Universidad Icesi

Facultad de Ciencias Naturales

Reto final - Biología Molecular

Introducción:

Desde diciembre del 2019, y en Colombia intensivamente desde marzo de 2020, se vive en el planeta
entero una pandemia como resultado de la expansión del virus SARS CoV-2 el cual ocasiona COVID-
19. La biología molecular ha tenido un papel fundamental durante la pandemia de COVID-19 a partir
de aplicaciones prácticas que permiten, entre otras: (1) el desarrollo de técnicas para el diagnóstico
de la infección con el virus, (2) el estudio e identificación de nuevas variantes gracias a la
secuenciación del RNA viral y (3) el acompañamiento tecnológico para soportar el desarrollo y
viabilidad de tratamientos y vacunas. La atención de la comunidad en general se ha volcado sobre
la importancia del descubrimiento de vacunas, las diferentes estrategias y alternativas utilizadas
para crear cada una de ellas, y el proceso que implica evaluar su efectividad. Ahora hemos
comprendido que este virus hará parte de nuestra cotidianidad por algún tiempo, y mientras se
aumenta el porcentaje de cobertura de la población vacunada, la ciencia necesita enfocarse en una
segunda estrategia: desarrollar tratamientos que permitan controlar más rápidamente la infección.

Ustedes, como estudiantes de este curso, han adquirido múltiples herramientas para entender más
profundamente los términos técnicos alrededor de este tema. Ahora, con todo ese bagaje,
¡pondremos a prueba su capacidad de innovación!

Aprendizajes adquiridos durante el curso:

A través del desarrollo de 10 casos de estudio abordados a lo largo del semestre, ustedes han
adquirido la capacidad de:

1. Definir claramente una pregunta de investigación.

2. Definir los objetivos principales del trabajo de investigación (asegurándose que estos son
coherentes con su pregunta y evaluables con su metodología).
3. Plantear una metodología adecuada (siguiendo un diagrama de flujo) para llevar a cabo el
trabajo. No se olviden que es importante incluir una descripción de la técnica seleccionada.
4. Justificar la selección de la técnica, identificando sus características, ventajas y desventajas.
Recuerden tener en cuenta también el tiempo que les tomará obtener resultados y cuánto
dinero cuesta utilizar la técnica (en términos relativos, eg. económico, intermedio, costoso).
¡Asegúrense de optimizar sus recursos!
5. Demostrar conocimiento a partir del análisis de los resultados esperados
6. 6. Apoyarse en literatura científica relevante y reciente para sustentar su escrito.

El reto final:

Una nueva variante del SARS CoV-2 se origina en el continente asiático. En esta nueva variante,
se presenta un cambio de un nucleótido en el gen spike. El análisis de docking molecular revela
una pérdida en la afinidad de todas las vacunas disponibles a septiembre de 2021, incluyendo
las de Moderna, Pfizer, Astra Zeneca, entre otras.
Ustedes trabajan como biólogos moleculares en el laboratorio farmacéutico Dharma,
específicamente en el área de investigación y desarrollo. Ustedes deben proponer nuevas
técnicas moleculares (diseños innovadores) para tratar a las personas que se enfermen de
COVID19, teniendo en cuenta que existen diferentes variantes.

Ustedes como biólogos moleculares deben:

a. Explicar claramente el problema: ¿Cómo una mutación en la proteína spike (s) resultó en la
una nueva variante que es refractaria a todas las vacunas disponibles?

b. Proponer y justificar una estrategia experimental en donde se diseñe un tratamiento que

tenga como blanco proteínas claves para la replicación del virus

c. Discutir una estrategia encaminada a verificar que esta nueva estrategia (diseñada por
ustedes) no afecte la regulación de genes ni altere interacciones de proteínas en el hospedero

d. Sustentar el desarrollo y modo de acción de este nuevo tratamiento demostrando

conocimiento y entendimiento del mecanismo de acción de la estrategia usada.

El comité ejecutivo y los financiadores de Dharma requieren conocer su propuesta general a

partir de una presentación oral y de un documento escrito. La propuesta investigativa debe
cumplir todos los parámetros formales de un proyecto de investigación bajo el método
científico. ¡El objetivo es salvar el mundo de las infecciones de Covid!

- La sustentación debe tener una duración de 10 minutos. Deberá entregar la plantilla o ayuda
audiovisual para la presentación (ppt o equivalente) el miércoles de la semana 16 hasta las 11
am. Todos los integrantes del grupo deben participar activamente en la exposición. En dicha
presentación se evaluarán aspectos relacionados con la oralidad de los expositores, y el diseño
y desarrollo de la propuesta investigativa. Las presentaciones se llevarán a cabo en la semana
16 en el horario de clase (miércoles y viernes).

- El documento escrito de la propuesta debe integrar todos los puntos contenidos en las
secciones ‘Aprendizajes adquiridos durante el curso’ y ‘Ustedes como biólogos moleculares
deben’. La propuesta debe tener máximo 5 hojas de texto a espacio sencillo, sin incluir tablas,
figuras, y referencias. Este documento se entregará el lunes de la semana 17 de clases a las
11:59 PM. El desarrollo, sustentación y entrega de la propuesta de investigación que deben
presentar a Dharma, será equivalente al 25% de la nota final del curso. Este valor se ponderará
así: 40% la sustentación y 60% la propuesta escrita.