barras de escala pueden ser una forma útil de indicar los tamaños reales en dibujos y micrografías.
4
 ¿Cómo estudiar con estas diapositivas?
Analiza las siguientes diapositivas y luego elabora un organizador visual y un resumen.

• ANÁLISIS. • RESUMEN.

1. Captar el todo, es decir tener una idea 1. Hacer una lectura exploratoria,
global de lo que queremos analizar. identificando la estructura y
2. Descomponer el todo en partes, de organización del texto.
acuerdo a lo que sea necesario y posible. 2. Hacer una lectura comprensiva,
3. Buscar las relaciones que existen entre subrayando las ideas principales, párrafo
las partes, elaborando un organizador por párrafo.
visual. 3. A partir del subrayado escribir las ideas
4. Definir la función de cada parte. principales usando las propias palabras
5. Jerarquizar cada parte, es decir enunciar sin alterar la idea del autor.
la parte principal y las secundarias.

NO OLVIDES:
• Organizarte para estudiar.
• Hacer tus comentarios sobre lo que has aprendido o no, para socializarlos en la siguiente clase.
5
 C.1 La biología molecular explica los procesos vivos
aludiendo a las sustancias químicas implicadas.
• El descubrimiento de la estructura del ADN en 1953 inició
una revolución en la biología que ha transformado nuestra
comprensión de los organismos vivos. Se planteó la
posibilidad de explicar los procesos biológicos a partir de la
estructura de las moléculas y de cómo éstas interactúan
entre sí.
• Muchas son las moléculas que encontramos en los seres
vivos, desde la más simple, el agua, hasta las más complejas
como las proteínas y los ácidos nucleicos: ADN y ARN. Los
glúcidos y los lípidos completan la gama de biomoléculas.
• Los ácidos nucleicos codifican la síntesis de las proteínas y
https://encrypted-
este proceso constituye el núcleo de la biología molecular.
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 La biología molecular tiene un enfoque reduccionista ya que investiga los procesos biológicos descomponiéndolos a través
de sus componentes químicos. Este enfoque ha supuesto un extraordinario avance para la biología ya que ha sido una
forma muy eficaz de conocer cómo son y cómo funcionan los seres vivos. Sin embargo el enfoque reduccionista no puede
explicarlo todo ya que las partes se combinan entre sí y surgen propiedades emergentes que no pueden ser estudiadas si
no se contempla al sistema biológico en su conjunto.
6
C.1 La biología molecular explica los procesos vivos aludiendo a
las sustancias químicas implicadas.

 El carbono es el elemento decimoquinto en orden de abundancia de la corteza terrestre, pero el

segundo en los seres vivos. Los elementos químicos presentes en los seres vivos reciben el nombre de
bioelementos o elementos biogénicos, de los que existen unos 70 diferentes (en la naturaleza hay unos
90).

• Bioelementos primarios o mayoritarios. Sa trata de

un grupo formado por los seis bioelementos antes
mencionados (C, H, O, N, P y S), que constituyen el
96% del total de la materia viva y son los
componentes fundamentales de las biomoléculas.
• Bioelementos secundarios, forman parte de todos
los organismos vivos aunque en menor proporción
que los anteriores (3,9%). Son; Na, K, Ca, Mg, Cl y Fe. http://3.bp.blogspot.com/-
xY1VxyWvO3E/UMgqhGthpvI/AAAAAAAAAOU/0yGxaIpZ2i8/s1600/Imagen3.jpg

• Oligoelementos, aunque se encuentran en trazas, en proporciones inferiores al 0,1% (en

cantidades superiores son tóxicos), estos elementos son imprescindibles, pues desempeñan
funciones esenciales en diferentes procesos bioquímicos y fisiológicos. Algunos oligoelementos,
como Cu, Zn, Mn, I, Ni y Co, aparecen en la mayoría de los organismos y otros, como Si, F, Cr, Li, B,
Mo y Al, solo están presentes en grupos concretos. 7
 NdC. Refutación de teorías: la síntesis artificial de la
urea ayudó a refutar el vitalismo.
 Una de las teorías ampliamente extendidas hasta hace 200 años era la filosofía del
vitalismo, la creencia de que los seres vivos y las cosas inanimadas se diferencian
fundamentalmente porque los seres vivos tienen un elemento o principio vitalista no
físico (chispa vital, energía vital, psique o alma) que hace que los compuestos
químicos de los seres vivos (compuestos orgánicos) solo se pueden producir dentro de
los propios seres vivos. Esta teoría tenía mucho arraigo en medicina y se pensaba que
las enfermedades eran producto de un desequilibrio entre las fuerzas vitales o
humores del cuerpo que afectaban no solo a la salud sino también a la personalidad o
temperamento de las personas.
 La urea es un ejemplo de compuesto orgánico que forma parte de la orina y que se
produce en el riñón. En 1828 el químico alemán Friederich Wöhler sintetizó urea
artificialmente a partir de compuestos inorgánicos: isocianato de plata y cloruro de
amonio. Fue el primer compuesto orgánico que se ente(l,)]
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http://2.bp.blogspot.com/-
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8
• Aunque los biólogos aceptan ahora que los procesos en los organismos vivos se rigen por las mismas fuerzas
químicas y físicas que la materia no viva, sigue habiendo algunos compuestos orgánicos que no han sido
sintetizados artificialmente. Por ejemplo, es aún imposible hacer proteínas complejas como la hemoglobina, sin
poder utilizar los ribosomas y otros componentes de las células.

Síntesis de la urea por Wöhler

https://encrypted-
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9
A.1 La urea como ejemplo de un compuesto producido por
organismos vivos, pero también puede sintetizarse artificialmente.
 La urea es un compuesto con una estructura molecular
http://www.3htcorp.com/wp-
content/uploads/2012/10/urea1.jpg

relativamente simple que contiene nitrógeno.

 Es un componente de la orina donde se descubrió por primera
vez.
 Se produce cuando hay un exceso de aminoácidos en el cuerpo,
como un medio de excretar el nitrógeno de los aminoácidos,
que de otro modo se acumularía en forma de amoniaco tóxico.
 Para ello se utiliza un ciclo de reacciones catalizadas por enzimas:
el ciclo de la urea. Este ciclo ocurre en el hígado.
 A continuación, la urea es transportada por el torrente
sanguíneo a los riñones donde se filtra y es expulsada fuera del
cuerpo a través de la orina.
 La urea también se puede sintetizar artificialmente.
 Las reacciones químicas que se utilizan son diferentes a las del
hígado y no hay enzimas involucradas, pero el producto final, la
urea, es el mismo.
http://www3.uah.es/bioquimica/Tejedor/bioquimica_quimica/IMAGENES/ciclo-urea.gif 10
Desechos nitrogenados.

Cuando los aminoácidos y ácidos nucleicos

se metabolizan, el subproducto inmediato
es el amoniaco, que es muy tóxico para el
organismo, pero que puede ser eliminado:

• Directamente como amoniaco al exterior

en invertebrados acuáticos o a través de
las branquias en los peces teleósteos.
• O se convierte en urea, en el caso de los
mamíferos, que es menos tóxica y se
disuelve en agua.
• O se convierte en ácido úrico, en el caso
de las aves y los reptiles terrestres, que es
insoluble en agua. La producción de ácido
úrico es energéticamente más costosa que
los otros mecanismos, pero también
ahorra que se excrete agua.
11
Pregunta tipo IB.
Prueba tipo 1 NS
En 1828 Friedrich Wöhler produjo urea (compuesto orgánico) de forma artificial mediante
una reorganización interna de los átomos de cianato de amonio (compuesto inorgánico).
¿Qué importante principio mostraba este experimento?

A. Los compuestos orgánicos pueden sintetizarse sin necesidad de una fuerza vital.
B. Los compuestos orgánicos solo pueden formarse a partir de compuestos inorgánicos
preexistentes.
C. Los compuestos inorgánicos son esenciales para los organismos vivos.
D. Los compuestos orgánicos son sustancias más simples que los compuestos inorgánicos.

Tomado de: Biología Nivel Superior Prueba 1. (2014). Bachillerato Internacional. (Original en español). Exámenes de muestra 1, 2,
3. Para primeros exámenes 2016.

12
C.2 Los átomos de carbono puede formar cuatro enlaces
covalentes y permiten así la existencias de toda una serie de
compuestos estables.
Los bioelementos suelen enlazarse entre sí mediante enlaces covalentes, el tipo de enlace más fuerte que origina
moléculas estables (una molécula es un conjunto de dos o más átomos enlazados entre sí covalentemente; las
moléculas se representan mediante fórmulas químicas). El enlace covalente se forma cuando dos átomos adyacentes
comparten al menos un par de electrones, siendo uno aportado por cada átomo.

La fuerza de un enlace covalente depende del número de

electrones compartidos:

1 par: enlace simple

2 pares: enlace doble
3 pares: enlace triple

Los electrones que se comparten en un enlace covalente se

encuentran siempre en la última capa y se denominan electrones
de valencia. El número de enlaces depende del número de
electrones de valencia.
13
C.2 Los átomos de carbono puede formar cuatro enlaces covalentes y
permiten así la existencias de toda una serie de compuestos estables.

14
C.2 Los átomos de carbono puede formar cuatro enlaces covalentes y
permiten así la existencias de toda una serie de compuestos estables.

15
C.2 Los átomos de carbono puede formar cuatro enlaces covalentes y
permiten así la existencias de toda una serie de compuestos estables.

16
C.2 Los átomos de carbono puede formar cuatro enlaces covalentes y
permiten así la existencias de toda una serie de compuestos estables.

17
C.2 Los átomos de carbono puede formar cuatro enlaces covalentes y
permiten así la existencias de toda una serie de compuestos estables.

18
C.2 Los átomos de carbono puede formar cuatro enlaces covalentes y
permiten así la existencias de toda una serie de compuestos estables.

19
 C.3 La vida se basa en los compuestos de carbono, entre ellos
glúcidos, lípidos, proteínas y ácidos nucleicos.

Los organismos vivos utilizan cuatro clases principales de compuestos de carbono que
tienen propiedades diferentes y que por tanto se pueden utilizar para diferentes
propósitos:

• Los glúcidos o hidratos de carbono se caracterizan por su composición. Ellos se componen

de carbono, hidrógeno y oxígeno, en proporción 1:2:1, de ahí el nombre erróneo de
hidratos de carbono (CH2O)n . Los glúcidos más sencillos se denominan azúcares como
glucosa.

• Los lípidos son una amplia clase de moléculas que son insolubles en agua, incluyendo
esteroides, ceras, ácidos grasos y triglicéridos. En el lenguaje común, los triglicéridos se
denominan grasas si son sólidos a temperatura ambiente o aceites si son líquidos.

• Las proteínas se componen de una o más cadenas de aminoácidos. Los aminoácidos

contienen carbono, hidrógeno, oxígeno y nitrógeno, y dos de ellos también contienen
azufre.

• Los ácidos nucleicos son cadenas de subunidades denominadas nucleótidos, que

contienen carbono, hidrógeno, oxígeno, nitrógeno y fósforo. Hay dos tipos de ácidos
nucleicos: ácido ribonucleico (ARN) y ácido desoxirribonucleico (ADN).
20
H.1 Dibujo de diagramas moleculares de la glucosa, la ribosa,
un ácido graso saturado y un aminoácido común.

Para dibujar estas moléculas se sugiere seguir los siguientes pasos:

a. Dibujar primero el esqueleto carbonado.
b. Añadir los grupos funcionales.
c. Completar con átomos de H los enlaces libres.
d. Contar el número de átomos de cada tipo, deben coincidir con los átomos de la fórmula global.
e. Compactar la fórmula desarrollada sin perder la forma tridimensional.

21
 http://recursos.cnice.mec.es/biosfera/alumno/2bachillerato/biomol/imagenes/glucido/animagluco.gif?w=240

22
 https://carbohidratosencbmayira.files.wordpress.com/2016/01/glucosa.gif

Cuando el enlace es alfa 1-4 entre dos moléculas de glucosa, la molécula en conjunto se la llama
maltosa. El enlace entre muchas moléculas de D-glucosa en enlace alfa 1-4 la molécula se la llama
amilosa, uno de los componentes del almidón.
Cuando el enlace entre dos moléculas de D-glucosa es beta 1-4, la molécula se llama celobiosa.
Muchas moléculas de celobiosa unidas en enlace beta 1-4 la molécula resultante se la llama
celulosa.
24
26
H.2 Identificación de compuestos bioquímicos tales como los
azúcares, los lípidos o los aminoácidos a partir de diagramas
moleculares.

27
C.4 El metabolismo es el conjunto de todas las reacciones
catalizadas por enzimas en una célula o un organismo.

E1 E2

29
El
Metabolismo
Humano

https://pikaia.files.wordpress.com/2007/09/mapamethz4.jpg
30
Animación de una ruta metabólica.

31
La inhibición por el producto final detiene la ruta metabólica e impide que se produzca un
exceso de producto final. Es un mecanismo habitual de control del metabolismo.

Sitio alostérico: lugar

donde se enlaza el
producto final a la enzima
(no es el sitio activo)

Produce un cambio Ejemplo de control con

conformacional feedback o retroalimentación
temporal del sitio negativa.
activo.
32
La inhibición por el producto final detiene la ruta metabólica e impide que se produzca un
exceso de producto final. Es un mecanismo habitual de control del metabolismo.

El producto final produce un cambio

conformacional temporal del sitio activo.

Sitio alostérico: lugar donde se enlaza el

Ejemplo de control con feedback o producto final a la enzima (no es el sitio
retroalimentación negativa. activo) 33
Hay dos grandes grupos de rutas metabólicas: rutas catabólicas y rutas anabólicas. Las primeras liberan
energía (ATP) y las segundas requieren algún aporte de energía. Funcionan de forma acoplada.

34
C.5 El anabolismo es la síntesis de moléculas complejas a partir
de moléculas más simples, incluida la formación de
macromoléculas a partir de monómeros, por reacciones de
condensación.
El metabolismo a menudo se divide en dos partes, el anabolismo y el catabolismo. El anabolismo son las reacciones en
las que se sintetizan moléculas más grandes a partir de otras moléculas precursoras más pequeñas. Por ejemplo
recuerda los esteroides anabólicos (como la testosterona) que son hormonas que promueven el desarrollo del cuerpo.
Las reacciones anabólicas requieren energía, que se suministra generalmente en forma de ATP.

En el anabolismo se incluyen estos procesos:

• La síntesis de proteínas mediante ribosomas.

• La síntesis de ADN durante la replicación.

• La fotosíntesis, incluyendo la producción de glucosa a partir de

dióxido de carbono y agua.

• La síntesis de glúcidos o hidratos de carbono complejos como http://i.ytimg.com/vi/WbQymcQ8JdI/hqdefault.jpg

almidón, celulosa o glucógeno.

35
Muchas biomoléculas son macromoléculas que se obtienen cuando se unen entre sí muchas
unidades (monómeros). Con unas pocas unidades diferentes se pueden formar infinidad de
macromoléculas, dependiendo cuántas se unan y en qué orden.

Las macromoléculas se pliegan y doblan en el espacio adoptando figuras tridimensionales específicas,

que dependen del tipo y secuencia de monómeros, lo cual determinará a su vez que funcionen o no.

En todos los grupos de compuestos orgánicos (glúcidos, lípidos, proteínas y ácidos nucleicos) hay
moléculas más pequeñas (unidades o monómeros) y macromoléculas (polímeros).
36
 Monómeros y polímeros en biomoléculas
Grupo Monómeros Polímeros
Lípidos Ácidos grasos Triglicéridos y otros lípidos
Glúcidos Monosacáridos Polisacáridos
Proteínas Aminoácidos Polipéptidos y proteínas
Ácidos nucleicos Nucleótidos ADN y ARN

37
38
C.6 El catabolismo es la descomposición de moléculas
complejas en moléculas más simples, incluida la hidrólisis de
macromoléculas en monómeros.
El catabolismo es la parte del metabolismo en la cual las moléculas más grandes se descomponen en
otras más pequeñas. Las reacciones catabólicas liberan energía y en algunos casos esta energía se
captura en forma de ATP, que luego puede ser utilizada por la célula. El catabolismo incluye, por
ejemplo:
• La digestión de la comida en la boca, en el estómago y en el
intestino delgado.

• La respiración celular en la cual la glucosa o los lípidos son

oxidados hasta dióxido de carbono y agua.

• La digestión de los compuestos de carbono complejos

presentes en la materia orgánica muerta por los
descomponedores (bacterias y hongos saprotrofos).

•La degradación de aminoácidos y nucleótidos hasta

amoniaco, urea o ácido úrico.

39
La construcción y rotura de macromoléculas: reacciones de condensación e hidrólisis.

A. Reacción de condensación o B. Reacción de hidrólisis.

deshidratación. Separación de monómeros añadiendo
Unión de dos monómeros con una molécula de agua. Reacción típica
separación de una molécula de agua. del catabolismo.
Reacción típica del anabolismo.

http://4.bp.blogspot.com/-
M3mMHfXsZmY/ULEnwovg-
6I/AAAAAAAAAFM/OmdxQ4Ob6hE/s1600
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MAS RECURSOS
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http://recursostic.educacion.es/ciencias/biosfera/web/
41
“Los COAR son una propuesta viva, sujeta a
mejoras y construida con todos sus actores”.

GRACIAS